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Reference ( gi|2 )            :                          GATACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCTTATAAATTTCACAATTTGTTTTATATTTTTGTGAAGTATATTCGCGCCTTAAGGCGTACATCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATCA-CACTATCATCA-------TTC---ATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGTGCTCGGGTTTT-----TTT-AAAATAAATTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTAATTTTCAA--AAAT-TAATTTATTATCTCTCCCA
gi|1                          :                            TACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCATTGAAATCACGGTATTTTTCTTATAAATTTAACAATTTGCTTTATATTTTTG----------------------GCGCACATAGTAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTCA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACCCTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCTTAA-TATTATCATCATTTATATTTT---ATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--GTATGTATTTCGAAAGCGCTCGTTTTTT-----TTA-AAAATAATTTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATT-ATT--------AAT-TCATTTATTATCTCTCC
gi|3                          : cgttaataacaactttgcgcttcacatttCTTAGCACAATTTGAATTTTACTGATGTTTTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCATATAAATTTCACAGTTGGCTCCATATTTTTGTGAAGTATATGCGAGCCAATAGGCACAAATCATAATTTGTGAATGTTT-TCACA-TTTCTATTACTTT-TT-TATTGTG--TT----T-TTTTCATACTTCCATGTTTTCATCATTGTAATCGTT---TGACATCTTAA-CATTATCATGA-------TTG---A-----TCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTC--GTT-------------------TTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGCTCTATTAA----------------T-TAATTCATTATCTCTTCCA
gi|5                          :                                                                                     gttaataacaactttgtactttacatttatGTGAAGTATATGCGCTCCTTAAGGCGCACGTCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAT-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACGCTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATAA-CATTATCATCA-------TTC---ATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGG-TTT-----TTT-AAAATAAATTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTAATTTTTAA--AAAT-TAATATATTATCTCTC
gi|6                          :                                                                                                                       AGTATATGCACGCCTAAAGGCACACATCATAATTTATAAATGTTT-TCACA-AATTTATTAA-TTACC-TATTGTA--AT----T-TTTTCATACTTTCATGTTTTTATCATCGTAATCATTAGCGGACATT-TTA-AAC-ATCATTA-------TTG---ATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGGAATA-------TATTCCAAAAGCGCTCG--TTTT-----TTT-AAAATAATTTT-A-AAG-AGTTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATT------------AAT-TAATTCATTATCTCTC
gi|4                          :                                                                                                                                   gtTTAAGGCGCACATCATAATTTGTGATAATTTGTCATA-ATTCTATTGA-TT-TTCTATTGTG--AG----T-TTATCATACTTCCATGTTTT-ATCATCGTAATCGTTATTTGACATT-TTA-AAC-ATTACCA-------TTTGTGATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGGAATA-----TATATTCCGAAAACGCTTTGATAAT-----TTT-AGA-TAATTTT-A-AAG-AATTCAGATTTGTTTGAGTGTATTAACTAAT--------AAAT-TTATTTATCATCTCTC
gi|11                         :                                                                                                          tttgcatatgtattacactgttagataaacattaatctcaagttgatatatacatacaataACATATTTTA--AA-TA-T---ATTGTG--AT----T-TGTCCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATAA-CATTATCATCA-------TTC---ATATTTTCA-TTTTCATCCCGTGAAGAAGGAATAATATATATATTCCGAAAGCGC
gi|7                          :                                                                                                                                                              tttatagctgtgatTCTTATTGG-TG-TA-TATAGCGCAAT----C-TTTTAATACATCCATGATTTTATCATCGTAATCGTT---TGATATTTTAA-CATTATCATCA-------TT----GTATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGAGCTC--GTTTT-----TTTAAAAATAATTTT-A-AAG-AATTAAGTATTGTTTGGGTGTATTAATAAATTT--------AT-TAATTTATTATCTCTCACA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                               TTTATCATCGTAATCGTT---TGACGTCTTAA-CATTATCATCA-------TTG---ATATTTTCA-TTTTCATCCCCTAAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGG-TTT-----ATT-AAAATAATTTT-A-AAG-AAATCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATT-ATTCTTAA--TAAT-TAATTTATTATCTCTCCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                            TCGTTATGTGACATTTTAAACATTATCATTA-------TTG---ATCTTTTTA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGG---A--ATATATATTCGGAAAGTGCTCGGGTTTT-----TT---AAATTATTTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTTTTAA------TTC------AT-CAATTTATAATCTCTCC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   TATCATCA-------TTG---ATATTT--A-----CATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCG--TTTT-----TTT-AAAATAATTTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTATTTTTTAA--TAAT-TAATTCATTATCTCTCCCaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                      tATTA-------TTG---ATATTTTTAATTTTCATCCTCTAAAAAAGGAA----ATATATCTTCCGAAAGCGCTCGTATTTT-----TT---AAATATATTT-TTAAG-AATTCAGTATTATTTGGGTGTATTAATCAAT----AAACAAATATAATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                            tgtgatcattagatttatacatttgaaaagtttatgcgctcctgaCA-------TTT---ATATTTTCA-CTTTCATCCCCTGA-----------------TATTCCGAAAGCGCTCGGGTTTTGTTTTTTT-TAAATAATTTT-G-AAG-AATTCAGTATTGTTTAGGTGTATTAATTAATTTTTGA--TAAT-TAA-TTATTATCTTTCat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        catttatatgttgaTT-----TTT-AAA-TATTTTTTA-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTATAATAATTGATT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----TTT-AAA-TAATTTT-A-AAG-AATTCAGTATTGTTTGGATGTATTAATTAATT--------AAT-TTATTTATTATaattctctctct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TT-A-AAATAATTCAGTATTGATTGGGTGTATTAAT





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Reference ( family-531 )      :     NNTACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCTTATAAATTTCACAATTTGCTTTATATTTTTGTGAAGTATATGCGCGCCTTAAGGCGCACATCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCTTAA-CATTATCATCA-------TTGATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGGTTTT-----TTT-AAA-ATA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTA-ATTTT---A--AATTAAT-TTATTATCTCTCCCA
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gi|15                         :                                                                                                                                                               A-TT-TC-CACTGTA--ATACATTGTTTCCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTTATCGTT---TGACATCctctctct
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----TTT-AAA--TA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGATGTATTAATTA-ATT--------AATTTAT-TTATTAT
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gi|4                          :                                                                                  gttaataacaactttgtactttacatttatTTAAGGCGCACATCATAATTTGTGATAATTTGTCATA-ATTCTATTGA-TT-TTCTATTGTG--AG----T-TTATCATACTTCCATGTTTT-ATCATCGTAATCGTTATTTGACATTTTAAACATTACCATTT-------GTGATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGG---A--ATATATATTCCGAAAACGCTTTGATAAT-----TTT--AG-ATA-ATTTTAAAG-AATTCAGATTTGTTTGAGTGTATTAACTA-A---T---A--AATTTAT-TTATCATCTCTC
gi|5                          :                                 tttgcatatgtattacactgttagataaacattaatctcaagttgatatatacatacaataGTGAAGTATATGCGCTCCTTAAGGCGCACGTCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAT-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACGCTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATAA-CATTATCATCA-------TTCATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGG-TTT-----TTT-AAA-ATA-AATTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTA-ATTTTTAAA--AATTAAT-ATATTATCTCTC
gi|6                          :                                                                                                  AGTATATGCACGCCTAAAGGCACACATCATAATTTATAAATGTTT-TCACA-AATTTATTAA-TTACC-TATTGTA--AT----T-TTTTCATACTTTCATGTTTTTATCATCGTAATCATTAGCGGACATTTTAA--AC-ATCATTA-------TTGATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGGAATA-------TATTCCAAAAGCGCTCG--TTTT-----TTT-AAA-ATA-ATTTTAAAG-AGTTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATT-------------AATTAAT-TCATTATCTCTC
gi|7                          :                                                                                                                                                     gtTCTTATTGG-TG-TA-TATAGCGCAAT----C-TTTTAATACATCCATGATTTTATCATCGTAATCGTT---TGATATTTTAA-CATTATCATCA-------TTG-TATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGAGCTC--GTTTT-----TTTAAAA-ATA-ATTTTAAAG-AATTAAGTATTGTTTGGGTGTATTAATAA-ATTT--------ATTAAT-TTATTATCTCTCACA
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Reference ( family-531 )      :     NNTACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCTTATAAATTTCACAATTTGCTTTATATTTTTGTGAAGTATATGCGCGCCTTAAGGCGCACATCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCTTAA-CATTATCATCA-------TTGATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGGTTTT-----TTTAAA-A-TA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTA------AT------T------AATTAAT-TTATTATCTCTCCCA
gi|1                          :       TACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCATTGAAATCACGGTATTTTTCTTATAAATTTAACAATTTGCTTTATATTTTTG----------------------GCGCACATAGTAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTCA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACCCTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCTTAA-TATTATCATCATTTATATTTTATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--GTATGTATTTCGAAAGCGCTCGTTTTTT-----TTAAAA-A-TA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATT-------AT------T------AATTCAT-TTATTATCTCTCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                          cgttaataacaactttgcgcttcacatttTCGTTATGTGACATTTTAAACATTATCATTA-------TTGATCTTTTTA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGG---A--ATATATATTCGGAAAGTGCTCGGGTTTT-----TT--AA-A-TT-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGT-T---TTA------AT------T------CATCAAT-TTATAATCTCTCC
gi|11                         :                                                                                                                                                  ACATATTTTA--AA-TA-T---ATTGTG--AT----T-TGTCCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATAA-CATTATCATCA-------TTCATATTTTCA-TTTTCATCCCGTGAAGAAGGAATAATATATATATTCCGAAAGCGCaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                      tttatagctgtgatCA-------TTTATATTTTCA-CTTTCATCCCCTGA-----------------TATTCCGAAAGCGCTCGGGTTTTGTTTTTTTTAA-A-TA-ATTTTGAAG-AATTCAGTATTGTTTAGGTGTATTAATTA------ATTTTTGAT------AATTAA--TTATTATCTTTC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                               catttatatgttgaTTATCATCA-------TTGATATTT--A-----CATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCG--TTTT-----TTTAAA-A-TA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTATTTTTTAA------T------AATTAAT-TCATTATCTCTCCC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT-----TTTAAATA-TT--TTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTATAATAATTG------AT------T------AATT
gi|15                         :                                                                                                                                                               A-TT-TC-CACTGTA--ATACATTGTTTCCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTTATCGTT---TGACATCctctctct
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----TTTAAA---TA-ATTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGATGTATTAATTA------AT------T------AATTTAT-TTATTAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-A-CA-TTCTTAAAATAATTCAGTATTGATTGGGTGTATTAAT
gi|2                          : caaatcTACTCAGCACAGTTTGAATTTTACCGGCGTATTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCTTATAAATTTCACAATTTGTTTTATATTTTTGTGAAGTATATTCGCGCCTTAAGGCGTACATCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAA-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACACTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATCA-CACTATCATCA-------TTCATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGTGCTCGGGTTTT-----TTTAAA-A-TA-AATTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTA------AT------TTTCAAAAATTAAT-TTATTATCTCTCCCAgta
gi|3                          :       gaCTTAGCACAATTTGAATTTTACTGATGTTTTTCACTGAAAACACGGTATTTTTCATATAAATTTCACAGTTGGCTCCATATTTTTGTGAAGTATATGCGAGCCAATAGGCACAAATCATAATTTGTGAATGTTT-TCACA-TTTCTATTACTTT-TT-TATTGTG--TT----T-TTTTCATACTTCCATGTTTTCATCATTGTAATCGTT---TGACATCTTAA-CATTATCATGA-------TTGA-----TCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTC--GT---------------------TTTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGCTCT--------------AT------T------AATTAAT-TCATTATCTCTTCCA
gi|4                          :                                                                                  gttaataacaactttgtactttacatttatTTAAGGCGCACATCATAATTTGTGATAATTTGTCATA-ATTCTATTGA-TT-TTCTATTGTG--AG----T-TTATCATACTTCCATGTTTT-ATCATCGTAATCGTTATTTGACATTTTAAACATTACCATTT-------GTGATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGGAATA-----TATATTCCGAAAACGCTTTGATAAT-----TTTAGA---TA-ATTTTAAAG-AATTCAGATTTGTTTGAGTGTATTAACTA------AT------A------AATTTAT-TTATCATCTCTC
gi|5                          :                                 tttgcatatgtattacactgttagataaacattaatctcaagttgatatatacatacaataGTGAAGTATATGCGCTCCTTAAGGCGCACGTCATAATTTGTGAACGTTT-TCACA-ATTTTATTAT-TT-TT-TATTGTG--AT----T-TTTTCACGCTTCCATGTTTTTATCATCGTAATCGTT---TGACATCATAA-CATTATCATCA-------TTCATATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGCGCTCGGG-TTT-----TTTAAA-A-TA-AATTTAAAG-AATTCAGTATTGTTTGGGTGTATTAATTA------AT------TTTTAAAAATTAAT-ATATTATCTCTC
gi|6                          :                                                                                                  AGTATATGCACGCCTAAAGGCACACATCATAATTTATAAATGTTT-TCACA-AATTTATTAA-TTACC-TATTGTA--AT----T-TTTTCATACTTTCATGTTTTTATCATCGTAATCATTAGCGGACATTTTAA--AC-ATCATTA-------TTGATCTTTTCA-TTTCCATCCCCTGAAGAAGGAATA-------TATTCCAAAAGCGCTCG--TTTT-----TTTAAA-A-TA-ATTTTAAAG-AGTTCAGTATTGTTTGGGTGT----ATTA------AT------T------AATTAAT-TCATTATCTCTC
gi|7                          :                                                                                                                                                     gtTCTTATTGG-TG-TA-TATAGCGCAAT----C-TTTTAATACATCCATGATTTTATCATCGTAATCGTT---TGATATTTTAA-CATTATCATCA-------TTG-TATTTTCA-TTTTCATCCCCTGAAGAAGGAATA--ATATATATTCCGAAAGAGCTCG--TTTT-----TTTAAA-AATA-ATTTTAAAG-AATTAAGTATTGTTTGGGTGTATTAATAA------AT------T------TATTAAT-TTATTATCTCTCACA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                  ATTA-------TTGATATTTTTAATTTTCATCCTCTAAAAAAGGAA----ATATATCTTCCGAAAGCGCTCGTATTTT-----TT--AA-A-TATATTTTTAAG-AATTCAGTATTATTTGGGTGTATTAATCA------AT------A------AACAAATATAATTAT