lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                             1       11    1             11               77777777777777777777777777                      44444444444              111   222     2222222222222222      11   111  99999999999999999999999999999         22222222                         99999999999999999999999999           11                       22222                 111111          11             11111111            00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000         1                22      1    2222222   11                22     333      1    11         1    1        1              1             11111          1111         99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999    11111               1111    1                   1111          1                                                                          333333333333                         555555555555555555555555555555555555555555555555555555            111     1        111      2222222222222       111   11111      11111111                    11  1                          44444444444444444444444444444444444   11111                            111111  33333333333       111     11                       000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000      11111111   1                               1111   3333333333             2222222222      111      1                                    222222222222                                   111                       11111                             222222                 77777777777777777777777777777777777777                 11        1            11111     22222         222   11      111                                     1111      33333333333   11111                      55            1        1                                    1                                                                                                  1                         1               4                                   1                                                                                                                                                                         55555555555555555555555555555555555555555555555555                                             
lowQualScore                  :             4 4 4 0   0 3   4 44    22 1  3      444  5 33               44444444444444444444444444          6     77    66666666666         77   000   222     6666666666666666    5 55   000  33333333333333333333333333333         44444444    3              3     11111111111111111111111111     1     55   2   1    2  2 6     22222     0 9  6 4    222222     4    11 0 1 4   5   44444444  00        00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  4      1  4  4 8  1     00 4 2  7    1111111   11   22   4 3 4 1 33   1 111   66 2    88  8  2   4    0 1      3    77 6      6     4       22222  4 66  5 0000  5   5  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777    44444      5        9999    1    5  3       55  2222 1   88   6          4           8 5            1  0       3      2          5 8     555555555555     8  9       99  0  0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888     1    5 444 77  3 2   6  555      4444444444444       000   22222   0  88888888               5    33  0 1   0     33 1           22222222222222222222222222222222222   00000   5   7  4        1    4 5 444444  77777777777     6 222 8   33   3 1 8   0   666     444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   4  99999999   0      9    77  3     9  3 44   3333   2222222222 44     3  3 3333333333      111   3  0  6 9   999999        7777   99999  333333333333  2   2 6   22     4       2  0  1 333  8  8  3    0     66  66666      1   55     7777        222222        6        66666666666666666666666666666666666666        5  3     77 3      1 0      55  44444     22222   55  2 000   66      333  4          3 7     6  0  1    1    2222  0   22222222222   33333 77                   77            7        5                                    5                                                 6          6                                     7        6       6        5               0                                   7              6        6                                                      6                                                                          6        6      00000000000000000000000000000000000000000000000000           6                                 
lowQualScore                  :             . . . .   . .   . ..    .. .  .      ...  . ..               ..........................          .     ..    ...........         ..   ...   ...     ................    . ..   ...  .............................         ........    .              .     ..........................     .     ..   .   .    .  . .     .....     . .  . .    ......     .    .. . . .   .   ........  ..        ..........................................................................  .      .  .  . .  .     .. . .  .    .......   ..   ..   . . . . ..   . ...   .. .    ..  .  .   .    . .      .    .. .      .     .       .....  . ..  . ....  .   .  .......................................................................    .....      .        ....    .    .  .       ..  .... .   ..   .          .           . .            .  .       .      .          . .     ............     .  .       ..  .  . ......................................................     .    . ... ..  . .   .  ...      .............       ...   .....   .  ........               .    ..  . .   .     .. .           ...................................   .....   .   .  .        .    . . ......  ...........     . ... .   ..   . . .   .   ...     ..........................................................................................   .  ........   .      .    ..  .     .  . ..   ....   .......... ..     .  . ..........      ...   .  .  . .   ......        ....   .....  ............  .   . .   ..     .       .  .  . ...  .  .  .    .     ..  .....      .   ..     ....        ......        .        ......................................        .  .     .. .      . .      ..  .....     .....   ..  . ...   ..      ...  .          . .     .  .  .    .    ....  .   ...........   ..... ..                   ..            .        .                                    .                                                 .          .                                     .        .       .        .               .                                   .              .        .                                                      .                                                                          .        .      ..................................................           .                                 
lowQualScore                  :             0 0 0 7   7 0   8 44    44 4  3      555  7 99               66666666666666666666666666          3     99    99999999999         99   000   333     6666666666666666    3 77   000  77777777777777777777777777777         66666666    7              7     88888888888888888888888888     0     00   1   1    6  4 7     22222     7 2  7 4    888888     4    77 1 1 4   1   11111111  99        11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  8      2  1  0 0  4     44 4 3  8    1111111   11   66   4 9 4 1 88   7 666   11 2    33  3  6   1    6 1      0    11 2      4     5       55555  0 99  0 6666  0   0  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777    00000      9        7777    4    9  7       77  6666 7   22   7          0           9 9            9  6       7      4          0 7     999999999999     6  6       33  6  1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555     2    0 000 00  2 0   8  666      6666666666666       000   55555   8  00000000               6    88  8 4   4     00 7           33333333333333333333333333333333333   00000   0   0  0        2    0 5 777777  55555555555     0 111 0   55   7 9 8   2   444     444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   2  22222222   8      0    11  7     2  3 66   4444   9999999999 66     3  3 0000000000      777   3  0  0 3   666666        7777   44444  444444444444  4   8 2   11     5       8  3  4 111  5  1  8    7     44  99999      4   00     7777        111111        3        44444444444444444444444444444444444444        4  3     22 3      2 7      55  11111     66666   55  8 888   55      000  4          6 4     1  2  6    3    6666  3   44444444444   66666 11                   00            0        0                                    0                                                 0          0                                     0        0       0        0               0                                   0              0        0                                                      0                                                                          0        0      00000000000000000000000000000000000000000000000000           0                                 
consensus                     :      GTTTTCTNANCNTTATTTAGTTTAGGTACGTTAAAAT-TTGAAAAAATA-TCATTTAAATCTATGTTT-----GTAGTTTC-CTGGT-TT--G-GAGTATAATTTTTTAT--AGAA---TC-TTT--TGTTTCTTT--AAGN--ATTTCNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CAT---TAGAT----GCCTGAAGTTNTA-A--T----CATTGATTTCGATACAAAGTTTCTGTTTTCTAAATTACAAAA------ANATTT---AATTTGTAACCTTTTCCCCTTC--TTGNACCCATTTNGCTCTTGATC-----TTATTTTNATGC-CCTC------TAATT-TTTTT-TCTCT-TATATCAANTA-A--TTCTTTTTTTTTTAATT----CT------A------CT--------AA-AGTA--TGATTT----TG------T-------AA-A-TTNTTTTTCNAGNTT-T-TCAATTTC--T-TNTA-AAGT-T-TNGACTCNNTTTGATCT-TNT-TGTTTTTTAAGAAAAG--ATGAATATGATATNGTTTTTCCCCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGAT-----CATT--TA-T----AT-CAA-ATTCTANATCTTCG---TTTGCAACANTATTTGTGTC------ANTAT-TAAAT---NG------TT------TCTT-TNACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCTA-TTGTNTTTTTTATTTCNTC--G-ACATA-NTTTGTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTCANTTTCCAATACGATCTTCCTTTTTTAAACTTNCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAN---CGAATGATCTGTTCTGTANCCTGGTTTAATATNTA-CNNTA---TCAATGTCC-----GTCATTA--AANGTG---CTC-GAAATTAAAA-AA-TA-ATCTAATCTNGC---TTTCTT----TTGA-GN-GTTTTTTTT--AAA-----CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGA--TCTCGCCAGCAATCNATTAAATTACATTCA---ATTA---ATAANNC-TT----AA-AN-AC--TTT-----CCCTAGCNTTNGGATTATTTATAT-TNAC----ATAATCANA-GCA-TCTATAT-CGG-GATTNAGAACCAGGTTAAAG---TCTCCTGCNATGATGGTTA--AA--GAATCANTT--------G----CT----AG-AATC-T-T-C-------TGCTTTAAN--TT--AT-C---ATAAAAGA---C--AGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAATAT--TTA-T--AAGTN-TAN----T--TTTTT-TA-TTACATANA--GTTGTA---TCT-AAAATNAGTTT------ATTTCCAT----TTTNA---TC--N-GTTTCTNTTGAATGNATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGA-ATNGCAACNCCTCTAGACTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAA----ACATTCATAN----CCCCACTGAGTACGTATAATAGNTA--T--A--T--CTTC---G--TC------GGTAAAATGNGTATCTTG-TAAAAAATATACCGAATA--ATNTTTACTTTTG----AGA--AAAT--NAAA-NGTATCTTTTCGTTTATTTTTAT-CNCCAAGNCCTTGNACATTCATAG---ATATAA---CTGAAATNTTAT----TC-GTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( gi|2 )            :      GTTTTCTTAACTTCATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAATTTATGTTT-----TTAATTTCCCTGAT-T-----GAATATAATTCTTTAT--AGAA---CCGTTT--TGTTTCTTT--AAGT--ATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CAT---TAGAT----GCCTGAAGTTGTA-A-------CATTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTCTAAATTGCAAAA------AAA------AATTT-----CTTTTCTCCTTC--TTGAACCCATTTTGCCCGTGATC-----TTATTCTTATCC-CTTC------TAATT-TTTTC-TCTCT-TATATCAATTA-A--TTCTTTTTTTTTTGATT----CT------A------TT--------AA-AGTA--TGGTTT----TG------T-------AAGATTTCTTTTTCTAGGTT-T-TCAATTTC-AT-TATA-AAGT-A-TTGCTTCCCTTTGGTCT-TGT-TGTCGTTTGATGTAAG--AGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGAT-----CACT--TA-T----AT-TAA-ATTGTAACTCCGCA---TTTGGAACATTATTTATATC------ATTAT-TAAA----AG------TC------TCTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTTA-TTGTATTCTTTATTTTATC--A-ATATA-GTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAG---AGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCTA-CAGTA---TCAATATCC-----ATCATTA--AACATG---TT--GAGATTAAAA-AG-TA-GTCAAGTCTTGC---TTTCTT----TTGA-GA-GTTTTTTTT--AAA-----CCATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGA--TCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATTCA---ATCA---ATAAATC-TT----GA-AG-AC--TTT-----TTCGAGCATTTGGATTATTTATAT-TAAT----GTATTCACA-ACAGTCTATAT-TAG-GATCCAGAGCTACATTGAAG---TCTCCAGCAATGATGGTTA--AA--GAATCAGTT--------G----CT----AG-AATC-T-T-C-------TGCTTTAAG--TT--AT-C---ATAGAAAA---T--AGGATCATCTCTATTT-GGGCCATAGATGT--TTA-T--AAGTT-TAT----T--TTTTT-TA-TTACATAAA--GTTGTA---TCT-AATATAATTTT------ATTTCCAT----TTTGG---TC--T-GTTTCCACTGAATGTACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACA-ATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAA----ACATTCATTT----CCCCACTGGGTACGTATAACAGGTA--T--A--T--CTGC---A--TC------AGTAAAATGAGTGTCTTG-AAGAAAATAAATTGAATA--ATGTTTACTTTTG----AGA--AAGT--CAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTAT-CTCCAAGACCCTGTACATTCATAA---ATATAA---TTGAAATATTAC----TC-GTCATTTAAGATATGCACT-TAAAAATAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAA-TTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :      GTTTTCTTAACTTCATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAATTTATGTTT-----TTAATTTCCCTGAT-T-----GAATATAATTCTTCAT--AGAA---CCGTTT--TGTTTCTTT--AAGT--ATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CAT---TAGAT----GCCTGAAGTTGTA-A-------CATTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTCTAAATTGCAAAA------ATATTTC--GAGTT-----CTTTTCTCCTTC--TTGCACCCATTTTGCCCGTGATC-----TTATTCTTATCC-CTTC------TAATT-TTTTC-TCTCT-TATATCAATTA-A--TTCTTTTTTTTTT-ATT----CT------A------TT--------AA-AGTA--TGGTTT----TG------T-------AAGATTTCTTTTTCTAGGTT-T-TCAATTTC-AT-TATA-AAGT-A-TTGCTTCCCTTTGGTCT-TGT-TGTTGTTTGATGTAAG--AGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAA-CACTTCTAAAAATAGTTGGT-----CACT--TA-T----AT-TAA-ATTGTAACTCCGCA---TTTGGAACATTATTTATATC------AGTAT-TAAA----AG------TA------TCTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTTA-TTGTATTCTTTATTTTATC--A-ATATA-GTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAG---AGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCTA-CAGTA---TCAATATCC-----ATCATTA--AACATG---TT--GAGATTAAAA-AG-TA-GTCAAGTCTTGC---TTTCTT----TTGA-GA-GTTTTTTTT--AAA-----CCATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGA--TCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATCCA---ATCA---TTAAATC-TT----GA-AG-AC--TTT-----TTCGAGCATTTGGATTATTTATAT-TAAT----GTATTCAAA-ACAGTCTATAT-TAG-GATGCAGAGCTACATTGAAG---TCTCCAGCAATGATGGTTA--AA--GAATCAGTT--------G----CT----AG-AATC-T-T-C-------TGCTTTAAG--TT--AT-C---ATAGAAAA---T--AGGATCATCTCTTTTT-GGGCCATAGATGT--TTA-T--AAGTT-TAA----T--TTTTT-TA-TTACATAAA--GTTGTA---TCT-AATATAATTTT------ATTTCCAT----TTTGG---TC--T-GTTTCCACTGAATGAACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGA-ATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAA----ACATTCATTT----CCTCACTGGGTACGTATAACAGGTA--T--A--T--CTGC---A--TC------AGTAAAATGAGTGTCTTG-AAGAAAATAAATTGAATA--ATGTTTACTTTTG----AGA--AAGT--CAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTAT-CTCCAAGACCCTGTACATTCATAG---ATATAA---TTGAAATATTAC----TC-GTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|5                          :     atTTTTCTAATCATTATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAATCTACTTTTACAGTTTAATTT---TGG--------GAGTCTAATTTTTTAT--AGAA---T--TTTACTGTTTCCTT--AATA--ATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CAT---TA----------TTAAGTTTTA-AACTCAA-CATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTCTAAATTACAAAAGTATCTAGA------CATTT--------TTCCCCCTC--TTGAATCCATTTTGCTCTTGATC-----TAATTTTCATAC-CTTC------T--TT-TTTTT-CCTCT-TATATCATTTA-A--TTATTGTTTCTT-AATT-------------------TC--------AATAGTA--T--TTT----TA------TCCCATACAAG--TCCTTTTTC-AAGTT-TATCTTTTTC-AC-CATA-AAGT-AATTG-TTCTCTTTTGTCT-TGTCTTTTTTTTTAT-TGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGT-----CATT--TT-T----TT-CTA-ATTCTAAATTTTTA---TTT------TCGATTGTGTT------AATATGTAAA----TG------TTGCGTTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTTA-TTATTTGTTTTATTTCATC--G-ACATA-TTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAA---ATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTTA-CTGTA---TTTATATCT-----GT---TA--AAAGTGAATCC--GAAATAAAAATAA-TA-ATCTAGTCTTGC---TTTCTT----T-GACGA-ATTTTTTT---AAA-----CCAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGA--TCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATTTACCCATTAC--ATTAAT---------A-AG-AA--CAT-----TTCGAGCGTTTGGGTTATTTATAT-TGAC----ATAGTTAAA-ACAATCTAGAT-CAG-GGTTTAAGACCATATTAAAA---TCACCTGCAATAATG---A--AC--AAATC-GTC--------ATAATCT----AA-AATG-T-C-A-------T-TTTTAAGGGTT--GT-----ATAAAACA---T--TGGATCATCCCTATTT-GGGCCATAAACAT--TAA-T--AAGTG-TAA----T--TTCTT-TA-TT---TGAA--ATTGTAGTTTTC-AAGATTAATTT------ATTTCCAT----CTTTG---TC--A-GGTTCTACCGCATGAATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGG-ATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATA----GCATTCATAC----CCCCACTGAGTACGTAT-ATAATTAACT-----T--CTTT---G--TC------TGTAAAATGGGTATCTTG-TAAAAAATATACCGAATA--AT-TTTCCTTTTC----AGA--AAATA-TAAA--GTGTCTTTTCGTTTGTTTTTAT-CACCAAGCCCTTGCACATTCATAG---ATGTTA---CT------TTAT----TT-GTCAT
gi|13                         :                ttTTATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAATCTACTTCT-----ACAGTTTC----AT-TTTGG-GAGTATAATTTTTTAT--AGAA---T--TTTACTGTTTCCTT--AATA--ATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CAT---TA----------TTAAGTTTTA-AACTCAA-CATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTCTAAATTACAAAAGTATCTAGA------CATTT--------TTCCCCCTC--TTGAATCCATTTTGCTCTTGTTC-----TAACTTTCATAC-CTTC------TAATT-TTTTT-TCT---TATATCATTTA-A--TTC-TTGTCTCTTAATT-------------------TC--------AATAGTA-----TTT----TGATCACAT-------ACAAGTTCTTTTTC-AAGTT-TATCTATTTC-TT-CATA-AAGTAA-TTG-TTCTTTTTTGTCT-TGT-CTTTTTTTATTGAACG--ATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGT-----CATT--TA-T----TT-CTA-ATTCTAAATTTTTA---TTT------TCGATTGTGTT------AATGTGTAAA----TGTTGCGTTT------TCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTTA-TTATTTGTTTTATTTCATC--G-ACATA-aatgttatataaaatggac
gi|3                          :            tttttcgaatcaAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTGTTT-----GTAA-----CTGGT-TTGTGGGCATATAATGATTGATCAAAAA---TC--CT--TGCTTCTTT--CAAA--ATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCAT---TTGATATTAGC--GAAG--GTATA-------CATTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTCTAGATTACAAAA------ATA------A-TTTGTAACCTTTTCCCCTTCA-TCTAACC-ATTTAGCTTTTGATC-----TTATATTAATGC-CCTC------TAATT-TTTTTGTCT-T-TAT-TCAAACA-G--TC--TTTTTTTATG-TT----CT------AAACTAGCT--------AA-ATTA--T---TA----TC------T-------AA---TTGTTTTTCAAGTCT-T-TCAATTTC-TT-TTAA-AAGT-T-TAGACTCAGTTTGAATT-TCT-TGTTTTTTAAGAAAAG--ATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGAT-----CGTT--AA-T----ATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-C------ATT---TAAATTTTGA------TC------TCTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCAA-TTACTTTTTTAATTTCGTC--T-ACATAAGTTT-TATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTAT---TGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-TA-C--TATCCTCAATGTCA-----GTAAGTA--AATGCT---CT--GAAATCAGAA-AA-AA-ATCCAATCTGGCCA-TTTTAT----TTG---------TATTT--AGACGTCTCCAAGTA-AA----CTCTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATTC----ATTA---ATAATAC-TT----AA-AACAT--TTT-----CCCTAGCTTTAGGATTATTAATAT-TTAC----ATAATTATGTGTA-TCTAT-T-TGGAGATTGAGAACTAGGTTAAAG---TGTCCTGCTAAGATTGT----------ATCA-TT--------T----CC----AT--ATC-TAT-CAA-----TGTCTT--G--TTTAAC-CCCTGTATAAAACT-C--AGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACATAT--TTA-TCGAAGTCATCC----T--TTTCT-TA-TTA-AT--T--GTCATA---TCT-AAAATCAGTTT------ATTACCAT----CTATA---TC--A-CCTTCAGTTTTATGTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGA-ATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAA----ACATTCGAAA----CCCCACTGCGCACGTATA-----TA-----A--T--TTTC---A--TCTTTGCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAAT---ATG---ATTTTTGCTGCAAA--AAAT--GGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTAT-CACCAAGGCCTTGGACGT------------TAA---CTGAAATAttgt
gi|17                         : atgtgaattgttgttcttgggtaAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT-----GTAA-----CTGGT-TTGTGGGCATATAATGATTGAT--AAAAAATCC---T--TGCTTCTTTCAAAGTTAATT----CTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGT---TTGATATTAGC--GAAGGTGTA---------CATTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTCTAGATTACAAAA------ATA------A-TTTGTAACCTTTTCCCTTTCATCTGA--CCATTTATCTTTTGATC-----TTATCTTAATGC-CCTC------TAATT-TTTTT-TGTCT-TAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT----CTAAACTAA------CT--------AA-ATTA-----TTA----TG------T-------AA---TTGTTTTTCAAGTCT-T-TCAATTTC--T-TTTAGAAGT-T-TAGACTCAGTTTGATTT-TCT-TGTTTTTTAAGAAAAG--ATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCaaggttaccttatgagtcattatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|8                          :                  aatgtgaattgttgttcttgggtaT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAATCTATGTTG-----GTGGTTTCATT-ATAT-----GAGTACAATTTTTTAT--AAAA---TAATTG--TGTTTCTTT--AAGT--ATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTACTAGTT------CTAATGTT-TA-T-------CATTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTCTAAATTACAAAA------AAATTTTAGAATAT------TTTTCTCCTTC--CTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTTATTCCCATCCACTTTTTTTTATAGTTGTTCTA-TTTCTATATATAAATT-----TTCCTCCCTTTTAATTT----CT------G------TTTTTTCTTGAA-AG-A--TGAATA----TG------A-------AATAGTTTTTCCTCT-GATT-T-CTAAca
gi|7                          :                     tttaaattttcatctggtatagggacatcaacgA-TC-TTTAAATCTATGTTG-----GTGGTTTCATT-ATAT-----GAGTACAATTTTTTAT--AAAA---TAATTG--TGTTTCTTC--AAGT--ATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CAT---TA---------CT--AGTTCTA-ATGTTTGTCATTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTCTAAATTACAAAA------GAATTTA--GATTT------TTTTCTCCTTC--CTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTTATTCCCATCC-ATT----------TT-TTTTC-TCTCT-AATATCG--TA-AAGTTCTTTTCTTTTTGATT----CA------A------TA--------GC-AGTA--TGGTCT----TG------T-------AA-ATTGTTTTTTATTAGTTAT-TCTATTTC-TA-TATATAATT-T-TTCCTCCCTTTTAATTT-TTT-TTTT-TTTGA---AAG--ATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGAT-----CATT--TA-T----AC-TAA-ATTCTATATCTTTG---TTTGCAATAGTATGTATGTC--------TGC-GAAATG--AT------TT------TCTT-TAACATTTTGAGATTTCAC-CATTCTACTTGTATTTTTTATTTCTTC--A-ACATA-TTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTA---CGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGTAACTTTA---TCAATGTCT-----GTCAT----AAGAGG---TTCAGAAATTAAAA-AAATA-ATCTAATCTAGC---TTTCTT----TTGC-GT-ATTCTTTTT--GAA-----CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGA--TCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATTCC---GCCATTTATA---C-T------A-AT-ACAGTAT-----TTCGAGCATTTGGATTATTTAAAT-GTAT----ATAGTCAAA-GCAATCTATAT-CTG-GATTCAAAACCAGGTTGAAA---TCTCCTGCTATAATA--TAAGAA--GAATCTTTA--------G----CT----A--AATT-T-T-T-------T-TTTTGAA--TTTGAT-T---ATAGAAGT---C--GGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAATAT--TAA-T--AAGAG-TAT----T--TTTTTAAA-TTGC-TATA--GTTGTT---TCC-AATATGAGTTT------GTTTCCAT----TTTGA---TC--C-GTTTCTTTGGAGTGAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAA-ATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATA----ACATTCATAG----CCCCACAGAATGCGTAT----GGTA--TTAA--TTACTTT---A--TC------TGTAAAATGCGTGTCTTG-TAAAAAATAGATaagaagtacttaaaaaataattaatgatttatgctaaattctatatctttgtttgcaatagtatgtatgtctgcgaaattattttctttaacagatagagatttcaccattctaattgtattttttatttcttcaacatattttgtatcttttaataatgagttgttcattttccaatacgatttaccttttttaaactttccaaattcaaatgttaagaatattaacgaatgatctgttctgtaacctggtttaattgtaactttatcaatgtctgccattagaggttcagaaattaaaaaataatctaacctagctttcttttgcgtattctttttgaatcatgtatattttttttctaaattttgatcccgccagcaatcaattaaattacatcccgccattaattctaatacagtatttcgagcatttggattattaaaatgtaaatagtcaaagcaatatatatctggattcaaaaccaggttgaaatctcctgctataatataagaagaatctttagctaaaatattatttttaatttgattataaaagtcgggctcgtctttattaggaccataaatattaatgagagtattttttttatttgctatagttgtttccaatatgagtttgtttccattttgatccgtttctttggagtgaatattaaattcaaaattattatttaaaaaaatggcaactcctctagactctagaccaaactcgatagtaataaacaagattgcctgcattca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                       ttttaaattttcatctagtacagggacatcaacgcttgataggacaAAA------AAT------AATTTGTAACCTTTTCCGCTTC--ATGCGACCATTTAGCTTTTGATC-----TTATCTTAATGC-CCTC------TAATT-TTTTT-TGTCT-TAATTCAAACAGA----CTTTTTTTTTT-ATT----TT-------------CT--------AA-ACTAACTAAATTAATATC------T-------AA---TTGTTTTTCAAGTCT-T-TCAATTTC--T-TTTAGAAGT-T-TAGACTCAGTTTTATTT-TCT-TGTTTTTTAAGAAAAG--ATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGAT-----CGTTACTA-TCAGCAT-CAA-ATaat
gi|11                         :                                                                                                                                      atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaattaattcttggtttttcaaaactttgccttcatttgatattagcTTCCTCTTCA-TTTAACC-ATTTAGCCTTTGATC-----TTATCTTAATGC-CCTC------TAATT-TTAT--TGTCT-TAATTCAAAAA-A--TACTTATTTTTATTATCTAAACT------AA-----CT--------AA-ATTA--TTATCT----TA------T-------------TGTATTTCAAGTTT-T-TCAATTTC--T-TCTAGAAGT-T-TAGACTCAGTTTGATCT-TCT-TGTT-TTTAAGAAAAG--ATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTGTAATATC--TAGC----AT-CAA-AT-----CTTTACAAGGTATGTCACA-AATTTGTA-C------AT--T-TAAATTTTGA------TC------TCTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCAA-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTA-A-GTTT-TATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTAT---TGAATGATCTGTTCGATA-CCAAG----ATA---A-AAA-A---TAATTATCCTCAATGTCAGTAAGAAAATG---CTCCGAAATCAGAA-AA-AA-ATCCAATCTGGCCATTTTATTTGTATTAA-GACGTCT---------------CCAAGTA-AA----CTTTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATTC----ATTT---ATAGTAC-TT----AA-AACAT--TTT-----CCCTAGCTTTAGGATTACTGATAT-TTAC----ATAATTATGTGTA-TCTATTT-GGG-GATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--AA--Gctttacaaggtatgtc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatttgacatagtaaACTTTTTTTTATAGTTG-T-TCTATTTCTATATATA-AATT---TTCCTCCCTTTTAATTTCTGT-TTTTTCTTGA---AAG--ATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTA-AAAAATAATTAAT-----GATT--TA-T----GC-TAA-ATTCTATATCTTTG---TTTGCAATAGTATGTATGTCTGCGAAATTAT-T----------------T------TCTT-TAACAGATAGAGATTTCAC-CATTCTAATTGTATTTTTTATTTCTTC--A-ACATA-TTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAA---CGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAACTTTA---TCAATGTCT-----GCCATTA--GAG--G---TTCAGAAATTAAAA-AA-TA-ATCTAACCTAGC---TTTCTT----TTGC-GT-ATTCTTTTT--GAA-----TCATGTA-TATT--TTTTTTCT---AAATTTTGA--TCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCC---GCCA---TTAATTC-T------A-AT-ACAGTAT-----TTCGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAA-----ATAGTCAAA-GCAATATATAT-CTG-GATTCAAAACCAGGTTGAAA---TCTCCTGCTATAATA--TAAGAA--GAATCTTTA--------G----CT----AA-AATA-T-T-A-------T-TTTTAAT--TTG-AT-T---ATAAAAGT---C--GGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAATAT--TAA-T--GAGAG-TAT----T--TTTTT-TATTTGC-TATA--GTTGTT---TCC-AATATGAGTTT------GTTTCCAT----TTTGA---TC--C-GTTTCTTTGGAGTGAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAA-ATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAA----ACA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaattttcatctggtatagggacatcaacgtttgagagaacaatctttaaatctatgttggtggtttcattatatgagtacaattttttataaaataattgtgtttctttaagtatttctttttgcgagtttataatttgaccattactagttctaatgtttatcattgatttcgaaataaaatttctgttttctaaattacaaaaaaattttagaatatttttctccttcctgtacccactttgctcgtgatcaaattttattcccatccTTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAATTCCGATT-TTAGAAGAATTA-------ATG---AGTTTTGT-TTCTGCTTC---ATTTA-AA--------AATGT------------TA--AAAGTGAGTCT--GAGATTTAAA-A--TATATCTAATCTTGA---TTTCAT----GTG------TTTTCTTTGTAAA-----CCATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGG--GCACACAAACACTCTACTAAATCACATTagattgcctgcattca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --GAGATAAGAA-AA-AA-GTCTAATCTAGC---TTTTTT----ATTA-GT-GTTTTTTCG--AAA-----CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGA--TCTCTCTAGCAATCGACGAAATCA----CA---ATCA---A-AAATTGTTTTTAGA-AC-AA--CTT-----CCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATAT-TAAC----ATTATCATA-ACAGTCTATTTGTGG-GTTTAAGATC-AGATTAAAA---TCACCTGCAA------TTA--AA--G-ATAAATT--------A----TC----TG-AATC-T-T-TAATTCCATTCTTCAAT--TG--TT-T---ATAAAAGT---C--TGGGTCATCTTTATTA-GGACCATATATAT--TTATT--AAG-T-TAA----A--TCTTT-TA-T--CATTGA---TGGTACAGTCT-AAAATTAATGT------ATTGCCAT----TATTA---TCAGTGGTTT---TTGAATGTAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGA-ATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAA----ACATTCAAAC----CCTCATTCAATACGTATAAT-GTTC--TC-A--T--CTTT---T--TC------AGTAAAATGTGTATCTTG-TAAAAAGGATATTGATCC--ATTTTTGCTTTTC----AGA--AAAT--TAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGT-CGCCAAGACCCTGTACATTCATAGAGTATATAG---TT---ATTTTAT----TT-GTCATatgtatttaatcattcactttattagataacgtttatcaatattaccagatgcgacacaggtttaaaaaaaaccactataataaatgggtcacatctggataaaagggaatgcttaacatatgtataaaagagaggatcgtctttatttggaccataaatatttacaagaaatagttccttatcacaaatggctgttcctaaaaataatgtaatatcattggttgtcaattgagagaatttaatgcaaaataat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagtgattgctggTCTATTAAGTTAAATTCA---CTTC---TTAAA-C-TT----AA-A--AC--TTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACAT-TAAT----ATAAT-----------TATAT-CTG-GAAATGAAGTCATATTAAAA---TCTCCTGCAATAATA-TTA--AG--ATGTCC-TT--------C----CTCCGAGG-AAGCAT-T-A-------TG---TAAC--TG--GT-T---ATAAACTA---T--TGG-TCATCA--ATTT-----------TAT--TTA-TC-AATTT-TAT----T--CTTTT-T--CCAAATCTA--GTAATA---TCT-A-------TTT------ATTTCTAG----CTTTA---TC--T-GAAGATATTGAGAGTAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAA-ATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAA----ACACCCATAT----CCTTAAAGCGCTTGTATA---GATG--T--T--T--CCGCCATG--TC------AGGAAAATGAGTATATTG-TAAGAAATATATTGAATA--TTATTTGCTTCTG----AAATTATGT----AA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAG-CATTGTACATCCATAG---ATacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAGTACATTCA----TTA---ATAAA-C-TT----AACAC-AT--TTT-----TCCTAGCTTTAGGATTATATATAT-TTATATAAGTATGCGTA-----TTTATAT-GGG-GATTGAGAACTAGATTAAAG---TCTCC--------TGCTTA--GATTGTATCATTTCCATAGCAA----CT----AGCAATG-T-C-T-------TG-TTCAAC--AC--AT-----GTATAAAACTCT--AGT-TAACCTTTGTTT-GGTCAATAATTAT--TTA-------TT-TATGTCAT--TCTTT-TC-T--CATTAATTGTTATA---TAT-AAACTAAGTTTGAAACCATCTATATCACCTTTAG---TT--T-G-----A-TG---GTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGT-ATTGCAACACCCCGTGACTGACTCT---TAAATT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCACGTAT-ATAATTT--TTCA--T--CTTT---G--CT------GACAAAATGTGTAACTTG-TAAAAAATATACTGAATATGATATT---GTTTA----AAA--CAATGGAAAA-CATATAT--ACGTTTATTTCTAT-CACCAAGGCCTTGGACGT---TAA---CTAGAA---T--AAAGGTTACCTTTTCAGTCATTgctttatttattttattggtcaataataggtttagggaaaacataatatttgca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgaccacgttaaaaaaattaaaaaAATTACATTCA----TTA---ATAATAC-TT----AA-AACAT--TTT-----CCCTAGCTTTAGGATTATTAATAT-TTAC----ATAATTATGTGTA-TCTAT-T-TGGAGATTGAGAACTAGGTTAAAG---TGTCCTGCTAAGATTGT----------ATCATTT-------------CC----AT-A-TC-TAT-CAA-----TGTCTT--G--TTTAAC-CCCTGTATAAAA---CTCAGGTTTATCTTTGTT--GGTCCATACATAT--TTA-TCGAAGTC--ATCC--T--TTTCT-TA-TTA-ATT----GTCATA---TCT-AAAATCAGTTT------ATTACCAT----CTATA---TC--A-CCTTCAGTTTTATGTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGA-ATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAA----ACATTCGAAA----CCCCACTGCGCACGTATA-----TA-----A--T--TTTC---A--TCTTTGCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATA---TG---ATTTTTGCTGCAAA--AAAT--GGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTAT-CACCAAGGCCTTGGACGTT------------AA---CTGAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATTGAAG---TATC--G-AAT-AT--------------TCAGTT--------G----CT----AG-GATG-T-TAC---------CATCAGG--TT--AA-C---ATTGAAA----T--AGGAGTTTCT-TATTTTGGGCCATA-ATGTACCTG-T--AA-----------T--TGTTT-TA-TTGCACAAA--GTTGTA---TTT-----TAATTTC------Aaaggttaccttatgagtcattatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ca-------TGCTT-AAC--AT--ATGT---ATAAAAGA---G--AGGATCGTCTTTATTT-GGACCATAAATAT--TTA-C--AAG---AAA----TAGTTCCT-TA-TCACAAATG--GCTGTT---CCTAAAAATAATGTA------ATAT-CA------TTGG---T---T-G--TCAATTGAGAGAATTT--AATGCAAAATAAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttgagagagaattattcattctctactgtgagtttccgtccataaatttaccaattccgattttagaagaattaatgagttttgtttctgcttcatttaaaaatgttaaaagtgagtctgagatttaaaatatatctaatcttgatttcatgtgttttctttgtaaaccatgtataatatatcctttctaggttgtgggcacacaaacactctactaaatcacattatgtatttaatcattcactttattagataacgtttatcaatattaccagatgcgacacaggtttaaaaaaaaccactataataaatgggtcacatctggataaaagggaa---ATAAAAGA---G--AGGCTTATCATTATCA-GGGCCAAAGATAT--AAA-C--AAGAA--ATA---T--GTTCT-TA-TCACAAACT--GTTGTT---TCT-AAAATTAGTTT------ATTTC-------TTTGAGAATT--G-GTTTCTTTTGAATGTATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAA-CGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATA----ACATTCACAT----CCCCACTGAATTTTAATAACATGTA--T--T--T--CCTC---A--TC------AGTAAAATGAGTATCTTG-TAGGAAGTAGGATAAATA--ATTTTT-CTTTTGA---AGG--AAAT--CAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTAT-CTTCTAGACCCTGTTCATTCATCG---ATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTG--AAAAA----ACATTCATAT----CCCCAAAGCGCTCGTAT---AGATT--T--T--TC-CTCC---ATGTC------AGTAAAATGAGTATCTTG-TAAGAAGTATATTGAATcgaaggctattttatttgcaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCATAC----CCCCACTGAGTACTTATA-TAATTA-----ACTT--CTTT---G--TC------TGTAAAATGGGTATCTTG-TAAAAAATATACCGAATA--ATTTTTACTTTTC----AGA--AAAT--CTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTAT-CACCAAGCCCTTGCACATTCATAG---ATGCAA---ATGTTACTTTAT----TT-GTCATctttttatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatTCATAC----CCCCACTGAGTACGTATA-TAATTA-----ACTT--CTTT---G--TC------TGTAAAATGGGTATCTTG-TAAAAAATATACCGAATA--AT-TTTCCTTTTC----AGA--AAATA-TAAA--GTGTCTTTTCGTTTGTTTTTAT-CACCAAGCCCTTGCACATTCATAG---ATGTTA---CT------TTAT----TT-GTCATaatgttatataaaatggactactaagagggggggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacctctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacagataggcagtataatactaaaaaaatatttccctgcagtgatggcttgcttttttcgaatctcatttaccgtacttaacagcaatgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtatctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttaatttgttgtcccacgccatggaataaggtatctgttccattatgcggttcccaatatatacaggtaatagcatgtaaacagcctaaatattgatttatagacaataacagtgtacataaccacaaaattaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacatatatctgatcagaaggattgttctgtgggatgaccactgtttcacaagatctattaaatataccatgttggtgtggtatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcattatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatatttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcagcaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTAC-CTCCAAGACCCTGTACA-TCACCG---ATACAAAGGTTG---TTTTAT----TT-GTCATaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                       1             11       11            4444444444444444444444444444444444444                   2222222222                       111       222222      11     555555555555        444444444444444444444       1                                      66666666666666666666                                                                                                        555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                             222222        1111            111    555555555555   1   1                                                                                                                                             11                                   1111111111                     444444444                                        1111             222222            11                                                 2222222222       11                                                        22222222                                                 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     1111111111      1111                                    11   11111              1111         111                                                                                                       11111                        11111111                    1      3333333       111                                        11            11                                                                        44444444444                                                                                                                                                                                                                                     1                                                                                                                                                                                                          55555555555555555555555555555555555555555555555555                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1 1 1  3            2  0 2  2  3      2    8 22       22    0       5555555555555555555555555555555555555    8888  0  66    3333333333          11   888     888    8  111111    1 88     333333333333     1  777777777777777777777       5  2                 777   4    4      55555555555555555555            4  1 3      1    0      1     8  3   8            8 5 2   77   22  8 55       777  777  4 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666  2           222222  2  4  11  333   44   2     1 55          7   0           1  1        3        1    11              1           66   9999   2   4 0  1     777777     11 7777       3 77 999    111111111111   0   0 1 6      1        11 6   5 5    1       5    1  4     1   5          1  3        2 1         2  0                 1                   22    22        0       11           999 5 6666666666        5  888    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  66         0000        66   333333       4    22    1 3               2 0         1              2222222222 0 0   22   7 3 3 88 4  7777   3 1   1  1        0     1       1 66666666     2 9999     1 2                   666  1  0  999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999  0  9999999999      2222  2           6  0     0  555     3 55   88888  4        6  3333 11      000     2  2 0      1       2 555  1   3  33       1     333                   0     1  2  1        1 44  11111   1  0   44            11111111  1                 6   44 1111111 44    000   5        1         6        1  3     33  7   6 2   11       55  44      1                1     1     1       3   555   555   99999999999     5                   4     7                2                                    3                                                                                                  4                         2                  5                                4                                                                                                                                                                         00000000000000000000000000000000000000000000000000                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    . . .  .            .  . .  .  .      .    . ..       ..    .       .....................................    ....  .  ..    ..........          ..   ...     ...    .  ......    . ..     ............     .  .....................       .  .                 ...   .    .      ....................            .  . .      .    .      .     .  .   .            . . .   ..   ..  . ..       ...  ...  . . ......................................................  .      ...  .           ......  .  .  ..  ...   ..   .     . ..          .   .           .  .        .        .    ..              .           ..   ....   .   . .  .     ......     .. ....       . .. ...    ............   .   . . .      .        .. .   . .    .       .    .  .     .   .          .  .        . .         .  .                 .                   ..    ..        .       ..           ... . ..........        .  ...    .  .........     .    . . .  .  .     .  ..         ....        ..   ......       .    ..    . .               . .         .              .......... . .   ..   . . . .. .  ....   . .   .  .        .     .       . ........     . ....     . .                   ...  .  .  ........................................................................  .  ..........      ....  .           .  .     .  ...     . ..   .....  .        .  .... ..      ...     .  . .      .       . ...  .   .  ..       .     ...                   .     .  .  .        . ..  .....   .  .   ..            ........  .                 .   .. ....... ..    ...   .        .         .        .  .     ..  .   . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .   ...   ...   ...........     .                   .     .                .                                    .                                                                                                  .                         .                  .                                .                                                                                                                                                                         ..................................................                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    0 0 0  3            1  7 3  1  3      3    9 11       22    1       7777777777777777777777777777777777777    0000  7  11    8888888888          99   999     777    9  333333    0 33     999999999999     0  999999999999999999999       8  1                 888   4    4      00000000000000000000            4  0 2      0    6      4     8  2   0            0 0 5   33   00  0 55       000  000  0 8 999999999999999999999999999999999999999999999999999999  0      555  4           333333  0  0  00  999   88   5     0 55          5   9           4  0        9        4    99              0           11   4444   6   4 9  0     000000     00 2222       2 88 666    000000000000   0   0 0 5      0        22 5   0 0    0       0    0  2     0   3          0  1        5 0         0  5                 0                   00    44        5       44           666 0 0000000000        4  888    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  11         6666        11   999999       4    22    4 7               6 1         0              3333333333 9 5   66   3 6 6 22 1  7777   6 9   0  0        3     0       8 66666666     5 6666     0 6                   444  0  4  111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  8  8888888888      6666  1           5  7     2  444     1 88   44444  0        2  1111 22      888     0  2 2      7       2 888  0   3  22       0     777                   5     0  6  0        0 00  66666   7  4   66            22222222  0                 6   22 2222222 22    888   1        0         2        3  5     88  5   1 1   55       55  66      8                0     0     0       3   888   888   00000000000     5                   7     3                5                                    0                                                                                                  0                         5                  5                                0                                                                                                                                                                         00000000000000000000000000000000000000000000000000                                             
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TA---------------TAAT--TTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAA-ATTT---A-ATTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-TN-TA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTTCT--TGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTT--TAT----ATCNAAT-TCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAA--TNTTG-G---TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTTA-TTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTANNGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGC--TTTCTTTTGAGTGTTTTTTTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATTCA--------ATTAATAANNCTT-A-A-AC-ANTT----TCC-CTAGCNTTNGGATTATTTATATTNACATAATCACG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCNATGATNGTTA--A--AGAATC-----ANTT--------GC-----T----A-----G-AATN-TT-N-------TGCTTTAAC--TT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTTGGGCCATAAAT---ATTTA-T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATTTTTA---TCNGTT-TCNNTTGAATGNATTTTGA-ATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTACGTATAATAGTTNT--A--T--CTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--ATTTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAG---ATA---TAA---NTG--ATTTTATTTGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTTCTNANCNTT-ATTTAGTTTAGGTACGTTAAAAT-TTGAAAAAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TA---------------TAAT--TTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTTCNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTTCGATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAANATTT---A-ATTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCTTGNACCCATTTNGCTCTTGATCTTATTTTNATGCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TGATTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCN--AGNTTTTCAATTTC-T-TN-TA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGATCTTNT--TGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATNGTTTTTCCCCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCATT--TAT----ATCAAAT-TCTANATCTTC-----GTTTGCAACANTATTTGTGTCANTAT-TAAA--TN----G---TTT-CTT-TNACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTTA-TTTCNTCGACATANTTTGTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTCANTTTCCAATACGATCTTCCTTTTTTAAACTTNCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTANCGAATGATCTGTTCTGTANCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAAATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGC--TTTCTTTTGAGNGTTTTTTTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCTCGCCAGCAATCNATTAAATTACATTCA--------ATTAATAANNCTT-A-A-AN-ACTT----TCC-CTAGCNTTNGGATTATTTATATTNACATAATCANA-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCNATGATGGTTA--A--AGAATC-----ANTT--------GC-----T----A-----G-AATC-TT-C-------TGCTTTAAN--TT-AT-CATAAAAGACAGGNTCATCTTTATTTGGGCCATAAAT---ATTTA-T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATTTTNA---TCNGTT-TCTNTTGAATGNATTTTGA-ATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCAACNCCTCTAGACTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTACGTATAATAGNTAT--A--T--CTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--ATNTTTACTTTTG-AGAAAATNAAA-NGTATCTTTTCGTTTATTTTTATCNCCAAGNCCTTGNACATTCA-TAG---ATA---TAA---CTGAAATNTTATTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TA---------------TAAT--TCTTCAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAAATATTTCG-A-GTT-------CTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-TA-TA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTTGT--TGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACT--TAT----ATTAAAT-TGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCAGTAT-TAAA---A----G---TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTTA-TTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGC--TTTCTTTTGAGAGTTTTTTTT--AAA------CCATGTG-AA-T--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATCCA--------ATCATTAAATCTT-G-A-AG-ACTT----TTT-CGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCAAA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGAATC-----AGTT--------GC-----T----A-----G-AATC-TT-C-------TGCTTTAAG--TT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTTGGGCCATAGAT---GTTTA-T--AAG-T-T-TAATTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTGG---TCTGTT-TCCACTGAATGAACTTTGA-ATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTACGTATAACAGGTAT--A--T--CTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--ATGTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAG---ATA---TAA---TTGAAATATTACTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTCA--------TACCCCCACTGAGTACGTAT-ATAATTA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT-TTTCCTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAG---ATG---TTA---CT------TTATTTGTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-TC-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCTTCT--TGTTTTT-AAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTGTA---AT----ATCTAGC-ATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAA--TTTTG-A---TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATACCAAGA--TAAAAAAT-A--ATT-ATCCTCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC-----CATTTTA---TTTGTATT--AAGACGTCTCCAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATTC---------ATTTATAGTACTTAA-A-AC-ATTT----TCC-CTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--A--AGaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGC--TTTTTTATTAGTGTTTTTTCG--AAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGACGAAATCACAATCA--------AA-AATTGTTTTT-AGA-AC-AACT----TCC-CTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCATA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GCAAT------TA--A--AGA-TA-----AATT--------AT-----C----T-----G-AATC-TT-TAATTCCATTCTTCAAT--TG-TT-TATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTAGGACCATATAT---ATTTATT--AAG-T---TAAATCTTTTA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATTA---TCAGTG-GTTTTTGAATGTAATTTAA-AATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAAACATTCA--------AACCCTCATTCAATACGTATAAT-GTTCTC-A--T--CTTT---TTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--ATTTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAGTATA---TAG---TT---ATTTTATTTGTCAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TA---------------TAAT--TTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGTATCT---A-G------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT-TCT--TATATCATTTA-A--TTCTTGT---CT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCTTGT--CTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATT--TAT----TTCTAAT-TCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATGTGTAAATGTT----GCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTTA-TTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tTCTATTAAGTTAAATTCA--------CTTCTTAAA-CTT-A-A-A--ACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--A--GATGTC------CTT--------CC-----TCCGAG-----G-AAGCATT-A-------TG---TAAC--TG-GT-TATAAA--------------CTATT--GGTCATCAATTTTATTTA-TC-AAT-T-T-TATTCTTTTT--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTTA---TCTGAA-GATATTGAGAGTAGTTTAC-ATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGT-ATAGATGT--T--T--CCGCCATGTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TTATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAG---ATGCTTTAT---TT---ATTTTATTGGTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTA----ATGA---GTTTTGT-TTCTGCTTCA---TTT-A-AA---------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGA--TTTCAT----GTGTTTTCTTTGTAAA------CCATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -------TGCTT-AAC--AT-ATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTTGGACCATAAAT---ATTTA-C--AAGAA-A-TAG-TTCCTTA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAATATCATT---------GGTTGTCAATTGAGAGAATTT--A-ATGCAAAATAATatgtatttaatcattcactttattagataacgtttatcaatattaccagatgcgacacaggtttaaaaaaaaccactataataaatgggtcacatctggataaaagggaatgcttaacatatgtataaaagagaggatcgtctttatttggaccataaatatttacaagaaatagttccttatcacaaatggctgttcctaaaaataatgtaatatcattggttgtcaattgagagaatttaatgcaaaataat
gi|16                         : ttgagagagaattattcattctctactgtgagtttccgtccataaatttaccaattccgattttagaagaattaatgagttttgtttctgcttcatttaaaaatgttaaaagtgagtctgagatttaaaatatatctaatcttgatttcatgtgttttctttgtaaaccatgtataatatatcctttctaggttgtgggcacacaaacactctactaaatcacattatgtatttaatcattcactttattagataacgtttatcaatattaccagatgcgacacaggtttaaaaaaaaccactataataaatgggtcacatctggataaaagggaaGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTA--TTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATA---------------TAATGATTGCTAA--AAAA--TC--C-TTGCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGAT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atgtgaattgttTA------A--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAAA----T---A-ATTTGTAAC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTTTCT--TGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATCAAATCTTTACAattagcaaaaataatttgtaaccttttccgcttcatgcgaccatttagcttttgatcttatcttaatgccctctaattttttttgtcttaattcaaacagacttttttttttattttctaaactaactaaattaatatctaattgtttttcaagtctttcaatttcttttagaagtttagactcagttttattttcttgttttttaagaaaagatgaatatgatattgtttttccctgaatttccaatagtaacatttcaaaaaaaagttgatcgttactatcagcatcaaatctttacaaggtatgtc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                             atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaatAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATA---------------TAAT--GATTGAT--AAAAAATC-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGTTTGATATTAGC--GAAGGTGTA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAAA----T---A-ATTTGTAAC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTTTCT--TGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgtgaattgttgttcttgggtaATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCAGGGCCAAAGAT---ATAAA-C--AAG-A-AATA-TGTTCTTA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC---TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAATGTATTTTGA-ATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAATTTTAATAACATGTAT--T--T--CCTC---ATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--ATTTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCG---ATA---CGAAGGCT---ATTTTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tGTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACA-TCA-CCG---ATA---CAAAGGTTG---TTTTATTTGTCATcaata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TA---------------TAAT--TCTTTAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAAAAA------A-ATTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-TA-TA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTTGT--TGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACT--TAT----ATTAAAT-TGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCATTAT-TAAA---A----G---TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTTA-TTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGC--TTTCTTTTGAGAGTTTTTTTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATTCA--------ATCAATAAATCTT-G-A-AG-ACTT----TTT-CGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCACA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGAATC-----AGTT--------GC-----T----A-----G-AATC-TT-C-------TGCTTTAAG--TT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTTGGGCCATAGAT---GTTTA-T--AAG-T-T-TATTTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTGG---TCTGTT-TCCACTGAATGTACTTTGA-ATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTACGTATAACAGGTAT--A--T--CTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--ATGTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAA---ATA---TAA---TTGAAATATTACTCGTCATTTAAGATATGCACTTAAAAA-TAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAATTT-AAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TC-----AGTT--------GC-----T----A-----G-GATG-TTAC---------CATCAGG--TT-AA-CATTGAA-ATAGGAGTTTCTTATTTTGGGCCATAA--------TG-T--ACC-T-G-TAATTGTTTTA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTCGT---ATAGATTT--T--T--CCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CTTTTTAtttca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATA---------------TAAT--GATTGATCAAAAA--TC-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGATATTAGC--GAAGGTATA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAAA----T---A-ATTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATTTCT--TGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTT--AAT----ATCTAGC-ATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAA--TTTTG-A---TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTAA-TTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-T-A-CTATCC---TCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGCCATTTTATTTG-------TATTT--AGACGTCT-CCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATTC---------ATTAATAATACTTAA-A-AC-ATTT----TCC-CTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT----------ATC-----ATTT--------CCA----T----ATCTATC-AATG-TC-T-------TG-TTTAAC--CC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TTGGTCCATACAT---ATTTA-TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTATA---TCACCT-TCAGTTTTATGTATTTTGT-ATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCACGTAT-ATAATTTTC-A--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGATTTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTG---AAA---TAA---AGGTTACCTTATGAGTCATTtg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATTCA---------TTAATAATACTT-A-A-AACATTT----TCC-CTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT----------ATC-----ATTT--------CCATATCT----A-----TCAATG-TC-T-------TG-TTTAAC--CC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTGTT-GGTCCATACAT---ATTTA-TCGAAG-T-CATCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTATA---TCACCT-TCAGTTTTATGTATTTTGT-ATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCACGTAT-ATAATTTTC-A--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGATTTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTG---AAA---TAA---AGGTTACCTTATGAGTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TC---------------TAAT--TTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGTATCT---A-G------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTATTGT---TT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-CA-TA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATT--TTT----TTCTAAT-TCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATATGTAAA--TGTTGCG---TTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTTA-TTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTT-A-CTGT-A---TTTATATCTGT---TAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGC--TTTCTTT-GACGAATTTTTTT--AAA------CCAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATTTACCCATTACATTAATAAG-------A-AC-ATTT--------CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTAAA-AC-AATCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--A--CAAATCGTCATAAT----------C-----T----A-----A-AATG-TC-A-------T-TTTTAAGGGTT-GT--ATAAAACATTGGATCATCCCTATTTGGGCCATAAAC---ATTAA-T--AAG-T-G-TAATTTCTTTA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTTG---TCAGGT-TCTACCGCATGAATTTTAA-ATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTACGTAT-ATAATTA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT-TTTCCTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAG---ATG---TTA---CT------TTATTTGTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttAAAGTACATTCA---------TTAATAAA-CTT-A-ACAC-ATTT----TTC-CTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTATGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT----------ATC-----ATTTCCATAGCAAC-----T----A-----GCAATG-TC-T-------TG-TTCAAC--AC-ATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTTGGTCAATAATT---ATTTA-TTTATG-T-CATTCTTTTCTCA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTATA---TCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCTT--AAA-TT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCACGTATA-TAATTTTTCA--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAATATGATATT---GTTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAG---A-A---TAA---aatgttatataaaatggac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TA---------------CAAT--TTTTTAT--AAAA--TAATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CATTA---------CT--AGTTCTA------A--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGAATTT---AGATTT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TATA-TA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATTTTT--TTTTTTTTGA---AAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATT--TAT----ACTAAAT-TCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAA--TG----A---TTTTCTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTTA-TTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGT-AACTTT-A---TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGC--TTTCTTTTGCGTATTCTTTTT--GAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATTCC--------GCCATTTATACTA-A-T-AC-AGTA----TTT-CGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCAAA-GC-AATCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TA--AGAAGAATC-----TTTA--------GC-----T----A-------AATT-TT-T-------TTTTTGAAT--TTGAT-TATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTAGGACCATAAAT---ATTAA-T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAATTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTGA---TCCGTT-TCTTTGGAGTGAATATTAA-ATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGCGTATGGTA-TTA---A--TTACTTT---ATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAaggttaccttttcagtcattatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAATTTTTTATAAAATAAT--T---------G-----------TGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTA---------CT--AGTTCTAATGTTTA--T------CA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAAAATTTTAGA-ATAT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA----TA------------------------------TAT-------A---AA--TTTTCCTCCC------TTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------TTCT--TG---------AAA-GATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATT--TAT----GCTAAAT-TCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAA--TT----AT--TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTTA-TTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAA-CTTT-A---TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGC--TTTCTTTTGCGTATTCTTTTT--GAA------TCATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCC--------GCCATTAATTCTA-A-T-AC-AGTA----TTT-CGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCAAA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGA--AGAATC-----TTTA--------GC-----T----A-----A-AATA-TT-A-------T-TTTTAAT--TTGAT-TATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTAGGACCATAAAT---ATTAA-T--GAG-A-G-TATTTTTTTTATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTGA---TCCGTT-TCTTTGGAGTGAATATTAA-ATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCA--------TACCCCCACTGAGTACTTAT-ATAATTA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--ATTTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAG---ATG---CAA---ATGTTACTTTATTTGTCATagattgcctgcattca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               1                       1             11       11            33333333333333333333                         222222                       111       222222      11     555555555555        444444444444444       3333                                    777777777777777777777                                                              111                                       555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                       22222        1111         111111    33333333       1                                                                                                                                                                                  1111111111                     444444444                                    11111                 222222            11                                    11111             2222222222       11   1111111111                                         22222222                                                 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555         1111111    222222222                                              11111   11111              1111         111                                                                                                        11111                        11111111                    333333333333333       111                                       111              11                                                             33333333333333333                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                               3            1  0 1  1  3      1    8 22       22    0       33333333333333333333      66 0     66    66  000000          11   333     888    8  111111    1 88     333333333333     1  777777777777777       4444                 777   4    4     4 555555555555555555555            1  1 1      1    0      1     8  1   8            555     77   22  8 55       777  777  4   666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666              222222  2  4  11  333   44   33    55    0     666               1  1        1        1    11              1        0        1              22222     44 7777       3 888888    00000000 1 5   0 1 6      1        11 6   5 5    1      5     1  4     1   1          1  3        1 1            0                 1                   22    22        0       11           999 5 6666666666        777777    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  1      22222 2      4   66   333333       4    22    444               1 0         1 00000             0000000000 0 1   11   3333333333  1   00 1   1  1        1     1       5 99999999     3 8888     1 2   0 00     0      555  1  0  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  3 1  1 7777777    111111111       8888  2  0        99  0     0 555      22222   88888  4        6  3333 11      000     2  2 0      1       88888   1   3  22      3 1     0                    0     1  1  1          44  33333      0   44            11111111  1                 555555555555555 44    000   5        1         6        1  3    000  44    8 2   11       22  44      1                0     2     0       3    22222222222222222        555                   1     7                1                                    1                                                                                                  1                         1                  5                                1                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               .            .  . .  .  .      .    . ..       ..    .       ....................      .. .     ..    ..  ......          ..   ...     ...    .  ......    . ..     ............     .  ...............       ....                 ...   .    .     . .....................            .  . .      .    .      .     .  .   .            ...     ..   ..  . ..       ...  ...  .   ......................................................  .      ...              ......  .  .  ..  ...   ..   ..    ..    .     ...               .  .        .        .    ..              .        .        .              .....     .. ....       . ......    ........ . .   . . .      .        .. .   . .    .      .     .  .     .   .          .  .        . .            .                 .                   ..    ..        .       ..           ... . ..........        ......    .  .........     .    . . .  .  .     .  .      ..... .      .   ..   ......       .    ..    ...               . .         . .....             .......... . .   ..   ..........  .   .. .   .  .        .     .       . ........     . ....     . .   . ..     .      ...  .  .  ..............................................................  . .  . .......    .........       ....  .  .        ..  .     . ...      .....   .....  .        .  .... ..      ...     .  . .      .       .....   .   .  ..      . .     .                    .     .  .  .          ..  .....      .   ..            ........  .                 ............... ..    ...   .        .         .        .  .    ...  ..    . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .    .................        ...                   .     .                .                                    .                                                                                                  .                         .                  .                                .                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               3            0  7 0  0  3      0    9 11       22    1       22222222222222222222      11 1     11    11  777777          99   000     777    9  333333    0 33     999999999999     0  999999999999999       4444                 888   4    4     4 888888888888888888888            0  0 0      4    6      4     8  0   0            333     33   00  0 55       000  000  0   222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0      666              333333  0  0  00  999   88   00    55    8     111               4  4        0        4    99              0        7        0              22222     55 2222       2 000000    00000000 1 0   0 2 5      0        22 5   0 0    0      0     0  2     0   0          0  1        0 0            5                 0                   00    00        5       66           666 0 0000000000        111111    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  9      44444 2      4   11   999999       4    22    222               0 1         2 00000             9999999999 1 7   88   7777777777  0   99 0   0  0        7     0       0 77777777     6 5555     0 9   1 55     8      888  0  8  55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555  3 0  0 4444444    222222222       6666  1  1        66  7     2 444      22222   44444  0        2  1111 22      888     0  2 2      7       11111   0   3  00      3 0     8                    5     0  0  0          00  77777      4   66            22222222  0                 444444444444444 22    888   1        0         2        3  5    333  66    0 1   55       00  66      0                9     9     8       3    55555555555555555        888                   0     3                0                                    0                                                                                                  0                         0                  5                                0                                                                                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTAA--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--A-GTTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTA-----TCAAATTACATTCA--------ATTAATAATNCTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTNGGATTATTTATATTNACATAATCACG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----AN---TT--------G---C-----T----A-----G-AA-TGTCNTGCT----TTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAA---TATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTACGTATAATAAT-TNT--A--T--CTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA--TA-AATG-TA--TTTTATTT---GTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTAA--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--A-ATTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTANNGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTA-----TCAAATTACATTCA--------ATTAATAANNCTT-A-A-A----CANTTTCCCTAGCNTTNGGATTATTTATATTNACATAATCACG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCNATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----AN---TT--------G---C-----T----A-----G-AA-TNTTNTGCT----TTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAA---TATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATTTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GNATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTACGTATAATAGT-TNT--A--T--CTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA--TA-ANTG--A--TTTTATTT---GTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTCAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTAA---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-ATA--TTTCGA-GTT-------CTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCAGTAT-TAAA----A-G-TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTG-----TCAAATTACATCCA--------ATCATTAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCAAA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----AG---TT--------G---C-----T----A-----G-AA-TCTTCTGCT----TTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTT-GGGCCATAGA---TGTTTA--T--AAG-T-T-TAATTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GAACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTACGTATAACAGG-TAT--A--T--CTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGA-TA--TA-ATTG--AAATATTACTC---GTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atTCA--------TACCCCCACTGAGTACGTAT-ATAAT-TA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-T-------GTT--A--CTTTATTT---GTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-CTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCTT--CTTG-TTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTG-TAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CAT--T-TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATACCAAGA--TAAAAAAT-A--ATT-ATCCTCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGT-ATT--AAGACGTCTCCAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTG-----TCAAATTACATTC---------ATTTATAGTACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--A--AGaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGCTTTTTTA--TTAGTGTTTTT-TCG--AAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGA-----CGAAATCACAATCA--------AA-AATTGTTTTT-AGA-A----CAACTTCCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCATA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GCAAT------TA--A--AGATAAATT-----AT---CT--------GAATC-----T----T-----T-AA-TTCCATTCT----TCAA--TTG-TT-TATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTA-GGACCATATA---TATTTAT-T--AAG-T---TAAATCTTTTA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATT----ATCAGTG-GTTTTTGAAT-GTAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAAACATTCA--------AACCCTCATTCAATACGTATAAT-GT-TCTC-A--T--CTTT---TTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--AT--TTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAGTA--TATAGTT--A--TTTTATTT---GTCAT
gi|13                         :                                                                                     aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTAAACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--A-G------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT---TCTTATATCATTTA-A--TTC-TTG---TC---TC-TTAATTTCA------AT---AGTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCTT--GTCTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATTTATTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATGTGTAAATGTTGCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTCTA-----TTAAGTTAAATTCA--------CTTCTTAAA-CTT-A-A-AACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--A--GAT---GTC------C---TT--------C---C-----TCCGAG-----G-AAGCATTATG-------TAA--CTG-GT-TATAAA--------------CTATT---GGTCATCAATTTTATTTA--TC-AAT-T-T-TATTCTTTTT--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTT----ATCTGAA-GATATTGAGA-GTAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGT-ATAGA-TGT--T--T--CCGCCATGTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TT--ATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAGA-TGCTTT-ATTT--A--TTTTATTG---GTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTAATGA-------GTTTTGT-TTCTGCTTCA---TTT-A-AA---------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGATTTCAT------GTGTTTTC-TTTGTAAA------CCATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATTATGT-----------ATT--TAATCATT----------CACTTTAT-TAG-ATAACGTTTATCAATATTACCA-GAT-GCG-AC-A--------C-A-GGTTTAAAAA-------AAA-----CC---ACTATAATA---A--A--TGG---GTC-----ACATCTG--------G---A-----T----A-----A-AA-GGGAATGCT----T-AA--CAT-ATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTT-GGACCATAAA---TATTTA--C--AAGAA-A-TAG-TTCCTTA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAATATCATT----------GGTTGTCAATTGAGA-GAATTT--AATGCAAAATAAT
gi|16                         :                                                                                                                     GTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTA--TTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGCTAA--AAAA--TC--C-TTGCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGAT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgtgaattgttTAA--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAA-A------T--A-ATTTGTAAC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATC-AAATCTTT-----attagcaaaaataatttgtaaccttttccgcttcatgcgaccatttagcttttgatcttatcttaatgccctctaattttttttgtcttaattcaaacagacttttttttttattttctaaactaactaaattaatatctaattgtttttcaagtctttcaatttcttttagaagtttagactcagttttattttcttgttttttaagaaaagatgaatatgatattgtttttccctgaatttccaatagtaacatttcaaaaaaaagttgatcgttactatcagcatcaaatctttacaaggtatgtc
gi|17                         : atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaatAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGAT--AAAAAATC-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGTTTGATATTAGC--GAAGGTGTA----------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--A-ATTTGTAAC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAacaaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatgtgaattgttgttcttgggta-TATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCA-GGGCCAAAGA---TATAAA--C--AAG-A-AATA-TGTTCTTA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC----TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAAT---TTTAATAACATGT--ATTT--CCTC---ATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--AT--TTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCGA-TA--CG-AAGGCTA--TTTTATTT---G
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACA-TCA-CCGA-TA--CA-AAGGTTG--TTTTATTT---GTCATcaata
gi|2                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTTAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTAA---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-A-A--A----A-ATTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCATTAT-TAAA----A-G-TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTG-----TCAAATTACATTCA--------ATCAATAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCACA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----AG---TT--------G---C-----T----A-----G-AA-TCTTCTGCT----TTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTT-GGGCCATAGA---TGTTTA--T--AAG-T-T-TATTTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GTACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTACGTATAACAGG-TAT--A--T--CTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAAA-TA--TA-ATTG--AAATATTACTC---GTCATTTAAGATATGCACTTAAAAA-TAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAATTT-AAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TC-----AG---TT--------G---C-----T----A-----G-GA-TGTTACCATCAGGTTAA--C---AT-TGAAATAGG-AGTTTC----TTATTTTGGGCCATAA--------TG--T--ACC-T-G-TAATTGTTTTA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTCGTATA--GAT-TTT-----T--CCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CT--TTTTtttca
gi|3                          :                                                                                                                    AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGATCAAAAA--TC-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGATATTAGC--GAAGGTATA----------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--A-ATTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTA-ATTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-T-A-CTATCC---TCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGTATTT--AGACGTCT-CCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTG-----TCAAATTACATTC---------ATTAATAATACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----AT---TT--------C---CA----T----ATCTATC-AA-TGTCTTG-T----TTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACA---TATTTA--TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCACGTAT-ATAAT-TTTC-A--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA--TA-AAGGTTA--CCTTATGA---GTCATTatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATTCA---------TTAATAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTATGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----AT---TT--------C---CATATCT----A-----TCAA-TGTCTTG-T----TTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTGTT--GGTCCATACA---TATTTA--TCGAAG-T-CATCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCACGTAT-ATAAT-TTTC-A--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA--TA-AAGGTTA--CCTTATGA---GTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                                                                                                  TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TCTAAT--TTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTAAACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--A-G------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTATTGT---TT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-C-ATA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATTTTTTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATATGTAAATGTTGCG-TTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTT-A-CTGT-A---TTTATATCTG---TTAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGCTTTCTTTGACGAA---TTTT-TTT--AAA------CCAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAA-----TTAAATTACATTTACCCATTACATTAATAAG-------A-A----CATTT---CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTAAA-ACAA-TCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--A--CAA---ATCGTCATAA---T-------------C-----T----A-----A-AA-TGTCAT-TT----TTAAGGGTT-G--TATAAAACATTGGATCATCCCTATTT-GGGCCATAAA---CATTAA--T--AAG-T-G-TAATTTCTTTA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTT----GTCAGGT-TCTACCGCAT-GAATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTACGTAT-ATAAT-TA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-T-------GTT--A--CTTTATTT---GTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttAAAGTACATTCA---------TTAATAAA-CTT-A-ACA----CATTTTTCCTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTATGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT-------------ATC-----AT---TTCCATAGCAA---C-----T----A-----GCAA-TGTCTTG-T----TCAA--CAC-ATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTT-GGTCAATAAT---TATTTATTT--ATG-TCA-TTCTTTTCTCA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTAT----ATCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCT---TAAATT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCACGTAT-ATAAT-TTTTCA--T--CTTT---GCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAAT---ATGATATTG--TTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAGA--A--TA-AA-G--G--TTACCTTTTCAGTCATTaatgttatataaaatggac
gi|7                          :                                                                            tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--TAATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CATTA---------CT--AGTTCTAA--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGA-A--TTT--AGATTT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TAT-ATA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATTT--TTTTTTTTTT---GAAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATTTATACTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATGAT----TTT-CTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGT-AACTTT-A---TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAA-----TTAACTTACATTCC--------GCCATTTATACTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCAAA-GC-AATCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TA--AGAAGA---ATC-----TT---TA--------G---C-----T----A-------AA-TTTTTTTTT----TGAA--TTTGAT-TATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAA---TATTAA--T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAATTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGCGTATGGTA-T-TA---A--TTACTTT---ATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                                                                                                     TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--TAATT-GTGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTA---------CT--AGTTCTAA--TGTTTATCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-AATTTT--A-GAAT---A--TTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA-------------------TA--TA-------------T-------A---AA--TTTTCCTCC------CTTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------TT--CTTG----------AAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATTTATGCTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATTAT----TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAA-CTTT-A---TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------TCATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAA-----TTAAATTACATCCC--------GCCATTAATTCTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCAAA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGA--AGA---ATC-----TT---TA--------G---C-----T----A-----A-AA-TATTAT-TT----TTAA--TTTGAT-TATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAA---TATTAA--T--GAG-A-G-TATTTTTTTTATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCA--------TACCCCCACTGAGTACTTAT-ATAAT-TA---ACTT--CTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG--CA-AATGTTA--CTTTATTT---GTCATagattgcctgcattca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               1                       1             11       11            33333333333333333333                     22222222222                       111       222222      11     555555555555        444444444444444444444       3333                                    777777777777777777777                                                              111                                       555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                       22222        1111         111111    33333333       1                                                                                                                                                                                  111111111                     444444444                                    11111                 111111111111           11                                                 2222222222                  1111                                         333333333333                                                 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555           22222     222222222                                                 11   11111              1111         111                                                                                                        11111                        11111111                         11       3333333                                               111              11                                                                  222222                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                                               3            1  0 1  1  3      1    8 22       22    0       33333333333333333333      66 0     66    00000000000          11   333     888    8  111111    1 88     333333333333     1  777777777777777777777       4444                 777   4    4     4 555555555555555555555            1  1 1      1    0      1     8  1   8            555     77   22  8 55       777  777  4   666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666              222222  2  4  11  333   44   33    55    0     666               1  1        1        1    11              1        0        1              22222     44 7777       3 888888    00000000 1 5   0 1 6      1        11 6   5 5    1      5     1  4     1   1          1  3        1 1            0                 1                   22    22        0       11           999 5 666666666        777777    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  1      22222 2      4   66   555555555555      4    22    444               1 0         1  0           0000000000 4 1   99   3 3 3 3333       0 1   2  1              1 0     0 666666666666     3 8888     1 2   0 00     0      555  3 0   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     555 1 33333     111111111       8888  2  0        55  0     0  555     44 44   88888  4        6  3333 11      000     2  2 0      3       88888   1   3  22      3 1     0                    0     1  1  1          44  33333      0   44            11111111  1             44   555 66     3 4444444    9999   5        1         6        1  3    000  44    8 2   11       22  44      1                0     2     0       3    3  3 666666 3 0 3     2                   88                     1                                    1                                                                                                  1                         1               5                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               .            .  . .  .  .      .    . ..       ..    .       ....................      .. .     ..    ...........          ..   ...     ...    .  ......    . ..     ............     .  .....................       ....                 ...   .    .     . .....................            .  . .      .    .      .     .  .   .            ...     ..   ..  . ..       ...  ...  .   ......................................................  .      ...              ......  .  .  ..  ...   ..   ..    ..    .     ...               .  .        .        .    ..              .        .        .              .....     .. ....       . ......    ........ . .   . . .      .        .. .   . .    .      .     .  .     .   .          .  .        . .            .                 .                   ..    ..        .       ..           ... . .........        ......    .  .........     .    . . .  .  .     .  .      ..... .      .   ..   ............      .    ..    ...               . .         .  .           .......... . .   ..   . . . ....       . .   .  .              . .     . ............     . ....     . .   . ..     .      ...  . .   .........................................................     ... . .....     .........       ....  .  .        ..  .     .  ...     .. ..   .....  .        .  .... ..      ...     .  . .      .       .....   .   .  ..      . .     .                    .     .  .  .          ..  .....      .   ..            ........  .             ..   ... ..     . .......    ....   .        .         .        .  .    ...  ..    . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .    .  . ...... . . .     .                   ..                     .                                    .                                                                                                  .                         .               .                                   .                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               3            0  7 0  0  3      0    9 11       22    1       22222222222222222222      11 1     11    22222222222          99   000     777    9  333333    0 33     999999999999     0  999999999999999999999       4444                 888   4    4     4 222222222222222222222            0  0 0      4    6      4     8  0   0            333     33   00  0 55       000  000  0   222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0      666              333333  0  0  00  999   88   00    55    8     111               4  4        0        4    99              0        7        0              22222     55 2222       2 000000    00000000 1 0   0 2 5      0        22 5   0 0    0      0     0  2     0   0          0  1        0 0            5                 0                   00    22        5       66           666 0 000000000        111111    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  9      44444 2      4   11   777777777777      4    22    222               0 1         2  5           9999999999 2 7   88   3 3 3 8888       1 0   2  0              0 1     8 888888888888     6 5555     0 9   1 55     8      888  8 8   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     888 0 22222     222222222       6666  1  1        88  7     2  444     22 66   44444  0        2  1111 22      888     0  2 2      6       11111   0   3  00      3 8     8                    5     0  0  0          00  77777      4   66            22222222  0             22   444 77     1 5555555    1111   1        0         2        3  5    333  66    0 1   55       00  66      0                9     9     8       3    3  3 666666 3 7 3     0                   33                     0                                    0                                                                                                  0                         0               5                                   0                                                                                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNTA---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATTCA--------ATTAATAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAAAGG-T-ACT-TTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNTA---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATTCA--------ATTAATAATNCTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTNGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAAATG-T-ATT-TTATTTGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTCAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-ATA--TTTCGAG-TT-------CTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCAGTAT-TAAA----A-G-TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGTA---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATCCA--------ATCATTAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----AA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TAATTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GAACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGA-TA-TAATTG-A-AATATTACTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T------T-ACT-TTATTTGTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-CTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCTT--CTTG-TTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTG-TAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CAT--T-TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATACCAAGA--TAAAAAAT-A--ATTATCCTCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGT-ATT--AAGACGTCTC-----CAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATTC---------ATTTATAGTACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--A--AGaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGCTTTTTTA--TTAGTGTTTTT-TCG--AAA------C-----CATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGACGAAATCACAATCA--------AA-AATTGTTTTT-AGA-A----CAACTTCCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCA----TA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GC------AATTA--A--AGATAAATT-----A---TCT--------GAATC-T---T-----T-AATTC---CAT---TCTTCAA--TTG-TT-TATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTA-GGACCATATAT---ATTTA--TT-AAG-T---TAAATCTTTTA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATT----ATCAGTG-GTTTTTGAAT-GTAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACTA--AAAAA-CATTCA--------AACCCTCATTCAATAC--GTA---TA-ATGTT-CTC--A--TCTTT---TTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--AT--TTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAGTA-TATAGT-T-ATT-TTATTTGTCAT
gi|13                         :                                                                                     aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT---TCTTATATCATTTA-A--TTC-TTG---TC---TC-TTAATTTCA------AT---AGTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCTT--GTCTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATTTATTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATGTGTAAATGTTGCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tTCTATTAAGTTAAATTCA--------CTTCTTAA-ACTT-A-A-AACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT----------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--A--GAT---GTC---------CTT--------C---C-TCCGA-----G-GAAG----CAT---TATGTAA--CTG-GT-TATAAA--------------CTATT---GGTCATCAATTTTATTTA--TC-AAT-T-T-TATTCTTTTT--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTT----ATCTGAA-GATATTGAGA-GTAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGTA---TAGATGTT-TCC--G--CCAT----GTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TT--ATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAGA-TGCTTTATT-T-ATT-TTATTGGTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTAATGA-------GTTTTGT-TTCTGCTTCA---TTT-A-AA--------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGATTTCAT------GTGTTTTC-TTTGTAAA------C-----CATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATT----------AT-----GTATTT-A-A-T----CATTCACTTTA----TTAGATAACGTTTATCAATATTACCAGATGCG-AC-A--------C-A-GGTTTAAAAA-------AAA-----CC---ACTATAATA---A--A--TGG---GTC-----ACATCTG--------G---A-T---A-----A-AAGGG---AAT---GC-TTAA--CAT-ATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTT-GGACCATAAAT---ATTTA--C--AAGAA-A-TAG-TTCCTTA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAAT---ATC-------ATTGGTTGTCAATTGAGA-GAATTT--AATGCAAAATAAT
gi|16                         :                                                                                                                     GTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTA--TTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGCTAA--AAAA--T-C--C-TTGCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGAT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgtgaattgttTA------A--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATC-AAATCTTT-----attagcaaaaataatttgtaaccttttccgcttcatgcgaccatttagcttttgatcttatcttaatgccctctaattttttttgtcttaattcaaacagacttttttttttattttctaaactaactaaattaatatctaattgtttttcaagtctttcaatttcttttagaagtttagactcagttttattttcttgttttttaagaaaagatgaatatgatattgtttttccctgaatttccaatagtaacatttcaaaaaaaagttgatcgttactatcagcatcaaatctttacaaggtatgtc
gi|17                         : atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaatAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGAT--AAAAAAT-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGTTTGATATTAGC--GAAGGTGTA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAacaaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatgtgaattgttgttcttgggta-TATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCA-GGGCCAAAGAT---ATAAA--C--AAG-A-AATA-TGTTCTTA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC----TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAAT-----TT---TA-ATAACATGT--ATTTCCTC---ATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--AT--TTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCGA-TA-CGAAGGCT-ATT-TTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACAT-CA-CCGA-TA-CAAAGG-TTGTT-TTATTTGTCATcaata
gi|2                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTTAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-A-A--A----AA-TTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCATTAT-TAAA----A-G-TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGTA---TCAATATCCATCATTAAACATG----T-T-GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATTCA--------ATCAATAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----CA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TATTTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GTACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAAA-TA-TAATTGAA-ATA-TTACTCGTCATTTAAGATATGCACTT-AAAAATAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAA-TTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TC-----A---GTT--------G---C-T---A-----G-GATGTTACCATCAGG--TTAA--C---AT-TGAAATAGG-AGTTTC----TTATTTTGGGCCATAA--------TG--T--ACC-T-G-TAATTGTTTTA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTC--GTA---TA---GAT-TTT-----TCCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CT--TTTTtttca
gi|3                          :                                                                                                                    AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGATCAAAAA--T-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGATATTAGC--GAAGGTATA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTA-ATTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-T-A-CTATCC--TCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGTATTT--AGA------CGTCTCCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATTCA---------TTAATAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CAT---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAAAGGTT-ACC-TTATGAGTCATTatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATTCA---------TTAATAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CAT---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAAAGGTT-ACC-TTATGAGTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                                                                                                  TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TCTAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTATTGT---TT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-C-ATA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATTTTTTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATATGTAAATGTTGCG-TTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTT-A-CTGTA---TTTATATCTG---TTAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGCTTTCTTTGACGAA---TTTT-TTT--AAA------C-----CAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATTTACCCATTACATTAATAA------G-A-A----CATTT---CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTA----AA-ACAA-TCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--A--CAA---ATCGTCATA---AT-------------C-T---A-----A-AATGT---CAT----TTTTAAGGGTT-G--TATAAAACATTGGATCATCCCTATTT-GGGCCATAAAC---ATTAA--T--AAG-T-G-TAATTTCTTTA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTT----GTCAGGT-TCTACCGCAT-GAATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T------T-ACT-TTATTTGTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttAAAGTACATTCA---------TTAATAA-ACTT-A-ACA----CATTTTTCCTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTA----TGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT-------------ATC-----A---TTTCCATAGCAA---C-T---A-----GCAATGT---CTT---G-TTCAA--CAC-ATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTT-GGTCAATAATT---ATTTATTT--ATG-TCA-TTCTTTTCTCA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTAT----ATCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCT---TAAATT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTTCA--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAAT---ATGATATTG--TTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAGA--A-TAAAGGTT-ACC-TTTTCAGTCATTaatgttatataaaatggac
gi|7                          :                                                                            tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--T-AATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CATTA---------CT--AGTTCTA------A--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGA-A--TTT--AGATTT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TAT-ATA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATTT--TTTTTTTTTT---GAAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATTTATACTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATGAT----TTT-CTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGT-AACTTTA---TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------C-----CATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATTCC--------GCCATTTATACTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCA----AA-GC-AATCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TA--AGAAGA---ATC-----T---TTA--------G---C-T---A-------AATTT---TTT---TTTTGAA--TTTGAT-TATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAATTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGC--GTATGGTA-TTAAT-TA-------CTTT---ATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                                                                                                     TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATAT--G-AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--TAA-TT-GTGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTA---------CT--AGTTCTAATGTTTA--T------CA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-AATTTT--AG-AAT---A--TTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA-------------------TA--TA-------------T-------A---AA--TTTTCCTCC------CTTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------TT--CTTG----------AAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATTTATGCTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATTAT----TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAA-CTTTA---TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------T-----CATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCC--------GCCATTAATTCTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCA----AA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGA--AGA---ATC-----T---TTA--------G---C-T---A-----A-AATAT---TAT----TTTTAA--TTTGAT-TATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--GAG-A-G-TATTTTTTTTATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--TTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-CAAATGTT-ACT-TTATTTGTCATagattgcctgcattca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               1                       1             11       11            33333333333333333333                     22222222222                       111       222222      11     555555555555        444444444444444444444       3333                                    777777777777777777777                                                              111                                       555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                       22222        1111         111111    33333333       1                                                                                                                                                                                  1111111111                     444444444                                    11111                 222222            11                                                22222222222222                     1111                                         333333333333                                                 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555           22222     222222222                                              11111   11111              1111         111                                                                                                        11111                        11111111                         11       3333333                                               111              11                                                                  3333333333                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                                               3            1  0 1  1  3      1    8 22       22    0       33333333333333333333      66 0     66    00000000000          11   333     888    8  111111    1 88     333333333333     1  777777777777777777777       4444                 777   4    4     4 555555555555555555555            1  1 1      1    0      1     8  1   8            555     77   22  8 55       777  777  4   666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666              222222  2  4  11  333   44   33    55    0     666               1  1        1        1    11              1        0        1              22222     44 7777       3 888888    00000000 1 5   0 1 6      1        11 6   5 5    1      5     1  4     1   1          1  3        1 1            0                 1                   22    22        0       11           999 5 6666666666        777777    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  1      22222 2      4   66   333333       4    22    444               1 0         1  0          11111111111111 2  555   7    666 3 0000     222 1   2  1              1 0     0 666666666666     3 8888     1 2   0 00     0      555  3 0   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     555 1 33333     111111111       8888  2  0        99  0     0  555     22222   88888  4        6  3333 11      000     2  2 0      3       88888   1   3  22      3 1     0                    0     1  1  1          44  33333      0   44            11111111  1             44   555 66     3 4444444    9999   5        1         6        1  3    000  44    8 2   11       22  44      1                0     2     0       3    3  3 0000000000  3      1                   88                     1                                    1                                                                                                  1                         1               5                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               .            .  . .  .  .      .    . ..       ..    .       ....................      .. .     ..    ...........          ..   ...     ...    .  ......    . ..     ............     .  .....................       ....                 ...   .    .     . .....................            .  . .      .    .      .     .  .   .            ...     ..   ..  . ..       ...  ...  .   ......................................................  .      ...              ......  .  .  ..  ...   ..   ..    ..    .     ...               .  .        .        .    ..              .        .        .              .....     .. ....       . ......    ........ . .   . . .      .        .. .   . .    .      .     .  .     .   .          .  .        . .            .                 .                   ..    ..        .       ..           ... . ..........        ......    .  .........     .    . . .  .  .     .  .      ..... .      .   ..   ......       .    ..    ...               . .         .  .          .............. .  ...   .    ... . ....     ... .   .  .              . .     . ............     . ....     . .   . ..     .      ...  . .   .............................................................     ... . .....     .........       ....  .  .        ..  .     .  ...     .....   .....  .        .  .... ..      ...     .  . .      .       .....   .   .  ..      . .     .                    .     .  .  .          ..  .....      .   ..            ........  .             ..   ... ..     . .......    ....   .        .         .        .  .    ...  ..    . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .    .  . ..........  .      .                   ..                     .                                    .                                                                                                  .                         .               .                                   .                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               3            0  7 0  0  3      0    9 11       22    1       22222222222222222222      11 1     11    22222222222          99   000     777    9  333333    0 33     999999999999     0  999999999999999999999       4444                 888   4    4     4 222222222222222222222            0  0 0      4    6      4     8  0   0            333     33   00  0 55       000  000  0   222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0      666              333333  0  0  00  999   88   00    55    8     111               4  4        0        4    99              0        7        0              22222     55 2222       2 000000    00000000 1 0   0 2 5      0        22 5   0 0    0      0     0  2     0   0          0  1        0 0            5                 0                   00    22        5       66           666 0 0000000000        111111    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  9      44444 2      4   11   999999       4    22    222               0 1         2  5          00000000000000 9  888   6    888 3 4444     999 0   2  8              0 1     8 888888888888     6 5555     0 9   1 55     8      888  8 8   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     888 0 22222     222222222       6666  1  1        66  7     2  444     22222   44444  0        2  1111 22      888     0  2 2      6       11111   0   3  00      3 8     8                    5     0  0  0          00  77777      4   66            22222222  0             22   444 77     1 5555555    1111   1        0         2        3  5    333  66    0 1   55       00  66      0                9     9     8       3    3  3 6666666666  7      0                   33                     0                                    0                                                                                                  0                         0               5                                   0                                                                                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAA---A-GG-TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAA---A-GG-TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTCAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-ATA--TTTCGAG-TT-------CTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCAGTAT-TAAA----A-G-TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATC---CA--------ATCAT---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----AA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TAATTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GAACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGA-TA-TAATTGA-AA-TA--TTACTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T----------TACTTTATTTGTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-CTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCTT--CTTG-TTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTG-TAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CAT--T-TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATACCAAGA--TAAAAAAT-A--ATT-ATCCTCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGT-ATT--AAGACGTCTCCAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATT---C---------ATTTA---TAGTACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--A--AGaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGCTTTTTTA--TTAGTGTTTTT-TCG--AAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGACGAAATCACAAT---CA--------AA-AA---TTGTTTTT-AGA-A----CAACTTCCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCA----TA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GC------AATTA--A--AGATAAATT-----A---TCT--------GAATC-----T---T-----T-AATTC---CAT---TCTTCAA--TTG-TT-TATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTA-GGACCATATAT---ATTTAT-T--AAG-T---TAAATCTTTTA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATT----ATCAGTG-GTTTTTGAAT-GTAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAAACATTCA--------AACCCTCATTCAATAC--GTA---TA-ATGTT-CTC--A--TCTTT---TTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--AT--TTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAGTA-TAT---A-GT-TATTTTATTTGTCAT
gi|13                         :                                                                                     aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT---TCTTATATCATTTA-A--TTC-TTG---TC---TC-TTAATTTCA------AT---AGTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCTT--GTCTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATTTATTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATGTGTAAATGTTGCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tTCTATTAAGTTAAATT---CA--------CTTCT---TAA-ACTT-A-A-AACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT----------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--A--GAT---GTC---------CTT--------C---C-----TCCGA-----G-GAAG----CAT---TATGTAA--CTG-GT-TATAAA--------------CTATT---GGTCATCAATTTTATTTA--TC-AAT-T-T-TATTCTTTTT--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTT----ATCTGAA-GATATTGAGA-GTAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGTA---TAGATGTT-TCC--G--CCAT----GTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TT--ATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAGA-TGCTTT---A-TT-TATTTTATTGGTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTAATGA-------GTTTTGT-TTCTGCTTCA---TTT-A-AA---------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGATTTCAT------GTGTTTTC-TTTGTAAA------CCATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATT-------------AT--------GTATTT-A-A-T----CATTCACTTTA----TTAGATAACGTTTATCAATATTACCAGATGCG-AC-A--------C-A-GGTTTAAAAA-------AAA-----CC---ACTATAATA---A--A--TGG---GTC-----ACATCTG--------G---A-----T---A-----A-AAGGG---AAT---GC-TTAA--CAT-ATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTT-GGACCATAAAT---ATTTA--C--AAGAA-A-TAG-TTCCTTA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAAT---ATC-------ATTGGTTGTCAATTGAGA-GAATTT--AATGCAAAATAAT
gi|16                         :                                                                                                                     GTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTA--TTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGCTAA--AAAA--T-C--C-TTGCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGAT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgtgaattgttTA------A--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATC-AAATCTTT-----attagcaaaaataatttgtaaccttttccgcttcatgcgaccatttagcttttgatcttatcttaatgccctctaattttttttgtcttaattcaaacagacttttttttttattttctaaactaactaaattaatatctaattgtttttcaagtctttcaatttcttttagaagtttagactcagttttattttcttgttttttaagaaaagatgaatatgatattgtttttccctgaatttccaatagtaacatttcaaaaaaaagttgatcgttactatcagcatcaaatctttacaaggtatgtc
gi|17                         : atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaatAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGAT--AAAAAAT-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGTTTGATATTAGC--GAAGGTGTA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAacaaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtgaattgttgttcttgggta-TATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCA-GGGCCAAAGAT---ATAAA--C--AAG-A-AATA-TGTTCTTA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC----TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAAT-----TT---TA-ATAACATGT--ATTTCCTC---ATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--AT--TTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCGA-TA-CGA---A-GGCTATTTTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACA-TCA-CCGA-TA-CAA---A-GGTTGTTTTATTTGTCATcaata
gi|2                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTTAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-A-A--A----AA-TTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCATTAT-TAAA----A-G-TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG----T-T-GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATT---CA--------ATCAA---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----CA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TATTTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GTACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAAA-TA-TAATTGA-AA-TA--TTACTCGTCATTTAAGATATGCACTT-AAAAATAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAA-TTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-GATGTTACCATCAGG--TTAA--C---AT-TGAAATAGG-AGTTTC----TTATTTTGGGCCATAA--------TG--T--ACC-T-G-TAATTGTTTTA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTC--GTA---TA---GAT-TTT-----TCCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CT--TTTTtttca
gi|3                          :                                                                                                                    AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGATCAAAAA--T-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGATATTAGC--GAAGGTATA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTA-ATTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-T-A-CTATCC---TCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGTATTT--AGACGTCT-CCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATT---C---------ATTAA---TAATACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CA----T---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAA---A-GGTTACCTTATGAGTCATTatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATT---CA---------TTAA---TAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CATATCT---A-----TCAATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTGTT--GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-T-CATCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAA---A-GGTTACCTTATGAGTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                                                                                                  TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TCTAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTATTGT---TT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-C-ATA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATTTTTTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATATGTAAATGTTGCG-TTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTT-A-CTGT-A---TTTATATCTG---TTAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGCTTTCTTTGACGAA---TTTT-TTT--AAA------CCAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATT---TACCCATTACATTAA---TAA------G-A-A----CATTT---CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTA----AA-ACAA-TCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--A--CAA---ATCGTCATA---AT-------------C-----T---A-----A-AATGT---CAT----TTTTAAGGGTT-G--TATAAAACATTGGATCATCCCTATTT-GGGCCATAAAC---ATTAA--T--AAG-T-G-TAATTTCTTTA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTT----GTCAGGT-TCTACCGCAT-GAATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T----------TACTTTATTTGTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttAAAGTACATT---CA---------TTAA---TAA-ACTT-A-ACA----CATTTTTCCTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTA----TGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT-------------ATC-----A---TTTCCATAGCAA---C-----T---A-----GCAATGT---CTT---G-TTCAA--CAC-ATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTT-GGTCAATAATT---ATTTATTT--ATG-TCA-TTCTTTTCTCA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTAT----ATCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCT---TAAATT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTTCA--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAAT---ATGATATTG--TTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAGA--A-TAA---A-GGTTACCTTTTCAGTCATTaatgttatataaaatggac
gi|7                          :                                                                            tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--T-AATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CATTA---------CT--AGTTCTA------A--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGA-A--TTT--AGATTT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TAT-ATA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATTT--TTTTTTTTTT---GAAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATTTATACTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATGAT----TTT-CTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGT-AACTTT-A---TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATT---CC--------GCCAT---TTATACTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCA----AA-GC-AATCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TA--AGAAGA---ATC-----T---TTA--------G---C-----T---A-------AATTT---TTT---TTTTGAA--TTTGAT-TATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAATTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGC--GTATGGTA-TTAAT-TA-------CTTT---ATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                                                                                                     TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATAT--G-AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--TAA-TT-GTGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTA---------CT--AGTTCTAATGTTTA--T------CA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-AATTTT--AG-AAT---A--TTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA-------------------TA--TA-------------T-------A---AA--TTTTCCTCC------CTTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------TT--CTTG----------AAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATTTATGCTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATTAT----TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAA-CTTT-A---TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------TCATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCCGCC--------ATTAATTCTAATAC-----A-G----TATTT---CGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCA----AA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGA--AGA---ATC-----T---TTA--------G---C-----T---A-----A-AATAT---TAT----TTTTAA--TTTGAT-TATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--GAG-A-G-TATTTTTTTTATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--TTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-CAA---ATGT-TACTTTATTTGTCATagattgcctgcattca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               1                       1             11       11            33333333333333333333                     22222222222                       111       222222      11     555555555555        444444444444444444444       3333                                    777777777777777777777                                                              111                                       555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                       22222        1111         111111    33333333       1                                                                                                                                                                                  1111111111                     444444444                                    11111                 222222            11                                                22222222222222                     1111                                         333333333333                                                 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555           22222     222222222                                              11111   11111              1111         111                                                                                                        11111                        11111111                         11       3333333                                               111              11                                                                  3333333333                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                                               3            1  0 1  1  3      1    8 22       22    0       33333333333333333333      66 0     66    00000000000          11   333     888    8  111111    1 88     333333333333     1  777777777777777777777       4444                 777   4    4     4 555555555555555555555            1  1 1      1    0      1     8  1   8            555     77   22  8 55       777  777  4   666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666              222222  2  4  11  333   44   33    55    0     666               1  1        1        1    11              1        0        1              22222     44 7777       3 888888    00000000 1 5   0 1 6      1        11 6   5 5    1      5     1  4     1   1          1  3        1 1            0                 1                   22    22        0       11           999 5 6666666666        777777    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  1      22222 2      4   66   333333       4    22    444               1 0         1  0          11111111111111 2  555   7    666 3 0000     222 1   2  1              1 0     0 666666666666     3 8888     1 2   0 00     0      555  3 0   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     555 1 33333     111111111       8888  2  0        99  0     0  555     22222   88888  4        6  3333 11      000     2  2 0      3       88888   1   3  22      3 1     0                    0     1  1  1          44  33333      0   44            11111111  1             44   555 66     3 4444444    9999   5        1         6        1  3    000  44    8 2   11       22  44      1                0     2     0       3    3  3 0000000000  3      1                   88                     1                                    1                                                                                                  1                         1               5                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               .            .  . .  .  .      .    . ..       ..    .       ....................      .. .     ..    ...........          ..   ...     ...    .  ......    . ..     ............     .  .....................       ....                 ...   .    .     . .....................            .  . .      .    .      .     .  .   .            ...     ..   ..  . ..       ...  ...  .   ......................................................  .      ...              ......  .  .  ..  ...   ..   ..    ..    .     ...               .  .        .        .    ..              .        .        .              .....     .. ....       . ......    ........ . .   . . .      .        .. .   . .    .      .     .  .     .   .          .  .        . .            .                 .                   ..    ..        .       ..           ... . ..........        ......    .  .........     .    . . .  .  .     .  .      ..... .      .   ..   ......       .    ..    ...               . .         .  .          .............. .  ...   .    ... . ....     ... .   .  .              . .     . ............     . ....     . .   . ..     .      ...  . .   .............................................................     ... . .....     .........       ....  .  .        ..  .     .  ...     .....   .....  .        .  .... ..      ...     .  . .      .       .....   .   .  ..      . .     .                    .     .  .  .          ..  .....      .   ..            ........  .             ..   ... ..     . .......    ....   .        .         .        .  .    ...  ..    . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .    .  . ..........  .      .                   ..                     .                                    .                                                                                                  .                         .               .                                   .                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                               3            0  7 0  0  3      0    9 11       22    1       22222222222222222222      11 1     11    22222222222          99   000     777    9  333333    0 33     999999999999     0  999999999999999999999       4444                 888   4    4     4 222222222222222222222            0  0 0      4    6      4     8  0   0            333     33   00  0 55       000  000  0   222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0      666              333333  0  0  00  999   88   00    55    8     111               4  4        0        4    99              0        7        0              22222     55 2222       2 000000    00000000 1 0   0 2 5      0        22 5   0 0    0      0     0  2     0   0          0  1        0 0            5                 0                   00    22        5       66           666 0 0000000000        111111    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  9      44444 2      4   11   999999       4    22    222               0 1         2  5          00000000000000 9  888   6    888 3 4444     999 0   2  8              0 1     8 888888888888     6 5555     0 9   1 55     8      888  8 8   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     888 0 22222     222222222       6666  1  1        66  7     2  444     22222   44444  0        2  1111 22      888     0  2 2      6       11111   0   3  00      3 8     8                    5     0  0  0          00  77777      4   66            22222222  0             22   444 77     1 5555555    1111   1        0         2        3  5    333  66    0 1   55       00  66      0                9     9     8       3    3  3 6666666666  7      0                   33                     0                                    0                                                                                                  0                         0               5                                   0                                                                                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAA---A-GG-TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAA---A-GG-TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTCAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-ATA--TTTCGAG-TT-------CTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCAGTAT-TAAA----A-G-TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATC---CA--------ATCAT---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----AA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TAATTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GAACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGA-TA-TAATTGA-AA-TA--TTACTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T----------TACTTTATTTGTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-CTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCTT--CTTG-TTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTG-TAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CAT--T-TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATACCAAGA--TAAAAAAT-A--ATT-ATCCTCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGT-ATT--AAGACGTCTCCAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATT---C---------ATTTA---TAGTACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--A--AGaatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGCTTTTTTA--TTAGTGTTTTT-TCG--AAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGACGAAATCACAAT---CA--------AA-AA---TTGTTTTT-AGA-A----CAACTTCCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCA----TA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GC------AATTA--A--AGATAAATT-----A---TCT--------GAATC-----T---T-----T-AATTC---CAT---TCTTCAA--TTG-TT-TATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTA-GGACCATATAT---ATTTAT-T--AAG-T---TAAATCTTTTA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATT----ATCAGTG-GTTTTTGAAT-GTAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAAACATTCA--------AACCCTCATTCAATAC--GTA---TA-ATGTT-CTC--A--TCTTT---TTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--AT--TTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAGTA-TAT---A-GT-TATTTTATTTGTCAT
gi|13                         :                                                                                     aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT---TCTTATATCATTTA-A--TTC-TTG---TC---TC-TTAATTTCA------AT---AGTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCTT--GTCTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATTTATTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATGTGTAAATGTTGCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tTCTATTAAGTTAAATT---CA--------CTTCT---TAA-ACTT-A-A-AACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT----------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--A--GAT---GTC---------CTT--------C---C-----TCCGA-----G-GAAG----CAT---TATGTAA--CTG-GT-TATAAA--------------CTATT---GGTCATCAATTTTATTTA--TC-AAT-T-T-TATTCTTTTT--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTT----ATCTGAA-GATATTGAGA-GTAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGTA---TAGATGTT-TCC--G--CCAT----GTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TT--ATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAGA-TGCTTT---A-TT-TATTTTATTGGTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTAATGA-------GTTTTGT-TTCTGCTTCA---TTT-A-AA---------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGATTTCAT------GTGTTTTC-TTTGTAAA------CCATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATT-------------AT--------GTATTT-A-A-T----CATTCACTTTA----TTAGATAACGTTTATCAATATTACCAGATGCG-AC-A--------C-A-GGTTTAAAAA-------AAA-----CC---ACTATAATA---A--A--TGG---GTC-----ACATCTG--------G---A-----T---A-----A-AAGGG---AAT---GC-TTAA--CAT-ATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTT-GGACCATAAAT---ATTTA--C--AAGAA-A-TAG-TTCCTTA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAAT---ATC-------ATTGGTTGTCAATTGAGA-GAATTT--AATGCAAAATAAT
gi|16                         :                                                                                                                     GTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTA--TTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGCTAA--AAAA--T-C--C-TTGCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGAT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgtgaattgttTA------A--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATC-AAATCTTT-----attagcaaaaataatttgtaaccttttccgcttcatgcgaccatttagcttttgatcttatcttaatgccctctaattttttttgtcttaattcaaacagacttttttttttattttctaaactaactaaattaatatctaattgtttttcaagtctttcaatttcttttagaagtttagactcagttttattttcttgttttttaagaaaagatgaatatgatattgtttttccctgaatttccaatagtaacatttcaaaaaaaagttgatcgttactatcagcatcaaatctttacaaggtatgtc
gi|17                         : atgtgaattgttgtttaggtatgtgaaaatctttaaacaatgtattcagattgctatttgtaactggtttgtgggcatataatgattgctaaaaaatccttgcttctttcaaaatAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGAT--AAAAAAT-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCGTTTGATATTAGC--GAAGGTGTA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAacaaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtgaattgttgttcttgggta-TATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCA-GGGCCAAAGAT---ATAAA--C--AAG-A-AATA-TGTTCTTA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC----TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAAT-----TT---TA-ATAACATGT--ATTTCCTC---ATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--AT--TTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCGA-TA-CGA---A-GGCTATTTTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACA-TCA-CCGA-TA-CAA---A-GGTTGTTTTATTTGTCATcaata
gi|2                          :                                                                                                 GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAAT--TCTTTAT--AGAA--C-CGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTGTA------A---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAA-A-A--A----AA-TTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-T-ATA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCTT--GTTGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATTTATATCATTAT-TAAA----A-G-TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTT-ATTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTTTTATATCT-A-CAGT-A---TCAATATCCATCATTAAACATG----T-T-GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATT---CA--------ATCAA---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----CA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--A--AGA---ATC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAA--GTT-AT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTT-GGGCCATAGAT---GTTTA--T--AAG-T-T-TATTTTTTTTA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAAT-GTACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTAC--GTA---TA-ACAGG-TAT--A--TCTGC---ATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAAA-TA-TAATTGA-AA-TA--TTACTCGTCATTTAAGATATGCACTT-AAAAATAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAA-TTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-----A---GTT--------G---C-----T---A-----G-GATGTTACCATCAGG--TTAA--C---AT-TGAAATAGG-AGTTTC----TTATTTTGGGCCATAA--------TG--T--ACC-T-G-TAATTGTTTTA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTC--GTA---TA---GAT-TTT-----TCCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CT--TTTTtttca
gi|3                          :                                                                                                                    AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT--GATTGATCAAAAA--T-C-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTCATTTGATATTAGC--GAAGGTATA----------------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAA-A------T--AA-TTTGTAAC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-T-TTA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATTT--CTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATTTGTA-CATT---TAAATTTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTA-ATTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTAAAATAT-T-A-CTATCC---TCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGTATTT--AGACGTCT-CCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATT---C---------ATTAA---TAATACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CA----T---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TT-GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-TCA-TCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAA---A-GGTTACCTTATGAGTCATTatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATT---CA---------TTAA---TAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-------------ATC-----A---TTT--------C---CATATCT---A-----TCAATGT---CTT---G-TTTAA--CCC-CTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTGTT--GGTCCATACAT---ATTTA--TCGAAG-T-CATCCTTTTCTTA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTAT-GTATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTC-A--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-AA-TAA---A-GGTTACCTTATGAGTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                                                                                                  TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TCTAAT--TTTTTAT--AGAA--T-T-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--CATTA----------TTAAGTTTTA------AACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-GTA--TCT--AG-------ACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTATTGT---TT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-C-ATA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATTTTTTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------TTGTGTTAATATGTAAATGTTGCG-TTTTCTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTT-ATTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCTTAATTTTT-A-CTGT-A---TTTATATCTG---TTAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGCTTTCTTTGACGAA---TTTT-TTT--AAA------CCAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATT---TACCCATTACATTAA---TAA------G-A-A----CATTT---CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTA----AA-ACAA-TCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--A--CAA---ATCGTCATA---AT-------------C-----T---A-----A-AATGT---CAT----TTTTAAGGGTT-G--TATAAAACATTGGATCATCCCTATTT-GGGCCATAAAC---ATTAA--T--AAG-T-G-TAATTTCTTTA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTT----GTCAGGT-TCTACCGCAT-GAATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-T----------TACTTTATTTGTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttAAAGTACATT---CA---------TTAA---TAA-ACTT-A-ACA----CATTTTTCCTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTA----TGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT-------------ATC-----A---TTTCCATAGCAA---C-----T---A-----GCAATGT---CTT---G-TTCAA--CAC-ATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTT-GGTCAATAATT---ATTTATTT--ATG-TCA-TTCTTTTCTCA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTAT----ATCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCT---TAAATT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCAC--GTA---T--ATAAT-TTTTCA--TCTTT---GCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAAT---ATGATATTG--TTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAGA--A-TAA---A-GGTTACCTTTTCAGTCATTaatgttatataaaatggac
gi|7                          :                                                                            tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--T-AATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--CATTA---------CT--AGTTCTA------A--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGA-A--TTT--AGATTT-------TTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TAT-ATA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATTT--TTTTTTTTTT---GAAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATTTATACTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATGAT----TTT-CTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTTTAAT-TGT-AACTTT-A---TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------CCATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATT---CC--------GCCAT---TTATACTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCA----AA-GC-AATCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TA--AGAAGA---ATC-----T---TTA--------G---C-----T---A-------AATTT---TTT---TTTTGAA--TTTGAT-TATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAATTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGC--GTATGGTA-TTAAT-TA-------CTTT---ATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                                                                                                     TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAATC-TTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATAT--G-AG--TACAAT--TTTTTAT--AAAA--TAA-TT-GTGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--CATTA---------CT--AGTTCTAATGTTTA--T------CA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-AATTTT--AG-AAT---A--TTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA-------------------TA--TA-------------T-------A---AA--TTTTCCTCC------CTTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------TT--CTTG----------AAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATTTATGCTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATGTATGTC--TGC-GAAATTAT----TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTT-ATTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTTTAAT-TGTAA-CTTT-A---TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------TCATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCCGCC--------ATTAATTCTAATAC-----A-G----TATTT---CGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCA----AA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGA--AGA---ATC-----T---TTA--------G---C-----T---A-----A-AATAT---TAT----TTTTAA--TTTGAT-TATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTA-GGACCATAAAT---ATTAA--T--GAG-A-G-TATTTTTTTTATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGT-GAATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--TTA---T--ATAAT-TA---ACTTCTTT---GTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-TG-CAA---ATGT-TACTTTATTTGTCATagattgcctgcattca


blockSeqs                     :                                                                                                               C            A    T  T  C      A    A TA       TG            TTTCATTTTGGGAG            GA       CA    TTTTACT              TA   TTA     ATC    A  CAAAAC    T TT     GATATTAGCG       T  ATGTTTGTCA                  AGAT                 ATT   T    G     G AATTTTAGAATA                     A  T A      A           T     A  G   A            GTC     AT   AA  G AG       TTA  ATG  A   ATTTCAATAGTATTTTGATCACATACAAG                           G      ATT              TTCA    G  A  AA  AGA   AG   GA    GT          AAG               T  T        A        C    GT              A                 T              ACAAG     TC CATT       T AATGTG    TGTTGCGT C T   G T C      A        AT A   A C    T      A     T  T     A   T          A  C        A A                              C                   TG    TT                AC           AAA A ATTATCC           CATCAT    A  GAGTCT             T T A  A        G  T      GACGA T      A   GT   ACGTCT       T    CT    CTT               T           T             TACCCATTACA    T  TTC   T    AA  C ACTT     TCC T   T  A              T         GATGCGACA        T TGT      G T                   ATA  T     AATTAAAGATAAATTATCTGAATCTTT                                       TAC A CAGG      CATATG          GTCT  G           TT           TTT     TCG     AAA    A        A  AAAT GA      CAG     A  T        G       TGAGA   A   G  TT      G T                                G  A  T          GG  AGACC          GT            CACATTTT  C             TT   TGG AG     A GTATT      CCAT   T        G         A        T  C    ATG  GA    G T   GA       AT  TT      T                      C             C    G  C AATTGAAA    C      T                   GA                     A                                    G                                                                                                  A                         A               .                                   A
blockSeqs                     :                                                                                                               C            T    G  A  C      C    A CA       TG            CTGGTTTGTGGGCA            .        .     AATCCTT              AA   AAT     ATC    A  CAAAAC    C TT     GATATTAGCG       G  ATGTTTATCA                  TGAT                 .     .    .     . TAATTTGTAAC                      T  A T      T           A     C  A   A            CTC     TA   TT  G .        .    .    .   TTTTCTAAACTAACTAAATTAATATCTAA                           C      A                ATTA    G  .  AA  AGA   TT   TG    .           ATT               T  A        T        T    AC              C                 T              ACAAG     CG TAGT       T AATATG    TGTTGCG  T .   G G T      T        TC G   . .    T      .     A  G     T   A          G  A        C T                              A                   GA    AT                AT           ATC . CTATCC            AGTAAG    A  GAATCC             . . .  G        A  T      TTA   T      .   .    CGTCT        .    CT    TTC               T           G             CCGCCA         T  .     T    AG  . A        TCC T   G  A              A         TGTGTA           A CTG      T A                   .    A     TGTATCATTTCCATAGCAACTAGC                                          .   A TC        CCCCTG          GAGA  A           A            .       TCG     AAA    T        T  ACAA TA      GTT     A  T        T       T       T   .  TA      . T                                T  C  A          GG  TGA            .             .         C             .    .   A      . TTTCA      T      A        T         A        T  T    ATG  .     G T   GC       TA  A       C                      A             .    .  . GAAGGC      T      T                   T                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                               .            T    G  A  C      C    . TA       .             CTGGTTTGTGGGCA            .        .     CCGTTTT              AA   AAT     T      .  CAAAAC    C TT     GATGCCTG         G  AACTCAACA                   AGAT                 .     .    .     . TAATTTGTAAC                      A  C A      A           T     A  G   .            TG      AT   AA  . .        .    .    .   ATTTCAATAGTATTTTTATCCCATACAAG                           G      A                ACCA    G  .  .   AGA   AG   TA    .           AAG               T  T        C        C    GT              A                 A              .         GA TAGT       T ATTAT     TTTTGA   C .   . A C      T        AC G   . .    A      .     A  A     G   T          A  T        G A                              T                   GG    GA                AC           TTT . ACTTTA            TGTCAT    C  GCTCC              . . .  G        T  T      TGA   T      .   .    .            .    .     TTC               A           T             CAA            C  .     T    AA  . .        CCT T   T  T              A         TAACAG           A GG       G A                   .    T     ATTAAGATGTCCTTCCTCCGAG                                            .   A TA        CCCCTG          GAGA  C           T            .       TTT     TCA    G        .  ACAA TG      .       A  T        T       T       G   .  AA      . A                                T  T  T          GA  AGA            .             .         T             .    .   A      . AACT       T      A        A         .        T  T    A    .     A T   GC       GT  G       A                      G             .    .  . AAAGGT      T      G                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                               .            T    T  A  .      A    . A        .             TTTCCCTGATTGAA            .        .     TTTTACT              GT   GCA     T      .  AAAA      A .      TT               A  AACTCAACA                   CGAA                 .     .    .     . TAATTTGTAAC                      A  T A      A           T     A  G   .            TG      AT   AA  . .        .    .    .   ATTCTATTAAAGTATGGTTTTGTAAGAT                            G      A                TATA    .  .  .   TGC   AG   GA    .           AAG               T  T        C        C    AA              T                 A              .         TC CAA        T ATT       TTTTGA   C .   . T C      A        AT A   . .    T      .     G  T     A   T          A  C        A A                              C                   TA    TT                AT           TT  . CAGTA             TGCCAT    A  GCTCT              . . .  A        T  T      TGC   A      .   .    .            .    .     CTT               G           T             CAC            T  .     A    A   . .        ACT T   A  T              A         CAACAG           T CA       A G                   .    A     AAATGGGTCACATCTGGATAA                                             .   C GC        GGGTTG          AATA  A           A            .       TT      TCA    T        .  ACAT CT      .       T  A        T       G       G   .  TT      . T                                A  T  A          GA  GTT            .             .         T             .    .   A      . TTCA       C      A        A         .        G  T    C    .     G T   C        CA  T       T                      A             .    .  . AAAGGT      T      T                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                               .            T    G  A  .      C    . A        .             CTGGTTTGTGGGCA            .        .     TAATTGT              AA   AAT     C      .  ATAA      C .      TT               T  ATTC                        CGAA                 .     .    .     . TATCTAGACA                       T  A C      T           T     T  C   .            TC      TA   AT  . .        .    .    .   TCTAAACTAACTAAATTATTATCTTA                              C      A                TTC     .  .  .   AGA   CC   GG    .           GAT               A  A        A        A    GT              A                 T              .         CG CAA        T ATT       TGAT     T .   . G C      T        TC G   . .    T      .     A  G     T   G          C  T        C T                              G                   TT    AA                TA           AT  . CTGTA             AGTAA     G  GTT                . . .  A        G  T      TGC   T      .   .    .            .    .     TTT               T           T             CAA            T  .     T    A   . .        TTT G   T  T              A         TGTGTA           T TA       C G                   .    T     GGTTAAAGAATCAGTTGCTAG                                             .   A GC        CACATG          CTCA  T           T            .       TC      TCA    A        .  GCAC AA      .       A  C        A       T       T   .  CA      . T                                T  A  A          GA  GTT            .             .         T             .    .   A      . TTCA       C      A        A         .        A  T    A    .     G T   C        CA  T       T                      A             .    .  . AAAGGT      T      T                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                            A    T  T  .      A    . A        .             TTTAATTTTGGGAG            .        .     TAATTGT              TA   TAA     C      .  ATAA      T .      CT               C  ACA                         T                    .     .    .     . TATCTAGACA                       A  T A      A           T     A  G   .            CC      TA   AA  . .        .    .    .   ATTCAATAGCAGTATGGTCTTGTAAA                              G      T                TTT     .  .  .   TTC   AG   GA    .           AAG               T  T        C        C    AC              C                 T              .         CA .          . TGC       TTAT     T .   . A .      A        CA .   . .    A      .     T  A     T   G          T  T        C T                              T                   AT    AC                AA           TG  . CTTTA             TGT       G  TCA                . . .  A        T  T      T     T      .   .    .            .    .     TTC               T           T             CCG            T  .     T    G   . .        TCC T   T  A              T         TGTGTA           A GG       G G                   .    T     TGTATCATTTCCATATCTATC                                             .   T TT        TTTGAT          CTCA  T           T            .       C       TT     C        .  CAT  AA      .       A  C        A       T       A   .  AG      . T                                T  A  A          GA  GGA            .             .         T             .    .   A      . AACT       T      A        A         .        T  T    A    .     G T   G        GG  A       A                      A             .    .  . AAAGGT      C      C                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                            G    C  C  .      G    . C        .             TTTCATTATATGAG            .        .     TCCTT                GT   TCT     .      .  G         A .      CT               C  CA                          .                    .     .    .     . ATTTAGATTT                       T  A T      T           A     C  A   .            G       TA   TT  . .        .    .    .   AACTAACTAAATTATTATGTAA                                  C      A                TTT     .  .  .   G     TC   TG    .           ATT               T  A        T        T    GA              T                 A              .         CA .          . TGC       AG       T .   . A .      A        CA .   . .    A      .     T  A     T              T  T        C T                              T                   AT    AC                T            TG  . AA                .         .  TCA                . . .  A        A  .      T     T      .   .    .            .    .     CT                C           A             CA             T  .     T    A   . .        TCC T   G  A              T         AAACAA           A GG       G A                   .    A     TGTATCATTTCCATATCTATC                                             .   T G         TTTGAT          CATT  T           T            .       C       TT     C        .  GCT  TT      .       A  T        T       T       A   .  AG      . T                                A  T  C          GG  AGT            .             .         A             .    .   .      . AACT       T      G        T         .        G  A    A    .     A T   G        GG  A       A                      G             .    .  . AAATGT      C      A                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                            G    C  C  .      G    . C        .             TTTCATTATATGAG            .        .     TCCTT                GT   TCT     .      .  G         A .                          CA                          .                    .     .    .     . AAAATTT                          C  T C      T           A     .  T   .            T       T    G   . .        .    .    .   AACTAGCTAAATTATTATCTAA                                  G      A                TTT     .  .  .   G     CC   TA    .           .                 A  A        T        T    GA              T                 A              .                                                                                                                                                                                                                                                                                       . . .  .        A  .      .     .      .   .    .            .    .     .                 C           A             CA             C  .     T    G   . .        TTC G   T  T              G         TGCGTA           A CA       T G                   .    T     GAACAAATCGTCATAATCTAA                                             .   A G         TTGTT           CTCT  A           T            .       T       TG     A        .  GCT  TT      .       G  A        A       T       A   .  TA      . A                                T  A  A          .   GA             .             .         A             .    .   .      . TCA        T      G        T         .        G  A    A    .     . .   C        AT  A       T                      G             .    .  . ATAGT       C      A                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C  T C      T           A     .  T   .            .       .    A   . .        .    .    .   TATATAAA                                                T      .                T       .  .  .   T     .    .     .           .                 A  A        T        T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A             CA             T  .     .    A   . .        TTT T   A  A              T         AAGCAA           A GG       G A                   .    T     ATAAGAAGAATCTTTAGCTAA                                             .   T T         CTGGT           GTCG  T           A            .       T       TG     C        .  A    AA      .       A  G        T       G       A   .  AG      . T                                G  A  T          .   CT             .             .         C             .    .   .      . CCG        T      T        G         .        T  C    A    .     . .   A        GG  A       A                      C             .    .  . TTATT       C      T                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CA             .  .     .    A   . .        .   G   A  T              T         AAGCAA           . CT       C A                   .    T     ATAAGAAGAATCTTTAGCTA                                              .   T G         GTTAT           GTCG  C           A            .       T       AG     T        .  A    TT      .       T  G        T       G       C   .  TT      . A                                G  A  T          .   .              .             .         A             .    .   .      . ATA        T      G        T         .        T  T    .    .     . .   C        CT  A       T                      G             .    .  . .           C      A                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A              .  .     .    .   . .        .   G   .  T              T         .                . CT       C .                   .    .                                                                       .   A T         CAT             GGA   C           .            .       T       AG     T        .  T    TA      .       T  .        .       .       C   .  TT      . A                                                                    .             .         G             .    .   .      . TT         T      T        C         .        T  C    .    .                                                       C             .    .  . .           .      T                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     .           .            .       T       T      .        .  A    TA      .       .                                                                                                                               .         C             .    .   .      . A          .      T        G         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                     A*                                                                                                          AAAA**             CT**********        ATCA*****************                                               TAATTTNTAACA*********                                                                                                                                                                                        TTN***                                                                                     GN                                                                         NNC***    TTTGG***                                                                                                                                                                                    TN*                                                                                                                             TTC                                                                                                                                                                                                                                                                        CNCGTG***                                                                                                                                                                                                                                                               A*       NTCA***                                                                                                                                    AAAGGT****
originalCons                  :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TCATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--CATTAGAT----GCCTGAAGTTNTA------A--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-A-A--TTT--AG-TTT---AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-T-NTA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCANTGT-TAAATNTTG-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATATNT-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAA--CTT-AT-TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNT--A--TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAA---A-GG-TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
finalCons                     :                                                                                                 GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-TA-TTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAAT--TTTTTAT--AGAA--T-C-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TTAAAA--TTTGNC--CATTACT----------AAGTTNTAATCA-----------------TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAA-ATAATTTNTAACA---------CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTCTTN---TA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCTT--CTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATTTGTGTCNNC---TAAATTTGG---TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTT-ATTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTTTAATTN-T-A-CNNT-A---TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------CCATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--A--AGA---ATC-----A---NTT--------G---C-----T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAACNCGTG---TATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTT-GGGCCATAAAT---ATTTA--T--AAG-T-N-TANTTTTTTTA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAAT-GTATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTA---TA-ATAAT-TNTCA---TCTTC---GTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-TA-TAAAGGT----TACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                    1                       1             1        11            33333333333333333333                   2222222222                       111       111111      111111111111   6666666666666666666666666666666666666666       3333                                     1   2222222                                                                                                        555555555555555555555555555555555555555555555555555555                          111111  1     11  111                                                                                                                       22222                     555555555555555555555       1                                                                                                                                                                        111111     1     1111111                     444444444                                    11111                 111111111111           11                                                22222222222222                     1111                                         333333333333                                                 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555           22222     222222       1111                                    11   11111               1111         111                                                                                                        11111                        11111111                      111                                                         111              11                                                             222222222222   111                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                    3            1  0 1  1  3      1    8 7        22    2       33333333333333333333      44  0  66    3333333333          11   444     333    8  666666    2 888888888888   1111111111111111111111111111111111111111       4444                 777   4    4      2 0   1111111            1  1 1      1    0      1     8  1   8            8 5 2   77   22  8 55       777  777  4   666666666666666666666666666666666666666666666666666666  1      666              222222  2  4  11  333   44   33   55           666               1  1        1        1    11              1        0  2     1              22222     44 2 99   66    333333333333333333333 1 5   0 1 6      1        11 6   5 5    1       5    1  4     1   1          1  3        1 1            0                 1                   22    22        0       55       444444   5 0 1 5 5555555        777777    5  000000000     0    4 4 4  1  0     1  1      22222 2      4   66   555555555555      4    22    444               1 0         1  0          33333333333333    555   7    666 3 0000     222 1   2  1              1 0     0 666666666666     3 8888     1 2   0 00     0      555  3 0   0000000000000000000000000000000000000000000000000000000     555 1 33333     111111       0000  2           2  0     0  555     3 55   88888  4      3  3  3333 11      000     2  2 0      3       88888   1   3  22       55     0                    0     1  1  1          44  11111   1  0   44            11111111  1             44    333  2 555 1 777    4   5        1         6        1  3    000  44    8 2   11       22  44      1                0     2     0       3    111111111111   111        1                   1     7                1                                    1                                                                                                  1                         1                  5                                1                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                    .            .  . .  .  .      .    . .        ..    .       ....................      ..  .  ..    ..........          ..   ...     ...    .  ......    . ............   ........................................       ....                 ...   .    .      . .   .......            .  . .      .    .      .     .  .   .            . . .   ..   ..  . ..       ...  ...  .   ......................................................  .      ...              ......  .  .  ..  ...   ..   ..   ..           ...               .  .        .        .    ..              .        .  .     .              .....     .. . ..   ..    ..................... . .   . . .      .        .. .   . .    .       .    .  .     .   .          .  .        . .            .                 .                   ..    ..        .       ..       ......   . . . . .......        ......    .  .........     .    . . .  .  .     .  .      ..... .      .   ..   ............      .    ..    ...               . .         .  .          ..............    ...   .    ... . ....     ... .   .  .              . .     . ............     . ....     . .   . ..     .      ...  . .   .......................................................     ... . .....     ......       ....  .           .  .     .  ...     . ..   .....  .      .  .  .... ..      ...     .  . .      .       .....   .   .  ..       ..     .                    .     .  .  .          ..  .....   .  .   ..            ........  .             ..    ...  . ... . ...    .   .        .         .        .  .    ...  ..    . .   ..       ..  ..      .                .     .     .       .    ............   ...        .                   .     .                .                                    .                                                                                                  .                         .                  .                                .                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                    3            0  7 0  0  3      0    9 8        22    9       22222222222222222222      66  7  11    9999999999          99   666     111    9  999999    6 444444444444   3333333333333333333333333333333333333333       4444                 888   4    4      2 2   7777777            0  0 0      4    6      4     8  0   0            0 0 5   33   00  0 55       000  000  0   222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0      666              333333  0  0  00  999   88   00   55           111               4  4        0        4    99              0        7  2     0              22222     55 2 00   99    222222222222222222222 1 0   0 2 5      0        22 5   0 0    0       0    0  2     0   0          0  1        0 0            5                 0                   00    22        5       99       444444   0 0 0 0 4444444        111111    9  333333333     1    4 4 4  4  1     0  9      44444 2      4   11   777777777777      4    22    222               0 1         2  5          00000000000000    888   6    888 3 4444     999 0   2  8              0 1     8 888888888888     6 5555     0 9   1 55     8      888  8 8   6666666666666666666666666666666666666666666666666666666     888 0 22222     555555       9999  1           8  7     2  444     1 88   44444  0      1  1  1111 22      888     0  2 2      6       11111   0   3  00       22     8                    5     0  0  0          00  66666   7  4   66            22222222  0             22    111  1 444 0 000    9   1        0         2        3  5    333  66    0 1   55       00  66      0                9     9     8       3    666666666666   777        0                   0     3                0                                    0                                                                                                  0                         0                  5                                0                                                                                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                      GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-T-ATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAATTTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--C---------ATT----A-----CT-A----AGTTNTAA--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAATAATTTNTA-AC-CTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-TN-TA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCT--TCTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACAGTATT--TGTGTCANTAT-TAAAT-TT-G-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTTA-TTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTT------TAA-T-TNT-A-CTGTA-TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--AAG---AATC-----AN---TT--------G---C-T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAACNTGTGTATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTTGGGCCATAAAT---ATTTA-T--AAG-T-N-TANTTTTTT-TA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAATG-TATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTATA-ATAAT---TNT-CATCTTCGTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-----TATAAAGGTT---ACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
Reference ( family-2021 )     :                      GTTTTCTAAACTTT-ATTTAGTTTAGGNACGTNAANAT-TTGAAANAATA-T-ATTTAAAT--CTATGTTTGTAGTTTCC-TGGTTTG-G-AG--TATAATTTTTTAT--AGAA--TC-TT-TTGTTTCTTTAAGNATTNNNTCTTG--CGTTT-TT-AAAA-TTTGNC--C---------ATT----A-----CT-A----AGTTNTAA--T------CA---TTGATTT-GATACAAAGTTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAATAATTTNTA-ACACTTTTCCCCTTCNTGNANCCATTTTGCTCTTGATCTTATTTTNATNCCC-TCTAATTTTTTT-TCTCTTATATCAANTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTAATTCTA------CTAA-AGTA--TNGTTT-------TGT-------A---AA--TTNTTTTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-TN-TA-AA-GT--TTNGACTCNNTTTGGTCT--TCTTGTTTTTTAANGAAAGATGAATATGATATAGTTTTTCCNCGGATTTCCAATAGNAACACTTCAAAAAANAGTTGATCGTTTATATCNAATTCTAAATCTTT-----GTTTGCGACANTATT--TGTGTCNNC---TAAAT-TT-G-G-TCT-CTT-TAACGTATTGNAGTTTTACNCTGTCT-A-TTGTNTTTTTTA-TTTCNTCGACATANTTTNTATCTTTTAANAGCGAGTTGTTNANTTTCCAATATGATTTTCCTTTTTTAAATTTTCCAAATTCAAATGTTAAAANNATTAANGAATGATCTGTTCTGTATCCTGGTT------TAA-T-TNT-A-CNNTA-TCAATGTCCGTCATTAAANGTG---CT-C-GAGATTAAAA-A-A-TAATCTAATCTNGCTTTCTTT--TGAGTGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTA-AATT--TTTTTTCTTCTAAATTTTGATCNCGCCAGCAATCTATCAAATTACATT---CA--------ATTAA---TAATACTT-A-A-A----CATTTTCCCTAGCNTTTGGATTATTTATATTNACATAATCA----CG-GC-A-TCTATATC-G-GGATTNAGAACCAGGTTAAAGTCTCCT---GCTATGATNGTTA--AAG---AATC-----AN---TT--------G---C-T---A-----G-AATGT---CNT---GCTTTAACNCGTGTATAAAAGNCAGGNTCATCTTTATTTGGGCCATAAAT---ATTTA-T--AAG-T-N-TANTTTTTT-TA-TTACATANAGTTGTA---TCTAAAATNAGTTTATTTCCATCTTT----ATCNGTT-TCNNTTGAATG-TATTTTGAATTCAAAATTATTATTAAAAAGAATNGCNACNCCTCTAGATTGGCTGGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TANCCCCACTGAGTAC--GTATA-ATAAT---TNT-CATCTTCGTCGGTAAAATGNGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTGCTTTTG-AGAAAATNNAA-NGTATCTNTTCGTTTATTTTTATCACCAAGGCCTTGTACATTCA-TAGA-----TATAAAGGTT---ACTTTATTNGTCATTTAAGATATGCACTNAAAAAATAATATATGCAGAGACNCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTNGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATNTCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACNAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAANTTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTCTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|1                          :                      GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTCGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAATTCTTCAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--C---------ATT----AGATGCCTGA----AGTTGTAA---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAAATA-TTTCGA-GTTCTTTTCTCCTTCTTGCACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTA-TTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-TA-TA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCT--TGTTGTTGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATA-AAACACTTCTAAAAATAGTTGGTCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATT--TATATCAGTAT-TAAA-----A-G-TAT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACGCGGTTT-A-TTGTATTCTTTA-TTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGGTTTTCCTTTTTCAAACTTTCCCAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTT------TTA-TATCT-A-CAGTA-TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTG-AATT--TTTTT-CTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATC---CA--------ATCAT---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----AA-AC-AGTCTATATT-A-GGATGCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--AAG---AATC-----AG---TT--------G---C-T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAAGTTAT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTTTTTGGGCCATAGAT---GTTTA-T--AAG-T-T-TAATTTTTT-TA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAATG-AACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAAGAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCTCACTGGGTAC--GTATA-ACAGG---TAT--ATCTGCATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGA-----TATAA---TTGAAATATTACTCGTCATTTAAGATATGCACTAAAAAAATAATATATGCAGAGACCCAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTTGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGTATGCAAGTTGCATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATTTCTAAATTTCCATCCCTTCTCCAACCAGATAATACTAAAAATTTTAAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAATTTAAGGCAACTCTTTGAAAGAGCAGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCCAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACATGCACAACTCTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTATCTCTCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTATA--TAAT---TAA-CTTCTTTGTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-----T------GTT---ACTTTATTTGTCAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCCTCTTCATTTAACCATTTAGCCTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTATT-G-TCTTAATTCAAAAA-A--TACTTAT---TT---TTATTA--TCTAAACTAACTAA-ATTA--TTATCT-------T--------------A--TTGTATTTCA--AGTTTTTCAATTTC-T-TC-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATCT--TCTTGTTTTT-AAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTCTCACGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAGAAGTTGATTGTA-ATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATT--TGTA-CATT---TAAAT-TTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTATTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTTAATTTCTCTTACGTAAGTTTTATCTTTTAAAAGCAAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAATGATTATTGAATGATCTGTTCGATA-CCAAGATAAAAAATAA-T-TAT-C-C-----TCAATGTCAGTAA--GAAAATG---CTCC-GAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGT-ATT--AAGACGTCTC-----CAAGTA-AACT--TTCTCTTATCAAAGTTAAGTTTTCTCCAGCATTCTGTCAAATTACATT---C---------ATTTA---TAGTACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTACTGATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-GGATTGATAACTAGGTTAAAGATTTTTATAGTTACGAT-GTCA--AAG---aatgttatataaaatggactactaagagggagggaaacctccactgttcctatcagaaagactccagactttatcacttctttattctccttatacctcatttgttgtgacatttcatttaatttttcaacaggtaggcagtataatactaaaaaaacatttccttccagtgatggcttgctttttttcgaatctcatttacttaacagcagtgtaaaatatttatgagaagagaggattttatttgtgtctataaaatttatatgggttttccatgtaaacgacttaaatggtggtaacttccacttatatacaggtaatagcatgtaaacaacataaatattaatttacagacagtaacagtgtacataaccacaaaataaaacacaaaaagcaccctatattacaattttcaatattacaacagatgtctgatcagaacgattgttctgtggggtgaccactatttcacaagatcgattaaatataccatgttagtgtgttatcttttcatatcccattttcacctcctacagctttgcattttcataatctgttacaaacatacattttggtagactgtcaacttccaagtctgcaaaaattgcataaatagtaaatagtttttaagaaaaacaaaataaaacaaaagagaaatacatcattaatctgacaacaagaaatcattcatgatatactagtctataagagta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatttgacatagtaa-GAGATAAGAA-A-A-AAGTCTAATCTAGCTTTTTTA--TTAGTGTTTTT-TCG--AAA------C-----CATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAGATTTTGATCTCTCTAGCAATCGACGAAATCACAAT---CA--------A-AAA---TTGTTTTT-AGA-A----CAACTTCCCTTGCGTTAGGGTTGTTTATATTAACATTATCA----TA-AC-AGTCTAT-TT-GTGGGTTTAAGATCAGATTAAAATCACCT---GC------AATTA--AAGATAAATT-----AT---CT--------GAATC-T---T-----T-AATTC---CAT---TCTTCAA-TTGTTTATAAAAGTCTGGGTCATCTTTATTAGGACCATATAT---ATTTATT--AAG-T---TAAATCTTT-TA-T--CATTGA-TGGTACAGTCTAAAATTAATGTATTGCCATTATT----ATCAGTG-GTTTTTGAATG-TAATTTAAAATCAAAGTTATTATTTAAAAGAATGGCAACTCCTCGAGATTGGCTTGA--GTAGTTACT---AAAAAACATTCA--------AACCCTCATTCAATAC--GTATA-AT-GT---TCT-CATCTTTTTCAGTAAAATGTGTATCTTGT-AAAAAGGATATTGATCC--AT--TTTTGCTTTTC-AGAAAATTAAA-GGTATCCCTCCTTTTATTTTTGTCGCCAAGACCCTGTACATTCA-TAGAG----TATATA-GTT---ATTTTATTTGTCAT
gi|13                         :          aagtgattgctggTTTTCGAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTCTACAGTTTCA-T--TTTG-GGAG--TATAATTTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTTATCTCGATCGTTTATT-G----TCTGTT--C---------ATT----A-----TT-A----AGTTTTAAACT------CAACATTGATTTAGATACAACATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGTA---TCTAGACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGTTCTAACTTTCATACCT-TCTAATTTTTTT-TCT--TATATCATTTA-A--TTCTTGT---CT---CT-T-AATTTCA------ATA---GTA--T--TTTGATCACATAC-------A---AG--TTCTTTTTCA--AGTTTATCTATTTC-T-TCATA-AA-GTAATTG--TTCTTTTTTGTCT--TGTCTTTTTTTATTGAACGATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTAAAAAAACAATTGGTCATTTATTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGATTGTGTTAATGTG--------TAAATGTT-GCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTTA-TTTCATCGACATATTacggttttggtgagggtataatacttttgct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTCTATTAAGTTAAATT---CA--------CTTCT---TAA-ACTT-A-A-AACTTCATCTCCTCTTGCTTTTTGATTATTTACATTAATATAAT----------------TATATCTG-GAAATGA-AGTCATATTAAAATCTCCT---GCAATAATA-TTA--AGA---TGTC------C---TT--------C---C-TCCGA-----G-GAAG----CAT---TATGTAACTGGT-TATAAA--------------CTATT--GGTCATCAATTTTATTTA-TC-AAT-T-T-TATTCTTTT-T--CCAAATCTAGTAATA---TCTA-------TTTATTTCTAGCTTT----ATCTGAA-GATATTGAGAG-TAGTTTACATTCGAAGTTATTATTGAATAAAATTGCCACACCTC-----------GA--ACAATTGCAG--AAAAAACACCCA--------TATCCTTA--AAGCGCTTGTATAGATG-T---TTC-CGCCAT-GTCAGGAAAATGAGTATATTGT-AAGAAATATATTGAATA--TT--ATTTGCTTCTG-AAATTATGTAA-TGATTCTATTCTTTTATTTCTATAATTTAAGCATTGTACATCCA-TAGATGCTTTAT-----TT---ATTTTATTGGTCA-ATAATAGGTTTAGGGAAAACATAATATTTGCAgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGAGAGAGAATTATTCATTCTCTACTGTGAGTTTCCGTCCATAAATTTACCAA-TTCCGATTTTAGAAGAATTAATGA-------GTTTTGT-TTCTGCTT------CAT-T-TAA-A---------AATGT-------TAAAAGTGAGTCT---GAGATTTAAA-ATA-TA-TCTAATCTTGATTTCAT------GTGTTTTC-TTTGTAAA------C-----CATGTATAATA--TATCCT-TTCTAGGTTGTGGGCACACAAACACTCTACTAAATCACATT-----------------A---TG-TATTT-A-A-T----CATTCACTTTA----TTAGATAACGTTTATCAATATTACCAGATGCG-AC-A--------C-A-GGTTTAAAAA-------AAA-----CC---ACTATAATA---A--ATG---GGTC-----ACATCTG--------G---A-T---A-----A-AAGGG---AAT---GCTT-AACATATGTATAAAAGAGAGGATCGTCTTTATTTGGACCATAAAT---ATTTA-C--AAGAA-A-TAG-TTCCT-TA-TCACAAATGGCTGTT---CCTAAAAATAATGTAAT---ATC-------ATTGGTTGTCAATTGAGAG-AATTT--AATGCAAAATAAT
gi|16                         :                                          GTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTAT--TTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAAT----------GA---------TTGCT-----AAAAA---ATCCTTG--CTTCT-TTCAAAA-TT-------------------------------------------AA--T------TC---TTGGTTT---TTCAAAACTT-TGCCTTCATTTGATATTAGCAAAAATAATTTGTA-AC-CTTTTCCGCTTCATGCGACCATTTAGCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAACAGA----CTTTT---TT---TT-TTA-TTTT-------CTAA-ACTAACTAAATT-------AAT-------ATCTAA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTTATTT--TCTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTTCCCTGAATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTACTATCAGCATC-AAATCTTT-----
gi|17                         :                             atgtgaattgttAGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGATTGCTATAT--GTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGAT--AAAAAATC-CT-T-GCTTCTTTCAAAGTTAATTCTTG---GTTT-TTCAAAACTTTGCC--TTCGTTTGATATT----AG----CG-A----AGGTGTA----------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTACTTTC---TAG-ATTA-CAAAAATAATTTGTA-AC-CTTTTCCCTTTCATCTGACCATTTATCTTTTGATCTTATCTTAATGCCC-TCTAATTTTTTT-TGTCTTAATTCAAAGAGA--CTTTTTTTTATT---TT-CTAAACTAA------CTAA-ATTA--TTA----------TGT-----------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TAGAA-GT--TTAGACTCAGTTTGATTT--TCTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAATATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAacaaggtatgtc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatgtgaattgttgttcttgggtaTATAAAAGAGAGGCTTATCATTATCAGGGCCAAAGAT---ATAAA-C--AAG-A-AATA-TGTTCT-TA-TCACAAACTGTTGTT---TCTAAAATTAGTTTATTTC----TTTGAGAATTGGTT-TCTTTTGAATG-TATTTTGAATTCAAAGTTATTGTTAAAACGTATTGCTTTTTCCCTAGATT----------AAGTTACTA--AAATAACATTCA--------CATCCCCACTGAAT-----TTTA-ATAACATGTAT-T-TCCTCATCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AGGAAGTAGGATAAATA--AT--TTTT-CTTTTGAAGGAAATCAAATTGTATCTTTTCGTTTGGCTTTATCTTCTAGACCCTGTTCATTCA-TCGA-----TACGAAGGCT---ATTTTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTGGCTTTACCTCCAAGACCCTGTACAT-CA-CCGA-----TACAAAGGTT---GTTTTATTTGTCATcaata
gi|2                          :                      GTTTTCTTAACTTC-ATTCAATTTTGATATATTTAAAT-TTGAAAAAGTA-TCATTTAAAT--TTATGTTTTTAATTTCCCTGATT---G-AA--TATAATTCTTTAT--AGAA--CCGTT-TTGTTTCTTTAAGTATTGCATCTTG--TGTTT-TT-AAAA-TTTGAC--C---------ATT----AGATGCCTGA----AGTTGTAA---------CA---TTGATTTTGATGTATAGTTCCTATTTTC---TAA-ATTG-CAAAAAAAAATTT------CTTTTCTCCTTCTTGAACCCATTTTGCCCGTGATCTTATTCTTATCCCT-TCTAATTTTTTC-TCTCTTATATCAATTA-A--TTCTTTT---TT---TT-TTGATTCTA------TTAA-AGTA--TGGTTT-------TGT-------A---AGATTTCTTTTTCT--AGGTTTTCAATTTCAT-TA-TA-AA-GT--ATTGCTTCCCTTTGGTCT--TGTTGTCGTTTGATGTAAGAGGAATGAGAAATAGTTATTCCACGAATTTCAAATAAAAGCACTTCTAAAAATAGTTGATCACTTATATTAAATTGTAACTCCGC-----ATTTGGAACATTATT--TATATCATTAT-TAAA-----A-G-TCT-CTT-TAATGTATTGTAATTTTACACGGTTT-A-TTGTATTCTTTA-TTTTATCAATATAGTTTATATCTTTTAAAAGTGAATTGTTGAATTTCCAATATGATTTTCCTTTTTCAAATTTTCCAAATTCAAGTATTAAACGGATCAGAGAATGGTCAGTTCTATATCCTGGTT------TTA-TATCT-A-CAGTA-TCAATATCCATCATTAAACATG---TT---GAGATTAAAA-A-G-TAGTCAAGTCTTGCTTTCTTT--TGAGAGTTTTT-TTT--AAA------C-----CATGTG-AATT--TTTTTTCTTCTAAATGTTGATCGCGCCAACAATCTGTCAAATTACATT---CA--------ATCAA---TAAATCTT-G-A-A----GACTTTTTCGAGCATTTGGATTATTTATATTAATGTATTCA----CA-AC-AGTCTATATT-A-GGATCCAGAGCTACATTGAAGTCTCCA---GCAATGATGGTTA--AAG---AATC-----AG---TT--------G---C-T---A-----G-AATCT---TCT---GCTTTAAGTTAT-CATAGAAAATAGGATCATCTCTATTTGGGCCATAGAT---GTTTA-T--AAG-T-T-TATTTTTTT-TA-TTACATAAAGTTGTA---TCTAATATAATTTTATTTCCATTTTG----GTCTGTT-TCCACTGAATG-TACTTTGAATTCAGAATTATTGTTAAAAACAATAGCTACACCTCTAGATTGGCTAGA--AAAATTGCTA--AAAAAACATTCA--------TTTCCCCACTGGGTAC--GTATA-ACAGG---TAT--ATCTGCATCAGTAAAATGAGTGTCTTGA-AGAAAATAAATTGAATA--AT--GTTTACTTTTG-AGAAAGTCAAA-TGTATCTTGTCGCTTATTTTTATCTCCAAGACCCTGTACATTCA-TAAA-----TATAA---TTGAAATATTACTCGTCATTTAAGATATGCACTTAAAAA-TAATATAAGCAGAGACACAAATTGTTCTTAACAAAAAATGTACTAATCATTGTGGTGGCAGTGTTGTTATGTAAGGTACCAGTAAAAAGGCAAAGCCTGTGTGCATGCAAGTTGTATTGTTCATCGTTAATGGAGGTATTGTATACATTTATATCTAAATTCCCATCCCCTCTCCAACAAGATAATACTAAAAATTT-AAAATAACACAAAAACATCATCTGTACAAAAAATTAAGGCAACTCTTCGAAAGAGCGGTAATAAAAAACATACTTTCACTTTAGGATACTTCATTGTTTTCAAGATCAATCTAATATTTTAACAGGAAGTACTGACATGATATACTTATATATATATACACATATACAAACATATAATCTCATACACGCACAACTTTACACTCATATGTGTCTGGTTGTTCATCAATAATTATCTCCATAGTTATGTACATTTTAATTATCTCCCTTTATATACATATCAATTATCTCCCTTATACAatttacattataagtggattacgattgttgaggagatccatgctgttctgtcgcggcaataatttaagaatatgtctatccgaaaaatgcccagaaaaaatggcagtataagagagaaaaataattccatacccgatccagtgttcagtgtcatatacttgtacaaaactaatcatgagttcattttcctaatttttaaacaacaacacatgtaagtagtga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TC-----AG---TT--------G---C-T---A-----G-GATGTTACCATCAGG--TTAACAT-----TGAAA--TAGGAGTTTCTTATTTTGGGCCATAA--------TG-T--ACC-T-G-TAATTGTTT-TA-TTGCACAAAGTTGTA---TTTTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caacattgaagtatcgaatatTG--AAAAAACATTCA--------TATCCCCAAAGCGCTC--GTATAGAT--T---TTT-CCTCCATGTCAGTAAAATGAGTATCTTGT-AAGAAGTATATTGAAT---CT--TTTTtttca
gi|3                          :                                         AGTTTAGGTATGTGAAAATCTTTAAACAATG-T-ATTCAGAT--TGCTGTTTGTAA----C-TGGTTTGTG-GGCATATAATGATTGATCAAAAA--TC-CT-T-GCTTCTTTCAAAATTAATTCTTG--TTTTT-TTCAAAACTTTGCCTTC---------ATTTGATA-----TT-AGCGAAGGTATA----------CA---TTTACTT----ACAAAGTTTCTATTTTC---TAG-ATTA-CAAAAATAATTTGTA-AC-CTTTTCCCCTTCATCTAACCATTTAGCTTTTGATCTTATATTAATGCCC-TCTAATTTTTTTGTCT-TTAT-TCAAACA-G--TCTTTTT---TTATGTT-CTAAA-CTAG-----CTAA-ATTA--TTATCT---------------------AA--TTGTTTTTCA--AGTCTTTCAATTTC-T-TT-TA-AAAGT--TTAGACTCAGTTTGAATT--TCTTGTTTTTTAAGAAAAGATGAGTATGATATTGTTTTACCCCGGATTTCCAATAGTAACATTTCAAAAAAAAGTTGATCGTTAATATCTAGCATCAAATCTTTACAAGGTATGTCACAA-ATT--TGTA-CATT---TAAAT-TTTG-A-TCT-CTTGTTGCGTACTGAAGTTTTGTATTATCA-A-TTACTTTTTTAA-TTTCGTCTACATAAGTTTTATCTTTTAAAAGCGAGTTATTAAATTTCCAATATGAACGTCCTTTTTTAAATTTCCCAAAAGTAAATGTTAAAGTAATTATTGAATGATCTGTTCGATACCCCGGTA------AAA-T-ATT-A-CTATCCTCAATGTCAGTAAGTAAA--TG---CT-CTGAAATCAGAA-A-A-AAATCCAATCTGGC---CATT--T---TATTTGTATTT--AGA------CGTCTCCAAGTA-AACT--CTCTCTTATCAAAGTTAAGTTCTCTCCAGCAGTCTGTCAAATTACATT---CA---------TTAA---TAATACTT-A-A-AA---CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-----------ATC-----AT---TT--------C---CAT---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAACCCCTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TTGGTCCATACAT---ATTTA-TCGAAG-TCA-TCCTTTTCT-TA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTATG-TATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTAT--ATAAT---TTT-CATCTTTGCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-----AATAAAGGTT---ACCTTATGAGTCATTatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgtgaattgttgttcttgggtaAATTACATT---C---------ATTAA---TAATACTTAA-A-A----CATTTTCCCTAGCTTTAGGATTATTAATATTTACATAATTA----TGTGT-A-TCTATTTG-G-AGATTGAGAACTAGGTTAAAGTGTCCT---GCTAAGATTGT-----------ATC-----AT---TT--------C---CAT---ATCTATC-AATGT---CTT---G-TTTAACCCCTGTATAAAACTCAGGTTTATCTTTG-TTGGTCCATACAT---ATTTA-TCGAAG-TCA-TCCTTTTCT-TA-TTA---ATTGTCATA---TCTAAAATCAGTTTATTACCATCTAT----ATCACCT-TCAGTTTTATG-TATTTTGTATTCAAAATTATTATTAAATAGAATTGCAAGACCCATAGATTGACTGTT--AAAACTATTA--AAAAAACATTCG--------AAACCCCACTGCGCAC--GTAT--ATAAT---TTT-CATCTTTGCTGACAAAATGTGTATCTTGTAAAAAAATAGACAGAATATGAT--TTTTGC---TGCAAAAAATGGAA-AACATCTAGACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAA-CTGA-----AATAAAGGTT---ACCTTATGAGTCATTatttataaaactgtatatatacattggctg
gi|5                          :                       TTTTCTAATCATT-ATTTAGTTTAGGAACATTAATAT-CAGAAAATATA-TTATTTAAAT--CTACTTTTACAGTTTAA-T--TTTG-GGAG--TCTAATTTTTTAT--AGAA--TT-TTACTGTTTCCTTAATAATTTAATCTTGATCGTTTATT-G----TCTGTT--C---------ATT----A-----TT-A----AGTTTTAAACT------CAACATTGATTTAGATACAAAATTTTGGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAGTA---TCTAGACATTTTTCCCCCTCTTGAATCCATTTTGCTCTTGATCTAATTTTCATACCT-TCT--TTTTTTT-CCTCTTATATCATTTA-A--TTA-TTG---TT---TC-TTAATTTCA------AT---AGTA--T--TTT-------TATCCCATACA---AG--TCCTTTTTCA--AGTTTATCTTTTTCAC-CA-TA-AA-GTAATTG--TTCTCTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTATTGAATTATGAGTATGATATAGTTTTTCCTCTAATCTCTAGTAACAATACTTCGAAAAACAATTGGTCATTTTTTTCTAATTCTAAATTTTT-----ATTTTCGA------T--TGTGTTAATATGTAAATGTT-GCGTTTT-CTT-TGA-ATATTGTAGTTTTATTCTGTTT-A-TTATTTGTTTTA-TTTCATCGACATATTTTTGGTCTTTTAACAATGAATTATTCATTTTCCAGTATGATCTCCCCTTTTTGAATTTGCCAAATTCAAATGTCAAAATTAATAAAGAGTGATCTGTTCTGTATCCAGGCT------TAATT-TTT-A-CTGTA-TTTATATCTG---TTAAAAGTGAA-TC-C-GAAATAAAAATA-A-TAATCTAGTCTTGCTTTCTTTGACGAA---TTTT-TTT--AAA------C-----CAAGAA-AATT--CCTTTTTTTCCATATTTTGATCTCGCCAACAATCAATTAAATTACATT---TACCCATTACATTAA---TAA------G-A-A----CATTT---CGAGCGTTTGGGTTATTTATATTGACATAGTTA----AA-ACAA-TCTAGATC-A-GGGTTTAAGACCATATTAAAATCACCT---GCAATAATG---A--ACA---AATCGTCATAA---T-------------C-T---A-----A-AATGT---CAT----TTTTAAGGGTTGTATAAAACATTGGATCATCCCTATTTGGGCCATAAAC---ATTAA-T--AAG-T-G-TAATTTCTT-TA-TT---TGAAATTGTAGTTTTCAAGATTAATTTATTTCCATCTTT----GTCAGGT-TCTACCGCATG-AATTTTAAATTCAAAATTATTATTAAAAAGGATAGCTACCCCTCTTGACTGACTGGA--ATAGTTGCTG--AAATAGCATTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--GTAT--ATAAT---TAA-CTTCTTTGTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTC-CTTTTC-AGAAAATATAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-----T------GTT---ACTTTATTTGTCATatttataaaactgtatatatacattggctgtctggtcagacgtaaactgtatattctgtataactgtttttatccataccggtacagtatatggtttgaaacctactagtcattgttccctgccacctgttcacacagaaaaaagcataaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataataggggttgggggcagatatttacatacataaaaaaggagatattcaaaaatcattttttttgttatctttccattaccaaaaagaaaaagggtactgtagtgtatacagtatatacacgaacctaactaaacctagttgtcattatctaataatagattaaacatagttacaatagtagattaaacatagttacaataacatgtacagaaagatcaacatcaatgtgcatgagctatttttacacactaatgataatgactgtatttaaggagagaaaaaacaaaaaacaatggtaatcatcgacgttttataaaaaaaacaaaaacgaggtcttatattagtatctcaacatacactagtttttaaaacttaacttttatagttacaatgtcaaagtacactcgtatatacaacttatatagtatttacattcacattttagttaagagaaaaaaaaaacatacacaaaaaaaaacagagcatgatagtaccatattctttgtacatgcatttgatccaccagaaatatatttctgacatctgtttcatttaatcacagctggttgtctgtaaaaaaaaattaaaacaattggcagagttctaatataaagccaagaagacatacaagcacatactgtacttcctatctgatatgcaatacatgtttaaacacacacatacatacacatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttAAAGTACATT---CA---------TTAA---TAA-ACTT-A-ACA----CATTTTTCCTAGCTTTAGGATTATATATATTTATATAAGTA----TGCGT-A-TTTATATG-G-GGATTGAGAACTAGATTAAAGTCTCCT---GCTTAGATTGT-----------ATC-----AT---TTCCATAGCAA---C-T---A-----GCAATGT---CTT---G-TTCAACACATGTATAAAACTCTAGTTAACCTTTGTTTGGTCAATAATT---ATTTA-TTTATG-T-CATTCTTTTCT-CA-TTA---ATTGTTATA---TATAAACTAAGTTTGAAACCATCTAT----ATCACCT-TTAGTTTGATGGTTTTTTTTACTCAAAATTATTATTAAATAGTATTGCAACACCCCGTGACTGACTCTT--AAA-TT--TA--AAAAAACACACACACATTTTTAACCCCCGTGGGCAC--GTATA--TAAT---TTTTCATCTTTGCTGACAAAATGTGTAACTTGT-AAAAAATATACTGAAT---ATGATATTG--TTTA-AAACAATGGAA-AACATATATACGTTTATTTCTATCACCAAGGCCTTGGACGTTAACTAGA------ATAAAGGTT---ACCTTTTCAGTCATTaatgttatataaaatggac
gi|7                          : tgaccacgttaaaaaaattaaaaaTTTTAAATTTTCATCTAGTACAGGGACATCAACGC-TTGATAGGACAAT-CTTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAATTTTTTAT--AAAA--TAATT-GTGTTTCTTCAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TA-ATAA-TTTTAC--C---------ATT----A-----CT-A-----GTTCTAA--TGTTTGTCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAG-AATTTA-G-ATTTTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCGAATTTT-ATTCCCATCCATTTTTTTTCTCTCTAATATC--GTA-AAGTTCTTTT---CT---TT-TTGATTC-A------ATAGCAGTA--TGGTCT-------TGT-------A---AA--TTGTTTTTTATTAGTTATTCTATTTC-TATA-TA-TA-AT--TTTTCCTCCCTTTTAATT--TTTTTTTTTTT---GAAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTTCAAAAAATAATTGATCATTTATACTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATG--TATGTCTGC---GAAAT----G-A-TTTTCTT-TAACATTTTGAGATTTCACCAT-TCT-ACTTGTATTTTTTA-TTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTATCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAATAATATTTACGAATGATCTGTTCTGTTACCTGGTT------TAA-T-TGT-AACTTTA-TCAATGTCTGTCATAAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-AATAATCTAATCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------C-----CATGTA-TATTCTTTTTTTCTTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAACTTACATT---CC--------GCCAT---TTATACTA-A-T-A----CAGTATTTCGAGCATTTGGATTATTTAAATGTATATAGTCA----AA-GCAA-TCTATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGAAG---AATC-----TT---TA--------G---C-T---A-------AATTT---TTT---TTTTGAATTTGATTATAGAAGTCGGGCTCGTCTTTATTAGGACCATAAAT---ATTAA-T--AAG-A-G-TATTTTTTTAAA-TTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGTG-AATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTTCTCTAGACTGGTTAGT--AAAATTGCTA--AAATAACATTCA--------TAGCCCCACAGAATGC--GTATG-GTATT---AAT-TA-CTTTATCTGTAAAATGCGTGTCTTGT-AAAAAATAatttataaaactgtatctacacattggctgtctggtcagacgtaaaatgtattatctgtataaatgttattgatcgttaccggcacagtatatggtttgaaacctactagacattgttctctgcaacctgttcccacataaaaagcacaaagtacaaaataaaaaatacatgaaaataatgggatggaaaagcagattcataaatctcttttttgttgtctctccattaccaaaaagtgtactggggtatatacagtatgtacacgaatatagctaaatctagttgtcattttctaagaatagattatacatggttacatgtacaaactatcaacatcaaaatacaagagctatttttacactccttcaaaaataaaaacaaaaacccacactaataactgtatttaaggagaaaaaaatcacagtagtaaacattgatattttataaacaaaccgagacgtcttatattaatatctcaatatatattgagtttatcacttactattttagttacaatgtcaaagtatatataattaatatagtatgtacatttcagttaagaaatttttaaaaaaaaaacaacaacagcagaatagtacccgattcattgtacatgcatttgatccactagaatatatttctgacaactgttccattaaatcacagctggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaatacatatacaacatacatatacacaaacgtacatatataaataaatacatacacatacatacaca
gi|8                          :                          TTTAAATTTTCATCTGGTATAGGGACATCAACGT-TTGAGAGAACAAT-CTTTAAAT--CTATGTTGGTGGTTTCA-TTATATG---AG--TACAATTTTTTAT--AAAA--TAATT-GTGTTTCTTTAAGTATTTCTTTTTG--CGAGT-TT-ATAA-TTTGAC--C---------ATT----A-----CT-A-----GTTCTAA--TGTTTATCA---TTGATTTCGAAATAAAATTTCTGTTTTC---TAA-ATTA-CAAAAAAATTTTAGA-ATATTTTTCTCCTTCCTGTACCCACTTTGCTCGTGATCAAATTTT-ATTCCCATCCACTTTTTTT-T------------ATA-G--TTGTTCT---AT---TT-CTA-------------------TA--TA-------------T-------A---AA--TTTTCCTCC------CTTTTAATTTC-T----------GT--TTT--------------T--TCTTG----------AAAGATGAATATGAAATAGTTTTTCCTCTGATTTCTAAAAGAAGTACTT-AAAAAATAATTAATGATTTATGCTAAATTCTATATCTTT-----GTTTGCAATAGTATG--TATGTCTGC---GAAA--TT-A-T-TTT-CTT-TAACAGATAGAGATTTCACCAT-TCTAA-TTGTATTTTTTA-TTTCTTCAACATATTTTGTATCTTTTAATAATGAGTTGTTCATTTTCCAATACGATTTACCTTTTTTAAACTTTCCAAATTCAAATGTTAAGAATATTAACGAATGATCTGTTCTGTAACCTGGTT------TAA-T-TGTAA-CTTTA-TCAATGTCTGCCATTAGAGGT-----T-CAGAAATTAAAA-A-A-TAATCTAACCTAGCTTTCTTT--TGCGTATTCTT-TTT--GAA------T-----CATGTA-TATT--TTTT---TTCTAAATTTTGATCCCGCCAGCAATCAATTAAATTACATCCCGCC--------ATTAATTCTAATAC-----A-G----TATTT---CGAGCATTTGGATTATTAAAATGTAAATAGTCA----AA-GCAA-TATATATC-T-GGATTCAAAACCAGGTTGAAATCTCCT---GCTATAATA--TAAGAAG---AATC-----TT---TA--------G---C-T---A-----A-AATAT---TAT----TTTTAATTTGATTATAAAAGTCGGGCTCGTCTTTATTAGGACCATAAAT---ATTAA-T--GAG-A-G-TATTTTTTT-TATTTGC-TATAGTTGTT---TCCAATATGAGTTTGTTTCCATTTTG----ATCCGTT-TCTTTGGAGTG-AATATTAAATTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGCAACTCCTCTAGACT--CTAGACCAAACTCGATAGTAATAAACAgataat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCA--------TACCCCCACTGAGTAC--TTATA--TAAT---TAA-CTTCTTTGTCTGTAAAATGGGTATCTTGT-AAAAAATATACCGAATA--AT--TTTTACTTTTC-AGAAAATCTAA-AGTGTCTTTTCGTTTGTTTTTATCACCAAGCCCTTGCACATTCA-TAGA-----TGCAAATGTT---ACTTTATTTGTCATagattgcctgcattca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TAGTATCAATAACCTTTTCAAAATTTAAAATAATATAATATGTATTTTTTTTTAAAATGTTATTAAATTTTCAGAAAGAATTTCCCTGTTGCCAAATAAAAACATTACATTTATCATTGTGTTGTGTGTTCGGTAGCCAGGCAGAATATCTAATGTAAGTTTTTAGAAAAAATATAGTCTTGCCATTTTGTTTGTATGTGCTCGTCTCCATGTAAATCCTTTATTTTCGAAATTAAGAT