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Reference ( gi|1 )            : AACTGTAATGGTCACTTCTTAAACACGATATACGCTTCAAAACATATTTCAATCAAGATGTCT-ATCTTCTATCCTAGCACA-AT-CATTCCTCGGCCTCTCAATTCCAACTTCCT--GCCTAAAAA-CCTAGACCTA-ACTATCTGTCTCTCC-CATCCC-AACTTTA-CTA---T---CCGACT---CCCAG-ATCTAAACTGT--T-T---GCATTTCC----CATTCAAA----A----ATGATTCTCTTGTA------TCT--TGCAT-TATAAAATGGCATA--AACGTGACAGCAAATTCATATACAAGTCACGTTCCTCATGT-TCATGTTGGAC----AGATGTTCG----CT-ATAT-CAA--TTACATACACATT---GCCCTGTTAAAAG------A-TCACCC-----G-AGTGTGATCGCTAAACTTAC--ATGAATACGGGCCTT-TGTCAAATTACAAACAT---GT-TAATAT-A-ATTA--TGATAGTTTC-CAGTTT--A-CT----AACGT------AAT-GTAT--TATCTT--CATTGACCCA--ATTATATTCGATTAATCTA----TTTTAAAAATG--CTAATTATTGAGTGATTATAAAACGCTA-ATAAATGGAAAGTAATACATGTTTTGTTTTTACATATTGAGATCGGGTAAATTGTAAATTTTATATTATATATTAACAC---AA--CACAGTGAATTTTTGGA-----AAAAC-TTTTTTTCCACATACTTTTTTTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAAACTTAATATTTTTGGATATTGATAACAATTATGAAGTTAAATTCAAAATTTCAACTCAAAAA----GT----AAAATACTGA--------GATAAATGGAATTAAA-GCAGTAAA----------TGGGAAAT------TA-------CAATTTCGG---------------A---CAGG---T----C---A-AT-T--CCAATTGGAAA-CA--------CAAG-T------TTCCAATTGA-A-A--GGTATATGACT--CAGTTGGT-AG------ATTCTATTGATAGATTC---TATTTTTAGATCAAGTT-TTCAATTGGAAGGTAAA-AA--T-CCAATTGGACGATTCTATTTATATAACAAATATTTTGAGTATGTGTAAAGTAAGAGCGT-------GTGTATG--TG--------AATGTGGGCATGCGTTTGTATATGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTTT---AAGTACGTTTGTGTTTACGTCTGTGT----GTG----A----AGCGTACGCCC-CTTACTATGTTTGTATAT---GCA---TT---CACGTGAAAGCATATGCGTGTATACATGTGCATAGAAACTAGAAGTAACAGTGAAAGAAACAAACACAAAAGAAGCATTTATATGTGTGCGTGCGAGTAG-TG-ACTTCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-ACAG
gi|12                         :  ACTGTTATGATCATTATTTAAACACGATATACTCTTCAAAACATTGTTCAGACAAAGCTCCC-ATCTAGTCTCCTAATACA-CA-CA-TCCCCAGTC-CTCAA---AAAGTCCCTAAACTTAAAAC-CCCAGTCTTA-ATTTACTG----------------GCTTTA-AAA---C---ACAACT---CT-----TCTTAGTT-T--T-T---ACA----------ATACAAA----A----ACTATTCACAGAAA------ATT--TGCAC-CATTAAATGATATA--AAAGTAACAGTTCATTCATATACAAGTCACATTTCTCATG
gi|8                          :                                                             TCTCATCTTGCCTCCAAACACA-CA-CATTCC-CGGCCTT---ATT------------GCCTAAAAA------ACCCACACT-----TCTCTC----------ACTT----------------GCT---TTCAG-AAGTAGACTGT--------------CC----CCTCCAAATCTTA----A--ATTTT----TA------ACT--TGCAC-TATAAAATCACATA--AAAATGATGGCTAGTTTATATAC-CGTCACATTGTTCATG---CAC-CTGGACAATTAAATATACA----TT-A-AC-CAAGTTCACATATCTATCTTAGACCTGTTTATA--------------C-----T-ACTG---TTGCTCATTTTAT--GTGAATGCGGCTCTTAAGCCAAATTAAAAACAT---GT-
gi|10                         :                                                          cgaagt-ATCTTGTAGCCTAATCCA-AA-CATCCCCCGGCCTCACAAATCCAACTCTCA--ACCTCCACATCCAAGACCTA-ACTGTC-----CTCC-AATCCA-AACTTTAACTAAGCC---CTAATTGAACCTAATATCTCA-CTGTCCT-TAA-GC-CCCCT----CATCCAAACT--ATCC-GTG--TCTATTATAACCATGTCTACTGAAC-TCTAAT-TATCATA--AAAGTGACAGCAAATTAATATACAAGTCACGTTTTTCATGG-ACAT-T--GAC----TGATATTCGGTTTCTAAAAT-TGG--TTACATaa
gi|18                         :                                                                    ctcgcTCCTAACACACACACATTCC----CTTC----------CTTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTCCCTGGCTTTCgtta
gi|2                          :                                                                                                             acaaagttaccatctcgcc-CTTAAATCTA-ATTCTCGACCTCACCGCATCCCTGACCTAA-CTA---AGCACTAACTGAACCCAACATCTCAA-TGT--CGTAAAGCCCTCCCTGCTCAT-CAGA----ACTATATGCTTCCTTTGTA------AC-----CATCTCTA---CTGCACACTAAT-TGTCATCAAAATCA---GCTAATCACGATTTTCATAT-ATACGCTAGAC----AGATGTTCG----CT-ATATATAA--TTGGACACACGCT---ATCCTATTGACAGTCT---C-TCATCA-----G-AA-GTGACCTCAAAGCTCCT--ATGA---------TT-TGCCAAG-TACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTG-TTGTT-----GTCTCAA-CTAGGAAATATCCAAA-AATAGCAT--TATAT----ATTGGCTTT--AAAATATTACATTATTCAA----CTCATAAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATAagtaataaactgccctccctaaacaaaaactggtaacttgcactattaaatgacattaaagtgacagctaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                gtctACTTAA-CTC---C---CTGGCT---TTCAG-TAATAAACTG----------CCCTCCC----TAAACAAA----A----A-------CTGGTA------ACT--TGCAC-TATTAAATGACATT--AAAGTGACAGCTAATttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|7                          :                                                                                                                          acaaagttaccatctcgcctcctaacacacacacattcccttccttcctgccgaaaaaccaagCT---CTCA---TCCAAACTAT--A-T---GC---TAC----CTTT--AT----A----ACCAT-CTCTT-----------C--TGCAC--ACTAATTGTCATA--AAAGT--CAGCTAATTCATATAAAAGTCACGTTT-TCATGT-ACATGCTGGAC----AGATGTTCG----CT-ATATAAAA--CTGGACACACGTT---ATCCTGTTGACAGCCCGTTACTCATCA-----GAAGTGTGACCTCTAAACTCCC--ATGAA---------T-TGCCAAG-TACAGACCTACCGTATACTAT-AGACTATCTGTTACTGTCACGCCTT--AGCT----TATATCCCTCAAAA-GCATTATATCTTGGCTTTGA---AATATTACATT--ATTAAACTAATAGTATTAA-------TCAATTTCTGAGTGACTATAAAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccAATGACATA--AACATGACGGCTAATAAATATAC-AGTCATATTATTTATGTATCA----GGAC----A
gi|6                          :                                                                                                                                                                 gacaaagtccccatctctgttatgtaacacacacattcctactcaaaacccatccatcctaaaaaaaactgacttaacatacccgcattcagaagtagactgaaacaaaaactggtaagtattcCATA--AAAGTGACAGTTAATTCATATACAAGTCACGTT-TTTATGT-ACATGCTGGAC----AGCTGTTTG----CT-ATATAAAA--TTGGACACACGTT---ATTCTGTTGACAGTCC---A-TCACTCATCAGA-AATGTGACCTCTAAAC--ACCGATGAATa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cctcctctcatccaaactatatgctacatttataaccatctctactgcacactaattctTATTAAATGT--ATACTTAAA--CACAGTGAATTCTGGAA-----AAAAC-TTTT----------------TTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAAATTTTATAATTTTATATAATTATAACTATTATTAAGTTACATTCAAAATTACAGCTCGGAAAGTTCGT----AAAATGCTAA--------GATAAATTGAATAAAA-GTAGTAAA-------------AAAACACTCTGTC-------CAATT--GG---------------AATTC------T----T---ATAT-T--CCAATTAG----CA--------TTAG-T------TTCCAATGGG-A-A--tgccaagtacagaactactgtacactatagactatctgttgccgtcacaccttaacttatatcacacaaaagcattataatttggctttgaaatgttacattattaaactaatagtatcaatcaatttatgtgtgcctataa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atgacttggaataaagcgctgacaaaacaattcaatTATGTTTTAACAC---AA--CAAAGTGAATTTCTGGA-----AAAA-------------ATACTTTGTTTTTCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAATTTAAAATTataacgatttccaagtggtcaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaATATCAAAAG---AAATCACAGTGAATTTCTGGA---------C-TTTTTTT-----TA--------TTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAATTCAAAATTTCAGCTAAAAAA----GTCTGTAAGATACCGATTCAAAGGGATAAATGGAATTTAA-GTAGTAAA--------------AAACACCCTGTC-------CAATT--GG---------------A-----AT---T----C---TTATAT--CCAATTGG----CA--------TTAG-T------TTCCAATTGG-A-A--A-T-TACGATTTCCAAACAGTCAA------ATCCAATTGG--GA-------------ACA-CAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-AAAAT-CCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTG--------AATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCC---AAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTG----A----AGCGCACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaTAACAC---AA--CACGGTGAATTTCTGGAGAAAAAAAA-------TCCTAAA-ACTTTT-TTTTCATTATGAATTTTAATGTTATAAACTGAATACTTTTGGATAATTATAACAATTATTAAATTAAGTTCAAAATTAAAGCTCAAAAACTTCGT----AAAATACTGA--------GATAAATGGAAATAAA-GTAGTAAA--------------AAAA------CA-------CAGTTTTGC---------------A---GAGA---T----C---tgcgtttgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgAT---AA--CACAGTAAATTTCTGGA-----AAAA-------------------TTTTTTTCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAATTTAAAATTTCAGCTAAAAAA----GT----TAA-----GG--------GTCCAAT-------AA-GAAG---A----------T----AAT-----------------ATTT------------------A---TAGA---T----C---ATAT-T------TTAGAT------------CAAG-T------TTCCAATTGG-A-A--TGTAAAAAATC--CAATTGGA-AG------ATTCTATTTATAGA-TCAAATATTTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttAC---AA--CACAGTAAATTTCTGGA-----AAAACTTTTTTTTCCAAAAGCTTTTTTTTT-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAATTCAAAATTACAGCTCAAAAA----GT----gtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT----TTTTTG-ATAATTATAACTATTATGAAGTTAAATTAAAAATTTCAGCTAAAAAAATT-GT----AAAATACTGA--------GATAAATGGAATTAAA-GTAGTAAA-------------AAAAC------CACCCTGTCCAATTT-GGAATTCTTATGTTCCAA---TAGGCATT----C---G-TT-T--CCAATGGGGAATTA--------CGA--T------TTCCGACCGG-A-A--AACACAAGTTTC-CAATTGGA-AGGTAAAAATCCGATTGGACGATTC---TATTTATAGATtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacacaaaaaaacccaaaaaaaacATTATAAATTAAAATTCAAAATTTCAGCTCCCAAA----GTTCATAAAATACTGA--------GATAAATGTAATTAAA-GTAATATATATATCACCCTGCTCAAT------TG-------GAATTTTGG--------------------AAT---T----CTTAA-AT-T--CCAATTTGCAA-T-----------AG-T------GTCCAATTGG-A-A--aaaatattttgtgtacgtgtaaagtagttgcgtgtgtatatgaatttgggcatgcgtttgtatgtgagtgcagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgagtgaagcgtacgtccgtttgcaggtatgtttatgcaccaagcgcgtggatacatatgcatgtatacatgtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacatgtgcgtgcgtgtagtgtgcacagtgacagaaataacaacagcagcaacagca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGAACTTAAATGCTATAAA----------C------T------TAA------TAATTTTGG---------------A---TAAG---TATAAC---T-AT-TATTCAGTT--AAA-TT--------TAAA-A------TTTCAGCTAA-A-AAAGTTA-AGGGTC--CAATAAGA-AG------ATAATATTTATAGATCA---TATTTT-AGATCAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA-T-CCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-------ATGTATG--TGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGT---AAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGT----GTGCGTGA----AGTGTTCGTGC-GTTTGAAGGATTGTATAT---GCA---GCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTT-AC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-attacaatttccaatgattaattttcgattgatttggaatcaattt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttataacacagtaaatttctggaaaaatttttttcattGGAAAT------CG-------TAATTTCCA---------------A---TTGGAAAC----T---A-AT-G--CCAATTGG--A-TA--------TAAGAA------TTCCAATTGG-ACA--GGgtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacacT-T--CCAACGGGAAA-TAAGGATTTCCAAG-CGGTCAATTCCAATTGGGA-A--GGTAAAGGGTC--CAATTGGA-AG------ATTTTATTTATATATTC---TAT----AAAAAAAATCGTCCAATTGGAATGTAAACAA--T-CCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCGC-------GTGTATG--TGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTG---GTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGT----GTG----AGTAAACCGTATGTGC-GTTTGAACGTTTCTATATACAGCA---TG---TGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTT-AC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-aaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcccaattggaattcttatattcaaattggcattagtCAAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-AA--T-CCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-------GTGTATA--TG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGT---AAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTG----A----AGCGTACGTCCGTTTGC-AGGTATGTTTAT---GCA---CCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAG-TG-TGCACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAGgtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacacaaaaaaacccaaaaaaaactttttttcattatgaactttaatgttataatctttttttgataattataactattatgaagttaaattaaaaatttcagctaaaaaaattgtaaaatactgagataaatggaattaaagtagtaaaaaaaccaccctgtccaatttggaattcttatgttccaataggcattcgtttccaatggggaattacgatttccgaccggaaaaca-TCCAATTGGATTGTTTA-CA--TTCCAATTGGACGATTTTTTTTATAGAATATATAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcccaattggaattcttatattcaaattggcattagtttccaacgggaaataaggatttccaagcggtcaattccaattgggaaggtaaagggtccaattggaagattttattAATTGGAATATAAG-AA--TTCCAATTGGACcgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atgacttggaataaagcgctgacaaaacaattcaattattaaatgtatacttaaacacagtgaattctggaaaaaacttttttttcattatgaactttaatgttataaattttataattttatataattataactattattaagttacattcaaaattacagctcggaaagttcgtaaaatgctaagataaattgaataaaagtagtaaaaaaacactctGCGCTTGTATGTGAATGCAGCATTGGTGCTTGTGT---AAGTGTGTTTGTGTGTCCGTCATTGTTA--GTG----A----AGCGTATGTGC-ATTTGAATGATTCTATAT---GCAGCATG---TGCATGAATGCATGTGCGTACATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACGGTAACAAGCACAAAAGAAGCATTTATTTTTGTGCGTGCGTGTAG-TGTAC-ACAGTTGCAGAAATAACAATAGCAGC-agcattagtttccaatgggaaataacgatttccaagtggtcaa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CTTAAACTCCTAACTGGCACTATTACCTGACATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCACCACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTACACTGGCCCGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGAACATGTCTGTTCTTAGCCCTATGTACGCTGTTGTTGATTAT
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGCCAAGTAACGTCCTACTATATACAATTAACTACTTGTTGTCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATAAGTTTAATATTTTGAGTTTAAATATTACATTATTAAACTAACAAAAAACAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
Unaligned ( gi|21 ): ATCCAAAACTGTTCCTACTCAATCTCTCAATTTCATTGCATCCCTAATTGAACCTAAGATCTCACTGTTCTAAAGCCCC
Unaligned ( gi|22 ): AGACAAGTACGCTGTCCTCTTGACGTGCCATCACTAACCATATGTTTAACCTCTAAGCTGCAATAATTAGCCAAGTAC






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Reference ( family-194 )      : NACTGTTATGATCATTATTTAAACACGATATACTCTTCAAAACATTGTTCAGACAAAGCTCCCATCT-TGTCTCCTAACACANACA--TTCCCCGGCCTC-CAA---T---AAC---TCCCT--GCCTAAAAA-CCNAGACCTAACTCTCTG-CTCTC----C-A-TCC--GA--CTTNAC-TA---C-CTAACT----CTCAG-ATCTNAACTGT-T-----G------C-CTCCC----CATNCAAAA--AC-AT-----TCTCTTGTAACT--------TGCACTA-TNAA-----ATGA-CATAAAAGTGACAGCTAATTCATAT---ACAAGTCACGTTTTT-------------CATGTA-CACGCTGGACAGATGTTCGCTATATANAATTGGACA--CACGTTATCCTGTTGACAGT-CCA----TCAT---CCG-AA-TGT--GACCTCTAAACTCNCATGAAT-------TTTGCCAAGT-ACAAACCTACCGT-TGCTATAAGACTATCTGTTNNTNTCACGNCCTCAAGCTAGGANATATCCNNNAAANAGCATTATATNTTGGCNTTGGCTTNATANNACATTACATTANNCNAATAGCNCNNAAAATGAATNAATTNCTGAGTGACTATAAAACACTATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTACGTNTTAACACAACACAGTGAATTTCTGGA----AAAACTTTTTT-------A-ACTTTTTTTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTCAAAATTNCAGCTC--AAAAA--TTGTAAAATACTGA--------GATAAATGGAATTAAAGTAGTAAA----AA----A-----CC--G--C--------AAT-TTTGGA----------------TAGGT-CA--T-A--T-T--CCAATTGGAAA---T-A--------C--AAGT------TTCCAATTGG-AAG-GTAN-AGGGTCCAATCGG-AAGATCCT-ATTTATAGATTC---TATTTT-AGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGT--AAA-A-AT-CCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATANTTTGTGTACGTGTAGAGTAGGNGCG-TGTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTTGTGTGTCCGTCTGTGTGTG-GTGAAGCGTACGTGCGTTTGAANGNTTNTATATGCA-CGAGCGCGTGAATGCATGTGCGTGCATACANGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAGCATTTATATTTGTGCGTGCGTGTAGTTNAC-NCAGTNGCAGAAATAACAACAGCAGC-ACAG
gi|1                          :  ACTGTAATGGTCACTTCTTAAACACGATATACGCTTCAAAACATATTTCAATCAAGATGTCTATCT-TCTATCCTAGCACAATCA--TTCCTCGGCCTCTCAA---TTCCAAC---TTCCT--GCCTAAAAA-CCTAGACCTAACTATCTGTCTCTC----CCA-TCCC-AA--CTTTAC-TA---T-CCGACT----CCCAG-ATCTAAACTGT-TT----G------CATTTCC----CATTCAAAA--ATGAT-----TCTCTTGTATCT--------TGCATTA-TAAA-----ATGG-CATAAACGTGACAGCAAATTCATAT---ACAAGTCACGTTCCT-------------CATGTT-CATGTTGGACAGATGTTCGCTATAT-CAATTACATA--CACATTGCCCTGTTAAAAG----A----TCAC---CCG-AG-TGT--GATCGCTAAACTTACATGAATACGGGCCTTTGTCAAATTACAAACAT---GT-TAATATAA--TTAT--GATAGTTTC-CAGTTT---ACTA--ACGTA--------AT-GTATTAT--CTT--CATTGACCCAAT--TATATTCGATTAATCTA----TTTTAAAAATG--CTAATTATTGAGTGATTATAAAACGCTA-ATAAATGGAAAGTAATACATGTTTTGTTTTTACATATTGAGATCGGGTAAATTGTAAATTTTATATTATATATTAACACAACACAGTGAATTTTTGGA----AAAACTTTTTTTCCAC--ATACTTTTTTTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAAACTTAATATTTTTGGATATTGATAACAATTATGAAGTTAAA-TTCAAAATTTCAACTC--AAAAA----GTAAAATACTGA--------GATAAATGGAATTAAAGCAGTAAATGGGAA----A-----TT--A--C--------AAT-TTCGGA----------------CAGGT-CA----A--T-T--CCAATTGGAAA---C-A--------C--AAGT------TTCCAATTGA-AAG-GTAT-ATGACTCAGTTGG-TAGATTCT-ATTGATAGATTC---TATTTTTAGAT-CAAGTT-TTCAATTGGAAGGT--AAA-A-AT-CCAATTGGACGATTCTATTTATATAACAAATATTTTGAGTATGTGTAAAGTAAGAGCG-TGTGTATGTG--------AATGTGGGCATGCGTTTGTATATGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTTTAAGTACGTTTGTGTTTACGTCTGTGTGTG----AAGCGTACGCCCCTTACTATGTTTGTATATGCA-TT--CACGTGAAAGCATATGCGTGTATACATGTGCATAGAAACTAGAAGTAACAGTGAAAGAAACAAACACAAAAGAAGCATTTATATGTGTGCGTGCGAGTAG-TGACTTCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-ACAG
gi|10                         :                                                          aCTCGCATCT-TGTAGCCTAATCCAAACA--TCCCCCGGCCTCACAAATCC---AAC---TCTCA--ACCTCCACATCCAAGACCTAACTGTC-----CTC----C-AATCC--AAACTTTAAC-TAAGCC-CTAATTGAACCTAAT-ATCTCA-CTGT-CCTTAAG------C-CCCCT----CATCCAAA----CTATCCGTGTCTATTATAACCA-------TGT-CTACTGAACTCTAATTATCATAAAAGTGACAGCAAATTAATAT---ACAAGTCACGTTTTT-------------CATGGA-CA---TTGACTGATATTCGGTTTCTAAAATTGGTTA--CATGTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCGCTTGTATGTGAATGCAGCATTGGTGCTTGTGTAAGTGTGTTTGTGTGTCCGTCATTGT-TA-GTGAAGCGTATGTGCATTTGAATGATTCTATATGCAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTACATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACGGTAACAAGCACAAAAGAAGCATTTATTTTTGTGCGTGCGTGTAGTGTAC-ACAGTTGCAGAAATAACAATAGCAGC-
gi|12                         :  ACTGTTATGATCATTATTTAAACACGATATACTCTTCAAAACATTGTTCAGACAAAGCTCCCATCT-AGTCTCCTAATACACACA---TCCCCAGTCCT-CAA---A---AAG---TCCCTAAACTTAAAAC-CCCAGTCTTAA---TTTA-CT----------------GG--CTTTAA-AA---C-ACAACT----CT-----TCTTAGTTTT-T-----A------------C----AATACAAAA--ACTAT-----TCACAGAAAATT--------TGCACCA-TTAA-----ATGA-TATAAAAGTAACAGTTCATTCATAT---ACAAGTCACATTTCT-------------CATGgtaacatcagaagcagcag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAACACAACACGGTGAATTTCTGGAGAAAAAAAATCCTAA-------A-ACTTTT-TTTTCATTATGAATTTTAATGTTATAAACTGAATACTTTTGGATAATTATAACAATTATTAAATTAAG-TTCAAAATTAAAGCTC--AAAAACTTCGTAAAATACTGA--------GATAAATGGAAATAAAGTAGTAAA----AA----A-----AC--A--C--------AGT-TTTGCA----------------GAGAT-C
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgATTAT-AAATTAAAATTCAAAATTTCAGCTCCCAAAGT--TCATAAAATACTGA--------GATAAATGTAATTAAAGTAATATA----TATATCA-----CCCTG--CTCAATTGGAAT-TTTGGA----------------ATTCT-TA--A-A--T-T--CCAATTTGCAA---T--------------AGT------GTCCAATTGG-AAA-TTAC-AATTTCCAAT------GAT--T-AATTTTCGATT----GATTTG-GAAT-CAATTT-
gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CTC--AA-------AACCCATCCAT---CCTAAAAA------A---AACT------------------------GA--CTTAACATA---C-CCG-CA----TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--AC------------TGGTAA-----------G---TA-TTCA-----ATGA-CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGACA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              TAACT--------GGCACTA-TTAC-----CTGA-CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCCCGATGTCCGCTAa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGA----AAAAAT--------------ACTTTGTTTTTCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTacttcccataaaacatgtgaacatgtctgttcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C---------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTAACTCCCTG----------------------------------------GCT----TTCAG-TAATAAACTGC--------------C-CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTA-TTAA-----ATGA-CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -------TTAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG-TCTC---GCCTTAA-CAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTTA----AATATTACATTA--TTAAACTAA-----CAAAAAAC-AATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                     a-CTTAAATCTAATTCTCGA-C-CTCACCGC-A-TCCCTGA--CCTAAC-TAAG-CACTAACTGAA-CCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-A-CTAA-----TTGT-CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGACAGATGTTCGCTATATATAATTGGACA--CACGCTATCCTATTGACAGT-CTC----TCAT---CAG-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATGA---------TTTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGT------CTCAA-CTAGGAAATATCC-AAAAATAGCATTATATATTGGCTT--------TAAAATATTACATTATTCAA----CTCATAAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtctCACAGTGAATTTCTGG--------ACTT---------------TTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTA--AAAAAGTCTGTAAGATACCGATTCAAAGGGATAAATGGAATTTAAGTAGTAAA----AA----ACACC-CT--GTCC--------AA---TTGG------------------AATT-CT--T-A--TAT--CCAATTGGCAT---T--------------AGT------TTCCAATTGG-AAA-TTAC-GATTTCCAAACAGTCAAATCCA-ATT--GGGA-------------ACA--CAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAAAA-A-AT-CCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGA----AAAACTTTTTTTTCCAAAA-GCTTTTTTTTT-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTC--AAAAA--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GACAAGTACGCTGTCCTCTTGAC-GTGCCA----TCACTAACCA-TA-TGTTTAACCTCTAAGCTGCAATAA---------TTAGCCAAGT-ACgttt
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CTC--AA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA------A---AACT------------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--AC------------TGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGACA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCCCGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT----CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA------AT----------------ACTTTGTTTTTCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTAACTC--------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT-A-TTAAACTAA-----CAAAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTAATTCTCGA-C-CTCACCGC-A-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGACAGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGCTATCCTATTGACAGT-CT-----CTCATCAG-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGT-----CTCAACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT-------AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctCACAGTGAATTTCTGGA----------CTTT-----------------TTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAA-AAAA-GTCTGTAAGATACCGATTCAAAGGGATAAATGGAATTTAAGTAGTAAA----AA----A------CACCCT--GTCC--------AAT-T--GGAA--TT-CT--TATAT--CC-----------------AATTGGCAT---T-A-----------GT------TTCCAATTGG-AAA-TTACGATTTCCAAACAG-----TC--------AAATC--CAA-TTGGGAACACAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA------CTTTTTTTTCCAAAA---GCTTTTTTTTT-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCA-AAAA-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GACAAGTACGCTGTCCTCTTGAC-GTGCCA-TCACTAACCAT-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACgttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aAAAAA--------------------A---ACTTTTTTT--CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAA-AAAA-ATT-GTAAAATACTGA--------GATAAATGGAATTAAAGTAGTAAA----AA----AACCACCC----T--GTCC--------AAT-TT-GGAATTCT-TA--TGT-T--CC-----------------AATAGGCAT---T----------C--GT------TTCCAATGGG-GAA-TTACGATTTCCGACCGGAAAACAC-----------------------------AAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gcaaaattgcattaaag--------AAT-TTTGGATAAGTATAACTAT-TATTC-----------------AGTT--AAA---T-T--------TAAAA------TTTCAGCTAA-AAAAGTTAAGGGTCCAATAAGAAGATAA-TATTTATAGATC--ATA-TTTTAGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-gtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-T--CC-----------------AACGGGAAA---T-AAGGATTTCCAAGCGGTCAATTCCAATTGGGAAG-GTAAAGGGTCCAATTGGAAGATTT-TATTTATATATT--CTA-T---AAAA-AAAATCGTCCAATTGGAATGTAAACA-A--TCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCGC-GTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTGGTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGTGTGAGTAAACCGTATGTGCGTTTGAACGTTTCTATATACAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTTAC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-tttatttatatattctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
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Reference ( family-194 )      : NACTGTNATGGTCACTNCTTAAACACGATATACNCTTCAAAACATNNTTCAGACAAAGTTCCCATCT-TGTCTCCTAACACACACA--TTCCCNGGCCTC-CAA----A----AC---TCCCT--GCCTAAAAA-CCNAGACCTA-ACTCTC--T--CTCTCC--A-TCC--GA--CTTNAC-TA--C-CC-----GACT---CTCAG-ATCTAAACTGT-C-----G------C-CTCCC----CATNCAAAA--AC-AT-----TCTCTTGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATAAAAGTGACGGCTAATTCATAT---ACAAGTCACGTTTTT-------------CATGTA-CATGCTGGAC----AGATGTTCGCTA------TATAAAAT-TG-GACA--CACGT-TAT------CCTGTTGACAGT-CCGTCACTCA--TCA---G-AA-TGT--GACCTCTAAACTCCNATGAAT--------TTGCCAAGT-ACAGACCTACCGTATACTATAAGACTATCTGTTGCTGTCNCGCCTTAACTAGGACATATCCCACAAATAGCATTATATCTTGGCTTTGA---AATATTACATT--ATTAAACTAATAGTAAAAATNAATCAATTATTGAGTGACTATAAAACGCTATATAAATGGAAAGTAATACATGTTTTGTTTTTACATATTGAGATCGGGTAAACTGCAAANTNTATNTTATGTTTTAACACAACACAGTGAATTTCTGGAAAAA-------CTT-----------A---ACTTTTTTTTTCATTATGAACTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTCAAAATTTCAGCTCA-AAAA-TTC-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAA------C----CGTCC-----------AATTTTGGANNNNT-CA--TAT--TCC-----------------AATTGG-----------------------AAAT-A--------CAAGT------TTCCAATT-GGAAAG-TANAANNT-CCAATCGGAA--GATTCTATTTATAGATCC-TA-TTT-------NAAAT-CAAGTT-TCCAATTGGAANGT-AAA-AA--TCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTACGTGTAGAGTAGGAGCGT-GTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTTGTGTGTCCGTCTGTGTGTG-GTGAAGCGTACGTGCGTTTGAANGTTTGTATATGCAGCATGCGCGTGAATGCATGTGCGTGCATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAGCATTTATATNTGTGCGTGCGTGTAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-ACAG
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT----------------ACTTTGTTTTTCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA-----------CTT-----------------TTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAA-AAAA-GTCTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGAATTCT-TA--TAT---CC-----------------AATTGG-----------------------CATT-A-----------GT------TTCCAATT-GGAAAT-TACGATTT-CCAAACAG-------TC-------AAATCC-AA-TTG-------GGAACACAAATT-TCTAATTTGAAGGT-AAA-AAAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---GCTTTTTTTTT-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCA-AAAA-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACgttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---ACTTTTTTT--CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAA-AAAA-ATT-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGAATTCT-TA--TGT--TCC-----------------AATAGG-----------------------CATT----------C--GT------TTCCAATG-GGGAAT-TACGATTT-CCGACCGGA------------------------------------AAACACAAGTT-TCCAATTGGAAGGT-AAA-AA--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacacaaaaaaacccaAACTGCAAAATGTATTTT---TTTT--TATAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-----------------------------TTTTTTTCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAA-TTTAAAATTTCAGCTAA-AAAA-GT---TAAGGGTCCAATAAGAA--------GATAATAT----TTA---TAG-----------A------T----CAT--------------ATTTTAGATCAA---G--T-T--TCC-----------------AATTGG------------------------AAT-----------------------------------G-TAAAAAAT-CCAATTGGAA--GATTCTATTTATAGATCca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcaaaattgcattaaag-----------AATTTTGGATAAGTATAACTATTATTC-----------------AGTT-------------------------AAAT-T--------TAAAA------TTTCAGCTAAAAAAG-TTAAGGGT-CCAATAAGAA--GATAATATTTATAGATCA-TA-TTT-------TAGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAAA-AA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-aaatattttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttataacacagtaaatttctggaaaaatttttttcattatgaacttaaatgctataaacttaatA----GAA------T----CGTCC-----------AATT--GGATTGTT-TA--CAT--TCC-----------------AATTGGACGATTTTTTTTATAGAATATATAAAT-A--------AAATC------TTCCAATT-GGACCC-TTTACCTTCCCAATTGGAATTGA--CCGCTTGGAAATCCTTA-TTTCCCGTTGGAAAC-TAA--T-GCCAATTTGAATAT-AAG-AAT-TCCAATTGGGCgtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--TCC-----------------AACGGG-----------------------AAAT-AAGGATTTCCAAGCGGTCAATTCCAATT-GGGAAGGTAAAGGGT-CCAATTGGAA--GATTTTATTTATATATTC-TA-T----------AAAA-AAAATCGTCCAATTGGAATGT-AAACAA--TCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCGC-GTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTGGTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGTGTGAGTAAACCGTATGTGCGTTTGAACGTTTCTATATACAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTTAC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-atttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                  gcccaattggaattcttatattcaaattggcattagtCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-T---A----CATTTATAA--CC-AT------CTCT----ACT---------GCAC-ACTAAT---TCT----CATAAAAGTGACAGTTAATTCATAT---ACAAGTCACGTTTTT--------------ATGTA-CATGCTGGAC----AGCTGTTTGCTA------TATAAAAT-TG-GACA--CACGT-TAT------TCTGTTGACAGT-CCATCACTCA--TCA---GAAA-TGT--GACCTCTAAACACCGATGAA---------TTGCCAAGT-ACAGAACTACTGTACACTAT-AGACTATCTGTTGCCGTCACACCTTAACT----TATATCACACAAA-AGCATTATAATTTGGCTTTGA---AATGTTACATT--ATTAAACTAATAGT----ATCAATCAATTTATGTGTGCCTATAAgtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                   cctcCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-TACC-------TTTATAA--CC-AT------CTCTT-----C--------TGCAC-ACTAAT---TGT----CATAAAAGT--CAGCTAATTCATAT---AAAAGTCACGTTTT--------------CATGTA-CATGCTGGAC----AGATGTTCGCTA------TATAAAAC-TG-GACA--CACGT-TAT------CCTGTTGACAGC-CCGTTACTCA--TCA---G-AAGTGT--GACCTCTAAACTCCCATGAA---------TTGCCAAGT-ACAGACCTACCGTATACTAT-AGACTATCTGTTACTGTCACGCCTTAGCT----TATATCCCTCAAA-AGCATTATATCTTGGCTTTGA---AATATTACATT--ATTAAACTAATAGT----ATTAATCAATTTCTGAGTGACTATAAAAC
gi|8                          :                                                    ccCGAAGTTCTCATCT-TGCCTCCAAACACACACA--TTCCC-GGCCTT-------------AT---T------GCCTAAAAA------ACCCACACT-----T--CTCTC-----------A--CTTG------------------CT---TTCAG-AAGTAGACTGT-C-----C------C-CTCCA----AATCTTAAA--------------TTTT-TAACT--------TGCACTATAAAA---TCA----CATAAAAATGATGGCTAGTTTATAT---AC-CGTCACATTGTT-------------CATGCA-C---CTGGACAATTAAATATACATTA-------ACCAAGT-T----CA--CATATCTATCTTAGACCTGTTTATACTACTGTTGCTCATTTTATGTG-AA-TGC--GGCTCTTAAGC
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATCCAAAACTGTTCCTACTCAATCTCTCAATTTCATTGCATCCCTAATTGAACCTAAGATCTCACTGTTCTAAAGCCCC






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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAA-AAAA-GT-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGAA-----TTCTTAT-AT-CC-----------------AATTG-----------------GCATT-A-----------GT------TTCCAATTGGAAAT-TACGATTTCCAAACAG-----TC-------AAATCCAA-TTGGGAACACAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCA-AAAA-GT-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---A--CTTTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAA-AAAA-AT-T-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGAA-----TTCTTAT-GTTCC-----------------AATAG-----------------GCATT----------C--GT------TTCCAATGGGGAAT-TACGATTTCCGACCGGAA--------------------------AACACAAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaaaattgcattaaag-----------AATTTTGGATAAGTATAACTATTATTC------------------AGTT-------------------AAAT-T--------TAAAA------TTTCAGCTAAAAAAGTTAAGGGTCCAATAAGAAGATAATATTTATAGATCATA-TTTTAGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-aaatattttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGA-----ATTC---TTAT-AT-CCAATTG-----------------GCATTA-----------GT------TTCCAATTGGAAAT-TACGATTTCCAAACAG-----TC-------AAATCCAA--TTG-GGAACACAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAA-G-T-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---A--CTTTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAAAAAA-A-T-T-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGA-----ATTC---TTAT-GTTCCAATAG-----------------GCATT---------C--GT------TTCCAATGGGGAAT-TACGATTTCCGACCGGAAA---------ACA-------------------CAAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaaaattgcattaaag-----------AATTTTGGATAAGTATAA---CTATTATTC-AGTT-------------------AAATT--------TAAAA------TTTCAGCTAAAAAAGTTAAGGGTCCAATAAGAAGATAATATTTATAGATCATA--TTTTA-GAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-aaatattttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGA-----ATTC---TTAT-AT-CCAATTGG-----------------------CATT---AGT-TTCCAATTGGAAA--T-TACGATTTCCAAACAG-------TC-------AAATCC-AA--TTG--------GGAA----CACAAATT-TCTAATTTG-AAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAA-G-T-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---A--CTTTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAAAAAA-A-T-T-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGA-----ATTC---TTAT-GTTCCAATAGG-----------------------CATT-C--GT-TTCCAATGGGGAA--T-TACGATTTCCGACCGGAA--A---------ACA-------------------------------CAAGTT-TCCAATTGG-AAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacacaaaaaaacccaAACTGCAAAATGTATTTT---TTTT--TATAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------------------------------TTTTTT--TCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAA-TTTAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T----TAAGGGTCCAATAAGAA--------GATAATAT----TTA---TAG-----------A------T----CAT--------------ATTTTAGA-------TC---AAGT--TTCCAATTGG-----------------------AA----------------TGTAAA--------AAATCCAATTGGAA--GATTCTATTTATAGATCca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaaaattgcattaaag-----------AATTTTGGATAAGTATAA---CTATTATTC-AGTTA------------------------AATT-TAAAA-TTTCAGCTAAAAAAGT-TAAG-GGTCCAATAAGAA--GATAATATTTATAGATCA-TA--TTTT-------A-GA----T-CAAGTT-TCCAATTGG-AATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-aaatattttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttataacacagtaaatttctggaaaaatttttttcattatgaacttaaatgctataaacttaatGCCC-----------AATT--GGA-----ATTC---TTAT-ATTCAAATTGG-----------------------CATT---AGT-TTCCAACGGGAAA--T-gtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A----GAA------T----CGTCC-----------AATT--GGA-----TTGT---TTAC-ATTCCAATTGGACGATTTTTTTTATAGAATATATAAAT-AAAATCTTCCAATTGGACCCTT-TAC-CTTCCCAATTGGAATTGA--CCGCTTGGAAATCCTTA--TTTCCCGTTGGA-AA----C-TAA--T-GCCAATTTG-AATATAAG-A-AT-TCCAATTGGGCaaggatttccaagcggtcaattccaattgggaaggtaaagggtccaattggaagattttatttatatattctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
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gi|12                         :  ACTGTTATGATCATTATTTAAACACGATATACTCTTCAAAACATTGTTCAGACAAAGCTCCCATCT-AGTCTCCTAATACACACA--TCCCCAGTCCTC-AAA----A----AG---TCCCTAAACTTAAAAC-CCCAGTCTTA-ATTTAC--T-----------------GG--CTTTAA-AA--C-AC-----AACT---CT-----TCTTAGTT------------------TTTAC----AATACAAAA--ACTAT-----TCACAGAAAATT--------TGCACCATTAAA---TGA----TATAAAAGTAACAGTTCATTCATAT---ACAAGTCACATTTCT-------------CATGgtaacatcagaagcagcag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAACACAACACGGTGAATTTCTGGAGAAAAAAAATCCT------------A---AAACTTTT-TTT--TCATTATGAATTTTAATGTTATAAACTGAATACTTTTGGATAATTATAACAATTATTAAATTAAG-TTCAAAATTAAAGCTCAAAAACT-T-C-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAAATAAAGTAGTA-AA----AAA------A----CA--C-----------AGTTTTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgATTAT-AAATTAAAATTCAAAATTTCAGCTCCCAAA-G-TTC-ATAA------AATACTGA--------GATAA-ATGTAATTAAAGTAATATAT----ATA------T----CACCCTGCTCAATTGGAATTTTGGAATTC---TTAAATTCC-AATTTG---CAAT--AGTGTCCAATTGGAA-AT-TACAATTTCCAAT-----GATTA-ATTT-TCGAT-TGA--TTTGG-AAT-CAAT-TT-cagagatc
gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGAATTC---TTATAT-CC-AATTGG---CATT--AGTTTCCAATTGGAA-AT-TACGATTTCCAAACAG-----TC-------AAATCCAA--TTG-GGAACACAAA-TT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAA-G-T-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacacaaaaaaacccaAACTGCAAAATGTATTTT---TTTT--TATAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------------------------------TTTTTT--TCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAA-TTTAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T----TAAGGGTCCAATAAGAA--------GATAATAT----TTA---TAG-----------A------T----CAT--------------ATTTTAGA--TC---AAGT-TTCC-AATTGG---AAT----GT----AA---AAA-A---------TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCca
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A----AAA------T----CTTCC-----------AATT--GGACCCT---TTACCTTCCCAATTGG---AATTG-A----CCGCTTGGAA-AT-CCTTATTTCCCGTTGGAAA---CTA---ATG---CCAA--TTT-G-AATATAAGAAT-TCCAATTGGgcggtcaattccaattgggaaggtaaagggtccaattggaagattttatttatatattctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gcTTCC-AAGCGG------TC-AATT-CCAATTGGGA-AGGTAAAGGGTCCAATTGGAAGATTTTATTTATATATTCTA--T---A-AAA-AAAA-TCGTCCAATTGGAATGTAAACA-A--TCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCGC-GTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTGGTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGTGTGAGTAAACCGTATGTGCGTTTGAACGTTTCTATATACAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTTAC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-atttatatattctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGAATTC---TTATAT-CCAATTGG---CATTAGTTTCCAATTGGAA-AT-TACGATTTCCAAACAG-----TC-------AAATCCAA--TTG-GGA-ACACAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAA-G-T-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---A--CTTTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAAAAAA-A-T-T-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGAATTC---TTATGTTCCAATAGG---CATTCGTTTCCAATGGGGA-AT-TACGATTTCCGACCGGAAAA---------------CA--------------CAAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcaaaattgcattaaagTCCAATAAGAAGATAATATTTATAGATCATA--TTT-T-AGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-attttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCCTA---CT--CAA----A----ACCCATCCAT---CCTAAAAA----A-----A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--A------------CTGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGTATCA----GGAC----A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTA-CA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA-------AT------------A------CTTTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCCCT----TC-C----------------TTCCT--GCCGAAAAA-CCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT--------TAGCCAAGT-AACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCTTAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATTTTGAGTTT-A---AATATTACATT--ATTAAACTAACA--AAAAA-CAATCAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                       -CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATA-TACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATG-AT--------TTGCCAAGT-ACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTC-----AACTAGGAAATAT-CCAAAAATAGCATTATATATTGGCTTTAA---AATATTACATT--ATTCAACTCAT----AAAATGAATAAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtctCACAGTGAATTTCTGGA--------------------------------CTTTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T-CTGTAA------GATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTA-AA----AAA------CACCCTGTCC-----------AATT--GGAATTC---TTATAT-CCAATTGG---CATTAGTTTCCAATTGGAA-AT-TACGATTTCCAAACAG-----TC-------AAATCCAA--TTG-GGA-ACACAAATT-TCTAATTTGAAGGTAAA-A-AAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------CTTTTTTTTCCAAAA---G--CTTTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAA-G-T-t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AAT--------TAGCCAAGT-ACtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAAAAA---------------------A---A--CTTTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAAAAAA-A-T-T-GTAA------AATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTA-AA----AAAACCACCC----TGTCC-----------AATTT-GGAATTC---TTATGTTCCAATAGG---CATTCGTTTCCAATGGGGA-AT-TACGATTTCCGACCGGAAAA---------------CA--------------CAAGTT-TCCAATTGGAAGGTAAA-A-A--TCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCGT-GTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacacaaaaaaacccaAACTGCAAAATGTATTTT---TTTT--TATAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA-------------------------------TTTTTT--TCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAA-TTTAAAATTTCAGCTAAAAAA-G-T----TAAGGGTCCAATAAGAA--------GATAATAT----TTA---TAG-----------A------T----CAT--------------ATTTTAGA--TC---AAGT-TTCCAATTGG---AAT--GT----AA---AAA-A---------TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAA--Tca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcaaaattgcattaaagTCCAATAAGAAGATAATATTTATAGATCATA--TTT-T-AGAT-CAAGTT-TCCAATTGGAATGTAAA-AAA--TCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCGT-ATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-attttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttataacacagtaaatttctggaaaaatttttttcattatgaacttaaatgctataaacttaataattttggataagtataactattattcagttaaatttaaaatttcagctaaaaaagttaagggGCCC-----------AATT--GGAATTC---TTATATTCAAATTGG---CATTAGTTTCCAACGGGAA-AT-AAGGATTTCCAAGCGG-----TCAAT-------TCCAA---TT-G--------------------GGAAGGTAAAGG-G--TCCAATTGGAAGATTTTATTTATATATgtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCCAAGCGG-----TCAATT-CCAATTGGGA-AGGTAAAGGGTCCAATTGGAAGATTTTATTTATATATTCTA--T---A-A-AA-AAAATCGTCCAATTGGAATGTAAACA-A--TCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCGC-GTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTGGTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGTGTGAGTAAACCGTATGTGCGTTTGAACGTTTCTATATACAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTTAC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-tctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|6                          :                                                                                                                                              gcccaattggaattcttatattcaaattggcattagtttccaacgggaaataaggatCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-T---A----CATTTATAA--CC-AT------CTCT----ACT---------GCAC-ACTAAT---TCT----CATAAAAGTGACAGTTAATTCATAT---ACAAGTCACGTTTTT--------------ATGTA-CATGCTGGAC----AGCTGTTTGCTA------TATAAAAT-TG-GACA--CACGT-TAT------TCTGTTGACAGT-CCATCACTCA--TCA---GAAA-TGT--GACCTCTAAACACCGATGAA---------TTGCCAAGT-ACAGAACTACTGTACACTAT-AGACTATCTGTTGCCGTCACACCTTAACT----TATATCACACAAA-AGCATTATAATTTGGCTTTGA---AATGTTACATT--ATTAAACTAATAGT----ATCAATCAATTTATGTGTGCCTATAAgtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                   cctcCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-TACC-------TTTATAA--CC-AT------CTCTT-----C--------TGCAC-ACTAAT---TGT----CATAAAAGT--CAGCTAATTCATAT---AAAAGTCACGTTTT--------------CATGTA-CATGCTGGAC----AGATGTTCGCTA------TATAAAAC-TG-GACA--CACGT-TAT------CCTGTTGACAGC-CCGTTACTCA--TCA---G-AAGTGT--GACCTCTAAACTCCCATGAA---------TTGCCAAGT-ACAGACCTACCGTATACTAT-AGACTATCTGTTACTGTCACGCCTTAGCT----TATATCCCTCAAA-AGCATTATATCTTGGCTTTGA---AATATTACATT--ATTAAACTAATAGT----ATTAATCAATTTCTGAGTGACTATAAAAC
gi|8                          :                                                    ccCGAAGTTCTCATCT-TGCCTCCAAACACACACA--TTCCC-GGCCTT-------------AT---T------GCCTAAAAA------ACCCACACT-----T--CTCTC-----------A--CTTG------------------CT---TTCAG-AAGTAGACTGT-C-----C------C-CTCCA----AATCTTAAA--------------TTTT-TAACT--------TGCACTATAAAA---TCA----CATAAAAATGATGGCTAGTTTATAT---AC-CGTCACATTGTT-------------CATGCA-C---CTGGACAATTAAATATACATTA-------ACCAAGT-T----CA--CATATCTATCTTAGACCTGTTTATACTACTGTTGCTCATTTTATGTG-AA-TGC--GGCTCTTAAGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACACAGTGAATT-CTGGAAAAA-------------------------A--CTTTT-TTT--TCATTATGAACTTTAATGTTATAAATTTTATAATTTTATATAATTATAACTATTATTAAGTTACA-TTCAAAATTACAGCTCGGAAA-GTT-C-GTAA------AATGCTAA--------GATAA-ATTGAATAAAAGTAGTA-AA----AAAACACT-C----TGTCC-----------AA--TTGGAATTC---TTATATTCCAATTAG---CATTAGTTTCCAATGGGAA-AT-AACGATTTCCAAcaaattaaaaacatgtaa


blockSeqs                     :       T         A                T           TG                    C   A              CA     CGGCCTCACAAATCCAACTCTCAA                 TCCA G     C   CTCGACCTCACCGCATCCCTGACCTAACTAAGCACTAACTGAACCCAACATCTCAATGTCGTAAAGCCCTCCCTGCTCATCAGAACTATATGCTTCCTTTGTAACCATCTCTACT                           T     ACTC  ATTAT         G  A       A    CTC  A            GTGAACCTTGGCG      T  CG      AATT            ACTTCCC       A  T    AG     C   CTTAGA           TG  A       TT   TGTG  AG   TT              T     T                 .          T  A      TA      T     T    T GC       AGGAC   TCCAA  T TA       ATT        A .     A       .            AAAAA   TGA       A                     T                                                          A G   T  ATG    A                           CTTTTTTTTCCAAAAG                 T   AT                                C                       T        A                     CTTC       GGGTCC        TTCAAAGG     T                 T  .      TCACCCTGCTCAATTGG              TT   A   .     AA          .     T          T    . GGT C          C  AAGATAATATTTATAGATCATATTTTAGAT        T  G                 AAAA                                                       T T    T      G  TGTGA                                                           G               G  C                    A T A        G                                 A                                A                      T T               TG   A                          A
blockSeqs                     :                                                                    .   C              .      AGTCCTCAAAAAGTCCCTAAA                    CCC  G     .   GTCCTCCAATCCAAACTTTAACTAAGCCCTAATTGAACCTAATATCTCACTGTCCTTAAGCCCCCTCATCCAAACTATCCGTGTCTATTATAACCAT                                             C     A     A             A  A       C    .    A            .                  .  TG      .               T             .  .    .      .   .                TA  A       .    GA    A    .               A     T                 .          C  A      AA      C     C    T AC       AGGAA   TCACA  A A        ATA        G .     A       .            AAA     TCA       A                                                                                         .      A                           AAAAATCCTAAAA                    T   .                                 C                       T        .                     GTTC       .             .            .                 .  .      ACCACCCTGTCC                   TT   A   .     TA          .     T          T    . TT  C          C  AAGATTTTATTTATATATTCTATAAAA           A  .                 AAA                                                        G T    .      A  TGTGA                                                           G               G  A                    C G T        G                                 T                                G                      A G               TG   A                          .
blockSeqs                     :                                                                    .   T              .      ACTCAAAACCCATCCAT                        CCA  G     .   TACTGGCTTTAAAACACAACTCTTCTTAGTTTTTACAATACAAAAACTATTCACAGAAAATTT                                                                               T     A     A             G  G       A    .    A            .                  .  TG      .               T             .  .    .      .   .                T   G       .    G     A    .               G     T                 .          T  A      AG      C     C    A GC       T       TCCCT  A A        AAT        G .     G       .            AGT     TTA       T                                                                                                .                           ATA                              T   .                                 T                       A        .                     GTCT       .             .            .                 .  .      ACACTCTGTCC                    TT   A   .     TG          .     T          G    . TT  C          T  GATTAATTTTCGATTGATTTGGAAT             G  .                 GGG                                                        G A    .      G  TGTGA                                                           G               G  C                    A G A        G                                 T                                T                      A T               TT   T                          .
blockSeqs                     :                                                                    .   C              .      TTCCTTCCTG                               CTT  A     .   TCTCTCACTTGCTTTCAGAAGTAGACTGTCCCCTCCAAATCTTAAATTTTTAACTT                                                                                      T     C     A             G  G       T    .    A            .                  .  T       .               T             .  .    .      .   .                T   G       .    T     A    .               C     .                 .          C  .      AG      C     .    A .        T       TCCA   A A        ATC        . .     A       .            AGT     CA        T                                                                                                                            AA                               T   .                                 C                       T        .                     GTTC       .             .            .                 .  .      CACCCTGTCC                     TT   A   .     TA          .     T          G    . TT  G          A  TCAAATCCAATTGGGAACA                   G  .                 CAA                                                        A A    .      G  .                                                               .               G  A                    A C T        A                                 A                                G                      . .               TT   T                          .
blockSeqs                     :                                                                    .   C              .      GGCCTTATTG                               .    .     .   CCCTGGCTTTCAGTAATAAACTGCCCTCCCTAAACAAAAACTGGTAACTT                                                                                            T     A     A             G  A       C    .    .            .                  .  .       .               T             .  .    .      .   .                C   .       .    G     .    .                     .                 .                                                                                                                                                                                                                                                                   A                                T   .                                 A                       G        .                     ATT        .             .            .                 .  .      ACAC                           T    A   .     TA          .     C          T    . TA  A          C  TCAATTCCAATTG                         A  .                 AA                                                                                                                                          .               .  .                                                                                                                                                                              
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATCCAAAACTGTTCCTACTCAATCTCTCAATTTCATTGCATCCCTAATTGAACCTAAGATCTCACTGTTCTAAAGCCCC






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gi|15                         :                                                    GACAAAGTCCCCATCTCTGTTATGTAACACACACA--TTCC-TA---CTC--A--AAACCCATCC-A-------TC-CTAAA-------AA-----A---A-ACT-----------------------GA--CTTAACATA--C-CC-----G-CA---TTCAG-AAGTAGACTG---------------------------AAACAAAA--AC------------TGGTAA-----------G---TATTCAA---TGA----CATAAACATGACGGCTAATAAATAT---AC-AGTCATATTATT-------------TATGT--AT-CAGGAC----Agattaattttcgattgatttggaatcaattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAACT--------GGCACTATTACC---TGA----CATAAAAATGATGGCTAATTTATCTCTCAC----CACATTGTTGTGAACCTTGGCGTATGTACA--CTGGCC----CGATGTCCGCTAACTTCCCATAAAACATGTGA-A--CATGT-----------CTGTTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttaaactccTATGTTTTAACACAACAAAGTGAATTTCTGGAAAAA--------------AT--A-----CT-----TTGTTTT--TCATATTGAAGTTTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGATAATTATAACTATTATTAAGTTAAA-TTTAAAATTcttagccctatgtacgctgttgttgattat
gi|18                         :                   aaatacaaaataaaaataaaaaatatttaaagaaACAAAGTTACCATCT-CGCCTCCTAACACACACACATTCC-CTT-CCTT------------CCT---------GC-CGAAA-------AACCAAGACTTA-ACTC-------------------------------------C-CT-----GGCT---TTCAG-TAATAAACTGC-C--------------CTCCC----TAAACAAAA--AC------------TGGTAACT--------TGCACTATTAAA---TGA----CATTAAAGTGACAGCTAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A--------TTAGCCAAG-TAACGTCCTACTATATACAATTA-ACTACTTGTTG---TCTCGCCT--TAACAAGGACATCTCCAACATA-AGTTTAATATT--TTGAGTTT-AAATATTACATT--ATTAAACTAACAAAAAACAAT--CAATTATTGAGTGACTTTAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                               CTTAAATCTA-ATTCTCGAC--CTCACCGCA-TCCCTGA--CCTAAC-TAAGCACT-----AACTGAACCCAACATCTCAA-TGT-C-----GTAAAGCC-CTCCCTGCTCAT-CAGAACTAT-ATGCT--TCCTTTGTAACCATCTCTACTGCAC-ACTAAT---TGT----CATCAAAAT--CAGCTAAT---------------CACGATTTT-------------CATATATACGCTAGAC----AGATGTTCGCTA------TATATAAT-TG-GACA--CACGC-TAT------CCTATTGACAGT-CT----CTCA--TCA---G-AA--GT--GACCTCAAAGCTCCTATGA---------TTTGCCAAG-TACAAACCTACCGC-TGCTATAA-ACTATCTGTTGTTGTCTCAACTAGGAA-------ATATCCAA-AAATAGCATTATATA--TTGGCTTTAAAATATTACATT--ATTCAACTCAT-AAAATGAAT--AAATTATTAAATGACTATAAAACACTATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtctCACAGTGAATTTCTGGA----------------------------CT-----TTTTTTTATTCATTATGAACTTCATTGTTATAAACTTATTATTTTTTGATAATTATAGCTATTATAGAGTTCAA-TTCAAAATTTCAGCTAAAAAAGTC---TGTAAGATACCGATTCAAAGGGATAA-ATGGAATTTAAGTAGTAAA----AA-ACACC--CTGTCC-----------AA--TTGGAATTC---TTATA-TCCAATTGG---CATTAGT-----TTCCAATTGGAA-AT-TACGATTTCCAAACAG--TCAAATC-----CAATTGG-------------GAACACAAATTTCTAATT-TGAAGGTAAAAAAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAAATAGTTTGTGTATGTGTAGAGTATGTGTGTTGTATGTGTGTGTGAGTGAATGCGGCCATATGTTTGTATGTGGGTGCAACGTATGTTCTTATCCAAGTGCGTTAGTGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGCGCACGTGCGTTTGttccattaaaaatatcaaaagaaatcacagtgaatttctggacttttttttattcattatgaacttcattgttataaacttattattttttgataattatagctattatagagttcaattcaaaatttcagctaaaaaagtctgtaagataccgattcaaagggataaatggaatttaagtagtaaaaaacaccctgtccaattggaattcttatatccaattggcattagtttccaattggaaattacgatttccaaacagtcaaatccaattgggaacacaaatttctaatttgaaggtaaaaaaatccaattggacgattctatttatagatcaaatagtttgtgtatgtgtagagtatgtgtgttgtatgtgtgtgtgagtgaatgcggccatatgtttgtatgtgggtgcaacgtatgttcttatccaagtgcgttagtgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagcgcacgtgcgtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtctcttaaatctaattctcgacctcaccgcatccctgacctaactaagcactaactgaacccaacatctcaatgtcgtaaagccctccctgctcatcagaactatatgcttcctttgtaaccatctctactgcacactaattgtcatcaaaatcagctaatcacgattttcatatatacgctagacagatgttcgctatatataattggacacacgctatcctattgacagtctctcatcagaagtgacctcaaagctcctatgatttgccaagtacaaacctaccgctgctataaactatctgttgttgtctcaactaggaaatatccaaaaatagcattatatattggctttaaaatattacattattcaactcataaaatgaataaattattaaatgactataaaacactatatattccattaaaaatatcaaaagaaatACAACACAGTAAATTTCTGGAAAAACTTTTTTTTCCAAAA---G-----CT-----TTTTTTT--T-ATTATGAACACTAATGTTATAAACTTAATACTTTTGGACAATTATAACTATTATTAAG-TAAA-TTCAAAATTACAGCTCAAAAAGTT---t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GACAAGTACGC-TGT------CCTCTTGAC-GTGCCATCACTAA--CCA---T-A--TGTTTAACCTCTAAGCTGCAAT-AA--------TTAGCCAAG-TACt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aAAAAA--------------A---A-----CT-----TTTTTT----CATTATGAACTTTAATGTTATAATCTT-----TTTTTGATAATTATAACTATTATGAAGTTAAA-TTAAAAATTTCAGCTAAAAAAATT----GTAAAATACTGA--------GATAA-ATGGAATTAAAGTAGTAAA----AA-AACCACCCTGTCC-----------AATTT-GGAATTC---TTATGTTCCAATAGG---CATTCGT-----TTCCAATGGGGA-AT-TACGATTTCCGACCGGAA---------------------------------AACACAAGTTTCCAATT-GGAAGGT-AAA-AATCCGATTGGACGATTCTATTTATAGATAAAATATTTTGTGTACGTGTAAAGTAGTTGCG-TGTGTATATG--------AATTTGGGCATGCGTTTGTATGTGAGTGCAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGAGTGAAGCGTACGTCCGTTTGCAGGTATGTTTATGCACCAAGCGCGTGGATACATATGCATGTATACATGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACA-----------------TGTGCGTGCGTGTAGTGTGC-ACAGTGACAGAAATAACAACAGCAGCAACAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aacacaaaaaaacccaAACTGCAAAATGTATTTT---TTTT--TATAACACAGTAAATTTCTGGAAAAA--------------------------------TTTTTT--TCATTATGAACTTAAATGCTATAAACTTAATAATTTTGGATAAGTATAACTATTATTCAGTTAAA-TTTAAAATTTCAGCTAAAAAAGTTAAGGGTCCAATAAGAA--------GATAATAT----TTA---TAG-----------A------TCAT--------------ATTTTAGA--TC---AAGT-TTCCAATTGG---AAT--GTAAAAAATCCAATTGGAAGAT-T-CTATTTca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcaaaattgcattaaag-------TT---TAGAT-CAAGTTTCCAATT-GGAATGT-AAAAAATCCAATTGGAAGATTCTATTTATAGATCAAATATTTTGTGTATATGTAGAGTAGGAGCG-TATGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTAAATGTAGCGTAGGTGCTTGTGTAAGTGCGTTT-TGTGTCCGTCTGTGTGTGCGTGAAGTGTTCGTGCGTTTGAAGGATTGTATATGCAGCACGCGCGTGAATGCATGTGTATGCATACATGTGCTCTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTATCAAACACAAAAGAAGCATGTATATGTGTGCACGCGTGAAGTTTAC-TCAGTGGCAGAAATAACAACAGCAGC-atagatcaaatattttgtgtatatgtagagtaggagcgtatgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtaaatgtagcgtaggtgcttgtgtaagtgcgttttgtgtccgtctgtgtgtgcgtgaagtgttcgtgcgtttgaaggattgtatatgcagcacgcgcgtgaatgcatgtgtatgcatacatgtgctctaaaactagaagtagtagtgacagtatcaaacacaaaagaagcatgtatatgtgtgcacgcgtgaagtttactcagtggcagaaataacaacagcagcagtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcaaaattgcattaaagaactgcaaaatgtatttttttttataacacagtaaatttctggaaaaatttttttcattatgaacttaaatgctataaacttaataattttggataagtataactattattcagttaaatttaaaatttcagctaaaaaagttaagggtccaataagaagataatatttatagatcatatGCCC-----------AATT--GGAATTC---TTATATTCAAATTGG---CATTAGT-----TTCCAACGGGAA-AT-AAGGATTTCCAAGCGG--TCAA--------------------------------------TTCCAATTGGGAAGGT-AAAGGGTCCAATTGGAAGATTTTATTTATATATgtaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCCAAGCGG-----TCAAT-----T-CCAATTGGGA-AGGTAAAGGGTCCAATTGGAA--GATTT--TATTTATATA-------TTCTATAAAAAAAATCGTCCAATT-GGAATGT-AAACAATCCAATTGGACGATTCTATTTATAGATCAATTAGTTTGTGTACAAGTAGAGTAAGAGCG-CGTGTATGTGTGTGAGTGAATGTGGGCATGCGCTTGTATGTGAGTGCAGCGTTGGTGGTTTTGAAAATGCGTTTGTGTGTCCATCAGTGTGTGAGTAAACCGTATGTGCGTTTGAACGTTTCTATATACAGCATGTGCATGAATGCATGTGCGTGCATACAAGTGCATTAAAACTAGAAGTAGTAGTGACAGTAGCAAACACAAAAGAAACATTTATATTTGTGAGTGCGTGTAGTTTAC-TCACTTGCAGAAATATCAATAGCAAC-tctataaaaaaaatcgtccaattggaatgtaaacaatccaattggacgattctatttatagatcaattagtttgtgtacaagtagagtaagagcgcgtgtatgtgtgtgagtgaatgtgggcatgcgcttgtatgtgagtgcagcgttggtggttttgaaaatgcgtttgtgtgtccatcagtgtgtgagtaaaccgtatgtgcgtttgaacgtttctatatacagcatgtgcatgaatgcatgtgcgtgcatacaagtgcattaaaactagaagtagtagtgacagtagcaaacacaaaagaaacatttatatttgtgagtgcgtgtagtttactcacttgcagaaatatcaatagcaacagtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|6                          :                                                                                                                                                     gcccaattggaattcttatattcaaattggcattagtttccaacgggaaataaggatCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-T---A----CATTTATAA--CC-AT------CTCT----ACT---------GCAC-ACTAAT---TCT----CATAAAAGTGACAGTTAATTCATAT---ACAAGTCACGTTTTT--------------ATGTACATGCTGGAC----AGCTGTTTGCTA------TATAAAAT-TG-GACA--CACGT-TAT------TCTGTTGACAGT-CCATCACTCA--TCA---GAAA-TGT--GACCTCTAAACACCGATGAA---------TTGCCAAG-TACAGAACTACTGTACACTAT-AGACTATCTGTTGCCGTCACACCT--TAACT----TATATCACACAAA-AGCATTATAAT--TTGGCTTTGAAATGTTACATT--ATTAAACTAAT-AGTATCAAT--CAATTTATGTGTGCCTATAAgtaacatcagcaaaagcaacaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          cctcCT---CTCA---TCCAAACTATAT-----G------C-TACC-------TTTATAA--CC-AT------CTCTT-----C--------TGCAC-ACTAAT---TGT----CATAAAAGT--CAGCTAATTCATAT---AAAAGTCACG-TTTT-------------CATGTACATGCTGGAC----AGATGTTCGCTA------TATAAAAC-TG-GACA--CACGT-TAT------CCTGTTGACAGC-CCGTTACTCA--TCA---G-AAGTGT--GACCTCTAAACTCCCATGAA---------TTGCCAAG-TACAGACCTACCGTATACTAT-AGACTATCTGTTACTGTCACGCCT--TAGCT----TATATCCCTCAAA-AGCATTATATC--TTGGCTTTGAAATATTACATT--ATTAAACTAAT-AGTATTAAT--CAATTTCTGAGTGACTATAAAAC
gi|8                          :                                                    ccCGAAGTTCTCATCT-TGCCTCCAAACACACACA--TTCC-CGG-CCTT--A-----------T-T-------GC-CTAAA-------AA-----ACCCACACT-----T--CTCTC-----------A--CTTG------------------CT---TTCAG-AAGTAGACTGT-C-----C------C-CTCCA----AATCTTAAA--------------TTTT-TAACT--------TGCACTATAAAA---TCA----CATAAAAATGATGGCTAGTTTATAT---AC-CGTCACATTGTT-------------CATG--CAC-CTGGACAATTAAATATACATTA-------ACCAAGT-T----CA--CATATCTATCTTAGACCTGTTTATACTACTGTTGCTCATTTTATGTG-AA-TGC--GGCTCTTAAGC
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