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Reference ( gi|2 )            :                                         AGTATAATAAGATTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCA-ACATTTTTGGA--GTAAA-TGC-CACATTTTTTTAGCAAACCGAATAC---GAA-------GAAAATCG---------------------ATA----ATCG---------TCG---GAG----------G-----CGAA---------------------CGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGGCTTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTGCAATATGTATATATAACTTAACATA---AAAAA--CAGTCGTTTT--------TAAAAAT--GTTCTA-ATGC---AAATTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTA--TTCTCATCTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTA---C--------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGT--CTAC--T-CGTTGTA-T-AGCGTATTACG--TTTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTAACAACGACGAAAGGA-------------G---------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATAATTTAA---TACATAAAGT-----TA-CA-------------GTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TATAC---ATATT-TGAGTGTATTGCTAATGATTTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGATGTATGCGATATTGAA-C-TAAACGGTC------TAGACGAACATCTT-CTATTTAACACCGAAGTAAGGCATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|10                         :                                         AGTATAGTATGATTGAAAATAAGT-----GGAAAAT-ATGGACAGATTTTTGCG--GAAAA-TGGACACAATTTTGCGG-AAATCCAATAC---GAA-------GAAAACCG---------------------ATA----AACG---------CCA---AAGGCGAACGAACG-----CGAATTTAGTAGTAGCTATCCCAATCGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGGCTTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAG
gi|3                          :                                           TATGATAAGCT--AAAATAGGA-----CATAAATCATTCC-ACATTTGTGGA--GCAAAATGC-CACATTTTGTGAGCAAACCGAATAC---GAAGAAAATCGATAATCGCCGAAGGCGA-----------ACG----ATCGCGAATTTAGTAG---TAGTTATC-----A-----CAAA---------------------CGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGGCTTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTATATTATGTATATATAACTTAACATA---AAACG--CAGACGTT------------AAAAT--GTTCTT-GTGT---CAATTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAA--TTTTCATCTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTA---C--------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGT--CCACA-T-CGTTGTAGT-AGCGTATTACG--TTTTA-ACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTCACTGTTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAAGTTAATG---------AATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACG--T------ATTTAA---TATATAAAGT-----TT-CA--------------TTA
gi|1                          :                                                      taAAAATAGGA-----GGTAAATCAT------------------------GC-CACATTTTTAGAGCAAACCGAATACGAAGAAAATC---GATAATCGTCGAAGGCGAACAAACGCGATATA----TTAG---------TTG---TAGTTATC-----A-----CAAA---------------------CGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGGCTTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTACATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAAAGGCAAACGT------------AAAACT--GTTTTC-ATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTA--TTCTAATCTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTA---C--------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGT--CTAC--T-CGTTATAGT-GGCGTGTTACG--TTTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTAAACAACGACGAAAGGT-------------G---------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATGATTGAA---TACATAAAGT-----TA-CA-------------GTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TATAC---ATAGT-TGAGTGTATTGCTAATGATCTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATAGGATATTGAG-C-TAAACGGTC------TAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCCAAGTAAGTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTTA-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTCtgtaacatacagttttttat
gi|9                          :                                         agtatatgttgagttAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCC-ACATTTTTGGG--GCAAA-TGC-CACATTTTGTGGGAAAACCGAATAC---GAA-------GAAAATCG---------------------ATA----ATCG---------CCA---AAG----------G-----CGAA---------------------CGAACGCGTACGGAAACGACCGAGTGATTATCGGCTTTTATTT-TACTTC-----ATAGGTT---------AA-----AGAAGGAAAAAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTGCATTATGTATA-ATA---------A---AAAAG--CATACGTTTT--------TAAAAAT--GTTCTT-GCGT---AAATTG
gi|8                          :                                           gtttatatggagctAAATAGGA-----GGGAAATCATGCC-ACATTTTTGGG--GCAAA-TGC-
gi|13                         : gaaattgagagattgagtaggaacagttttggataggaaagacagattagtagtatAAATAGGACTTTAGATAA-CCATGGA-A-ATCTTTTGT--GTAAG--GC-CACATTTTTGT-GCAAACCGAATAC---GCA-------GAAAATCT---------------------ATA----ATCGAGCGTGGTTTTGGTTGAA----------GTTTTTCAAA---------------------CGAGTGTGAACGGAAGCGGATGAGCGAGTATCGGCTTgtacggaaacgaccgagcgagtatcggcttttattttacttcgtaggttaaagaaggaaatagcttgaagttttatgtatataacataaaaaagcatacgtttttaaaaatgttcttgcgtaaattgttttattacattttacaaaatagtattctcattatacgttggttatttaaagattacccgtata
gi|8                          :                                                              tatatggcttctaaaggtatA-ACAGTTTTGGATAGGAAA--GA-CAGATT-----AGTAGTATAAATAG---GAG-------GGAAATC----------------------ATGCCACATTT---------TTG---G-G----------G-----CAAA---------------------TG----CGTACGGAAACGACCGAGCGAGTATCGGCTTTTATTT-TACTTCGT-------------AG-GTTAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTA---------------TGTATATA-------ACATA---AAAAAG-CATACGTTTT--------TAAAAAT--GTTCTT-GCGT---AAATTG-TTTTATTACATTTT---ACAAAATAGTA--TTCTCATTATACGTT-GGTTATTTAAAGATTA---C--------CCGTATA
gi|14                         :                                                                                         gaaattgagagattgagtaggATTTTGTGGGCAAACCGTATAC---AAA-------GAAAATCA---------------------ATA----ATCA---------CCG---AAA----------G-----CGAA---------------------CGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTAATCTATA-TTAGT-AGATGG-TTTGAAGCGGAAA-----AG--GGAAAGAGGTTGAA---GTTTTA-TT---TTTACATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAAAG-CAGACGT------------AAAAGT---TTGCATGTGT---TAATTGTTTC-ATTACATTTT---ACAGAACGGTATTTTTTTTTCTCATTTG-AG-TATTTACATATAACACC--------CCG--TTTCTATAATGGTATCGCCTAT--CCAC--GACGATATA-CAAGCATATTAGG--TTTTATTCATCAAC-----GAC-AA--AA---AGTGTGATAGGTTAACGCTAACAAAAATA-------------A---------AATA----ATAATACCAGCGAACGTTGAACTGTTAGAAAACAC--ATT------TTTAA---TATATAAAAT-----TACCACGAATAATATACTGTTAATTATATTTTGCTTAATAGTTTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTATAGA-------TAAGAACTacgtggtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tctttT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAGc
gi|11                         :            ttgtttaaagattacacccctccccgtatctataatggtatcgtctatctacgacgttgtatattagattgtatttatctacgacaaaagaggtgtcgggttaatgcagaaaatatcagcgaacgttgaactgtcagaaatcacgtatttaatatataaagttaccttaagtaattatacggtttattttattttgtttattaatgttaaacacaatagtataaagtgaatcaatttgtatataactcatcgttctgtgtaaactcggttacaattacgtatattaaggacatgtataaatccttgggcacatcgattgttatTTGAAAATGTTTTG-TT---TTTGTA-TA-ATGTATATAGCTTGACATA---AA-----------TTTTATTTATCGTAAATAA--GTTTTA-TT-----AAATTGT----ATTATATTTCTTAAAAAAATAGTT--TTCTCATCACAC--------AT----GGCTTA---C--------CCGCGTATTTATAATGGTATCGTCCATCCCTAA--T-ATTAAAA-T-AGCGTA-TATGATTTTTA-T
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggTGAA---TTTTTGTTTTTGTTT--AATGTGTATA----ACTTGACGTATGTAAAAA--AAAT-ATCAT--------TGCAAATAAGTTCAT-ATGT---AAATCG-TTTTATTTTATTTT---------TATT---TTTTTATTTTATTTTACAT-------GGCTTA---C--------CTGCGTAGCTATAATGGTATCGTCCAT--CCACAAT--GCTATATT-AGCG--TTAT---TTTTA-Tttatcgtcgactataggggtgtcatgttaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTAGTT-------CATTATGTGTGTA-GACT-AACATA---AAAAG--CATTTGTT----------------------------GT---AAATTGTTTG-ATTAGATTTT---ACAAAATAGTA--ttatcgttgtctttaggggtgtcaggttaacggt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTATTAGATTTT---ACAAAGTAGTA--ATCTCGTTTAATTTG-C-TTATTTAAAGACTA---C--------CCCCGTTTCTGTAATGATATTGTCTAT--CCAC-----------------G----ACG--TT--------GAACA----AGCGAATTAGG-------TTTTATTTATCTACGACAAAAGGG-------------GTGTCAGGTTAATGC-AGAAAATATCAGCGAAAGGTGAACTT---------ACGTATTTGATA-TATAAAGTTACCTGAAATGATA-TA-CA-------------GTTCTCTATATTTTGCTTGTTAGTTTTTAACAAAA-TAGTAT--------TCAATTTAT--AATATATTT-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTTTATTGATGACA--TATATAAAATATTATAAATA-ATTGATTATCAATTATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgTTGTTTAAAGATTA---CACCCCTCCCCG--TATCTATAATGGTATCG----T--CTA---T-C-------T-A-CG----ACG--TTGTA-T-----------------ATTAG---ATTGTATTTATCTA----CGACAAAAGAG-------------GTGTCGGGTTAATGC-AGAAAATATCAGCGAACGTTGAACTGTCAGAAATCACGTATTTAAT-ATATAAAGTTACCTTAAGTAATTATA-CG-------------GTTTATTTTATTTTGTTTATTAATGTTAAAC-ACAATAGTATAAAGTGAATCAATTTGT--A--------------TATAACTCATCGTTCTGTGTAAACTCGGTTACAATTACGTATATTAAGGACATGTATAA---ATCCT-TGGGCACATCGAT--TG--TTATCTATT------ATC--CTCTGTTGCTTTACCTTCATACC-CATCT---AA-CGAA-GTAAtctt
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCA-CATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCCTTTCTCATTTACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAATGAGTAAAAAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAATTATA-TTGTTGTTCACTTAAGGAAAACAGTTATAATTTATGCGATAGTAAACC-TA----GTCTTCTTTTGGACACATATTTTCCTAATTAACcaaaacgttaatgcagagcaaacgacaggta
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Reference ( family-1657 )     :                                                        AGTATGGTANGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGGGCAAA-TGC-CACA-TTTTNNG------GGCAAAC--CGAATACGAAGAAA-------ATCG----------ATA-ATC-------------GCC---------GNA-------G----------GCGAA---------------------CGATCGCGNACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATATGACTTAACATA---AAAA-GGCANA-CG-TTTTA---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTANATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T--CGTT-ATA-T-AGCGTATTACG--TTTTATCA-AAACATT--AAC-AATTAAG-C-AC---TG-TTTTTATTTANCNACGACAAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATATCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-ATTTAAAGTTAC-----ATAAAGT-A--T--TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTNTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATANT-TGAGTACATCGA-T-A-T-GA-T-TATTTATTGCG-TAATCGACTCTTGTGCGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-CGAGTGTAACTCNGTATTCAAACATTTGCCNCCCCCTTTCTCATTNACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGTAAAGAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCGCTTAA-GAAAACAGTTATAA-T-TACGCGATANTAAAC-TAAG----C-GTCTAGACGNACATCTT-CTANTTAACACCCAAGTAAGTCGTGCANACTGNGCCTACGTTGACAACANCGNTATCNATACCGGTATTATATATCGCGCCAANGCTGCGNTAATCGACTCCTGCGTGCCNCNTCAAANCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCNGTATTCAAATATTTGCCNCCCC
gi|1                          :                                                          TATGTTGAGTT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTAGAGCAAA---C-CGAA-TACGAAGAAAATCGATAATCGTCGAAGGCGAACAAA-------CGCG----------ATATATTA------------GTT---------GTA-------GTTATC-----ACAAA---------------------CGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGG--C----TTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAAAGGCAAA-CG-T---A---A----AACT--GTTTTCATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTAAT--CTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTAC------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGTCTAC--T--CGTT-ATAGT-GGCGTGTTACG--TTTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAG-CCAC---TG-TTTTTATTAAACAACGACGAAAGG--TG-------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAAT-GATTGAA--TAC-----ATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATAGT-TGAGTGTATTGC-T-AAT-GA-TCTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAA-TGTATAGGATATTGAGC-TAAA----CGGTCTAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCCAAGTAAGTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTT-AAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTC
gi|10                         :                                                    agtaAGTATAGTATGATTGAAAATAAGT-----GGAAAAT-ATG-GACAGATTTTTGCGGAAAA-TGGACACAATTTTGCG------G--AAAT--CCAATACGAAGAAA-------ACCG----------ATA-AAC-------------GCC---------AAA-------GGCGAACGAACGCGAATTTAGTAGTAGCTATCCCAATCGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggAATATT--AA--AAT--AG-C-GTATATGATTTTTATTTATCGTCGACTATAGGGGTGTC-ATG-TT----AAttatcgtcgactataggggtgtcatgttaa
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                 ---------------------CGATCGCTTACGGAAACGGCCGAACGAGTATAGGATCAATGTTTTATTgtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
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gi|2                          :                                                        AGTATAATAAGATTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCAACA--TTTTTGGAGTAAA-TGC-CACA-TTTTTTT------AGCAAAC--CGAATACGAAGAAA-------ATCG----------ATA-ATC-------------GTC---------GGA-------G----------GCGAA---------------------CGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGG--C----TTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTG---CAATATGTATATATAACTTAACATA---AAAA--ACAGT-CGTTTTTA---A----AAAT--GTTCTAAT--GCAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGTCTAC--T--CGTT-GTA-T-AGCGTATTACG--TTTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCC-AC---TG-TTTTTATTTAACAACGACGAAAGGAG---------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATAATTTAA---TAC-----ATAAAG-----T--TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATATT-TGAGTGTATTGC-TAA-T-GATT-TATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGA-TGTATGCGATATTGAAC-TAAA----CGGTCTAGACGAACATCTT-CTATTTAACACCGAAGTAAGGCATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|3                          :                                                          TATGATAAGCT--AAAATAGGA-----CATAAATCATTCCACA--TTTGTGGAGCAAAATGC-CACA-TTTTGTG------AGCAAAC--CGAATACGAAGAAAATCGATAATCGCCGAAGGCGAACG-ATC-------------GCGAATTTAGTAGTA-------GTTATC-----ACAAA---------------------CGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTA---TATTATGTATATATAACTTAACAT----AAAA-CGCAGA-CG-TT------A----AAAT--GTTCTTGT--GTCAA-TTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAATTTTCAT--CTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGTCCACA-T--CGTT-GTAGT-AGCGTATTACG--TTTTAACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTC-AC---TG-TTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAA-G-TTAATGAATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACGTATTTAAT-ATATAAAGTTTC-----ATTATGT-AACA--TACAGTTTTTTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ta----TTTTAATC-TATATTAGTAGATGG-TTTGAAGCGGAAA-----AG--GGAAAGAGGTTGAA---GTTTTATTT----TTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAA-AGCAGA-CG-T---A---A----AAGT--TTGCATGT--GTTAA-TTGTTTC-ATTACATTTT---ACAGAACGGTATTTTTTTTTCTCATTTG-AGT-ATTTACATATAACA-----CCCCGTTTCTATAATGGTATCGCCTATCCAC--GA-CGAT-ATA-CAAGCATATTAGG--TTTTATT-----CATC--AAC-GA-CAAA-A-AG---TG-TGATAGGTTAACGCTAACAAAAA-------------T----AAAAT-A-ATAATACCAGCGAACGTTGAACTGTTAGAAAACACATTTTTAAT-ATATAAAATTACCACGAATAA--T-A-----TACTGTTAATTATATTTTGCTTAATAGTTTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTATAGA-------TAAGAACT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcttAATACAATGAGAATTAACGTAATTTAACGGATAATTGTTGTTCGC------------ATTATA------CGCGATAATAAACATAAG----CTGTCAAGCTGGACATCTT-C--CTTAATAC-----------ATGCATACTGTGTCTATGTTG--AATACCGC--TCTATA----TA-TATATATCGCGCCAATGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCACATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCc
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gi|9                          : gaaattgagagattgagtaggaacagttttggataggaaagacagattagtagtataTATGG--AGCT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTGGGGCAAA-TGC-CACA-TTTTGTG------GGAAAAC--CGAATACGAAGAAA-------ATCG----------ATA-ATC-------------GCC---------AAA-------G----------GCGAA---------------------CGAACGCGTACGGAAACGACCGAGTGATTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTC-----ATAGGTT---------AA-----AGAAGGAAAAAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTG---CATTATGTATA-----------ATA---AAAA-AGCATA-CGTTTTTA---A----AAAT--GTTCTTGC--GTAAA-TTG





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consensus                     :                                                        AGTATGGTAAGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGCGG--------------GCAAACCGA-ATA-----CG---AAG------AAAATCGA----TA-ATC-------------GCC--------------------------GNAG--TT--GTC-CGAACGANCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA----AAAAAG-CANA-CG-TTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAG-CCACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGT-A--T--TACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTG-CTAAT-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CGTGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
Reference ( family-1657 )     :                                                        AGTATGGTAAGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGTGG--------------GCAAACCGA-ATA-----CG---AAG------AAAATCGA----TA-ATC-------------GCC--------------------------GNAG--TT--G---CGAACGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA----AAAAAG-CANA-CG-TTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAG-C-ACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGT-A--T--TACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTG-NTA-T-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
gi|1                          :                                                          TATGTTGAGTT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTAGAGCAAA---C-CGAA-T---ACGAA-------------GAAAATCGA--TAATCGTCG---AAGGCGAACAAACGCGA----TATATTA------------GTT--------------------------GTAG--TT--ATCACAAACGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGG--C----TTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA----AAAAAGGCAAA-CG-T----A---A----AACT--GTTTTCATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTAAT--CTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTAC------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGTCTAC--T-CGTTAT---AGT-GGCGTGTTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAG-CCACTGTTTTTATTAAACAACGACGAAAGG--TG-------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATGA-T-TGAA--TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATAGT-TGAGTGTATTG-CTAAT-GATCT-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATAGGATATTGAGC-TAAACGGTC---TAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCC-AAGTAA-GTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTT-AAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTC
gi|10                         :                                                    agtaAGTATAGTATGATTGAAAATAAGT-----GGAAAAT-ATG-GACAGATTTTTGCGGAAAA-TGGACACAATTTTGCGGAAATCCAATACGAAGAAAACCGATAAA-----CGCCAAAG------GCGAACGAACGCGA-ATTTA-----------GTA--------------------------GTAG--CT--ATCCCAATCGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGAAAATGTTTTGTTT----TTG---TATAATGTATATA-G-CTTGACATA----AA-------------TTTT-ATTTATCGTAAATAAGTT-TTAT---TAAA-TTGT----ATTATATTTCTTAAAAAAATAGTTTTCTCAT--CACAC--------AT----GGCTTAC------CCGCGTATTTATAATGGTATCGTCCATCC-C--T-AATATTAAAA-T-AGCGTA-TATGATT-TTTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggTTTTTATTTATCGTCGACTATAGGGGTGTC-ATG-TT----AAttatcgtcgactataggggtgtcatgttaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                 ggttgaaaatgttttgtttttgtataatgtatatagcttgacataaattttatttatcgtaaataagttttattaaattgtattatatttcttaaaaaaatagttttctcatcacacatggcttacccgcgtatttataatggtatcgtccatccctaatattaaaatagcgtatatgaTGAA---TTTTTGTTTTTGTTTA-------ATGTGTATA--ACTTGACGTATGTAAAAAAA--ATATCA-TTGC-A---A----ATAA--GTTCATAT--GTAAA-TCG-TTTTATTTTATTTT---------TATT-TTTTTAT--TTTATTTTACAT-------GGCTTAC------CTGCGTAGCTATAATGGTATCGTCCATCCACAAT--GCTAT---ATT-AGCG--TTAT---T-TTTAT
gi|13                         :                                                                        AAATAGGACTTTAGATAA-CCATGGAA-A--TCTTTTGTGTAAG--GC-CACA-TTTT-TGT--------------GCAAACCGA-ATA-----CG---CAG------AAAATCTA----TA-ATCGAGCGTGGTTTTGGTT--------------------------GAAGTTTT--T---CAAACGAGTGTGAACGGAAGCGGATGAGCGAGTATCGG--C----TTttatcgttgtctttaggggtgtcaggttaacggt
gi|14                         :                                                                                                        tatatggcttctaaaggtatA-TTTTGTGG--------------GCAAACCGT-ATA-----CA---AAG------AAAATCAA----TA-ATC-------------ACC--------------------------GAAA------G---CGAACGAACGTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          TACGGAAACGGCCGAACGAGTATAGGATCAATGTTTTATTgtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttgtgggcaaaccgtatacaaagaaaatcaataatcaccgaaagcgaacgaacgtggtttcagcagcagctatcacaatcgatcgctAAGATTAC------TCCCGTATCTATTATGACATCGTCTATCCAG--GACGTTGC---A-CAAGCGTATTA-G--T-TTTTTC-----CATT--AAC-AAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTAGTTCATTATGTGTGTA-GACT-AACATA----AAAA-G-CA--------TT-------------T--GTT-------GTAAA-TTGTTTG-ATTAGATTTT---ACAAAATAGTAcaaaacgttaatgcagagcaaacgacaggta
gi|2                          :                                                        AGTATAATAAGATTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCAACA--TTTTTGGAGTAAA-TGC-CACA-TTTTTTTA--------------GCAAACCGA-ATA-----CG---AAG------AAAATCGA----TA-ATC-------------GTC--------------------------GGAG------G---CGAACGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGG--C----TTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTG---CAATATGTATATATAACTTAACATA----AAAAA--CAGT-CG-TTTTTA---A----AAAT--GTTCTAAT--GCAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGTCTAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAG-CCACTGTTTTTATTTAACAACGACGAAAGGAG---------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAAT-AATTTAA---TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATATT-TGAGTGTATTG-CTAAT-GAT-TTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGATGTATGCGATATTGAAC-TAAACGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CCGAAGTAAGG-CATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|3                          :                                                          TATGATAAGCT--AAAATAGGA-----CATAAATCATTCCACA--TTTGTGGAGCAAAATGC-CACA-TTTTGTGA--------------GCAAACCGA-ATA-----CG---AAG------AAAATCGA----TA-ATC-------------GCCGAAGGCGAACGATCGCGAATTTAGTAGTAG--TT--ATCACAAACGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTA---TATTATGTATATATAACTTAACAT-----AAAACG-CAGA-CG-TT-------A----AAAT--GTTCTTGT--GTCAA-TTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAATTTTCAT--CTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGTCCACA-T-CGTTGT---AGT-AGCGTATTACG--T-TTTAACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTC-ACTGTTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAA-G-TTAATGAATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTT-CATTATGT-AACA--TACAGTTTTTTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcttAATACAATGAGAATTAACGTAATTTAACGGATAATTGTTGTTCGC---------------AT--TATACGCGATAATAAACATAAGCTGTC---AAGCTGGACATCTT-C--CTTAATA-------------CATGCATACTGTGTCTATGTTGAATACCGC----TCTATA----TA-TATATATCGCGCCAATGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCACATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCc
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consensus                     :                                                        AGTATGGTAAGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGCGG-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------GNAGTTGTC-CGAA-CGANCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA----AAAAAG-CANA-CG-TTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGT-A--T--TACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CGTGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
Reference ( family-1657 )     :                                                        AGTATGGTAAGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGCGG-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------GNAGTTGTC-CGAA-CGANCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA----AAAAAG-CANA-CG-TTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGT-A--T--TACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CGTGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
gi|1                          :                                                          TATGTTGAGTT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTAGAGCAAA---C-CGAA-T---ACGAAGAAAATCGA-TAATCGTCGAAGGCGAACAAACGCGATATATTAG-------------TT--------------------------GTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGG--C----TTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA----AAAAAGGCAAA-CG-T----A---A----AACT--GTTTTCATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTAAT--CTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTAC------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGTCTAC--T-CGTTAT---AGT-GGCGTGTTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTAAACAACGACGAAAGG--TG-------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATGA-T-TGAA--TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATAGT-TGAGTGTATTGCTAAT-GATCT-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATAGGATATTGAGC-TAAACGGTC---TAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCC-AAGTAA-GTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTT-AAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTC
gi|10                         :                                                    agtaAGTATAGTATGATTGAAAATAAGT-----GGAAAAT-ATG-GACAGATTTTTGCGGAAAA-TGGACACAATTTTGCGG---AAATCCAATA-----CGAAG------AAAACCGATA-AAC-G-------------CCAAAGGCGAACGAACGCGAATTTAGTAGTAGCTATC-CCAATCGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGAAAATGTTTTGTTT----TTG---TATAATGTATATA-G-CTTGACATA----AA-------------TTTT-ATTTATCGTAAATAAGTT-TTAT---TAAA-TTGT----ATTATATTTCTTAAAAAAATAGTTTTCTCAT--CACAC--------AT----GGCTTAC------CCGCGTATTTATAATGGTATCGTCCATCC-C--T-AATATTAAAA-T-AGCGTA-TATGATT-TTTA-T
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggTTTTTATTTATCGTCGACTATAGGGGTGTC-ATG-TT----AAttatcgtcgactataggggtgtcatgttaa
gi|12                         :                                                                                                                                                          ggttgaaaatgttttgtttttgtataatgtatatagcttgacataaattttatttatcgtaaataagttttattaaattgtattatatttcttaaaaaaatagttttctcatcacacatggcttacccgcgtatttataatggtatcgtccatccctaatattaaaatagcgtatatgaTGAA---TTTTTGTTTTTGTTTA-------ATGTGTATA--ACTTGACGTATGTAAAAAAA--ATATCA-TTGC-A---A----ATAA--GTTCATAT--GTAAA-TCG-TTTTATTTTATTTT---------TATT-TTTTTAT--TTTATTTTACAT-------GGCTTAC------CTGCGTAGCTATAATGGTATCGTCCATCCACAAT--GCTAT---ATT-AGCG--TTAT---T-TTTA-T
gi|13                         :                                                                        AAATAGGACTTTAGATAA-CCATGGAA-A--TCTTTTGTGTAAG--GC-CACA-TTTT-TGT-GCAAACCGAATA-----CGCAG------AAAATCTATA-ATC-GAGCGTGGTTTTGGTT--------------------------GAAGTTTTT-CAAA-CGAGTGTGAACGGAAGCGGATGAGCGAGTATCGG--C----TTttatcgttgtctttaggggtgtcaggttaacggt
gi|14                         :                                                                                                        tatatggcttctaaaggtatA-TTTTGTGG-GCAAACCGTATA-----CAAAG------AAAATCAATA-ATC-A-------------CC--------------------------GAAA--G---CGAA-CGAACGTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TACGGAAACGGCCGAACGAGTATAGGATCAATGTTTTATTgtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttgtgggcaaaccgtatacaaagaaaatcaataatcaccgaaagcgaacgaacgtggtttcagcagcagctatcacaatcgatcgctAAGATTAC------TCCCGTATCTATTATGACATCGTCTATCCAG--GACGTTGC---A-CAAGCGTATTA-G--T-TTTT-TC-----CATT--AAC-AAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAGTTCATTATGTGTGTA-GACT-AACATA----AAAA-G-CA--------TT-------------T--GTT-------GTAAA-TTGTTTG-ATTAGATTTT---ACAAAATAGTAcaaaacgttaatgcagagcaaacgacaggta
gi|2                          :                                                        AGTATAATAAGATTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCAACA--TTTTTGGAGTAAA-TGC-CACA-TTTTTTTA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------TC--------------------------GGAG--G---CGAA-CGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGG--C----TTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTG---CAATATGTATATATAACTTAACATA----AAAAA--CAGT-CG-TTTTTA---A----AAAT--GTTCTAAT--GCAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGTCTAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTAACAACGACGAAAGGAG---------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAAT-AATTTAA---TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-TTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGATGTATGCGATATTGAAC-TAAACGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CCGAAGTAAGG-CATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|3                          :                                                          TATGATAAGCT--AAAATAGGA-----CATAAATCATTCCACA--TTTGTGGAGCAAAATGC-CACA-TTTTGTGA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CCGAAGGCGAACGATCGCGAATTTAGTAGTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTA---TATTATGTATATATAACTTAACAT-----AAAACG-CAGA-CG-TT-------A----AAAT--GTTCTTGT--GTCAA-TTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAATTTTCAT--CTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGTCCACA-T-CGTTGT---AGT-AGCGTATTACG--T-TTTA-ACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTCACTGTTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAA-G-TTAATGAATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTT-CATTATGT-AACA--TACAGTTTTTTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcttAATACAATGAGAATTAACGTAATTTAACGGATAATTGTTGTTCGC---------------AT--TATACGCGATAATAAACATAAGCTGTC---AAGCTGGACATCTT-C--CTTAATA-------------CATGCATACTGTGTCTATGTTGAATACCGC----TCTATA----TA-TATATATCGCGCCAATGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCACATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCc
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Reference ( family-1657 )     :                                                        AGTATGGTAAGNTTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGCGG-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------GNAGTTGTC-CGAA-CGANCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA----AAAAAG-CANA-CG-TTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGT-A--T--TACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAT--A-------T-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CGTGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
gi|1                          :                                                          TATGTTGAGTT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTAGAGCAAA---C-CGAA-T---ACGAAGAAAATCGA-TAATCGTCGAAGGCGAACAAACGCGATATATTAG-------------TT--------------------------GTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGG--C----TTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA----AAAAAGGCAAA-CG-T----A---A----AACT--GTTTTCATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTAAT--CTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTAC------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGTCTAC--T-CGTTAT---AGT-GGCGTGTTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTAAACAACGACGAAAGG--TG-------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATGA-T-TGAA--TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATAGT-TGAGTGTATTGCTAAT-GATCT-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATAGGATATTGAGC-TAAACGGTC---TAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCC-AAGTAA-GTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTT-AAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTC
gi|10                         :                                                    agtaAGTATAGTATGATTGAAAATAAGT-----GGAAAAT-ATG-GACAGATTTTTGCGGAAAA-TGGACACAATTTTGCGG---AAATCCAATA-----CGAAG------AAAACCGATA-AAC-G-------------CCAAAGGCGAACGAACGCGAATTTAGTAGTAGCTATC-CCAATCGATCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTATGAAG-GTAAAGCAACAGAGGATAATAG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGAAAATGTTTTGTTT----TTG---TATAATGTATATA-G-CTTGACATA----AA-------------TTTT-ATTTATCGTAAATAAGTT-TTAT---TAAA-TTGT----ATTATATTTCTTAAAAAAATAGTTTTCTCAT--CACAC--------AT----GGCTTAC------CCGCGTATTTATAATGGTATCGTCCATCC-C--T-AATATTAAAA-T-AGCGTA-TATGATT-TTTA-T
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggTTTTTATTTATCGTCGACTATAGGGGTGTC-ATG-TT----AAttatcgtcgactataggggtgtcatgttaa
gi|12                         :                                                                                                                                                          ggttgaaaatgttttgtttttgtataatgtatatagcttgacataaattttatttatcgtaaataagttttattaaattgtattatatttcttaaaaaaatagttttctcatcacacatggcttacccgcgtatttataatggtatcgtccatccctaatattaaaatagcgtatatgaTGAA---TTTTTGTTTTTGTTTA-------ATGTGTATA--ACTTGACGTATGTAAAAAAA--ATATCA-TTGC-A---A----ATAA--GTTCATAT--GTAAA-TCG-TTTTATTTTATTTT---------TATT-TTTTTAT--TTTATTTTACAT-------GGCTTAC------CTGCGTAGCTATAATGGTATCGTCCATCCACAAT--GCTAT---ATT-AGCG--TTAT---T-TTTA-T
gi|13                         :                                                                        AAATAGGACTTTAGATAA-CCATGGAA-A--TCTTTTGTGTAAG--GC-CACA-TTTT-TGT-GCAAACCGAATA-----CGCAG------AAAATCTATA-ATC-GAGCGTGGTTTTGGTT--------------------------GAAGTTTTT-CAAA-CGAGTGTGAACGGAAGCGGATGAGCGAGTATCGG--C----TTttatcgttgtctttaggggtgtcaggttaacggt
gi|14                         :                                                                                                        tatatggcttctaaaggtatA-TTTTGTGG-GCAAACCGTATA-----CAAAG------AAAATCAATA-ATC-A-------------CC--------------------------GAAA--G---CGAA-CGAACGTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TACGGAAACGGCCGAACGAGTATAGGATCAATGTTTTATTgtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttgtgggcaaaccgtatacaaagaaaatcaataatcaccgaaagcgaacgaacgtggtttcagcagcagctatcacaatcgatcgctAAGATTAC------TCCCGTATCTATTATGACATCGTCTATCCAG--GACGTTGC---A-CAAGCGTATTA-G--T-TTTT-TC-----CATT--AAC-AAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAGTTCATTATGTGTGTA-GACT-AACATA----AAAA-G-CA--------TT-------------T--GTT-------GTAAA-TTGTTTG-ATTAGATTTT---ACAAAATAGTAcaaaacgttaatgcagagcaaacgacaggta
gi|2                          :                                                        AGTATAATAAGATTGAAAATAGGA-----GGTAAATCATGCAACA--TTTTTGGAGTAAA-TGC-CACA-TTTTTTTA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------TC--------------------------GGAG--G---CGAA-CGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGG--C----TTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTG---CAATATGTATATATAACTTAACATA----AAAAA--CAGT-CG-TTTTTA---A----AAAT--GTTCTAAT--GCAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGTCTAC--T-CGTTGT---A-T-AGCGTATTACG--T-TTTA-TCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTAACAACGACGAAAGGAG---------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAAT-AATTTAA---TA-CATAAAGT-------TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTAC--A-------T-AGAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-TTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGATGTATGCGATATTGAAC-TAAACGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CCGAAGTAAGG-CATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|3                          :                                                          TATGATAAGCT--AAAATAGGA-----CATAAATCATTCCACA--TTTGTGGAGCAAAATGC-CACA-TTTTGTGA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CCGAAGGCGAACGATCGCGAATTTAGTAGTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTA---TATTATGTATATATAACTTAACAT-----AAAACG-CAGA-CG-TT-------A----AAAT--GTTCTTGT--GTCAA-TTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAATTTTCAT--CTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGTCCACA-T-CGTTGT---AGT-AGCGTATTACG--T-TTTA-ACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTCACTGTTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAA-G-TTAATGAATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTT-CATTATGT-AACA--TACAGTTTTTTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                              ta----TTTTAATC-TATATTAGTAGATGG-TTTGAAGCGGAAA-----AG--GGAAAGAGGTTGAA---GTTTTATTT----TTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA----AAAAAG-CAGA-CG-T----A---A----AAGT--TTGCATGT--GTTAA-TTGTTTC-ATTACATTTT---ACAGAACGGTATTTTTTTTTCTCATTTG-AGT-ATTTACATATAACA-----CCCCGTTTCTATAATGGTATCGCCTATCCAC--GACGATAT---A-CAAGCATATTAGG--T-TTTATTCATCAAC-----GAC-AA--AA---AGTGTGATAGGTTAACGCTAACAAAAA-------------T----AAAAT-A-ATAATACCAGCGAACGTTGAACTGTTAGAAAACACATTTTTAAT-A-TATAAAATTACCACGAATA-A--TA-TACTGTTAATTATATTTTGCTTAATAGTTTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTATAGA-------TAAGAACT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcttAATACAATGAGAATTAACGTAATTTAACGGATAATTGTTGTTCGC---------------AT--TATACGCGATAATAAACATAAGCTGTC---AAGCTGGACATCTT-C--CTTAATA-------------CATGCATACTGTGTCTATGTTGAATACCGC----TCTATA----TA-TATATATCGCGCCAATGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCACATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCA-CATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCCTTTCTCATTTACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAATGAGTAAAAAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAATTATA-TTGTTGTTCACTTAAGGAAAACAGTTATAATTTATGCGATAGTAAAC-CTAGTCTTCTTTTGGACACATATTTTCCTAATTAACctttctcatttacatgtctgtataaataaggaggcaaaatgagtaaaaaaaaaacacaatgagaataaacgtaatttaaattatattgttgttcacttaaggaaaacagttataatttatgcgatagtaaacctagtcttcttttggacacatattttcctaattaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatacaatgagaattaacgtaatttaacggataattgttgttcgcattatacgcgataataaacataagctgtcaagctggacatcttccttaatacatgcatactgtgtctatgttgaataccgctctatatatatatatcgcgccaaTTTTATTAGATTTT---ACAAAGTAGTAATCTCGT--TTAATTTG-C-TTATTTAAAGACTAC------CCCCGTTTCTGTAATGATATTGTCTATCCAC--------------------G----ACG--T-T--------GAACA----AGCGAATTAGG-------TTTTATTTATCTACGACAAAAGGGGTGTCAG-G-TT----AATGC-AGAAAATATCAGCGAAAGGTGAACTT---------ACGTATTTGAT-A-TATAAAGTTA-CCTGAAATGA--TA-TACAGTTCTCTATATTTTGCTTGTTAGTTTTTAACAAAA-TAGTAT--------TCAATTTAT--AATATATTT-AGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTTTATTGATGACA--TATATAAAATATTATAAATA-ATTGATTATCAAT-T-ATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgTTGTTTAAAGATTACACCCCTCCCCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCTAC--GACGTTGT---A-T-ATTAGATT--G--TATTTA-TCtctt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTATTTATCTACGACAAAAGAGGTGTC-G-GGTT----AATGC-AGAAAATATCAGCGAACGTTGAACTGTCAGAAATCACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CCTTAAGTAA--TTATACGGTTTATTTTATTTTGTTTATTAATGTTAAAC-ACAATAGTATAAAGTGAATCAATTTGT--A--------------TATAACTCATCGTTCTGTGTAAACTCGGTTACAATTACGTATATTAAGGACATGTAT---AAATCCT-TGGGCACATCG---AT-TGT-T-ATCTATT------ATC--CTCTGTTGCTTTACCTTCATACC-CATCT---AA-CGAA-GTAAtacgacaaaagaggtgtcgggttaatgcagaaaatatcagcgaacgttgaactgtcagaaatcacgtatttaatatataaagttaccttaagtaattatacggtttattttattttgtttattaatgttaaacacaatagtataaagtgaatcaatttgtatataactcatcgttctgtgtaaactcggttacaattacgtatattaaggacatgtataaatccttgggcacatcgattgttatctattatcctctgttgctttaccttcatacccatctaacgaagtaa
gi|8                          :                                                                           ttgtttaaagattacacccctccccgtatctataatggtatcgtctatctacgacgttgtatattagaAATA-----GGAGG------GAAATC-----AT--G-------------CC--------------------------ACATTT-TT-GGGG-CAAATGCGTACGGAAACGACCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGT-------------AG-GTTAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAT------------------GTATATA-------ACATA----AAAAAG-CATA-CGTTTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGC--GTAAA-TTG-TTTTATTACATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--TATACGTT-GGTTATTTAAAGATTAC------CCGTATA
gi|9                          : gaaattgagagattgagtaggaacagttttggataggaaagacagattagtagtataTATGG--AGCT--AAAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTGGGGCAAA-TGC-CACA-TTTTGTGG-GAAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------AAAG--G---CGAA-CGAACGCGTACGGAAACGACCGAGTGATTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTC-----ATAGGTT---------AA-----AGAAGGAAAAAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTG---CATTATGTATA-----------ATA----AAAAAG-CATA-CGTTTTT-A---A----AAAT--GTTCTTGC--GTAAA-TTG


blockSeqs                     :                                                              GT   A TG         CTTTA           GA   GA             AT  A    A    GC G             .         .           G   .   . CCGAAGGCGAACGATCGCGAATTTAGTAGTAGTTATCA                 T   T                              AT AATG        .       TTA     G  T    C     GCAAC                  AAT         TTG    GTTC            TAACTT      TGTA    AA   TTTTATTTATCGT           AA   C    .      .   T   T    T     TTA                  TT        ACA T             ACCCCT                               TAATATTAAAAT         T    TGAT A    T  AGA    TTTA   G       C               T G     T     G T TCAAGTTAATG       A G      A                 TT     A            . A T    G   C   A    AATTA         A                                      AAAGTGAA         AATATATTT                                                           ATG   ATA C     A      T    CTA  CA  TT        G  C     G      T       C         T     T    A    T                                                                          AAA                                      AT          T   T            G            T     A     G   TTT              C T T      CCGAAGTAAGG                                GATG      C     T                                                           GA
blockSeqs                     :                                                              AT   A TG         .               CA   .              T   .    .    GT T             .         .           T   .   . CCAAAGGCGAACGAACGCGAATTTAGTAGTAGCTATC                  .   G                              .  .           .       TTA     G  T    .     .                      .           G      T               TAACTT      .       CG   TATCATTGCAA             .    C    .      .   T   T    T     .                    .         CG  T             A                                    AATGCTATATT          T    CG   .    .  AGA    TTTA   .       T               A A     G     A T TCATGTT           . A      T                 TT     A            . . A    A   .   T    AACA          T                                      .                AGATA                                                               A     .   A     .      C    ATT  G   T         A  A     G      G       .         T     T    .    T                                                                          .                                        C           T   G            A            A     .     T   .                . T C      .                                          .         .     .                                                           G 
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Reference ( family-1657 )     :                                                        AGTATGGTAAGNT--A-AAATAGGA-----GGTAAATCATGCNACA--TTTTTGGAGCAAA-TGC-CACA-TTTTGCGG-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------GNAGTTGTC-CGAA-CGANCGCGTACGGAAACGGCCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACTTAACATA---AAAAAG-CATACGTTTT--------TAAAAATGTTCTTGT--GTAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCCACAACGTT-GTA-T-AGCGTATTACG--T-TTTATCAGAAACATT--AAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTANCNACGACGAAAGGGGTGTC-G-G-TT----AATAC-AGAAAATANCAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CATNAAGTAA-TATACAGTTNATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTATAG-T-A------GAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGACA--TAT---ANATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-T-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTNTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-TCGTTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATGCGATANTGAAC-TAAGCGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CC-AAGTAA-G-CGTGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGTCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGCGTGCCTCTTCAAACCTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTCCTC
gi|1                          :                                                          TATGTTGAGTT--A-AAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTAGAGCAAA---C-CGAA-T---ACGAAGAAAATCGA-TAATCGTCGAAGGCGAACAAACGCGATATATTAG-------------TT--------------------------GTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGACGAGCATATACCGG--C----TTTTATTTCTACTTCGGTAGATGGATTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGATTGAA---GTTTTATTT--GTTTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAAAGGCAAACGT------------AAAACTGTTTTCATACGTAAAATTGTTCTT-TTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTAAT--CTCATTTT-TGTTATTTAAAGATTAC------CTGAGTATCTATAACGAGAGCGTCTGTCTACT-CGTT-ATAGT-GGCGTGTTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTAAACAACGACGAAAGG--TG-------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAATGA-T-TGAA--TA-CATAAAGT-----TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAATGTTTAACAAAAATAGTTT--------TCAGTTTACA--T-A------GAACTATAACACATCGTTCTGTATAATCTCGGTAACAATAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATAGT-TGAGTGTATTGCTAAT-GATCT-ATTTATTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCT-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAATACAATGAGAATAAACGTAATTTAAAGGATA-GCGCTGTTCACTTAATGAAAACAGTTATAATGTATAGGATATTGAGC-TAAACGGTC---TAGATGAACATCTT-CTATTTAACACCC-AAGTAA-GTCGTGCAAACTGAACCTACGTTAACAACAGCGATATCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGCTGCGCTAATCGACTCTTGCGTACCTCTTCAAACCTCATTTT-AAAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAATATTTACCTTCTC
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gi|14                         :                                                                                                                tatatggcttctaA-TTTTGTGG-GCAAACCGTATA-----CAAAG------AAAATCAATA-ATC-A-------------CC--------------------------GAAA--G---CGAA-CGAACGTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                    TACGGAAACGGCCGAACGAGTATAGGATCAATGTTTTATTgtttcagcagcagctatcacaatcgatcgcttacggaaacggccgaacgagtataggatcaatgttttatta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attttgtgggcaaaccgtatacaaagaaaatcaataatcaccgaaagcgaacgaacgtggtttcagcagcagctatcacaatcgatcgctAAGATTAC------TCCCGTATCTATTATGACATCGTCTATCCAGGACGTT-GCA-CAAGCGTATTA-G--T-TTTTTC-----CATT--AAC-AAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAGTTCATTATGTGTGTA-GACT-AACATA---AAAA-G-CAT--------------------------TTGTT-GTAAA-TTGTTTG-ATTAGATTTT---ACAAAATAGTAcaaaacgttaatgcagagcaaacgacaggta
gi|2                          :                                                        AGTATAATAAGATTGA-AAATAGGA-----GGTAAATCATGCAACA--TTTTTGGAGTAAA-TGC-CACA-TTTTTTTA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------TC--------------------------GGAG--G---CGAA-CGATCTCGTACGGAAATGGCCGCGCGAGTTTCGG--C----TTTAATAT-TACTTCGTTAGATGGGTTTGAAG-GTAAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAATT--GTTTG---CAATATGTATATATAACTTAACATA---AAAAA--CAGTCGTTTT--------TAAAAATGTTCTAAT--GCAAA-TTGTTTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--CTCACTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAATATCTATAATGAGATCGTCTGTCTACT-CGTT-GTA-T-AGCGTATTACG--T-TTTATCAGAAACATTTAAAC-AATTAAGCCACTGTTTTTATTTAACAACGACGAAAGGAG---------------AATAC-AGAAAATAACAGCGAACGTTGAACTTTTAGAAAACACGAATTTAAT-AATTTAA---TA-CATAAAGT-----TACAGTTAATTATATTTTGCTTATTAGTGTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTACA--T-A------GAACTATAACGCATCGGTCTGTATAATCTCGGTAACATTAAGGTATATTGATGAC---TAT---ACATATT-TGAGTGTATTGCTAAT-GAT-TTATTTATTGCGCTAATCGACTCTTTTGTGCCA-CTTCAAACCTCATTTTGAAA-TGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTCCTTTCTCATTAACATGTCTGTATAAATAAAGAGGCAAAACGAGT---GAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTACAGGATA-CCGTTGTTTACTTAATGAAAATAATTATGATGTATGCGATATTGAAC-TAAACGGTC---TAGACGAACATCTT-CTATTTAACA-CCGAAGTAAGG-CATGCAAACTGAGCCTACGTTAACAACAGCGATGCCAATACCGGTATTATATATCGAACCAAAGTTGCGCTAATCGACTCTTGTGTGCCTCTTCAAACCTCATCATG-AAATGAGTGTAACTCTGTATTCAAACATTTACCTCCTC
gi|3                          :                                                          TATGATAAGCT--A-AAATAGGA-----CATAAATCATTCCACA--TTTGTGGAGCAAAATGC-CACA-TTTTGTGA-GCAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CCGAAGGCGAACGATCGCGAATTTAGTAGTAGTTATCACAAA-CGATCTTAAACGGAAACGGCCGAACGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGTTTGATGGAGTTGAAG-GTAAA-----AGGAGGAAATAACTTGAA---GTTTTATTT--TTTTA---TATTATGTATATATAACTTAACAT----AAAACG-CAGACGTT------------AAAATGTTCTTGT--GTCAA-TTG-TTTTATTAGATTTT---ACAAAATAGAATTTTCAT--CTCTCTTT-CGTTATTTAAAGATTAC------CCGAGTATTGATAATGAGATCGTCTGTCCACATCGTT-GTAGT-AGCGTATTACG--T-TTTAACAGAGATATTTAAAC-AATTAAGTCACTGTTTTTATTTACCTACGACAAAAGGGGTGTCAA-G-TTAATGAATACAAAAAAATATCAGCGAAAGATGAACTT---------ACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTT-CATTATGTAA-CATACAGTTTTTTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ta----TTTTAATC-TATATTAGTAGATGG-TTTGAAGCGGAAA-----AG--GGAAAGAGGTTGAA---GTTTTATTT----TTA---CATTATGTATATA-GACT-AACATA---AAAAAG-CAGACGT------------AAAAGTTTGCATGT--GTTAA-TTGTTTC-ATTACATTTT---ACAGAACGGTATTTTTTTTTCTCATTTG-AGT-ATTTACATATAACA-----CCCCGTTTCTATAATGGTATCGCCTATCCACGACGAT-ATA-CAAGCATATTAGG--T-TTTATT-----CATC--AAC-GACAAAA--AGTGTGATAGGTTAACGCTAACAAAAA-------------T----AAAAT-A-ATAATACCAGCGAACGTTGAACTGTTAGAAAACACATTTTTAAT-A-TATAAAATTACCACGAA-TAA-TATACTGTTAATTATATTTTGCTTAATAGTTTTTAACAAAAATAGTAT--------TCAGTTTATAGATAA------GAACT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcttAATACAATGAGAATTAACGTAATTTAACGGATAATTGTTGTTCGC---------------AT--TATACGCGATAATAAACATAAGCTGTC---AAGCTGGACATCTT-C--CTTAATA-------------CATGCATACTGTGTCTATGTTGAATACCGC----TCTATA----TA-TATATATCGCGCCAATGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCACATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTTACGATAATCGACTCCTGTCTGCCA-CATTAAAACTCATTTTGAAAATGAGTGTAACTCGGTATTCAAATATTTGCCGCCCCCTTTCTCATTTACATGTCTGTATAAATAAGGAGGCAAAATGAGTAAAAAAAAAACACAATGAGAATAAACGTAATTTAAATTATA-TTGTTGTTCACTTAAGGAAAACAGTTATAATTTATGCGATAGTAAAC-CTAGTCTTCTTTTGGACACATATTTTCCTAATTAACctttctcatttacatgtctgtataaataaggaggcaaaatgagtaaaaaaaaaacacaatgagaataaacgtaatttaaattatattgttgttcacttaaggaaaacagttataatttatgcgatagtaaacctagtcttcttttggacacatattttcctaattaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatacaatgagaattaacgtaatttaacggataattgttgttcgcattatacgcgataataaacataagctgtcaagctggacatcttccttaatacatgcatactgtgtctatgttgaataccgctctatatatatatatcgcgccaaTTTTATTAGATTTT---ACAAAGTAGTAATCTCGT--TTAATTTG-C-TTATTTAAAGACTAC------CCCCGTTTCTGTAATGATATTGTCTATCCACGAC--------------------G--T-T-------GAACA----AGCGAATTAGG-------TTTTATTTATCTACGACAAAAGGGGTGTCAG-G-TT----AATGC-AGAAAATATCAGCGAAAGGTGAACTT---------ACGTATTTGAT-A-TATAAAGTTA-CCTGAAATGA-TATACAGTTCTCTATATTTTGCTTGTTAGTTTTTAACAAAA-TAGTAT--------TCAATTTATAA-T-ATATTTAGAACTATAACGCATCGTTCTGTGTAATCTCGGTAACAATAAGGTTTATTGATGACA--TATATAAAATATTATAAATA-ATTGATTATCAAT-T-ATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgTTGTTTAAAGATTACACCCCTCCCCGTATCTATAATGGTATCGTCTATCTACGACGTT-GTA-T-ATTAGATT--G--TATTTATCtctt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGTATTTATCTACGACAAAAGAGGTGTC-G-GGTT----AATGC-AGAAAATATCAGCGAACGTTGAACTGTCAGAAATCACGTATTTAAT-A-TATAAAGTTA-CCTTAAGTAATTATACGGTTTATTTTATTTTGTTTATTAATGTTAAAC-ACAATAGTATAAAGTGAATCAATTTGTA---------------TATAACTCATCGTTCTGTGTAAACTCGGTTACAATTACGTATATTAAGGACATGTAT---AAATCCT-TGGGCACATCG---AT-TGT-T-ATCTATT------ATC--CTCTGTTGCTTTACCTTCATACC-CATCT---AA-CGAA-GTAAtacgacaaaagaggtgtcgggttaatgcagaaaatatcagcgaacgttgaactgtcagaaatcacgtatttaatatataaagttaccttaagtaattatacggtttattttattttgtttattaatgttaaacacaatagtataaagtgaatcaatttgtatataactcatcgttctgtgtaaactcggttacaattacgtatattaaggacatgtataaatccttgggcacatcgattgttatctattatcctctgttgctttaccttcatacccatctaacgaagtaa
gi|8                          :                                                                            ttgtttaaagattacacccctccccgtatctataatggtatcgtctatctacgacgttgtatattagaAATA-----GGAGG------GAAATC-----AT--G-------------CC--------------------------ACATTT-TT-GGGG-CAAATGCGTACGGAAACGACCGAGCGAGTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTCGT-------------AG-GTTAA-----AGAAGGAAATAGCTTGAA---GTTTTAT------------------GTATATA-------ACATA---AAAAAG-CATACGTTTT--------TAAAAATGTTCTTGC--GTAAA-TTG-TTTTATTACATTTT---ACAAAATAGTATTCTCAT--TATACGTT-GGTTATTTAAAGATTAC------CCGTATA
gi|9                          : gaaattgagagattgagtaggaacagttttggataggaaagacagattagtagtataTATGG--AGCT--A-AAATAGGA-----GGTAAATCATGCCACA--TTTTTGGGGCAAA-TGC-CACA-TTTTGTGG-GAAAACCGAATA-----CGAAG------AAAATCGATA-ATC-G-------------CC--------------------------AAAG--G---CGAA-CGAACGCGTACGGAAACGACCGAGTGATTATCGG--C----TTTTATTT-TACTTC-----ATAGGTT---------AA-----AGAAGGAAAAAGCTTGAA---GTTTTATTT--GTTTG---CATTATGTATA-----------ATA---AAAAAG-CATACGTTTT--------TAAAAATGTTCTTGC--GTAAA-TTG