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Reference ( gi|1 )            :                                                               GGTGTAAATAATTGTGTATAAATGCATAATTTATGACTGATGTAAACACGTACACTCAGGTAATGGTCATACTTTTTTTAAG--AATTTATTTACTAGTATA----TA---ATTGCTGTATAAGGGTAAGGCAGCC--AATGAATCAAGGAGAAAATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTAAC-A-TAACAGTTTGAAAGTTTTCATTTGTGTGCACACATTACATAA---T------ACCA---TTAATCCTTTCAT--TATGATGTATTTCACA--CTTGCTACATTTTGATAT-AAAAATAAAC-CGCAAGAAACACTATCAT-GTCAAAACCTA-GTTCATTCTTTA-TTTCAATTCAATCACTGA----CATGGTATCTGACTTCTGCATGGAACCTATAAATAATAAATA-ATATTGTAAGTCTATTCTTCAATTATTGTGTGTGACAATTG-CATGTGCAT-ATGTAGTAAAAATTTACTTCAACCACCAG--GAGCGGGAACAGATATTTTCGGA
gi|2                          :                                                               GGTGTCAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACAACTGATATAAACACTTATACACAGACAGTGATTAAATTGCTTAAAAG--AATTTATGTAATAATATA----TA---ATTGCTTTATTAGGTCAAGGTACCC--AATGAATCTCGGACACACTGTCAACAACTG-AATGG-AAACAAAGTCAGTTC-ATTTAA-A-CAATGGTTTGAACATTTTTAGTTGTGCGCACAC--TACATAA---T------TACA---TTAGTCGATTCTT--TATGACATATTTCACC--CTTGCAGCA-TTAGACGTCAGAAACA----TGCAAG-AATACTACCTT-ATCAAAACCTA--TTCATTCTATG-TTTCCATCAAATTACTCA----CAAGG--TCTGATTTCTATAGGGAACCTATACCTTAAAAATA-ATATTTTGAGTCCTTTCTGAAAATATTGTTTGTGACAATTG-CGTATG
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gi|14                         :                                                       aactgcttttagtattctgatcaatcatctacaactgcgacaGATTGATGTAAA-------ACTCAATCAGAGG-CA-ATTGTTTTTAAAACAATTTGTTTGCTAATATA----GA---ATTATTTTATTAGGTTAAa
gi|3                          :                                                                                                                                taaacccgcaacggcgccaattatacatcctccTACA----TAGTTATTGCTGTACAAGGGTAAGGTAGCT--AATGAATCGTGGAGAAAAT---------T--AAC-A-AAACAATGTCAGATC-GCAAAC-A-TAACTGTTTGAAAATTTTCGATTGTGTGCACTCATTACATAA---T------ACCA---TTGGCCCATTTGT--TATGACGTATTTCACC--AATGCTACATTTTGATGT-AAAA--AAACACACAATAAATTCTGCCAT-GTCAAAACCTA--T---TTCTTTG-TTTCCATTCAATTATCGA----CATTGTATCCGACTTCCGTGCGGAACCTATAGCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCGTTATTCAATTATTGTATATGACAATCG-CCTGTTTA----GTCTT-----TTTTTTTCAACCGCCAG--TTGCGTGCACTGATATTTTC
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTG-TTTCTATTCAATTATTGA----CATAGTATccactcttaaacatttgtacacaattatattgacactgttgctgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaataagtaacagtaccgaactgagctcgtTCAGTAATTGA----CATGATGTCTGACT-CTGTACGGAACCTGAACCTAATAGATA-ATAAAATAA---CATTCTTCAATTATTGTCAATGACAATTG-CCTGTGCATAATGTAGTAAATTATTATTTCAACTATCAG--GTGGGTGCACGGATATTTCCAGAatcagatctattcgataacgatctgaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cAATAATTGA----TTTGGTATA-GATTATCATACGGAACATATACCTAATAAATA-ATACC---AGTCCATTCTAAAAGTATT-TAT-TGACAAGTG-CCTTTGCAT-ATGTTTTAAAATTGTATTTCAGCTGTCAGGTGAGTGTGCACGTGTATTaatgtgaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tataagtatttcaaacttgctaaattttgatgtcaaaatagcacaagaactactTAATAAATA-ATATTACAAGTCCATTCTTCAATTATTGT-TGTGAAAATTG-CCTGTGCAT-A--TAGTAAGTTTTTAATTCAACCGCCAG--GTGCGTGCATGGATATTTTCaaatacgaagctat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cACAAATACATATT-TAA-----TTCTTAAAATATTGTTTATTACAGTTG-CCCATGTAT-AATTTTCAAATATGTATTTCAACCAACAG--GTGCGTGCACAGATAa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATCTATGCTTCAATTATTGTATGTGACAATCA-CTTGTGAAT-ATGTAGTAAGTTTTTATTTCAACCTCCAG--TTGCATGAAATGATATTTTCGGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tataattataaaaaCAACTGGCAGGTGTGT-GCGCAATAT---TTTATTTCAACTGGCAG--GTGTGTGCACAGATATTTTTGGAa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|22 ): TTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAA






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consensus                     :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTANCCAA-TGAATCNCGGAGACA-ATGTC-AACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCCTT------GCT--ACATTTCGATGTCAGAATAAAC-CGCAAGAAATACTACCATGTCAAAACCTA-T--TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGACTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATCGCCTGTGCATA-TGTAGTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
Reference ( family-156 )      :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACNAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTAGCCAA-TGAATCNCGGAGANA-ATGTC-AACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGCGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACNCTT------GCT--ACATTTCGATGTNAAAATAAAC-CGCAAGAANTACTACCATGTCAAAACCTA-T--TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGATTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATTGCCTGTGCATA-TGTANTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
gi|1                          :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTATAAATGCATAATTTATGACTGATGTAAACA-CGT-AC-ACTCAGGTAATGGTCATACTTTTTTTAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATAAGGGTAA-GGCAGCCAA-TGAATCAAGGAGAAA-ATGTC-AACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTAACA-TAACAGTTTGAAAGTTTTCATTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTAATCCTTTCAT--T--AT-----GATG----TATTT-CACACTT------GCT--ACATTTTGATATAAAAATAAAC-CGCAAGAAACACTATCATGTCAAAACCTAGT--TCATTCTTTATTTCAATTCAATCACTGA----CATGGTATCTGACTTCTGCATGGAACCTATAAATAATAAATA-ATATTGTAAGTCTATTCTTCAAT-TATTGTGTGTGACAATTGCATGTGCATA-TGTAGTAAAAATTTACTTCAACCACCAGGA--GCGGGAACAGATATTTTCGGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T--ACATTTCAATGCCAGA-TAAAT--GCAAAAATCACTACATTGTCAAAACTTG-TGTTCGTTCTTTGGTTTCATGCAATAATTAATTGTCATAGCATCTAATTTTTGTACGTAACCTATACCTAATAAAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAGTAATTGA----CATGATGTCTGACT-CTGTACGGAACCTGAACCTAATAGATA-ATAAAATAA---CATTCTTCAAT-TATTGTCAATGACAATTGCCTGTGCATAATGTAGTAAATTATTATTTCAACTATCAGGT--GGGTGCACGGATATTTCCAGAccactcttaaacatttgtacacaattatattgacactgttgctgttt
gi|12                         :                                                      cGATGTCAATTATTGTG--------CATATTTTACGACTTATGC---CATC-T-GT-ATACATGCAATGGTCAAACTTTATT-AAG-AGTGTATTTAGTAAT----ATATA---AATGT----TCAG----A-CGT----AA-TGA-----------------C-AACAACTGAAAG-G-AAACAAAGTAAGATC-ACTGACaatgtgaa
gi|13                         :                                            gtaaagcgccacGTGTAAATAATTGTGTCTA---ACATCT----CGATTGGTGTAA-----------ATTCA--------TTACACTTTTTTAAAG-AATTTACTTACAAAC----ATA
gi|14                         :                               aactgcttttagtattctgatcaatcatctacaactgcgacaCAATTATACATCCTCCGATTGATGTAAA----------ACTCAATCAGAGG-CAATTGTTTTTAAAACAATTTGTTTGCTAAT----ATAGA---ATTATTTTATTAGGTTAA-a
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaacccgcaacggcgcAAATCTATGCTTCAAT-TATTGTATGTGACAATCACTTGTGAATA-TGTAGTAAGTTTTTATTTCAACCTCCAGTT--GCATGAAATGATATTTTCGGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tataattataaaaaCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGT-TGTGAAAATTGCCTGTGCATA-T--AGTAAGTTTTTAATTCAACCGCCAGGT--GCGTGCATGGATATTTTCa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAAATACATATT-TAA-----TTCTTAAAA-TATTGTTTATTACAGTTGCCCATGTATA-ATTTTCAAATATGTATTTCAACCAACAGGT--GCGTGCACAGATAa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                      GTAACAGTACCGAACTGAG-CTCGTATACT-ATGTC-AATAATTG-AATAG-AAACAAAATCAGATCTATTCG-A-TAACGATCTGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaataaTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCGC-AATATTTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGTGTG-CGCAATA---TTTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCACAGATATTTTTGGAatttcaactggcaggtgtgtgcacagatatttttggaaatatgaaactatgt
gi|2                          :                                       ttatttcaactggcagGGTGTCAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACAACTGATATAAACA-C-TTAT-ACACAGACAGTGATTAAATTGCTTAAAAG-AATTTATGTAATAAT----ATATA---ATTGCTTTATTAGGTCAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGACACA-CTGTC-AACAACTG-AATGG-AAACAAAGTCAGTTC-ATTTAAA-CAATGGTTTGAACATTTTTAGTT---GTGCGCA----CAC--TACATAA---T------TAC-----A---TTAGTCGATTCTT--T--AT-----GACA----TATTT-CACCCTT------GCA--GCA-TTAGACGTCAG---AAACATGCAAGAA-TACTACCTTATCAAAACCTA-T--TCATTCTATGTTTCCATCAAATTACTCA----CAAGG--TCTGATTTCTATAGGGAACCTATACCTTAAAAATA-ATATTTTGAGTCCTTTCTGAAAA-TATTGTTTGTGACAAT------TGCGTA-TGTTTTAAATTTTTATaatatgaaactatgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                       accgcaacTATTAGGTTAA-G--ACTTAA-TGCATCTCAGAAACA-ATGCT-AACAACAG-AACAG-AAGCAAAGTCAcaatgtatacattgtcatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                         tTGCTTTATTTGAAAAA-GTTCCCCAA-TGGAACTCGGAGACA-ATATC-AATAACTG-AAT-GAAAACAAActa
gi|3                          :                                                        GTGTAAATAATTGTGTACAAATGCAAAGTTTACAACTGATGCAAACA---T-AT-AC
gi|3                          :                                                                                                                                                           T----ACATAGTTATTGCTGTACAAGGGTAA-GGTAGCTAA-TGAATCGTGGAGAAA-AT----------T--AAC-A-AAACAATGTCAGATC-GCAAACA-TAACTGTTTGAAAATTTTCGATT---GTGTGCA----CTCATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGCCCATTTGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCAAT------GCT--ACATTTTGATGTAAAA--AAACACACAATAAATTCTGCCATGTCAAAACCTA-T-----TTCTTTGTTTCCATTCAATTATCGA----CATTGTATCCGACTTCCGTGCGGAACCTATAGCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCGTTATTCAAT-TATTGTATATGACAATCGCCTGT---T----TAGT--CTTTTTTTTTCAACCGCCAGTT--GCGTGCACTGATATTTTCatagttattgctgtacaagggtaaggtagctaatgaatcgtggagaaaattaacaaaacaatgtcagatcgcaaacataactgtttgaaaattttcgattgtgtgcactcattacataataccattggcccatttgttatgacgtatttcaccaatgctacattttgatgtaaaaaaacacacaataaattctgccatgtcaaaacctatttctttgtttccattcaattatcgacattgtatccgacttccgtgcggaacctatagctaataaataatattacaagtccgttattcaattattgtatatgacaatcgcctgtttagtctttttttttcaaccgccagttgcgtgcactgatattttcaaaaacg
gi|4                          :                                                                                                                        gtgtaaataattgtgtacaaatgcaaagtttacaactgatgcaaacataTCGCCTTATTAAG-TAGTGGTACCCAG-TGAATCTCACAC-CA-ATGTC-AATAACTG-A------------GTT---TC-ACTTACA-TAATGTGTTGAACATTTT---TT---GT---CAAATCCACAATACATTA---T------TCTTCTAAA---TTTATCT-TTCGC--TCAATCCGCAGACAAAATTATTT-CATTCTTCATGTTGCCTCGCATTTCTATATCAGAG-AAAT--GTTACAAATACTACCATGT--------A-T--TTTTTCTTTATTTCCATTCAATTATTTA----C-----------TTCCTG---GGAAATTAAACAAGATAAATT-AGAGTAAACATCCATTC-TCAATACATAATTCGTAACAAAAGCTTGTGaaaaacg
gi|5                          :                                                       GGTGTAACTAATTGTATACAAATACATATGCTACGACTGATGTAAACA-C-T-TTCACTTAGGTAGTGGTCAAACATTATTAAGG-ACGTTATTTTCAAGT----ATTCA---ATTGCTGGATAACTGTAA-GGTAACCAA-TGAATCACGGAGAAA-ATGTC-ATTAACTG-AAC-G-AAACACGGGCAGATC-ACTAACATTAACAGTTCGAAAGTTTTTAGTT---GTGTACA----CACATTACACAA---T------ggtcggtttaaaa
gi|6                          :                                                  gcgatGGTGTAAATAAGAGTGTACAAGTACATAGTTTACGACTGGTGTAAACA-C------ACTCAGGTAATGACCAAATATCTTTAAAT-AATTTATTTACAAGA----ATATA---ATTGCAGTATAATGGTGA-GGTAAGCAA-TGAATCACGGAAATACATTTTAAACAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                         tttaccattccactttgaatcaactgcatttggtgctcttgccaaccatcatcaacagccac-G-AAATTGAATCAGATC-ACTTAGA-TAACCGTCTGAAA-TTTTC--TTAACGTGTGCA----CA-A-TACATAAGCCTTCTGAAACC-----ACCTTTGGTCCAATCATCAT--AT-----GAAT----TATTTACAACCTT------GCT--ACAaactattttattcacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            gagtttactaagtaaaggcacgcaaccaatctcatactcttatgcaaatacttaaatg--T--AT-----AA-G----TATTT-CAAACTT------GCT--AAATTTTGATGTCAAAATAG---CACAAGAACTACTAgtgacccagtttcagaaacgcgtgcgaaacac
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATAATTGA----TTTGGTATA-GATTATCATACGGAACATATACCTAATAAATA-ATACCA---GTCCATTCTAAAAG-TATT-TAT-TGACAAGTGCCTTTGCATA-TGTTTTAAAATTGTATTTCAGCTGTCAGGTGAGTGTGCACGTGTATTataattgatttggtatagattatcatacggaacatatacctaataaataataccagtccattctaaaagtatttattgacaagtgcctttgcatatgttttaaaattgtatttcagctgtcaggtgagtgtgcacgtgtattaaatacgaagctat
gi|9                          : tataagtatttcaaacttgctaaattttgatgtcaaaatagcacaagaactactGGTGTAAATAAATGTGTACACATACATGT----------ACATAA----T-T-AT-ACTCGGGTAATGGTCAAACTTGTTTAAAG-AATTTATTTCCTAGTATAGATATA---GTTACCGTATATGGGTAA-AGTAGTCTA-TGAATTCCGGAGA-A-ATGTC-CACAACTG-AAC-G-AAACAAGGTCAGATA-AACAACA-TATTGATTGGAAAGTTTTCAATA---TTGAACA----CACaaatacgaagctat
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consensus                     :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAG--ACA---ATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCCTT------GCT--ACATT---TCGATGTCAGAATAAAC-CGCAAGAAACACTACCATGTCAAAACCTA-T--TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGACTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATCGCCTGTGCATA-TGTAGTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
Reference ( family-156 )      :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTANCCAA-TGAATCNCGGAG--ACA---ATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCCTT------GCT--ACATT---TCGATGTCAGAATAAAC-CGCAAGAAATACTACCATGTCAAAACCTA-T--TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGACTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATCGCCTGTGCATA-TGTAGTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
gi|1                          :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTATAAATGCATAATTTATGACTGATGTAAACA-CGT-AC-ACTCAGGTAATGGTCATACTTTTTTTAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATAAGGGTAA-GGCAGCCAA-TGAATCAAGGAG--AAA---ATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTAACA-TAACAGTTTGAAAGTTTTCATTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTAATCCTTTCAT--T--AT-----GATG----TATTT-CACACTT------GCT--ACATT---TTGATATAAAAATAAAC-CGCAAGAAACACTATCATGTCAAAACCTAGT--TCATTCTTTATTTCAATTCAATCACTGA----CATGGTATCTGACTTCTGCATGGAACCTATAAATAATAAATA-ATATTGTAAGTCTATTCTTCAAT-TATTGTGTGTGACAATTGCATGTGCATA-TGTAGTAAAAATTTACTTCAACCACCAGGA--GCGGGAACAGATATTTTCGGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--ACATT---TCAATGCCAGA-TAAAT--GCAAAAATCACTACATTGTCAAAACTTG-TGTTCGTTCTTTGGTTTCATGCAATAATTAATTGTCATAGCATCTAATTTTTGTACGTAACCTATACCTAATAAAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGTAATTGA----CATGATGTCTGACT-CTGTACGGAACCTGAACCTAATAGATA-ATAAAATAA---CATTCTTCAAT-TATTGTCAATGACAATTGCCTGTGCATAATGTAGTAAATTATTATTTCAACTATCAGGT--GGGTGCACGGATATTTCCAGAccactcttaaacatttgtacacaattatattgacactgttgctgttt
gi|12                         :                                                      cGATGTCAATTATTGTG--------CATATTTTACGACTTATGC---CATC-T-GT-ATACATGCAATGGTCAAACTTTATT-AAG-AGTGTATTTAGTAAT----ATATA---AATGT----TCAG----A-CGT----AA-TGA---------------------CAACAACTGAAAG-G-AAACAAAGTAAGATC-ACTGACaatgtgaa
gi|13                         :                                            gtaaagcgccacGTGTAAATAATTGTGTCTA---ACATCT----CGATTGGTGTAA-----------ATTCA--------TTACACTTTTTTAAAG-AATTTACTTACAAAC----ATA
gi|14                         :                               aactgcttttagtattctgatcaatcatctacaactgcgacaCAATTATACATCCTCCGATTGATGTAAA----------ACTCAATCAGAGG-CAATTGTTTTTAAAACAATTTGTTTGCTAAT----ATAGA---ATTATTTTATTAGGTTAA-a
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taaacccgcaacggcgcAAATCTATGCTTCAAT-TATTGTATGTGACAATCACTTGTGAATA-TGTAGTAAGTTTTTATTTCAACCTCCAGTT--GCATGAAATGATATTTTCGGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tataattataaaaaCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGT-TGTGAAAATTGCCTGTGCATA-T--AGTAAGTTTTTAATTCAACCGCCAGGT--GCGTGCATGGATATTTTCa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACAAATACATATT-TAA-----TTCTTAAAA-TATTGTTTATTACAGTTGCCCATGTATA-ATTTTCAAATATGTATTTCAACCAACAGGT--GCGTGCACAGATAa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                      GTAACAGTACCGAACTGAG-CTCGTAT--ACT---ATGTCAATAATTG-AATAG-AAACAAAATCAGATCTATTCG-A-TAACGATCTGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaataaTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCGC-AATATTTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTGTG-CGCAATA---TTTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCACAGATATTTTTGGAatttcaactggcaggtgtgtgcacagatatttttggaaatatgaaactatgt
gi|2                          :                                       ttatttcaactggcagGGTGTCAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACAACTGATATAAACA-C-TTAT-ACACAGACAGTGATTAAATTGCTTAAAAG-AATTTATGTAATAAT----ATATA---ATTGCTTTATTAGGTCAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAC--ACA---CTGTCAACAACTG-AATGG-AAACAAAGTCAGTTC-ATTTAAA-CAATGGTTTGAACATTTTTAGTT---GTGCGCA----CAC--TACATAA---T------TAC-----A---TTAGTCGATTCTT--T--AT-----GACA----TATTT-CACCCTT------GCA--GCA-T---TAGACGTCAG---AAACATGCAAG-AATACTACCTTATCAAAACCTA-T--TCATTCTATGTTTCCATCAAATTACTCA----CAAGG--TCTGATTTCTATAGGGAACCTATACCTTAAAAATA-ATATTTTGAGTCCTTTCTGAAAA-TATTGTTTGTGACAAT------TGCGTA-TGTTTTAAATTTTTATaatatgaaactatgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                       accgcaacTATTAGGTTAA-G--ACTTAA-TGCATCTCAGAA--ACA---ATGCTAACAACAG-AACAG-AAGCAAAGTCAcaatgtatacattgtcatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                         tTGCTTTATTTGAAAAA-GTTCCCCAA-TGGAACTCGGAG--ACA---ATATCAATAACTG-AAT-GAAAACAAActa
gi|3                          :                                                        GTGTAAATAATTGTGTACAAATGCAAAGTTTACAACTGATGCAAACA---T-AT-AC
gi|3                          :                                                                                                                                                           T----ACATAGTTATTGCTGTACAAGGGTAA-GGTAGCTAA-TGAATCGTGGAG--AAA---AT---------T--AAC-A-AAACAATGTCAGATC-GCAAACA-TAACTGTTTGAAAATTTTCGATT---GTGTGCA----CTCATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGCCCATTTGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCAAT------GCT--ACATT---TTGATGT-AAAA-AAACACACAATAAATTCTGCCATGTCAAAACCTA-T--T---TCTTTGTTTCCATTCAATTATCGA----CATTGTATCCGACTTCCGTGCGGAACCTATAGCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCGTTATTCAAT-TATTGTATATGACAATCGCCTGT---T----TAGT--CTTTTTTTTTCAACCGCCAGTT--GCGTGCACTGATATTTTCatagttattgctgtacaagggtaaggtagctaatgaatcgtggagaaaattaacaaaacaatgtcagatcgcaaacataactgtttgaaaattttcgattgtgtgcactcattacataataccattggcccatttgttatgacgtatttcaccaatgctacattttgatgtaaaaaaacacacaataaattctgccatgtcaaaacctatttctttgtttccattcaattatcgacattgtatccgacttccgtgcggaacctatagctaataaataatattacaagtccgttattcaattattgtatatgacaatcgcctgtttagtctttttttttcaaccgccagttgcgtgcactgatattttcaaaaacg
gi|4                          :                                                                                                                        gtgtaaataattgtgtacaaatgcaaagtttacaactgatgcaaacataTCGCCTTATTAAG-TAGTGGTACCCAG-TGAATCTCACAC---CA---ATGTCAATAACTG-A------------GTT---TC-ACTTACA-TAATGTGTTGAACATTTT---TT---GT---CAAATCCACAATACATTA---T------TCTTCTAAA---TTTATCT-TTCGC--TCAATCCGCAGACAAAATTATTT-CATTCTTCATGTTGCCTCGCATT---TCTATATCAGAG-AAAT--GTTACAAATACTACCATGT--------A-T--TTTTTCTTTATTTCCATTCAATTATT---------------T-ACTTCC-TG-GGAAATTAAACAAGATAAATT-AGAGTAAACATCCATTC-TCAATACATAATTCGTAACAAAAGCTTGTGaaaaacg
gi|5                          :                                                       GGTGTAACTAATTGTATACAAATACATATGCTACGACTGATGTAAACA-C-T-TTCACTTAGGTAGTGGTCAAACATTATTAAGG-ACGTTATTTTCAAGT----ATTCA---ATTGCTGGATAACTGTAA-GGTAACCAA-TGAATCACGGAG--AAA---ATGTCATTAACTG-AAC-G-AAACACGGGCAGATC-ACTAACATTAACAGTTCGAAAGTTTTTAGTT---GTGTACA----CACATTACACAA---T------ggtcggtttaaaa
gi|6                          :                                                  gcgatGGTGTAAATAAGAGTGTACAAGTACATAGTTTACGACTGGTGTAAACA-C------ACTCAGGTAATGACCAAATATCTTTAAAT-AATTTATTTACAAGA----ATATA---ATTGCAGTATAATGGTGA-GGTAAGCAA-TGAATCACGGAAATACA---TTTTAAACAA
gi|7                          :                                                                                                                          tttaccattccactttgaatcaactgcatttggtgctcttgccaaccatcatcaacagccacAA-GGCACGCAA-CCAATCTC--AT--ACTCTTATGCAAATACTTA-AAT-GGAAATTGAATCAGATC-ACTTAGA-TAACCGTCTGAAA-TTTTC--TTAACGTGTGCA----CA-A-TACATAAGCCTTCTGAAACC-----ACCTTTGGTCCAATCATCAT--AT-----GAAT----TATTTACAACCTT------GCT--ACAGTGACCCAGTTTCAG---AAACGCGTGCGAAACACaactattttattcacaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAATTGA----TTTGGTATA-GATTATCATACGGAACATATACCTAATAAATA-ATACCA---GTCCATTCTAAAAG-TATT-TAT-TGACAAGTGCCTTTGCATA-TGTTTTAAAATTGTATTTCAGCTGTCAGGTGAGTGTGCACGTGTATTataattgatttggtatagattatcatacggaacatatacctaataaataataccagtccattctaaaagtatttattgacaagtgcctttgcatatgttttaaaattgtatttcagctgtcaggtgagtgtgcacgtgtattaaatacgaagctat
gi|9                          : tataagtatttcaaacttgctaaattttgatgtcaaaatagcacaagaactactGGTGTAAATAAATGTGTACACATACATGT----------ACATAA----T-T-AT-ACTCGGGTAATGGTCAAACTTGTTTAAAG-AATTTATTTCCTAGTATAGATATA---GTTACCGTATATGGGTAA-AGTAGTCTA-TGAATTCCGGAG--A-A---ATGTCCACAACTG-AAC-G-AAACAAGGTCAGATA-AACAACA-TATTGATTGGAAAGTTTTCAATA---TTGAACA----CACaaatacgaagctat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-156 )      :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAG--ACA---ATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCCTT------GCT--ACATT---TCGATGTCAGAATAAAC-CGCAAGAAACACTACCATGTCAAAACCTA-T--TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGACTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATCGCCTGTGCATA-TGTAGTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
gi|1                          :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTATAAATGCATAATTTATGACTGATGTAAACA-CGT-AC-ACTCAGGTAATGGTCATACTTTTTTTAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATAAGGGTAA-GGCAGCCAA-TGAATCAAGGAG--AAA---ATGTCAACAACTG-AAC-G-AAACAAAGTCAGATC-ACTAACA-TAACAGTTTGAAAGTTTTCATTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTAATCCTTTCAT--T--AT-----GATG----TATTT-CACACTT------GCT--ACATT---TTGATATAAAAATAAAC-CGCAAGAAACACTATCATGTCAAAACCTAGT--TCATTCTTTATTTCAATTCAATCACTGA----CATGGTATCTGACTTCTGCATGGAACCTATAAATAATAAATA-ATATTGTAAGTCTATTCTTCAAT-TATTGTGTGTGACAATTGCATGTGCATA-TGTAGTAAAAATTTACTTCAACCACCAGGA--GCGGGAACAGATATTTTCGGA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGTAATTGA----CATGATGTCTGACT-CTGTACGGAACCTGAACCTAATAGATA-ATAAAATAA---CATTCTTCAAT-TATTGTCAATGACAATTGCCTGTGCATAATGTAGTAAATTATTATTTCAACTATCAGGT--GGGTGCACGGATATTTCCAGAccactcttaaacatttgtacacaattatattgacactgttgctgttt
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gi|14                         :                               aactgcttttagtattctgatcaatcatctacaactgcgacaCAATTATACATCCTCCGATTGATGTAAA----------ACTCAATCAGAGG-CAATTGTTTTTAAAACAATTTGTTTGCTAAT----ATAGA---ATTATTTTATTAGGTTAA-a
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taaacccgcaacggcgcAAATCTATGCTTCAAT-TATTGTATGTGACAATCACTTGTGAATA-TGTAGTAAGTTTTTATTTCAACCTCCAGTT--GCATGAAATGATATTTTCGGA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACAAATACATATT-TAA-----TTCTTAAAA-TATTGTTTATTACAGTTGCCCATGTATA-ATTTTCAAATATGTATTTCAACCAACAGGT--GCGTGCACAGATAa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                      GTAACAGTACCGAACTGAG-CTCGTAT--ACT---ATGTCAATAATTG-AATAG-AAACAAAATCAGATCTATTCG-A-TAACGATCTGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaataaTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCGC-AATATTTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTGTG-CGCAATA---TTTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCACAGATATTTTTGGAatttcaactggcaggtgtgtgcacagatatttttggaaatatgaaactatgt
gi|2                          :                                       ttatttcaactggcagGGTGTCAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACAACTGATATAAACA-C-TTAT-ACACAGACAGTGATTAAATTGCTTAAAAG-AATTTATGTAATAAT----ATATA---ATTGCTTTATTAGGTCAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAC--ACA---CTGTCAACAACTG-AATGG-AAACAAAGTCAGTTC-ATTTAAA-CAATGGTTTGAACATTTTTAGTT---GTGCGCA----CAC--TACATAA---T------TAC-----A---TTAGTCGATTCTT--T--AT-----GACA----TATTT-CACCCTT------GCA--GCA-T---TAGACGTCAG---AAACATGCAAG-AATACTACCTTATCAAAACCTA-T--TCATTCTATGTTTCCATCAAATTACTCA----CAAGG--TCTGATTTCTATAGGGAACCTATACCTTAAAAATA-ATATTTTGAGTCCTTTCTGAAAA-TATTGTTTGTGACAAT------TGCGTA-TGTTTTAAATTTTTATaatatgaaactatgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                       accgcaacTATTAGGTTAA-G--ACTTAA-TGCATCTCAGAA--ACA---ATGCTAACAACAG-AACAG-AAGCAAAGTCAcaatgtatacattgtcatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                         tTGCTTTATTTGAAAAA-GTTCCCCAA-TGGAACTCGGAG--ACA---ATATCAATAACTG-AAT-GAAAACAAActa
gi|3                          :                                                        GTGTAAATAATTGTGTACAAATGCAAAGTTTACAACTGATGCAAACA---T-AT-AC
gi|3                          :                                                                                                                                                           T----ACATAGTTATTGCTGTACAAGGGTAA-GGTAGCTAA-TGAATCGTGGAG--AAA---AT---------T--AAC-A-AAACAATGTCAGATC-GCAAACA-TAACTGTTTGAAAATTTTCGATT---GTGTGCA----CTCATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGCCCATTTGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCAAT------GCT--ACATT---TTGATGT-AAAA-AAACACACAATAAATTCTGCCATGTCAAAACCTA-T--T---TCTTTGTTTCCATTCAATTATCGA----CATTGTATCCGACTTCCGTGCGGAACCTATAGCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCGTTATTCAAT-TATTGTATATGACAATCGCCTGT---T----TAGT--CTTTTTTTTTCAACCGCCAGTT--GCGTGCACTGATATTTTCatagttattgctgtacaagggtaaggtagctaatgaatcgtggagaaaattaacaaaacaatgtcagatcgcaaacataactgtttgaaaattttcgattgtgtgcactcattacataataccattggcccatttgttatgacgtatttcaccaatgctacattttgatgtaaaaaaacacacaataaattctgccatgtcaaaacctatttctttgtttccattcaattatcgacattgtatccgacttccgtgcggaacctatagctaataaataatattacaagtccgttattcaattattgtatatgacaatcgcctgtttagtctttttttttcaaccgccagttgcgtgcactgatattttcaaaaacg
gi|4                          :                                                                                                                        gtgtaaataattgtgtacaaatgcaaagtttacaactgatgcaaacataTCGCCTTATTAAG-TAGTGGTACCCAG-TGAATCTCACAC---CA---ATGTCAATAACTG-A------------GTT---TC-ACTTACA-TAATGTGTTGAACATTTT---TT---GT---CAAATCCACAATACATTA---T------TCTTCTAAA---TTTATCT-TTCGC--TCAATCCGCAGACAAAATTATTT-CATTCTTCATGTTGCCTCGCATT---TCTATATCAGAG-AAAT--GTTACAAATACTACCATGT--------A-T--TTTTTCTTTATTTCCATTCAATTATT---------------T-ACTTCC-TG-GGAAATTAAACAAGATAAATT-AGAGTAAACATCCATTC-TCAATACATAATTCGTAACAAAAGCTTGTGaaaaacg
gi|5                          :                                                       GGTGTAACTAATTGTATACAAATACATATGCTACGACTGATGTAAACA-C-T-TTCACTTAGGTAGTGGTCAAACATTATTAAGG-ACGTTATTTTCAAGT----ATTCA---ATTGCTGGATAACTGTAA-GGTAACCAA-TGAATCACGGAG--AAA---ATGTCATTAACTG-AAC-G-AAACACGGGCAGATC-ACTAACATTAACAGTTCGAAAGTTTTTAGTT---GTGTACA----CACATTACACAA---T------ggtcggtttaaaa
gi|6                          :                                                  gcgatGGTGTAAATAAGAGTGTACAAGTACATAGTTTACGACTGGTGTAAACA-C------ACTCAGGTAATGACCAAATATCTTTAAAT-AATTTATTTACAAGA----ATATA---ATTGCAGTATAATGGTGA-GGTAAGCAA-TGAATCACGGAAATACA---TTTTAAACAA
gi|7                          :                                                                                                                          tttaccattccactttgaatcaactgcatttggtgctcttgccaaccatcatcaacagccacAA-GGCACGCAA-CCAATCTC--AT--ACTCTTATGCAAATACTTA-AAT-GGAAATTGAATCAGATC-ACTTAGA-TAACCGTCTGAAA-TTTTC--TTAACGTGTGCA----CA-A-TACATAAGCCTTCTGAAACC-----ACCTTTGGTCCAATCATCAT--AT-----GAAT----TATTTACAACCTT------GCT--ACAGTGACCCAGTTTCAG---AAACGCGTGCGAAACACaactattttattcacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gagtttactaagta--T--AT-----AA-G----TATTT-CAAACTT------GCT--AAATT---TTGATGTCAAAATAG---CACAAGAACTACTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAATTGA----TTTGGTATA-GATTATCATACGGAACATATACCTAATAAATA-ATACCA---GTCCATTCTAAAAG-TATT-TAT-TGACAAGTGCCTTTGCATA-TGTTTTAAAATTGTATTTCAGCTGTCAGGTGAGTGTGCACGTGTATTataattgatttggtatagattatcatacggaacatatacctaataaataataccagtccattctaaaagtatttattgacaagtgcctttgcatatgttttaaaattgtatttcagctgtcaggtgagtgtgcacgtgtattaaatacgaagctat
gi|9                          : tataagtatttcaaacttgctaaattttgatgtcaaaatagcacaagaactactGGTGTAAATAAATGTGTACACATACATGT----------ACATAA----T-T-AT-ACTCGGGTAATGGTCAAACTTGTTTAAAG-AATTTATTTCCTAGTATAGATATA---GTTACCGTATATGGGTAA-AGTAGTCTA-TGAATTCCGGAG--A-A---ATGTCCACAACTG-AAC-G-AAACAAGGTCAGATA-AACAACA-TATTGATTGGAAAGTTTTCAATA---TTGAACA----CACaaatacgaagctat


blockSeqs                     :                                                                           AT       T               ACACTTAT        T C A                   C               ATAG     GTT     TT   C   T   C         C      T    TACTCTT               A  TAG                T   G C T             A    TAG  AAC       AATC    T       GCCTTCTGAAACCACCT       A    A   T TCA    CCGCAGACAAAAT     A  CC   CATGTT   TC   T GAC          AAAAACAC                T            . GTTCG                   A   A TTGT     C        T  G  C                     C     AT  A             A      C         T           A G                      T     GA        G
blockSeqs                     :                                                                           AA       C               ACACTTTC        A C G                   .               .        .       TT   T   G   T         .      T    AATACA                .  TGG                .   C A .             A    CGA  .         .       A       TTCTTCTAAA              G    A   G CAT    GACA              .  CC   .        .    T .            ATAAAT                  T            . TCA                     A   G .        T        T  G  C                     .     AC  G             .      A         C           . G                      C     .         T
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blockSeqs                     :                                                                           AA       T               ACATAT          G T G                   .               .        .       TG   T   T   .         .      T    CACA                  .  TGA                .   A C .             G    CAA  .         .       .       TACCA                   G    .   A T      GAAT              .  AC   .        .    G .            AGAAAT                  A            . T                       T   G .        T        T  G  C                     .     AC  G             .      T         T           . G                      A     .         A
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Reference ( family-156 )      :                                                       GGTGTAAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACGACTGATGTAAACA-C-T-AT-ACTCAGGCAGTGGTCAAACTTTTTTAAAG-AATTTATTTACTAGT----ATATA---ATTGCTGTATNAGGGTAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAG--ACA---ATGTCAACAACTGAACGGAAACAAAGTCAGATC-ACTNACA-TAACGGTTTGAAAGTTTTCAGTT---GTGTGCA----CACATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGTCCATTCGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCCTT------GCT--ACATT---TCGATGTCAGAA-AA-AT-GCAAGAAACACTACCATGTCAAAACC--TA-TTCGTTCTTTGTTTCCATTCAATNATTGA----CATGGTATCTGACTTCCGTACGGAACCTATACCTAATAAATA-ATATTATAAGTCCATTCTTCAAT-TATTGTNTGTGACAATCGCCTGTGCATA-TGTAGTAAATTTTTATTTCAACCGCCAGGT--GCGTGCACGGATATTTTCGGA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAAATACATATT-TAA-----TTCTTAAAA-TATTGTTTATTACAGTTGCCCATGTATA-ATTTTCAAATATGTATTTCAACCAACAGGT--GCGTGCACAGATAa
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTGTGTG-CGCAATA---TTTTATTTCAACTGGCAGGT--GTGTGCACAGATATTTTTGGAatttcaactggcaggtgtgtgcacagatatttttggaaatatgaaactatgt
gi|2                          :                                       ttatttcaactggcagGGTGTCAATAATTGTGTACAAATACATATTTTACAACTGATATAAACA-C-TTAT-ACACAGACAGTGATTAAATTGCTTAAAAG-AATTTATGTAATAAT----ATATA---ATTGCTTTATTAGGTCAA-GGTACCCAA-TGAATCTCGGAC--ACA---CTGTCAACAACTGAATGGAAACAAAGTCAGTTC-ATTTAAA-CAATGGTTTGAACATTTTTAGTT---GTGCGCA----CAC--TACATAA---T------TAC-----A---TTAGTCGATTCTT--T--AT-----GACA----TATTT-CACCCTT------GCA--GCA-T---TAGACGTCAGAA-AC-AT-GCAAG-AATACTACCTTATCAAAACC--TA-TTCATTCTATGTTTCCATCAAATTACTCA----CAAGG--TCTGATTTCTATAGGGAACCTATACCTTAAAAATA-ATATTTTGAGTCCTTTCTGAAAA-TATTGTTTGTGACAAT------TGCGTA-TGTTTTAAATTTTTATaatatgaaactatgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                       accgcaacTATTAGGTTAA-G--ACTTAA-TGCATCTCAGAA--ACA---ATGCTAACAACAGAACAGAAGCAAAGTCAcaatgtatacattgtcatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                         tTGCTTTATTTGAAAAA-GTTCCCCAA-TGGAACTCGGAG--ACA---ATATCAATAACTGAATGAAAACAAActa
gi|3                          :                                                        GTGTAAATAATTGTGTACAAATGCAAAGTTTACAACTGATGCAAACA---T-AT-AC
gi|3                          :                                                                                                                                                           T----ACATAGTTATTGCTGTACAAGGGTAA-GGTAGCTAA-TGAATCGTGGAG--AAA---AT--TAACAA---------AACAATGTCAGATC-GCAAACA-TAACTGTTTGAAAATTTTCGATT---GTGTGCA----CTCATTACATAA---T------ACC-----A---TTGGCCCATTTGT--T--AT-----GACG----TATTT-CACCAAT------GCT--ACATT---TTGATGTAAAAA-AACAC-ACAATAAATTCTGCCATGTCAAAACC--TA-T---TTCTTTGTTTCCATTCAATTATCGA----CATTGTATCCGACTTCCGTGCGGAACCTATAGCTAATAAATA-ATATTACAAGTCCGTTATTCAAT-TATTGTATATGACAATCGCCTGT---T----TAGT--CTTTTTTTTTCAACCGCCAGTT--GCGTGCACTGATATTTTCatagttattgctgtacaagggtaaggtagctaatgaatcgtggagaaaattaacaaaacaatgtcagatcgcaaacataactgtttgaaaattttcgattgtgtgcactcattacataataccattggcccatttgttatgacgtatttcaccaatgctacattttgatgtaaaaaaacacacaataaattctgccatgtcaaaacctatttctttgtttccattcaattatcgacattgtatccgacttccgtgcggaacctatagctaataaataatattacaagtccgttattcaattattgtatatgacaatcgcctgtttagtctttttttttcaaccgccagttgcgtgcactgatattttcaaaaacg
gi|4                          :                                                                                                                        gtgtaaataattgtgtacaaatgcaaagtttacaactgatgcaaacataTCGCCTTATTAAG-TAGTGGTACCCAG-TGAATCTCACAC---CA---ATGTCAATAACTGA-----------GTT---TC-ACTTACA-TAATGTGTTGAACATTTT---TT---GT---CAAATCCACAATACATTA---T------TCTTCTAAA---TTTATCT-TTCGC--TCAATCCGCAGACAAAATTATTT-CATTCTTCATGTTGCCTCGCATT---TCTATATCAGAG-AA-AT-GTTACAAATACTACCATGT----------A-TTTTTTCTTTATTTCCATTCAATTATT---------------T-ACTTCC-TG-GGAAATTAAACAAGATAAATT-AGAGTAAACATCCATTC-TCAATACATAATTCGTAACAAAAGCTTGTGaaaaacg
gi|5                          :                                                       GGTGTAACTAATTGTATACAAATACATATGCTACGACTGATGTAAACA-C-T-TTCACTTAGGTAGTGGTCAAACATTATTAAGG-ACGTTATTTTCAAGT----ATTCA---ATTGCTGGATAACTGTAA-GGTAACCAA-TGAATCACGGAG--AAA---ATGTCATTAACTGAAC-GAAACACGGGCAGATC-ACTAACATTAACAGTTCGAAAGTTTTTAGTT---GTGTACA----CACATTACACAA---T------ggtcggtttaaaa
gi|6                          :                                                  gcgatGGTGTAAATAAGAGTGTACAAGTACATAGTTTACGACTGGTGTAAACA-C------ACTCAGGTAATGACCAAATATCTTTAAAT-AATTTATTTACAAGA----ATATA---ATTGCAGTATAATGGTGA-GGTAAGCAA-TGAATCACGGAAATACA---TTTTAAACAA
gi|7                          :                                                                                                                          tttaccattccactttgaatcaactgcatttggtgctcttgccaaccatcatcaacagccacAA-GGCACGCAA-CCAATCTC--AT--ACTCTTATGCAAATACTTAAATGGAAATTGAATCAGATC-ACTTAGA-TAACCGTCTGAAA-TTTTC--TTAACGTGTGCA----CA-A-TACATAAGCCTTCTGAAACC-----ACCTTTGGTCCAATCATCAT--AT-----GAAT----TATTTACAACCTT------GCT--ACAGTGACCCAGTTTCAGAA-AC-GC-GTGCGAAACACaactattttattcacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gagtttactaagta--T--AT-----AA-G----TATTT-CAAACTT------GCT--AAATT---TTGATGTCAAAA-TA-GC-ACAAGAACTACTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATAATTGA----TTTGGTATA-GATTATCATACGGAACATATACCTAATAAATA-ATACCA---GTCCATTCTAAAAG-TATT-TAT-TGACAAGTGCCTTTGCATA-TGTTTTAAAATTGTATTTCAGCTGTCAGGTGAGTGTGCACGTGTATTataattgatttggtatagattatcatacggaacatatacctaataaataataccagtccattctaaaagtatttattgacaagtgcctttgcatatgttttaaaattgtatttcagctgtcaggtgagtgtgcacgtgtattaaatacgaagctat
gi|9                          : tataagtatttcaaacttgctaaattttgatgtcaaaatagcacaagaactactGGTGTAAATAAATGTGTACACATACATGT----------ACATAA----T-T-AT-ACTCGGGTAATGGTCAAACTTGTTTAAAG-AATTTATTTCCTAGTATAGATATA---GTTACCGTATATGGGTAA-AGTAGTCTA-TGAATTCCGGAG--A-A---ATGTCCACAACTGAAC-GAAACAAGGTCAGATA-AACAACA-TATTGATTGGAAAGTTTTCAATA---TTGAACA----CACaaatacgaagctat
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Unaligned ( gi|22 ): TTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAA