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lowQualScore                  :         0   22           1 22 77777  9 9  00  1111 9   33     1    888888  1 444     88  22 888888   1 5555555 1 1 5555  2      55    33333 00000  0000000000000000000000000000  4  9999999999   77777777777  66666 7        
consensus                     :      ATA-ATA--TATTTACGGTG-TN-A-----CC-G-TT-GGA----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-T-C----AT-AATTTAN-TTAA-----G-----TA---------CG-----GT---A------AANTA---G------AAA------T----AT-T--TA-TTACCTAA
Reference ( gi|5 )            :      ATA-ATA--TATTTACGGTG-TT-A-----CC-G-TT-AGA----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TG------A-T-C----AT-AATTTAT-TTAA-----G-----TA---------TA-----GT---A------AAATA---G------AAA------T----AT-T--TA-TTACCTAA
gi|11                         :      ATAGATA--TATTTACGGTGTTT-A-----CCTGCTT-AGAGTCTC-TGATGGCGAA-GCAT------TC-ACATATGGTC-TT--C------GCATTG------A--------AT-AATTTAT-
gi|16                         : caccgATA-ATA--TATTTACGGTG-TT-A-----CC-G-TT-AGA----C-
gi|1                          :  accgATA-ATACGTAGTGACGGCG-TT-G--------G-T----A----CGCGA--GCGAAAGCACAGAAGAGACA---ATGGGT-TT--T------GCA-TA------ACT-C----A--AATTTATCTTAA-----G-----TACGGTAACGTTA-----GA---A------AAATA----------AAA------TA---AT-TTATA-TTACCTAA
gi|12                         :        t-ATA--TATTTTCGGTG-TTTA-----CC-G-TTTAGA----C-CGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC--T--T------GCA-TA------A-T-C----AG-CA--TAT-TTAA-----aaacgttgtgtttt
gi|13                         :         -ATA--TATTTACGGTG-TT-A-----CC-G-TT-AAC----C-CGG--GCTAA-GAAT------GA-A---AAGGTT-TT--T------GAA-TT------T-T-C----AT-AATTTAT-TGAA-----t
gi|4                          :           TA--CATGTATGGTG-TT-CTGTTCCT-G-TT-GGA----C-TGA--ACAAA-GCAT------GA-A---ATGGTT-TT--T------GCA-TA------A-T-CATATAT-AATTCAG-TTAA-----G-----TACGG------TATT---GT---A------AATTA---G------AAA------T----A
gi|10                         :                ATATACGGTG-TG-A-----CC-G-TT-GGA----C--GA--GCGAA-GCAA------GA-A----TGGT--TT--T------GCA-TA------A-C-C----ATTAATTTAT-TTA------G-----TA---------CG-----GT---A------AGTTA---G------AAA------TAGAAATAT--TA-TTACCgaaatgtcca
gi|6                          :                ATTTACGGTG-TG-A-----CC-G-AT-TTA----C-TGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATTGTC-AT--T------GCA-TA------A-T-A----AT-AATTAGG-TTAA-----G-----TA---------TG-----GG---A------AATTA---GAGTTACAAA------T----GT-C--TA-TT
gi|8                          :                   TACGGTG-TG-A-----CT-G-TT-GGA----C-CGA--GCGAA-GGAT------GA-A---ATGGTA-TT--T------GCA-TT------A-T-C----AT-AAATTAG-TTAA-----G-----TAC--------CG-----GT---AAGCTAGAAATA---A------AAA------T----AT-T--TATTTACCTtacttga
gi|9                          :                 taTACGGAG-TT-A-----CC-G-TT-GGA----C-AGA--GTGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-T-C----AT-AATTTAG-TTAA-----G-----TA---------CG-----GT---A------AGTTACCTG------AAAACATATT----AT-T--TA-
gi|3                          :                 taTACGGTG-TG-A-----C--G-TT-GGA----C-CGAC-GCGA--GCAA------GA-A---ATG--T-TT--T------GCA-TA------A-TTC----GTTCATTTAT-TTAA-----GG----TA---------CACGGAAGTTAGA------AAATA---G------AA-------T----AT-T---A-TTACCTAAg
gi|14                         :               actaTACGGTG-TG-A-----CT-G-CT-GGA----A-CGA--GCAAA-GCAT------G--T---ATTGTC-AT--T------GGA-TG------G-T-C----AT-AATTCAA-TAAA-----G-----aaatgtgttttt
gi|2                          :                        TG-TG-A-----CC-A-TT-GGA----C-CAA--GCAAA-GCAT------GG-A---ATGCTCATTGCT------GCA-GA------A-T-C----AT-AATTCAA-TTAA-----GAAAGCTA---------CAT----GT---A------CATTA---G------AAA------T----c
gi|7                          :                                    aC-G-TT-GGA----C-CAA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATTGTCATT--TATAGGAGCG-TGTCTCGTG-T-C----AT-AATTCAA-TTAATAACGG-----TA----------A-----GTTA-G------AAATA---G------AAA------T----AT-C--AA-TTcgaaatgtccatttgctttagaatatatatcataataatgtatgaaa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATAATTATAATTTAGTGAAATAGTATTTACAGGAAAACGTATTTTATTAATGAAATT






Alignments
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lowQualScore                  :      .              . .. ..... .. . .  .  . .... .   ..     .    ......  . ...      .  .. ......   .  ........  .... . . .     ..     .....  .  .....    ...  ... .................................  .        
lowQualScore                  :      0              9 99 11111 77 7 7  7  7 7777 7   88     9    222222  9 000      7  99 222222   9  99999999  1111 7 9 9     99     55555  0  00000    000  000 777777777777777777777777777777777  7        
consensus                     :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-NTTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAA
Reference ( family-236 )      :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-NTTAAG-----TA-CG-----GTAA-ANTA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAA
gi|1                          :              TACGTAG-TG-A-----CGGC-G-TT-GGTA----CGCGA--GCGAAAGCACAGAAGAGACA---ATGGGT-TT--T------GCA-TA------ACTC----A---A-ATTTATCTTAAG-----TA-CG-----GTAACGTTA---GAA----AAA------TAAAATAAT------TTATA-TTACCTAA
gi|10                         :      tataaATATACGGTG-TG-A-----C--C-G-TT-GG-A----C--GA--GCGAA-GCAA------GA-A----TGGT--TT--T------GCA-TA------A-CC----A-TTA-ATTTA-TTTA-G-----TA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------TAGAA--ATA-----T--TA-TTACCaaacgttgtgtttt
gi|11                         :   ATAGATATATTTACGGTGTTT-A-----C--CTGCTT-AG-AGTCTC-TGATGGCGAA-GCAT------TC-ACATATGGTC-TT--C------GCATTG------A-------A-T-A-ATTTA-
gi|12                         : caccg-ATATATTTTCGGTG-TTTA-----C--C-G-TTTAG-A----C-CGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC--T--T------GCA-TA------A-TC----AGC-ATATTTA-ATt
gi|13                         :      -ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AA-C----C-CGG--GCTAA-GAAT------GA-A---AAGGTT-TT--T------GAA-TT------T-TC----A-T-A-ATTTA-TTGAA
gi|14                         :              TACGGTG-TG-A-----C--T-G-CT-GG-A----A-CGA--GCAAA-GCAT------G--T---ATTGTC-AT--T------GGA-TG------G-TC----A-T-A-ATTCA-ATAAAG-----
gi|16                         :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-c
gi|2                          :               accgTG-TG-A-----C--C-A-TT-GG-A----C-CAA--GCAAA-GCAT------GG-A---ATGCTCATTGCT------GCA-GA------A-TC----A-T-A-ATTCA-ATTAAGAAAGCTA-CAT----GTAC-ATTA---G------AAA------T------
gi|3                          :             aTACGGTG-TG-A-----C----G-TT-GG-A----C-CGAC-GCG-A-GCAA------GA-A---ATG--T-TT--T------GCA-TA------ATTC----GTT-C-ATTTA-TTTAAGGTA--CA-CG-----G-AA-GTTA---G------AAA-------------ATAGAATAT--TA-TTACCTAAcgaaatgtccatttgctttagaatatatatcataataatgtatgaaa
gi|4                          :    actaTACATGTATGGTG-TT-CTGTTCC--T-G-TT-GG-A----C-TGA--ACAAA-GCAT------GA-A---ATGGTT-TT--T------GCA-TA------A-TCATATA-T-A-ATTCA-GTTAAG-----TA-CGGTATTGTAA-ATTA---G------AAA------T------Aaaatgtgttttt
gi|5                          :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TG------A-TC----A-T-A-ATTTA-TTTAAG-----TA-TA-----GTAA-AATA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAAgaaatgtcca
gi|6                          :           ATTTACGGTG-TG-A-----C--C-G-AT-TT-A----C-TGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATTGTC-AT--T------GCA-TA------A-TA----A-T-A-ATTAG-GTTAAG-----TA-TG-----GGAA-ATTA---GAGTTACAAA------T------GT------C--TA-TT
gi|7                          :                                --C-G-TT-GG-A----C-CAA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATTGTCATT--TATAGGAGCG-TGTCTCGTG-TC----A-T-A-ATTCA-ATTAAT-----AA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------T------Atacttga
gi|8                          :             tTACGGTG-TG-A-----C--T-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GGAT------GA-A---ATGGTA-TT--T------GCA-TT------A-TC----A-T-A-AATTA-GTTAAG-----TACCG-----GTAA-GCTA---GAAATAAAAA------T------AT------T--TATTTACCTgaaatatcaattcacatg
gi|9                          :            taTACGGAG-TT-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-AGA--GTGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-GTTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTACCTG------AAAACATATT------AT------T--TA-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATAATTATAATTTAGTGAAATAGTATTTACAGGAAAACGTATTTTATTAATGAAATT






Alignments
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lowQualScore                  :      .              . .. ..... .. . .  .  . .... .   ..     .    ......  . ...      .  .. ......   .  ........  .... . . .     ..     .....  .  .....    .    ... .................................  .        
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Reference ( family-236 )      :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-NTTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAA
gi|1                          :              TACGTAG-TG-A-----CGGC-G-TT-GGTA----CGCGA--GCGAAAGCACAGAAGAGACA---ATGGGT-TT--T------GCA-TA------ACTC----A---A-ATTTATCTTAAG-----TA-CG-----GTAACGTTA---GAA----AAA------TAAAATAAT------TTATA-TTACCTAA
gi|10                         :      tataaATATACGGTG-TG-A-----C--C-G-TT-GG-A----C--GA--GCGAA-GCAA------GA-A----TGGT--TT--T------GCA-TA------A-CC----A-TTA-ATTTA-TTTA-G-----TA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------TAGAA--ATA-----T--TA-TTACCaaacgttgtgtttt
gi|11                         :   ATAGATATATTTACGGTGTTT-A-----C--CTGCTT-AG-AGTCTC-TGATGGCGAA-GCAT------TC-ACATATGGTC-TT--C------GCATTG------A-------A-T-A-ATTTA-
gi|12                         : caccg-ATATATTTTCGGTG-TTTA-----C--C-G-TTTAG-A----C-CGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC--T--T------GCA-TA------A-TC----AGC-ATATTTA-ATt
gi|13                         :      -ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AA-C----C-CGG--GCTAA-GAAT------GA-A---AAGGTT-TT--T------GAA-TT------T-TC----A-T-A-ATTTA-TTGAA
gi|14                         :              TACGGTG-TG-A-----C--T-G-CT-GG-A----A-CGA--GCAAA-GCAT------G--T---ATTGTC-AT--T------GGA-TG------G-TC----A-T-A-ATTCA-ATAAAG-----
gi|16                         :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-c
gi|2                          :               accgTG-TG-A-----C--C-A-TT-GG-A----C-CAA--GCAAA-GCAT------GG-A---ATGCTCATTGCT------GCA-GA------A-TC----A-T-A-ATTCA-ATTAAGAAAGCTA-CAT----GTAC-ATTA---G------AAA------T------
gi|3                          :             aTACGGTG-TG-A-----C----G-TT-GG-A----C-CGAC-GCG-A-GCAA------GA-A---ATG--T-TT--T------GCA-TA------ATTC----GTT-C-ATTTA-TTTAAGGTA--CA-CG-----G-AA-GTTA---G------AAA-------------ATAGAATAT--TA-TTACCTAAcgaaatgtccatttgctttagaatatatatcataataatgtatgaaa
gi|4                          :    actaTACATGTATGGTG-TT-CTGTTCC--T-G-TT-GG-A----C-TGA--ACAAA-GCAT------GA-A---ATGGTT-TT--T------GCA-TA------A-TCATATA-T-A-ATTCA-GTTAAG-----TA-CGGTATTGTAA-ATTA---G------AAA------T------Aaaatgtgttttt
gi|5                          :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TG------A-TC----A-T-A-ATTTA-TTTAAG-----TA-TA-----GTAA-AATA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAAgaaatgtcca
gi|6                          :           ATTTACGGTG-TG-A-----C--C-G-AT-TT-A----C-TGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATTGTC-AT--T------GCA-TA------A-TA----A-T-A-ATTAG-GTTAAG-----TA-TG-----GGAA-ATTA---GAGTTACAAA------T------GT------C--TA-TT
gi|7                          :                                --C-G-TT-GG-A----C-CAA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATTGTCATT--TATAGGAGCG-TGTCTCGTG-TC----A-T-A-ATTCA-ATTAAT-----AA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------T------Atacttga
gi|8                          :             tTACGGTG-TG-A-----C--T-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GGAT------GA-A---ATGGTA-TT--T------GCA-TT------A-TC----A-T-A-AATTA-GTTAAG-----TACCG-----GTAA-GCTA---GAAATAAAAA------T------AT------T--TATTTACCTgaaatatcaattcacatg
gi|9                          :            taTACGGAG-TT-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-AGA--GTGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-GTTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTACCTG------AAAACATATT------AT------T--TA-


blockSeqs                     :      .              T TT TGTTC .  T C  T  . GTCT .   TG     .    .       . CAT      A  GC ATAGGA   T  TCTCGTG   ATAT G T T     T      AAAGC  C  GTATT    .    CCT AGTTACAAATGTC                      T
blockSeqs                     :      .              . G  .     .  . .  .  . .    .   C      .    .       . .        A  .  .        .  AT        .    T . .     A      GTA    .  T        .    .   AAATAAAAATATT                      .
blockSeqs                     :      .              . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     T      .      .  .        .    .   AAAACATATTATT                      .
blockSeqs                     :      .              . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     A      .      .  .        .    .   AAATAGAAATAT                       .
blockSeqs                     :                     . G  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     A      .      .  .        .    .   AAAATAGAATAT                       .
blockSeqs                     :                     . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  T         .    . . .     T      .      .  .        .    .   AAATATT                            .
blockSeqs                     :                     . G  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  G         .    . . .     G      .      .  .        .    .                                       
blockSeqs                     :                     . G  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     T      .      .  .        .    .                                       
blockSeqs                     :                     . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     G      .      .  .        .    .                                       
blockSeqs                     :                     . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     A      .                                                               
blockSeqs                     :                     . G  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     G                                                                      
blockSeqs                     :                     . G  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .     G                                                                      
blockSeqs                     :                     . T  .     .  . .  .  . .    .   .      .    .       . .        .  .  .        .  A         .    . . .                                                                            
blockSeqs                     :                                .  . .  .  . .    .                                                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                                **                                ******                               A*******                 N*                                 AAATAAAAATATT********************
originalCons                  :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTA-NTTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---G------AAA------T------AT------T--TA-TTACCTAA
finalCons                     :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TAA-------TC----A-T-A-ATTTAN-TTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---GAAATAAAAATATT--------------------TA-TTACCTAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATAATTATAATTTAGTGAAATAGTATTTACAGGAAAACGTATTTTATTAATGAAATT






Alignments
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lowQualScore                  :      0              9 99 11111 77 7 7  7  7 7777 7   88     9    222222  9 000      7  99 222222   9  99999999  1111 7 9 9     11     55555  0  00000    0    000      99    0 8 11  4        
consensus                     :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTAN-TTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---GAAATA-GAAAT-ATT--TA-TTACCTAA
Reference ( family-236 )      :   ATA-ATATATTTACGGTG-TN-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTAN-TTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTA---GAAATA-AAAAT-ATT--TA-TTACCTAA
gi|1                          :              TACGTAG-TG-A-----CGGC-G-TT-GGTA----CGCGA--GCGAAAGCACAGAAGAGACA---ATGGGT-TT--T------GCA-TA------ACTC----A---A-ATTTATCTTAAG-----TA-CG-----GTAACGTTA---GAAAAATAAAATAATTTATA-TTACCTAA
gi|10                         :      tataaATATACGGTG-TG-A-----C--C-G-TT-GG-A----C--GA--GCGAA-GCAA------GA-A----TGGT--TT--T------GCA-TA------A-CC----A-TTA-ATTTAT-TTA-G-----TA-CG-----GTAA-GTTA---GAAATA-GAAAT-A-T--TA-TTACCaaacgttgtgtttt
gi|11                         :   ATAGATATATTTACGGTGTTT-A-----C--CTGCTT-AG-AGTCTC-TGATGGCGAA-GCAT------TC-ACATATGGTC-TT--C------GCATTG------A-------A-T-A-ATTTA
gi|12                         : caccg-ATATATTTTCGGTG-TTTA-----C--C-G-TTTAG-A----C-CGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC--T--T------GCA-TA------A-TC----AGC-ATATTTAA-Tt
gi|13                         :      -ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AA-C----C-CGG--GCTAA-GAAT------GA-A---AAGGTT-TT--T------GAA-TT------T-TC----A-T-A-ATTTAT-TGAA
gi|14                         :              TACGGTG-TG-A-----C--T-G-CT-GG-A----A-CGA--GCAAA-GCAT------G--T---ATTGTC-AT--T------GGA-TG------G-TC----A-T-A-ATTCAA-TAAAG-----
gi|16                         :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-c
gi|2                          :               accgTG-TG-A-----C--C-A-TT-GG-A----C-CAA--GCAAA-GCAT------GG-A---ATGCTCATTGCT------GCA-GA------A-TC----A-T-A-ATTCAA-TTAAGAAAGCTA-CAT----GTAC-ATTA---GAAATC-GAAAT-GTC--CA-TT
gi|3                          :             aTACGGTG-TG-A-----C----G-TT-GG-A----C-CGAC-GCG-A-GCAA------GA-A---ATG--T-TT--T------GCA-TA------ATTC----GTT-C-ATTTAT-TTAAGGTA--CA-CG-----G-AA-GTTA---GAAAAT-AGAAT-A-T--TA-TTACCTAAtgctttagaatatatatcataataatgtatgaaa
gi|4                          :    actaTACATGTATGGTG-TT-CTGTTCC--T-G-TT-GG-A----C-TGA--ACAAA-GCAT------GA-A---ATGGTT-TT--T------GCA-TA------A-TCATATA-T-A-ATTCAG-TTAAG-----TA-CGGTATTGTAA-ATTA---GAAATA-GAAAT-GTaaatgtgttttt
gi|5                          :   ATA-ATATATTTACGGTG-TT-A-----C--C-G-TT-AG-A----C-CGA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TG------A-TC----A-T-A-ATTTAT-TTAAG-----TA-TA-----GTA----------AAATA-GAAAT-ATT--TA-TTACCTAAcca
gi|6                          :           ATTTACGGTG-TG-A-----C--C-G-AT-TT-A----C-TGA--ACGAA-GCAT------GA-A---ATTGTC-AT--T------GCA-TA------A-TA----A-T-A-ATTAGG-TTAAG-----TA-TG-----GGAA-ATTA---GAGTTA-CAAAT-GTC--TA-TT
gi|7                          :                                --C-G-TT-GG-A----C-CAA--GCGAA-GCAT------GA-A---ATTGTCATT--TATAGGAGCG-TGTCTCGTG-TC----A-T-A-ATTCAA-TTAAT-----AA-CG-----GTAA-GTTA---GAAATA-GAAAT-ATC--AA-TTtacttga
gi|8                          :             tTACGGTG-TG-A-----C--T-G-TT-GG-A----C-CGA--GCGAA-GGAT------GA-A---ATGGTA-TT--T------GCA-TT------A-TC----A-T-A-AATTAG-TTAAG-----TACCG-----GTAA-GCTA---GAAATA-AAAAT-ATT--TATTTACCTcacatg
gi|9                          :            taTACGGAG-TT-A-----C--C-G-TT-GG-A----C-AGA--GTGAA-GCAT------GA-A---ATGGTC-TT--T------GCA-TA------A-TC----A-T-A-ATTTAG-TTAAG-----TA-CG-----GTAA-GTTACCTGAAAAC-ATATT-ATT--TA-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATAATTATAATTTAGTGAAATAGTATTTACAGGAAAACGTATTTTATTAATGAAATT