lowQualScore : 1 11111 11111 1111 111111 111111 33333333333333333333 111
lowQualScore : 0 9999 55555 4 00000 3 1 666 33 2 777 5 2 2 999999 2 99999999 2 2 66 2 2 2 666 3333 2 99999 111111 2 5555 444 2 5555 2 777 666666 33 2 2 2 2 33 33 2 55555 4 33 2 7777777 111111 11111111111111111111 444 2 2 2 2 666 2 2
lowQualScore : . .... ..... . ..... . . ... .. . ... . . . ...... . ........ . . .. . . . ... .... . ..... ...... . .... ... . .... . ... ...... .. . . . . .. .. . ..... . .. . ....... ...... .................... ... . . . . ... . .
lowQualScore : 8 4444 66666 0 00000 6 4 999 77 7 333 3 7 7 777777 5 11111111 5 5 99 5 7 7 999 1111 4 11111 555555 4 0000 111 4 0000 4 444 888888 22 4 4 4 4 22 22 4 99999 7 22 4 6666666 777777 99999999999999999999 111 4 4 4 4 777 5 5
consensus : TTATTTATT----TATTT-T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-AT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A--T---TTAACA-TT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
Reference ( gi|123336 ) : TTATTCATT----TATTT-T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-AT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A--T---TTAACA-CG--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AGATG--GC-TCA-CAAA
gi|123337 : TTATTTATT----TATTT-G---TC-A-----TTCTGACAGAGAATGGAAAA-ATCGTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-AT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CG-TG--T-A-------A--T---TTAACA-CT--G--------------AA---T-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123338 : TTAATTATA----TATTT-T---TC-A-----TTCCTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGAAAC---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAAC-T-TTTATG------C-AATGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----AT------TTT-AT----T---TAT-A----A-AG---TA------A--TC-T-T-CATGG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A--T---TCAACA-CT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AAATG--TC-TCA-CAAA
gi|123340 : TTATTTATT----TATTT-G---TC-A-----TT-TTGCAGGGAATGAAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTG--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATAAGTGATC-AGTGA--------C-ACA-A--CACAAA-CAA-ATTAAAG---ACTGAT-A-----CT------T---AT----T---TGC-A----A-GG---TA------A--TC-T-C-TTCAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--C-A-------A--T---TTAACA-TT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123339 : TTAATTATT----TATTT-T---TC-A-----TTCCTACAGGGAATG-AACA-ATCTTTTAGAACAGAAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAACTT-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA--AA-ATTAAAC---A----T-G-----CT------TTT-AT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATGG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A--T---TCAACA-CT--G--------------AC---T-ATTTAAAA-A-AAATG--TC-TCA-CAAA
gi|123341 : TTATTTATC----TATTTATACGTC-A-----TTCTTACAGGAAATG
gi|123342 : ttatTTATTTATT-----ATTA-T---TG-AGTGAGTTCTTGCAGGGA-TGGAAGA-ATATTTTAGAACAGATGA---TGTT----AGCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA--------AGTGAATCAAAGAC-ACA-T--CA-AAA-CAA-ATTAAAGCTGA----T-A-----CT------TTT-AT----T---TGC-A----A-GT---TA------A--TC-T-C-CATAG----AA---AG--AGGGAAAT-----CATTG--T-A-------A------TTAACA-TT--G--------------AC---T-C-TT-TAC-A-AGATG--TC-TCA-CAAttttatcagccaaagtctttatacagtgacacaacaaaacaaattaaagatactttttatttacaaggtaatcttcatagtaacagaagggaaatcatgtaatttaacattgactcttttaaaagatgtctcaaaa
gi|123343 : TTATT-ATT----TATTT-TA--TCTA-----TTTT--------ATGGACG---TCATTTATTGCAGGAAAAGTTGTT--TTATCA-GCC---AAAGTCTT-TT-ATAG-----CAAGTGA--------C-A-------A-AAA-CAATATTAAAA---A----T-AAG---CT------TTT-AT----T---TAC-A----A--G---TA------A--TT-C-T-CATAG----AA--CAG-AA-GGAAAT-----CA-TG--T-A-------AGTT---TTAACA-T---G--------------AC---T-CTTT-TAATACAGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123344 : TTATTAATTAATATATAT-G---TC-A-----TTCATA-AGGAAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGG-AA---TG-T--TTATCA-GCC---AAATCT-T-TT-ATA------C-AGTTA--------C-ACA-A--CA-
gi|123345 : ttatTTATTTATT----TATTT-G---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAACA-ATCTTTTTGAACAGGAAA---
gi|123347 : -T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAACATCTTCTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCCC--AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AA--CAA-AATAAAG---ACTGAT-A-----CT------TT--AT----T---TAC-A----A-GG---TACATGTAA--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--TAA-------A--TA--TTAA----A--G--------------A------CATT-TAA-A-AATT----C-TCA-CAAA
gi|123348 : -ATTTTTTG---CAGGAAA---TGTT--TTATCA-GC----AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTGAAG---A----T-A-----C-------TTT-AT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TCTT-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAATCAGTACA-TG--T-A-------A------TTAACA-TT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123349 : -ATTTTTTG---CAGGAAAA--TGTT--TTATCA-GCC---AAAGCC-T-TT--TA------C-CATGA--------CCACAGA--CA-AA--CAA-ATTA--G---A----T-A-----CTG-----TTT-AT----T---TAC-A----A-GG----A------A--T----T-CA-AG-TGAAA--CAG-AAGGAAATT-----CA-TG--T-A-------A--T---TTAACATTG--A--------------AC---T-CTTC-C-A-A-AGATG--TCTTCA-CAAA
gi|123341 : ACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTTTAT----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A--T---TTAACA-TT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-AAA
gi|123346 : ttatttatttatctatttatacgtcattcttCAGGAAA---AATCGCTTATCA--CC---GAAGCT-TCTT-A-A------C-AGTGA--------C-TCA-AACCA-AAA-CAA-AT-AAAT---A----C-C-----CTCTCGAGTTT-AT---------AC-A----ATGGATCTC------A--TC-T-TTCATAG-T--AGACCAG-AAGGATAAT-----CA-T---T-A-------A--T---TTAACA--GTTG--------------AC---T-TTCT-T-G-A-AGATGTTGC-TCA-CAA
gi|123350 : tatttatctattttaatttatttatctagttataaaacgcattttgcAGGAAA---TGTT----ATCA--CC---AAAGTC-T-TA-A-A------C-AGTGA--------C-ACA-AAACA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT--T----T---TAC-A----A-AG---T-------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CC-AA--T-A-------A--T---TTTAAA-CA--A--------------ATTGAT-CTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123351 : AAA---TGTT--T-ATAA-TC-----AATTC-T-TT-ATA------C--GTGA--------C-ACA----CA-AAAGCAA-ATTAAAGT--A----T-AACTGGCT------TTT-ATTGTAT---TGC-A----A-GGTA-TA------A--TC-T-T-GATAGTT--AA--TAGTAAGGGAAAT-----CATTG--T-G-------A--T---TTAACATTT--G--------------AT---T-CTTT-T-A-A-AGTTG--TC-TCAGCAAA
gi|123352 : AA---TGTT--TTATCAAGCCCAAAAAGTC-T----ATA------C-A-TGA--------C-ACA-A--AC-AAA-CAA-ATTAAAG---A----TAA-----CT------TTT-A-----T---TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-ACGGGAAAT-----CA-TG--T-A-------A------TTAACA-TT--GAACCATAATTCATTAC---T-C-TT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-CAAA
gi|123353 : ------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-AT----T---TACAA----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-TGTAT-A-------A--T---TTAACA-TT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-A-GAATG--TC-TCA-CAAA
gi|123354 : agAG---AG---T-A-----CTG-----TCT-AT----TCTGTAC-ATAAGA-GA---TG------AACTC-TAT-CATAG-T--AA--CGA-ATGGAAAAT-----C--TG--T-A-------A--TC--TTAACA-GT--G--------------AT---TTCTTT-TAA-A-AGATG--TC-TCA-
gi|123355 : -A-----CG------TTT-AT----T---TAC-A----A-GA---TA------A--TC-T-T-CATAG-T--AA--CAG-AGAGGAAAT-----CA-TG--T-ACCGTGTGA--TAAATTAACA-AT--G--------------AC---T-CTTT-TAA-G-AAATG--
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 111111 11111111111111 11111111111111
lowQualScore : 7777777777777 3 99999 3 666 33 2 666 5 2 2 999999 2 88888888 2 2 66 2 2 2 666 2222 2 88888 000000 2 8888 2 4444 2 333 999999 33 2 2 2 55 33 2 55555 2 2 33 00000000000000 33 33 4 333 55555555555555 2 2 2 2 33 2 2
lowQualScore : ............. . ..... . ... .. . ... . . . ...... . ........ . . .. . . . ... .... . ..... ...... . .... . .... . ... ...... .. . . . .. .. . ..... . . .. .............. .. .. . ... .............. . . . . .. . .
lowQualScore : 8888888888888 6 11111 1 555 44 5 999 0 5 5 111111 4 55555555 4 4 55 4 5 5 555 4444 2 66666 888888 2 6666 2 7777 2 999 444444 11 2 2 2 33 11 2 66666 2 2 11 66666666666666 11 11 4 999 33333333333333 2 2 2 2 11 4 4
consensus : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
Reference ( family-845 ) : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123336 : TTATTCATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CG---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGG--C-TCA-CAAA
gi|123337 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTGACAGAGAATGGAAAA-ATCGTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CG-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CT---G--------------AAT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123338 : TTAATTATATATT--------TT---TC-A-----TTCCTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGAAAC---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAAC-T-TTTATG------C-AATGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----AT------TTT-ATT----TAT-A----A-AG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123339 : TTAATTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCCTACAGGGAATG-AACA-ATCTTTTAGAACAGAAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAACTT-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA--AA-ATTAAAC---A----T-G-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-ATTTAAAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123340 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TT-TTGCAGGGAATGAAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTG--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATAAGTGATC-AGTGA--------C-ACA-A--CACAAA-CAA-ATTAAAG---ACTGAT-A-----CT------T---ATT----TGC-A----A-GG---TA------A--TC-T-C-TTCAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--CA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123341 : ACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTTTATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-AAA
gi|123342 : ttatttatttatctatttatacgtcattcttTTATTTATT-ATT--------AT---TG-AGTGAGTTCTTGCAGGGA-TGGAAGA-ATATTTTAGAACAGATGA---TGTT----AGCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA--------AGTGAATCAAAGAC-ACA-T--CA-AAA-CAA-ATTAAAGCTGA----T-A-----CT------TTT-ATT----TGC-A----A-GT---TA------A--TC-T-C-CATAG---AA---AG--AGGGAAAT-----CATT-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-C-TT-TAC-A-AGATGT--C-TCA-CAA
gi|123343 : TTATT-ATTTATT--------TTA--TCTA-----TTTT--------ATGGACG---TCATTTATTGCAGGAAAAGTTGTT--TTATCA-GCC---AAAGTCTT-TT-ATAG-----CAAGTGA--------C-A-------A-AAA-CAATATTAAAA---A----T-AAG---CT------TTT-ATT----TAC-A----A--G---TA------A--TT-C-T-CATAG---AA--CAG-AA-GGAAAT-----CA-T-G--TA-------AGTT---TT--AAC--A--T---G--------------ACT-CTTT-TAATACAGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123344 : TTATTTATTAATTAATATATATG---TC-A-----TTCATA-AGGAAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGG-AA---TG-T--TTATCA-GCC---AAATCT-T-TT-ATA------C-AGTTA--------C-ACA-A--CA-
gi|123345 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAACA-ATCTTTTTGAACAGGAAA---
gi|123346 : TATTTATCTATT--------TTAATTT-A-----TTTATCTAGT---TATAAAA-CGCATTTTGC-CAGGAAA---AATCGCTTATCA--CC---GAAGCT-TCTT-A-A------C-AGTGA--------C-TCA-AACCA-AAA-CAA-AT-AAAT---A----C-C-----CTCTCGAGTTT-AT------AC-A----ATGGATCTC------A--TC-T-TTCATAGT--AGACCAG-AAGGATAAT-----CA-T----TA-------A--T---TT--AAC--AGTT---G--------------ACT-TTCT-T-G-A-AGATGTTGC-TCA-CAA
gi|123347 : T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAACATCTTCTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCCC--AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AA--CAA-AATAAAG---ACTGAT-A-----CT------TT--ATT----TAC-A----A-GG---TACATGTAA--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA------------------AAT--A-TTAAAG--------------A---CATT-TAA-A-A-AT-T--C-TCA-CAAA
gi|123348 : -ATTTTTTG---CAGGAAA---TGTT--TTATCA-GC----AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTGAAG---A----T-A-----C-------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TCTT-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAATCAGTACA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123349 : -ATTTTTTG---CAGGAAAA--TGTT--TTATCA-GCC---AAAGCC-T-TT--TA------C-CATGA--------CCACAGA--CA-AA--CAA-ATTA--G---A----T-A-----CTG-----TTT-ATT----TAC-A----A-GG----A------A--T----T-CA-AGTGAAA--CAG-AAGGAAATT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---GA-------------ACT-CTTC-C-A-A-AGATGT--CTTCA-CAAA
gi|123350 : AGGAAA---TGTT----ATCA--CC---AAAGTC-T-TA-A-A------C-AGTGA--------C-ACA-AAACA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT--TT----TAC-A----A-AG---T-------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CC-A-A--TA-------A--T---TTTAAACAAA-TT---G--------------A-T-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123351 : AAA---TGTT--T-ATAA-TC-----AATTC-T-TT-ATA------C--GTGA--------C-ACA----CA-AAAGCAA-ATTAAAGT--A----T-AACTGGCT------TTT-ATTGTATTGC-A----A-GG---TATA----A--TC-T-T-GATAGTT-AA--TAGTAAGGGAAAT-----CA-TTG--TG-------A--T---TT--AAC--ATTT---G--------------ATT-CTTT-T-A-A-AGTTGT--C-TCAGCAAA
gi|123352 : AA---TGTT--TTATCAAGCCCAAAAAGTC-T----ATA------C-A-TGA--------C-ACA-A--AC-AAA-CAA-ATTAAAG---A----TAA-----CT------TTT-A-T----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-ACGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---GAACCATAATTCATTACT-C-TT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123353 : ------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TACAA----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-GTATA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-GAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123354 : agAG---AG---T-A-----CTG-----TCT-ATTCTG-TAC-ATAAGA-GA---TG------AACTC-TAT-CATAGT--AA--CGA-ATGGAAAAT-----C--T-G--TA-------A--TC--TT--AAC--A-GT---G--------------ATTTCTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-
gi|123355 : -A-----CG------TTT-ATT----TAC-A----A-GA---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AGAGGAAAT-----CA-T-G--TACCGTGTGA--TAAATT--AAC--A-AT---G--------------ACT-CTTT-TAA-G-AAATGT--
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 111111 11111111111111 11111111111111
lowQualScore : 7777777777777 3 99999 3 666 33 2 666 5 2 2 999999 2 88888888 2 2 66 2 2 2 666 2222 2 88888 000000 2 8888 2 4444 2 333 999999 33 2 2 2 55 33 2 55555 2 2 33 00000000000000 33 33 4 333 55555555555555 2 2 2 2 33 2 2
lowQualScore : ............. . ..... . ... .. . ... . . . ...... . ........ . . .. . . . ... .... . ..... ...... . .... . .... . ... ...... .. . . . .. .. . ..... . . .. .............. .. .. . ... .............. . . . . .. . .
lowQualScore : 8888888888888 6 11111 1 555 44 5 999 0 5 5 111111 4 55555555 4 4 55 4 5 5 555 4444 2 66666 888888 2 6666 2 7777 2 999 444444 11 2 2 2 33 11 2 66666 2 2 11 66666666666666 11 11 4 999 33333333333333 2 2 2 2 11 4 4
consensus : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
Reference ( family-845 ) : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123336 : TTATTCATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CG---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGG--C-TCA-CAAA
gi|123337 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTGACAGAGAATGGAAAA-ATCGTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CG-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CT---G--------------AAT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123338 : TTAATTATATATT--------TT---TC-A-----TTCCTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGAAAC---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAAC-T-TTTATG------C-AATGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----AT------TTT-ATT----TAT-A----A-AG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123339 : TTAATTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCCTACAGGGAATG-AACA-ATCTTTTAGAACAGAAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAACTT-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA--AA-ATTAAAC---A----T-G-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-ATTTAAAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123340 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TT-TTGCAGGGAATGAAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTG--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATAAGTGATC-AGTGA--------C-ACA-A--CACAAA-CAA-ATTAAAG---ACTGAT-A-----CT------T---ATT----TGC-A----A-GG---TA------A--TC-T-C-TTCAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--CA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123341 : ACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTTTATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-AAA
gi|123342 : ttatttatttatctatttatacgtcattcttTTATTTATT-ATT--------AT---TG-AGTGAGTTCTTGCAGGGA-TGGAAGA-ATATTTTAGAACAGATGA---TGTT----AGCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA--------AGTGAATCAAAGAC-ACA-T--CA-AAA-CAA-ATTAAAGCTGA----T-A-----CT------TTT-ATT----TGC-A----A-GT---TA------A--TC-T-C-CATAG---AA---AG--AGGGAAAT-----CATT-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-C-TT-TAC-A-AGATGT--C-TCA-CAA
gi|123343 : TTATT-ATTTATT--------TTA--TCTA-----TTTT--------ATGGACG---TCATTTATTGCAGGAAAAGTTGTT--TTATCA-GCC---AAAGTCTT-TT-ATAG-----CAAGTGA--------C-A-------A-AAA-CAATATTAAAA---A----T-AAG---CT------TTT-ATT----TAC-A----A--G---TA------A--TT-C-T-CATAG---AA--CAG-AA-GGAAAT-----CA-T-G--TA-------AGTT---TT--AAC--A--T---G--------------ACT-CTTT-TAATACAGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123344 : TTATTTATTAATTAATATATATG---TC-A-----TTCATA-AGGAAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGG-AA---TG-T--TTATCA-GCC---AAATCT-T-TT-ATA------C-AGTTA--------C-ACA-A--CA-
gi|123345 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAACA-ATCTTTTTGAACAGGAAA---
gi|123346 : TATTTATCTATT--------TTAATTT-A-----TTTATCTAGT---TATAAAA-CGCATTTTGC-CAGGAAA---AATCGCTTATCA--CC---GAAGCT-TCTT-A-A------C-AGTGA--------C-TCA-AACCA-AAA-CAA-AT-AAAT---A----C-C-----CTCTCGAGTTT-AT------AC-A----ATGGATCTC------A--TC-T-TTCATAGT--AGACCAG-AAGGATAAT-----CA-T----TA-------A--T---TT--AAC--AGTT---G--------------ACT-TTCT-T-G-A-AGATGTTGC-TCA-CAA
gi|123347 : T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAACATCTTCTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCCC--AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AA--CAA-AATAAAG---ACTGAT-A-----CT------TT--ATT----TAC-A----A-GG---TACATGTAA--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA------------------AAT--A-TTAAAG--------------A---CATT-TAA-A-A-AT-T--C-TCA-CAAA
gi|123348 : -ATTTTTTG---CAGGAAA---TGTT--TTATCA-GC----AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTGAAG---A----T-A-----C-------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TCTT-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAATCAGTACA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123349 : -ATTTTTTG---CAGGAAAA--TGTT--TTATCA-GCC---AAAGCC-T-TT--TA------C-CATGA--------CCACAGA--CA-AA--CAA-ATTA--G---A----T-A-----CTG-----TTT-ATT----TAC-A----A-GG----A------A--T----T-CA-AGTGAAA--CAG-AAGGAAATT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---GA-------------ACT-CTTC-C-A-A-AGATGT--CTTCA-CAAA
gi|123350 : AGGAAA---TGTT----ATCA--CC---AAAGTC-T-TA-A-A------C-AGTGA--------C-ACA-AAACA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT--TT----TAC-A----A-AG---T-------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CC-A-A--TA-------A--T---TTTAAACAAA-TT---G--------------A-T-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123351 : AAA---TGTT--T-ATAA-TC-----AATTC-T-TT-ATA------C--GTGA--------C-ACA----CA-AAAGCAA-ATTAAAGT--A----T-AACTGGCT------TTT-ATTGTATTGC-A----A-GG---TATA----A--TC-T-T-GATAGTT-AA--TAGTAAGGGAAAT-----CA-TTG--TG-------A--T---TT--AAC--ATTT---G--------------ATT-CTTT-T-A-A-AGTTGT--C-TCAGCAAA
gi|123352 : AA---TGTT--TTATCAAGCCCAAAAAGTC-T----ATA------C-A-TGA--------C-ACA-A--AC-AAA-CAA-ATTAAAG---A----TAA-----CT------TTT-A-T----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-ACGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---GAACCATAATTCATTACT-C-TT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123353 : ------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TACAA----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-GTATA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-GAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123354 : agAG---AG---T-A-----CTG-----TCT-ATTCTG-TAC-ATAAGA-GA---TG------AACTC-TAT-CATAGT--AA--CGA-ATGGAAAAT-----C--T-G--TA-------A--TC--TT--AAC--A-GT---G--------------ATTTCTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-
gi|123355 : -A-----CG------TTT-ATT----TAC-A----A-GA---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AGAGGAAAT-----CA-T-G--TACCGTGTGA--TAAATT--AAC--A-AT---G--------------ACT-CTTT-TAA-G-AAATGT--
blockSeqs : AATATATATG T GTGAG C AGT GC A CAA T C T AGTGAT A ATCAAAGA C G AC C G T CTG CTGA A ACTGG CTCGAG T GTAT A TAAG T ATC CATGTA AC T A T GA AC T CAGTA T T TA CCGTGTGATAAA TA AA G AAA AACCATAATTCATT T A T C TG T G
blockSeqs : TTAAT . . . A . . C T . . G . . . . AA . . . T CTGA . AG G . CTG . . . . TA . . . . T . . . . . . AGTT . . T . A . . . . . . .
blockSeqs : TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
finalCons : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 111111 11111111111111 11111111111111
lowQualScore : 7777777777777 3 99999 3 666 33 2 666 5 2 2 999999 2 88888888 2 2 66 2 2 2 666 2222 2 88888 000000 2 8888 2 4444 2 333 999999 33 2 2 2 55 33 2 55555 2 2 33 00000000000000 33 33 4 333 55555555555555 2 2 2 2 33 2 2
lowQualScore : ............. . ..... . ... .. . ... . . . ...... . ........ . . .. . . . ... .... . ..... ...... . .... . .... . ... ...... .. . . . .. .. . ..... . . .. .............. .. .. . ... .............. . . . . .. . .
lowQualScore : 8888888888888 6 11111 1 555 44 5 999 0 5 5 111111 4 55555555 4 4 55 4 5 5 555 4444 2 66666 888888 2 6666 2 7777 2 999 444444 11 2 2 2 33 11 2 66666 2 2 11 66666666666666 11 11 4 999 33333333333333 2 2 2 2 11 4 4
consensus : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
Reference ( family-845 ) : TTATTTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123336 : TTATTCATTTATT--------TT---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CG---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGG--C-TCA-CAAA
gi|123337 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTGACAGAGAATGGAAAA-ATCGTTTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CG-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-CT---G--------------AAT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123338 : TTAATTATATATT--------TT---TC-A-----TTCCTGCAGGGAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGAAAC---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAAC-T-TTTATG------C-AATGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----AT------TTT-ATT----TAT-A----A-AG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123339 : TTAATTATTTATT--------TT---TC-A-----TTCCTACAGGGAATG-AACA-ATCTTTTAGAACAGAAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAAACTT-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA--AA-ATTAAAC---A----T-G-----CT------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATGGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TC--AAC--A-CT---G--------------ACT-ATTTAAAA-A-AAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123340 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TT-TTGCAGGGAATGAAAAA-ATCTTTTAGAACAGGAAA---TGTG--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATAAGTGATC-AGTGA--------C-ACA-A--CACAAA-CAA-ATTAAAG---ACTGAT-A-----CT------T---ATT----TGC-A----A-GG---TA------A--TC-T-C-TTCAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--CA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123341 : ACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTTTATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-AAA
gi|123342 : ttatttatttatctatttatacgtcattcttTTATTTATT-ATT--------AT---TG-AGTGAGTTCTTGCAGGGA-TGGAAGA-ATATTTTAGAACAGATGA---TGTT----AGCA-GCC---AAAGTC-T-TT-ATA--------AGTGAATCAAAGAC-ACA-T--CA-AAA-CAA-ATTAAAGCTGA----T-A-----CT------TTT-ATT----TGC-A----A-GT---TA------A--TC-T-C-CATAG---AA---AG--AGGGAAAT-----CATT-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-C-TT-TAC-A-AGATGT--C-TCA-CAA
gi|123343 : TTATT-ATTTATT--------TTA--TCTA-----TTTT--------ATGGACG---TCATTTATTGCAGGAAAAGTTGTT--TTATCA-GCC---AAAGTCTT-TT-ATAG-----CAAGTGA--------C-A-------A-AAA-CAATATTAAAA---A----T-AAG---CT------TTT-ATT----TAC-A----A--G---TA------A--TT-C-T-CATAG---AA--CAG-AA-GGAAAT-----CA-T-G--TA-------AGTT---TT--AAC--A--T---G--------------ACT-CTTT-TAATACAGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123344 : TTATTTATTAATTAATATATATG---TC-A-----TTCATA-AGGAAATGGAAAA-ATCTTTTAGAACAGG-AA---TG-T--TTATCA-GCC---AAATCT-T-TT-ATA------C-AGTTA--------C-ACA-A--CA-
gi|123345 : TTATTTATTTATT--------TG---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAACA-ATCTTTTTGAACAGGAAA---
gi|123346 : TATTTATCTATT--------TTAATTT-A-----TTTATCTAGT---TATAAAA-CGCATTTTGC-CAGGAAA---AATCGCTTATCA--CC---GAAGCT-TCTT-A-A------C-AGTGA--------C-TCA-AACCA-AAA-CAA-AT-AAAT---A----C-C-----CTCTCGAGTTT-AT------AC-A----ATGGATCTC------A--TC-T-TTCATAGT--AGACCAG-AAGGATAAT-----CA-T----TA-------A--T---TT--AAC--AGTT---G--------------ACT-TTCT-T-G-A-AGATGTTGC-TCA-CAA
gi|123347 : T---TC-A-----TTCTTGCAGGGAATGGAAAACATCTTCTAGAACAGGAAA---TGTT--TTATCA-GCCC--AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AA--CAA-AATAAAG---ACTGAT-A-----CT------TT--ATT----TAC-A----A-GG---TACATGTAA--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-G--TA------------------AAT--A-TTAAAG--------------A---CATT-TAA-A-A-AT-T--C-TCA-CAAA
gi|123348 : -ATTTTTTG---CAGGAAA---TGTT--TTATCA-GC----AAAGTC-T-TT-ATA------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTGAAG---A----T-A-----C-------TTT-ATT----TAC-A----A-GG---TA------A--TCTT-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAATCAGTACA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123349 : -ATTTTTTG---CAGGAAAA--TGTT--TTATCA-GCC---AAAGCC-T-TT--TA------C-CATGA--------CCACAGA--CA-AA--CAA-ATTA--G---A----T-A-----CTG-----TTT-ATT----TAC-A----A-GG----A------A--T----T-CA-AGTGAAA--CAG-AAGGAAATT-----CA-T-G--TA-------A--T---TT--AAC--A-TT---GA-------------ACT-CTTC-C-A-A-AGATGT--CTTCA-CAAA
gi|123350 : AGGAAA---TGTT----ATCA--CC---AAAGTC-T-TA-A-A------C-AGTGA--------C-ACA-AAACA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT--TT----TAC-A----A-AG---T-------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CC-A-A--TA-------A--T---TTTAAACAAA-TT---G--------------A-T-CTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123351 : AAA---TGTT--T-ATAA-TC-----AATTC-T-TT-ATA------C--GTGA--------C-ACA----CA-AAAGCAA-ATTAAAGT--A----T-AACTGGCT------TTT-ATTGTATTGC-A----A-GG---TATA----A--TC-T-T-GATAGTT-AA--TAGTAAGGGAAAT-----CA-TTG--TG-------A--T---TT--AAC--ATTT---G--------------ATT-CTTT-T-A-A-AGTTGT--C-TCAGCAAA
gi|123352 : AA---TGTT--TTATCAAGCCCAAAAAGTC-T----ATA------C-A-TGA--------C-ACA-A--AC-AAA-CAA-ATTAAAG---A----TAA-----CT------TTT-A-T----TAC-A----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-ACGGGAAAT-----CA-T-G--TA-------A------TT--AAC--A-TT---GAACCATAATTCATTACT-C-TT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-CAAA
gi|123353 : ------C-AGTGA--------C-ACA-A--CA-AAA-CAA-ATTAAAG---A----T-A-----CT------TTT-ATT----TACAA----A-GG---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AAGGGAAAT-----CA-T-GTATA-------A--T---TT--AAC--A-TT---G--------------ACT-CTTT-TAA-A-GAATGT--C-TCA-CAAA
gi|123354 : agAG---AG---T-A-----CTG-----TCT-ATTCTG-TAC-ATAAGA-GA---TG------AACTC-TAT-CATAGT--AA--CGA-ATGGAAAAT-----C--T-G--TA-------A--TC--TT--AAC--A-GT---G--------------ATTTCTTT-TAA-A-AGATGT--C-TCA-
gi|123355 : -A-----CG------TTT-ATT----TAC-A----A-GA---TA------A--TC-T-T-CATAGT--AA--CAG-AGAGGAAAT-----CA-T-G--TACCGTGTGA--TAAATT--AAC--A-AT---G--------------ACT-CTTT-TAA-G-AAATGT--