lowQualScore : 11111111
lowQualScore : 22222 00 1 99999999 1 0 0 000 0 0 0
lowQualScore : ..... .. . ........ . . . ... . . .
lowQualScore : 00000 66 2 11111111 2 8 4 777 8 8 4
consensus : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
Reference ( gi|95361 ) : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95383 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-AG-A-CTATA---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95358 : TATATATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95363 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTAT
gi|95364 : TATATATG-----T--TTGT--G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATA
gi|95387 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTCTG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95388 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95422 : TATTTATG-----T--TT-T--C-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95399 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95398 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95394 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95392 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95370 : TATTTATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95404 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---GTTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95402 : TGTATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95401 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ACTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95405 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95365 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-AG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95362 : TATATATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTATAT
gi|95407 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95410 : TATATATG-----C--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95423 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTC-CCAATTTATAT
gi|95457 : TATATATG-----T--TT-T--A-----G-GG-A-CTATGTTTATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATAT
gi|95431 : TATATTTG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95430 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-ATCATA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95429 : TATATATG-----T--TT-T--T-----A-GG-A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95428 : TATATATG-----T--TT-T--T-----A-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95393 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95419 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95439 : TACATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95438 : TATACATG-----T--TT-T--T-----A-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95436 : TATATATT-----T--TT-T--G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTCATAT
gi|95477 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-CACACA-TTG-TTTACTTCGACAATGTATAT
gi|95442 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTATATTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95446 : TAGATATG-----T--TT-T--T-----T-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95448 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-GTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95391 : TATATATG-----T--TT-TC-G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AAAACA-TTG-TTTAGTTCGCCAATTTATAT
gi|95450 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-TG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95369 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAAATTATAT
gi|95451 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTAT-ATCACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95445 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCACTTTATAT
gi|95374 : TGTATATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-CGATG---ATTGCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95379 : TGTATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-ATATG---ATTACGTCT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95464 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTCACTTCGCCATTTTATAT
gi|95463 : TGTATATG-----T--TT-T--G-----G-GG-A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-ATG-TCTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95462 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95406 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTGTTTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95375 : TATACATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTATAT
gi|95468 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-AG-A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95465 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GA-A-CTACG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95377 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95486 : TATATATG-----T--TT-T--T-----C-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95483 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-TG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95420 : TATATATG-----T--TT-T--C-----TTGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95400 : TATGTATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95372 : TATATATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTCATAT
gi|95449 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95443 : TATATATGGGGTTT--TT-T--G-----G-GGGA-CTATG---ATTACGTTG-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95440 : TATGTATT-----T--TT-T--G-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95456 : tgTATCTATGAT---T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATA
gi|95432 : TATACATG-----T--TT-T--G-----G-GG-AATTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95371 : TATATATG-----T--TT-T--T-----A-GG-A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95359 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCAAATTTATAT
gi|95482 : TATATATGA----T--TT-T--T-----T-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95435 : TGTATATG-----T--TT-T--T-----T-GG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATA
gi|95471 : TATATATG-----T--TT-T--AT----G-GG-A-CTATG---ATTACATTT-AATACA-CTA-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95433 : TATATATG-----T--TT-T--T-----GCGG-A-CT--G---ATTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95455 : TATATATG-----T--GT-T--T-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTTA-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTA
gi|95444 : TATATATG-----T--TT-T--G-----G-G--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCAAATTTATA
gi|95416 : TATATATG-----T--TT-TTGG-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTTT-ACTACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95385 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-ACCACATTTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95454 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCACGAATTTATAT
gi|95470 : TGTATATG-----T--TT-T--G-----G-G--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAAATTCGCCAATTTATAT
gi|95378 : TGTATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95434 : TATACATG-----T--TT-T--A-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCCAA-TTATAT
gi|95412 : TATATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95474 : TGTATGTG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG--TTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95475 : TATATATG-----T--TT-T--T-----TTGG-A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95427 : TATAT-TT-----T--TT-T--G-----G-GG-A-TTATG---ATTACATTTTAACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95467 : tgTATATATG-----T--TT-T--TTTTTTG-GG-A-TTATG---ATTACGTTT-GATACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95380 : TATATATG-----T--TT-T--TC----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTT-TTTACTTCGCCATTTTA
gi|95461 : TATATATG-----T--TTCT--T-----G-AG-A-TTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTGACTTTGCCAATTTATAT
gi|95426 : TATATATG-----T--TT-TT-G-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTTC-AACACA-TTG-TTAACTTCACCAATATAT
gi|95411 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95409 : TGTATATG-----T--TT-T--G-----G-GGGA-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTTAATTTGTAT
gi|95413 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCATTTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95414 : TATATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCT-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95650 : ATATATG-----T--AT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTTCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95647 : ATATATG-----TAGTT-T--G-----G-G--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95641 : ATATATG-----T--TT-TTCG-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTGTGAACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95648 : ATAAATG-----T--TT-T--TT----A-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95649 : ATATATG-----T--TT-TTGG-----G-GG-A-TTTTG---ATTACATTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTCAATTGATAT
gi|95670 : TATATG-----T--TT-T--C-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95667 : TATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95669 : TATATG-----T--AT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95674 : TACATA-----T--TT-T--T-----A-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95668 : TATATG-----T--TT-T--TT----G-GG-A-CTATG---ATT-CGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95671 : TATATG-----T--TT-T--T-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAATTTCGCCAATTTATA
gi|95666 : TATATG-----T--TTCT--T-----G-GG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95715 : ATG-----T--CT-T--T-----G-GG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
Alignments
lowQualScore : 2222 0 0 4 22222 0 66 0 000 0 0 0
lowQualScore : .... . . . ..... . .. . ... . . .
lowQualScore : 2222 4 8 4 44444 8 00 4 777 8 8 4
consensus : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
Reference ( family-83 ) : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95358 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95359 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCAAATTTATAT
gi|95361 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95362 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTATAT
gi|95363 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTAT
gi|95364 : TATATATG----T-TT-G-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATA
gi|95365 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95369 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAAATTATAT
gi|95370 : TATTTATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95371 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95372 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTCATAT
gi|95374 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CGATG---ATTGCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95375 : TATACATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTATAT
gi|95377 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95378 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95379 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTCT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95380 : TATATATG----T-TT-T-TC----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTT-TTTACTTCGCCATTTTA
gi|95383 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-AG--A-CTATA---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95385 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ACCACATTTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95387 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTCTG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95388 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95391 : TATATATG----T-TT-T-C-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AAAACA-TTG-TTTAGTTCGCCAATTTATAT
gi|95392 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95393 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95394 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95398 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95399 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95400 : TATGTATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95401 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ACTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95402 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95404 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---GTTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95405 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95406 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTGTTTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95407 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95409 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTTAATTTGTAT
gi|95410 : TATATATG----C-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95411 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95412 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95413 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCATTTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95414 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCT-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95416 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTATG---ATTACGTTT-ACTACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95419 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95420 : TATATATG----T-TT-TCT-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95422 : TATTTATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95423 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTC-CCAATTTATAT
gi|95426 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTC-AACACA-TTG-TTAACTTCACCAATATAT
gi|95427 : TGTATATT----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACATTTTAACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95428 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95429 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95430 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ATCATA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95431 : TATATTTG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95432 : TATACATG----T-TT-T-G-----G-GG--AATTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95433 : TATATATG----T-TT-T-T-----GCGG--A-CT--G---ATTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95434 : TATACATG----T-TT-T-------A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCCAA-TTATAT
gi|95435 : TGTATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATA
gi|95436 : TATATATT----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTCATAT
gi|95438 : TATACATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95439 : TACATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95440 : TATGTAT-----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95442 : tgTATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTATATTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95443 : TATATATGGGGTT-TT-T-T-----G-GGGGA-CTATG---ATTACGTTG-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95444 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCAAATTTATA
gi|95445 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCACTTTATAT
gi|95446 : TAGATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95448 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-GTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95449 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-G---A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95450 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95451 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTAT-ATCACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95454 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCACGAATTTATAT
gi|95455 : TATATATG----T-GT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTA-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTA
gi|95456 : TATCTATGAT--T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATA
gi|95457 : TATATATG----T-TT-T-A-----G-GG--A-CTATGTTTATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATAT
gi|95461 : TATATATG----T-TTCT-T-----G-AG--A-TTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTGACTTTGCCAATTTATAT
gi|95462 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95463 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-ATG-TCTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95464 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTCACTTCGCCATTTTATAT
gi|95465 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GA--A-CTACG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95467 : TATATATG----T-TT-T-TTTTTTG-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-GATACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95468 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95470 : TGTATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAAATTCGCCAATTTATAT
gi|95471 : TATATATG----T-TT-TAT-----G-GG--A-CTATG---ATTACATTT-AATACA-CTA-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95474 : TGTATGTG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG--TTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95475 : TATATATG----T-TT-T-T-----TTGG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95477 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-CACACA-TTG-TTTACTTCGACAATGTATAT
gi|95482 : TATATATGA---T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95483 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95486 : TATATATG----T-TT-T-T-----C-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95641 : ATATATG----T-TT-T-TCG---G-GG--A-TTATG---ATTACGTGTGAACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95647 : ATATATG----TAGT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95648 : ATAAATG----T-TT-T-TT----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95649 : ATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTTTG---ATTACATTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTCAATTGATAT
gi|95650 : ATATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTTCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95666 : TATATG----T-TTCT-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95667 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95668 : TATATGT---T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATT-CGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95669 : TATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95670 : TATATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95671 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAATTTCGCCAATTTATA
gi|95674 : TACATA----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95715 : ATG----T-CT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
Alignments
lowQualScore : 2222 0 0 4 22222 0 66 0 000 0 0 0
lowQualScore : .... . . . ..... . .. . ... . . .
lowQualScore : 2222 4 8 4 44444 8 00 4 777 8 8 4
consensus : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
Reference ( family-83 ) : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95358 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95359 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCAAATTTATAT
gi|95361 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95362 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTATAT
gi|95363 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTAT
gi|95364 : TATATATG----T-TT-G-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATA
gi|95365 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95369 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAAATTATAT
gi|95370 : TATTTATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95371 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95372 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTCATAT
gi|95374 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CGATG---ATTGCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95375 : TATACATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTATAT
gi|95377 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95378 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95379 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTCT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95380 : TATATATG----T-TT-T-TC----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTT-TTTACTTCGCCATTTTA
gi|95383 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-AG--A-CTATA---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95385 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ACCACATTTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95387 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTCTG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95388 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95391 : TATATATG----T-TT-T-C-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AAAACA-TTG-TTTAGTTCGCCAATTTATAT
gi|95392 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95393 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95394 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95398 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95399 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95400 : TATGTATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95401 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ACTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95402 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95404 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---GTTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95405 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95406 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTGTTTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95407 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95409 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTTAATTTGTAT
gi|95410 : TATATATG----C-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95411 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95412 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95413 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCATTTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95414 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCT-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95416 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTATG---ATTACGTTT-ACTACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95419 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95420 : TATATATG----T-TT-TCT-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95422 : TATTTATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95423 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTC-CCAATTTATAT
gi|95426 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTC-AACACA-TTG-TTAACTTCACCAATATAT
gi|95427 : TGTATATT----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACATTTTAACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95428 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95429 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95430 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ATCATA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95431 : TATATTTG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95432 : TATACATG----T-TT-T-G-----G-GG--AATTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95433 : TATATATG----T-TT-T-T-----GCGG--A-CT--G---ATTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95434 : TATACATG----T-TT-T-------A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCCAA-TTATAT
gi|95435 : TGTATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATA
gi|95436 : TATATATT----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTCATAT
gi|95438 : TATACATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95439 : TACATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95440 : TATGTAT-----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95442 : tgTATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTATATTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95443 : TATATATGGGGTT-TT-T-T-----G-GGGGA-CTATG---ATTACGTTG-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95444 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCAAATTTATA
gi|95445 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCACTTTATAT
gi|95446 : TAGATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95448 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-GTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95449 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-G---A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95450 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95451 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTAT-ATCACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95454 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCACGAATTTATAT
gi|95455 : TATATATG----T-GT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTA-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTA
gi|95456 : TATCTATGAT--T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATA
gi|95457 : TATATATG----T-TT-T-A-----G-GG--A-CTATGTTTATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATAT
gi|95461 : TATATATG----T-TTCT-T-----G-AG--A-TTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTGACTTTGCCAATTTATAT
gi|95462 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95463 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-ATG-TCTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95464 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTCACTTCGCCATTTTATAT
gi|95465 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GA--A-CTACG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95467 : TATATATG----T-TT-T-TTTTTTG-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-GATACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95468 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95470 : TGTATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAAATTCGCCAATTTATAT
gi|95471 : TATATATG----T-TT-TAT-----G-GG--A-CTATG---ATTACATTT-AATACA-CTA-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95474 : TGTATGTG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG--TTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95475 : TATATATG----T-TT-T-T-----TTGG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95477 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-CACACA-TTG-TTTACTTCGACAATGTATAT
gi|95482 : TATATATGA---T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95483 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95486 : TATATATG----T-TT-T-T-----C-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95641 : ATATATG----T-TT-T-TCG---G-GG--A-TTATG---ATTACGTGTGAACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95647 : ATATATG----TAGT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95648 : ATAAATG----T-TT-T-TT----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95649 : ATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTTTG---ATTACATTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTCAATTGATAT
gi|95650 : ATATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTTCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95666 : TATATG----T-TTCT-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95667 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95668 : TATATGT---T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATT-CGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95669 : TATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95670 : TATATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95671 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAATTTCGCCAATTTATA
gi|95674 : TACATA----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95715 : ATG----T-CT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
blockSeqs : GGGT T TTTTT GG
blockSeqs : AT T CG GG
blockSeqs : A T C GG
blockSeqs : T T T G
blockSeqs : . T . G
blockSeqs : . T . G
blockSeqs : . T . G
blockSeqs : . T . G
blockSeqs : . C . G
blockSeqs : . T . G
blockSeqs : . A . G
blockSeqs : . . . G
blockSeqs : . . . G
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
finalCons : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
Alignments
lowQualScore : 2222 0 0 4 22222 0 66 0 000 0 0 0
lowQualScore : .... . . . ..... . .. . ... . . .
lowQualScore : 2222 4 8 4 44444 8 00 4 777 8 8 4
consensus : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
Reference ( family-83 ) : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95358 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95359 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCAAATTTATAT
gi|95361 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95362 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTATAT
gi|95363 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTATTTTGCCAATTTAT
gi|95364 : TATATATG----T-TT-G-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATA
gi|95365 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95369 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAAATTATAT
gi|95370 : TATTTATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95371 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95372 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTCATAT
gi|95374 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CGATG---ATTGCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95375 : TATACATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTATAT
gi|95377 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95378 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTATGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95379 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTCT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95380 : TATATATG----T-TT-T-TC----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTT-TTTACTTCGCCATTTTA
gi|95383 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-AG--A-CTATA---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95385 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ACCACATTTG-TTTACTTCGCCAATTTAT
gi|95387 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTCTG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95388 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95391 : TATATATG----T-TT-T-C-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AAAACA-TTG-TTTAGTTCGCCAATTTATAT
gi|95392 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95393 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95394 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95398 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95399 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTAAG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95400 : TATGTATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95401 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ACTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95402 : TGTATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95404 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---GTTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95405 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95406 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACATG-TTGTTTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95407 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAGTTTA
gi|95409 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTTAATTTGTAT
gi|95410 : TATATATG----C-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TCG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95411 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95412 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCA-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95413 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCATTTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95414 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGGTT-AACTCT-TTT-TTTAATTCGCCAATTTATAT
gi|95416 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTATG---ATTACGTTT-ACTACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95419 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95420 : TATATATG----T-TT-TCT-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95422 : TATTTATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95423 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTC-CCAATTTATAT
gi|95426 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACGTTC-AACACA-TTG-TTAACTTCACCAATATAT
gi|95427 : TGTATATT----T-TT-T-T-----G-GGG-A-TTATG---ATTACATTTTAACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95428 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95429 : TATATATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95430 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-ATCATA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95431 : TATATTTG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95432 : TATACATG----T-TT-T-G-----G-GG--AATTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95433 : TATATATG----T-TT-T-T-----GCGG--A-CT--G---ATTACGTTT-AACACA-CTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95434 : TATACATG----T-TT-T-------A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTT-TTTACTTCGCCAA-TTATAT
gi|95435 : TGTATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATA
gi|95436 : TATATATT----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTCATAT
gi|95438 : TATACATG----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95439 : TACATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-CTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95440 : TATGTAT-----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95442 : tgTATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTATATTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95443 : TATATATGGGGTT-TT-T-T-----G-GGGGA-CTATG---ATTACGTTG-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95444 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCAAATTTATA
gi|95445 : TATATATG----T-TT-T-------G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCACTTTATAT
gi|95446 : TAGATATG----T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95448 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-GTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95449 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-G---A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95450 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95451 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTAT-ATCACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95454 : TATATATG----T-TT-TTT-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCACGAATTTATAT
gi|95455 : TATATATG----T-GT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTA-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTA
gi|95456 : TATCTATGAT--T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATA
gi|95457 : TATATATG----T-TT-T-A-----G-GG--A-CTATGTTTATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTCATAT
gi|95461 : TATATATG----T-TTCT-T-----G-AG--A-TTATG---ATTACGTTT-GACACA-TTG-TTGACTTTGCCAATTTATAT
gi|95462 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATA
gi|95463 : TGTATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-ATATG---ATTACGTTT-AACACA-ATG-TCTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95464 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTCACTTCGCCATTTTATAT
gi|95465 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-GA--A-CTACG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95467 : TATATATG----T-TT-T-TTTTTTG-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-GATACA-TTG-TTTACTTCGTCAATTTATAT
gi|95468 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-AG--A-CTATG---ATTACGTTT-AGCACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95470 : TGTATATG----T-TT-T-------G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAAATTCGCCAATTTATAT
gi|95471 : TATATATG----T-TT-TAT-----G-GG--A-CTATG---ATTACATTT-AATACA-CTA-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95474 : TGTATGTG----T-TT-T-T-----G-GGG-A-CTATG---ATTACGTTT-AATACA-TTG--TTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95475 : TATATATG----T-TT-T-T-----TTGG--A-CTATG---ATTACGATT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95477 : TATATATG----T-TT-T-G-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-CACACA-TTG-TTTACTTCGACAATGTATAT
gi|95482 : TATATATGA---T-TT-T-T-----T-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTATAT
gi|95483 : TATATATG----T-TT-T-T-----G-TG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95486 : TATATATG----T-TT-T-T-----C-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCATTTTAT
gi|95641 : ATATATG----T-TT-T-TCG---G-GG--A-TTATG---ATTACGTGTGAACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95647 : ATATATG----TAGT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTTGCCAATTTATAT
gi|95648 : ATAAATG----T-TT-T-TT----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACAAA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95649 : ATATATG----T-TT-T-T-----G-GGGGA-TTTTG---ATTACATTT-AACACA-TTT-TTAACTTCGTCAATTGATAT
gi|95650 : ATATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTTCGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATA
gi|95666 : TATATG----T-TTCT-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAACTTCGCCAATTTATAT
gi|95667 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT
gi|95668 : TATATGT---T-TT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATT-CGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95669 : TATATG----T-AT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95670 : TATATG----T-TT-T-C-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCTAATTTATAT
gi|95671 : TATATG----T-TT-T-T-----G-GG--A-TTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTAATTTCGCCAATTTATA
gi|95674 : TACATA----T-TT-T-T-----A-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCGCCAATTTATAT
gi|95715 : ATG----T-CT-T-T-----G-GG--A-CTATG---ATTACGTTT-AACACA-TTG-TTTACTTCACCAATTTATAT