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Reference ( gi|61354 )        : TTTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGCAT-A-----TTTT-T---------------------G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AAAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A---TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GA-G-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC--TT------TTT------T-G--TA----C------CA-CG--TGGC-G---ACG-C-GA---TTTC-ATT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---GC-----ATT-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--CTACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACACCGTAT
gi|61356                      : TTTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGCAT-A-----TTTT-T---------------------G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTT----G-AAA---AT------T-A-A----AAAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-A-TTTC---A-AAGATATC------A-ATATTA----A-T--A-TTGT--C-TAAT--A------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GA-G-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----TC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCCTTTT------TTT------T-G--TA----C------CA-CG--TGAC-A---CCG-C-GA---TCTC-ATT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---GC-----ATC-CG-A--ACT---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--CTACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
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gi|61365                      :  TTAAAGGA-TT-ACA-AAT-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGCAT-A-----CTTT-T---------------------G--TAAG-T-CAC---CTG-AAAAT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-C----ACAA-GC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GG-A-TTTC---A-AAGATATC------A-A---TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GA-G-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCA--TT------TTT------T-G--TA----C------CA-CG--TGAC-T---ACC-C-GA---TCTC-ATT----TTT-G-AAA---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---GC-----ATC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---CAT-ATG--CCACA-T-A----ACAA-TTTTT--AA--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-TT-TGAATTACA
gi|61366                      :  TTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-CAT-AAATT-CT-TGCAT-A-----TTTT-T---------------------G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AACA-TC--GT--AT-T------T-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A---TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GA-G-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC--TT------TTT------G-G--TA----C------CA-CG--TGAC-A---ACG-C-GA---TCTC-A--------A---------------------C-AA--CA--C--A---GA-----ATC-CG-A--GCG---A--TAATTT--A--T-T---TAT-ATG--CTACA-T-A----ACAT-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGCAA-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTATtgta
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Reference ( family-828 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AAAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAG-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT--T------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA--TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----A-TC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--CC-ACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
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gi|61358                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAAGGA-CT-ACA-AGC-TGC-CATTT-A----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAA-TAATG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT---G--TAAG-T-CAT---CTG-AGAGT-A--TTG--------TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AAAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T-------AT-T-T-A-TCT-GT-G--------GAG-T--------C-C-AC-A---------AA--G--AA-T-G----CC--ATTTT-------GA------ATA---G-CG-CA-GCCC-TT------TT--T------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA--TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----G-TC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A----C---TAT-ATG--CT-ACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
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gi|61360                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACA--TAAC-AATNCA--C--A---G-C-----A-TC-CA-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--TT-ACA-T-A----GCAA-TTTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCATA-TTTA-TT-TGAATTACATCGTATtncacagcatccaagcgatagtttatttatatgttacatagcaatttttagaatgagatgtgcatcatatttatttgaattacatcgtat
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gi|61367                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAAGGA-AT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT---G--TAAG-T-CAC---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTT-C----G-AAA---AT------T-A-C----ACAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--C------ATT-T------TAT-T-TTA-TTT-GT-G---------AG-T--------C---AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CCTTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT---------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATT---CTA--TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-GA--CA--T--A---G-C-----A-TA-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-AT---CC-ACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A------------------TA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
gi|61368                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAAGGA-TTTACA-AGAGTGC-C-TCTTATGA-C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-GAT-AA-CG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-T-CAC---CTG-ATAAT-G--ATA-----C--TTT--CA---G-AAA---AT------T-C-A----CACA-AC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-T-TTTC---A-AAGATATC------A---TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------GTT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAGGT--------C-C-AC-A---------AAT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-GG-CC-GCCC-TT------TT--T------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA--TC----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----ATTC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A----T---CAA-ATG--CC-ACA-T-A----ACAA---TTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-T-ATTTACATCGTAT
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gi|61360                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACA--TAAC-AATNCA--C--A---G-C-----A-TC-CA-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--TT-ACA-T-A----GCAA-TTTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCATA-TTTA-TT-TGAATTACATCGTATtncacagcatccaagcgatagtttatttatatgttacatagcaatttttagaatgagatgtgcatcatatttatttgaattacatcgtat
gi|61361                      : tttaaaggattacaagctgccattttactacatcacaatgaaataaatgcttgcatattttttcgaaaattangcatatttttgtaagtcatctaaaagtattagtaaactttttcgaaaattaaaaattcgtattcgatcgcgtttcaaagatatcaataacattgtctaattattttatttatttgtggagtccacaagtaaatgcccattttgaatagcgccgcccttttttatacatgtaccacgtgacaacgccatctcattttagaaggtaaataaatcaacacaacatccaagcgatggtttatctatatgttTTTAACGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----CCTTACAAACAATCAACAC-AAATAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------ATTA-----TTTT-T-G--TAAG-T-CATA--CTG-AA-GA-A--TTA-----T--TTTTT-----A-AAA---AT------T-A-A----AAAT-TC--AT--AT-T------C-GGA--TC---GC-G-TTTC---ACAAGATGTC------A-A-TA----TTC--A-TTGT--C-TAATGTT------ATT-T------TATCT-T-A-TTTTGT-G--------GAG-T--------C-C-ACGA---------AGT-A--AA-T-G----CC-AATTT--------GA------AAACCCG-CG-CC-GCCA-TT------CT--T------T-GGTTT----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-CC-GATC---TCA--TT----TTACG-AAC---G-AAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----A-TT-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--TCC---TAT-AAGGCCT-AC--T-A----ACAC-ATTTT--AGAAA-A--TGAGATGTGA-A-TCTTA-TTTA----TGAATTACATCGTA
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gi|61366                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-CAT-AAATT-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AACA-TC--GT--AT-T------T-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAG-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT--T------G-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA----------A---------------------C-AA--CA--C--A---G-A-----A-TC-CG-A--GCG---A--TAATTT--A--T-T---TAT-ATG--CT-ACA-T-A----ACAT-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGCAA-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
gi|61367                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAAGGA-AT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT---G--TAAG-T-CAC---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTT-C----G-AAA---AT------T-A-C----ACAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--C------ATT-T------TAT-T-TTA-TTT-GT-G---------AG-T--------C---AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CCTTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT---------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATT---CTA--TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-GA--CA--T--A---G-C-----A-TA-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-AT---CC-ACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A------------------TA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
gi|61368                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAAGGA-TTTACA-AGAGTGC-C-TCTTATGA-C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-GAT-AA-CG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-T-CAC---CTG-ATAAT-G--ATA-----C--TTT--CA---G-AAA---AT------T-C-A----CACA-AC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-T-TTTC---A-AAGATATC------A---TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------GTT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAGGT--------C-C-AC-A---------AAT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-GG-CC-GCCC-TT------TT--T------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA--TC----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----ATTC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A----T---CAA-ATG--CC-ACA-T-A----ACAA---TTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-T-ATTTACATCGTAT
gi|61369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAACGGA-TT-ACA-AGC--GCGCATTTTATATCC--TAC------TCT---C----TAA-AAT-AAATG-CTGTGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-TTCAT---CTG-AAAGA-A--TTA-----T--TTTTTT----TTAAA---AA------T-A-A----AAAA-TC--AT--AT--------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATGTC------A-A--A----T-C--A-TTGT--C-TAGT--T------TAT-T------TAT-----A-TTT-GT-G--------GAG-T--------CAC-AC-A---------AGT-A--AAATAG----CC-CATTTTT------GA------ACC---G-CG-CC-GCCAATT------CT--T------T-GC-TT----CCA-C---TG---AC-TTTTACG-C--GATC---TC---TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----A-TT-CGTA--GTCTTTA--TAGTTC-----T-T---AAT-AT----C-ACA-T-A----ACCACATTTTT-AG--A-A--TGAGATGTGA-A-TCTTA-TTTA-CT-GGAATTACATCGT
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .   .   .   .       .    .     .       .   .  .   .   .     .  .   .                      . .        . . .     . .  T      .     . .    .     .       .    .   .    .      . C         .  .   .   . .      . . .   .    . .    .   .        .      . .  .    . .  .    .  .    .  .        . .        . . . .   .  . .          . .        . .  . .           . .   . . .     .      .        .        .   .  .  .    .  .       .  .      . .   .      .  .   .    A       . .     .     .   .      . .   .         .     .  .   .  .  .   . .     .  .  . .    .   .       .  .  . .     .   .   .   . . .       .     .   .  . .           . .     .    .  .
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Reference ( family-828 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAAGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----C--TACA-----TCA---C-AA-TAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------AT-A-----TTTT-T-G--TAAG-T-CAT---CTG-AAAGT-A--TTA-----C--TTTTTC----G-AAA---AT------T-A-A----AAAA-TC--GT--AT-T------C-G-A--TC---GC-G-TTTC---A-AAGATATC------A-A-TA----A-C--A-TTGT--C-TAAT--T------ATT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAG-T--------C-C-AC-A---------AGT-A--AA-T-G----CC-CATTTT-------GA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT--T------T-G--TA----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-C--GATC---TCA--TT----TTA-G-AAC---GTAAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----A-TC-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--T-T---TAT-ATG--CC-ACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-A--TGAGATGTGC-A-TCTTA-TTTA-CT-TGAATTACATCGTAT
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gi|61361                      : tttaaaggattacaagctgccattttactacatcacaatgaaataaatgcttgcatattttttcgaaaattangcatatttttgtaagtcatctaaaagtattagtaaactttttcgaaaattaaaaattcgtattcgatcgcgtttcaaagatatcaataacattgtctaattattttatttatttgtggagtccacaagtaaatgcccattttgaatagcgccgcccttttttatacatgtaccacgtgacaacgccatctcattttagaaggtaaataaatcaacacaacatccaagcgatggtttatctatatgttTTTAACGGA-TT-ACA-AGC-TGC-CATTTTA----CCTTACAAACAATCAACAC-AAATAA-AAT-AAATG-CT-TGC---------------------ATTA-----TTTT-T-G--TAAG-T-CATA--CTG-AA-GA-A--TTA-----T--TTTTT-----A-AAA---AT------T-A-A----AAAT-TC--AT--AT-T------C-GGA--TC---GC-G-TTTC---ACAAGATGTC------A-A-TA----TTC--A-TTGT--C-TAATGTT------ATT-T------TATCT-T-A-TTTTGT-G--------GAG-T--------C-C-ACGA---------AGT-A--AA-T-G----CC-AATTT--------GA------AAACCCG-CG-CC-GCCA-TT------CT--T------T-GGTTT----CCA-CG--TG---AC-A---ACG-CC-GATC---TCA--TT----TTACG-AAC---G-AAACA--AATC-AA--CA--C--A---G-C-----A-TT-CG-A--GCG---A--TAGTTT--A--TCC---TAT-AAGGCCT-AC--T-A----ACAC-ATTTT--AGAAA-A--TGAGATGTGA-A-TCTTA-TTTA----TGAATTACATCGTA
gi|61362                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAAGGA-TTTACACAGCGTGC--ATTTTA----C--T---------CA---C-AC-TAATAAT-AAATG-GT-TGC---------------------AT-A-----TTTTGT-G--AGAG-TGCATTG-CGG-AAGGT-AATTTA-----C--TTTTTA----G-AAA---AT------T-A-A----AAA--TC--GT--AT-T--------G-A--T----GC-G-TTAC---A-AAGATATC------A-ACTA----A-C--AGTTGT--C-TAAT--T------ACT-T------TAT-T-T-A-TTT-GT-G--------GAG-T--------C---AC-A---------AGT-A--AA-TTG----CC-CATTTTTGC----AA------ATA---G-CG-CC-GCCC-TT------TT--T------G-A--TA----C-A-CG--TG---A--G---ACG-C--GATC---TTA--TT----TTA-G-AAC---GTAA-CA--AAT--AA--CA--C--A---G-C-----A-TC-CG-A--GCG---AACTA-TTT--A--T-T---TAT-ATG--CCTACA-T-A----ACAA-ATTTT--AG--A-AACTGGAGTGTGC-C-TCTTA-TTTA-CTCTGTCTTACATCGTAT
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