lowQualScore                  :                   11111      111                                                                                                                                                 111111                        
lowQualScore                  :        44      2  00000      333 4444  2 2 4  88 22 4444    333   55 333 333   2 2 2 2   2 2 22 88 55555 2 2   2 22  77777  88888 2  44     1 77  1   1  22  5555 2 22  1 1 55 1 444444   1  1  3  444 1 1     
lowQualScore                  :        ..      .  .....      ... ....  . . .  .. .. ....    ...   .. ... ...   . . . .   . . .. .. ..... . .   . ..  .....  ..... .  ..     . ..  .   .  ..  .... . ..  . . .. . ......   .  .  .  ... . .     
lowQualScore                  :        22      7  33333      000 2222  4 1 2  33 99 5555    777   00 777 777   1 1 1 1   1 1 99 88 66666 2 1   1 99  44444  22222 1  77     7 33  7   7  33  4444 8 33  7 7 66 0 777777   7  7  3  888 7 8     
consensus                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTGCCT--G-TA-C-T-GAN-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-GG-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
Reference ( gi|118034 )       : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--G-TA-C-T-GAC-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-AG-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118035                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--G-TA-C-T-GAC-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-AG-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----A-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118037                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--G-TA-C-TGGAC-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-A------G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-TA-AT-TCG-AA---A---CT-A--AT-A-T--CC----T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118036                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTC--T--G-TA-C-T-GAC-T-------CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-AG-----G-T-ATT-A---A-----CA-----A-TG-G-CGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CGC---TA-TCG--A-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118038                     : TTTTTTT--TGTAAA-TG-----TTTAGTGC-T--G-TA-C-T-GATGT--T----CTGT---TTTCAA---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-GG-----G-TTATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G--TATT
gi|118039                     : TTTATAT--TGTAAA-CG-----TCTGGTGCCT--T-TA-C-T-AAG-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-
gi|118040                     :  TTATAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTGC-T--G-TA-C-G-AAG-G--T----CTGT---TT---A---C--------------CA---A--C-GG-----G-T-ATT-A--GA-----TATTGAAG-TG-ATCCGA-T--AT-TCG-AA--TA----TAA--AT-A-T--CCA---T--TAG-AA-TA-TT---C-G-CTATTcacaggcacttggggcatg
gi|118041                     :   TGTATGTTGTAAA-TA-----TCTAGTGCCT--G-TA-C-T-GAC-T--A----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-G--T-GG-----A-T-ATT-A--AA-----CAC----G-CA-ACAGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CAAA--AT-A-T--CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-ATGTT
gi|118042                     :   TATAT--TGTAAA-TG-----TCTAGTGTCT--G-TA-CAT-GAG-T--T----CTGT---T-C--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--T--G-----G-T-AAT-A--TA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CT-A--AT-A-T--CCA-------CA-AA-TA--T---C-G-CTATT
gi|118043                     :   TATAT--TGTGAA-CAACGTCTCTAGTGACA--T-TA-C-T-GAG---------CTGT---TTC--A---C---AG--A-T-TGTCA-T-A--C--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----GGTG-ACTGAAATGAAT-TCG-AA--TA---ATAA--AT-A-T--CCA---TC-TCG-AACTA-TT---CGG-CTATT
gi|118044                     :     TAT--TGTAAAGCG-----TCTAGTAC-T--G-T--C-T-GAG-T--T----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-A--C-GG-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACTGAA-T--AT-TCG-AA--TG---CTAA--TT-A----CCA---T--TCA-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118045                     :     TAT--T-TAAA-TA------CTAGTGCCT-----A-C-T-GAG-T--T----CTGT---TTC--A---TCAGAGC-A-T-T-TCA-T-A--CTGG-----G-T-ATT-ACCGATTACACAT----G-TA-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--ATCATT--CCA---T--TCT-AA-TATTT---C-GCCTATT
gi|118046                     :     TAT--TGTAAA-CGTC---TCTAGTGACTAGA-CA-C-T-GAG-T--T----CTGTTTGTTCA-A---C---AGC-AGT-T-TCA-T-ACGC-AG-----T-T-GTTCA--TAT----CAT----G-TG-ACCGAA-T--ATGTCG-AA--TAAATCTAA--AT-A-T--CCA---T--T-G-AA-TATTT---C-G-CTA
gi|118047                     :     TAT--T-TAAA--------TCTA--TCCT--A-TA-C-T-GA--T--T----CTGT---TTC--A---C----GC-A-CGT-TCA-T-A--C-AG-----G-T-ATT-A--GA------AC----G-TG-ACC-AA-TA-AT-TCG-AAATCG---CT-A--AT-A-TC-CCA---TGCTCG-AA-TA-TTC--C-G-CTATT
gi|118048                     :            TAAA-CA-----TCTAGTGCCT--G-TA-C-C-GAG-T--T----CTGT---TTA--A---C---AGT-A-T-T-TCA-TTA--T-GG-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T---CA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118049                     :                -CG-----TCTAGT------GATAAC-T-GAT-T--T------GT---TTT--AACCC---AGC-A-T-T--AA-T-A--C-GG-----AAT-ACT-A--TA-----CAT----G-TG-ACAGA--T--AT-T---GA--TA---CCAA--AT-A-T--C-A---TG-TCGGAA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118051                     :                                CT--G-TA-C-TTGAG-T--T----CAGT---T-C--A---C---AGCCA-T-T-TAA-C-G--C--G-----G-T-ATT-A--TA-----CAT----G-TGCACCGAA-TT-AT-TCGCAA--TA---CTAA--AT-A-T--C-A---G--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118050                     :                                   agtga-C-T-GAC-GAGT----CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-T-A-T-A--G-GGTATCAG-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAT-A--AT-TCG-A---TA---CTAA--AT-A-TT-CCA---T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118052                     :                                   ctaatgc-T-GAC-T--T----GATT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TAACT-A--C-AG-----G-T-ATT-A--GA-----CAC------TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AC--AA---CT-A--AT-A-T--CCA---TACTCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118053                     :                                          -T-GAC-T--TAGTCCTGT---TTC--A--------GC-T-T-T-TCA-T-A--C-GG-----G-T-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTANCCAT-A-TGGGTA---T--TAG-AA-TA-
gi|118054                     :                                                                                                            -ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTAA--AT-T-T--CCA---T--TCA-AA-TC-CTCAAC-A-CTATT
gi|118035                     :                                                                                                                                         CGAA-T--AT-TCG-AA--TG------G--AT-A-T--TTAGTAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-
gi|118048                     :                                                               tttgtattgtaaacgtctagtccctgtactgacttctgtttcacagcatttcatacaggtattagacacatggcCGAA-T--AT-TCG-AA--TG---------AT-A-T--TTAGTAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ctatt
gi|118044                     :                                                                       taaacatctagtgcctgtaccgagttctgtttaacagtatttcattatgggtattagacacgtgacCGAA-T--AT-TTG-AA--TG---GTAA--TT-A-G--C-A---T--TCG-AA-TA-TT---C-ctatt
gi|118038                     :                                                                   tattgtaaagcgtctagtactgtctgagttctgtttcacagcatttcatacgggtattagacatgtgactCGAA-T--AT-TCG-AA--TG------G--AT-A-T--TTAGTAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ctatt
gi|118052                     :                                                            ttttttttgtaaatgtttagtgctgtactgatgttctgttttcaacagcatttcatacgggttattagacatgtgacCGAA-T--AT-TCG-AG--TA----TGG--AT-A-T--TAG---TTGTCG-AA-TA-TT---C-G-tatt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                            11                        
lowQualScore                  :        33      2  99999      0   33   2 2 4  55      333   44 333 333   2 2 2 2   2 2  4444 5555555 2   2 22  77777  77777 2  2      2 88  2   2  22  333    22  2 2 66    11   2  2  4  555 2 2     
lowQualScore                  :        ..      .  .....      .   ..   . . .  ..      ...   .. ... ...   . . . .   . .  .... ....... .   . ..  .....  ..... .  .      . ..  .   .  ..  ...    ..  . . ..    ..   .  .  .  ... . .     
lowQualScore                  :        99      5  77777      6   11   1 1 2  22      555   88 555 555   0 0 0 0   0 0  4444 6666666 0   0 88  00000  22222 0  0      0 88  0   0  88  555    88  0 0 88    55   0  0  0  888 1 1     
consensus                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTGCCT--GTA-C-T-GAG-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
Reference ( family-826 )      : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTGCCT--GTA-C-T-GAN-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118034                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--GTA-C-T-GAC-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118035                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--GTA-C-T-GAC-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----A-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118036                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGT--CT--GTA-C-T-GAC-T-CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A---A-----CA-----A-TG-G-CGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CGCTA-TCG--A-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118037                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTCCCT--GTA-C-TGGAC-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC----A-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-TA-AT-TCG-AA---A---CT-A--AT-A-T--CC-T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118038                     : TTTTTTT--TGTAAA-TG-----TTTAGTGC-T--GTA-C-T-GATGTTCTGT---TTTCAA---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-TTATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G--TATT
gi|118039                     : TTTATAT--TGTAAA-CG-----TCTGGTGCCT--TTA-C-T-AAG-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-
gi|118040                     :  TTATAT--TGTAAA-CG-----TCTAGTGC-T--GTA-C-G-AAG-GTCTGT---TT---A---C--------------CA---AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----TATTGAAG-TG-ATCCGA-T--AT-TCG-AA--TA----TAA--AT-A-T--CCAT--TAG-AA-TA-TT---C-G-CTATTcacaggcacttggggcatg
gi|118041                     :   TGTATGTTGTAAA-TA-----TCTAGTGCCT--GTA-C-T-GAC-TACTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-GT-G--G-----A-T-ATT-A--AA-----CAC----G-CA-ACAGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CAAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ATGTT
gi|118042                     :   TATAT--TGTAAA-TG-----TCTAGTGTCT--GTA-CAT-GAG-TTCTGT---T-C--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AT----G-----G-T-AAT-A--TA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CT-A--AT-A-T--CCA----CA-AA-TA--T---C-G-CTATT
gi|118043                     :   TATAT--TGTGAA-CAACGTCTCTAGTGACA--TTA-C-T-GAG---CTGT---TTC--A---C---AG--A-T-TGTCA-T-AC-G--G-------T-ATT-A--GA-----CAT----GGTG-ACTGAAATGAAT-TCG-AA--TA---ATAA--AT-A-T--CCATC-TCG-AACTA-TT---CGG-CTATT
gi|118044                     :     TAT--TGTAAAGCG-----TCTAGTAC-T--GT--C-T-GAG-TTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACTGAA-T--AT-TCG-AA--TG---CTAA--TT-A----CCAT--TCA-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118045                     :     TAT--T-TAAA-TA------CTAGTGCCT----A-C-T-GAG-TTCTGT---TTC--A---TCAGAGC-A-T-T-TCA-T-ACTG--G-----G-T-ATT-ACCGATTACACAT----G-TA-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--ATCATT--CCAT--TCT-AA-TATTT---C-GCCTATT
gi|118046                     :     TAT--TGTAAA-CGTC---TCTAGTGACTAGACA-C-T-GAG-TTCTGTTTGTTCA-A---C---AGC-AGT-T-TCA-T-AC-GCAG-----T-T-GTTCA--TAT----CAT----G-TG-ACCGAA-T--ATGTCG-AA--TAAATCTAA--AT-A-T--CCAT--T-G-AA-TATTT---C-G-CTA
gi|118047                     :     TAT--T-TAAA--------TCTA-T-CCT--ATA-C-T-GA--TTCTGT---TTC--A---C----GC-A-CGT-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA------AC----G-TG-ACC-AA-TA-AT-TCG-AAATCG---CT-A--AT-A-TC-CCATGCTCG-AA-TA-TTC--C-G-CTATT
gi|118048                     :            TAAA-CA-----TCTAGTGCCT--GTA-C-C-GAG-TTCTGT---TTA--A---C---AGT-A-T-T-TCA-TTAT-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T---CAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118049                     :                -CG-----TCTAGTG-----ATAAC-T-GAT-TT--GT---TTT--AACCC---AGC-A-T-T--AA-T-AC-G--G-----AAT-ACT-A--TA-----CAT----G-TG-ACAGA--T--AT-T---GA--TA---CCAA--AT-A-T--C-ATG-TCGGAA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118050                     :                         CTAATGCCT--G-A-C---GAG-T-CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-T-A-T-AG-G--GTATCAG-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAT-A--AT-TCG-A---TA---CTAA--AT-A-TT-CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118051                     :                           AGTGACT--GTA-C-TTGAG-TTCAGT---T-C--A---C---AGCCA-T-T-TAA-C-GC-G--G-------T-ATT-A--TA-----CAT----G-TGCACCGAA-TT-AT-TCGCAA--TA---CTAA--AT-A-T--C-AG--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118052                     :                                                     T---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TAACT-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC------TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AC--AA---CTAA---T-A-T--CCATACTCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118053                     :                             tgacttgatA-C-T-TAG-TCCTGT---TTC--A--------GC-T-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTANCCAT-A-TGGGTAT--TAG-AA-TA-
gi|118054                     :                                                                                                   tg-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTAA--AT-T-T--CCAT--TCA-AA-TC-CTCAAC-A-CTATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              11                        
lowQualScore                  :        33      2  66666   33   0    33  2 2 4  55      333   44 333 333   2 2 2 2   2 2  4444 5555555 2   2 22  77777  77777 2  2      2 88  2   2  22  333    22  2 2 66    11   2  2  4  555 2 2     
lowQualScore                  :        ..      .  .....   ..   .    ..  . . .  ..      ...   .. ... ...   . . . .   . .  .... ....... .   . ..  .....  ..... .  .      . ..  .   .  ..  ...    ..  . . ..    ..   .  .  .  ... . .     
lowQualScore                  :        99      5  22222   11   6    11  1 1 2  33      555   88 555 555   0 0 0 0   0 0  4444 6666666 0   0 88  00000  22222 0  0      0 88  0   0  88  555    88  0 0 88    55   0  0  0  888 1 1     
consensus                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
Reference ( family-826 )      : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118034                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118035                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----A-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118036                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGT--CTG--TA-C-T-GA--CTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A---A-----CA-----A-TG-G-CGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CGCTA-TCG--A-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118037                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-TGGA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC----A-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-TA-AT-TCG-AA---A---CT-A--AT-A-T--CC-T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118038                     : TTTTTTT--TGTAAA-TG-----TTT--AGTGC-TG--TA-C-T-GATGTTCTGT---TTTCAA---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-TTATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G--TATT
gi|118039                     : TTTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--GGTGCCTT--TA-C-T-AA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-
gi|118040                     :  TTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGC-TG--TA-C-G-AA-GGTCTGT---TT---A---C--------------CA---AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----TATTGAAG-TG-ATCCGA-T--AT-TCG-AA--TA----TAA--AT-A-T--CCAT--TAG-AA-TA-TT---C-G-CTATTcacaggcacttggggcatg
gi|118041                     :   TGTATGTTGTAAA-TA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-CTACTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-GT-G--G-----A-T-ATT-A--AA-----CAC----G-CA-ACAGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CAAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ATGTT
gi|118042                     :   TATAT--TGTAAA-TG-----TCT--AGTGTCTG--TA-CAT-GA-GTTCTGT---T-C--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AT----G-----G-T-AAT-A--TA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CT-A--AT-A-T--CCA----CA-AA-TA--T---C-G-CTATT
gi|118043                     :   TATAT--TGTGAA-CAACGTCTCT--AGTGACAT--TA-C-T-GA-G--CTGT---TTC--A---C---AG--A-T-TGTCA-T-AC-G--G-------T-ATT-A--GA-----CAT----GGTG-ACTGAAATGAAT-TCG-AA--TA---ATAA--AT-A-T--CCATC-TCG-AACTA-TT---CGG-CTATT
gi|118044                     :     TAT--TGTAAAGCG-----TCT--AGTAC-TG--T--C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACTGAA-T--AT-TCG-AA--TG---CTAA--TT-A----CCAT--TCA-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118045                     :     TAT--T-TAAA-TA------CT--AGTGCCT----A-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---TCAGAGC-A-T-T-TCA-T-ACTG--G-----G-T-ATT-ACCGATTACACAT----G-TA-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--ATCATT--CCAT--TCT-AA-TATTT---C-GCCTATT
gi|118046                     :     TAT--TGTAAA-CG-----TCTCTAGTGACTAGACA-C-T-GA-GTTCTGTTTGTTCA-A---C---AGC-AGT-T-TCA-T-AC-GCAG-----T-T-GTTCA--TAT----CAT----G-TG-ACCGAA-T--ATGTCG-AA--TAAATCTAA--AT-A-T--CCAT--T-G-AA-TATTT---C-G-CTA
gi|118047                     :     TAT--T-TAAA--------TCT--A-T-CCTA--TA-C-T-GA--TTCTGT---TTC--A---C----GC-A-CGT-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA------AC----G-TG-ACC-AA-TA-AT-TCG-AAATCG---CT-A--AT-A-TC-CCATGCTCG-AA-TA-TTC--C-G-CTATT
gi|118048                     :            TAAA-CA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-C-GA-GTTCTGT---TTA--A---C---AGT-A-T-T-TCA-TTAT-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T---CAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118049                     :                -CG-----TCT--AGTG---A--TAAC-T-GA---TTTGT---TTT--AACCC---AGC-A-T-T--AA-T-AC-G--G-----AAT-ACT-A--TA-----CAT----G-TG-ACAGA--T--AT-T---GA--TA---CCAA--AT-A-T--C-ATG-TCGGAA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118050                     :                         CT--AATGCCTG---A-C---GA-GT-CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-T-A-T-AG-G--GTATCAG-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAT-A--AT-TCG-A---TA---CTAA--AT-A-TT-CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118051                     :                           --AGTGACTG--TA-C-TTGA-GTTCAGT---T-C--A---C---AGCCA-T-T-TAA-C-GC-G--G-------T-ATT-A--TA-----CAT----G-TGCACCGAA-TT-AT-TCGCAA--TA---CTAA--AT-A-T--C-AG--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118052                     :                                                       T---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TAACT-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC------TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AC--AA---CTAA---T-A-T--CCATACTCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118053                     :                               tgacttgatA-C-T-TA-GTCCTGT---TTC--A--------GC-T-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTANCCAT-A-TGGGTAT--TAG-AA-TA-
gi|118054                     :                                                                                                     tg-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTAA--AT-T-T--CCAT--TCA-AA-TC-CTCAAC-A-CTATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              11                        
lowQualScore                  :        33      2  66666   33   0    33  2 2 4  55      333   44 333 333   2 2 2 2   2 2  4444 5555555 2   2 22  77777  77777 2  2      2 88  2   2  22  333    22  2 2 66    11   2  2  4  555 2 2     
lowQualScore                  :        ..      .  .....   ..   .    ..  . . .  ..      ...   .. ... ...   . . . .   . .  .... ....... .   . ..  .....  ..... .  .      . ..  .   .  ..  ...    ..  . . ..    ..   .  .  .  ... . .     
lowQualScore                  :        99      5  22222   11   6    11  1 1 2  33      555   88 555 555   0 0 0 0   0 0  4444 6666666 0   0 88  00000  22222 0  0      0 88  0   0  88  555    88  0 0 88    55   0  0  0  888 1 1     
consensus                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
Reference ( family-826 )      : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118034                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118035                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----A-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118036                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGT--CTG--TA-C-T-GA--CTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A---A-----CA-----A-TG-G-CGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CGCTA-TCG--A-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118037                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-TGGA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC----A-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-TA-AT-TCG-AA---A---CT-A--AT-A-T--CC-T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118038                     : TTTTTTT--TGTAAA-TG-----TTT--AGTGC-TG--TA-C-T-GATGTTCTGT---TTTCAA---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-TTATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G--TATT
gi|118039                     : TTTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--GGTGCCTT--TA-C-T-AA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-
gi|118040                     :  TTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGC-TG--TA-C-G-AA-GGTCTGT---TT---A---C--------------CA---AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----TATTGAAG-TG-ATCCGA-T--AT-TCG-AA--TA----TAA--AT-A-T--CCAT--TAG-AA-TA-TT---C-G-CTATTcacaggcacttggggcatg
gi|118041                     :   TGTATGTTGTAAA-TA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-CTACTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-GT-G--G-----A-T-ATT-A--AA-----CAC----G-CA-ACAGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CAAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ATGTT
gi|118042                     :   TATAT--TGTAAA-TG-----TCT--AGTGTCTG--TA-CAT-GA-GTTCTGT---T-C--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AT----G-----G-T-AAT-A--TA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CT-A--AT-A-T--CCA----CA-AA-TA--T---C-G-CTATT
gi|118043                     :   TATAT--TGTGAA-CAACGTCTCT--AGTGACAT--TA-C-T-GA-G--CTGT---TTC--A---C---AG--A-T-TGTCA-T-AC-G--G-------T-ATT-A--GA-----CAT----GGTG-ACTGAAATGAAT-TCG-AA--TA---ATAA--AT-A-T--CCATC-TCG-AACTA-TT---CGG-CTATT
gi|118044                     :     TAT--TGTAAAGCG-----TCT--AGTAC-TG--T--C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACTGAA-T--AT-TCG-AA--TG---CTAA--TT-A----CCAT--TCA-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118045                     :     TAT--T-TAAA-TA------CT--AGTGCCT----A-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---TCAGAGC-A-T-T-TCA-T-ACTG--G-----G-T-ATT-ACCGATTACACAT----G-TA-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--ATCATT--CCAT--TCT-AA-TATTT---C-GCCTATT
gi|118046                     :     TAT--TGTAAA-CG-----TCTCTAGTGACTAGACA-C-T-GA-GTTCTGTTTGTTCA-A---C---AGC-AGT-T-TCA-T-AC-GCAG-----T-T-GTTCA--TAT----CAT----G-TG-ACCGAA-T--ATGTCG-AA--TAAATCTAA--AT-A-T--CCAT--T-G-AA-TATTT---C-G-CTA
gi|118047                     :     TAT--T-TAAA--------TCT--A-T-CCTA--TA-C-T-GA--TTCTGT---TTC--A---C----GC-A-CGT-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA------AC----G-TG-ACC-AA-TA-AT-TCG-AAATCG---CT-A--AT-A-TC-CCATGCTCG-AA-TA-TTC--C-G-CTATT
gi|118048                     :            TAAA-CA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-C-GA-GTTCTGT---TTA--A---C---AGT-A-T-T-TCA-TTAT-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T---CAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118049                     :                -CG-----TCT--AGTG---A--TAAC-T-GA---TTTGT---TTT--AACCC---AGC-A-T-T--AA-T-AC-G--G-----AAT-ACT-A--TA-----CAT----G-TG-ACAGA--T--AT-T---GA--TA---CCAA--AT-A-T--C-ATG-TCGGAA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118050                     :                         CT--AATGCCTG---A-C---GA-GT-CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-T-A-T-AG-G--GTATCAG-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAT-A--AT-TCG-A---TA---CTAA--AT-A-TT-CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118051                     :                           --AGTGACTG--TA-C-TTGA-GTTCAGT---T-C--A---C---AGCCA-T-T-TAA-C-GC-G--G-------T-ATT-A--TA-----CAT----G-TGCACCGAA-TT-AT-TCGCAA--TA---CTAA--AT-A-T--C-AG--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118052                     :                                                       T---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TAACT-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC------TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AC--AA---CTAA---T-A-T--CCATACTCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118053                     :                               tgacttgatA-C-T-TA-GTCCTGT---TTC--A--------GC-T-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTANCCAT-A-TGGGTAT--TAG-AA-TA-
gi|118054                     :                                                                                                     tg-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTAA--AT-T-T--CCAT--TCA-AA-TC-CTCAAC-A-CTATT


blockSeqs                     :        GT      G  ACGTC   CT        GA  A A G  TG      TTG   CA ACC CAG   C G G G   C T  GCA  TATCAG  T   C CC  TTACA  TTGAA G  C      A GA  G   C  AT  AAT    CC  C T GG    GC   G  C  T  CAA G C
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . T  C       .     A  .   .     . . . .   . .  TG   AA      .   . .   T      C     .  .      . A   .   .  .   .      .   . . C     AC   .  .  T  C   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  C       .     .  .   .     . . . .   . .  A    G       .   . .   .      C     .  .      . A   .   .  .   .      .   . . T     A    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  A    G       .   . .   .      T     .  .      . T   .   .  .   .      .   . . .     C    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      C     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     G    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  C       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    A       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  A    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      C     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    T       .   . .   .      C     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :        .       .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                .  .       .         .   . . .  G       .     .  .   .     . . . .   . .  A    G       .   . .   .      T     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                           .         .   . . .  .       .     .  .   .     . . . .   . .  G    G       .   . .   .      C     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                           .         .   . . .  .       .     .  .   .     . . . .   . .  .    .       .   . .   .      A     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                                         . . .  .       .     .  .   .     . . . .   . .  .    .       .   . .   .      A     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .  .   . .
blockSeqs                     :                                                        .     .  .   .     . . . .   . .               .   . .   .      .     .  .      . .   .   .  .   .      .   . . .     .    .  .  .         


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
finalCons                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              11                        
lowQualScore                  :        33      2  66666   33   0    33  2 2 4  55      333   44 333 333   2 2 2 2   2 2  4444 5555555 2   2 22  77777  77777 2  2      2 88  2   2  22  333    22  2 2 66    11   2  2  4  555 2 2     
lowQualScore                  :        ..      .  .....   ..   .    ..  . . .  ..      ...   .. ... ...   . . . .   . .  .... ....... .   . ..  .....  ..... .  .      . ..  .   .  ..  ...    ..  . . ..    ..   .  .  .  ... . .     
lowQualScore                  :        99      5  22222   11   6    11  1 1 2  33      555   88 555 555   0 0 0 0   0 0  4444 6666666 0   0 88  00000  22222 0  0      0 88  0   0  88  555    88  0 0 88    55   0  0  0  888 1 1     
consensus                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
Reference ( family-826 )      : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118034                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118035                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-T-GA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----A-TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118036                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGT--CTG--TA-C-T-GA--CTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A---A-----CA-----A-TG-G-CGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CGCTA-TCG--A-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118037                     : TTTGTAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTCCCTG--TA-C-TGGA-CTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC----A-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-GCCGAA-TA-AT-TCG-AA---A---CT-A--AT-A-T--CC-T--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118038                     : TTTTTTT--TGTAAA-TG-----TTT--AGTGC-TG--TA-C-T-GATGTTCTGT---TTTCAA---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-TTATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G--TATT
gi|118039                     : TTTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--GGTGCCTT--TA-C-T-AA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-
gi|118040                     :  TTATAT--TGTAAA-CG-----TCT--AGTGC-TG--TA-C-G-AA-GGTCTGT---TT---A---C--------------CA---AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----TATTGAAG-TG-ATCCGA-T--AT-TCG-AA--TA----TAA--AT-A-T--CCAT--TAG-AA-TA-TT---C-G-CTATTcacaggcacttggggcatg
gi|118041                     :   TGTATGTTGTAAA-TA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-T-GA-CTACTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-GT-G--G-----A-T-ATT-A--AA-----CAC----G-CA-ACAGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CAAA--AT-A-T--CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-ATGTT
gi|118042                     :   TATAT--TGTAAA-TG-----TCT--AGTGTCTG--TA-CAT-GA-GTTCTGT---T-C--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AT----G-----G-T-AAT-A--TA-----CAT----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CT-A--AT-A-T--CCA----CA-AA-TA--T---C-G-CTATT
gi|118043                     :   TATAT--TGTGAA-CAACGTCTCT--AGTGACAT--TA-C-T-GA-G--CTGT---TTC--A---C---AG--A-T-TGTCA-T-AC-G--G-------T-ATT-A--GA-----CAT----GGTG-ACTGAAATGAAT-TCG-AA--TA---ATAA--AT-A-T--CCATC-TCG-AACTA-TT---CGG-CTATT
gi|118044                     :     TAT--TGTAAAGCG-----TCT--AGTAC-TG--T--C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACTGAA-T--AT-TCG-AA--TG---CTAA--TT-A----CCAT--TCA-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118045                     :     TAT--T-TAAA-TA------CT--AGTGCCT----A-C-T-GA-GTTCTGT---TTC--A---TCAGAGC-A-T-T-TCA-T-ACTG--G-----G-T-ATT-ACCGATTACACAT----G-TA-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--ATCATT--CCAT--TCT-AA-TATTT---C-GCCTATT
gi|118046                     :     TAT--TGTAAA-CG-----TCTCTAGTGACTAGACA-C-T-GA-GTTCTGTTTGTTCA-A---C---AGC-AGT-T-TCA-T-AC-GCAG-----T-T-GTTCA--TAT----CAT----G-TG-ACCGAA-T--ATGTCG-AA--TAAATCTAA--AT-A-T--CCAT--T-G-AA-TATTT---C-G-CTA
gi|118047                     :     TAT--T-TAAA--------TCT--A-T-CCTA--TA-C-T-GA--TTCTGT---TTC--A---C----GC-A-CGT-TCA-T-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA------AC----G-TG-ACC-AA-TA-AT-TCG-AAATCG---CT-A--AT-A-TC-CCATGCTCG-AA-TA-TTC--C-G-CTATT
gi|118048                     :            TAAA-CA-----TCT--AGTGCCTG--TA-C-C-GA-GTTCTGT---TTA--A---C---AGT-A-T-T-TCA-TTAT-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC----G-TG-ACCGAA-T--AT-TCG-AA--TA---CTAA--AT-A-T---CAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118049                     :                -CG-----TCT--AGTG---A--TAAC-T-GA---TTTGT---TTT--AACCC---AGC-A-T-T--AA-T-AC-G--G-----AAT-ACT-A--TA-----CAT----G-TG-ACAGA--T--AT-T---GA--TA---CCAA--AT-A-T--C-ATG-TCGGAA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118050                     :                         CT--AATGCCTG---A-C---GA-GT-CTGT---TTC--A---C---AGC-A-T-T-T-A-T-AG-G--GTATCAG-T-ATT-A--GA-----CAT----G-TG-ACCGAT-A--AT-TCG-A---TA---CTAA--AT-A-TT-CCAT--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118051                     :                           --AGTGACTG--TA-C-TTGA-GTTCAGT---T-C--A---C---AGCCA-T-T-TAA-C-GC-G--G-------T-ATT-A--TA-----CAT----G-TGCACCGAA-TT-AT-TCGCAA--TA---CTAA--AT-A-T--C-AG--TCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118052                     :                                                       T---TTC--A---C---AGC-A-T-T-TAACT-AC-A--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAC------TG-GCCGAA-T--AT-TCG-AC--AA---CTAA---T-A-T--CCATACTCG-AA-TA-TT---C-G-CTATT
gi|118053                     :                               tgacttgatA-C-T-TA-GTCCTGT---TTC--A--------GC-T-T-T-TCA-T-AC-G--G-----G-T-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTANCCAT-A-TGGGTAT--TAG-AA-TA-
gi|118054                     :                                                                                                     tg-ATT-A--GA-----CAA----G-TG-ACCAAA-T--AT-TCA-AA--TA---CTAA--AT-T-T--CCAT--TCA-AA-TC-CTCAAC-A-CTATT