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lowQualScore                  :      .  .   .........    .  .  .   . ......  .   ..  ...   ....... ... ...            .  .......     .  .....  .     ............................................      ...   .......................................................................... .  ...   .  .. .  .       .      .. .   .....   .....         ... .    ..      ..                   .    .     
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Reference ( gi|25970 )        : AGGTA-GC-ACT-----GCT-GGAG-ACAGGGTGA-G------AAAGGC-GGG---TCT--CGC-TT-A-C-C-ACCTTAGAACGCTGG--CGTC-CGTTCGGG----TTT-GGGCA---CTG-----AATGTTT-T--------AC---T--AGG---GCCCCCCA---GTG--C--------ACCC--------------C--------------A----------AA--CTG--GG-----G--C-AC---TGGGCGA-C-TC-CCCAGTTACCCCAC--A-AAA-A---TTC-AGC-ATGCGGCCGCT-T-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
gi|25971                      : AGGTA-GC-ACT-----GCA-GGAG-ACAGGGTGA-G------AAAGGC-GGG---TCT--CGA-TT-A-C---ATCTTAGAACGCTGG--CGTC-CGTTCGGG----TT--GGGCA---CTG-----AATGTTT-T--------AC---T--AGG---GCCCC-CA---GTG--C--------ACCC--------------C--------------A----------AA--CTG--GG-----G--C-AC---TGGGCGA-C-TC-TCCAGTTACCCCAC--A-AAA-A---TTC-AGC-ATGCGGCCGAT-T-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
gi|25972                      : AGGTA-GCCACT-----GCA-GGAG-ACAGGGTGA-G------AAAGGC-GGG---TCT--CGA-TT-A-C-A-TCCTTAGAACGCTGG--CGTC-CGTTCGGG-----TT-GGGCA---CTG-----AATGTTT-T--------AC---T--AGG---G-CCCCCA---GTG--C--------ACCC--------------C--------------A----------AA--CTG--GG-----G--C-AC---TGGGCGA-C-TCTCCCAGTTACCCCACA-A-AAA-A---TTC-AGC-ATGCGGCCGAT-T-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTATCCTGT-TATTT
gi|25973                      : AGGTA-GC-ACT-----GCA-GCAG-ACAGGGTGA-G------AAGGTT-GGG---TTT--CGC-TT-A-C-T-TCCTTAGAACGCTGG--CGTC-CGTTCAGG----TTT-GGACA---CTG-----AATGTTT-T--------AC---T--TGG---GCCCTCCA---GTG--T--------ACTC--------------CTTACAAGCTAAGTTA----------AA--CTG--TA-----G--C-AG---TGGGCGA-C-TC-CCCAGTTATTCCAT--A-AAA-A---ATC-ATC-ATGCGGCCGATAC-TTGC--CCATTT--ATCGCTATCCCGAATGTAT-TCGTATAATT
gi|25975                      : AGGTA-GC-ACT-------TAGGAG-ACAGG-CGA-G------A--GGT-AGG---CCT--CAC-CT-G-C-CCACCTTAGAACGCGGG--GACT-CGTTC-AG----CTT-GGAT----CT-------ATAGCT-C--------ACA--T--AAG-----CCCCCA---GTG--C--------TCCC--------------CTACGGTGTGTAGTTA----------AA--TT---GC-----T--C-AC---TGGTCGG---TT-CCCAGTTCCCCCAC--A-AAATT---TTC---T-ATGCGACCATT-T-
gi|25977                      : AGGTA-CC-ACTT----AC---GAG-ACAGG-CGA-G------AAGGGC-AGG---TCT--CAT-CT-C-C-C-ACCTTAGAACGC-GG--TGACTCGTTTAGG----TTT-GAGAAT--CT-------ATGCTGAT--------AT---T--AAC---GTCCCCTAC--GTGGTT--------A-GT--------------C--------------A----------AA--TTG--GAC----T--C-AC---TGGTCAG-C-TC-CCCAGCTTCGTTAC--A-AAA-A---
gi|25974                      : AGGTAAGC-ACT-----GCA-GGAG-ACAGG-TGA-G------AAGGGC-AGG---TCT--CGC--T-A-C-C-TCCTTAGAACGCTGG--TG---CGT--GGC----TTT-
gi|25976                      : AGGTA-GT-ACT-------TAGGAA-ACCGGGCGA-G------AAGGGC-AGA---CCTAAC-C-TT-C-C-T-ACCTTAGAACGC-GG--TAACTCGTTCAGG-----TT-GGGTA---TCGGCCCCGGTGTGT-T-------------------------CCCTACGTGTG--T--------A-GT--------------T--------------A----------AA--CTG--AAC----T--C-AC---TGGTCGG-C-TC-CCCAATT-CCCCAC--A-AAA-T---TTT-TTCTATGCGACCA-T-T-ACCT--CCATTT--
gi|25978                      : AGTTA-GC-ACT-------TAGGAG-AC-GGGCGA-G------AAGGGC-AGG---TCTAAC-C-TT-C-C-C-ACCTT-TAACGCGGG--GACT-CGTTCAGG-----TT-GGATAT--CT-------ATG-CT-C--------ACA--T--AGG-----CCCCCG---ATG--T--------GTCC--------------CCTACGTCTGTAGTTA----------AA--CTG--AAC----T--C-AC---TGGTCGG-C-TC-CCCAGTT-CCCCAT--A-A
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gi|25979                      : AGTTA-GC-ACT-------TAGGAG-AC--GGCGAAG------AAGGGC-AG----TCT--AAC-TT-C-C-C-ACCTT-TAACGCGGG--GACT-CGTTCAGG-----TT-GGGTAT--CTA-----G----CT-C--------AC---T--ATA---GGCCCCGAT--GTG--T---------CCC--------------CTACGTTGTAGTT--A----------AA--CTG--GAC----T--C-AC----GGTCGG-C-TC-CCCAGTT-CCCCAT--A-A
gi|25982                      : AGGTA-GC-ACT-----G-T-GGAC-ACAGA-TGA-GTTGCGCAGAAGT-AA----TCT--ATC------C-T-GCCTTAGAACG-TGTT-CAAC-TGTTCAGGACTGCCT-GGACA---CCT-----A-TGCTC----------ACA--T--AGG---GTCCCCGG---TTA--T--------GCCC--------------CTACGTTGGTAGTT-A----------AA--CTG--GT-----A--T-AC---CGGTCGC-C-TC-TCCAGTT-CCCCAC--A-CAA-A---TTT-TGC-GTGCGAC
gi|25983                      :  GGTA-GC-ACT-----GCA-GGAG-ACAGGGTGA-G------AAGGGC-GGG---TCT--CGC-TT-A-C-C-TCCTTACAACGCTGG--CGTC-CGTTCAGG----ATT-GGCCA---ATG-----AATGTTT-T--------ACT--T--GGG---GCCCCCCA---GTG--C--------ACCC--------------C--------------T----------TA--C----AA-----G--C-AC---TGGGTTA-C-TC-CCCAGTTACCCCACGAA-AAA-G---TCC-ATC-ATGTGGCCAATAT-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAACGTAT-CTGT-TAATTatttt
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gi|25987                      :                                                                            CCTTAGAACGC-GG--TAACTCGTTCAGG----TT--GGGTAT--CT-------ATACTC----------ACA--T--AGG-----CCCCCG---GTG--T--------GTTC--------------CCTACGAGTGTAGTTA----------AA--CTG--AA-----GT-C-AC---TGGTCGG-C-TC-CCCAGTT-CCCTAC--A-AAA-A---------C-ATGCGACC
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Reference ( family-760 )      : AGGTA-GC-ACT-----GCNGGAG-ACAGG------GCG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCCT-N---CC-ACCTTAGAACGCGGGNANCCGTTCAG----GTTT-GGGCACCG-----AATGT-TT-TAC---TA---GGG--CCC-CCA-G-TGC-G--------CCC----C-----------G----------A------------A--A-CTG--G-G-N-----C-ACTGGTCGG-C-TC-CCCA-G-TT---CCCCAC--A-AAAA----TTCANC-ATGCGACCGAT-T-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
gi|25970                      : AGGTA-GC-ACT-----GCTGGAG-ACAGG------GTG-A-GAAAGGC-GGG---TCTCGCTT-A---CC-ACCTTAGAACGCTGGCGTCCGTTCGG----GTTT-GGGCACTG-----AATGT-TT-TAC---TA---GGGC-CCC-CCA-G-TGC-A--------CCC----C----------------------A------------A--A-CTG--G-G-G-----C-ACTGGGCGA-C-TC-CCCA-G-TTA--CCCCAC--A-AAAA----TTCAGC-ATGCGGCCGCT-T-TTGT--CCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
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Reference ( family-760 )      : AGGTA-GC-ACT-----GCAGGAG-ACAGG------GCG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCC-TN---CC-ACCTTAGAACGCGGG-GACTCGTTCAGG----TTTGGG-CACCGAATGT-TT-CAC-T---A---GGG--CCC-CCA-G-T-GC-G--------CCC----C-----------G---------T--------A---AA-CTG--G-G-----N-C-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-ATTCNNC-ATGCGGCCGAT-T-TCGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
gi|25970                      : AGGTA-GC-ACT-----GCTGGAG-ACAGG------GTG-A-GAAAGGC-GGG---TCTCGCT-TA---CC-ACCTTAGAACGCTGG-CGTCCGTTCGGG----TTTGGG-CACTGAATGT-TT-TAC-T---A---GGGC-CCC-CCA-G-T-GC-A--------CCC----C------------------------------A---AA-CTG--G-G-----G-C-ACTGGGCGA-CT-C-CCCAG-TTA--CCCCAC--A-AAA-ATTCAGC-ATGCGGCCGCT-T-TTGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
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gi|25976                      : AGGTA-GT-ACT------TAGGAA-ACCGG------GCG-A-GAAGGGC-AGA---CCTAACC-TT---CCTACCTTAGAACGCGGT-AACTCGTTCAGG-----TTGGG-TATCG---GC-CC-CGG-T---G---TGT--TCC-CTACG-T-GT-G----------T----A-----------GT--------T--------A---AA-CTG--A-AC----T-C-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAA-TT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTTCTATGCGACC-AT-T-ACCTCCATTT--
gi|25977                      : AGGTA-CC-ACT------TACGAG-ACAGG-------CG-A-GAAGGGC-AGG---TCTCATC-TC---CC-ACCTTAGAACGCGGT-GACTCGTTTAGG----TTTGAG-AATCT-ATGC-TGATAT-T---A---ACG--TCC-CCT-A-C-GT-G--------GTT----A-----------G---------TC-------A---AA-TTG--G-AC----T-C-ACTGGTCAG-CT-C-CCCAGCTT---CGTTAC--A-AAA-A
gi|25978                      : AGTTA-GC-ACT------TAGGAG-AC-GG------GCG-A-GAAGGGC-AGG---TCTAACCTTC---CC-ACCTT-TAACGCGGG-GACTCGTTCAGG-----TTGGA-TATCT-ATG--CT-CACAT---A----GG--CCC-CCG-A-T-GT-G--------TCCCCTAC-----------GTCTGTAGT-T--------A---AA-CTG--A-AC----T-C-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAT--A-A
gi|25979                      : AGTTA-GC-ACT------TAGGAG-AC--G------GCG-AAGAAGGGC-AG----TCTAACT-TC---CC-ACCTT-TAACGCGGG-GACTCGTTCAGG----TT-GGG-TATCTAGC----T-CAC-T---AT--AGG--CCC-CGATG-T-GT-C--------CCCTA--C-----------G---------TTGTAGTT-A---AA-CTG--G-A-----CTC-AC-GGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAT--A-A
gi|25980                      : AGGTA-AC-ACT--------------CAGG----------A-GAAGGGT-GGG---TCTCATC-TG---CCCACCTTAGAACGCGGG-GATTCGTTCAGG----CTTGGG-TATCT-ATG--CT-CACAT---A----GG--CCT-CCA-G-T-GC-G--------TCC----C-----------
gi|25981                      : AGGTA-GC-ACTTACATGTAGGAG-ACAAG-------CA-A-GAGGGGT-AGG---TATCATC-TGT--CC-AGCTTAGAAGGCGGG-GACTCGTTCAGA----CTTGGG-TATC-----T-TT-GAT-C---ATATAGG--CCC-CTA-G-T-GC-GAGTGCGTACCCTA--C-----------G---------TGTAAAGTTA---AA-TTA--G-G-----TTC-ACTGGTCGG-TT-A-CCCAG-TTC--CCCCAT--A-AAACGTTTTCA-ATGCGACC
gi|25982                      : AGGTA-GC-ACT-----GT-GGAC-ACAGATGAGTTGCGCA-GAAGTA----A---TCTATCC-TG---CC----TTAGAACGTGTTCAACT-GTTCAGGACTGCCTGGA-CACCTA-TGC-T--CACAT---A---GGG--TCC-CCG-G-TTAT-G--------CCC----CTACGTTGGTA-G---------TT-------A---AA-CTG--G-T-----A-T-ACCGGTCGC-CT-C-TCCAG-TT---CCCCAC--A-CAA-ATTTTGC-GTGCGAC--AT-T-T
gi|25983                      :  GGTA-GC-ACT-----GCAGGAG-ACAGG------GTG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCT-TA---CC-TCCTTACAACGCTGG-CGTCCGTTCAGG----ATTGGC-CAATGAATGT-TT-TAC-T---T---GGGGCCCC-CCA-G-T-GC-A--------CCC----C-----------T---------T--------A---CA--------A-----G-C-ACTGGGTTA-CT-C-CCCAG-TTA--CCCCACGAA-AAA-GTCCATC-ATGTGGCCAATAT-TTGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAACGTAT-CTGT-TAATTt
gi|25984                      :   GTC-GC-ACT------TAGGAG-ACGGG------CCG-A-GAAGGGTTAGG---CCTCACC-TGACGCC--CCTTAGAACGCGGG--ACTCGTTCAGG----TTT-GG-TACCATATGG-TA-CCA-T---A---GG----CC-CCA-G-T-GCTG--------TCC----T-----------AGTGTGTAGTT--------A---AATCTG--G-GC----T-C-ACTGGTCGGTCT-CTCCCAG-TTC--CCCCAC--A-AAT-TTTCTA--ATGCGACC
gi|25985                      :                    AGGAGTACGGG------CTG-A-GAAGGGC-AGGGAATAATGCC-TTT--CC-ACTTTCGAACGCGGG-GACATGTTTAGG----TTTGGGGTATCTAATGT-T--CAC-TGATA---GG----CC-CCG-GCT-GT-GGTT-----CCCTTA-C-----------G---------TGTGTATTAA---GA-CTG--G-A-----CTC-A-TGGTCGG-CTTC-CCCAGGTT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTCT-ATGCGACCGAT-TACCACCCATTT--
gi|25986                      :                                       G-A-GAAGGGT-AGT---TCTCACC-TG---CCCACCTCAGAACGCGGG-GAATCGTTCAGG----CTTGGG-CACC-CATG--CC-CACAT---A----GG--TCC-CCA-G-T-GC-G--------TCCTTTAC-----------GTGTGCAGT-T--------A---AA-CTG--G-GA----T-C-ACTGGTTAG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-AT
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gi|25988                      :                                                                                AACGCGGG-GATTCGTTCAGG----TT-GGG-TACCTA-TGC-T--CACAT---A---GG----CC-CCG-G-T-GT-G--------TCC----CCTACGTGTGTAG---------TT-------A---AA-CTG--A-A-----CTC-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTCT-ATGCAACC-AT-T-ACCACCATTT--
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lowQualScore                  :      .  .   .......     .  .  .......  . .       ..  ...       . ....  ..              ..           ..... .   .    ...  .....   ..............   .   . . .  ..........   ................................... ...  .   .. ......... .         .  . .     .  ...      .. .   .    ....        .  . .          ..                   .    .     
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Reference ( family-760 )      : AGGTA-GC-ACT-----GCAGGAG-ACAGG------GCG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCC-TN---CC-ACCTTAGAACGCGGG-GACTCGTTCAGG----TTTGGG-CACCGAATGT-TT-CAC-T---A---GGG--CCC-CCA-G-T-GC-G--------CCC----C-----------G---------T--------A---AA-CTG--G-G-----N-C-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-ATTCNNC-ATGCGGCCGAT-T-TCGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
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gi|25985                      :                    AGGAGTACGGG------CTG-A-GAAGGGC-AGGGAATAATGCC-TTT--CC-ACTTTCGAACGCGGG-GACATGTTTAGG----TTTGGGGTATCTAATGT-T--CAC-TGATA---GG----CC-CCG-GCT-GT-GGTT-----CCCTTA-C-----------G---------TGTGTATTAA---GA-CTG--G-A-----CTC-A-TGGTCGG-CTTC-CCCAGGTT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTCT-ATGCGACCGAT-TACCACCCATTT--
gi|25986                      :                                       G-A-GAAGGGT-AGT---TCTCACC-TG---CCCACCTCAGAACGCGGG-GAATCGTTCAGG----CTTGGG-CACC-CATG--CC-CACAT---A----GG--TCC-CCA-G-T-GC-G--------TCCTTTAC-----------GTGTGCAGT-T--------A---AA-CTG--G-GA----T-C-ACTGGTTAG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-AT
gi|25987                      :                                                                         tCCTTAGAACGCGGT-AACTCGTTCAGG----TT-GGG-TATC---TATACT-CACAT---A---GG---CCC-CCG-G-T-GT-GTT------CCCTA--C-----------GAGTGTAGT-T--------A---AA-CTG--AAG-----T-C-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCTAC--A-AAA-A-----C-ATGCGACC-AT-T-ACCACCATTT--
gi|25988                      :                                                                                AACGCGGG-GATTCGTTCAGG----TT-GGG-TACCTA-TGC-T--CACAT---A---GG----CC-CCG-G-T-GT-G--------TCC----CCTACGTGTGTAG---------TT-------A---AA-CTG--A-A-----CTC-ACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTCT-ATGCAACC-AT-T-ACCACCATTT--
gi|25989                      :                                                                                             CGTTCGGG----TTCGGG-CACGGAATGT-TT-TAC-T---T---GGGC-CCC-CCA-G-T-GC-A--------TCC----CTTACAA-----GCCAAGT---T--------A---AA-CTG--G-G-----G-C-ACTGGGCGA-CT-C-CCCAG-TTACCCCCCAC----AAA-ATTCATC-ATCCGGCCGAT-T-TTGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
gi|25990                      :                                                                                            cCATTCAGG----TTTGGG-CACCG-ATG--TT-CAC-T---A---GGG--TCC-CCAGG-T-GT-T--------TCC----C-----------C---------T-------------A-CTGTTA-GTTATTA-C-ACGGGTCGC-CT-C-CACAG-TT---CCCCAC--A-AAA-A
gi|25991                      :                                                                                                                                                                                                     --------A---AA-CTG--G-A-----A-CTACTGGTCGG-CT-C-CCCAG-TT---CCCCAC--A-AAA-TTTTTCT-ATGTGACC--T-T-ACCACCATTTTACT-GTTA--CCG---GTAT-GTGT-TATTT
gi|25992                      :                                                                                                                                                                                                                                            GA-CT-C-CCCAG-TT---ACCTAA--C-AAA-ATTCATC-ATGCGGCCGAT-T-TTGTCCATTT--CTTGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT


blockSeqs                     :      A  C   TACATGT     T     TGAGTTG  C A       TA  GAA       T GACG  CA              CA           ACTGC T   G    GAA  CTGA    CATATAGG         T   C C T  GAGTGCGTA    CTTACAAGCTAAGTT                     GTT  T   TT GTTATTA   T         T  T T     C  ACC      GA C   C    TTCT        G  A A          TA                   C    A
blockSeqs                     :      .  .   GC          .     G        . .       G   .         . GT    TA              C            T     T   .    GAA  TACT    TTGGGGC          .   T . .  GGTT         CCTACGTCTGTAGTT                     .    .   .  ACT       .         .  . T     G  A        A  .   .    AGC         G  A .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   GC          .     G        . .       G   .         . TT    CA              C            T     T   .    GAA  TTT     TGATAGG          .   G . .  GTT          TTTACGTGTGCAGTT                     .    .   .  ACT       .         .  . .     .  A        .  .   .    AGC         G  . .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   GC          .     G        . .       G   .         . A     CA              C            C     T   .    TAG  TTT     TATAGG           .   . . .  TG           CCTACGTGTGTAGTT                     .    .   .  ACT       .         .  . .     .  A        .  .   .    ATC         A  . .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   GC          .     G        . .       A   .         . A     A               G            T     T   .    GAA  TTT     ATAGGG           .   . . .  A            CTTACAAGCCAAGTT                     .    .   .  ACT       .         .  . .     .  C        .  .   .    TCT         G  . .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   GT          .     G        . .       A   .         . A     T               A            T     T   .    ATA  GCT     TTGGGC           .   . . .  A            CTACGTTGGTAGTT                      .    .   .  GTT       .         .  . .     .  A        .  .   .    TCA         G  . .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   GC          .     G        . .       A   .         . A     T               G            C     T   .    TAA  CCC     TAGGG            .   . . .  A            TTACGTGTGTATTA                      .    .   .  GCT       .         .  . .     .  C        .  .   .    TGC         G  . .          .                    .    .
blockSeqs                     :      .  .   T           .     G        . .       A   .         . G     T               G            C     T   .    GAA  TTT     TAGGG            .   . . .  T            TACGTGTAAAGTT                       .    .   .  ACT       .         .  . .     .  .        .  .   .    ATC         .  . .          .                          
blockSeqs                     :      .  .   T           .     G        . .       A   .         . T     A               G            A     T   .    TA   TTT     TTGGG            .   . . .  G            TACGAGTGTAGTT                       .    .   .  GAT       .         .  . .     .  .        .  .   .    TCT         .  . .          .                          
blockSeqs                     :      .  .   T           .     C        . .       A   .         . C     A               G            T     T   .    TA   GTA     ATAAG            .   . . .  G            TACGTTGTAGTT                        .    .   .  AGT       .         .  . .     .  .        .  .   .    TCT         .  . .          .                          
blockSeqs                     :      .  .   T           .     C        . .       G   .         . C     A               G            T     T   .    TA   TTT     TGTGT            .   . . .  G            TAGTGTGTAGTT                        .    .   .  ACT       .         .  . .     .  .        .  .   .    ATC         .  . .          .                          
blockSeqs                     :      .  .   T           .     .        . .       A   .         . C     A               C            C     T   .    TA   CT      TAACG            .   . . .  C            CTACGGTGTGT                         .    .   .  GG        .         .  . .     .  .        .  .   .    TCT         .  . .                                     
blockSeqs                     :      .  .   T           .     .        . .       G   .         . G     T               G            T     T   .    TA   CT      ATAGG            .   . . .  G            AGTT                                .    .   .  GG        .         .  . .     .  .        .  .   .    ATC         .  . .                                     
blockSeqs                     :      .  .   .           .     .        . .       A   .         . G     A               G            T     C   .    CA   CT      ATAGG            .   . . .  G            AGTC                                .    .   .  AG        .         .  . .     .  .        .  .   .    TA                                                     
blockSeqs                     :                         .     .        . .       A   .         . A     .               A            T     T   .    TA   TT      ATAGG            .   . . .  A            CTT                                 .    .   .  CT        .         .  . .     .  .        .  .   .    C                                                      
blockSeqs                     :                                        . .       .   .         . G     .               G            T     .   .    GA   CC      ATAGG            .   . . .  G            CCT                                 .    .   .  TA        .         .  . .     .  .        .  .   .                                                           
blockSeqs                     :                                                                                        .            .     .   .    G    CT      ATAGG            .   . . .  G            C                                   .    .   .  AG        .         .  . .     .  .        .  .   .                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                     .     .   .    .    TT      TAGGG            .   . . .  A            C                                   .    .   .  GG        .         .  . .     .  .        .  .   .                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                     .     .   .    .    T       TAGG             .   . . .  T                                                .    .   .  AA        .         .  . .     .  .        .  .                                                               
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blockSeqCons                  :                                                                                                                                 NTAGG*********                           CTACGTGTGTAGTT*********************             ACT******                         ***
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Reference ( family-760 )      : AGGTA-GC-ACT-----GCAGGAG-ACAGG------GCG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCCTN---CC-ACCTTAGAACGCGGG-GACTCGTTCAGG----TTT-GGGCACC---GAATGT-TTCAC--NTAGG--CCC-CC-AGT-GCG----C---CCCT-AC-GTGTGTAGTTAA-A-CTGGACTCACTGGTCGG-C-TC-CCCA-G-TT---CCCCAC--A-AAA-A-TTCNNC-ATGCGGCCGAT-T-TCGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAATGTAT-CTGT-TAATT
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gi|25983                      :  GGTA-GC-ACT-----GCAGGAG-ACAGG------GTG-A-GAAGGGC-GGG---TCTCGCTTA---CC-TCCTTACAACGCTGG-CGTCCGTTCAGG----ATT-GGCCAAT---GAATGT-TTTAC--TTGGGGCCCC-CC-AGT-GCA----C---CCCT---------TA--CAA-G--------CACTGGGTTA-C-TC-CCCA-G-TTA--CCCCACGAA-AAA-G-TCCATC-ATGTGGCCAATAT-TTGTCCATTT--CTCGCTATCCCGAACGTAT-CTGT-TAATTt
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gi|25986                      :                                       G-A-GAAGGGT-AGT---TCTCACCTG---CCCACCTCAGAACGCGGG-GAATCGTTCAGG----CTT-GGGCACC---CA-TGC-C-CAC--ATAGG--TCC-CC-AGT-GCG----T---CCTTTAC-GTGTGCAGTTAA-A-CTGGGATCACTGGTTAG-C-TC-CCCA-G-TT---CCCCAC--A-AAA-A-T
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