lowQualScore                  :                                                      111111111                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :      1  222 3 1 22 222   44   22 22  3  1  44 5 1    222222222 1  666666666 1 1 1 1   3 22 888  22 5 1   3 1 8888    88888  1 444 3   66666 777       1   333  222  1 777  1 1  3   666 22   3       3   22 22   1 44 333      22       
lowQualScore                  :      .  ... . . .. ...   ..   .. ..  .  .  .. . .    ......... .  ......... . . . .   . .. ...  .. . .   . . ....    .....  . ... .   ..... ...       .   ...  ...  . ...  . .  .   ... ..   .       .   .. ..   . .. ...      ..       
lowQualScore                  :      7  999 3 7 33 999   00   33 33  3  7  66 0 7    888888888 6  444444444 6 6 6 6   2 22 111  33 0 7   3 7 7777    88888  7 666 5   11111 444       7   000  555  7 888  7 7  5   555 44   4       5   44 44   7 88 000      44       
consensus                     : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-C-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
Reference ( gi|68313 )        : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---CTTAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-C-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68312                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CAA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTCAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAACAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-A-AA-CTC---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68314                      : TGTCA-GC---A-T-C--C---AGC--AAA--G--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--A---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A-----TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68315                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--CGA-A--A---TA-AGC--AACTTTA
gi|68316                      : TGTCA-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GG--T-T-TTC-A-T---TTAAT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-C-AAGCTT---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68317                      : TGTCA-GC---G-T-T--C---ATC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-GCAG---------C-CG---------A-G-T---CCACA--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TTT-----T---AAAATAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68318                      : TGTCA-GC---GGT-C--C----GC--AAA--A--AA-TG-GC--G---ACAA---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTATA----AA-A---T-TTT-----TAA-AAAATAT-TAC---AA-T-TCTT---TA-C-AA-CTTTTAA--ACTTCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTT
gi|68319                      : TGTCT-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--G--CA-TG-GC--A-C-AGAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAATTAT-TAC---AA-C---------------------------TCCCAGAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68320                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---GGC--AAA--A--AA-TG-TCCGG-C--CAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-AGAC---GA--AAT-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TTT-----A-C-AAAATAT-TAC---AAAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCTCAGTGG-AAAACA--TGA-A--AAATAATAGG--AACTTTA
gi|68321                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--A--TG-TC--G-G-ACAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTACATG--CA-AG--T-TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AA-C-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ACT------GG-AAA--A--TGA-A--A---AAGAAC--TACTTTA
gi|68327                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AA-TG-GC--G-----------------------------A-T-T-T-TCG-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---T------------------------------AAAATAT-TAC---AA-C-TC-T---TA-C-AA-CAC---A--ATTCCCAGTAG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68328                      : TGTTA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AAATG-TC--G-G-AGAG---------T-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-CAT-----T-T-AAAACAT-TAT---AA-C-TC-T---CA-C-GA-CTC---A--ACTCCATGTGG-GAA--A--TGA-A--A---TATTAC--TACTTTA
gi|68322                      : TGTCA-GTCTGG-TTC--C---AGCTGAGA--A--AA-TG-GG--G-C-ACAG---------CACG---------A-GCT-T-CAA-A--G---GA--T-T-TCC-A-T---TTTAT-----TA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-C-TC-------------------------CCCAGAGG-AAA--A--GGGGA--A---AATAGC--AACT
gi|68323                      : TGTCAAGC---G-T-C--CCTGAGC--AAA--A--AT-TGCGC--G-CGACAG---------C-CG---------AAG-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC--------TAAT-----CA-AATAT-TTTG----T-T-AAAATAT-TATCTAAA-T-TC-C---TA-CCAA-CTT---A--ACTTCCAGAGG-AAA--ATTTGA-A--G---AATAGC---ATTTTA
gi|68325                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G-C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGA-T---TTTAT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AA-T-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCAGATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68324                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G-C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGA-T---TTTAT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AA-T-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCAGATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68326                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--GGC-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--T---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---
gi|68329                      : TGCCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AT-CC-GCCAC-C-ACA----------C-CG---------A-G-T-T-CCA-C--G---GAGTT-T-TTC-ATT---CTTATATATATA-T---T-TTT-----T-A-AAAATATATAC---AA-T-CC-T---AG-C-AA-C-C---ATGACT-TCAGAGGAAAA--A--TGA-A--A---AATAGCAAAACTTTA
gi|68330                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGCA-AAA--A--AA-TG-GC--GCC-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-C----------------------------CTTAT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATA
gi|68331                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--A-C-ACAA---------C-TG---------A-G-T-T-CCA-A--
gi|68332                      :  GTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G-C-ACAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAA-TAT-TAC---AA-T-TC-T---TA-C-AA-CTT---A--AATTCCAGAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTCT
gi|68333                      :   TCA-GC---G-T-C--C---AGT--GAA--A--AA-TG-TC--G-G-ATAG---------C-CG---------A-T-T-T-AAC-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTAT-----CA-A---T-TAT-----T-T-GAAATAA-TAC---AT-C-TC-T---CA-C-AA-CTC---A--ACTCCTTGTGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAAC--TACTTTA
gi|68334                      :    CA-GC---G---C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-TACCA-A--C---GA--A-T---C-A-T----TTA------CACA---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AA-C-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCAGA---AAA--A--TGA-A--A---AATA-C--AACTTT
gi|68335                      :     A-GC---GCT-CGAC---AGC--AAACAATTAA-TG-GC--GGC-ACAG---------T-CGCGTCGAAAGA-G-TAT-CCACA--CCA-GA--T-TATTC-A-TTCTCTCAT-----CA-A---T-TTTGTGACT-A-ATAATAT-CAC---AA-TATC-TA--TAGC-AAACTC---A--ACTTCCAGAGGGAAA--A--TGA-A--A---AATATC--AACTTTA
gi|68336                      :        C---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G-C-ACAG---------C-AG---------A-G-T-T-TCA-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTGAT-----CA-G---T-TTT-----T-T-AAAAGAT-TGC---AA-C-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ATGTCCATAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68337                      :                                                   CAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACT-A--C---GA--T-T-TTC-A-T---TTTGT-----CA-T---T-TCT-----T-T-TAAATAT-CAC---AA-C-TT-T---TA-C-TA-CTC---A--ACTCCCAGTAG-AAA--C--TGA-A--A---GATAGC--AAC
gi|68338                      :                                                                                                                                                   ATAT-TGC---AA-T-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCAGAAG-AAG--A--TGA-A--A---AATAGC--AGGTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                       111111111                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :      1  222 3 1 22 222   22   22 22  4  1  22 55 3    222222222 1  666666666 1 1 1 1   3 22 777  22 4 1   3   1  222  88888  1 444 3   55555 666       1   444   1  1 777  1 1  3   666 22       1    1   22 44   1 44 222      22       
lowQualScore                  :      .  ... . . .. ...   ..   .. ..  .  .  .. .. .    ......... .  ......... . . . .   . .. ...  .. . .   .   .  ...  .....  . ... .   ..... ...       .   ...   .  . ...  . .  .   ... ..       .    .   .. ..   . .. ...      ..       
lowQualScore                  :      7  888 2 6 22 888   22   22 22  8  6  22 44 2    333333333 5  222222222 5 5 5 5   1 11 888  22 8 6   2   6  888  44444  6 444 3   88888 777       7   666   7  7 555  7 7  3   222 33       7    7   33 00   7 66 999      33       
consensus                     : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
Reference ( family-675 )      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68312                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CAA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TC---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAACAT-TAC---AAT-TC-T---TA-A-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68313                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATC-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68314                      : TGTCA-GC---A-T-C--C---AGC--AAA--G--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--A---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A-----TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68315                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--CGA-A--A---TA-AGC--AACTTTA
gi|68316                      : TGTCA-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GG--T-T-TTC-ATT-TA---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AAGCTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68317                      : TGTCA-GC---G-T-T--C---ATC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-GCAG---------C-CG---------A-G-T---CCACA--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T---AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68318                      : TGTCA-GC---GGT-C--C----GC--AAA--A--AA-TG-GC--G----ACAA---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ATA----AA-A---T-TTT-----TAA-AAAATAT-TAC---AAT-TCTT---TA-C-AA-CTTTTAA--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTT
gi|68319                      : TGTCT-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--G--CA-TG-GC--A--C-AGAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAATTAT-TAC---AAC-TC--------------------------CCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68320                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---GGC--AAA--A--AA-TG-TCCGG--C--CAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-AGAC---GA--AAT-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----A-C-AAAATAT-TACA--AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCTCA-GTGG-AAAACA--TGA-A--AAATAATAGG--AACTTTA
gi|68321                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--A--TG-TC--G--G-ACAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ACATG--CA-AG--T-TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ACT-------GG-AAA--A--TGA-A--A---AAGAAC--TACTTTA
gi|68322                      : TGTCA-GTCTGG-TTC--C---AGCTGAGA--A--AA-TG-GG--G--C-ACAG---------CACG---------A-GCT-T-CAA-A--G---GA--T-T-TCC-ATT-TT---AT-----TA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-C------------------------CCA-GAGG-AAA--A--GGGGA--A---AATAGC--AACT
gi|68323                      : TGTCAAGC---G-T-C--CCTGAGC--AAA--A--AT-TGCGC--G--CGACAG---------C-CG---------AAG-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-----TA---AT-----CA-AATAT-TTTG----T-T-AAAATAT-TATCTAAAT-TC-C---TA-CCAA-CTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--ATTTGA-A--G---AATAGC---ATTTTA
gi|68324                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68325                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68326                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--GG-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--T---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---
gi|68327                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AA-TG-G-----------------------CG---------A-T-T-T-TCG-A--C---GA--T-T-TTC-ATT----------------------------------AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CAC---A--ATTCCCA-GTAG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68328                      : TGTTA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AAATG-TC--G--G-AGAG---------T-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-CAT-----T-T-AAAACAT-TAT---AAC-TC-T---CA-C-GA-CTC---A--AC-TCCATGTGG-GAA--A--TGA-A--A---TATTAC--TACTTTA
gi|68329                      : TGCCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AT-CC-GC--CACC-ACA----------C-CG---------A-G-T-T-CCA-C--G---GAGTT-T-TTC-ATTCTT---ATATATATA-T---T-TTT-----T-A-AAAATATATAC---AAT-CC-T---AG-C-AA-C-C---ATGACTTC-A-GAGG-AAA--AA-TGA-A--A---AATAGCAAAACTTTA
gi|68330                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--CCACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CC-------------------------TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATA
gi|68331                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--A--C-ACAA---------C-TG---------A-G-T-T-CCA-A--
gi|68332                      :  GTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--C-ACAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAA-TAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTT---A--AATTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTCT
gi|68333                      :   TCA-GC---G-T-C--C---AGT--GAA--A--AA-TG-TC--G--G-ATAG---------C-CG---------A-T-T-T-AAC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TAT-----T-T-GAAATAA-TAC---ATC-TC-T---CA-C-AA-CTC---A--ACTCCTT-GTGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAAC--TACTTTA
gi|68334                      :    CA-GC---G---C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-TACCA-A--C---GA--A-T---C-ATT-T----A------CACA---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GA---AAA--A--TGA-A--A---AATA-C--AACTTT
gi|68335                      :     A-GC---GCT-CGAC---AGC--AAACAATTAA-TG-GC--GG-C-ACAG---------T-CGCGTCGAAAGA-G-TAT-CCACA--CCA-GA--T-TATTC-ATT-CTCTCAT-----CA-A---T-TTTGTGACT-A-ATAATAT-CAC---AATATC-TA--TAGC-AAACTC---A--ACTTCCA-GAGGGAAA--A--TGA-A--A---AATATC--AACTTTA
gi|68336                      :        C---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-AG---------A-G-T-T-TCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TG---AT-----CA-G---T-TTT-----T-T-AAAAGAT-TGC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ATGTCCA-TAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68337                      :                                                    CAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACT-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---GT-----CA-T---T-TCT-----T-T-TAAATAT-CAC---AAC-TT-T---TA-C-TA-CTC---A--ACTCCCA-GTAG-AAA--C--TGA-A--A---GATAGC--AAC
gi|68338                      :                                                                                                                                                    ATAT-TGC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAAG-AAG--A--TGA-A--A---AATAGC--AGGTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                       111111111                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :      1  222 3 1 22 222   22   22 22  4  1  22 55 3    222222222 1  666666666 1 1 1 1   3 22 777  22 4 1   3   1  222  88888  1 444 3   55555 666       1   444   1  1 777  1 1  3   666 22       1    1   22 44   1 44 222      22       
lowQualScore                  :      .  ... . . .. ...   ..   .. ..  .  .  .. .. .    ......... .  ......... . . . .   . .. ...  .. . .   .   .  ...  .....  . ... .   ..... ...       .   ...   .  . ...  . .  .   ... ..       .    .   .. ..   . .. ...      ..       
lowQualScore                  :      7  888 2 6 22 888   22   22 22  8  6  22 44 2    333333333 5  222222222 5 5 5 5   1 11 888  22 8 6   2   6  888  44444  6 444 3   88888 777       7   666   7  7 555  7 7  3   222 33       7    7   33 00   7 66 999      33       
consensus                     : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
Reference ( family-675 )      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68312                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CAA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TC---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAACAT-TAC---AAT-TC-T---TA-A-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68313                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATC-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68314                      : TGTCA-GC---A-T-C--C---AGC--AAA--G--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--A---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A-----TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68315                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--CGA-A--A---TA-AGC--AACTTTA
gi|68316                      : TGTCA-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GG--T-T-TTC-ATT-TA---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AAGCTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68317                      : TGTCA-GC---G-T-T--C---ATC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-GCAG---------C-CG---------A-G-T---CCACA--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T---AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68318                      : TGTCA-GC---GGT-C--C----GC--AAA--A--AA-TG-GC--G----ACAA---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ATA----AA-A---T-TTT-----TAA-AAAATAT-TAC---AAT-TCTT---TA-C-AA-CTTTTAA--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTT
gi|68319                      : TGTCT-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--G--CA-TG-GC--A--C-AGAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAATTAT-TAC---AAC-TC--------------------------CCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68320                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---GGC--AAA--A--AA-TG-TCCGG--C--CAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-AGAC---GA--AAT-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----A-C-AAAATAT-TACA--AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCTCA-GTGG-AAAACA--TGA-A--AAATAATAGG--AACTTTA
gi|68321                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--A--TG-TC--G--G-ACAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ACATG--CA-AG--T-TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ACT-------GG-AAA--A--TGA-A--A---AAGAAC--TACTTTA
gi|68322                      : TGTCA-GTCTGG-TTC--C---AGCTGAGA--A--AA-TG-GG--G--C-ACAG---------CACG---------A-GCT-T-CAA-A--G---GA--T-T-TCC-ATT-TT---AT-----TA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-C------------------------CCA-GAGG-AAA--A--GGGGA--A---AATAGC--AACT
gi|68323                      : TGTCAAGC---G-T-C--CCTGAGC--AAA--A--AT-TGCGC--G--CGACAG---------C-CG---------AAG-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-----TA---AT-----CA-AATAT-TTTG----T-T-AAAATAT-TATCTAAAT-TC-C---TA-CCAA-CTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--ATTTGA-A--G---AATAGC---ATTTTA
gi|68324                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68325                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68326                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--GG-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--T---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---
gi|68327                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AA-TG-G-----------------------CG---------A-T-T-T-TCG-A--C---GA--T-T-TTC-ATT----------------------------------AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CAC---A--ATTCCCA-GTAG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68328                      : TGTTA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AAATG-TC--G--G-AGAG---------T-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-CAT-----T-T-AAAACAT-TAT---AAC-TC-T---CA-C-GA-CTC---A--AC-TCCATGTGG-GAA--A--TGA-A--A---TATTAC--TACTTTA
gi|68329                      : TGCCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AT-CC-GC--CACC-ACA----------C-CG---------A-G-T-T-CCA-C--G---GAGTT-T-TTC-ATTCTT---ATATATATA-T---T-TTT-----T-A-AAAATATATAC---AAT-CC-T---AG-C-AA-C-C---ATGACTTC-A-GAGG-AAA--AA-TGA-A--A---AATAGCAAAACTTTA
gi|68330                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--CCACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CC-------------------------TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATA
gi|68331                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--A--C-ACAA---------C-TG---------A-G-T-T-CCA-A--
gi|68332                      :  GTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--C-ACAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAA-TAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTT---A--AATTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTCT
gi|68333                      :   TCA-GC---G-T-C--C---AGT--GAA--A--AA-TG-TC--G--G-ATAG---------C-CG---------A-T-T-T-AAC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TAT-----T-T-GAAATAA-TAC---ATC-TC-T---CA-C-AA-CTC---A--ACTCCTT-GTGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAAC--TACTTTA
gi|68334                      :    CA-GC---G---C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-TACCA-A--C---GA--A-T---C-ATT-T----A------CACA---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GA---AAA--A--TGA-A--A---AATA-C--AACTTT
gi|68335                      :     A-GC---GCT-CGAC---AGC--AAACAATTAA-TG-GC--GG-C-ACAG---------T-CGCGTCGAAAGA-G-TAT-CCACA--CCA-GA--T-TATTC-ATT-CTCTCAT-----CA-A---T-TTTGTGACT-A-ATAATAT-CAC---AATATC-TA--TAGC-AAACTC---A--ACTTCCA-GAGGGAAA--A--TGA-A--A---AATATC--AACTTTA
gi|68336                      :        C---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-AG---------A-G-T-T-TCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TG---AT-----CA-G---T-TTT-----T-T-AAAAGAT-TGC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ATGTCCA-TAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68337                      :                                                    CAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACT-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---GT-----CA-T---T-TCT-----T-T-TAAATAT-CAC---AAC-TT-T---TA-C-TA-CTC---A--ACTCCCA-GTAG-AAA--C--TGA-A--A---GATAGC--AAC
gi|68338                      :                                                                                                                                                    ATAT-TGC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAAG-AAG--A--TGA-A--A---AATAGC--AGGTTTA


blockSeqs                     :      A  CTG G T GA CTG   TG   CA TT  A  C  CG AC G    GGAAATAGC A  CGTCGAAAG A C A A   C GA ACG  GT A A   G   C  CTC  ATATA  C ATA G   GTGAC AA        A   CTA   A  T CTA  G C  G   TTA TG       T    G   AC TT   G AG AAT      AA
blockSeqs                     :      .  .   C . .  .     .    .  .   A  .  .  G  C    GGAAATAGC .  .         . . . .   C .  ACG  .  G .   G   .  .    ATG    . G   G   G     AG        .   A     .  . CTA  . .  A   T   .        .    .   .  A    . AG .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   A  .  .  G  .    .         .  .         . . . .   . .  CA   .  G .   .   .  .    A      . .   .   .     AG        .   .     .  . A    . .  .   T   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     G         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     C         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     G         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     T         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     T         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     T         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     A         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     T         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     T         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     .         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :      .  .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .   .   .     .         .   .     .  . .    . .  .   .   .        .    .   .  .    . .  .        . 
blockSeqs                     :         .   . . .  .     .    .  .   .  .  .  .  .    .         .  .         . . . .   . .  .    .  . .   .   .  .    .      . .                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                       .         .  .         . . . .   . .                                                                                                                                        


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
finalCons                     : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                       111111111                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :      1  222 3 1 22 222   22   22 22  4  1  22 55 3    222222222 1  666666666 1 1 1 1   3 22 777  22 4 1   3   1  222  88888  1 444 3   55555 666       1   444   1  1 777  1 1  3   666 22       1    1   22 44   1 44 222      22       
lowQualScore                  :      .  ... . . .. ...   ..   .. ..  .  .  .. .. .    ......... .  ......... . . . .   . .. ...  .. . .   .   .  ...  .....  . ... .   ..... ...       .   ...   .  . ...  . .  .   ... ..       .    .   .. ..   . .. ...      ..       
lowQualScore                  :      7  888 2 6 22 888   22   22 22  8  6  22 44 2    333333333 5  222222222 5 5 5 5   1 11 888  22 8 6   2   6  888  44444  6 444 3   88888 777       7   666   7  7 555  7 7  3   222 33       7    7   33 00   7 66 999      33       
consensus                     : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
Reference ( family-675 )      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68312                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CAA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TC---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAACAT-TAC---AAT-TC-T---TA-A-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68313                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATC-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68314                      : TGTCA-GC---A-T-C--C---AGC--AAA--G--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--A---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A-----TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68315                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CA---------A-G-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--CGA-A--A---TA-AGC--AACTTTA
gi|68316                      : TGTCA-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GG--T-T-TTC-ATT-TA---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AAGCTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68317                      : TGTCA-GC---G-T-T--C---ATC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-GCAG---------C-CG---------A-G-T---CCACA--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T---AAAATAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68318                      : TGTCA-GC---GGT-C--C----GC--AAA--A--AA-TG-GC--G----ACAA---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ATA----AA-A---T-TTT-----TAA-AAAATAT-TAC---AAT-TCTT---TA-C-AA-CTTTTAA--ACTTCCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTT
gi|68319                      : TGTCT-GT---G-T-C--C---AGC--AAA--G--CA-TG-GC--A--C-AGAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAATTAT-TAC---AAC-TC--------------------------CCA-GAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68320                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---GGC--AAA--A--AA-TG-TCCGG--C--CAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-AGAC---GA--AAT-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TTT-----A-C-AAAATAT-TACA--AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCTCA-GTGG-AAAACA--TGA-A--AAATAATAGG--AACTTTA
gi|68321                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--A--TG-TC--G--G-ACAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---ACATG--CA-AG--T-TTT-----T-G-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ACT-------GG-AAA--A--TGA-A--A---AAGAAC--TACTTTA
gi|68322                      : TGTCA-GTCTGG-TTC--C---AGCTGAGA--A--AA-TG-GG--G--C-ACAG---------CACG---------A-GCT-T-CAA-A--G---GA--T-T-TCC-ATT-TT---AT-----TA-A---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-C------------------------CCA-GAGG-AAA--A--GGGGA--A---AATAGC--AACT
gi|68323                      : TGTCAAGC---G-T-C--CCTGAGC--AAA--A--AT-TGCGC--G--CGACAG---------C-CG---------AAG-T-T-CCA-A--C---AA--T-T-TTC-----TA---AT-----CA-AATAT-TTTG----T-T-AAAATAT-TATCTAAAT-TC-C---TA-CCAA-CTT---A--ACTTCCA-GAGG-AAA--ATTTGA-A--G---AATAGC---ATTTTA
gi|68324                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68325                      : TGTC---T---G-T-C--C---AGC--AAA--A--A--TG-GT--G--C-ACAGGGAAATAGCC-CG-----------G-T-T-CCA-A--CACGGA--TGT-TTCGATT-TT---AT-----AA-A---TGTTC-----T-AGAAAATAT-TAC---AAT-TT-TCTATA-C-AA-CTTT--A--ACTTCCA-GATG-AAA--A--TGA-AAGA---GATGGC--AACTTTA
gi|68326                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--GG-C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CCA-A--T---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---
gi|68327                      : TGTCA-AC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AA-TG-G-----------------------CG---------A-T-T-T-TCG-A--C---GA--T-T-TTC-ATT----------------------------------AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CAC---A--ATTCCCA-GTAG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68328                      : TGTTA-GC---G-T-C--C---AGT--AAA--A--AAATG-TC--G--G-AGAG---------T-CG---------A-T-T-T-ACC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-CAT-----T-T-AAAACAT-TAT---AAC-TC-T---CA-C-GA-CTC---A--AC-TCCATGTGG-GAA--A--TGA-A--A---TATTAC--TACTTTA
gi|68329                      : TGCCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AT-CC-GC--CACC-ACA----------C-CG---------A-G-T-T-CCA-C--G---GAGTT-T-TTC-ATTCTT---ATATATATA-T---T-TTT-----T-A-AAAATATATAC---AAT-CC-T---AG-C-AA-C-C---ATGACTTC-A-GAGG-AAA--AA-TGA-A--A---AATAGCAAAACTTTA
gi|68330                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--CCACAG---------C-CG---------A-G-T-T-CC-------------------------TT---AT-----CA-A---T-TTT-----T-A-AAAATA
gi|68331                      : TGTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--A--C-ACAA---------C-TG---------A-G-T-T-CCA-A--
gi|68332                      :  GTCA-GC---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AAATG-GC--G--C-ACAG---------C--G---------A-G-T-T-CCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----AA-A---T-TTT-----T-A-AAA-TAT-TAC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTT---A--AATTCCA-GAGG-AAA--A--TG--A--A---AATAGC--AACTCT
gi|68333                      :   TCA-GC---G-T-C--C---AGT--GAA--A--AA-TG-TC--G--G-ATAG---------C-CG---------A-T-T-T-AAC-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---AT-----CA-A---T-TAT-----T-T-GAAATAA-TAC---ATC-TC-T---CA-C-AA-CTC---A--ACTCCTT-GTGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAAC--TACTTTA
gi|68334                      :    CA-GC---G---C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-CG---------A-G-T-TACCA-A--C---GA--A-T---C-ATT-T----A------CACA---T-TTT-----T-A-AAAATAT-TAC---AAC-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTCCCA-GA---AAA--A--TGA-A--A---AATA-C--AACTTT
gi|68335                      :     A-GC---GCT-CGAC---AGC--AAACAATTAA-TG-GC--GG-C-ACAG---------T-CGCGTCGAAAGA-G-TAT-CCACA--CCA-GA--T-TATTC-ATT-CTCTCAT-----CA-A---T-TTTGTGACT-A-ATAATAT-CAC---AATATC-TA--TAGC-AAACTC---A--ACTTCCA-GAGGGAAA--A--TGA-A--A---AATATC--AACTTTA
gi|68336                      :        C---G-T-C--C---AGC--AAA--A--AA-TG-GC--G--C-ACAG---------C-AG---------A-G-T-T-TCA-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TG---AT-----CA-G---T-TTT-----T-T-AAAAGAT-TGC---AAC-TC-T---TA-T-AA-CTC---A--ATGTCCA-TAGG-AAA--A--TGA-A--A---AATAGC--AACTTTA
gi|68337                      :                                                    CAG---------C-CG---------A-T-T-T-ACT-A--C---GA--T-T-TTC-ATT-TT---GT-----CA-T---T-TCT-----T-T-TAAATAT-CAC---AAC-TT-T---TA-C-TA-CTC---A--ACTCCCA-GTAG-AAA--C--TGA-A--A---GATAGC--AAC
gi|68338                      :                                                                                                                                                    ATAT-TGC---AAT-TC-T---TA-C-AA-CTC---A--ACTTCCA-GAAG-AAG--A--TGA-A--A---AATAGC--AGGTTTA