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lowQualScore                  :     . . .   .   . . .   ..   .. .. . . .   .. ......... ..... ...... ..  ..   .       ..  ..  . .    .  .. ..  .       . . .    .. . ....   . . .. ..  . . .. .  .. ..   . .  ..    .     .. . .     ... . ..  ........   ..... .....     .   ..  ....   .  ...   ...  . .     ..    .    ...  .  ....  ....       .. .. . .....  .   ..  ... .   ..     ...   .  . . ..   . .....  .  ..  .. .. . .. ... . .       
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Reference ( gi|101469 )       : ATAT-T-T-ACA-TTC-A-G-TGT-GTTT--C--TGA-T-CAT--T---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTCCTA-T-A-ACACG-C-T----CTA-A-A--C--CG-A-A--TAAC-GG--CGT-A-TG--AATA-CACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-GTA------T-ACA-----T---T-TGTAC-TTG--TA-AT-CTG-TT---ATA---TG-T-ATATGA-AGTA-AATA---GA-AA----AT-T--ATGAAGT--T--A-A--T--AA-AAG--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-A-G--CCT-A-----AT-TTT-AA--T--GCA-TA---G-T-TTGAAGA
gi|101470                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-A-G-TGT-ATTT--C--TCT-T-CAT--T---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTTCTA-T-A-ACACA-C-T----CTA-A-A--C--CG-A-A--TCAC-TG--CAT-A-TG--AATA-CACAA--C-T-GGAACGTAA-C-ATA------TAACG-----C---T-GTTAC-TTGTATA-AT-CTG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---AA-AA----AT-A--ATGAAGT--T--A-G-----AA-AAG--AA---G-GGT--AAAAA---TCT-CC-A-G--CCT-A-----AT-TTC-AA--T--GCA-TA---G-T-TTGAAGA
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gi|101485                     : ACAT-T-T-ACA-TTC-A-G-CGT--TTT--C--TCA-T-TAT--T---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAC--TG--AA-G-AACA-TT--T--AA-ATTCCTA-T-A-ACACA-C-T----CTT-A-A--C--CG-A-G--TCAC-AG--CGT-A-TA--AATA-CACAta
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gi|101487                     : ATAT-T-C-ATA-TTC-A-G-TGT-ATTT--C--AAT-T-CAT--T---------G-----A------A--AT--GCA-TTGGAAA--TC--TG-C-AACA-TT--A--AA-ATTCaattgaggat
gi|101488                     :  TAT-T-T-ACA-TTC-A-G-TGT-ATTT--C--TCA-T-CAT--T---------GTTTCAA------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--CA-ATTCCTAAT-A-ACACA-C-T----CTA-A-A--C--CG-A-AA-TCAC-GG--CGT-A-TG--AATA-CACAA--C-T-GGAAC---A-C-ATA------TAACA-----T---C-TGTACTTTG--TA-AT-CTG-CT---AT----TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AA----AT-A--ATGAAGT--T--A-A--TTAAA-AAG--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-A-G--TTC-T-----AT-TTC-AA--T--GTATTA---G---TTGAAGA
gi|101489                     :   AT-T-T-TCA-TCC-A-----T-CTTT--T--TGC-T-CATATT---------G-----A------A--ATATGCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTTCTA-T-A-ACACA-C-T----CTA-A-A--C--CG-A-A--TCAC-GG--TGT-A-TGTGAATA-CACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-ATA------T-ACA-----T---A-TGTAC-TTG--TA-AT-CTG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AA----AT-A--ATGAAGT--T----A--T--AA-AAG--AT-----GAT--GAAAA---TCT-CC-A-G--CCT-A-----AT-TTC-AATGT--GTA-TA---G-T-TTGAAGta
gi|101487                     :             -TCC-A-A-TGC-ATTT--CAATGA----AT--T---------G-----A------A--AT--ACA-CTGAATA--TG--AA-
gi|101490                     :                                  ataA-T-CAT--T---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TGA-AA-G-AG-A-TT--C--AA-ATTCCTA-T-A-ACACG-C-T----CTT-A-A--C--CG-A-A--TCACGGG--CGT-A-TG--AATA-CACCA--C-T-GGAAC-T-A-C-ATA------TAACA-----T---T-TGTAC-TTG--TATAT-CTG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AA----AT-T--ATGAA-T--T--A-A--T--AA-AAG--AT---GAGAT--G-AAA---CCT-CC-A-G--CCT-A-----AA-TTC-AA--T--GCA-TA---G-T-TTGAAGAaatctgcaacattaaaattc
gi|101491                     :                      atttacttagtatccA-T-GAT--T---------G-----A------A--ATT-GGA-CTGGAAAA-TGG-AA-G-AGCA-TT--C--AC-ATTTCTA---A-AAACA-T-TACTCCTA-A-A--CGGCG-A-A--TCAC-GG--CGT-AATG--AATA-CATAAATC-T-GGAAC-T-A-C-ATA------TTACA-----T---TCTGTAC-TTG--TA-ATTCTGGTT---A-A---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GATAA----AT-A--ATGAAGT--T--TTA--T--AA-AAG--AT---G-GATTTGAAAA---CCT-CT-A-G--CCT-A-----AT-TTC-AA--TGGGCATTA---G-T-TTGAAAAta
gi|101492                     :                                                                              A-CTGCAAA--TG--TA-G-ACCA-TT--C--AA-ACTCTTA-T-A-AAACA-C-T----CTA-A-C--C--TG-A-A--TCAC-TG--CGT-A-TA--AATA-TACAA--C-T-ta
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gi|101483                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AGCTG-TATTT-CTCA-T-AAAT---------G-----A------A--AT--GCA-TTGGAAG--GG--AA-G-AACA-TT--T--AA-ATTCC--A-AA-ACAC-ACGTC----C-TA-A-A--C--CG-AGG-TC-AC-TG--CGT-ATTG--AATAAACAA--CTT-GGAAA-T-A-C-------A-T-CCA-----T-CGTG-T---AC-TTT--T---TGC-TA-CT---ATA---TGTT-ATGTGT-AGTA-AATA---GA-AAATACATTATGT-------A-A--AAA-T--AT---G-GAT--TAAGA---AAT-CC-A-A--TTT-TA-T-CTTAT--T--TTA-AA---GTT-TTGAAGA
gi|101484                     : ATATGT-T-ACAATTC-AG-TG-TAGTT-TGCT-TGCATT---------G-----AT-----A--AT--GCAACTGGAAA--TGCGAA-G-AGCA-TT--TCAAA-ATTTC-TA-TA-ACAC-AC--T----CCTA-A-A--T--CA-A-A-TC-AC-AA--CGA-A-TT--AATAT----------------C-A-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---A--TTG--TA-TT-CCTG-GT---ATA----G-T-ATATGT-AGTA-AATA---G--AAAT-AATGAAGT--TAATCT-A--AAA-G--AT---G------AAAAA---CCTCCC-ATA--CCTAAA-T-TTCAA--T--GCA-TA---G-C-TTCAAAAta
gi|101485                     : ACAT-T-T-ACA-TTC-AG-CG-T-TTT-CTCA-T-TATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAC--TG--AA-G-AACA-TT--T--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TT-A-A--C--CG-A-G-TC-AC-AG--CGT-A-TA--AATACACAta
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gi|101487                     : ATAT-T-C-ATA-TTC-AG-TG-TATTT-CAAT-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-TTGGAAA--TC--TG-C-AACA-TT--A--AA-ATTCtttaaaattgaggat
gi|101488                     :  TAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------GTTTCAA------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--CA-ATTCC-TAATA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-AATC-AC-GG--CGT-A-TG--AATACACAA--C-T-GGAAC---A-C-----ATA-TAACA-----T-C-TG-T---ACTTTG--TA-AT-C-TG-CT---AT----TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-AATGAAGT--TAATTA-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-A-G--TTC-TA-T-TTCAA--T--GTATTA---G---TTGAAGA
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Reference ( family-648 )      : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-A-TC-AC-GG--CGT-A-TG--AATACACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--TA-AT-C-TG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-NATGAAGT--TAA--A-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-TA---G-T-TTGAAGA
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gi|101471                     : ATAT-C-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA--TTTC-TA-TA-ACAC-AT--T----C-TA-A-A--C--TG-A-G-TC-AT-GG--CGT-A-TG--AATACACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-A-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--TC-GT-G-TG-TT---ATA---TG-T-ATGTGT-AGTA-AAT-----A-AACTACATAAAGT--AAA--A-A--AAA-AT-AT---G-GAT--TAAAA---CTT-CC-A-G--CCC-AA-T-TTCAA--T--TTA-AA---G-T-TTGAGGAta
gi|101472                     : ATAT-C-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AG-A-TT--C---A-ATTTC-TA-TA-A-AC-AT--T----C-TA-A-A--C--TG-A-G-TC-AT-GG--CGT-A-TG--AATA-ACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-A-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--TC-GT-G-TG-TT---ATA---TG-T-ATGTGT-AGTA-AAT-----A-AACTACATAAAGT--AAA--A-A--AAA-AT-AT---G-GAT--T-AAA---CTT-CC-A-G--CCC-AA---TTCAA--T--TTA-AA---G-T-TTGAGGAta
gi|101473                     : ATAT-C-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AACG-AG-A-TT--C---A-ATTTC-TA-TA-A-AC-AT--T----C-TT-A-A--C--TG-A-G-TC--T-GG--CGT-A-T---AAT-CA-GA--C-T-GGAAC-T-ACC-----ATA-A-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--TC-GT-G-TG-TT---AT----TG-T-TGATGT-AGT---AT-----A-AACTACATAAAG---TAA--A-A--AAA-A--ATATGG-GAT--TACAA-----T-CC-A-G--CCC-AATT-TTCAA--T--TTA-AA---G-T-TTGAGGAta
gi|101474                     : ATAT-TAT-AC--TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CAT----------G-----A------ATAAT--GCA-CTGGAAAGATG--AA-G-AGCA-TT--C--AATATTTC-T--TA-ACACGAC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-A-TC-AC-GG--TGT-A-TG--AATACACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-T--CA-----T-A-TG-T---AC-TTG--TA--T-C-TG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT--ATGAAGT--TAT--A-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAAAA---TCT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-TA---G-T-TTGAAGta
gi|101475                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCT-T-CATTTCTCTTATTG-----A------A--AA--TCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TA-A-C--A--CGCA-A-TC-AC-TG--CAT-A-TG--AATAC-TAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--TA-AT-C-TG-TT---ATA---TGTT-ATATGT-AGTA-AATA---AA-AAAT-AATGAAGT--T-A--G-A--AAA-G--AA---G-GGT---AAAA---TCT-CCGA-G--CTT-AA-T-TTCAA--T--GCA-TA---GTT-TTGAAGA
gi|101476                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AG-A-GGCA-TT--C--AA--TTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-A-TC-AC-GG--CGT-A-TG--AATACACAA--C-C--GAAC-TAA-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--T---T-----------------TG-T-ATTTGT-AA-A-AATA---GA-AAAT-AATGAAGTTATAA--A-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAAGA---CTT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--C--GTA-TA---G-G-TTGAAGAta
gi|101477                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCT-CTGCAAA--TG--TA-G-AGCA-TT--C--AA-ATCCC-TA-TA-ACAT-AC--T----C-TA-A-A--C--AG-G-G-CC-AT-GG--CGT-A-TG--AATACA-AA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATT-T-AGA-----T-C-TG-C---AC-TTG--CA-TT-T-TA-TT---ACA---TG-T-GTACGT-AATA-AATA----A-AAATACATGACGT--ACA--A-A--GAA-A--AT---G-GAT--GAAAA---CTT-CC-T-G--CCT-AG-T-TTCAA--T--TTA--A---G-TATTGAGGAta
gi|101478                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-A--TGTTATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGAAAG--TG--AA-GAAGCATTT--C--AA-ATTCC-TA-TATACAC-ACG-T----C-TA-A-AACC--CA-A-T-TC-AC--G--CGT-A-TG--AATACACAA--CTT-GGAAC-T-A-CA----ATA-T-ACAATCAGT-C-TG-T---AC-TTG--TA-AT-C-TG-CTATAATA---TG-TAATATGT-AG-A-AATA---GA-AAATAGATGAAGT--TTA--G-ATCAAA-G--AT---G---T--GAAAA---CCT-CC-A-AGTCCT-AA-T-TTCAAT-T--GTA-TAGTTG-T-TTGAAGAta
gi|101479                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTTTAAA--TG--AA-A-AACA-TT--C--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-C--A-A--C--CG-A-G-TC-AC-GG--CGT-A-TG--AATAAATAC--C-A-GGAA----------------------------C-TG-T---AC-TAG--CA-GC-C-TG-TT---ATA---TG-C-AAATG--A--A-AATACTTG--AAGT-AA--AACT--TGACGA-A--AAA-A--AT---G-AAG--GAAAA---CAT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-AA---A-T-TTGAAGAta
gi|101480                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TT-AATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AC--GCA-TTGAAAA--TG--AA-T-AGCT-TT--C--AA-ATTAA-TA-TA-ACAC-AC--T----C-AA-A-A--C--CG-A-G-GCTAC-GGGCCGT-A-TG--AATACAGAG--CGT-GGAGCTT-G-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---AC-TTG--CA-GT-C-TG-CT---ATA---TA-C-ATACAT-AGTA-AATA---GA-AAATACAT-AAGG--TAA--A-A--AAA-GCAAT---G-GAT--GAAAA---CGT-CC-A-G--CCT-TG-A-TTGAA--T--TTA-AA---G-T-TTGATGAta
gi|101481                     : ATAT-T-TTACA-TTCCAG-TG-TATTT-CTCAGT-CATT---------G-----GTCAAACA--AT--GCA-CTGGCAA--TG--AG-G---CA-TCTCC--AA-ATTTC-CA-TA-ACAC-AC--T----C-TTTA-A--C--CG-A-A-TC-AG-CG--CGTCA-TG--AATACACAA--C-TTGGACC-C-A-CCTACCATAAT-ACA-----T-C-TG-TTGTAC-TTG--TA-ATTC-TG-TC---ATAATATG-T-ATATTTTAGTATAATA---GA-AAAT-AATGAAGT--TAA--ACA--AAA-G--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-C-G--TCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-TA---G-T-TTTGAGAt
gi|101482                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTCC-TG-TA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-A-TC-AC-GG--CGT-A-TG--AATCCACAA--C-C-GGAAC-T-A-C-----ATA-T-ACta
gi|101483                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AGCTG-TATTT-CTCA-T-AAAT---------G-----A------A--AT--GCA-TTGGAAG--GG--AA-G-AACA-TT--T--AA-ATTCC--A-AA-ACAC-ACGTC----C-TA-A-A--C--CG-AGG-TC-AC-TG--CGT-ATTG--AATAAACAA--CTT-GGAAA-T-A-C-------A-T-CCA-----T-CGTG-T---AC-TTT--T---TGC-TA-CT---ATA---TGTT-ATGTGT-AGTA-AATA---GA-AAATACATTATGT-------A-A--AAA-T--AT---G-GAT--TAAGA---AAT-CC-A-A--TTT-TA-T-CTTAT--T--TTA-AA---GTT-TTGAAGA
gi|101484                     : ATATGT-T-ACAATTC-AG-TG-TAGTT-TGCT-TGCATT---------G-----AT-----A--AT--GCAACTGGAAA--TGCGAA-G-AGCA-TT--TCAAA-ATTTC-TA-TA-ACAC-AC--T----CCTA-A-A--T--CA-A-A-TC-AC-AA--CGA-A-TT--AATAT----------------C-A-C-----ATA-T-ACA-----T-C-TG-T---A--TTG--TA-TT-CCTG-GT---ATA----G-T-ATATGT-AGTA-AATA---G--AAAT-AATGAAGT--TAATCT-A--AAA-G--AT---G------AAAAA---CCTCCC-ATA--CCTAAA-T-TTCAA--T--GCA-TA---G-C-TTCAAAAta
gi|101485                     : ACAT-T-T-ACA-TTC-AG-CG-T-TTT-CTCA-T-TATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAC--TG--AA-G-AACA-TT--T--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TT-A-A--C--CG-A-G-TC-AC-AG--CGT-A-TA--AATACACAta
gi|101486                     : ATAT-T-T-ACA-TTC-AT-TG-TATTT-CTCATT-CATT---------G-----A------A--CT--GTA-CT--AAA--------------A-TT--C--AA-ATTCCTTT-TA-ACAC-AC--A----C-TC-ATA--A--TA-A-A-TC-AC-TG--CGT-A--G--GATATACAA--C-T-GGAAC---A-C-----ATT-T-ACA-----T-C-TG-T---A---TG--TA------TG-TT----------------------GTA-AAGA---AA-AAATATATGAAGT--AAA--A-A--AAA-T--AT---G-GTT--AAA------CT-TC-A-G--CCT--A-T-TCTAA--T--
gi|101487                     : ATAT-T-C-ATA-TTC-AG-TG-TATTT-CAAT-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-TTGGAAA--TC--TG-C-AACA-TT--A--AA-ATTCtttaaaattgaggat
gi|101488                     :  TAT-T-T-ACA-TTC-AG-TG-TATTT-CTCA-T-CATT---------GTTTCAA------A--AT--GCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--CA-ATTCC-TAATA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-AATC-AC-GG--CGT-A-TG--AATACACAA--C-T-GGAAC---A-C-----ATA-TAACA-----T-C-TG-T---ACTTTG--TA-AT-C-TG-CT---AT----TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-AATGAAGT--TAATTA-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAAAA---CCT-CC-A-G--TTC-TA-T-TTCAA--T--GTATTA---G---TTGAAGA
gi|101489                     :   AT-T-T-TCA-TCC-A--TC-TTTTTGCTCA-T--ATT---------G-----A------A--ATATGCA-CTGGAAA--TG--AA-G-AGCA-TT--C--AA-ATTTC-TA-TA-ACAC-AC--T----C-TA-A-A--C--CG-A-A-TC-AC-GG--TGT-A-TGTGAATACACAA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-T-ACA-----T-A-TG-T---AC-TTG--TA-AT-C-TG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-AATGAAGT--T-A--T-A--AAA-G--AT-----GAT--GAAAA---TCT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAATGT--GTA-TA---G-T-TTGAAGta
gi|101490                     :   AT-T-T-AC---TT-AG-TA-T------CCA-T-CATT---------G-----A------A--AT--GCA-CTGGAAA--TGA-AA-G-AG-A-TT--C--AA-ATTCC-TA-TA-ACAC-GC--T----C-TT-A-A--C--CG-A-A-TC-ACGGG--CGT-A-TG--AATACACCA--C-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-TAACA-----T-T-TG-T---AC-TTG--TATAT-C-TG-TT---ATA---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-TATGAA-T--TAA--T-A--AAA-G--AT---GAGAT--G-AAA---CCT-CC-A-G--CCT-AA-A-TTCAA--T--GCA-TA---G-T-TTGAAGA
gi|101491                     :                                 A-T-GATT---------G-----A------A--ATT-GGA-CTGGAAAA-TGG-AA-G-AGCA-TT--C--AC-ATTTC-TA--A-AAAC-AT--TACTCC-TA-A-A--CGGCG-A-A-TC-AC-GG--CGT-AATG--AATACATAAATC-T-GGAAC-T-A-C-----ATA-TTACA-----TTC-TG-T---AC-TTG--TA-ATTC-TGGTT---A-A---TG-T-ATATGT-AGTA-AATA---GATAAAT-AATGAAGT--TTT--ATA--AAA-G--AT---G-GATTTGAAAA---CCT-CT-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--TGGGCATTA---G-T-TTGAAAAta
gi|101492                     :                                                                        A-CTGCAAA--TG--TA-G-ACCA-TT--C--AA-ACTCT-TA-TA-AAAC-AC--T----C-TA-A-C--C--TG-A-A-TC-AC-TG--CGT-A-TA--AATATACAA--C-T-ta
gi|101493                     :                                                                                                                                                      -A-TC-AC-GG--CGT-A-TA--AACAAACAA--C-T-GGAAC-T-A-T-----ATA-T-ACG-----T-C-TG-C---AC-TTG--TA-AG-C-TG-
gi|101494                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    G-T-ATATGT-AGTA-AATA---GA-AAAT-AGTGACGT--TAA--T-A--AAA-G--AT---G-GAT--GAATA---CCT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAC--T--GCA-TA---G-T-TTGAAAA
gi|101495                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATA---GA-AAAT-AATGAAGT--TTA--T-A--ATATG--AT---G-GAT--GAAAATCCCCT-CC-A-G--CCT-AA-TGTTCAA--T--GTA-TA---G-T-TTGAAGta
gi|101496                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA-A--AT---G-GAT--GACAA---CTT-CC-A-G--CCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-AT---G-T-TTGAAGAtata
gi|101497                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A-G--CCT-AA-T-TTCAA--T--GTA-TA---G-T-TTGAAGAta


blockSeqs                     :     G A T   A   C  C  T     G    G G    TCTCTTATT TTTCA TCAAAC TA  AT   A       GA  CG  C A    T  TC CA  T     T  A  T    G  GT ACTC C  T T AC GG  C G A  T  G  GC   C T  TG         AT T T     GTA C CTACC   A A   ATCAG T G  T TGT  T   TA  TA T C  G  ATA   ATA  T A      T    T    CTT  T    AC       TATA CGA  TC   T CA  ATG A   TT     TCC   C  G T GT   A  T G     TG GG   TT GTT T A
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    T .    .         .     T      .   T    .       A   A   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  G  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . A  .          .  G .     TA  . A       . A   .     . .  . .    .   .   A  G .  .  .     .    T .      .    .    .    .    AC       AA   TCT  .    . T   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     T  .    TT .   T .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   G   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  T .     TT  . .       . T   .     . .  . .    .   .   G  T .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AC       AA   TTA  .    . T   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    T  .   . .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   G  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AC       TA   AC   .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    A  .   . .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   G  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AG       TA   AT   .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    A  .   . .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   A  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AC       AC   G    .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    A  .   . .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   T  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AC       TT   A    .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    T  .   . .
blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   A  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    AT       TG   A    .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    T  .   . .
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blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     T   . .       . .   .     . .  . .    .   .   .  . .  .  .     .    . .      .    .    .    .    T        TT   A    .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    T  .   . .
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blockSeqs                     :     . . .   .   .  .  .     .    . .    .         .     .      .   .    .       .   .   . .    .  .  .   .     .  .  .    .  .  .    .  . . .  .   . . .  .  .  .    . .  .          .  . .     .   . .       . .   .     . .  . .    .   .   .  . .  .             . .      .    .    .    .    A        T    T    .    . .   .   .   .      .     .  . . .    .  . .     .  .    A  .   . .
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