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Reference ( gi|33412 )        :                                                                                                                           ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGA--A---G-GA-TC--C---T-GA----G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTTG--GT---G-CTG---------CAGG-A--G-A-----CG-A-----------------------A-TT--CT-T--AGAAG--TAC--TT--GAAA---TT-TG-AA---T-T-G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATT--GCTGA--A--G-G-A-TC--C---T-GA----GTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
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gi|33426                      :                                                           tgttgtatatgatgtgggttgtgttgttgatatatcagaagacaggtcttccgttttagtcgacATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGA--G---G-GC-TC--A---T-AG----G-TT--G---A-----TTTGT-AT-G-AAGAA-
gi|33411                      :                                                        tgttgttgtatatgacgtgggctgtgttgttgatatatcagatgacaggttttcagttttagtcgacATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGA--G---G-GC-TC--A---T-AG----G-TT--G---A-----TTTGT-AT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--G-ATT-G-C--G-T
gi|33414                      :                                                                                                                            TTTGCG---TTG-AAG-G---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGA--A---G-GA-TC--G---T-GG----G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTTG--GT---A-GAG---------CAGG-A--G-A-----CG-A-----------------------A-TT--CT-C--AGAAG--TAG--TT--GCAT---TT-TG-AG---T-A-G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACT--GTTGA--A--G-G-A-TC--C---T-GG----GTT--AA-TTCTT-GTA-AAGAGTggggaaaccagaagtcagggtctcataattagataaactgtgagtagaaga
gi|33415                      :                                                                                                                            TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGA--A---G-GA-TC--C---T-GG----G-TT--A---A-----TTCTT-GT-A-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTCA--AT---A-CAC---------CAGG-A--G-A-----CG-A-----------------------A-TT--CT-T--GAAAG--TAG--TC--GAAA---TT-TT-AG---T-T-G-GA-GA---T-GAATC-G--G-T-AAA--T---ACC--GTTGA--A--G-G-A-TC--G---T-GG----GTT--AA-TTCTT-TTG-AGGAAT
gi|33416                      :                                                                                                                            TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGA--A---G-GA-TC--A---T-GG----G-TT--A---A-----TACTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTTG--GT---A-GTC---------CAGG-A--G-A-----CA-A-----------------------T-TT--CT-C--GGAAG--TAG--TT--GCAA---TT-TG-AG---T-C-G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACC--GTTGA--A--G-G-A-TC--G---T-GG----GTT--AA-TTCTT-TTG-AAGAGT
gi|33417                      :                                                                                                                            TTTGAAGTTTCG-AAA-GCACTG-AATC-GGTGTC-GA--T---ACT--GC-TGA--A---G-GAATC--C---T-GG----G-TT--A---C-----TTCTTAGT-G-AGGAAGT-----C-TGTGTG--TTGA---T-AAGAGGTT--G-GTT-G-T----TG--------------------GTTG--GT---G-CTG---------C-GG-A--GAA-----CG-A-----------------------A-TT--CT-TA-AGAAGAATAG--TT--GAAATATTC-TG-AA---T-T-GCCA-GA---T-GAATC-A--GTT-TGA--T---ACC--GTGAA--A--G-G-A-TC--G---T-G-----GTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33419                      :                                                                                                                            TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AAAC-GAT--A-GA--T---ACT--GC-TGA--A---A-GA-TC--G---T-GG----G-TT--A---A-----TTCTG-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTT--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTTG--GT---A-TAC---------CAGG-A--G-A-----TG-A-----------------------A-TT--CT-C--GGATG--TAG--TT--GAAA---TT-TG-AG---T-C-G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGG--GATGA--A--G-A-A-TC--T---T-G
gi|33418                      :                                                                                                                            TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGA--A---G-GA-TCAAC---TGGG----G-TT--A---ATTTTTTTCTT-GTAA-AAGAG-T-----A-TGT-TGGTTTGAA--TAAAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTCA--AT---A-CC----------CAGT-A--GTA-----CGAA-----------------------A-TT--CT-T--GAAAG--TG---TC--GAAA---TT-TT-AG---T-T-GCGA-GA---T-GAATC-G--G-T--AA--T---A-C--GTTAA--G--G-A-A-TC--G---T-G-----GTT--TA-TTCTT-TTGCAGGAATtgaagaat
gi|33425                      :                                                                                                                               GAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGA--A---G-GAATC--G---T-G-----G-TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAA-
gi|33420                      :              tcgatactacgctgaaggatcctgggttaattcttttgaagagtgtgttgttgaataagaggtggtgtgttgttggtaggtccaggagcgattttcgaagtagttgaaatgagGAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGA--A---G-GAATC--G---T-G-----G-TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAAAT-----C-TGT-T---TTGAA--T-AAGATGTG--G---T-G-T--G-TT--------------------GCTA--GT---A---GA--------CAAG-ATAA-A-----AG-A-----------------------A-TT--CT-C--TGAAT--TAT--TTTGAAAA---TT-AGTAG---T-T-A-AA-AG---T-GAATC-A--G-T-AGA--T---ACT--GCTGA--A--G-A-G-TC--T---T-GT----GTTC-GA-TTCTT-TTG-AAGAAT
gi|33424                      :                                                                                                                               GGG---TTG-AAG-A---TG-ATTC-GGT----GA--TC--ACC--GT-TGA--A---ACGA-CT--CGGGT-GG----G-TT--A---A-----TTC-T-GT-G-AGGAA-T-----
gi|33401                      : gtcgatactgcgtggaactggatcctggggctatacattcttttgaagagtgtgttgttgaataagaggtgggttgatgagtgttggtagtccaggagagcgattttctcggaagtagttgaactgGGG---TTG-AAG-A---TG-ATTC-GGT----GA--TC--ACC--GT-TGA--A---ACGA-CT--CGGGT-GG----G-TT--A---A-----TTCT--GT-G-AGGAA-TTCTGCC-TGT-TT--TTGAAATT-AAGATGTG--G-GTT-G-TG-G-TT--------------------GCTA--GTTAGA-CCA---------AAGATA--A-G-----TA-A-----------------------A-TT--CT-T---GAAG--TAT--TT--GAAA---TT-GT-AG---T-TCA-AA-GA---T-GAAT--A--G-T-AGA--T---ACT--GCTGA--A--G-G-A-T---C---T-AATGTTGTC--GA-TTCTT--TG-AAGAAT
gi|33403                      :                                                                                                                           aactgAG---TTA-AAA-G---TG-AATC-AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGA--A---G-AG-TC--T---T-GT----G-TTC-G---A-----TTCTT-TT-G-AAGAA-T-----C-TG
gi|33421                      :                                                                                                                           aattagt---TCA-AAG-A---TG-AAT--AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGA--A---G-GA-T---C---T-AATGTTG-TC--G---A-----TTCTT--T-G-AAGAA-T-----C-TGT-AG--TT-AA--T-AAGAACTG--GTTTT-G-T--G-TT--------------------GTCGCAAA---A-C-----------CAGG-A--G-A-----CG-ATGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTGA-TT--CT-TGGAGATG--TGCTATT--GAAAATCTT-TG-AAGTTT-C-G-AA-AGCACT-GAATC-GGTG-T-CGA--T---ACT--GCTGA--A--G-GAA-TC--C---T-GG----GTT--AC-TTCTTAGTG-AGGAA
gi|33422                      :                                                                                                                                       G-AAG-G---TG-ATTTTGGT--A-GA--TTTTACT--GC-TGA--AAA-G-GA-TC--G---TAGG----G-TTTAA---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGA---T-AAGAGGTT--G-GTT-G-T--G-TT---------------------TTG--GT---A-GAG---------CAGG-A--G-A-----CG---------------------------TT--CT-C--AGA-G--TCG--TT--GCAT---TT-TG-AG---T-A-G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACT--GTTGA--A--G-G-A-TCAAC---TGGG----GTT--AA-TTTTT-
gi|33423                      :                                                                                                                                          AG-A---TG-AATC-AGT--TTGA--T---ACC--GT-GAA--A---G-GA-TC--G---T-G-----G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----TGTGT-TG--TT--A--T-AAGAGGTG--G-GTTTG-TTGG-TT--------------------GTTG--GT---AAC-----------CAGG-A--G-AGATTACG-A-----------------------AATTAGTC-T--GAAAA--TAC--T----ATA---GT-T---A---TAT-G-AA-GG---T-GATTTTG--G-T-AGA--TTTTACT--GCTGA--AAAG-G-A-TC--G---TAGG----GTTTAAA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33424                      :                                                                                                                                                          GT--C-GA--T---ACT--GCGTGG--AACTG-GA-TC--C---T-GG----GGCT--ATACA-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-GAT--GAGT--------------------GTTG--GT---A-GTC---------CAGG-A--G-AG----CG-AT----------------------T-TT--CT-C--GGAAG--TAG--TT--G-AA---CT-GG-GG---T-T-G-AA-GA---T-GATTC-G--G-T--GA--TC--ACC--GTTGA--A--ACG-A-CT--CGGGT-GG----GTT--AA-TTC-T-GTG-AGGAAT
gi|33425                      :                                                                                                                                                           T--C-GA--T---ACTACGC-TGA--A---G-GA-TC--C---T-GG----G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G---T-G-T--G-TT--------------------GTTG--GTA--G-GTC---------CAGG-A--G-------CG-A--------------------------T--TT-T--CGAAG--TAG--TT--GAAA---TGAGG-AG---T-T-G-AAGGA---TGGAATC-G--G-TAAGA--T---ACC--GTTGA--A--G-GAA-TC--G---T-G-----GTT--AACTTCTT-GTG-AGGAA
gi|33430                      :                                                                                                                                                           T--C-GA--T---ACTACGC-TGA--A---G-GA-TC--C---T-GG----G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----
gi|33426                      :                                                                                                                                                                                                                                                      -TGT-TG--TTGTA--T-ATGACGTG--G-GCT-G-T--G-TT--------------------GTTG--AT---A-TAT---------CAGA-T--G-A-----CA-G-----------------------G-TT--TT-C--AGTTT--TAG--TC--GACA---TT-TG-AG---T-T-G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GGTTT---ACT--GATGA--G--G-G-C-TC--A---T-AG----GTT--GA-TTTGT-ATG-AAGAA
gi|33427                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -TG--TTGTA--T-ATGATGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------GTTG--AT---A-TAT---------CAGA-A--G-A-----CA-G-----------------------G-TC--TT-C--CGTTT--TAG--TC--GACA---TT-TG-AG---T-T-G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GG--T----TT--ACTGATGA--G-G-ACTC--A---T-GG----GTT--GA-TTCGT-GTG-AAGAA
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gi|33409                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA---TT-TG-AG---T-C-G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGG--GATGA--A--G-A-A-TC--T---T-G
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Reference ( family-573 )      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-CNCCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
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gi|33397                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-AGT--T-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-CACCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTATC-TGAAA--TA----TA-T--AAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GG---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33398                      :       aATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGC-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--G-GCT-G-T--G-TT--------------------------GCTG---GT-A-GCCCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TC--TG-AG---T-C----A-AA-GA---T-GATTC-T--G-T-CGA--T---AATGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AG-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33399                      :       aATTTTAG---TTG-GAG-A---TG-AATC-GGT--A-AA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-CACCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-TGAAA--TA----TA-C--AAAT---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--A--T-G-GGTT--AA-TACTT-TTG-AAGAGT
gi|33400                      :       aATTTTAG---TTGCGAG-A---TG-AATC-GGT----AA--T---AC---GT-TAAG---G-A-A-TC--G--T-G-GT-TT--A---------TTCTT-TT-GCAGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTA--G-GTT-G-T--G-TTCTGTAGTTAAATAAGAACTGGTTTGTGTTGTCGGC-A-AACCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33401                      :           aGGG---TTG-AAG-A---TG-ATTC-GGT----GA--TC--ACC--GT-TGAA---ACG-ACTC--GGGT-G-GG-TT--A---A-----TTCT--GT-G-AGGAA-TTCTGCC-TGT-TT--TTGAAATT-AAGATGTG--G-GTT-G-T--GGTT--------------------------GCTA---GTTA-GACCAAAG-AT-A-AGTAA-----------------------ATTCTT-G-AAG--TA----TT-T--GAAA---TT--GT-AG---TTC----A-AA-GA---T-GAAT--A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TCTAA--T-GTTGTC--GA-TTCTT--TG-AAGAAT
gi|33402                      :   aactgATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---AAT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTG----T-AAATTGTGTTG-GTT-G-C--G-TT--------------------------GTTG---
gi|33403                      :            aAG---TTA-AAA-G---TG-AATC-AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-A-G-TC--T--T-G-TG-TTC-G---A-----TTCTT-TT-G-AAGAA-T-----C-TG
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gi|33405                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-G-AG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-GACCAG-G-AG-A-GG--A-----------------------AATATG-GGAAG--TA----GT-T--GTAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-TGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TT--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33406                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-G-AG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--A-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-G-CTGCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33407                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-G-AG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--A-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-G-CTGCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33408                      :       aATGTGAG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACA--GC-TGAA---G-G-A-TT--G--T-G-TG-TT--A---A-----TTTTT-GT-G-ATGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-ATGACGTG--T-ACT-G-T--G-TC--------------------------GCTG---GT-T-CACCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------TTTCTCTGAAAGA-TA-------C--GAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAAAC-G--A-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--A-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTG-GTG-AGGAAT
gi|33409                      :       aATTTGAG---TCG-ATG-A---TA-AGTC-GGC--G-GA--T---AGG--GA-TGAA---G-A-A-TC-----------------------------TT-GT-G-AAGAA-T-----G-TTT-TG--TTGAA--T-AAGAAGTG--A-GGT-G-A--G-TT--------------------------GTTT---GT-A-CACCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------ATTCGC-GGAAT--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-A--G-T-AAA--A---ACTG--AATA--A-G-A-T---G--T-G-GGTT--
gi|33410                      :       aATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----A-TGT-TG--TTG
gi|33411                      :       aATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGAG---G-G-C-TC--A--T-A-GG-TT--G---A-----TTTGT-AT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--G-ATT-G-C--G--T--------------------------G--G---GG-A-AACCAG-A-AG-T-CA--G-----------------------GGTCTC-ATAAT--TA----GA-T--AAAC---TG--TG-AG---T-A----G-AA-GA---
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gi|33414                      :         TTTGCG---TTG-AAG-G---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-GAGCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-AGAAG--TA----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTA-AAGAGT
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gi|33416                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--A--T-G-GG-TT--A---A-----TACTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-GTCCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GCAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AAGAGT
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gi|33418                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--AACTGG-GG-TT--A---ATTTTTTTCTT-GTAA-AAGAG-T-----A-TGT-TGGTTTGAA--TAAAGAGGTG--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-A-C-CCAG-T-AGTA-CGA-A-----------------------ATTCTT-GAAAG--T-----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----GCGA-GA---T-GAATC-G--G-T--AA--T---AC-GTTAA-G--G-A-A-TC--G--T-G-GTTT---A-TTCTT-TTGCAGGAAT
gi|33419                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AAAC-GAT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---A-G-A-TC--G--T-G-GG-TT--A---A-----TTCTG-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTT--G-GTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-A-TACCAG-G-AG-A-TG--A-----------------------ATTCTC-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGGGATGA-A--G-A-A----------------------TCTT-GTG-AAGAAT
gi|33420                      :            GAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-AATC--G--T-G-G--TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAAAT-----C-TGT-T---TTGAA--T-AAGATGTG--G---T-G-T--G-TT--------------------------GCTA---GT-A-GACAAG-ATAA-A-AG--A-----------------------ATTCTC-TGAAT--TA----TT-TTGAAAA---TT--AGTAG---T-T----A-AA-AG---T-GAATC-A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-A-G-TC--T--T-G-TGTTC-GA-TTCTT-TTG-AAGAAT
gi|33421                      :               ---TCA-AAG-A---TG-AAT--AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TCTAA--T-GTTG-TC--G---A-----TTCTT--T-G-AAGAA-T-----C-TGT-AG--TT-AA--T-AAGAACTG--GTTTT-G-T--G-TT--------------------------GTCG---CA-A-AACCAG-G-AG-A-CG--ATGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTGATTCTT-GGAGA--TGTGCTAT-T--GAAAATCTT--TG-AAGTTT-C----G-AA-AGCACT-GAATC-GGTG-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-GAA-TC--C--T-G-GGTT--AC-TTCTTAGTG-AGGAA
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gi|33423                      :                       AG-A---TG-AATC-AGT--TTGA--T---ACC--GT-GAAA---G-G-A-TC--G--T-G-G--TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----TGTGT-TG--TT--A--T-AAGAGGTG--G-GTTTG-TTGG-TT--------------------------GTTG---GT-A--ACCAG-G-AG-A-----G-----------------------ATTA-C-GAAAT--TA----GTCT--GAAA---ATACTATAG---T-TATATG-AA-GG---T-GATTTTG--G-T-AGA--TTTTACTGCTGA-AAAG-G-A-TC--G--TAG-GGTTTAAA-TTCTT-GTG-AGGAAT
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lowQualScore                  :               ... . .   . ...  .    .   ....  .. ...   ..  .    ... . . .  ..... .  . .  .. ... .....     .  . .     . .......   .  ..   . .. .        ..    . . .. .  ..........................    ...  . ...    . .  . .  .. .......................      ..    ..  ....  . ..    ...  ..  .  ... ...... .  .  ... .     . .. . ..  .. ...        . .. . . .  ..... . .    ..  .     .   .      
lowQualScore                  :               666 7 4   4 444  4    4   2222  44 444   44  2    999 2 2 5  66666 5  2 2  00 222 44444     2  2 2     5 6666666   3  88   6 88 3        88    6 3 88 6  44444444444444444444444444    333  3 333    3 3  7 3  22 77777777777777777777777      00    22  8888  3 88    777  55  7  333 111111 7  3  333 4     4 00 4 33  99 999        4 00 4 9 4  99999 9 4    44  5     5   5      
consensus                     :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
Reference ( family-573 )      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33396                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-A--G-T-TGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33397                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-AGT--T-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTATC-TGAAA--TA----TA-T--AAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GG---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33398                      :       aATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGC-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGCT-G-T--G-TT--------------------------GCTG---GT-AGC-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TC--TG-AG---T-C----A-AA-GA---T-GATTC-T--G-T-CGA--T---AATGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AG-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33399                      :       aATTTTAG---TTG-GAG-A---TG-AATC-GGT--A-AA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-TGAAA--TA----TA-C--AAAT---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--A--T-G-GGTT--AA-TACTT-TTG-AAGAGT
gi|33400                      :       aATTTTAG---TTGCGAG-A---TG-AATC-GGT----AA--T---AC---GT-TAAG---G-A-A-TC--G--T-GG-T-TT--A---------TTCTT-TT-GCAGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTA--GGTT-G-T--G-TTCTGTAGTTAAATAAGAACTGGTTTGTGTTGTCGGC-AAA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33401                      :           aGGG---TTG-AAG-A---TG-ATTC-GGT----GA--TC--ACC--GT-TGAA---ACG-ACTC--GGGT-GG-G-TT--A---A-----TTCT--GT-G-AGGAA-TTCTGCC-TGT-TT--TTGAAATT-AAGATGTG--GGTT-G-T--GGTT--------------------------GCTA---GTTAGA-CCAAAG-AT-A-AGTAA-----------------------ATTCTT-G-AAG--TA----TT-T--GAAA---TT--GT-AG---TTC----A-AA-GA---T-GAAT--A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TCTAA--T-GTTGTC--GA-TTCTT--TG-AAGAAT
gi|33402                      :   aactgATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---AAT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTG----T-AAATTGTGTTGGTT-G-C--G-TT--------------------------GTTG---
gi|33403                      :            aAG---TTA-AAA-G---TG-AATC-AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-A-G-TC--T--T-GT-G-TTC-G---A-----TTCTT-TT-G-AAGAA-T-----C-TG
gi|33404                      : aattagtATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--T-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TT--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TA--------------------------GTTG---GT-TGT-CCAG-G-AG-A-GG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TG--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACAGCTGA-A--G-G-A-TT--G--T-G-TGTT--AA-TTTTT-GTG-ATGAAT
gi|33405                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGA-CCAG-G-AG-A-GG--A-----------------------AATATG-GGAAG--TA----GT-T--GTAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-TGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TT--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33406                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--AGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33407                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--AGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33408                      :       aATGTGAG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACA--GC-TGAA---G-G-A-TT--G--T-GT-G-TT--A---A-----TTTTT-GT-G-ATGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-ATGACGTG--TACT-G-T--G-TC--------------------------GCTG---GT-TCA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------TTTCTCTGAAAGA-TA-------C--GAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAAAC-G--A-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--A-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTG-GTG-AGGAAT
gi|33409                      :       aATTTGAG---TCG-ATG-A---TA-AGTC-GGC--G-GA--T---AGG--GA-TGAA---G-A-A-TC-----------------------------TT-GT-G-AAGAA-T-----G-TTT-TG--TTGAA--T-AAGAAGTG--AGGT-G-A--G-TT--------------------------GTTT---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------ATTCGC-GGAAT--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-A--G-T-AAA--A---ACTG--AATA--A-G-A-T---G--T-G-GGTT--
gi|33410                      :       aATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----A-TGT-TG--TTG
gi|33411                      :       aATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGAG---G-G-C-TC--A--T-AG-G-TT--G---A-----TTTGT-AT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--GATT-G-C--G--T--------------------------G--G---GG-AAA-CCAG-A-AG-T-CA--G-----------------------GGTCTC-ATAAT--TA----GA-T--AAAC---TG--TG-AG---T-A----G-AA-GA---
gi|33412                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33413                      :        ATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGAG---G-A-C-TC--A--T-GG-G-TT--G---A-----TTCGT-GT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--GATT-G-C--G--T--------------------------G--G---GT-AAA-CCAG-A-CG-T-CA--G-----------------------GGTCTC-ATAAT--TA----GA-T---AAA---TTG-TG-AG---T-A----G-AA-GA---
gi|33414                      :         TTTGCG---TTG-AAG-G---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGA-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-AGAAG--TA----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTA-AAGAGT
gi|33415                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-A-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GAAAG--TA----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----G-GA-GA---T-GAATC-G--G-T-AAA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AGGAAT
gi|33416                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--A--T-GG-G-TT--A---A-----TACTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GCAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AAGAGT
gi|33417                      :         TTTGAAGTTTCG-AAA-GCACTG-AATC-GGTGTC-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-GAA-TC--C--T-GG-G-TT--A---C-----TTCTTAGT-G-AGGAAGT-----C-TGTGTG--TTG-A--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T----TG--------------------------GTTG---GT-GCT-GC-G-G-AGAA-CG--A-----------------------ATTCTTAAGAAGAATA----GT-T--GAAATATTC--TG-AA---T-T----GCCA-GA---T-GAATC-A--GTT-TGA--T---ACCGTGAA-A--G-G-A-TC--G--T---GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33418                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--AACTGGG-G-TT--A---ATTTTTTTCTT-GTAA-AAGAG-T-----A-TGT-TGGTTTGAA--TAAAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-AC--CCAG-T-AGTA-CGA-A-----------------------ATTCTT-GAAAG--T-----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----GCGA-GA---T-GAATC-G--G-T--AA--T---AC-GTTAA-G--G-A-A-TC--G--T-G-GTTT---A-TTCTT-TTGCAGGAAT
gi|33419                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AAAC-GAT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---A-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTG-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ATA-CCAG-G-AG-A-TG--A-----------------------ATTCTC-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGGGATGA-A--G-A-A----------------------TCTT-GTG-AAGAAT
gi|33420                      :            GAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-AATC--G--T-GG---TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAAAT-----C-TGT-T---TTGAA--T-AAGATGTG--G--T-G-T--G-TT--------------------------GCTA---GT-AGA-CAAG-ATAA-A-AG--A-----------------------ATTCTC-TGAAT--TA----TT-TTGAAAA---TT--AGTAG---T-T----A-AA-AG---T-GAATC-A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-A-G-TC--T--T-G-TGTTC-GA-TTCTT-TTG-AAGAAT
gi|33421                      :               ---TCA-AAG-A---TG-AAT--AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TCTAA--T-GTTG-TC--G---A-----TTCTT--T-G-AAGAA-T-----C-TGT-AG--TT-AA--T-AAGAACTG--GTTTTG-T--G-TT--------------------------GTCG---CA-AAA-CCAG-G-AG-A-CG--ATGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTGATTCTT-GGAGA--TGTGCTAT-T--GAAAATCTT--TG-AAGTTT-C----G-AA-AGCACT-GAATC-GGTG-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-GAA-TC--C--T-G-GGTT--AC-TTCTTAGTG-AGGAA
gi|33422                      :                    G-AAG-G---TG-ATTTTGGT--A-GA--TTTTACT--GC-TGAAAA-G-G-A-TC--G--TAGG-G-TTTAA---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGA---T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT---------------------------TTG---GT-AGA-GCAG-G-AG-A-CG---------------------------TTCTC-AGA-G--TC----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--AACTGG-GGTT--AA-TTTTT-
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gi|33424                      :                                       GT--C-GA--T---ACT--GCGTGGAACTG-G-A-TC--C--T-GG-GGCT--ATACA-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-GAT--GAGT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-AGCG--AT----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--G-AA---CT--GG-GG---T-T----G-AA-GA---T-GATTC-G--G-T--GA--TC--ACCGTTGA-A--ACG-ACTCGGG--T-G-GGTT--AA-TTC-T-GTG-AGGAAT
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Reference ( family-573 )      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
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gi|33415                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-A-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GAAAG--TA----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----G-GA-GA---T-GAATC-G--G-T-AAA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AGGAAT
gi|33416                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--A--T-GG-G-TT--A---A-----TACTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GCAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AAGAGT
gi|33417                      :         TTTGAAGTTTCG-AAA-GCACTG-AATC-GGTGTC-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-GAA-TC--C--T-GG-G-TT--A---C-----TTCTTAGT-G-AGGAAGT-----C-TGTGTG--TTG-A--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T----TG--------------------------GTTG---GT-GCT-GC-G-G-AGAA-CG--A-----------------------ATTCTTAAGAAGAATA----GT-T--GAAATATTC--TG-AA---T-T----GCCA-GA---T-GAATC-A--GTT-TGA--T---ACCGTGAA-A--G-G-A-TC--G--T---GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33418                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--AACTGGG-G-TT--A---ATTTTTTTCTT-GTAA-AAGAG-T-----A-TGT-TGGTTTGAA--TAAAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-AC--CCAG-T-AGTA-CGA-A-----------------------ATTCTT-GAAAG--T-----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----GCGA-GA---T-GAATC-G--G-T--AA--T---AC-GTTAA-G--G-A-A-TC--G--T-G-GTTT---A-TTCTT-TTGCAGGAAT
gi|33419                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AAAC-GAT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---A-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTG-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ATA-CCAG-G-AG-A-TG--A-----------------------ATTCTC-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGGGATGA-A--G-A-A----------------------TCTT-GTG-AAGAAT
gi|33420                      :            GAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-AATC--G--T-GG---TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAAAT-----C-TGT-T---TTGAA--T-AAGATGTG--G--T-G-T--G-TT--------------------------GCTA---GT-AGA-CAAG-ATAA-A-AG--A-----------------------ATTCTC-TGAAT--TA----TT-TTGAAAA---TT--AGTAG---T-T----A-AA-AG---T-GAATC-A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-A-G-TC--T--T-G-TGTTC-GA-TTCTT-TTG-AAGAAT
gi|33421                      :               ---TCA-AAG-A---TG-AAT--AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TCTAA--T-GTTG-TC--G---A-----TTCTT--T-G-AAGAA-T-----C-TGT-AG--TT-AA--T-AAGAACTG--GTTTTG-T--G-TT--------------------------GTCG---CA-AAA-CCAG-G-AG-A-CG--ATGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTGATTCTT-GGAGA--TGTGCTAT-T--GAAAATCTT--TG-AAGTTT-C----G-AA-AGCACT-GAATC-GGTG-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-GAA-TC--C--T-G-GGTT--AC-TTCTTAGTG-AGGAA
gi|33422                      :                    G-AAG-G---TG-ATTTTGGT--A-GA--TTTTACT--GC-TGAAAA-G-G-A-TC--G--TAGG-G-TTTAA---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGA---T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT---------------------------TTG---GT-AGA-GCAG-G-AG-A-CG---------------------------TTCTC-AGA-G--TC----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--AACTGG-GGTT--AA-TTTTT-
gi|33423                      :                       AG-A---TG-AATC-AGT--TTGA--T---ACC--GT-GAAA---G-G-A-TC--G--T-GG---TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----TGTGT-TG--TT--A--T-AAGAGGTG--GGTTTG-TTGG-TT--------------------------GTTG---GT-A-A-CCAG-G-AG-A-----G-----------------------ATTA-C-GAAAT--TA----GTCT--GAAA---ATACTATAG---T-TATATG-AA-GG---T-GATTTTG--G-T-AGA--TTTTACTGCTGA-AAAG-G-A-TC--G--TAG-GGTTTAAA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33424                      :                                       GT--C-GA--T---ACT--GCGTGGAACTG-G-A-TC--C--T-GG-GGCT--ATACA-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-GAT--GAGT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-AGCG--AT----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--G-AA---CT--GG-GG---T-T----G-AA-GA---T-GATTC-G--G-T--GA--TC--ACCGTTGA-A--ACG-ACTCGGG--T-G-GGTT--AA-TTC-T-GTG-AGGAAT
gi|33425                      :                                        T--C-GA--T---ACTACGC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G--T-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGGTCCAG-G-AG---CG--------------------------ATTTTC--GAAG--TA----GT-T--GAAA---TGA-GG-AG---T-T----G-AAGGA---TGGAATC-G--G-TAAGA--T---ACCGTTGA-A--G-GAA-TC--G--T---GGTT--AACTTCTT-GTG-AGGAA
gi|33426                      :                                                                                                                              -TGT-TG--TTGTA--T-ATGACGTG--GGCT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---AT-ATA-TCAG-A-TG-A-CA--G-----------------------GTTTTC-AGTTT--TA----GT-C--GACA---TT--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GGTTT---ACTGATGA-G--G-G-C-TC--A--T-A-GGTT--GA-TTTGT-ATG-AAGAA
gi|33427                      :                                                                                                                                  -TG--TTGTA--T-ATGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---AT-ATA-TCAG-A-AG-A-CA--G-----------------------GTCTTC-CGTTT--TA----GT-C--GACA---TT--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GGTTT---ACTGATGA-G--G-A-C-TC--A--T-G-GGTT--GA-TTCGT-GTG-AAGAA
gi|33428                      :                                                                                                                                        TGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GCTG---GT-AGC-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAA--TA----GT-T--GAAA---TC--TG-AG---T-C----A-AA-GA---T-GATTC-T--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AG-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33429                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----
gi|33430                      :                                        T--C-GA--T---ACTACGC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----


blockSeqs                     :               GTT   C   G CAC  G    T   GTC   TT TTT   AC  G    ACT C A C  GGG   G  T G  TA TAC TTTTT     A  A C     G TCTGCC    G  GT     AT A        TT    T A TG G  CTGTAGTTAAATAAGAACTGGTTTGT    TCG  T GGT    A T  A G  TA TGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTG      TG    AA  TGCT  C TG    TAT  AC  T  GTT TATAT  C  G  CAC G     T GT T AA  TT TTT        T AA C A C  TAA   G T    TA  C     A   C
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   AA    TT C     AC  .    AA  . . A  AAC   A  . .  C  .   C         .  . .     A TG        .  .      .  .        .     T . .  A  .                             .    . CA     . .  T .  A  T                            AA    A   .     . .     ATC  G   T  .   TC     C  .  .   .     . .  . A   TT C          . .  . A .  AAC   A .    C   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   TT    .  .     .   .    .   . . .  TAA   .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GC     . .  . .  .  .                            T     .   .     . .     .    A   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  GGG   . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   T     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . A         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . AA     . .  . .  .  .                            T     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  A     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GT     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  C     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .   .     . .  . T   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   T     .  .     .   .    .   . . .  T     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CT     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CT     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  C     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  C     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . G         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . A         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . AA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   A      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   G     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CT     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  C     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . AA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   A      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  C     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  A     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   A      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . T   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  A     .  . .  .  .   .         .  . .     . A         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GT     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .   .     . .  . G   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . A         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . CT     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . TA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  T     . .    .   .     .   .
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blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . AA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . A   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   A     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .   .     . .  . C   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . C         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GT     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   A      .  .  .   .     . .  . .   .  .          . .  . . .  A     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . G         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . TA     . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . .   .  .          . .  . . .  A     . .    .   .     .   .
blockSeqs                     :               .     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  G     .  . .  .  .   .         .  . .     . G         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . TA     . .  . .  .  .                            A     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . .   .  .          . .  . . .  G     . .    .   .     .    
blockSeqs                     :                     .   . .    .    .   C     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . .         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . GC     . .  . .  .  .                            C     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .   .     . .  . .   .  .          . .  . . .  .     . .    .              
blockSeqs                     :                         . .    .    .   .     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . .         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . C      . .  . .  .  .                            G     .   .     . .     .    .   .  .   T      .  .  .                                                                          
blockSeqs                     :                                         .     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     . .         .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .    . A      . .  . .  .  .                            .     .   .     . .     .    .   .  .   C      .  .  .                                                                          
blockSeqs                     :                                         .     .  .     .   .    .   . . .  C     .  . .  .  .   .         .  . .     .           .  .      .  .        .     . . .  .  .                             .                                                                                                                                                                                       
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blockSeqCons                  :        
originalCons                  :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
finalCons                     :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT





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lowQualScore                  :               ... . .   . ...  .    .   ....  .. ...   ..  .    ... . . .  ..... .  . .  .. ... .....     .  . .     . .......   .  ..   . .. .        ..    . . .. .  ..........................    ...  . ...    . .  . .  .. .......................      ..    ..  ....  . ..    ...  ..  .  ... ...... .  .  ... .     . .. . ..  .. ...        . .. . . .  ..... . .    ..  .     .   .      
lowQualScore                  :               666 7 4   4 444  4    4   2222  44 444   44  2    999 2 2 5  66666 5  2 2  00 222 44444     2  2 2     5 6666666   3  88   6 88 3        88    6 3 88 6  44444444444444444444444444    333  3 333    3 3  7 3  22 77777777777777777777777      00    22  8888  3 88    777  55  7  333 111111 7  3  333 4     4 00 4 33  99 999        4 00 4 9 4  99999 9 4    44  5     5   5      
consensus                     :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
Reference ( family-573 )      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ANA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33396                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-A--G-T-TGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33397                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-AGT--T-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTATC-TGAAA--TA----TA-T--AAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GG---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33398                      :       aATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGC-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGCT-G-T--G-TT--------------------------GCTG---GT-AGC-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TC--TG-AG---T-C----A-AA-GA---T-GATTC-T--G-T-CGA--T---AATGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AG-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33399                      :       aATTTTAG---TTG-GAG-A---TG-AATC-GGT--A-AA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-TGAAA--TA----TA-C--AAAT---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--A--T-G-GGTT--AA-TACTT-TTG-AAGAGT
gi|33400                      :       aATTTTAG---TTGCGAG-A---TG-AATC-GGT----AA--T---AC---GT-TAAG---G-A-A-TC--G--T-GG-T-TT--A---------TTCTT-TT-GCAGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTA--GGTT-G-T--G-TTCTGTAGTTAAATAAGAACTGGTTTGTGTTGTCGGC-AAA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33401                      :           aGGG---TTG-AAG-A---TG-ATTC-GGT----GA--TC--ACC--GT-TGAA---ACG-ACTC--GGGT-GG-G-TT--A---A-----TTCT--GT-G-AGGAA-TTCTGCC-TGT-TT--TTGAAATT-AAGATGTG--GGTT-G-T--GGTT--------------------------GCTA---GTTAGA-CCAAAG-AT-A-AGTAA-----------------------ATTCTT-G-AAG--TA----TT-T--GAAA---TT--GT-AG---TTC----A-AA-GA---T-GAAT--A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TCTAA--T-GTTGTC--GA-TTCTT--TG-AAGAAT
gi|33402                      :   aactgATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---AAT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTG----T-AAATTGTGTTGGTT-G-C--G-TT--------------------------GTTG---
gi|33403                      :            aAG---TTA-AAA-G---TG-AATC-AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-A-G-TC--T--T-GT-G-TTC-G---A-----TTCTT-TT-G-AAGAA-T-----C-TG
gi|33404                      : aattagtATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--T-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TT--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TA--------------------------GTTG---GT-TGT-CCAG-G-AG-A-GG--A-----------------------ATTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GAAA---TG--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ACAGCTGA-A--G-G-A-TT--G--T-G-TGTT--AA-TTTTT-GTG-ATGAAT
gi|33405                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGA-CCAG-G-AG-A-GG--A-----------------------AATATG-GGAAG--TA----GT-T--GTAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-TGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TT--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33406                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--AGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33407                      :       aATTTGAA---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTG--AGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33408                      :       aATGTGAG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ACA--GC-TGAA---G-G-A-TT--G--T-GT-G-TT--A---A-----TTTTT-GT-G-ATGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-ATGACGTG--TACT-G-T--G-TC--------------------------GCTG---GT-TCA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------TTTCTCTGAAAGA-TA-------C--GAAC---TT--TG-CG---T-T----G-AA-GA---T-GAAAC-G--A-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--A-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTG-GTG-AGGAAT
gi|33409                      :       aATTTGAG---TCG-ATG-A---TA-AGTC-GGC--G-GA--T---AGG--GA-TGAA---G-A-A-TC-----------------------------TT-GT-G-AAGAA-T-----G-TTT-TG--TTGAA--T-AAGAAGTG--AGGT-G-A--G-TT--------------------------GTTT---GT-ACA-CCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------ATTCGC-GGAAT--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-A--G-T-AAA--A---ACTG--AATA--A-G-A-T---G--T-G-GGTT--
gi|33410                      :       aATCTGAG---TCA-AAG-A---TG-ATTC-TGT--C-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---G-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----A-TGT-TG--TTG
gi|33411                      :       aATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGAG---G-G-C-TC--A--T-AG-G-TT--G---A-----TTTGT-AT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--GATT-G-C--G--T--------------------------G--G---GG-AAA-CCAG-A-AG-T-CA--G-----------------------GGTCTC-ATAAT--TA----GA-T--AAAC---TG--TG-AG---T-A----G-AA-GA---
gi|33412                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-GCT-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-AGAAG--TA----CT-T--GAAA---TT--TG-AA---T-T----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-CGA--T---ATTGCTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-AGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33413                      :        ATTTGAG---TTG-AAG-A---TG-AACC-GG-----GGTTT---ACT--GA-TGAG---G-A-C-TC--A--T-GG-G-TT--G---A-----TTCGT-GT-G-AAGAA-G-----C-TGT-TG--TTATG--T-ATGAGGTG--GATT-G-C--G--T--------------------------G--G---GT-AAA-CCAG-A-CG-T-CA--G-----------------------GGTCTC-ATAAT--TA----GA-T---AAA---TTG-TG-AG---T-A----G-AA-GA---
gi|33414                      :         TTTGCG---TTG-AAG-G---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGA-GCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-AGAAG--TA----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--C--T-G-GGTT--AA-TTCTT-GTA-AAGAGT
gi|33415                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-A-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-ACA-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTT-GAAAG--TA----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----G-GA-GA---T-GAATC-G--G-T-AAA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AGGAAT
gi|33416                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AATC-GGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TC--A--T-GG-G-TT--A---A-----TACTT-TT-G-AAGAG-T-----A-TGT-TG--TTGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-A-CA--A-----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--GCAA---TT--TG-AG---T-C----G-AA-GA---T-GAATC-G--G-T-AGA--T---ACCGTTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AA-TTCTT-TTG-AAGAGT
gi|33417                      :         TTTGAAGTTTCG-AAA-GCACTG-AATC-GGTGTC-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-GAA-TC--C--T-GG-G-TT--A---C-----TTCTTAGT-G-AGGAAGT-----C-TGTGTG--TTG-A--T-AAGAGGTT--GGTT-G-T----TG--------------------------GTTG---GT-GCT-GC-G-G-AGAA-CG--A-----------------------ATTCTTAAGAAGAATA----GT-T--GAAATATTC--TG-AA---T-T----GCCA-GA---T-GAATC-A--GTT-TGA--T---ACCGTGAA-A--G-G-A-TC--G--T---GGTT--AA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33418                      :         TTTGAG---TAG-AGG-A---TG-AGTC-GGT--C-GA--T---ACT--GT-TGAA---G-G-A-TC--AACTGGG-G-TT--A---ATTTTTTTCTT-GTAA-AAGAG-T-----A-TGT-TGGTTTGAA--TAAAGAGGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTCA---AT-AC--CCAG-T-AGTA-CGA-A-----------------------ATTCTT-GAAAG--T-----GT-C--GAAA---TT--TT-AG---T-T----GCGA-GA---T-GAATC-G--G-T--AA--T---AC-GTTAA-G--G-A-A-TC--G--T-G-GTTT---A-TTCTT-TTGCAGGAAT
gi|33419                      :         TTTGCG---TTG-AAG-A---TG-AAAC-GAT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---A-G-A-TC--G--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTG-GT-G-AGGAA-T------------------------AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-ATA-CCAG-G-AG-A-TG--A-----------------------ATTCTC-GGATG--TA----GT-T--GAAA---TT--TG-AG---T-C----G-AT-GA---T-AAGTC-G--G-C-GGA--T---AGGGATGA-A--G-A-A----------------------TCTT-GTG-AAGAAT
gi|33420                      :            GAG---TTG-AAGGA---TGGAATC-GGT--AAGA--T---ACC--GT-TGAA---G-G-AATC--G--T-GG---TT--A---AC----TTCTT-GT-G-AGGAAAT-----C-TGT-T---TTGAA--T-AAGATGTG--G--T-G-T--G-TT--------------------------GCTA---GT-AGA-CAAG-ATAA-A-AG--A-----------------------ATTCTC-TGAAT--TA----TT-TTGAAAA---TT--AGTAG---T-T----A-AA-AG---T-GAATC-A--G-T-AGA--T---ACTGCTGA-A--G-A-G-TC--T--T-G-TGTTC-GA-TTCTT-TTG-AAGAAT
gi|33421                      :               ---TCA-AAG-A---TG-AAT--AGT--A-GA--T---ACT--GC-TGAA---G-G-A-TCTAA--T-GTTG-TC--G---A-----TTCTT--T-G-AAGAA-T-----C-TGT-AG--TT-AA--T-AAGAACTG--GTTTTG-T--G-TT--------------------------GTCG---CA-AAA-CCAG-G-AG-A-CG--ATGAGTGAAGTTGTATGAGGGTTGATTCTT-GGAGA--TGTGCTAT-T--GAAAATCTT--TG-AAGTTT-C----G-AA-AGCACT-GAATC-GGTG-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-GAA-TC--C--T-G-GGTT--AC-TTCTTAGTG-AGGAA
gi|33422                      :                    G-AAG-G---TG-ATTTTGGT--A-GA--TTTTACT--GC-TGAAAA-G-G-A-TC--G--TAGG-G-TTTAA---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----C-TGT-TG--TTGA---T-AAGAGGTT--GGTT-G-T--G-TT---------------------------TTG---GT-AGA-GCAG-G-AG-A-CG---------------------------TTCTC-AGA-G--TC----GT-T--GCAT---TT--TG-AG---T-A----G-AG-GA---T-GAGTC-G--G-T-CGA--T---ACTGTTGA-A--G-G-A-TC--AACTGG-GGTT--AA-TTTTT-
gi|33423                      :                       AG-A---TG-AATC-AGT--TTGA--T---ACC--GT-GAAA---G-G-A-TC--G--T-GG---TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----TGTGT-TG--TT--A--T-AAGAGGTG--GGTTTG-TTGG-TT--------------------------GTTG---GT-A-A-CCAG-G-AG-A-----G-----------------------ATTA-C-GAAAT--TA----GTCT--GAAA---ATACTATAG---T-TATATG-AA-GG---T-GATTTTG--G-T-AGA--TTTTACTGCTGA-AAAG-G-A-TC--G--TAG-GGTTTAAA-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33424                      :                                       GT--C-GA--T---ACT--GCGTGGAACTG-G-A-TC--C--T-GG-GGCT--ATACA-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--GGTT-GAT--GAGT--------------------------GTTG---GT-AGT-CCAG-G-AG-AGCG--AT----------------------TTTCTC-GGAAG--TA----GT-T--G-AA---CT--GG-GG---T-T----G-AA-GA---T-GATTC-G--G-T--GA--TC--ACCGTTGA-A--ACG-ACTCGGG--T-G-GGTT--AA-TTC-T-GTG-AGGAAT
gi|33425                      :                                        T--C-GA--T---ACTACGC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----G-TGT-TG--TTGAA--T-AAGAGGTG--G--T-G-T--G-TT--------------------------GTTG---GT-AGGTCCAG-G-AG---CG--------------------------ATTTTC--GAAG--TA----GT-T--GAAA---TGA-GG-AG---T-T----G-AAGGA---TGGAATC-G--G-TAAGA--T---ACCGTTGA-A--G-GAA-TC--G--T---GGTT--AACTTCTT-GTG-AGGAA
gi|33426                      :                                                                                                                              -TGT-TG--TTGTA--T-ATGACGTG--GGCT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---AT-ATA-TCAG-A-TG-A-CA--G-----------------------GTTTTC-AGTTT--TA----GT-C--GACA---TT--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GGTTT---ACTGATGA-G--G-G-C-TC--A--T-A-GGTT--GA-TTTGT-ATG-AAGAA
gi|33427                      :                                                                                                                                  -TG--TTGTA--T-ATGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GTTG---AT-ATA-TCAG-A-AG-A-CA--G-----------------------GTCTTC-CGTTT--TA----GT-C--GACA---TT--TG-AG---T-T----G-AA-GA---T-GAACC-G--G----GGTTT---ACTGATGA-G--G-A-C-TC--A--T-G-GGTT--GA-TTCGT-GTG-AAGAA
gi|33428                      :                                                                                                                                        TGAA--T-AAGATGTG--GGTT-G-T--G-TT--------------------------GCTG---GT-AGC-CCAG-G-AG-A-CG--A-----------------------ATTCTC-GGAAA--TA----GT-T--GAAA---TC--TG-AG---T-C----A-AA-GA---T-GATTC-T--G-T-CGA--T---ACTGCTGA-A--G-G-A-TC--G--T-G-GGTT--AG-TTCTT-GTG-AGGAAT
gi|33429                      :        ATTTGAG---TCG-AAG-A---TG-AATC-GGT--C-GA--T---ATT--GC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GA-G-TT--A---A-----TTCTT-GT-G-AGGAA-T-----
gi|33430                      :                                        T--C-GA--T---ACTACGC-TGAA---G-G-A-TC--C--T-GG-G-TT--A---A-----TTCTT-TT-G-AAGAG-T-----