lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 44444 1 11 33333 1 1 11 1 1 777777777 11 1 1 1 4 33333 0 1
lowQualScore : . ..... . .. ..... . . .. . . ......... .. . . . . ..... . .
lowQualScore : 1 11111 1 44 77777 1 1 44 1 1 999999999 44 1 1 1 3 88888 1 4
consensus : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
Reference ( gi|36234 ) : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCAC-----CACGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36235 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AA-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGTCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36236 : TACC-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GTC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATAGTA-AAA
gi|36237 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----AGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGTGTAACCTCCAACATCCAGTGTA-AAA
gi|36238 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AT-A---------TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTATATAAA
gi|36240 : TGCT-CCAGCGT-----GTT-A--GA-----GGTT-TAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-CAC-TTGGCGTTCATACATGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36241 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CGC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACGTAA
gi|36242 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----TGCGTAACTT
gi|36244 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36243 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36245 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----G----CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACG-AACC-CGAGCA
gi|36246 : TACT-CCAGCATAT---GCT-A--GA-----AGTT-CAC-AGT--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAAC
gi|36247 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--T-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----CGCG
gi|36248 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTT-CAT-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTAGCGC-----CA
gi|36239 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----G--T-CAC-GGC--G-AT-A---------TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAA-CTCTA-CATTCATTATATAAA
gi|36249 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--A-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-T
gi|36251 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--G--------TT-CAC-GGT--G-AG-G---------TA--C-TTTT-GGC-TTGGTGT-----CACGTAACggtgc
gi|36252 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--AA-----GTTT-CAC-GGC--G-AG------------A--C-TTTTGGACTTTGCCGC-----CACGTAAC--------TCCATTTTA-AAA
gi|36259 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTT-CAT-GGCCAG-AT-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36261 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTT-CAT-GGC--C-AG-ATAT------TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36260 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTT-CAT-GGC--C-AG-ATAT------TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36253 : TACT-CCAGCAT-----GCT-G--AA-----TGTT-CAT-GGT--GAAG-A---------TG--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CAC
gi|36254 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTT-CAC-GGC--A-AG-G---------TA--C-TTCC-GAC-TTG
gi|36256 : TACTTCCAGCAT-----GGT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TATTT-TTTT-TAC-TTGGCGC-----Catgc
gi|36255 : TACT-CCAGTAT-----GCT-A--CA-----TGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TC--A-TTTT-GAC-TTGGTGC-----CA
gi|36262 : TACT-CCAGCAT-----TCT-ATTGA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-GTTT-GAC-TT
gi|36257 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-TACAGAC--A-AG-A---------TA--CTTTTT-GAC-TTGG
gi|36258 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--GA-----TGTT-CTC-TGC--G-AG-A---------TA--C-GTTT-GAC-TTAGCGC-----CAtgc
gi|36264 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-AGC--G-AG-A---------TA--C-T
gi|36263 : TACT-CCAGCAT-----GCT-T--GA-----GACT-CAC-AAT--G-AA-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGG
gi|36265 : TACT-CCTGCAT-----GCT-A--GA-----GGTA-CAT-GGT--C-AG-A---------TA--C-TTTT-AAT-TTGGTGC-----TGCATAtgc
gi|36266 : TACT-TCAGCAT-----GTT-C--GA-----GGTT--GC-GGC--G-AG-A---------TA--T-GTTT-GGC-TTGGC
gi|36250 : TAC--CCAGCAT-----GCTTA--GAA----GGTT-CAC-GGC--A-AGAA---------TA--C-TTTT-GAC-T
gi|36267 : TACT-CCAGCATTATATACC-A--GA-----GGTT-CAT-GGT--G-AG-G---------TA--C-TTTT-GA
gi|36268 : ACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--A-TG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TTGGC
gi|36269 : CT-CCAGCAT-----TCT-A--GA-----GGTT-CAT-GGT--G-AG-A---------TA--C-CGTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGgtc
gi|36270 : CT-CCAGCAT-----GCT-A--GAGTAGAGGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-TTTT-GAC-TT
gi|36271 : CAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTT-CAC-GGC--G-AG-A---------TA--C-tatgccgc
gi|36235 : AT-----GCT-A--GA-----GGTTACGC-GGC--G-AC-AAGTCAAAAGTA--T-TT-----------CGC-----CGTG-AACCTCTAGCAT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 44444 1 11 33333 1 11 1 1 333 11 1 1 1 33333 0 0
lowQualScore : . ..... . .. ..... . .. . . ... .. . . . ..... . .
lowQualScore : 1 11111 1 44 77777 1 44 1 1 777 44 1 1 1 11111 1 0
consensus : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
Reference ( family-534 ) : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36234 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCAC-----CACGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36235 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGTCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36236 : TACC-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GTC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATAGTA-AAA
gi|36237 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----AGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGTGTAACCTCCAACATCCAGTGTA-AAA
gi|36238 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTATATAAA
gi|36239 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----G--TCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAA-CTCTA-CATTCATTATATAAA
gi|36240 : TGCT-CCAGCGT-----GTT-A--GA-----GGTTTAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-CAC-TTGGCGTTCATACATGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36241 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCGC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACGTAA
gi|36242 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----TGCGTAACTT
gi|36243 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36244 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36245 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----G---CAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACG-AACC-CGAGCA
gi|36246 : TACT-CCAGCATAT---GCT-A--GA-----AGTTCAC-AGT--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAAC
gi|36247 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--T-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----CGCG
gi|36248 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAT-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36249 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-A---TA--C-TTTT-GAC--TGGTGC-----a
gi|36250 : TAC--CCAGCAT-----GCTTA--GAA----GGTTCAC-GGC--A-AGAA---TA--C-TTTT-GAC-T
gi|36251 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--G--------TTCAC-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GGC-TTGGTGT-----CACGTAAC
gi|36252 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--AA-----GTTTCAC-GGC--G-AG------A--C-TTTTGGACTTTGCCGC-----CACGTAAC--------TCCATTTTA-AAA
gi|36253 : TACT-CCAGCAT-----GCT-G--AA-----TGTTCAT-GGT--GAAG-A---TG--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CAC
gi|36254 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-G---TA--C-TTCC-GAC-TTGATGC-----
gi|36255 : TACT-CCAGTAT-----GCT-A--CA-----TGTTCAC-GGC--G-AG-A---TC--A-TTTT-GAC-TTGGTGC-----C
gi|36256 : TACTTCCAGCAT-----GGT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TATTT-TTTT-TAC-TTGGCGC-----Ca
gi|36257 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTTACAGAC--A-AG-A---TA--CTTTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36258 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--GA-----TGTTCTC-TGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36259 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGCCAG-AT-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAACa
gi|36260 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36261 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36262 : TACT-CCAGCAT-----TCT-ATTGA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TT
gi|36263 : TACT-CCAGCAT-----GCT-T--GA-----GACTCAC-AAT--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36264 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-AGC--G-AG-A---TA--C-T
gi|36265 : TACT-CCTGCAT-----GCT-A--GA-----GGTACAT-GGT--C-AG-A---TA--C-TTTT-AAT-TTGGTGC-----TGCATA
gi|36266 : TACT-TCAGCAT-----GTT-C--GA-----GGTT-GC-GGC--G-AG-A---TA--T-GTTT-GGC-TTGGC
gi|36267 : TACT-CCAGCATTATATACC-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GA
gi|36268 : ACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-TG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGT-----C
gi|36269 : CT-CCAGCAT-----TCT-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-A---TA--C-CGTT-GAC-TTGGCGC-----CGCG
gi|36270 : CT-CCAGCAT-----GCT-A--GAGTAGAGGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTTATGC-----CGC
gi|36271 : CAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 44444 1 11 33333 1 11 1 1 333 11 1 1 1 33333 0 0
lowQualScore : . ..... . .. ..... . .. . . ... .. . . . ..... . .
lowQualScore : 1 11111 1 44 77777 1 44 1 1 777 44 1 1 1 11111 1 0
consensus : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
Reference ( family-534 ) : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36234 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCAC-----CACGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36235 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGTCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36236 : TACC-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GTC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATAGTA-AAA
gi|36237 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----AGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGTGTAACCTCCAACATCCAGTGTA-AAA
gi|36238 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTATATAAA
gi|36239 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----G--TCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAA-CTCTA-CATTCATTATATAAA
gi|36240 : TGCT-CCAGCGT-----GTT-A--GA-----GGTTTAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-CAC-TTGGCGTTCATACATGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36241 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCGC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACGTAA
gi|36242 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----TGCGTAACTT
gi|36243 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36244 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36245 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----G---CAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACG-AACC-CGAGCA
gi|36246 : TACT-CCAGCATAT---GCT-A--GA-----AGTTCAC-AGT--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAAC
gi|36247 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--T-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----CGCG
gi|36248 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAT-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36249 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-A---TA--C-TTTT-GAC--TGGTGC-----a
gi|36250 : TAC--CCAGCAT-----GCTTA--GAA----GGTTCAC-GGC--A-AGAA---TA--C-TTTT-GAC-T
gi|36251 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--G--------TTCAC-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GGC-TTGGTGT-----CACGTAAC
gi|36252 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--AA-----GTTTCAC-GGC--G-AG------A--C-TTTTGGACTTTGCCGC-----CACGTAAC--------TCCATTTTA-AAA
gi|36253 : TACT-CCAGCAT-----GCT-G--AA-----TGTTCAT-GGT--GAAG-A---TG--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CAC
gi|36254 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-G---TA--C-TTCC-GAC-TTGATGC-----
gi|36255 : TACT-CCAGTAT-----GCT-A--CA-----TGTTCAC-GGC--G-AG-A---TC--A-TTTT-GAC-TTGGTGC-----C
gi|36256 : TACTTCCAGCAT-----GGT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TATTT-TTTT-TAC-TTGGCGC-----Ca
gi|36257 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTTACAGAC--A-AG-A---TA--CTTTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36258 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--GA-----TGTTCTC-TGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36259 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGCCAG-AT-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAACa
gi|36260 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36261 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36262 : TACT-CCAGCAT-----TCT-ATTGA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TT
gi|36263 : TACT-CCAGCAT-----GCT-T--GA-----GACTCAC-AAT--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36264 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-AGC--G-AG-A---TA--C-T
gi|36265 : TACT-CCTGCAT-----GCT-A--GA-----GGTACAT-GGT--C-AG-A---TA--C-TTTT-AAT-TTGGTGC-----TGCATA
gi|36266 : TACT-TCAGCAT-----GTT-C--GA-----GGTT-GC-GGC--G-AG-A---TA--T-GTTT-GGC-TTGGC
gi|36267 : TACT-CCAGCATTATATACC-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GA
gi|36268 : ACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-TG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGT-----C
gi|36269 : CT-CCAGCAT-----TCT-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-A---TA--C-CGTT-GAC-TTGGCGC-----CGCG
gi|36270 : CT-CCAGCAT-----GCT-A--GAGTAGAGGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTTATGC-----CGC
gi|36271 : CAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-
blockSeqs : T TATAT T TT GTAGA A CA A A TAT TT T G T TCATA T
blockSeqs : . AT . . A . . . . TAT . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
finalCons : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 44444 1 11 33333 1 11 1 1 333 11 1 1 1 33333 0 0
lowQualScore : . ..... . .. ..... . .. . . ... .. . . . ..... . .
lowQualScore : 1 11111 1 44 77777 1 44 1 1 777 44 1 1 1 11111 1 0
consensus : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
Reference ( family-534 ) : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36234 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCAC-----CACGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36235 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGTCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36236 : TACC-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GTC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATAGTA-AAA
gi|36237 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----AGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGTGTAACCTCCAACATCCAGTGTA-AAA
gi|36238 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAACCTCTAGCATCCATTATATAAA
gi|36239 : TATT-TCAGCAT-----GCT-A--GA-----G--TCAC-GGC--G-AT-A---TA--C-ATTT-AAC-TTGGCGC-----CGCGTAA-CTCTA-CATTCATTATATAAA
gi|36240 : TGCT-CCAGCGT-----GTT-A--GA-----GGTTTAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-CAC-TTGGCGTTCATACATGTAACCTCTAGCATCCATTGTA-AAA
gi|36241 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCGC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACGTAA
gi|36242 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----TGCGTAACTT
gi|36243 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36244 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTA
gi|36245 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----G---CAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CACG-AACC-CGAGCA
gi|36246 : TACT-CCAGCATAT---GCT-A--GA-----AGTTCAC-AGT--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CGCGTAAC
gi|36247 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--T-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----CGCG
gi|36248 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAT-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36249 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-A---TA--C-TTTT-GAC--TGGTGC-----a
gi|36250 : TAC--CCAGCAT-----GCTTA--GAA----GGTTCAC-GGC--A-AGAA---TA--C-TTTT-GAC-T
gi|36251 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--G--------TTCAC-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GGC-TTGGTGT-----CACGTAAC
gi|36252 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--AA-----GTTTCAC-GGC--G-AG------A--C-TTTTGGACTTTGCCGC-----CACGTAAC--------TCCATTTTA-AAA
gi|36253 : TACT-CCAGCAT-----GCT-G--AA-----TGTTCAT-GGT--GAAG-A---TG--C-TTTT-GAC-TTGGCGC-----CAC
gi|36254 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--AA-----GGTTCAC-GGC--A-AG-G---TA--C-TTCC-GAC-TTGATGC-----
gi|36255 : TACT-CCAGTAT-----GCT-A--CA-----TGTTCAC-GGC--G-AG-A---TC--A-TTTT-GAC-TTGGTGC-----C
gi|36256 : TACTTCCAGCAT-----GGT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TATTT-TTTT-TAC-TTGGCGC-----Ca
gi|36257 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTTACAGAC--A-AG-A---TA--CTTTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36258 : TACT-CAAGCAT-----GCT-A--GA-----TGTTCTC-TGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TTAGCGC-----C
gi|36259 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGCCAG-AT-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAACa
gi|36260 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36261 : TACC-CCAGCAC-----GCT-A--GA-----GGTTCAT-GGC--C-AG-ATATTA--C-TTTT-GAC-TTGATAC-----AACTTAAC
gi|36262 : TACT-CCAGCAT-----TCT-ATTGA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-GTTT-GAC-TT
gi|36263 : TACT-CCAGCAT-----GCT-T--GA-----GACTCAC-AAT--G-AA-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGTGC-----
gi|36264 : TACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-AGC--G-AG-A---TA--C-T
gi|36265 : TACT-CCTGCAT-----GCT-A--GA-----GGTACAT-GGT--C-AG-A---TA--C-TTTT-AAT-TTGGTGC-----TGCATA
gi|36266 : TACT-TCAGCAT-----GTT-C--GA-----GGTT-GC-GGC--G-AG-A---TA--T-GTTT-GGC-TTGGC
gi|36267 : TACT-CCAGCATTATATACC-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-G---TA--C-TTTT-GA
gi|36268 : ACT-CCAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--A-TG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTGGCGT-----C
gi|36269 : CT-CCAGCAT-----TCT-A--GA-----GGTTCAT-GGT--G-AG-A---TA--C-CGTT-GAC-TTGGCGC-----CGCG
gi|36270 : CT-CCAGCAT-----GCT-A--GAGTAGAGGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-TTTT-GAC-TTTATGC-----CGC
gi|36271 : CAGCAT-----GCT-A--GA-----GGTTCAC-GGC--G-AG-A---TA--C-