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Reference ( gi|70735 )        : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GT--C-G----A-GAT-G-A-TTTGT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G---A--TT--T-TG-A---GTTTT-T----TT---T-C--T--------T---TAC-A--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-C-G-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70738                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GT--C-G----A-GAT-G-A-TTTGT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G---A--TT--T-TG-A---GTTTT-------T---T-C--T--------T---TAC-A--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-T-GG-CC-CG-T-C-C-G-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
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Alignments
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Reference ( family-504 )      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTN--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ANT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
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gi|70755                      : AAAAT-TAT-CTCCT-GAA-C---TA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-C-T-----G--T--G--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T--TCT-C--T------T----ACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C---C-G-----CGCGG-----CC-TAT-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CGCCTCTGG-TATta
gi|70756                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-G--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A-----CTT-T--TTT-C--T------T---TACA--C-AC------A--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--
gi|70757                      : AAAAT-T-T-C-CTA-GAA-C-G-TT--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-G-T---T-G-CT--A--AAT---------A---GACTT-T--TTT-C--T------T---TACA--C-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CTT-TGC--TT--C-G-C-G---------------------------CC-CG-T-C-TG-A-GC-T--T---CG-CTT-AG-TAT
gi|70758                      : AAAAT-T-----CTT-GA--C-G-TA--T---A--G----A-GAT-GGA--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--GGGAATG-T-T--G-G---ACTTT-T--TTT-C--T------T---TACA----AC------G--TG-T-TA-C-C---TT--A---G----G---CCT-TGC--TT--C-G-CTG-GG--C--GG-----CC-T-T-C-GGCCC-CG-C-CTCG-ACGCTT--T---CGCCTC-GG-TAT
gi|70759                      : AAAAT-T-TTC-CTT-GAA-C-A-TA--T-GTA--GCTTTA-ATT-G-A--TTT--CT----ATT-T-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--T-A----TGTT-T--TTT-A--AAAAAAAT---TATA--T-AC------A--TA-T-TA-C-C---TG-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-A-T-G-GA--TG-GG-----CC-T-G-T-GG-CC-CG-T-C-TG-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TA
gi|70760                      : AAAAG-T-T-T-CAT-GAA-C-T-TA--T-ATAACG----A-GAT---A--TTT--CT--------A-T-T-T---G-G-CA--G--ATT--T-T--G-A------CT-T--TTT-CAGT------T---CACA--T-AC------A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---G-A--A---TGT-TGC--TT--T-A-C-T-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-TTT-GG-TGT
gi|70761                      : AAAGT-T-T-T-AGT-GAA-C-G-TA--T-ATA--G----A-GAT---A--TTT--CT----GTT-----T-T---G-G-CA--G--ATT--T-T--T-A---ATTTT--------CAGT------T---CACA--T-AC------A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--A---TGT-TGC--TT--T-G-C-T-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TGTatta
gi|70762                      :  AAAT-T-C-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT---T----TTT-C-T-CAT---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A----CTTT-T--TTT-C-------------TACA--T-A-------G--TG-T-TA-C-CT--TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-G---CG-GG-----CC---T-C-GG-CC-CGCC-C-CG-A-GC----T---CG-CTC-GG-atta
gi|70763                      :  AAAT-T-T-C-ATT-GAA-C-G-AA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTA-T-T-T-C---T---CT--G--AAT--T-T--G-GCGGGTTTTTT--TTT-C--T------T---TGAA--A-AC------G--TG-C-TA-C-C---TT-TA---C-A--G---CCT-TGT--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CA-CTC-GG-TATtta
gi|70764                      :  AAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTA--G----A-GAT-G-AATTTT--CT----TCT-C---C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T--TTTCC--T------T---TCCA--T-AC------G--TGTT-TACC-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGCCTTT--C-G-C-G-GG--C--GG-----CC-T-T-C--G-CC-GG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-ATC-
gi|70765                      :  AAATGT-T-C-CTT-TAA-C-G-TA--T-TTG--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----ATT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-AT--GTTTT-T--CTT-CAATA-----TGCATACA--T-AT------G--CA-T-TA-T-C---TT-TA---G-AGCG---CCT-TGC---T--C-G-T-G-GA--CG-G
gi|70766                      :   AAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTT--C----A-GAT-G-T--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-G--C-A---G--TT-T--TTC-C--G------T---TACA----AC------G--TT-T-TA-C-C---TT-TA---A-AG-G---CCT-TGCT-TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-G-CG-A-GC-T--T---CG-TTC-GG-TAT
gi|70767                      :      -T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-C-T-T---T-G-CT--A--AAT--T-T--T-A---CTTTT-T--CTT-C--T------G---TGCA--T-G---------------TA-C-C---TT-TA---G-A--T---CCT-TGC--T
gi|70768                      :          -C-CTT--AA-C-G-TA--T-TTA--G----A-T-T-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-TCT---T-G-CT--G--AAT--C-T--G-A---TTTTT-T--TTT-T--C------T---TACA--T-AC------G--TG---TA-C-C---TTATA---G-A--GGGCCCT-TGCT-TT--C-GCC-G-GG--CG-GG-----CC-T-T-CGGG-CC-GG-C-C-CG-A-GC-T--TCCCCG-CTC-
gi|70769                      :               T-GAA-CCG-TA--T-ATA--G----A-GA----A--TTT--C---------CGT-T-T---T-G-CT--G--CAT--T-C--T-C---CTTTA-TCATTT-CAGT------T---CACA--T-ACC-----A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--A---TGT-TGC--TT--T-G-C-T-GA--CG-GG-----TC-T---C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TGT
gi|70770                      :                   A-C-G-TC--T-G----G----A-CAT-G-A--GTG--------TTT-C-TAT-T---T-G-CA--G--ATT--TCT--ATA---ATTTT-T--TAT-C--T------T---TACA--T-A-------G--TA---TA-C-C---TT-TAT--G-A--G---CCC-AGC--TT--C-A-C----A--C---G-----CC-T-T-C-GG-TC-GT-CAC-AG-A-GC-T--T---CG-CTC-atta
gi|70771                      :                                                                  -C-T-T-T---T-G-CC--A--ATT--T-T--G-A---CTTTT-T--CCT----T------T---TACA--A-TC------G--TG-T-TA-C-A---TT-TA---A-A--AA--CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--TG-GG-----CC-T-T-C-TG-CT-CG-
gi|70772                      :          gtatgccagagata-TA--T-CTG--G----A-GAT-C-A--TTA--TC----TTT-C-T-T-T---T-G-CC--G--ATTTAT-T--G-G---ATTCC-T--TTC-A--T------A---TACATGT-AC------A--TT-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--G---CCT-CGC--TT--C-A-T-G-AT--TG-AG-----CC-T-C-T-GG-C
gi|70773                      :                          A--T-GTA--G----A-TAT-G-A--TTT--CT----TAT-T-T-T-T---CAG-AT--A--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T---------------------ACA--T-AC------A--TG-G-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CTT-TCC--TT--T-G-G-G-AA--CG-AG-----AC-T-T-C-AG-TC-CG----------------T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70774                      :                                                -A--TTT--AT----ATT-C-T-T-T---T-T-CT--G--AAT--------------------------C--T------T---TACA--T-GCATGTATG--TG-T-TA-C-C---TT-CA---A-A--G---CCT-TGC--TT--A-T-C-G-GA--CG-GG----------T-C-GT-AC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70775                      :                                                                                                                   T-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TCC--TT--C-G-C-G-GG--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-T-CA-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT


blockSeqs                     :      G A T T   T   A C C  AT T  AAC CTTT A   T G AT   TAT AAAG   G C A A AAA C A  TG GG T TA A TT T CGGGT   T CA     AG AAAAAA GCA    TG    ATGTAT GT    C      TTT     CTT   GC AGT       CT  AA A C T C AAT GA  TTTTC  C A G G  C  A  CG  T  C G  T AA CCC  C   T  A
blockSeqs                     :      . . . .   .   A C .  A  T  GA  AA   .   . . .    G   C      . G A C .   A .  .  .  T G  C .  . TGT     . .      AG A      .      A     A      .     C      GT      T     G  GGC       T   AA G . . . A   GC  C      . . . .  .  A  CC  .  . C  . CA .    C   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  C  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . GT      . .      AA .      .      .     C      .     A      T       .     .  GC        T   A  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  CA  .  . .  . .  .    C   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . GT      . .      AG .      .      .     .      .     .      .       .     .  A         .   A  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . GT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   A  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . GT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   C  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  T   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . GT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  G   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . GT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . GT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . GA      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . AC      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . AT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    T   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . TT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . AT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . AT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . CT      . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . G       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . T       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . C       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . C       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   G   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    G   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . C       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . T   .   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  G   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . G       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   .   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  T   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . C       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . A   .   .      . . . .  .  .  T   .  . .  . .  .    .   .  .
blockSeqs                     :      . . . .   .   . . .  .  .  C   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . T       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . G   .   .      . . . .  .  .  C   .  . .  . .  .    .   .   
blockSeqs                     :          . .   .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    T   .      . . . . .   . .  .  .  T .  . .  . C       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .   .      . . . .  .  .  .   .  . .  . .  .    .   .   
blockSeqs                     :                .   . . .  .  .  A   .    .   . . .    C   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . G       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .   .      . . . .  .  .  .   .  . .  . .  .    .   .   
blockSeqs                     :                    . . .  .  .  G   .    .   . . .    A   .      . . . . .   . .  .  .  A .  . .  . .       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .   .      . . . .  .  .  .   .                         
blockSeqs                     :                        .  .  .  A   .    .   . . .    .   .      . . . . .   . .  .  .  . .  . .  . .       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .   .      . . . .  .  .                                
blockSeqs                     :                           .  .  .   .    .   . . .    .   .      . . . . .   . .  .  .  . .  . .  . .       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .   .      . . . .  .                                   
blockSeqs                     :                                                . .    .   .      . . . . .   . .  .  .  . .  . .  . .       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .   .  . . . . .   .                                                       
blockSeqs                     :                                                                  . . . . .   . .  .  .  . .  . .  . .       . .      .  .      .      .     .      .     .      .       .     .  .         .                                                                          
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTN--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ANT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
finalCons                     : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTN--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ANT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT





Alignments
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lowQualScore                  :      . . . .   .   . . .  .. .  ... .... .   . . ..   ... ....   . . . . ... . .  .. .. . .. . .. . .....   . ..   . .. ...... ...    .. .  ...... ..  . .  . . ...  .  ... . .. ...   .   ..  .. . . . . ... ..  .....  . . . .  .  .  ... .  . .  . .. ...  .   .  .   
lowQualScore                  :      2 2 2 2   1   2 2 1  55 2  999 7777 1   1 0 44   222 2222   0 0 0 0 888 0 0  44 44 9 44 0 44 0 55555   0 44   0 44 888888 777    33 0  888888 33  0 9  0 0 000  0  777 0 33 777   0   33  99 1 0 0 0 555 66  77777  1 1 1 1  1  2  999 1  1 3  1 11 000  4   1  2   
consensus                     : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTN--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ANT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
Reference ( family-504 )      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTN--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ANT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70735                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-T--G-A---GTTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
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gi|70739                      : AAAAA-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-T--G-A---G--TT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CTT-TGC--TT--C-G-G-C-GA--CG-GG-----CC-T-T-T-GG--C-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70740                      : AAAAT-T---C-CTT-GAA-CCG-TA--T-GTT--G----G-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A----TTTT-T--TTT-C--T------T---TACA--C-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TACTTGTA--A---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--GG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70741                      : AAATT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-T-TAAAT-AACT--G--AAT--T-T--G-A----CTTT-T--CTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C---------------G-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CA-CTC-AG-TATta
gi|70742                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAAAC-G-TA--T--TC--G----A-GAT-G-A--TTT--GT----TT--C-T-T-T---T-G-CT--G--A-T--T-T--G-A---GTTTT-T--TT--C--T------T---TGCA--T-AC------G--TG-A-TA-TAC---TT-TA---A-A--GAGTCTT-TAC--TTA-CAG-C-G-GA--CGAGG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70743                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GCG--A----T-GAT-G-A--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---TCG-CT--G--ATT--T-T--G-A---GTTTA-T--TT-----C------T---TACA--TAAC------G--TG-T-TA-C-CTTTTT-TA---G-A------CCT-TGC--TT--C-G-C-G-AA--C--GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC----T---CG-CTC-GG-TAta
gi|70744                      : AAACT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TAA-T-GTA-------A-GAT-G-A--T----CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--TAT--G-A----CTTT-T--TTT-C--T------T----A-A--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G--------CCT-TGC--TAA-C-G-C-G-GG--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CC-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATata
gi|70745                      : AAACT-T-T-C-CTT-GAA---G-TA--TTGTA-------A-GAT-G-A--TT---CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--A-T--T-T--G-A---CTTTT-T--GTC-T--C------T---TA-A--T-ACA-----G--TG-T-TA-C-C---TT-T----G-A--G---GCT-TGC--TAA-C-G-C-G-GG--CG-G------CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CC-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATca
gi|70746                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA---G-TA--TTGTGA-G----A-GAT-G-A--TCT---------TT-C-T-C-T-----G-CT--G--ATT--A-T--G-A----CTTT-T--TGT-C--T------T---TA-A--T-AA------G--TG-TCTA-C-C---TT-TA-----A--G---CCT-TGC--TTAAC-G-C-G-GG--CG-GG-----CCCT-T-C-GG-CCACG-C-C-CC-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70747                      : AAACT-T-T-C-CTT-AGA-A-G-TAATT-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TT--C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T--GTT-C--T------T----ACA--T-AA------G--TG-TCTA-C-C---TT-TA-----A--G----CT-TGC--TTAAC-G-C-G-GG--CG-GGC----CC-T-T-C-GG-CCACG-C-C-CGCA-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70748                      : AAAAT-T-T-T-CTTTGAG-T-G-TA--T-GTC--A----A-GAT-G-A--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-T--G-A---G-TTT-T--TTT-C--T------T---T-CA--T-AC------G--TG-T-AA-C-C---TT-T----G-A--G---CCTATGC---T--C-G-C---AA--CG-GG-----CC-T-----GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-TAAT---TG-CTC-GG-TATca
gi|70749                      : AAAAA-T-C-C-CTT-GAAAC-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--GTAAAGTTT-T-C-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-T--G-A---GTTTT-T--TGT-C--T------T---TACAA-T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--GGC-CTT-TGC--T---C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-G-T-GG-CC-CG-C-C-CG-AGGC-T--T---TGCCTC-GG-ta
gi|70750                      : AAAAT-T-G-C-CTT-GAA-C-G-TG--T--TA--G----A-GATTG-A--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CCTGG--AAT--T-T--G-A---CTTTT-G--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-TATA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-GCGG--C--GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-GCAT---CG-CTC-GGATAT
gi|70751                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A---T-G-A--TTT--GT----TTT-CCT-T-T---T-G-C---G--ATT--T-TTTG-A---GTTTT------T-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA---C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C---GA--C--GG-----CC-T-T-C-G----------T-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70752                      : AAAAT-T-T-C-CCT-GAA-C-G-TA--T-GTA-------A-GA--G-T--TTC--CT----TTT-C-T-C-T-----G-CT--G--AAT--T-T--C-A----CCTT-T--TTT-C--T------T---TACA--T--C------G--TG-T-TA-C-CGT-TT-CA---G-A--G---CCT-TCC--TT--CGG-C-G-G---CG-GGTTTTCCC-T-TGC-GG-CC-CG-C-C-
gi|70753                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTA--G----AAGAT-G-A--TTT--TTC---TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--A-T--T-T--G-A------CT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-----TT-TA---G-A--G---CCT-TGA--TT--C-G-C-G-GG--CG-GG-----CC--------------G------A-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70754                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-GCTA--TCGTA--GAA--A-GAT-G-A--TTTTATC----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--A------T--G-A------CT-T--TTT-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGA--TTC-C-G-C-G-G---CG-GG------------C-GG-----G-C-C-GA-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70755                      : AAAAT-TAT-CTCCT-GAA-C---TA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-C-T-----G--T--G--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T--TCT-C--T------T----ACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C---C-G-----CGCGG-----CC-TAT-C-GG-CC-CG-C-C-CG-A-GC-T--T---CGCCTCTGG-TATta
gi|70756                      : AAAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-G--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A-----CTT-T--TTT-C--T------T---TACA--C-AC------A--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--
gi|70757                      : AAAAT-T-T-C-CTA-GAA-C-G-TT--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-G-T---T-G-CT--A--AAT---------A---GACTT-T--TTT-C--T------T---TACA--C-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CTT-TGC--TT--C-G-C-G---------------------------CC-CG-T-C-TG-A-GC-T--T---CG-CTT-AG-TAT
gi|70758                      : AAAAT-T-----CTT-GA--C-G-TA--T---A--G----A-GAT-GGA--TTT--CT----TTT-C-T-C-T---T-G-CT--GGGAATG-T-T--G-G---ACTTT-T--TTT-C--T------T---TACA----AC------G--TG-T-TA-C-C---TT--A---G----G---CCT-TGC--TT--C-G-CTG-GG--C--GG-----CC-T-T-C-GGCCC-CG-C-CTCG-ACGCTT--T---CGCCTC-GG-TAT
gi|70759                      : AAAAT-T-TTC-CTT-GAA-C-A-TA--T-GTA--GCTTTA-ATT-G-A--TTT--CT----ATT-T-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--T-A----TGTT-T--TTT-A--AAAAAAAT---TATA--T-AC------A--TA-T-TA-C-C---TG-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-A-T-G-GA--TG-GG-----CC-T-G-T-GG-CC-CG-T-C-TG-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TA
gi|70760                      : AAAAG-T-T-T-CAT-GAA-C-T-TA--T-ATAACG----A-GAT---A--TTT--CT--------A-T-T-T---G-G-CA--G--ATT--T-T--G-A------CT-T--TTT-CAGT------T---CACA--T-AC------A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---G-A--A---TGT-TGC--TT--T-A-C-T-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-TTT-GG-TGT
gi|70761                      : AAAGT-T-T-T-AGT-GAA-C-G-TA--T-ATA--G----A-GAT---A--TTT--CT----GTT-----T-T---G-G-CA--G--ATT--T-T--T-A---ATTTT--------CAGT------T---CACA--T-AC------A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--A---TGT-TGC--TT--T-G-C-T-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TGTatta
gi|70762                      :  AAAT-T-C-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT---T----TTT-C-T-CAT---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A----CTTT-T--TTT-C-------------TACA--T-A-------G--TG-T-TA-C-CT--TT-TA---G-A--G---CCT-TGC--TT--C-G-C-G-G---CG-GG-----CC---T-C-GG-CC-CGCC-C-CG-A-GC----T---CG-CTC-GG-atta
gi|70763                      :  AAAT-T-T-C-ATT-GAA-C-G-AA--T-GTA--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTA-T-T-T-C---T---CT--G--AAT--T-T--G-GCGGGTTTTTT--TTT-C--T------T---TGAA--A-AC------G--TG-C-TA-C-C---TT-TA---C-A--G---CCT-TGT--TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----TC-T-T-C-GG-CC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CA-CTC-GG-TATtta
gi|70764                      :  AAAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTA--G----A-GAT-G-AATTTT--CT----TCT-C---C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T--TTTCC--T------T---TCCA--T-AC------G--TGTT-TACC-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TGCCTTT--C-G-C-G-GG--C--GG-----CC-T-T-C--G-CC-GG-C-C-CG-A-GC-T--T---CG-ATC-
gi|70765                      :  AAATGT-T-C-CTT-TAA-C-G-TA--T-TTG--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----ATT-C-T-C-T---T-G-CT--G--AAT--T-T--G-AT--GTTTT-T--CTT-CAATA-----TGCATACA--T-AT------G--CA-T-TA-T-C---TT-TA---G-AGCG---CCT-TGC---T--C-G-T-G-GA--CG-G
gi|70766                      :   AAT-T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTT--C----A-GAT-G-T--TTT--GT----TTT-C-T-T-T---T-G-CT--G--ATT--T-G--C-A---G--TT-T--TTC-C--G------T---TACA----AC------G--TT-T-TA-C-C---TT-TA---A-AG-G---CCT-TGCT-TT--C-G-C-G-GA--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-T-G-CG-A-GC-T--T---CG-TTC-GG-TAT
gi|70767                      :      -T-T-C-CTT-GAA-C-G-TA--T-GTC--G----A-GAT-G-A--TTT--CT----TTT-C-C-T-T---T-G-CT--A--AAT--T-T--T-A---CTTTT-T--CTT-C--T------G---TGCA--T-G---------------TA-C-C---TT-TA---G-A--T---CCT-TGC--T
gi|70768                      :          -C-CTT--AA-C-G-TA--T-TTA--G----A-T-T-G-A--TTT--CT----TTT-C-T-TCT---T-G-CT--G--AAT--C-T--G-A---TTTTT-T--TTT-T--C------T---TACA--T-AC------G--TG---TA-C-C---TTATA---G-A--GGGCCCT-TGCT-TT--C-GCC-G-GG--CG-GG-----CC-T-T-CGGG-CC-GG-C-C-CG-A-GC-T--TCCCCG-CTC-
gi|70769                      :               T-GAA-CCG-TA--T-ATA--G----A-GA----A--TTT--C---------CGT-T-T---T-G-CT--G--CAT--T-C--T-C---CTTTA-TCATTT-CAGT------T---CACA--T-ACC-----A--TG-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--A---TGT-TGC--TT--T-G-C-T-GA--CG-GG-----TC-T---C-GG-TC-TT-T-C-CA-A-GC-T--T---CG-CTT-GG-TGT
gi|70770                      :                   A-C-G-TC--T-G----G----A-CAT-G-A--GTG--------TTT-C-TAT-T---T-G-CA--G--ATT--TCT--ATA---ATTTT-T--TAT-C--T------T---TACA--T-A-------G--TA---TA-C-C---TT-TAT--G-A--G---CCC-AGC--TT--C-A-C----A--C---G-----CC-T-T-C-GG-TC-GT-CAC-AG-A-GC-T--T---CG-CTC-atta
gi|70771                      :                                                                  -C-T-T-T---T-G-CC--A--ATT--T-T--G-A---CTTTT-T--CCT----T------T---TACA--A-TC------G--TG-T-TA-C-A---TT-TA---A-A--AA--CCT-TGC--TT--C-G-C-G-GA--TG-GG-----CC-T-T-C-TG-CT-CG-
gi|70772                      :          gtatgccagagata-TA--T-CTG--G----A-GAT-C-A--TTA--TC----TTT-C-T-T-T---T-G-CC--G--ATTTAT-T--G-G---ATTCC-T--TTC-A--T------A---TACATGT-AC------A--TT-T-TA-C-T---TT-TA---A-A--G---CCT-CGC--TT--C-A-T-G-AT--TG-AG-----CC-T-C-T-GG-C
gi|70773                      :                          A--T-GTA--G----A-TAT-G-A--TTT--CT----TAT-T-T-T-T---CAG-AT--A--AAT--T-T--G-A---CTTTT-T---------------------ACA--T-AC------A--TG-G-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CTT-TCC--TT--T-G-G-G-AA--CG-AG-----AC-T-T-C-AG-TC-CG----------------T---CG-CTC-GG-TAT
gi|70774                      :                                                -A--TTT--AT----ATT-C-T-T-T---T-T-CT--G--AAT--------------------------C--T------T---TACA--T-GCATGTATG--TG-T-TA-C-C---TT-CA---A-A--G---CCT-TGC--TT--A-T-C-G-GA--CG-GG----------T-C-GT-AC-CG-T-C-CG-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TATta
gi|70775                      :                                                                                                                   T-C--T------T---TACA--T-AC------G--TG-T-TA-C-C---TT-TA---G-A--G---CCT-TCC--TT--C-G-C-G-GG--CG-GG-----CC-T-T-C-GG-CC-CG-C-T-CA-A-GC-T--T---CG-CTC-GG-TAT