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Reference ( gi|42233 )        : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGA-TGGCGCCACTTAT-TAT-GATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCT----CGTTCA----T--CA-GT-G--CG-G--AT--C--AGG--AT--T-T-TG--TC--AAA---GA-AAGAATGGG----GG--------------T--------G---------T-T-------G------AAA-A-------TTGA------CCA--------A--A-GC-------G-A--TA-----------A-G-----G--GC---T----C------T-T-A--------GA----------TG---A-A---G--C-----AA-----G----------G--GGG---C----------A---AG---A--GGGT--T--AAAG-T-C-C-C---ATGG--GAA-A---CT-C--TC-GC-G---GTT--------TT---A--------CT-GAG----C--TT-T-----GAAA-GTTA--AG------TTTTA--G-A-G------T--T---------T-A-------A------T-----G---C-------T------A-------T---------C------A------CA--T-------------T-------A---AT--T-A--TTGAG--T-A--GCT--------GC-CATC--AACAAAAAAAAAAGGGGGG----G---GG---CCG----CATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAAT-T--CTG-CA-----A---A----ACG-------T------TCTGA--TAATGTCGACA-----T-----T-TCAT-T--GA---C-AAATCG--AGATAA-T-ATCATGA-C-GT--GTCGG---ATT--CGTGTCA-GA-----AGA----AATA---AGT-T-TAC-ATG--------CA-------ATG-T-T---CT------TCAG--TGTCAGATATAATGATGTTGA-C---TGG-T-CAAATAGAT-TAT-A-T-G---A------CTTGT-TACAGGGAA-AAATTATTTC-GACTTGTCAGGA-----GTC-T-TAT------GATG-AC-------GAGT--ATA-G--AC----ACGTT------------A--GTGGGT---ATT-AACA---C-----A-AT-----ACA--T--CGAG-CACAG---AACT--TTCCCTATAGTCATAGACT-GA-TACTTTGCCGAA-AAGTCGAC-------CC--ACAAGATA--ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
gi|42232                      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGA-TGGCGCCACTTAT-TAT-GATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCT----CGTTCA----T--CA-GT-G--CG-G--AT--C--AGG--AT--T-T-TG--TC--AAA---GA-AAGAATGGG----GG--------------T--------G---------T-T-------G------AAA-A-------TTGA------CCA--------A--A-GC-------G-A--TA-----------A-G-----G--GC---T----C------T-T-A--------GA----------TG---A-A---G--C-----AA-----G----------G--GGG---C----------A---AG---A--GGGT--T--AAAG-T-C-C-C---ATGG--GAA-A---CT-C--TC-GC-G---GTT--------TT---A--------CT-GAG----C--TT-T-----GAAA-GTTA--AG------TTTTA--G-A-G------T--T---------T-A-------A------T-----G---C-------T------A-------T---------C------A------CA--T-------------T-------A---AT--T-A--TTGAG--T-A--GCT--------GC-CATC--AACAAAAAAAAAAGGGGGG----G---GG---CCG----CATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAAT-T--CTG-CA-----A---A----ACG-------T------TCTGA--TAATGTCGACA-----T-----T-TCAT-T--GA---C-AAATCG--AGATAA-T-ATCATGA-C-GT--GTCGG---ATT--CGTGTCA-GA-----AGA----AATA---AGT-T-TAC-ATG--------CA-------ATG-T-T---CT------TCAG--TGTCAGATATAATGATGTTGA-C---TGG-T-CAAATAGAT-TAT-A-T-G---A------CTTGT-TACAGGGAA-AAATTATTTC-GACTTGTCAGGA-----GTC-T-TAT------GATG-AC-------GAGT--ATA-G--AC----ACGTT------------A--GTGGGT---ATT-AACA---C-----A-AT-----ACA--T--CGAG-CACAG---AACT--TTCCCTATAGTCATAGACT-GA-TACTTTGCCGAA-AAGTCGAC-------CC--ACAAGATA--ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
gi|42231                      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGA-TGGCGCCACTTAT-TAT-GATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCT----CGTTCA----T--CA-GT-G--CG-G--AT--C--AGG--AT--T-T-TG--TC--AAA---GA-AAGAATGGG----GG--------------T--------G---------T-T-------G------AAA-A-------TTGA------CCA--------A--A-GC-------G-A--TA-----------A-G-----G--GC---T----C------T-T-A--------GA----------TG---A-A---G--C-----AA-----G----------G--GGG---C----------A---AG---A--GGGT--T--AAAG-T-C-C-C---ATGG--GAA-A---CT-C--TC-GC-G---GTT--------TT---A--------CT-GAG----C--TT-T-----GAAA-GTTA--AG------TTTTA--G-A-G------T--T---------T-A-------A------T-----G---C-------T------A-------T---------C------A------CA--T-------------T-------A---AT--T-A--TTGAG--T-A--GCT--------GC-CATC--AACAAAAAAAAAAGGGGGG----G---GG---CCG----CATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAAT-T--CTG-CA-----A---A----ACG-------T------TCTGA--TAATGTCGACA-----T-----T-TCAT-T--GA---C-AAATCG--AGATAA-T-ATCATGA-C-GT--GTCGG---ATT--CGTGTCA-GA-----AGA----AATA---AGT-T-TAC-ATG--------CA-------ATG-T-T---CT------TCAG--TGTCAGATATAATGATGTTGA-C---TGG-T-CAAATAGAT-TAT-A-T-G---A------CTTGT-TACAGGGAA-AAATTATTTC-GACTTGTCAGGA-----GTC-T-TAT------GATG-AC-------GAGT--ATA-G--AC----ACGTT------------A--GTGGGT---ATT-AACA---C-----A-AT-----ACA--T--CGAG-CACAG---AACT--TTCCCTATAGTCATAGACT-GA-TACTTTGCCGAA-AAGTCGAC-------CC--ACAAGATA--ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
gi|42234                      :                                                                   TCACGTCAACGGTAAGAACA-TCATT-GTTT-GAAA-CATCCATATGT--TCAAGTCTGGAAAGCC--TGTTG
gi|42234                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCGGGGG-TATCT-TTGCAAATT-TATTCCCGGCAAAA---TTTATGGCGATGACATCA-TCAGAAA-AAGTAGGTGACGTTTGG---AGACCAAGACCTGAGCAGTCGG---CATACACTTTCTCTTTGT---GTG-AT-GTGCAA--GTGCAGTTGCAGGGT--TCGAT--TGA-TGG----AC--ATGTAT--ATT-CCTTTCCC--ATAAC--AACTGCAGTAAACATTGCG-ATT-GGGAT-CCAAAAC-CT-TGTTTCCA-TTTCTGAAATAAAATAT---CGTTACATGAATACATAT-----ATG---ATGAATTGATGG--TGAGGATAATG-ATGACGATGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgggggtatctttgcaaatttattcccggcaaaatttatggcgatgacatcatcagaaaaagtaggtgacgtttggagaccaagacctgagcagtcggcatacactttctctttgtgtgatgtgcaagtgcagttgcagggttcgattgatggacatgtatattcctttcccataacaactgcagtaaacattgcgattgggatccaaaaccttgtttccatttctgaaataaaatatcgttacatgaatacatatatgatgaattgatggtgaggataatgatgacgatgat
gi|42232                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 tcacgtcaacggtaagaacatcattgtttgaaacatccatatgttcaagtctggaaagcctgttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAATC-ATAATAAGTGGCGCCA-TCAT-TATCAATTACC
gi|42231                      :     tttcgaaatttgaacgagtctatattgttttcagaattttcaacgtctatgagatatttgtactattcactcaatggtaagaacactcatttgttaagaaagtatccatatgtcgtcaagtctggaaagcccttattgaacggtttggccatatagtttgaacctctggctagtttgttatgtgaaaacactggagtttgcgggagttgatattatacgactcagcagtagacagtttatctgttcaagtgtctgtaaaatcggttactgatttcatagccaagatacgagtcaaggtgctggggagattcggggggtatctattgcaaattatatttccggcaaaaaaatttatgcgatgacctcagtcagaaagaagtaggggacgttgggggcagatcaagacggagcagtcagcgccgtaaactgctctgtatcaggtgaatagtgcagacgtgcagtcgcagGGTAATC-ATAATAAGTGGCGCCA-TCAT-TATCAATTACCgttcccctataacagaactgcaatacattgggaattggggatcccaacacgctgtgtttccagtttctgaaatcaaacatggccgtagacggatggaatttccaacgagaatgaatcgaaagtttgagcacagtgaatgatatgattaattgattgatttttgttgcgttttatgttcgcgtcgaaaatgaggacgtctggagacagatgaaagataatgtaaatgacaggggaagagtagcttaaactaggtgtaatcctcgttcatcagtgcggatcaggattttgtcaaagaaagaatgggggtgttgaaaattgaccaaagcgataagggctcttagatgaagcaagggggcaagagggttaaagtcccatgggaaactctcgcggttttactgagctttgaaagttaagttttagagtttaatgctatcacattaattattgagtagctgccatcaacaaaaaaaaaagggggggggccgcatgctaaatgatgacacgttacaaatatattattaccaacataggggacattttattacacaaacgctgcttacttacgtgggttattcctaaaaaaaaaccccaatcaaaacgtgattgggttccataattctgcaaaacgttctgataatgtcgacatttcattgacaaatcgagataatatcatgacgtgtcggattcgtgtcagaagaaataagtttacatgcaatgttcttcagtgtcagatataatgatgttgactggtcaaatagattatatgacttgttacagggaaaaattatttcgacttgtcaggagtcttatgatgacgagtatagacacgttagtgggtattaacacaatacatcgagcacagaactttccctatagtcatagactgatactttgccgaaaagtcgacccacaagataataattatctgacggcaaatgccaccatacatgttttcacaggcttttggtgtagccatggtcattcgctgatatcgtgactggcacaagcataaaaaatattaatgttgtcaaattctcaacttttgtcttcagagttctaacttcttaagtcctaagggtctgaattccatcggcctggcaattggatgacaacgattgtttacttggagcataggagctgagagcttctacatagtagttgcttgacgatacaaggaaactatgcatgtccttcatttgtttggatcgagccaaagttaaagctgaagtatgttataggatgattttgacggcaggcatgccaattatcgatcagtggacattacctcatgatacccgagtaatttggatgacttttagttaatgaggtagcggtataacggcacattccttcgagaggatcattatgaaactatacctaatacaattcctactagcatagcagagtttatgttttggaaaacagagccagatctagggcgggaaaaacataagataaacacattaagtcatgagaggcgtatcgcagcagaataaacaggacatgataaataagtgcccgcggatgccacgaagaaaaaccattacataataggcgggatcgcaatgggcggattccccagagcaaggagacatatgacaataggatggatgcagtctggaaccaacatgcatgtaggccggtgcgagcatctggaaatcgtgaagagatgcaatgataaataggggacataccgcggatccggaactacgataacaccacagggtaatatataaactgtgttccttgatctcc
gi|42235                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttcgaaatttgaacgagtctatattgttttcagaattttcaacgtctatgagatatttgtactattcactcaatggtaagaacactcatttgttaagaaagtatccatatgtcgtcaagtctggaaagcccttattgaacggtttggccatatagtttgaacctctggctagtttgttatgtgaaaacactggagtttgcgggagttgatattatacgactcagcagtagacagtttatctgttcaagtgtctgtaaaatcggttactgatttcatagccaagatacgagtcaaggtgctggggagattcggggggtatctattgcaaattatatttccggcaaaaaaatttatgcgatgacctcagtcagaaagaagtaggggacgttgggggcagatcaagacggagcagtcagcgccgtaaactgctctgtatcaggtgaatagtgcagacgtgcagtcgcagGAGAAGTTTCAATTCCGTGTA---CTAAAGCGATCA----CA-CATGT-G--CG-G--AT--CGCAGG--AT--T-TGTGGTCC--GAA---CA-GGGGGTGGG----GG--------------C--------G---------T-T-------G------AAA-A---------GA------CCC--------A--ATAC-------C-T--TA-----------A-G-----G--TC---T----C------T-G-G--------GG----------TG---G-A---G--C-----GA------------------------------------A---AA---C--GGG---------G-G-C-C-C----T-G--AAA-G---CTGC--TC-G--G---GTA--------TT---G--------TA-AAG----C--TT-T-----GAAA-GTTAATAC------TTTTAT-G-A-G---------T---------T-A-------A------TTTA--G---CTTACTA-T------A-------T---------CGCTAATA------CA--G-------------T-------A---ATAAT-C--TTGAA--T-----TTG-------GT-CATC--AATAAAAA------GGGGA----G---GT---CTG----Cgttcccctataacagaactgcaatacattgggaattggggatcccaacacgctgtgtttccagtttctgaaatcaaacatggccgtagacggatggaatttccaacgagaatgaatcgaaagtttgagcacagtgaatgatatgattaattgattgatttttgttgcgttttatgttcgcgtcgaaaatgaggacgtctggagacagatgaaagataatgtaaatgacaggggaagagtagcttaaactaggtgtaatcctcgttcatcagtgcggatcaggattttgtcaaagaaagaatgggggtgttgaaaattgaccaaagcgataagggctcttagatgaagcaagggggcaagagggttaaagtcccatgggaaactctcgcggttttactgagctttgaaagttaagttttagagtttaatgctatcacattaattattgagtagctgccatcaacaaaaaaaaaagggggggggccgcatgctaaatgatgacacgttacaaatatattattaccaacataggggacattttattacacaaacgctgcttacttacgtgggttattcctaaaaaaaaaccccaatcaaaacgtgattgggttccataattctgcaaaacgttctgataatgtcgacatttcattgacaaatcgagataatatcatgacgtgtcggattcgtgtcagaagaaataagtttacatgcaatgttcttcagtgtcagatataatgatgttgactggtcaaatagattatatgacttgttacagggaaaaattatttcgacttgtcaggagtcttatgatgacgagtatagacacgttagtgggtattaacacaatacatcgagcacagaactttccctatagtcatagactgatactttgccgaaaagtcgacccacaagataataattatctgacggcaaatgccaccatacatgttttcacaggcttttggtgtagccatggtcattcgctgatatcgtgactggcacaagcataaaaaatattaatgttgtcaaattctcaacttttgtcttcagagttctaacttcttaagtcctaagggtctgaattccatcggcctggcaattggatgacaacgattgtttacttggagcataggagctgagagcttctacatagtagttgcttgacgatacaaggaaactatgcatgtccttcatttgtttggatcgagccaaagttaaagctgaagtatgttataggatgattttgacggcaggcatgccaattatcgatcagtggacattacctcatgatacccgagtaatttggatgacttttagttaatgaggtagcggtataacggcacattccttcgagaggatcattatgaaactatacctaatacaattcctactagcatagcagagtttatgttttggaaaacagagccagatctagggcgggaaaaacataagataaacacattaagtcatgagaggcgtatcgcagcagaataaacaggacatgataaataagtgcccgcggatgccacgaagaaaaaccattacataataggcgggatcgcaatgggcggattccccagagcaaggagacatatgacaataggatggatgcagtctggaaccaacatgcatgtaggccggtgcgagcatctggaaatcgtgaagagatgcaatgataaataggggacataccgcggatccggaactacgataacaccacagggtaatatataaactgtgttccttgatctcc
gi|42236                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGCTTAAATTA--TTTTGTTAT----TGTTCA----------GT-GG-CG-G--AT--C--AAG--GA--T-T-TG--TC--AAA----A-GGG---GGGCCC-GG--------------TCC------G---------T-T-------G------AAA-A-------GGAG------CCAAT------A--A-GC-------T----TA-----------A-G-----G-------T----C------T-G-G--------GA----------TG---A-A---G--CCA---AA-----GTT--------G--GGGC--C----------C---AG---G--GGG---C--GACG-T-C-C-C----T-G--GAA-G---CT-C--TC-G--A---GTT--------TT---A-----------GAG----C--TT-T-----CAAA-GTT---AC------TTTTA--G-A-G------G--T---------T-A-------A------TTTA--G---C-------T------A-------T---------
gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAATC-T----C-TTTA----TTTCA-GT-GG-CG-GG-AC--C--AGG--AT--T-T-GT--TC--GAA---GG-GAGGGGGGG----GGGGGT----------C--------G---------T-T-------G------AAA-----------GA--------G--------A--A-GC-------A-A--TA-----------A-A-----G--CCAAGT----C------C-G-A--------GA----------TG---A-A---G--CCA---AA-----GT---------G--GGGGC-C----------C---AG---G--GGAC--G--AAAG-C-C-C-T------G--GAA-G---CT-T--TC-G--A---GTT--------TT-------------T-GAG----C--TT-T-----TAAA-GTT---AC------TTTTAGGG-G-G------TGGT---------T-A-------A------TTTA--A---C-------T------A-------T----------------A------TA--T-------------C-------A---AT--
gi|42238                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T----CCTTTA----C--CA-GT-GG-CGCG--AT--CC-AGG--AT--T-T--G--TC--GAA---GC-GGG--TGGG----GG--------------T--------GGCGTCGCGTT-T-------GTTTAACAAA-A---------GAAG----CCA--------A----TT-------G-A--TA-----------A-----------C---T----CAATGTCT-G-G--------GA----------TG---T-A---GT-C-----AA-----GC---------A--GGG---C----------C---AGCT-A--GGGCACG--AAAG---C-C-C---ATGG---AA-G---CC-C--TC--C-GA--GAT--------TT---A-----------GAG----C--TTCT-----TAAA-GTTA--C-------TTTTA--G-A-G------G--T-----------A-------A------TTA---G---C--------------A-------T---------CT-----A------CA--T-------------T-------C---AT--A-A--T--AA--T-AAAGTTTG------GT-CACC----CAAAAAAAAAAGGGGGG----G---GG---
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gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATAAT-TTTCTG-CACAAATA---A----ACA-------TAATTTATCTGAACCAAGCTCAACA-----TAA---T-TTTC-T--GAAA-C-AAATTA--ACATAT-T-ATC-TGA-C-AAAAGTCGGCC-ACTG-CTTATCT---------------AACA---AGT-TAGAC-ATA--------TG-------ATG-T-CGA-CT------T------GTCAG--ATAATGATGTCGA-C---
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gi|42289                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CA-----T---A----ATA-------T------CCTGA--CAA-GTCGACA-----TAA---T-TCAT-TCTGAACAC-AAGTCA--ACATAA-TTATC-TGAGC-AA--GTCAA-------------CA-TA-----ATATTCCGACA---AGT-T-AAC-AT----------A-------ATT-TAT---CT------ACAA---GTCGG-CATTGTTATCTGGAGCAAGTAG-T-CAA-TAAAT-TATTA-T-G---ATGTCGGCTTGT-CA----GAA-AAATGATGTC-GACTTGTCAG
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gi|42287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------TCTGA--CAAT-TCGACA-----T-----CATTATCT--GA---C-AAGTCG--ACATCA-TTATC-TGA-C-AA--GTCGA---CAT--CATAT----A-----ATA----AGTA---TGT-C-TAC-TTGTCAGATAACA-------ATG-C-CGA-CT------T------GTCAGA-A-AATTATGTTGA-C---TTG-T-CAGATA-AT-TAT-G-TTG---A------CTTGT-CG------A-AAATTATGTC-GACTTGTCAG-------ATA-T-TAT------GATG-AG-------AAGT--AGATG--GC----A-GTT------------A--GT-GGC---ATT-AACA---C-----GCATTA---ATA--A--CAAGATACCG---AG----TTCC---TAATCATGG--T-GA-TTATTTTCTGAC-AAGTCGAC-------AT--A-AAGAT
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gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------TCTGA--CAAT-TCGACA-----T-----CATTATCT--GA---C-AAGTCG--ACATCA-TTATC-TGA-C-AA--GTCGA---CAT--CATAT----A-----ATA----AGTA---TGT-C-TAC-TTGTCAGATAACA-------ATG-C-CGA-CT------T------GTCAGA-A-AATTATGTTGA-C---TTG-T-CAGATA-AT-TAT-G-TTG---A------CTTGT-CG------A-AAATTATGTC-GACTTGTCAG-------ATA-T-TAT------G
gi|42291                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------TCTGA--CAA-GTCGACA-----TAA---T-TTTC-T--GA---C-AAGTCA--ACATAATT-ATC-TGA-C-AA--GTCtgaattatgttgac
gi|42290                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgtcagaaaattatgtt------TCTGA--CAA-GTCGACA-----T-----CATTATCT--GA---C-AAGTCA--ACATCATT-ATC-TGA-C-AA--GTCGtattaaaatgacaagta
gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgacaagttggcatattatctgacaagtagacataattattatgatgt------TCTGA--CAAT-TCGACA-----T-----CATTATCT--GA---C-AAGTCG--ACATCA-TTATC-TGA-C-AA--GTCGA---CAT--CATAT-----------------AATA---AGT---------------------------ATG-T-----CT------AC-T--TGTCAG--ATAACAATGCCGA-C---TTG-T-CAGA-AAAT-TAT-GTT-G---A------CTTGT---CAG---A-TAATTATtaatgatttcgacttgttcatgattatgttgacttgtcagaa
gi|42293                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         c------TCTGA--CAA-GTCGACA-----TATATAT-TTGTCT--GA---C-AAGTCA--ACATAATT-ATC-TGA-C-tgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagatctgacaagtcaacataattatctgacaagtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
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gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGA--CAA-GTTGGCA-----T-----A-TTATCT--GA---C-AAGTAG--ACATAA-TTATTATGA----T--GTCG----ACT----TGTCA-GA-------------------------TA--ATG-----------------ATG-T-TGA-CT------T------GTCAGATA--ATGATGTCGA-C---TTG-T-CAGATA-AT-GAT-T-TCG---A------CTTGT-T-CATG------ATTATGTT-GACTTGTCAGAA-----
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gi|42292                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cataaATGTTGA-C---TTG-T-CAGATAT-T-TAT-G-TCG---A------CTTGT---CAGAAAA-TAATCATttgttagataagcagtggccgacttttgtcagataatatgttaatttgtttcagaaaattatgttgagcttggttcagataaattatgtttatttgtgcagaaaattatgttgaattgtcagaaaattatttcgacttgtcagatatttgatgtacaatagagtggattggtgcaagttagttgacattaacacgcattaattaacaaggataacggcggttcctaatcatagtgattattttcttgagcaagtcggaacataaaatctgacatctgacagtggtggcagaaatatgccaccatagaatacatgttcaagct
gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatcagataattatgtcgacttgtgagataattatgtttacttgtcagaaaattatgtcaacttgtcagatattatgataacacgtagatggctacgtaaacgtttccgtagatggcagttggtggcattaacacgcattaataacaagataccgagttcctaagcatg---A------CTTGT---CAG---A-TAATTATGTT-GACTTGTCAG-------ATCTT-TAT------GTCG-AC-------TTGT--GCA-G--AT----AT-TT------------A--GTGaaat
gi|42295                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtcta-AAACTTTTTCAGACTTGTCAGA-------TA-T-TAT------GATG-AC-------AAGT--AGATG--GC----A-GTT------------A--GT-GGC---ATT-AACA---C-----ACATTA---ATA--A--CAAGATACCG---AGTT--GT-----TAAGCATGG--T-GA-TTATTTTCTGAC-AAGTCGAC---------------------ATAACTATCTGAC-------ggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|42250 ): ATCAGTGGCGGATCTAGGGATTTGTCGAAGAGGGGAGGGGGTTCATTGAAAGAGGAGCCAATTAATAAGCTCTAGAGGTCTGGATTGAAGCCAAAATGGGGCCCAGGGTCAAAACCCCAGAAGCTGTCTGGTGTGAGACTTTTATTATTATTATTTTTAAAGTTAACTTTCAGTGGTTAATTAATTATTTAGCT






Alignments
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAACGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCGGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATCGATAATGAGTGGCGCCACTCAT-TATCGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-A-T-C-C-AG-G--ATT-T-TG--TC-G-A-A---------G--AGGG-G--G-GG-G-G---G--G-----T---C-C---GTT-----GA-AAAA-G--G------A---G--C--C-A------A-----A----G-C-N---T----------A-A--G----------G--T---------C-T--G--G----GA--T-G-A--A--G-CC--A-AA---G----------G---GG-G---C--C--AG--GGGGC-C-G---AA-G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---C-T-C--TC---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------ACT-T-TTAG-A----GG-TT-AA------T-T------T---G---C---------T------A-------T--------C------A---CA--T-------------T-------A---AT---NA--T----T--A-AG-TA-G---TTG-CGTCA-CC---AAAAAA----------AAAAGGGGGG----G---GG---CCGCATG-----CTAAATGATGGCAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATT--CTGACAA---AACGT-----TC-TGA-CAA-G-TCGACAT--T-TTATCTGACAAGTCGAC------AT---A---AT-TATC-TGAC---------AAGT--CGGC--ATTCNTGT--CAGAA-AAATANGTTTAC-----ATG--------CA--------ATGTCGACTT---TG--TCAGATATAATNA-TGTCGACTTG-T-CAGAT-A-A-T---TATGTCGACTTGT-CACA--GAA-AAATTATGTC-GACTTGTCAGAAATATTATGATG--AC----GA---GTANA-TG--GC-ACGT-----------T---AG-TG---------GGCATT---AACA-CG-----ATTAACANC-GA------GACACNGAGNTTTCCC-ATAGTCATGGACTGATNNTTTTC-TG-A-CAAGTCGACNCACAAGAT---A---------ATAANTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TG--CAA-GGTCGACAT--CATTATCTGACAAGTCGAC------AT---C---ATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGTGGCCGACTTTTGT--CAGAT-AA-TATGTTAAT-----TTGTTT-----CAGAAAATT-ATGTTGAGCT---TGGTTCAGATA-AATTA-TGTTTATTTG-TGCAGAA-A-A-T---TATGTTGAATTGT-CA-----GA-AAATTATTTC-GACTTGTCAG--ATATT-TGATGT-ACAATAGA---GTGGATTGGTGC-AAGT-----------T---AG-TT---------GACATT---AACA-CGCATTAATTAACAAG-GA------TA-ACGGCGGTTCC----TAATCATAG--TGATTATTTTCTTG-AGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGAC-ATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCTtgaattatgttgac
gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cataatcaTT--CTGACAAGTCAACATAA---TCATGAACAA-G-TCGAAAT--CATTATCTGACAAGTCGAC------AT---C---AT-TATC-TGAC---------AAGT--CAAC--ATCATTAT--CTGA------------------------------CA--------A-GTCGAC------A--TCATA-ATAATTA-TGTCTACTTG-T-CAGAT-A-A-T----ATGCCAACTTGT-CA------A-TAATTATGTT-AACTTGTCAGAAA-ATTATTGTG--AC----
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-A-T-C-C-AG-G--ATT-T-TG--TC-G-A-A--------G--AGGG-G--GGG-G---G---G--G-----T---C-C---GTT-----G-A-AAAA-G--G------A---G--C--C-A------A------A----G-CT---T----------A-A--G----------G--T---------C--T--G--G----GA--TG-A--A--GCC-A-AAGC--G-G-GG-----------C-C----AG--GGGGC-C-G---AA-G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--TC---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------A--CT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----AT--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAG--G-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGT------TC-TG-ACAA-G-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---AAT-TATC-TGAC-----------G-AGTCGGC--ATTCTTGT--CAGAA-AAATANGTCTAC-----NTG--------CA--------ATGTCGACTT---TG--TCAGATATAATTA-TGTCGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTCGACTTGT-CACAGG--A-AAATTA-TGTC-GACT-TGTCAGGAATATTATGATG---AC----GA---GT-AGAT--G-GC-ACGT-----------TAG-TG---------GGCAT-----TAACA-CGCAT--T------AA-CANCGA-G---ACACCGAGNTT--TCCC-AT--AGTCATG--GACTGATNATTTTC-TGA-CAAGTCGACACA-AAGAT---A---------ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----AT-GC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-G-A-C-C-AG-G--ATT-T-GT--TC-G-A-A--------GGGAGGG-G--GGG-G---G---G--G-----G---T-C---GTT-----G-A-AAGA-G--A------A---G--CAAT-A------A------A----G-CC----------------A--A----------G--T---------C--C--G--A----GA--TG-A--A--GCC-A-AAGT--G-G-GGGC---------C-C----AG--GGGAC-G-A---AA-G-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--TC---G-A---G--T-TT------T--T--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTT--------A--CT-T-TTAG-GGGGTGG-TT-A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattTC-TGA-CAAGTCAAC----------------------ATAATTATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----AT-ATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGgtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACATAATTCATC-TG-ACAA-T-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT-----AATAAGTATGTCTAC-----TTGTCAGATAACA--------ATGCCGAC-T---TG--TCAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTTGACTTGT-C----G--A-AAATTA-TGTC-GACT-TGTCAG--ATATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-TG--CAA-GGTCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAGAT-AA-TATGTTAAT-----TTGTTT-----CAGAAAATT-ATGTTGAGCT---TGGTTCAGATA-AATTA-TGTTTATT-TG-TGCAGAAA-A-TTATGTTGAATTGT-CA---G--A-AAATTA-TTTC-GACT-TGTCAG--ATATT-TGATGT--ACAATAGA---GT-GGATTGGTGC-AAGT-----------TAG-TT---------GACAT-----TAACA-CGCAT--T------AATTAACAAGG---ATAACGGCGGT--TCC---T--AATCATA--G--TGATTATTTTCTTGAGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGA-CATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATAT-GC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
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gi|42287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------TC-TG-ACAA-T-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT-----AATAAGTATGTCTAC-----TTGTCAGATAACA--------ATGCCGAC-T---TG--TCAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTTGACTTGT-C----G--A-AAATTA-TGTC-GACT-TGTCAG--ATATTATGATG---AG----AA---GT-AGAT--G-GC-A-GT-----------TAG-T----------GGCAT-----TAACA-CGCAT--T------AA-TAACAA-G---ATACCGAG--T--TCC---T--AATCATG--G--TGATTATTTTC-TGA-CAAGTCGACATA-AAGAT---
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--AGGG-G--GGG-G---G-----G--G----T---C-C---G-----TTG-A-AAAA--G--G--A----G-C--C-A----A-------T-----A----G--C--T---T--A-A--G---G--T---------C--T--G--G----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------C-GGGGG--CCCAG--GGGGC-C-G---AAG-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--T-C---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------A--CT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----AT--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAG--G-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGT-A-----TC-TG-ACAA-G-TCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGAC------AT---AAT-TATC-TGAC--G----------AGTCGGC--ATTCTTGT--CAGAA-AAGTATGTCTACTTG--T-------CA-------A----TGTCGACTT---TG--T-CAGATATAATTA-TGTCGACT-TG-T-CAGATA-A---T-TATGTCGACTTGT---CAAG--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCAG-AA-TATTATGATG---AC----GAGTAGA-TG--GC-ACGT-----------TAG-TG---------GGCATTAAC-ACGCATTAA-CAACGA-GATACCGAGNTTTCC--C-ATAGTCATGGACTGATNATTT-TC-TGA-CAAGTCGACACA-AAGAT---A---------ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42236                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gagaagtttcaattccgtgtactaaagcgatcacacatgtTGGCTTAAATTA--TTTTGTTATTGTTCA----------GTGG-C---G-G-AT-C-A-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-AA-A------------AGGG-G--GGC-C---C-----G--G----T---C-C---G-----TTG-A-AAA---G--G--A----G-C--C-A----A-------T-----AA---G--C--T---T--A-A--G---G--T---------C--T--G--G----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------T-TGGGG--CCCAG--GGGG--C-G---ACGT----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-C--T-C---G-A---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-C----AAA-GTT--------A--CT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------tctgc
gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-GA-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GTT---C-GA-A---------GGGAGGG-G--GGG-G---G-----G--G----G---T-C---G-----TTG-A-AAGA--G--A--A----G-C----A----A-------T-----AAA--G--C--C--------A--A---G--T---------C--C--G--A----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------T-GGGGG--CCCAG--GGGAC-G-A---AAG-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--T-C---G-A---G--T-TT------T--T--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTT--------A--CT-T-TTAG-GGGGTGG-TT-A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgactt-TC-TGA-CAAGTCAAC----------------------ATAATTATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----ATATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACAT-AATTCATC-TG-ACAA-T-TCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC--A----------AGTCGAC--A-TCATAT-----AATAAGTATGTCTACTTG--TCAGATAACA-------A----TGCCGAC-T---TG--T-CAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A---T-TATGTTGACTTGT---C--G--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCAG--A-TATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-TG--CAA-GGTCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGAC------AT---CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAGAT-AA-TATGTTAATTTGTTT-------CAGAAAATTA----TGTTGAGCT---TGGTT-CAGATA-AATTA-TGTTTATT-TG-TGCAGAAA-A---T-TATGTTGAATTGT---C-AG--AA--AATTATTTC-GACTTG-TCAG--A-TATT-TGATGT--ACAATAGAGTGGATTGGTGC-AAGT-----------TAG-TT---------GACATTAAC-ACGCATTAATTAACAAGGATAACGGCGGTTCC-----TAATCATAG--TGATTATTT-TCTTGAGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGA-CATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cataatcaTTCTGACAAGTCAACATAA-----TCATGAACAA-G-TCGAAATCATTAT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC--A----------AGTCAAC--ATCATTAT--C------------------TG--A-------CA-------A-----GTCGAC------A--T-CATA-ATAATTA-TGTCTACT-TG-T-CAGATA-A-----TATGCCAACTTGT---CAAT------AATTATGTT-AACTTG-TCAG-AA-AATTATTGTG---AC----
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--AGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------T---C-C---G-----TTG-A-AAAA--G--G--A----G-C--C-A----A-------T-----A----G--C--T---T--A-A--G---G--T---------C--TG--G----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------C-GGGGG--C--CCAGG-GGG-C--G---AA--G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--T-C---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------ACT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----A--T--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAG--G-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGT-----A-----TC-TG-ACAA-G-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---AAT-TATC-TGAC-----------G-AGTCGGC--ATTCTTGT--CAGAN-AAGTATGTCTACTTGT-------CA-------A----TGTCGACTT---TG--T-CAGATATAATTA-TGTCGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTCGACTTGT---CAAG--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCAG-GA-TATTATGATG---AC----GAGTAGAT--G-GC-ACGT-----------TAG-TG---------GGCATTAAC-ACGCATTAA-TAACGA-GATACCGAGNTTTCC--C-ATAGTCATGGACTGATNATTT-TC-TGA-CAAGTCGACACA-AAGAT---A---------ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-GA-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GTT---C-GA-A---------GGGAGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------G---T-C---G-----TTG-A-AAGA--G--A--A----G----C-A----A-------TAA---A----G--C--C--------A--A---G--T---------C--CG--A----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------T-GGGGG--C--CCAGG-GGA-C--GA--AA--G-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--T-C---G-A---G--T-TT------T--T--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTT--------ACT-T-TTAG-GGGGTGG-TT-A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgactt-TC-TGA-CAAGTCAAC----------------------ATAATTATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----ATATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACAT-----AATTCATC-TG-ACAA-T-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT----AAT-AAGTATGTCTACTTGTCAGATAACA-------A----TGCCGAC-T---TG--T-CAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTTGACTTGT---C--G--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCA--GA-TATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-TG--CAA-GGTCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAGAT-AA-TATGTTAATTTGTTT-----CAGAAAATTA----TGTTGAGCT---TGGTT-CAGATA-AATTA-TGTTTATT-TG-TGCAGAAA-A-TTATGTTGAATTGT---CA-G--AA--AATTATTTC-GACTTG-TCAG--A-TATT-TGATGT--ACAATAGAGTGGATTGGTGC-AAGT-----------TAG-TT---------GACATTAAC-ACGCATTAATTAACAAGGATAACGGCGGTTCC-----TAATCATAG--TGATTATTT-TCTTGAGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGA-CATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cataatcaTTCTGACAAGTCAACATA----A-----TCATGAACAA-G-TCGAAAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCAAC--ATCATTAT--CTGAC-AA------------------------------------GTCGAC------A--T-CATA-ATAATTA-TGTCTACT-TG-T-CAGATA-A--TATGCCAACTTGT---CAAT------AATTATGTT-AACTTG-TCAG-AA-AATTATTGTG---AC----
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--AGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------T---C-C---G-----TTG-A-AAAA--G--G--A----G-C--C-A----A-------T-----A----G--C--T---T--A-A--G---G--T---------C--TG--G----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------C-GGGGG--C--CCAGG-GGG-C--G---AA--G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--T-C---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------ACT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----A--T--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAG--G-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGT-----A-----TC-TG-ACAA-G-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---AAT-TATC-TGAC-----------G-AGTCGGC--ATTCTTGT--CAGA-TAAGTATGTCTACTTGT-------CA-------A----TGTCGACTT---TG--T-CAGATATAATTA-TGTCGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTCGACTTGT---CAAG--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCAG-GA-TATTATGATG---AC----GAGTAGAT--G-GC-ACGT-----------TAG-TG---------GGCATTAAC-ACGCATTAA-TAACGA-GATACCGAGNTTTCC--C-ATAGTCATGGACTGATNATTT-TC-TGA-CAAGTCGACACA-AAGAT---A---------ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-GA-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GTT---C-GA-A---------GGGAGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------G---T-C---G-----TTG-A-AAGA--G--A--A----G----C-A----A-------TAA---A----G--C--C--------A--A---G--T---------C--CG--A----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------T-GGGGG--C--CCAGG-GGA-C--GA--AA--G-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--T-C---G-A---G--T-TT------T--T--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTT--------ACT-T-TTAG-GGGGTGG-TT-A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgactt-TC-TGA-CAAGTCAAC----------------------ATAATTATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----ATATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACAT-----AATTCATC-TG-ACAA-T-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT----AA-TAAGTATGTCTACTTGTCAGATAACA-------A----TGCCGAC-T---TG--T-CAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTTGACTTGT---C--G--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCA--GA-TATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-TG--CAA-GGTCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAGA-TAA-TATGTTAATTTGTTT-----CAGAAAATTA----TGTTGAGCT---TGGTT-CAGATA-AATTA-TGTTTATT-TG-TGCAGAAA-A-TTATGTTGAATTGT---CA-G--AA--AATTATTTC-GACTTG-TCAG--A-TATT-TGATGT--ACAATAGAGTGGATTGGTGC-AAGT-----------TAG-TT---------GACATTAAC-ACGCATTAATTAACAAGGATAACGGCGGTTCC-----TAATCATAG--TGATTATTT-TCTTGAGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGA-CATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cataatcaTTCTGACAAGTCAACATA----A-----TCATGAACAA-G-TCGAAAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCAAC--ATCATTAT--CTGA-CAA------------------------------------GTCGAC------A--T-CATA-ATAATTA-TGTCTACT-TG-T-CAGATA-A--TATGCCAACTTGT---CAAT------AATTATGTT-AACTTG-TCAG-AA-AATTATTGTG---AC----
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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--AGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------T---C-C---G-----TTG-A-AAAA--G--G--A----G-C--C-A----A-------T-----A----G--C--T---T--A-A--G---G--T---------C--TG--G----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------C-GGGGG--C--CCAGG-GGG-C--G---AA--G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--T-C---G-G---G--T-TT------T--A--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTTA-------ACT-T-TTAG-A----GG-TT-A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----A--T--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAG--G-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGT-----A-----TC-TG-ACAA-G-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---AAT-TATC-TGAC-----------G-AGTCGGC--ATTCTTGT--CAGA-TAAGTATGTCTACTTGT-------CA-------A----TGTCGACTT---TG--T-CAGATATAATTA-TGTCGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTCGACTTGT---CAAG--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCAG-GA-TATTATGATG---AC----GAGTAGAT--G-GC-ACGT-----------TAG-TG---------GGCATTAAC-ACGCATTAA-TAACGA-GATACCGAGNTTTCC--C-ATAGTCATGGACTGATNATTT-TC-TGA-CAAGTCGACACA-AAGAT---A---------ATAATTATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-GA-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GTT---C-GA-A---------GGGAGGG-G--GGG-G-G-----G--G--------G---T-C---G-----TTG-A-AAGA--G--A--A----G----C-A----A-------TAA---A----G--C--C--------A--A---G--T---------C--CG--A----GA--T-G-A--A--GCCA-AAG---------T-GGGGG--C--CCAGG-GGA-C--GA--AA--G-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--T-C---G-A---G--T-TT------T--T--G--A--------------GC---------------TT-T-T----AAA-GTT--------ACT-T-TTAG-GGGGTGG-TT-A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgactt-TC-TGA-CAAGTCAAC----------------------ATAATTATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----ATATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACAT-----AATTCATC-TG-ACAA-T-TCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT----AA-TAAGTATGTCTACTTGTCAGATAACA-------A----TGCCGAC-T---TG--T-CAGA-A-AATTA-TGTTGACT-TG-T-CAGATA-A-TTATGTTGACTTGT---C--G--AA--AATTATGTC-GACTTG-TCA--GA-TATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-TG--CAA-GGTCGACAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAGA-TAA-TATGTTAATTTGTTT-----CAGAAAATTA----TGTTGAGCT---TGGTT-CAGATA-AATTA-TGTTTATT-TG-TGCAGAAA-A-TTATGTTGAATTGT---CA-G--AA--AATTATTTC-GACTTG-TCAG--A-TATT-TGATGT--ACAATAGAGTGGATTGGTGC-AAGT-----------TAG-TT---------GACATTAAC-ACGCATTAATTAACAAGGATAACGGCGGTTCC-----TAATCATAG--TGATTATTT-TCTTGAGCAAGTCGGAACATAAAAT-------------CTGA-CATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
gi|42286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cataatcaTTCTGACAAGTCAACATA----A-----TCATGAACAA-G-TCGAAAT---CATT-AT-CTGACAAGTCGAC------AT---CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCAAC--ATCATTAT--CTGA-CAA------------------------------------GTCGAC------A--T-CATA-ATAATTA-TGTCTACT-TG-T-CAGATA-A--TATGCCAACTTGT---CAAT------AATTATGTT-AACTTG-TCAG-AA-AATTATTGTG---AC----
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gi|42295                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--AACTTTTTCAGACTTG-TCAG--A-TATTATGATG---AC----AAGTAGAT--G-GC-A-GT-----------TAG-TG---------G-CATTAAC-ACACATTAA-TAACAA-GATACCGAGTTGT-------TAAGCATGG--TGATTATTT-TC-TGA-CAAGTCGAC----------------------ATAACTATCTGAC-------


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Reference ( family-361 )      : TTTCGAAATTTGAACGAGTCTATATTGTTTTCAGAATTTTCAACGTCTATGAGATATTTGTACTATTCAC-TCAATGGTAAGAACACTCATTTGTTAAGAAAGTATCCATATGTCGTCAAGTCTGGAAAGCCCTTATTGAACGGTTTGGCCATATAGTTTGAACCTCTGGCTAGTTTGTTATGTGAAAACACTGGAGTTTGCGGGAGTTGATATTATACGACTCAGCAGTAGACAGTTTATCTGTTCAAGTGTCTGTAAAATCGGTTACTGATTTCATAGCCAAGATACGAGTCAAGGTGCTGGGGAGATTCGGGGGGTATCTATTGCAAATTATATTTCCGGCAAAAAAATTTATG-CGATGACCTCAGTCAGAAAGAAGTAGGGGACGTTGGGGGCAGATCAAGA-CGGAGCAGTCAGCGCCGTAAAC-TGCTCTGTATCAGGTGAATAGTGCAGACGTGCAGTCGCAGGGTAATTGATAATGATGGCGCCACTTAT-TATGATTACCGTTCCCCTATAACAGAACTGCAAT--ACATTGGGAATTGGGGATCCCAACACGCTGTGTTTCCAGTTTCTGAAATCAAACATGGCCG-TAGACGGATGGA-ATTTCCAACGAGAATGAATCGAAAGTTTGAGCACAGTGAATGAT-ATGATTAATTGATTGATTTTTGTTGCGTTTTATGTTCGCGTCGAAAATGAGGACGTCTGGAGACAGATGAAAGATAATGTAAATGACAGGGGAAGAGTAGCTTAAACTAGGTGTAATCCTCGTTCA----T--CA-GTGG-C---G-G-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--AGGG-G--GGG-G---G---G--G-----T---C-C---GTT-----G-A-AAAA--G--G--A-G-C--C----A----AT--A---A-G---C--T---T----------A-A--G---G--T---------C--T--G--G----GA--T-G-A--A--GCC-A-AAG---------TGGGGG--C--CCAGG-GGG--CG---AA--G-----------C-C-C------C---GG-AA-G---CT-C--TC---G-G---G--T-TT------T--A--G--A---GC-TT-T-T----A-----AA--------G-TT-A---C-T-T-TTAG-A----GG-TT---A-------A--T--TT--A--G------C---------T------A-------T--------C------A-----CA--T--------T-------A--------A-------------T-A-----AT--T--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CC------AA-AA--AAAGG-GGGGG----G----GG---C---CGCATG-----CTAAATGATGACAC--GTTACAAATATATTATT--------ACCAAC----ATAG----GGGACATTTTATTACACAAACGCTGCTTACTTACGTGGGTTATTCCTAAAAAAAAACCCCAATCAAAACGTGATTGGGTTCCATAATTCTGACAAGTCAACGTAAT----C--TGA-CAA-G-TCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGACAT------AAT-TATC-TGAC-----------G-AGTCGGC--ATTCTTGT--CAG-ATAAGTATGTCTACTTGT--CA-GATAA-CNATGTCGA-CT----TG--TCAGATA-AAT---TAT-GTCGACTTG-T-CAGAT-A-ATTA-TGTCGACT-TGT---CAG---A-A--AATTATGTC-GACTTGTCAG--ATATTATGATG-AC----GAGTAGA-TG--GCACGTTAGTGGGCATTAACA-CGCAT--TAA-TAACGA-G---ATACCG--A-G--TTCC---TAGTCAT--GGCTGATNA------TTTTC-TGA-CAAGTCGA--CACA--AT-ATAAT----TATCTGAC-------GGC--AA----ATGC-CACC-----ATACATGTTTTCACAGGCTTTTGGTGTAGCCATGGTCATTCGCTGATATCGTGACTGGCACAAGCATAAAAAATATTAATGTTGTCAAATTCTCAACTTTTGTCTTCAGAGTTCTAACTTCTTAAGTCCTAAGGGTCTGAATTCCATCGGCCTGGCAATTGGATGACAACGATTGTTTACTTGGAGCATAGGAGCTGAGAGCTTCTACATAGTAGTTGCTTGACGATACAAGGAAACTATGCATGTCCTTCATTTGTTTGGATCGAGCCAAAGTTAAAGCTGAAGTATGTTATAGGATGATTTTGACGGCAGGCATGCCAATTATCGATCAGTGGACATTACCTCATGATACCCGAGTAATTTGGATGACTTTTAGTTAATGAGGTAGCGGTATAACGGCACATTCCTTCGAGAGGATCATTATGAAACTATACCTAATACAATTCCTACTAGCATAGCAGAGTTTATGTTTTGGAAAACAGAGCCAGATCTAGGGCGGGAAAAACATAAGATAAACACATTAAGTCATGAGAGGCGTATCGCAGCAGAATAAACAGGACATGATAAATAAGTGCCCGCGGATGCCACGAAGAAAAACCATTACATAATAGGCGGGATCGCAATGGGCGGATTCCCCAGAGCAAGGAGACATATGACAATAGGATGGATGCAGTCTGGAACCAACATGCATGTAGGCCGGTGCGAGCATCTGGAAATCGTGAAGAGATGCAATGATAAATAGGGGACATACCGCGGATCCGGAACTACGATAACACCACAGGGTAATATATAAACTGTGTTCCTTGATCTCC
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gi|42237                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TC-TTTA----TTTCA-GTGG-C---G-G-GA-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GTT---C-GA-A---------GGGAGGG-G--GGG-G---G---G--G-----G---T-C---GTT-----G-A-AAGA--G--A--A-G-C-------A----AT--A---AAG---C--C----------------A--A---G--T---------C--C--G--A----GA--T-G-A--A--GCC-A-AAG---------TGGGGG--C--CCAGG-GGA--CG---AAA-G-----------C-C-C------T---GG-AA-G---CT-T--TC---G-A---G--T-TT------T--T--G--A---GC-TT-T-T----A-----AA--------G-TT-A---C-T-T-TTAG-GGGGTGG-TT---A-------A--T--TT--A--A------C---------T------A-------T---------------A-----TA--T--------C-------A--------A-------------T-
gi|42238                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCTTTA----C--CA-GTGG-C---GCG-AT-C-C-A-G-G--A-T-T--T-GT----C-GA-A---------G--CGGGTG--GGG-GT--G---GC-G-----T---CGC---GTTTGTTTA-ACAAAA--G--A--A-G-C--C----A----ATTGAT--A-A---C--T---C----------A-A--T---G--T---------C--T--G--G----GA--T-G-T--A--GTC-A-A-G---------CAGGGC--CAGCTAGG-GCA--CG---AAA-G-----------C-C-CA-----T---GG-AA-G---CC-C--TCC--G-A---G--A-TT------T--A--G--A---GC-TTCT-T----A-----AA--------G-TT-A---C-T-T-TTAG-A----GG-T----A-------A--T--T---A--G------C----------------A-------T--------CT-----A-----CA--T--------TCAT----A--------A-------------T-A-----AT--A--A-A-G--T--T-TG--G-TCA-------CCCAAA--AA-AA--AAAGG-GGGGG----G----G
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gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCACTTGT--CA-GATAA-TTATGTTGA-CT----TG--TCAGAT--CTT---TAT-GTCGACTTG-TGCAGAT-A-TTTAGTGTAGACTGTGT---CAG---A-T--CTTTTTGTC-GACTTGTCAG--ATATT--------------------------CACGT--GT-----TCAAAA-TTCATGATGA-AAACGT-GTTCATGCCC--A-G--TTTG---T-GCCATCCAGTTGACAACATATTTTTTC-TGA-CAAGTCAA--CATA--AT-----T----CATCTGAC-------acagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagatctgacaagtcaacataattatctgacaagtggtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42283                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattTC-TGA-CAAGTCAA--C--------ATAAT----TATCTGACAAGTGGTGGCAGAA----ATATGCACC-----A---ATATCTT-ACAGtggcagaaatatgcaccaatatcttacag
gi|42284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cataattatctgacaagtcaacataattttctgacaagtcggcattgttatctgacaagtagacatacttattatatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgacttgtcagataatgatgtcgaattgtcagatgaattatgttgacttgtcagaaaaaatatgttgtcaactggatggcacaaactgggcatgaacacgttttcatcatgaattttgaacacgtgaatatctgacaagtcgacaaaaagatctgacacagtctacactaaatatctgcacaagtcgacataaagaGTCAACATAATTCATC--TGA-CAA-T-TCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGACAT------CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT----A-ATAAGTATGTCTACTTGT--CA-GATAA-CAATGCCGA-CT----TG--TCAGA-A-AAT---TAT-GTTGACTTG-T-CAGAT-A-ATTA-TGTTGACT-TGT---C-G---A-A--AATTATGTC-GACTTGTCAG--ATATTATG
gi|42285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATAAT----CACTG--CAA-GGTCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGACAT------CATATGTC-TAACTTGTTAGATAAGCAGT-GGCCGACTTTTGT--CAG-ATAA-TATGTTAATTTGTTTCA-GAAAA-TTATGTTGAGCT----TGGTTCAGATA-AAT---TAT-GTTTATTTG-TGCAGAA-A-ATTA-TGTTGAAT-TGT---CAG---A-A--AATTATTTC-GACTTGTCAG--ATATT-TGATGTACAATAGAGTGGATTGGTGCAAGTTAGTTGACATTAACA-CGCAT--TAATTAACAAGG---ATAACGGCG-G--TTCC---TAATCAT--AG-TGATTA------TTTTCTTGAGCAAGTCGG--AAC---AT-AAAATCTGACATCTGACAGTGGT-GGC--AGAAATATGC-CACCATAGAATACATGTT----CAAGCT
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gi|42287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T----C--TGA-CAA-T-TCGACATCATTAT-CTGACAAGTCGACAT------CAT-TATC-TGAC-----------A-AGTCGAC--A-TCATAT----A-ATAAGTATGTCTACTTGT--CA-GATAA-CAATGCCGA-CT----TG--TCAGA-A-AAT---TAT-GTTGACTTG-T-CAGAT-A-ATTA-TGTTGACT-TGT---C-G---A-A--AATTATGTC-GACTTGTCAG--ATATTATGATG-AG----AAGTAGA-TG--GCA-GTTAGT-GGCATTAACA-CGCAT--TAA-TAACAA-G---ATACCG--A-G--TTCC---TAATCAT--GG-TGATTA------TTTTC-TGA-CAAGTCGA--CATA--Atgtgac
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gi|42289                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tctgacaagtcaacatcattatctgacaagtcgacatcataataattatgtctacttgtcagataatatgccaacttgtcaataattatgttaacttgtcagaaaattattgtgacttgtcagataatatgttgacttgtcagaaaattatgtcgacttgtcagatatatgatgacaagtaaatggcagttagtggcattaacacgcattaataacaagataacgagttcctaatcatggtgattattt----C--TGA-CAA-G-TCGACATCATTTTTCTGACAAGCCGACATCAT---AAT-AATT-TA-----------------TTGAC---TACTTGCTCCAG-ATAACAATGCCGACTTGT---A-GATAAATTATGTTAA-CT----TG--TCGGA-A-TAT---TAT-GTTGACTTGCT-CAGAT-A-ATTA-TGTTGACT-TGTGTTCAG---A-ATGAATTATGTC-GACTTGTCAGG-ATATTATGATC-AC----AAGTAGA-TG--GCA-GTTAGTTG-CATTAACAACGCAT--TAA-TAACAA-G---ATACCG--AAG--TGCC---TAATCAT--GGCTGATAT------TTTTC-TGA-CAAGTCGA--CATA--A
gi|42290                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --TGA-CAA-G-TTGGCAT-ATTAT-CTGACAAGTAGACAT------AAT-TATTATGAT-----------G---TCGAC------TTGT--CAG-ATAATGATGTTGACTTGT--CA-GATAA-TGATGTCGA-CT----TG--TCAGAT--AAT---GAT-TTCGACTTGTT-C--AT-G-ATTA-TGTTGACT-TGT---CAG---A-A--agat
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gi|42295                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -A--AACTTTTTCAGACTTGTCAG--ATATTATGATG-AC----AAGTAGA-TG--GCA-GTTAGTGG-CATTAACA-CACAT--TAA-TAACAA-G---ATACCG--A-G--TTGT---TAAGCAT--GG-TGATTA------TTTTC-TGA-CAAGTCGA--C--------ATAAC----TATCTGAC-------