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Reference ( gi|117271 )       :                            TTTTTA--AAG-GAGTT-AGAGCCCTT-G-GACTTA-GGA-TTTT--CTATGCAAAATA-C--TTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTC-------C-TT--------AATCCT--TTACTTCGA-GG--TTTTTAAA---GGAGTT---------------A---GT-TC-----CCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------AGT-GCC-C-----TAT-TTTTA
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gi|117302                     :                                                                                                ttttcaatgagttgttaccctttgacttagatttgttatgcaaaattccatggattcttttacccaatagacattTT---------------A---GG-TT-----CCTGAGTCC---A--TA--A------T-A----T-G------T-G--CGG-GC-G-T-T-T--C-A----TGT------AT-CA--G---------A-T----T----G----G--C-------GCT-GCC-C-----TAT-TTT
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gi|117305                     :                                                                                                                          aatttgtaaccctttgacttaatgaaatacaaattctatgtaattattcctttccctgatgaacattaaaat-TC-----CCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGT-GCC-C-----TAT-TTTT
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Reference ( family-320 )      :                                                                                   TTTT-TNAAG-GAGTT-ANGGCCCTT-G-GACTTA-GGATTTT--CTATGCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTAATCCT--TNACTCC-GAN-G-TTTTTAAAGGAGTT--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
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gi|117308                     :                                                                                                                                                                                                                                -T-CCCTGGGTTC---AA-TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--A---------C-T----T----G----G--C-------AGTGTC-C-----TAT-TTTT
gi|117309                     :                                                                                                                                                                                                                                -T-CCCTGGGCCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117310                     :                                                                                                                                                                                                                                -T-CCCAGGGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-T--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-----G---------CTT----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117311                     :                                                                                                                                                                                                                                -T-CCCTTGGTCA---A--TA--A------T-AATGTT-A------TAG--TGG-GC-G-T-A-T--C-AACTTTGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117312                     :                                                                                                                                                                                                                                -T-CCCTTGGTCA---AAATA--AAATG--T-A----T-A------TTG--CGG-GC-G-T-A-T--C-AC---TTT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-A-----TGT-TTCTA
gi|117313                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGGGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117314                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGTGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117315                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CTCTATGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117316                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGGGTCA---A--CA--A------T-A----T-A------T-G--TGG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117317                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCAGGGTCA---A--TA--A------T-A----T----------G--TGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117318                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CTCTGTGTCA---A--TA--G------T-G----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTT
gi|117319                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CTCTGGAGCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------GATGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117321                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGG-TCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GT-G-T-A-C--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TATATTTT
gi|117322                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGTGTCA---A---A--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GCCG-TTA-T--C-A-----GT------AC-CG--G---------CCT----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117323                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTGTGTC--------A--A------T-A----T-A------T-G--TTG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTACC-C-----TAT-TTTT
gi|117324                     :                                                                                                                                                                                                                                  -CCCTG--TTC---A--TA---------T-AC---T-T------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-AA---TGT------AC-CG--GG--------C-TAGTGT----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TT
gi|117325                     :                                                                                                                                                                                                                                       GGGTCC------TA--A------T-A----T-A------T-G--TAG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--CGCCG---GGTGCT-C-----TAT-TTTTA
gi|117326                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CAG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G-----------T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117327                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------AGTGTC-C-----TAT-TTTT
gi|117328                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGTCC---A--TG--A------T-A----T-A------T-G--TGG-AC-G-T-A-T--C-A----TGC------AC-CG--GT--------T-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTCA
gi|117329                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----TCACCGTTTTG--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
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gi|117276                     :                                                                                   TTTT-TTAAG-GAGTT-AGGGCCCTT-GCGATTTACGGATTTTACCTATGCAAACTATCTTT-GGTTACTC-GC-AACTCCTCC-TTAATCCTAATAACTCC-TAT-G---TTTAAAGG-AGTT--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---G--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-AC-GTT-A-T--C-A----TGT------AA-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------AGTGCC-T-----TAT-TTTT
gi|117277                     :                                                                                   TTTT-TAAAG-GCGAT-AGCGTCCTT-G-GACTTA-AGATTTT--CTACGCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTAATCCC--GAACTCC-GAT-G-TTTTTAAAGG-AGTT--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TATTACCATATT-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--C---------C-T----T----G----G--C-------GATGTC-C-----TAT-TTT
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gi|117280                     :        tttttaaaaattaaattgtaacactttaaattagatttgttatgtaaaattccatggatttttttcctatacacatTTT-TCAAT-GAGTT-GTTACCCTT-T-GACTTA--GATTTG--TTATGCAAAAT
gi|117280                     :                                                                                                                                                                                                             TT--------------A-G--T-ACCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-G------T-G--TGG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----C----A----A--C-------TGTGCC-C-----TAT-TTTTAtccatggattcttttacccaatagacattttagtacctgggtccataatatgtgtgggcatatcatgtaccggttcaactgtgccctattttta
gi|117281                     :        ttttcaatgagttgttaccctttgacttagatttgttatgcaaaattccatggattcttttacccaatagacattTTTT-TAAAG-GAATTTAGGGCCCTT-G-GACTTA-GGATTTTT-CTATGCAAGATA-CTTT-GTCT--TCTGCAAACTCCTCC-TTAAT-CT--TTACTCC-GA-------TTG--------T--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117287                     :                                                                                                                                                                ttaacttgttatacaaaattcatggattcttttccccaataccatTT--------------A-AG-T-C--TGGG-CC---A--TA--AG-----T-A----TGA------T-G--TGG-GC-GAT-A-T--C-A----TGT------ACGTG--G---------T-T----T----G----GA-C-------AGTGCC-C-----TA
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gi|117312                     :                                                                                                                                                                                                                                 -T-CCCTTGGTCA---AAATA--AAATG--T-A----T-A------TTG--CGG-GC-G-T-A-T--C-AC---TTT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-A-----TGT-TTCTA
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gi|117269                     :                                                                                                                                                                                                                                        ttGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GT-A-T-A-T--C-A----TGC------AC-CG--GTTTGCATGAT-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TGT-TTTTAttcattgaattttttccccgatagacattgaagtccataatatatgcgggtatatcatgcaccggtttgcatgatttggcggtgccctgttttta
gi|117270                     : ttttttatcaatgagttataaccctttggctaagatttataatgcaaaatttcattgaattttttccccgatagacattgaaTTTT-TAAAAAGAGTT-GCGGCCCTT-G-CATTTA-T--TTTT--TTATCCAAAATA-TTTT-G-----------------------AATTTT--TT-CCCC-TAT-A-T------AGATATTT--------------A-AG-T-CCTTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GC-G-T-A-T--T-A----TGT------AC-CA--G---------T-T----G----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117271                     :                                                                                  tTTTT-TAAAG-GAGTT-AGAGCCCTT-G-GACTTA-GGATTTT--CTATGCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTAATCCT--TTACTTC-GAG-G-TTTTTAAAGG-AGTT--------------A-GT-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------AGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117272                     :                                                                                   TTTT-TAAAG-GAGTT-ATGGCCCTT-G-GACTTA-GGTTTTT--CTATTCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTATTCCT--TAATTCC-GAT-G-TTTTTAAA-G-AGTT--------------AGGG-T-TCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
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gi|117275                     :                                                                                  tTTTT-TGAAG-GAGTT-AGGGCCCTT-G-GACTTA-GGTTTTT--CTATGCAAAATA-CTTT-GTCT--TT-GC-AACTCCTCC-TTAATCCT--TAACTCC-AAT-G-TTTTTAAAGG-AGTT--------------A----------GGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-CC-T-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117280                     :                                                                                                                                                                                                             TT--------------A-G--T-ACCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-G------T-G--TGG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----C----A----A--C-------TGTGCC-C-----TAT-TTTTAtccatggattcttttacccaatagacattttagtacctgggtccataatatgtgtgggcatatcatgtaccggttcaactgtgccctattttta
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gi|117295                     :                                                                                                                                                                                    catgtacatgttagatgctgatgatTT--------------A-AG-T-CCTTGG--CC---A--TA--A------A-A----A-A------A-G--CGG--C-G-T-A-T--C-A----TGTGCATGTAC-TG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-CAA---TAT-TTT
gi|117296                     :                                                                                                                                                                                                           atTT--------------A-GG-G-CCCTGGGTCAG--A--TA--AA-----T-G----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117297                     :                                                                                                                                                                                                                             t-GG-C-CCCTGGGTCCCAAG--TA--A------T-A----T--------T-G--CGGAGC-G-T-A-A--C-A----TGT------AC-TGTGG---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117298                     :                                                                                                                                                                                                         tttaag--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-T--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117299                     :                                                                                                                                                                                                          ttaTT--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117315                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTATGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117316                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGGGTCA---A--CA--A------T-A----T-A------T-G--TGG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117317                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCAGGGTCA---A--TA--A------T-A----T----------G--TGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117318                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTGTGTCA---A--TA--G------T-G----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTT
gi|117319                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTGGAGCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------GATGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117320                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGCGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GCTGCC-C-----AAT-
gi|117321                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGG-TCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GT-G-T-A-C--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TATATTTT
gi|117322                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGTGTCA---A---A--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GCCG-TTA-T--C-A-----GT------AC-CG--G---------CCT----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117323                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGTGTC--------A--A------T-A----T-A------T-G--TTG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTACC-C-----TAT-TTTT
gi|117324                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTG--TTC---A--TA---------T-AC---T-T------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-AA---TGT------AC-CG--GG--------C-TAGTGT----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TT
gi|117325                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGGTCC------TA--A------T-A----T-A------T-G--TAG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--CGCCG---GGTGCT-C-----TAT-TTTTA
gi|117326                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CAG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G-----------T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117327                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------AGTGTC-C-----TAT-TTTT
gi|117328                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TG--A------T-A----T-A------T-G--TGG-AC-G-T-A-T--C-A----TGC------AC-CG--GT--------T-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTCA
gi|117329                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----TCACCGTTTTG--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117330                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----T----C----A--CTTTTGTGGGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117331                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A--------------------G-GC-G-T-A-TATC-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----A--C-------TATGCC-C-----TA
gi|117332                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                          -G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----T----G----G--C-------GGTGCC-G-----TAT-TTTT
gi|117333                     :                                                                                                                                                                                                                                                                           cacaatatttGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----A--C-------GGTGCC-C-----


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blockSeqs                     :                                                                                       . T  T      CTA       G        GG     TT            A     . GATTC     A         .        TT       .   GTT        GAC    .              G    .          .   .      G        C      CATGTA T      .  . . T   .    C      .       .     T         . .    .    .    .  .              T    
blockSeqs                     :                                                                                       . C  C      CTA       T        GG     G             A     . TCTTC     A         .        TT       .   GTT        GG     .              .    .          .   .      A        .      CATGTA .      .  . . .   .    A      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  T      ATA       T        AG     G             A     . TCTTC     A         .        TA       .   GTT        GG     .              .    .          .   .      .        .      AAA    .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      GCG       G        GG     A             A     . TCTTC     A         .        TG       .   GTT        GG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      AGA       G        GG     T             A     . TCTTC     A         .        TA       .   GTT        GG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      ATG       G        AG     T             A     . TCTTT     A         .        TA       .   GTT        GG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      AGG       G        GG     T             A     . TCTTC     C         .        GA       .   TTT        GG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . G  G      AGA       G        AG     T             A     . .         .         .        TT       .   AT         TG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . T  G      AGG       G        G      T             .     . .         .         .        AA       .   GT         GG     .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      AGG       G        G      T             .     . .         .         .        .        .   G          G      .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . C  T      AGC       T        G      T                                                  .        .   .          G      .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                       . A  G      GTT       G        T      G                                                               .          G      .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                             T        G      G                                                               .          .      .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                              .    .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                   .          .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .      .        .      .      .      .  . . .   .    .      .       .     .         . .    .    .    .  .              .    
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|117267                     :                                                                                                                                                                                                                                                      --A------T-A----T-A------T-G--CAG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------GT-CA--T---------T-T----T----G----G--T-------TGTGCC-C-----TAT-CTtccatggattttttcctaatacacattaaaatcccttgtatatatgcaggcgtatcatgtgtcattttggttgtgccctatct
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gi|117269                     :                                                                                                                                                                                                                                        ttGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GT-A-T-A-T--C-A----TGC------AC-CG--GTTTGCATGAT-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TGT-TTTTAttcattgaattttttccccgatagacattgaagtccataatatatgcgggtatatcatgcaccggtttgcatgatttggcggtgccctgttttta
gi|117270                     : ttttttatcaatgagttataaccctttggctaagatttataatgcaaaatttcattgaattttttccccgatagacattgaaTTTT-TAAAAAGAGTT-GCGGCCCTT-G-CATTTA-T--TTTT--TTATCCAAAATA-TTTT-G-----------------------AATTTT--TT-CCCC-TAT-A-T------AGATATTT--------------A-AG-T-CCTTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GC-G-T-A-T--T-A----TGT------AC-CA--G---------T-T----G----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117271                     :                                                                                  tTTTT-TAAAG-GAGTT-AGAGCCCTT-G-GACTTA-GGATTTT--CTATGCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTAATCCT--TTACTTC-GAG-G-TTTTTAAAGG-AGTT--------------A-GT-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------AGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117272                     :                                                                                   TTTT-TAAAG-GAGTT-ATGGCCCTT-G-GACTTA-GGTTTTT--CTATTCAAAATA-CTTT-GTCT--TC-GC-AACTCCTCC-TTATTCCT--TAATTCC-GAT-G-TTTTTAAA-G-AGTT--------------AGGG-T-TCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
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gi|117275                     :                                                                                  tTTTT-TGAAG-GAGTT-AGGGCCCTT-G-GACTTA-GGTTTTT--CTATGCAAAATA-CTTT-GTCT--TT-GC-AACTCCTCC-TTAATCCT--TAACTCC-AAT-G-TTTTTAAAGG-AGTT--------------A----------GGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-CC-T-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117280                     :                                                                                                                                                                                                             TT--------------A-G--T-ACCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-G------T-G--TGG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----C----A----A--C-------TGTGCC-C-----TAT-TTTTAtccatggattcttttacccaatagacattttagtacctgggtccataatatgtgtgggcatatcatgtaccggttcaactgtgccctattttta
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gi|117294                     :                                                                                                                                                                                                                    gattgttatcccgatgaacatGGTCC---A--TA--A------TGA----A-A------T-A--CAG-GC-T-T-A-T--TTA----TTT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117295                     :                                                                                                                                                                                    catgtacatgttagatgctgatgatTT--------------A-AG-T-CCTTGG--CC---A--TA--A------A-A----A-A------A-G--CGG--C-G-T-A-T--C-A----TGTGCATGTAC-TG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-CAA---TAT-TTT
gi|117296                     :                                                                                                                                                                                                           atTT--------------A-GG-G-CCCTGGGTCAG--A--TA--AA-----T-G----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117297                     :                                                                                                                                                                                                                             t-GG-C-CCCTGGGTCCCAAG--TA--A------T-A----T--------T-G--CGGAGC-G-T-A-A--C-A----TGT------AC-TGTGG---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117299                     :                                                                                                                                                                                                          ttaTT--------------A-GG-T-CCCTGGGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117310                     :                                                                                                                                                                                                                                 -T-CCCAGGGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-T--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-----G---------CTT----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
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gi|117314                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGTGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117315                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTATGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117316                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGGGTCA---A--CA--A------T-A----T-A------T-G--TGG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117317                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCAGGGTCA---A--TA--A------T-A----T----------G--TGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117318                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTGTGTCA---A--TA--G------T-G----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTT
gi|117319                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CTCTGGAGCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------GATGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117320                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGCGTCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----G--C-------GCTGCC-C-----AAT-
gi|117321                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGG-TCA---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CAG-GT-G-T-A-C--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TATATTTT
gi|117322                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGTGTCA---A---A--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GCCG-TTA-T--C-A-----GT------AC-CG--G---------CCT----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117323                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTGTGTC--------A--A------T-A----T-A------T-G--TTG-GT-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CA--G---------C-T----T----A----G--C-------GGTACC-C-----TAT-TTTT
gi|117324                     :                                                                                                                                                                                                                                   -CCCTG--TTC---A--TA---------T-AC---T-T------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-AA---TGT------AC-CG--GG--------C-TAGTGT----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TT
gi|117325                     :                                                                                                                                                                                                                                        GGGTCC------TA--A------T-A----T-A------T-G--TAG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--CGCCG---GGTGCT-C-----TAT-TTTTA
gi|117326                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CAG-GC-A-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G-----------T----T----G----G--C-------GGTGCC-C-----TAT-TTTT
gi|117327                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-A------T-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----G--C-------AGTGTC-C-----TAT-TTTT
gi|117328                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TG--A------T-A----T-A------T-G--TGG-AC-G-T-A-T--C-A----TGC------AC-CG--GT--------T-T----T----G----G--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTCA
gi|117329                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----TCACCGTTTTG--T-------GGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117330                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A----T-ACATGTAT-G--CGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----T----C----A--CTTTTGTGGGTGCC-C-----TAT-TTTTA
gi|117331                     :                                                                                                                                                                                                                                         GGTCC---A--TA--A------T-A--------------------G-GC-G-T-A-TATC-A----TGT------AC-CG--G---------T-T----T----G----A--C-------TATGCC-C-----TA
gi|117332                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                          -G-T-A-T--C-A----TGT------AC-TG--G---------T-T----T----G----G--C-------GGTGCC-G-----TAT-TTTT
gi|117333                     :                                                                                                                                                                                                                                                                           cacaatatttGG-GC-G-T-A-T--C-A----TGT------AC-CG--G---------C-T----T----G----A--C-------GGTGCC-C-----
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|117278 ): TTTTTAAACAAGTTGTAACACTTTAAATTAGATTTGTTTTGTAAAATTCCATGGAT