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Reference ( gi|116606 ) : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-T--C-C-A-T-T--G-A-T-C--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--T-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116679 : AT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A----C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A--------------------------------------------A--T---G--T--A--G-----------------A-G------T-----G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAA-G---T-T-C-C--G--A-T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116643 : AT-ATTA-----TA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T-------------A---G-A--C-T-A-C---TT-CCTTCT-------G--GT--------T-T-A--T-C-T-TA--G--AA-G----T-A-T-----GG-T---T---T---T-T-TT-----------CCAA-TGA---T-A--TTCAG--T-----G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----T----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G----A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116613 : aaaaagt-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TC-G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A------T-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--------------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--C--G-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116609 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-ATA-C---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GG--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T-------T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------TGG------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--TGA-G---T-C-C-C--G--A-T--T-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116615 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-C--ACA-G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T----------T---G--T--A--G-----------------T-G------G-----G------------T---G--C---------C----------------T-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-CT-G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116616 : aaaga-ATTA--T-ATA-C---A-T--AA-----T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-AAT-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------TA-A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-A-A---G-T-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116612 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--T-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-AT-----------A--T-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------TGG------T-----G------------C---C--C---------CT---------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---TCC-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116668 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A-----A--C-A-A-----TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--ATT-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T-----G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--GAAT-T--A-GC-G---A-CA-G-TTTAC-T-A-GTT
gi|116618 : a-ATTA--T-ATA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-G-T--G-A-T-G--A---ATA--C-AGA-C---TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TG--T---G---T-G--T-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-TAGA-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116621 : aaaga-ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-C--C-C-A-T-T--G-T-T-T--G---A-A--C-A-A-C---TT-C----T-----------T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-AT-----------A--A-------T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G----T--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116620 : aaaga-ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-A--C-C-C-T-T--G-T-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------T--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TC--T---G---T-G-GA-----------T--A-A-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116651 : aaaga-ATTAT-A-ATA-C-T-A-TTAA------TG-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---GGA--C-A---C---TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T---TT--G---T-G-T---------------A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-CGC-C--G--A-T--A-G--G---AGCA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116623 : aaga-ATTA--T-ATA-C-C-T-T--A------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-AT-----------A--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------------G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T---T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G------A-A-TT--C-T-A-GTT
gi|116625 : aaaga-ATTAT-G-ATA-CGT-A-TT-A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-C-T--A---G-A--CGA-A-C---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T--A--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TC--T---G---TGG-TT-----------C--A-T-----T-AT-T---G--T--A--G-----------------T-GAT----T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------G----G----------T-A-T------G---T-C-C-C--GA-G-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116622 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT------T-------A--TT----------A-A--T-CCT-GA--G--AA-ATGA-T-C-------G--T---T---G---T-G-TT-----------A--A-TA----T-G--T---A--T--A--G-----------------T-G------C------------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-A-G---T-T-C-C--A--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116627 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T---T--A------T----A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------T--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----GT-T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-------------------------------------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-T-TT--C-T-A-GTT
gi|116634 : aaaga-ATTA--T-ATA-T-A-A-T--A------T--T-A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C------------G--TT--------C-A----T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---GT--T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--A--G--G-----------------T--------T-----G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-C--T-A-G---T-
gi|116636 : aaaga-ATTA--A--TA-C-T---T--A------T--T-A-C--C-C-A-T----G-A-T-T--AA--G-A--C-A-A-C---GT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT--------------A-G-----T-A--G---T--T--A--G-----------------T-G------T-----G----------------C--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---A-C-C-C--G--A-T--A-G--
gi|116635 : aaaga-ATTA--T-ATA---T-A-T--AATAG--T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-GTGA---GCA--C-A-AAC---TT-T----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TA--T---GC--T-G-TT--------------A-T-----T-A--T---G--G--T--G-----------------T-GT-----T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T---G---T-C-C-G--A--T-A--G-G--G---A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
gi|116666 : aaggaTA--ATATA-C-T-AAT--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--G---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---TAC-C-C--A----A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116681 : aaTA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------T---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-A--T-A-G---T-C-C-C--G--A-A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116683 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A----C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A---C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T---T-GA--G--AA-A--A-T-G-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116667 : TA--ATATA-C-T-A-C--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-T---TT-C----T----------TT--------T-A----T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T---T---T---T-G-TT-----------C--A-G-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------T---C--C---------CTGG-------------G-G-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-
gi|116685 : aaTA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---A-A--C-A-AAC---TT-C----T-------G--TT--------T-G-G--T-C-T-G---G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TTCTGA-------C--A-T-----T-A--T------------G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------T----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------TAA-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-A--A-G--G---ACCA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116670 : TA--ATATA-C-T-A-T------------T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TC--------------G--GT--------T-A-A--T-----GA--G--AA-A--A-T------------------------T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T------T--A--G-----------------T-G------TT----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-T-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116682 : aaTA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-G--C-C-C-T-T--G-A-T-T--A---G-AG-C-A-A-----TT-C----T-------G--TT--------T-G----T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GG-T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G----------------T--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--A--A-A--A-G--G---A-CATG-TT--C-T-A-GTT
gi|116674 : TA--ACATA-C-T-T-C--A------T--T-A----C-C-A-T-T--G-ACT-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T--------T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--A--A--G-----------------T-G------T-----G------------T---C--C---------CGCACAGGCGGGAGGGGG-C-G-----G-G---G--------A----G----------T---T--T-A-T---T-C-C-C--G--A-T--A-AGTG---A-CA-T-GT--C-T-A-GCT
gi|116686 : aaTA--A-ACA-----A-T--A------T--T-AAC--C-C-A-T-T--G-A-TGT--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-AAA-G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-AT-T---A--T--A--G-----------------T-G------T-----C------------C---C--C---------T----------------G-G-G-----G-G---G--------
gi|116676 : TA--ACATG-C-T-A-T--A------T--T-A-A--C-A-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-T---GT-T----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-TCAA--G--AA-A--G-T---T-----G--T---T---T---T-G-TT-----------C--A-T-----A-A--T---A--T--A--A-----------------T-G------T-----G------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GA---G----------T-A-T--T-A-A---T-C-
gi|116677 : TA--ACATG-C-T-A-T--A------T--A-A-C--T-A-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-T---GT-T----T-------G--TT----------A-A--T-T-C-AA--G--AA-A--G-T---T-----G--T---T---T---T-G-T------------C--A-T-----A-A--T---A--T--A--------------------T-G------T-----G------------G---C--C--------------------------G-C-G-----G-G---G--------G----A----------T-A-T--T-A-A---T-C-C-A--A-------A-G--G------A-G-TC--C-T-A-GTT
gi|116631 : A--A-ATG-A-T-A-T--A------T--T-A-TA-C-T-A-GAT--G-A-C-C--AATAG-A--C-A-T-C---TT-CATTCT-------GGTTT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT---T---A---T-T-TG-----------C--A-T-----T-A--T---A--A--ATTG-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G------------------------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116653 : aaa--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TTGG-A-T-T--A---C-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--TCC-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--T-----------------C-G------T-----G------------CCG-C--C---------C----------------G-C-G-----GCGAGTG--------G----GTATTAGTT--T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116649 : aagaat-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-T--C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT------------A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T-------T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C------------------C-G-----C-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116684 : aaagatatgt-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-G--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TTAACTTCGTT-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G--T-----------C--ATT-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G-------------------C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GC---G----------T-A-T--T-A-G---T-C-CTC--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-ATGTT
gi|116678 : t-ATA-C-TTA-T--A------T--TTA-C--T-C-A-T----G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----C-C-T-----A--T-------G---T-G-TTT----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-A-G---T-C-C-C--G--A-T--A----G---C-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116632 : aat-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T-------------A---G-A--C-ATA-A---TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT---T---A---T-T-TC-----------C--A-T-----T-A--T---A--A--ATTG-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-A-G---T-C-C-C--G--A-A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116673 : agaaaatgatgcatt-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A----C-C-A-T-TT-G-A-T-C--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----G--T---T---A---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---A--C--A--G-----------------T-G------C-----ATCACCCCCCCCCC---C--C---------C----------------ACC-GGGGGTG-G---G--------G----G----------T-A-T--C-A-G---A-C-C-C--A--A-A--A-G--A---A-CA-G-TT--T-T-A-GTT
gi|116629 : aatagtTA-C-T-A-T--A------T--TGA-C--C-C-A-T-T--G-A-T----A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T---T-----G--T---TTTTG---T---TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--C---------G----------------G-G-G-----G-G---G--------G----GGGGGGGGGGTT-A-T--T-A-G---T-C-C-C--C--G-T--A-G--G---A-CA-G--T--C-T-A-GTT
gi|116638 : aaagaattatTA-C-T-A-T--AA-----T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-CT-A---G-A--C-G-A-CG--TTAC----T-------G--TT------------A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------CT-A-T-----TCAC-T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------G---T--C---------C----------------G-C-------------T--------G----G----------T-A-T--TCA-G---T---C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-
gi|116637 : aaaaattatttTA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T----G---G-A--C-A-A-T---TA-C----T-------G--TT--------TGA-A--T-A-T-GA--A--AATA--A-T-CGT-----GATT---T---G---T-G-TT-----------CA-A-T-----T-A--TG--G--T--A--G-----------------T-G------TG----G------------C---C--CGA-------C----------------G-C-G-----C-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T-CTC-C--G--A-A--A-GT-G---A-CA-GTTT--C-T-A-G
gi|116633 : agaaaatatatggA-C-T-A-T--A------T--T-A----C-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G----C-A-A-C---T--C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-TAC-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------A--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-A-G---T-----C--G--A-T--A----G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116687 : aaaaaattatgtaA-T-T-A-T--A------T----A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-CT---T-------G--TT--------T-A-AATC-C-T-GA--G--AA-A--A-T-CTT-----G--T---T---GTTCT-G-TA-----------A--A-T-----T-A--TTG-A--T--AC-G-----------------T-G------G-----G------------TGAACGAC---------C----------------G-C-GT----G-A---G--------G----G----------T-GTT--T-A-G---T-C-C-C--G--A-T--AGG--G---A-CATG-TT--C-T-A-GT
gi|116688 : -C-T-A-T--A------A--T-A-C--C-C-A-TGT--GGA-T-T--A---G-A--C-A-C-C---TT------T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--G--GA-A----T-CGT-----G--T---TT--G---T-G-TT-----------C--G-T-----TTA--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------C---C--T---------C----------------A-C-G-----G-G---A--------T----G----------C-A-T--CAA-G---T-C-C-C--A--A-T--A-G--GAACA-TA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116689 : -T-A-T--A------T--T-A----C-C-A-T-T--G-A-G-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T-----G-----------------T-G------T-----G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-A-G---T---C-C--G--A-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116672 : --A------T--T-A-TACC-C-A-T-T--G-A-T-T--A---G-A--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T---T---G---T-G-TT-----------C--A-T-----T-A--T---G--T--A--G-----------------T-G------T-----G----------------C--C---------C----------------A-A-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T---G---T-C-C------------A-A--G-----CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116692 : aacaata-A-T-T--G-A-T-T--A---G-T--C-A-A-C---TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--A-T-C--------------T---G---T-G-TC-----------C--A-T-----T-A--T---T--T--A--G-----------------T-G------T-----G------------T---C--C---------T----------------G-C-G-----G-
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Alignments
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Reference ( family-274 ) : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116611 : AAAGAAT-AATA--T-ATA-C-T-A-T--AGTTGCAT--T-A-C--C-C-A-T-T--G-AAT-T-A--G-A--C-A---C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T-------T-G-T-T-----------T--C-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-GG-----T-G------------C---C--C--------------------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T-C-C-C--G-A--T--A-G--GA--A-CC-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116612 : -ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--T-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--T-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------TGG------T-G------------C---C--C---------CT---------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---TCC-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116613 : aaaga-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TC-G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A------T-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A-----------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--C-G--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116614 : aaagaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A----------------------------------A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------T--G-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-GCATGTGT-G------------C---C--C---------C----------------A-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-A--G-A--C--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116615 : -ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-C-ACAG-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----------------------------T---G--T--A--G--------------T-G------G-G------------T---G--C---------C----------------T-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-CT-G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116616 : aaaga-ATTA--T-ATA-CAT-A----A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-AAT-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------TA-A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-AA---G-T-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116617 : aaagaAAAGAAT-A--A--G-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-AAT-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T-----G--T-T-------T-GTT-T-----------C--A-T-----T-----------------AC----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--TGAA-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116618 : -ATTA--T-ATA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-G-T--G-A-T-G-A--ATA--C-AGA-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G----T---G---T-G-TGT-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--TAGA-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116619 : aaagaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T---------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--GA-AA-A--A-T-T-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-GGC----------C---C--C---------C----------------G-G-G-----G-G---G--------GTACCG----------T-A-T--T-AG---T-C-C-CG-G-A--T--A-G--GA--A-CAGG-TT--T-T-G-ATT
gi|116620 : -ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-A--C-C-C-T-T--G-T-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---T-G-G-A-----------T--A-A-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116621 : aaaga-ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-C--C-C-A-T-T--G-T-T-T-G--A-A--C-A-A-C-TT-C----T-----------T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--A-------T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G----T--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116622 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT------T-------A--TT----------A-A--T-CCT-GA--G--AA-ATGA-T-C-------G--T-T---G---T-G-T-T-----------A--A-TA----T-----------------G-----T---A--T--A--G--------------T-G------C--------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--A-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116623 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-C-T-T--A------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G--------G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T---T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-A-TT--C-T-A-GTT
gi|116624 : aaagaAAACAATGAT------ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--T-A-T-T-G--G-A--G-A-A-C-TT-T----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--A---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-AC---T-C-G-C--G-A--A--A-G--G---A-
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gi|116626 : aaagaAAC-ACTA--ATATA-C-T-T-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-CTTT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-C-C-C-----G--T-T-------T-G-T-T-----------C--A-T-----T------------------------------T--A----------------------------C------------C---C--C---------C----------------G-CGG-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--GAA--A--A-G--G---A-CA-G-TT--CAT-A-GTT
gi|116627 : a-ATTA--T-ATA-C-T---T--A------T----A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----GT-T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T---------------------------------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-T-TT--C-T-A-GTT
gi|116628 : aaagaAAAGAAT--TTA--T-ATA-C-T-G-T--A------T----A-C--C-C-A-T----G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-A-CT-C----T-------GT-TT--------T-A-A--T-C-T-GA-----AA-A--A-T-C-TGTG--G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----C-----------------------T---G--T--T--G--------------T-G------T-A------------C---C--C---------C----------------A-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--ACG--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116629 : TA-C-T-A-T--A------T--TGA-C--C-C-A-T-T--G-A-T---A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T---T-----G--T-TTTTG---T---T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------G----------------G-G-G-----G-G---G--------G----GGGGGGGGGGTT-A-T--T-AG---T-C-C-C--C-G--T--A-G--G---A-CA-G--T--C-T-A-GTT
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gi|116631 : AT-ATTA-----TA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-A-T-C-TT-CATTCT-------GGTTT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-G-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G------------------------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116632 : aaaaaatgat-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-ATA-A-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116633 : agaaaatgatgcattA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G----C-A-A-C-T--C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-TAC-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------A--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-AG---T-----C--G-A--T--A----G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116634 : aaaaaattatgta-ATTA--T-ATA-T-A-A-T--A------T--T-A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C------------G--TT--------C-A----T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---GT--T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--A--G--G--------------T--------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-C--T-AG---T-
gi|116635 : aaaga-ATTA--T-ATA---T-A-T--AATAG--T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-TGTGA--GCA--C-A-AAC-TT-T----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TAT---GC--T-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G--G--T--G--------------T-GT-----T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T---C-C--G-A--T--AGG--G---A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
gi|116636 : aagga-ATTA--A--TA-C-T---T--A------T--T-A-C--C-C-A-T----G-A-T-T-AA-G-A--C-A-A-C-GT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T--------------A-G-----T-----------------A-----G---T--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C--------------------------G-C-G-----G-G---G------------------------T-A-T--T-AG---A-C-C-C--G-A--T--A-G--
gi|116637 : aaagaTA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A---T-G--G-A--C-A-A-T-TA-C----T-------G--TT--------TGA-A--T-A-T-GA--A--AATA--A-T-CGT-----GATT-T---G---T-G-T-T-----------CA-A-T-----T-----------------A-----TG--G--T--A--G--------------T-G------TGG------------C---C--CGA-------C----------------G-C-G-----C-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-CTC-C--G-A--A--A-GT-G---A-CA-GTTT--C-T-A-G
gi|116638 : agaaaatatatggTA-C-T-A-T--AA-----T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-TCT-A--G-A--C-G-A-CGTTAC----T-------G--TT------------A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------CT-A-T-----TC----------------AC----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------G---T--C---------C----------------G-C-------------T--------G----G----------T-A-T--TCAG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-
gi|116639 : aaaaattattt-T-A--G-A--C-A-C-C-TT-CAT--TCGG----G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--T-T-C-TTGG--G--T-T-------T-G-T-TTCCCCCCCCC-C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--T--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CA-C-TT--C-T-A-GTT
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gi|116641 : aagaaatgatattttattagatgacaaaAAT-ATTACTA-ATA----------G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T---A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--CT--------T-A-AA-T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GA-T-G---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---G--T--A--G----------------G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---GGGGCGGGGG----GTGTT------T-A-T--T-A----T-C-A-C--A-G--A--A-G--G---A-CA---TT--C-T-A-GTT
gi|116642 : agaaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-------------------------------------T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------G--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------
gi|116643 : AT-ATTA-----TA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-T-A-C-TT-CCTTCT-------G--GT--------T-T-A--T-C-T-TA--G--AA-GT-A-T-G-------G--T-T---T---T-T-T-T-----------CCAA-TGA---T-----------------A-----TTCAG--T-----G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------T---------------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A-----A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116644 : aaaaagtAAAGAAT-AATA--A--TA-C-T-A-T--A------C--TCA-C--C-T-A-T----G-A-T-T-A--C-A--C-A-A---TT-C----T-------G--AT--------T-ATA--T-C-T-GG--A--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------T--G-T-----C-----------------ATC---T---G--TA-A--G--------------T-G------T-G------------C---C--CGT-------C----------------T-G-G-----G-G---G--------G----G----------T-A----T-AGGGTT-C-C-C--G-
gi|116645 : -A--C-A-T-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-TGG---G--T-T---A---T-T-T-C-----------C--A-------T-----------------A-----T---G--T--A--T--------------T-G------T-G------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---A--------G----G----------TAA-T--T-AG---T-G-C-C--G-A--A--G-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-TTT
gi|116646 : aaaaaatgaattataagatgaccaaagaAAATGAT-ATTA-----TA-C-T-A-G--G------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--A-A-A-C-TT-CATTCT-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGTT-T---T---T-T-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----
gi|116647 : aaaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--CAA-A-T-TT-C----T-------
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gi|116651 : -ATTAT-A-ATA-C-T-A-TTAA------TG-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--GGA--C-A---C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-TT--G---T-G-T----------------A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-CGC-C--G-A--T--A-G--G---AGCA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116652 : aagaAAGAAT-AATA--A-----C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-ATT-T--G-A-T-T-A--C-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------CA-A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116653 : --A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TTGG-A-T-T-A--C-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--TCC-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--T--------------C-G------T-G------------CCG-C--C---------C----------------G-C-G-----GCGAGTG--------G----GTATTAGTT--T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116654 : aagaatAACAAT-G-------ATATC-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-AAT-T--G-A-T-T-A--G-AACC-A-A-C-TT-A----T-------A--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-GC-----T-G------------C---C--C---------C------------------C-GC----G-G---G--------G----G----------T-A-A--T-AG---G-T-C-C--A-A-----A-G--G---A-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116655 : AACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------TGTT-A-C--T-C-A-T----G-A-TGT-A--G-A--T-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--A--AG-AT-A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G---T-----------C--A-T-----TC----------------A-----T---G--T--A--A--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-GA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116656 : -A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--TTG-------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T--------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------T----G----------T-A-T--T-CG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116657 : aacaataatatact-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-C-----G--T-T---T---T-T-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATAG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------A---------------T-A-T--T-GG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116658 : aacaataatatactAAATGAT-ATTG--A-A---C-T-A-GG-A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-A-A-C-TT-CATTCT-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--G-T-C-T-----T--T-T---TC--T-C-C-C-----------C--A-T-----T------------------------------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116662 : AAAAAT-AT------ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C------------A-G-T-A--G-A--C-A-----TT-C----T-------G--GT--------T-A-AA-T-C-T-GA--G--GA-A--C-G-C-T-----G--T-C---T---T-T-T-TTCC--------C--A-T-----G-----------------A-----T---A--C--T--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----C-G---G--------G---------------T-A-T--T-TG---T-C-C-C--G-A--A--C-G--G---A-CA-G-TT--C-
gi|116663 : AAA-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------TC-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--GAA--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---C-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G--TA-A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C------------------C-GC----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AT---C-C-C-C--G-A--T--A-G--GA--A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
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gi|116667 : aaTA--ATATA-C-T-A-C--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-TT-C----T----------TT--------T-A----T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-G-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CTGG-------------G-G-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-
gi|116668 : aa-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A----A--C-A-A---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--ATT-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-AATT--A-GC-G---A-CA-G-TTTAC-T-A-GTT
gi|116669 : aAAT-AATA--A-GTA-C-T-C-T--A------C--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G--------A-C-TT-C----T-------G--TTAAC-----T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--C-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--G-T-A-GTT
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gi|116671 : aaACTAT-ATT------TA---T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----------------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116673 : aacaataatta-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-T-T-T--G-A-T-C-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--C--A--G--------------T-G------C-ATCACCCCCCCCCC---C--C---------C----------------ACC-GGGGGTG-G---G--------G----G----------T-A-T--C-AG---A-C-C-C--A-A--A--A-G--A---A-CA-G-TT--T-T-A-GTT
gi|116674 : aatagtTA--ACATA-C-T-T-C--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-ACT-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T--------T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--A--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CGCACAGGCGGGAGGGGG-C-G-----G-G---G--------A----G----------T---T--T-AT---T-C-C-C--G-A--T--A-AGTG---A-CA-T-GT--C-T-A-GCT
gi|116675 : aaAAT-AT------ATA-A-C-G-T--A------T--G-A-T--T-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT------T-------G--TT--------A-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G-----G-TGT-----------A--G-T-----T-----------------A-----A---T--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-T-------G-G---G--------A----G----------T-ATT--T-AG---TAC-C-A--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-G
gi|116676 : agtTA--ACATG-C-T-A-T--A------T--T-A-A--C-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-TCAA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A--A--------------T-G------T-G------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GA---G----------T-A-T--T-AA---T-C-
gi|116677 : TA--ACATG-C-T-A-T--A------T--A-A-C--T-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------G---T--------T-A-A--T-T-C-AA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G---T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A-----------------T-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----A----------T-A-T--T-AA---T-C-C------A--A--A-G--G------A-G-TC--C-T-A-GTT
gi|116678 : -ATA-C-TTA-T--A------T--TTA-C--T-C-A-T----G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----C-C-T-----A--T-----G---T-G-T-TT----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-AG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---C-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116679 : aatAT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116680 : AT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116681 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-A--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116682 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-G--C-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-AG-C-A-A---TT-C----T-------G--TT--------T-G----T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GG-T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------T--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CATG-TT--C-T-A-GTT
gi|116683 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A---C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T---T-GA--G--AA-A--A-T-G-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116684 : -ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-G--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TTAACTTCGTT-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G---T-----------C--ATT-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G-------------------C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GC---G----------T-A-T--T-AG---T-C-CTC--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-ATGTT
gi|116685 : tTA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--A-A--CAA-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-G-G--T-C-T-G---G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-TCTGA-------C--A-T-----T-----------------A-----T------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---ACCA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116686 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-AAC--C-C-A-T-T--G-A-TGT-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-AAA-G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------AT----T---A--T--A--G--------------T-G------T-C------------C---C--C---------T----------------G-G-G-----G-G---G--------
gi|116687 : A-T-T-A-T--A------T----A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-CT---T-------G--TT--------T-A-AATC-C-T-GA--G--AA-A--A-T-CTT-----G--T-T---GTTCT-G-T-A-----------A--A-T-----T-----------------A-----TTG-A--T--AC-G--------------T-G------G-G------------TGAACGAC---------C----------------G-C-GT----G-A---G--------G----G----------T-GTT--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--AGG--G---A-CATG-TT--C-T-A-GT
gi|116688 : -C-T-A-T--A------A--T-A-C--C-C-A-TGT--GGA-T-T-A--G-A--C-A-C-C-TT------T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--G--GA-A----T-CGT-----G--T-TT--G---T-G-T-T-----------C--G-T-----TT----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--T---------C----------------A-C-G-----G-G---A--------T----G----------C-A-T--CAAG---T-C-C-C--A-A--T--A-G--GAACA-TA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116689 : -T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-G-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116690 : -A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--T-A--C-A-A-CTTT-C----C-------GC-TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A---C-T-----T--T-T---G---T-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G-----A--G--------------T-G------T--------------C---G--C---------C----------------T-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A----T-AG---T-C-T-T--G-A--A--A-G--G---A-CA-G--T--C-T-A-G
gi|116691 : -A-T-T--G-A-T-T-G--G-A--C-A-A-T-TT-T----TAATTCTGG--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-TGG---G--T-T---A---T-T-T-TC----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATTG--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------A----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-CCGA-A--A--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
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gi|116693 : -A-A-C-TTTC----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-TTGA--GGAAA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---T-G-T-------------C--A-TA----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-T------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---GT-------T----A----------T-A-TTAT-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA----T--C-T-A-GTT
gi|116694 : -TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----TCTGTAAGAAGTAGGTACAGTTTCT---G--T--A--A--------------T-T------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-A--G-A--A--A-G--G---A-CG-GTTT--C-T-A-GTT
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gi|116696 : tttccactgtgggc--------T-A-A--T-C-T-GAA-G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116697 : tta--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--AGT-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-C-----------C--A-T-----C-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C------------------C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A-----A-A--G---A-C--G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116699 : T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---A-C--G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116701 : -C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----A--T-T---G---T-G-T-T-----------C--G-T-----T-----------------A-----T---T--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--G-A--C--A-G--G---A-CA-A-TT--C-T-A-GTT
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gi|116704 : tgcct------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116706 : --------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-CT--C-T-A-GT
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lowQualScore : 5 5 2222 5 1 5 5 33 666666 88 5 5 77 555 5 5 22 5 5 9 5 11 9 11 4 4 5 4 9 3333 5555555 22 3333333333 4 55 4 4 9 55 00 4 44 7 8 3 44444 22 7 7777777 4 8 8 88888888888 66 4 44444 11111111111111111 22222 777 11 44 88 44444444444444 2 000000 8 7777777777777777 66 888888888 8888888888888888 4 7777777 4 777 99999999 7777 3333333333 3 8 66 5 777 3 9 4 55 4 11111 3 55 111 9 3 1 66 4 3 5
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Reference ( family-274 ) : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116606 : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-T--C-C-A-T-T--G-A-T-C-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-T--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116623 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-C-T-T--A------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G--------G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T---T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-A-TT--C-T-A-GTT
gi|116624 : aaagaAAACAATGAT------ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--T-A-T-T-G--G-A--G-A-A-C-TT-T----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--A---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-AC---T-C-G-C--G-A--A--A-G--G---A-
gi|116625 : -ATTAT-G-ATA-CGT-A-TT-A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-C-T-A--G-A--CGA-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T--A--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---TGG-T-T-----------C--A-T-----T-----------------AT----T---G--T--A--G--------------T-GAT----T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------G----G----------T-A-T-----G---T-C-C-C--G-AG-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116626 : aaagaAAC-ACTA--ATATA-C-T-T-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-CTTT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-C-C-C-----G--T-T-------T-G-T-T-----------C--A-T-----T------------------------------T--A----------------------------C------------C---C--C---------C----------------G-CGG-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--GAA--A--A-G--G---A-CA-G-TT--CAT-A-GTT
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gi|116630 : aaagaattatAAACAAT-AATA--T-ATA---T-A-TG-A------T--T-A-C--C-CGA-T-A--G-A-T-A-G--A-A--C-A-----TT-CATG-T-------A--TT--------T-A-G--T-C-T-GA------A-A--A-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----------------------A-----T---G--A--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---C--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A-----A-A--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116632 : aaaaaatgat-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-ATA-A-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116651 : -ATTAT-A-ATA-C-T-A-TTAA------TG-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--GGA--C-A---C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-TT--G---T-G-T----------------A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-CGC-C--G-A--T--A-G--G---AGCA-G-TT--C-TAA-GTT
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gi|116653 : --A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TTGG-A-T-T-A--C-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--TCC-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--T--------------C-G------T-G------------CCG-C--C---------C----------------G-C-G-----GCGAGTG--------G----GTATTAGTT--T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116655 : AACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------TGTT-A-C--T-C-A-T----G-A-TGT-A--G-A--T-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--A--AG-AT-A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G---T-----------C--A-T-----TC----------------A-----T---G--T--A--A--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-GA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116656 : -A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--TTG-------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T--------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------T----G----------T-A-T--T-CG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116657 : aacaataatatact-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-C-----G--T-T---T---T-T-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATAG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------A---------------T-A-T--T-GG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116658 : aacaataatatactAAATGAT-ATTG--A-A---C-T-A-GG-A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-A-A-C-TT-CATTCT-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--G-T-C-T-----T--T-T---TC--T-C-C-C-----------C--A-T-----T------------------------------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116659 : aa-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-CATTCT-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----T--T-T---TC--T-C-C-C-----------C--A-T-----T------------------------------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116662 : AAAAAT-AT------ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C------------A-G-T-A--G-A--C-A-----TT-C----T-------G--GT--------T-A-AA-T-C-T-GA--G--GA-A--C-G-C-T-----G--T-C---T---T-T-T-TTCC--------C--A-T-----G-----------------A-----T---A--C--T--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----C-G---G--------G---------------T-A-T--T-TG---T-C-C-C--G-A--A--C-G--G---A-CA-G-TT--C-
gi|116663 : AAA-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------TC-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--GAA--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---C-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G--TA-A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C------------------C-GC----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AT---C-C-C-C--G-A--T--A-G--GA--A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
gi|116664 : AACAAT-ATTA--TTATA-T-T-A-G--A------T--G-A-T--G-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-T-T-GA--G--NN-N--N-N-N-N-----N--N-T---G---T-----T-----------T--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-T-G-----G-A---G--------G----G----------G-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116665 : agAAACAAT-AT--------A-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--C--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------T-T-G-----G-G---G--------T----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--
gi|116666 : TA--ATATA-C-T-AAT--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--G-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---TAC-C-C--A-A-----A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116667 : aaTA--ATATA-C-T-A-C--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-TT-C----T----------TT--------T-A----T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-G-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CTGG-------------G-G-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-
gi|116668 : aa-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A----A--C-A-A---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--ATT-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-AATT--A-GC-G---A-CA-G-TTTAC-T-A-GTT
gi|116669 : aAAT-AATA--A-GTA-C-T-C-T--A------C--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G--------A-C-TT-C----T-------G--TTAAC-----T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--C-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--G-T-A-GTT
gi|116670 : TA--ATATA-C-T-A-T------------T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TC--------------G--GT--------T-A-A--T-----GA--G--AA-A--A-T----------------------T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T------T--A--G--------------T-G------TTG------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-T-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116671 : aaACTAT-ATT------TA---T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----------------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116672 : aataatat--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------A-A-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T-C-C------------A-A--G-----CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116673 : aacaataatta-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-T-T-T--G-A-T-C-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--C--A--G--------------T-G------C-ATCACCCCCCCCCC---C--C---------C----------------ACC-GGGGGTG-G---G--------G----G----------T-A-T--C-AG---A-C-C-C--A-A--A--A-G--A---A-CA-G-TT--T-T-A-GTT
gi|116674 : aatagtTA--ACATA-C-T-T-C--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-ACT-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T--------T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--A--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CGCACAGGCGGGAGGGGG-C-G-----G-G---G--------A----G----------T---T--T-AT---T-C-C-C--G-A--T--A-AGTG---A-CA-T-GT--C-T-A-GCT
gi|116675 : aaAAT-AT------ATA-A-C-G-T--A------T--G-A-T--T-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT------T-------G--TT--------A-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G-----G-TGT-----------A--G-T-----T-----------------A-----A---T--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-T-------G-G---G--------A----G----------T-ATT--T-AG---TAC-C-A--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-G
gi|116676 : agtTA--ACATG-C-T-A-T--A------T--T-A-A--C-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-TCAA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A--A--------------T-G------T-G------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GA---G----------T-A-T--T-AA---T-C-
gi|116677 : TA--ACATG-C-T-A-T--A------T--A-A-C--T-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------G---T--------T-A-A--T-T-C-AA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G---T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A-----------------T-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----A----------T-A-T--T-AA---T-C-C------A--A--A-G--G------A-G-TC--C-T-A-GTT
gi|116678 : -ATA-C-TTA-T--A------T--TTA-C--T-C-A-T----G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----C-C-T-----A--T-----G---T-G-T-TT----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-AG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---C-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116679 : aatAT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116680 : AT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116681 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-A--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116682 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-G--C-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-AG-C-A-A---TT-C----T-------G--TT--------T-G----T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GG-T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------T--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CATG-TT--C-T-A-GTT
gi|116683 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A---C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T---T-GA--G--AA-A--A-T-G-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116684 : -ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-G--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TTAACTTCGTT-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G---T-----------C--ATT-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G-------------------C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GC---G----------T-A-T--T-AG---T-C-CTC--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-ATGTT
gi|116685 : tTA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--A-A--CAA-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-G-G--T-C-T-G---G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-TCTGA-------C--A-T-----T-----------------A-----T------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---ACCA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116687 : A-T-T-A-T--A------T----A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-CT---T-------G--TT--------T-A-AATC-C-T-GA--G--AA-A--A-T-CTT-----G--T-T---GTTCT-G-T-A-----------A--A-T-----T-----------------A-----TTG-A--T--AC-G--------------T-G------G-G------------TGAACGAC---------C----------------G-C-GT----G-A---G--------G----G----------T-GTT--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--AGG--G---A-CATG-TT--C-T-A-GT
gi|116688 : -C-T-A-T--A------A--T-A-C--C-C-A-TGT--GGA-T-T-A--G-A--C-A-C-C-TT------T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--G--GA-A----T-CGT-----G--T-TT--G---T-G-T-T-----------C--G-T-----TT----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--T---------C----------------A-C-G-----G-G---A--------T----G----------C-A-T--CAAG---T-C-C-C--A-A--T--A-G--GAACA-TA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116689 : -T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-G-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116691 : -A-T-T--G-A-T-T-G--G-A--C-A-A-T-TT-T----TAATTCTGG--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-TGG---G--T-T---A---T-T-T-TC----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATTG--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------A----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-CCGA-A--A--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
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gi|116693 : -A-A-C-TTTC----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-TTGA--GGAAA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---T-G-T-------------C--A-TA----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-T------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---GT-------T----A----------T-A-TTAT-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA----T--C-T-A-GTT
gi|116694 : -TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----TCTGTAAGAAGTAGGTACAGTTTCT---G--T--A--A--------------T-T------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-A--G-A--A--A-G--G---A-CG-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116695 : --AA-G--A-TAC-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T-G------------A---C--CGTGGAGGAGG----------------G-G-G-----G-G---G--------G----G----------G-G-C--T-AG---T-T-T-T--A-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116696 : tttccactgtgggc--------T-A-A--T-C-T-GAA-G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116697 : tta--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--AGT-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-C-----------C--A-T-----C-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C------------------C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A-----A-A--G---A-C--G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116699 : T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---A-C--G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116701 : -C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----A--T-T---G---T-G-T-T-----------C--G-T-----T-----------------A-----T---T--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--G-A--C--A-G--G---A-CA-A-TT--C-T-A-GTT
gi|116702 : A-A--A-T-T-C-----A--T-T---A---T-T-T-C-----------CC-A-C-----C-----------------A-----T---T--C--A--A--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-AG---T-C-C-C--G-T--T--A-G--G---A-CA-G-CT--C-T-A-GTT
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gi|116704 : tgcct------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116706 : --------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-CT--C-T-A-GT
blockSeqs : G CTA A TA GTTGCA GT G CC A TG A G CA T AC G T T ATTC AATTCTG GT AACTTCGTT AT AA GA TG A G ATTTC GG C TTTG TCCCCCTCCCC CA CACAA CTGTAAGAAGTAGGTAC GTTTC TCA AC AC TT TATAAGATTAACTT G CATGTG TCACCCCCCCCCC GTGGAGGAG GCACAGGCGGGAGGGG GGGGGT GGGCGGGG TACC GGGGGGGGGT A G C CG TGA C GT AAC G T A A
blockSeqs : G TA G T ATAG A C CG T C A C A C G A G G CTTC CGG T AACT A A A T T T GTG GG C GTTC TCCCCCCCCC A GA C TC TG AT A TT . G AT TTAAGGTC GA TGG GG T A TATTAGTT A C A T TAG G T A T T T A
blockSeqs : . TA . G G A T TC A . C G . G . A T T ATTC CGG G TG A A . T A G TGG AT A GT CTGA A A C C G . A TT . G G TGAA GT T GG . C TGTT A A A G ATT G C A T T T A
blockSeqs : . TA . G A G . TC . . . G . A . . . . ATTC G G GT . . . . G . TGG GT C GC TCC T A T T . . . TA . . T GCC . . GC . . . . A . . GT . . A . T . A
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blockSeqs : . AT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . T . . . . . . .
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originalCons : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
finalCons : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
Alignments
lowQualScore : 2222
lowQualScore : 0 1 0000 0 1 0 0 22 333333 22 1 0 00 111 1 0 11 0 1 1 0 11 1 11 1 1 0 1 0 8888 3333333 55 4444444444 0 11 0 0 0 11 11 0 11 1 0 1 44444 44 1 3333333 0 0 0 66666666666 22 0 22222 44444444444444444 33333 111 11 11 33 22222222222222 1 333333 0 5555555555555555 00 222222222 3333333333333333 0 3333333 0 000 11111111 1111 4444444444 1 0 00 2 000 1 0 0 11 0 55555 1 11 222 0 1 3 00 1 2 0
lowQualScore : . . .... . . . . .. ...... .. . . .. ... . . .. . . . . .. . .. . . . . . .... ....... .. .......... . .. . . . .. .. . .. . . . ..... .. . ....... . . . ........... .. . ..... ................. ..... ... .. .. .. .............. . ...... . ................ .. ......... ................ . ....... . ... ........ .... .......... . . .. . ... . . . .. . ..... . .. ... . . . .. . . .
lowQualScore : 5 5 2222 5 1 5 5 33 666666 88 5 5 77 555 5 5 22 5 5 9 5 11 9 11 4 4 5 4 9 3333 5555555 22 3333333333 4 55 4 4 9 55 00 4 44 7 8 3 44444 22 7 7777777 4 8 8 88888888888 66 4 44444 11111111111111111 22222 777 11 44 88 44444444444444 2 000000 8 7777777777777777 66 888888888 8888888888888888 4 7777777 4 777 99999999 7777 3333333333 3 8 66 5 777 3 9 4 55 4 11111 3 55 111 9 3 1 66 4 3 5
consensus : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
Reference ( family-274 ) : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116606 : AAACAAT-ATTA--A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-T--C-C-A-T-T--G-A-T-C-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-T--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116607 : AAAGAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TA----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-CGG-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---T-CA-G-TT--C-T-A-TTT
gi|116608 : AAAGAAT-AATA-----TA-C---A-T--A------T--T-A-C--C-CCA-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TA----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-GC-----------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---T-CA---TT--C-T-A-TTT
gi|116609 : -ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-ATA-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GG--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T-------T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------TGG------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--TGAG---T-C-C-C--G-A--T--T-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116610 : aaagaAAAGAAT-AATA--T-A-A-C-T-A-T--AG-----T--T-A-TTAC-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------TGG------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A--A-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116611 : AAAGAAT-AATA--T-ATA-C-T-A-T--AGTTGCAT--T-A-C--C-C-A-T-T--G-AAT-T-A--G-A--C-A---C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T-------T-G-T-T-----------T--C-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-GG-----T-G------------C---C--C--------------------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T-C-C-C--G-A--T--A-G--GA--A-CC-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116612 : -ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--T-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--T-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------TGG------T-G------------C---C--C---------CT---------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---TCC-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116613 : aaaga-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-TC-G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A------T-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A-----------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--C-G--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116614 : aaagaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A----------------------------------A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------T--G-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-GCATGTGT-G------------C---C--C---------C----------------A-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-A--G-A--C--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116615 : -ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-C-ACAG-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----------------------------T---G--T--A--G--------------T-G------G-G------------T---G--C---------C----------------T-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-CT-G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116616 : aaaga-ATTA--T-ATA-CAT-A----A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-AAT-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------TA-A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-AA---G-T-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116617 : aaagaAAAGAAT-A--A--G-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-AAT-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T-----G--T-T-------T-GTT-T-----------C--A-T-----T-----------------AC----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--TGAA-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116618 : -ATTA--T-ATA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-G-T--G-A-T-G-A--ATA--C-AGA-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G----T---G---T-G-TGT-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--TAGA-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116619 : aaagaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T---------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--GA-AA-A--A-T-T-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-GGC----------C---C--C---------C----------------G-G-G-----G-G---G--------GTACCG----------T-A-T--T-AG---T-C-C-CG-G-A--T--A-G--GA--A-CAGG-TT--T-T-G-ATT
gi|116620 : -ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-A--C-C-C-T-T--G-T-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--TT--------A-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---T-G-G-A-----------T--A-A-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116621 : aaaga-ATTAT-A-GTA-C-T-A-T--A------TA-T-A-C--C-C-A-T-T--G-T-T-T-G--A-A--C-A-A-C-TT-C----T-----------T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--A-------T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G----T--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116622 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT------T-------A--TT----------A-A--T-CCT-GA--G--AA-ATGA-T-C-------G--T-T---G---T-G-T-T-----------A--A-TA----T-----------------G-----T---A--T--A--G--------------T-G------C--------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G---------------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--A-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116623 : aaaga-ATTA--T-ATA-C-C-T-T--A------T--A-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-A-T-----------A--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G--------G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T---T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-A-TT--C-T-A-GTT
gi|116624 : aaagaAAACAATGAT------ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--T-A-T-T-G--G-A--G-A-A-C-TT-T----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--A---------C----------------G-C-G-----G-T---G--------G----G----------T-A-T--T-AC---T-C-G-C--G-A--A--A-G--G---A-
gi|116625 : -ATTAT-G-ATA-CGT-A-TT-A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-C-T-A--G-A--CGA-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T--A--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---TGG-T-T-----------C--A-T-----T-----------------AT----T---G--T--A--G--------------T-GAT----T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------G----G----------T-A-T-----G---T-C-C-C--G-AG-T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116626 : aaagaAAC-ACTA--ATATA-C-T-T-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-CTTT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-C-C-C-----G--T-T-------T-G-T-T-----------C--A-T-----T------------------------------T--A----------------------------C------------C---C--C---------C----------------G-CGG-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--GAA--A--A-G--G---A-CA-G-TT--CAT-A-GTT
gi|116627 : a-ATTA--T-ATA-C-T---T--A------T----A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------T--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----GT-T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T---------------------------------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-T-TT--C-T-A-GTT
gi|116628 : aaagaAAAGAAT--TTA--T-ATA-C-T-G-T--A------T----A-C--C-C-A-T----G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-A-CT-C----T-------GT-TT--------T-A-A--T-C-T-GA-----AA-A--A-T-C-TGTG--G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----C-----------------------T---G--T--T--G--------------T-G------T-A------------C---C--C---------C----------------A-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--ACG--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116629 : TA-C-T-A-T--A------T--TGA-C--C-C-A-T-T--G-A-T---A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T---T-----G--T-TTTTG---T---T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------G----------------G-G-G-----G-G---G--------G----GGGGGGGGGGTT-A-T--T-AG---T-C-C-C--C-G--T--A-G--G---A-CA-G--T--C-T-A-GTT
gi|116630 : aaagaattatAAACAAT-AATA--T-ATA---T-A-TG-A------T--T-A-C--C-CGA-T-A--G-A-T-A-G--A-A--C-A-----TT-CATG-T-------A--TT--------T-A-G--T-C-T-GA------A-A--A-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----------------------A-----T---G--A--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---C--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A-----A-A--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116631 : AT-ATTA-----TA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-A-T-C-TT-CATTCT-------GGTTT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-G-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G------------------------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116632 : aaaaaatgat-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--C-ATA-A-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGGT-T---A---T-T-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--A--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G-------------G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116633 : agaaaatgatgcattA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G----C-A-A-C-T--C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-TAC-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------A--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---------------------------------------------------------------G----------T-A-T--T-AG---T-----C--G-A--T--A----G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116634 : aaaaaattatgta-ATTA--T-ATA-T-A-A-T--A------T--T-A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C------------G--TT--------C-A----T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---GT--T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--A--G--G--------------T--------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-C--T-AG---T-
gi|116635 : aaaga-ATTA--T-ATA---T-A-T--AATAG--T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-TGTGA--GCA--C-A-AAC-TT-T----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--TAT---GC--T-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G--G--T--G--------------T-GT-----T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------A-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T---C-C--G-A--T--AGG--G---A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
gi|116636 : aagga-ATTA--A--TA-C-T---T--A------T--T-A-C--C-C-A-T----G-A-T-T-AA-G-A--C-A-A-C-GT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T--------------A-G-----T-----------------A-----G---T--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C--------------------------G-C-G-----G-G---G------------------------T-A-T--T-AG---A-C-C-C--G-A--T--A-G--
gi|116637 : aaagaTA-T-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A---T-G--G-A--C-A-A-T-TA-C----T-------G--TT--------TGA-A--T-A-T-GA--A--AATA--A-T-CGT-----GATT-T---G---T-G-T-T-----------CA-A-T-----T-----------------A-----TG--G--T--A--G--------------T-G------TGG------------C---C--CGA-------C----------------G-C-G-----C-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-CTC-C--G-A--A--A-GT-G---A-CA-GTTT--C-T-A-G
gi|116638 : agaaaatatatggTA-C-T-A-T--AA-----T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-TCT-A--G-A--C-G-A-CGTTAC----T-------G--TT------------A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------CT-A-T-----TC----------------AC----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------G---T--C---------C----------------G-C-------------T--------G----G----------T-A-T--TCAG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-
gi|116639 : aaaaattattt-T-A--G-A--C-A-C-C-TT-CAT--TCGG----G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--T-T-C-TTGG--G--T-T-------T-G-T-TTCCCCCCCCC-C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--T--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CA-C-TT--C-T-A-GTT
gi|116640 : aagaaatgatattttattagatgacaaa-T-A--G-A--C-A-C-C-TT-CAT--TCGG----G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--T-T-C-TTGG--G--T-T-------T-G-T-TTCCCCCTCCCCC--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--T--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CA-C-TT--C-T-A-GTT
gi|116641 : aagaaatgatattttattagatgacaaaAAT-ATTACTA-ATA----------G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T---A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--CT--------T-A-AA-T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GA-T-G---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---G--T--A--G----------------G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---GGGGCGGGGG----GTGTT------T-A-T--T-A----T-C-A-C--A-G--A--A-G--G---A-CA---TT--C-T-A-GTT
gi|116642 : agaaAAACAAT-AATA-----TA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-------------------------------------T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------G--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------
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gi|116646 : aaaaaatgaattataagatgaccaaagaAAATGAT-ATTA-----TA-C-T-A-G--G------T--G-A-C--C-A-A-T------------A--G-A--A-A-A-C-TT-CATTCT-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-T-----GGTT-T---T---T-T-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATTG--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----
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gi|116652 : aagaAAGAAT-AATA--A-----C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-ATT-T--G-A-T-T-A--C-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------CA-A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G-----------------A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
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gi|116663 : AAA-ATTAT-A-ATA-C-T-A-T--A------TC-T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--GAA--C-A-A-C-TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-A-T-----G--T-T---G---C-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G--TA-A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C------------------C-GC----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AT---C-C-C-C--G-A--T--A-G--GA--A-CA-G-TT--CTT-A-GTT
gi|116664 : AACAAT-ATTA--TTATA-T-T-A-G--A------T--G-A-T--G-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-T-T-GA--G--NN-N--N-N-N-N-----N--N-T---G---T-----T-----------T--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-T-G-----G-A---G--------G----G----------G-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116665 : agAAACAAT-AT--------A-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--C--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------T-T-G-----G-G---G--------T----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--
gi|116666 : TA--ATATA-C-T-AAT--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--G-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---TAC-C-C--A-A-----A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116667 : aaTA--ATATA-C-T-A-C--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-TT-C----T----------TT--------T-A----T-C-T-GA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-G-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CTGG-------------G-G-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-
gi|116668 : aa-ATTA--T-ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A----A--C-A-A---TT-C----T-------G---T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--ATT-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-AATT--A-GC-G---A-CA-G-TTTAC-T-A-GTT
gi|116669 : aAAT-AATA--A-GTA-C-T-C-T--A------C--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G--------A-C-TT-C----T-------G--TTAAC-----T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--C-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--G-T-A-GTT
gi|116670 : TA--ATATA-C-T-A-T------------T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TC--------------G--GT--------T-A-A--T-----GA--G--AA-A--A-T----------------------T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T------T--A--G--------------T-G------TTG------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-T-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116671 : aaACTAT-ATT------TA---T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----------------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-T-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116672 : aataatat--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------A-A-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T--G---T-C-C------------A-A--G-----CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116673 : aacaataatta-ATA-C-T-A-G--A------T--G-A-C--C-A-T-T-T--G-A-T-C-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-T-GA--A--GA-A--A-T-A-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--C--A--G--------------T-G------C-ATCACCCCCCCCCC---C--C---------C----------------ACC-GGGGGTG-G---G--------G----G----------T-A-T--C-AG---A-C-C-C--A-A--A--A-G--A---A-CA-G-TT--T-T-A-GTT
gi|116674 : aatagtTA--ACATA-C-T-T-C--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-ACT-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G---A-A--A-T-C-T--------T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--A--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------CGCACAGGCGGGAGGGGG-C-G-----G-G---G--------A----G----------T---T--T-AT---T-C-C-C--G-A--T--A-AGTG---A-CA-T-GT--C-T-A-GCT
gi|116675 : aaAAT-AT------ATA-A-C-G-T--A------T--G-A-T--T-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT------T-------G--TT--------A-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-A-T-----G--T-T---G-----G-TGT-----------A--G-T-----T-----------------A-----A---T--T--A--G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-T-------G-G---G--------A----G----------T-ATT--T-AG---TAC-C-A--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-G
gi|116676 : agtTA--ACATG-C-T-A-T--A------T--T-A-A--C-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------GG-TT--------T-A-A--T-C-TCAA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A--A--------------T-G------T-G------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GA---G----------T-A-T--T-AA---T-C-
gi|116677 : TA--ACATG-C-T-A-T--A------T--A-A-C--T-A-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-T-GT-T----T-------G---T--------T-A-A--T-T-C-AA--G--AA-A--G-T---T-----G--T-T---T---T-G---T-----------C--A-T-----A-----------------A-----T---A--T--A-----------------T-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----A----------T-A-T--T-AA---T-C-C------A--A--A-G--G------A-G-TC--C-T-A-GTT
gi|116678 : -ATA-C-TTA-T--A------T--TTA-C--T-C-A-T----G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----C-C-T-----A--T-----G---T-G-T-TT----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-AG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---C-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116679 : aatAT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116680 : AT-ATTA----------T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-TA--G--GA-A--A-T-C-T-----A-----------------------------------------------------------A-----T---G--T--A--G--------------A-G------T-G----------------G--C---------C----------------G-T-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-T-C-C--G-A--T--A-A--G---G-CA-G-TT--C-TAA-GTT
gi|116681 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-T--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-A--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116682 : TA--A-ACA-----A-T--G------T--T-A-G--C-C-C-T-T--G-A-T-T-A--G-AG-C-A-A---TT-C----T-------G--TT--------T-G----T-C-T-GA--G--AA-A--AAT-C-T-----GG-T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G----------------T--C---------C----------------G-C---------G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--A-A--A--A-G--G---A-CATG-TT--C-T-A-GTT
gi|116683 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A---C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T---T-GA--G--AA-A--A-T-G-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------A-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GT
gi|116684 : -ATA-C-T-A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-G--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TTAACTTCGTT-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G---T-----------C--ATT-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G-------------------C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------GC---G----------T-A-T--T-AG---T-C-CTC--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-ATGTT
gi|116685 : tTA--A-ACA-----A-T--A------T--T-A-C--C-C-A-T-T--G-A-T-T-A--A-A--CAA-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-G-G--T-C-T-G---G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-TCTGA-------C--A-T-----T-----------------A-----T------------G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--A--A-G--G---ACCA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116686 : TA--A-ACA-----A-T--A------T--T-AAC--C-C-A-T-T--G-A-TGT-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-G--T-C-T-AAA-G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------AT----T---A--T--A--G--------------T-G------T-C------------C---C--C---------T----------------G-G-G-----G-G---G--------
gi|116687 : A-T-T-A-T--A------T----A-C--CTC-A-T-T--G-A-T-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-CT---T-------G--TT--------T-A-AATC-C-T-GA--G--AA-A--A-T-CTT-----G--T-T---GTTCT-G-T-A-----------A--A-T-----T-----------------A-----TTG-A--T--AC-G--------------T-G------G-G------------TGAACGAC---------C----------------G-C-GT----G-A---G--------G----G----------T-GTT--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--AGG--G---A-CATG-TT--C-T-A-GT
gi|116688 : -C-T-A-T--A------A--T-A-C--C-C-A-TGT--GGA-T-T-A--G-A--C-A-C-C-TT------T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-GG--G--GA-A----T-CGT-----G--T-TT--G---T-G-T-T-----------C--G-T-----TT----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--T---------C----------------A-C-G-----G-G---A--------T----G----------C-A-T--CAAG---T-C-C-C--A-A--T--A-G--GAACA-TA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116689 : -T-A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-G-T-A--G-A--C-A-A-C-TT-C----T-------G--T-----------A-A--T-C-T-GA--G--AA-A--A-T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T-----G--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-------G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T---C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116690 : -A-T--A------T--T-A-C--C---A-T-T--G-A-T-T-A--T-A--C-A-A-CTTT-C----C-------GC-TT--------T-A-G--T-C-T-GA--G--AA-A--A---C-T-----T--T-T---G---T-G-T-T--------------A-T-----T-----------------A-----T---G-----A--G--------------T-G------T--------------C---G--C---------C----------------T-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A----T-AG---T-C-T-T--G-A--A--A-G--G---A-CA-G--T--C-T-A-G
gi|116691 : -A-T-T--G-A-T-T-G--G-A--C-A-A-T-TT-T----TAATTCTGG--TT--------T-A-A--T-C-T-GA--G--GA-A--G-T-C-TGG---G--T-T---A---T-T-T-TC----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--ATTG--------------T-G------T-G----------------C--C---------C----------------G-C-G-----A-G---G--------A----G----------TAA-T--T-AG---T-C-C-CCGA-A--A--A-G--G---A-CA-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116692 : -A-T-T--G-A-T-T-A--G-T--C-A-A-C-TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--A-T-C------------T---G---T-G-T-C-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---T--T--A--G--------------T-G------T-G------------T---C--C---------T----------------G-C-G-----G-
gi|116693 : -A-A-C-TTTC----T-------G--GT--------T-A-A--T-C-TTGA--GGAAA-A--A-T-C-T-----G--TCT---G---T-G-T-------------C--A-TA----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-T------------G---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---GT-------T----A----------T-A-TTAT-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA----T--C-T-A-GTT
gi|116694 : -TT-C----T-------G--TT--------T-A-A--T-C-T-AA--G--GA-A--A-T-C-T-----G--T-T---A---T-G-T-T-----------C--A-T-----TCTGTAAGAAGTAGGTACAGTTTCT---G--T--A--A--------------T-T------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-A--G-A--A--A-G--G---A-CG-GTTT--C-T-A-GTT
gi|116695 : --AA-G--A-TAC-T-----G--T-T---T---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---A--T--A--G--------------T-G------T-G------------A---C--CGTGGAGGAGG----------------G-G-G-----G-G---G--------G----G----------G-G-C--T-AG---T-T-T-T--A-A--A--A-G--G---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116699 : T--------T-A-A--T-C-T-GA--G--AA-A----T-C-T-----G--T-T---G---T-G-T-T-----------C--A-T-----T-----------------A-----T---G--T--A--G--------------T-G------T-G------------C---C--C---------C----------------G-C-A-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--TAAG---T-C-C-C--G-A--T--A----G---A-C--G-TT--C-T-A-GTT
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gi|116702 : A-A--A-T-T-C-----A--T-T---A---T-T-T-C-----------CC-A-C-----C-----------------A-----T---T--C--A--A--------------T-G------T-G------------C---C--C---------T----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--A-AG---T-C-C-C--G-T--T--A-G--G---A-CA-G-CT--C-T-A-GTT
gi|116703 : ---T-G-T-T-----------C----------------------------------T---G--T--A--T--------------T-A------T-G------------C---C--C---------T----------------G---G-----G-G---G--------G----G------------A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-A--A---A-CA-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116704 : tgcct------------C---C--C---------C----------------G-C-G-----G-G---G--------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G------A-G-TT--C-T-A-GTT
gi|116706 : --------G----G----------T-A-T--T-AG---T-C-C-C--G-A--T--A-G--G---A-CA-G-CT--C-T-A-GT