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lowQualScore                  :            . .   . . .....    ......... . ..... .. ...     . .. . . .......         ..... ..... .  ....  ..  . . .. .  .    
lowQualScore                  :            2 7   2 2 00000    999999999 2 00000 66 555     2 33 2 2 7777777         99999 00000 4  9999  66  4 4 11 1  6    
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Reference ( gi|52592 )        :    TTTTTATG-C-CCC-C-G----GAATC-T----T-CG-A-----T--T-C-GGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
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gi|52591                      :    TTTTTATG-C-CCT-C-G----GAATC-T----T-CG-A-----T--T-C-GGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGggt
gi|52586                      :    TTTTTATG-C-CCC-C-G----GAATC-T----T-TG-A-----T--T-C-GGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCTGt
gi|52610                      :    TTTTCATG-C-CCC-C-G----GAATC-T----T-CG-A-----T--T-C-GGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TGTGt
gi|52589                      :    TTTTTATG-C-CCC-C-G----GAATC-T----T-CG-A-----T--T-C-GGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGt
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Reference ( family-159 )      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52585                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTG
gi|52586                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCTGt
gi|52587                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-TG-Tt
gi|52589                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGtc
gi|52590                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCTAAATT-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCTG
gi|52591                      : TTTTTATG-CCCT-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGt
gi|52592                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTGt
gi|52593                      : TTTTTATG-CCCCTC-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----G----C-G-T--T-TGTTCTG
gi|52594                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----C-----T-CA----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52595                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCt
gi|52596                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-AT----GT--CT-G-T--C-CG-TCTGggt
gi|52597                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTC-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCGt
gi|52598                      : TTTTTTTG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--C-TG-TCTGt
gi|52599                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TGGGGG-C--ATT-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-TG-TTTGt
gi|52600                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--G-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52601                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-C-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TA-TCTGcattctgt
gi|52602                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----C--T-CGGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-T--TCTGt
gi|52603                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----A--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52604                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAG-TTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52605                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CA----GT--CC-G-T--T-TA-TCTGt
gi|52607                      : TTTTTATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--C----T--T-TG-TCT
gi|52608                      : TTTTTATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-
gi|52609                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----A-----T-CT----GT--TT-G-T--T-
gi|52610                      : TTTTCATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TGTG
gi|52611                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52612                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52613                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52614                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-A-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52615                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52616                      : TTTTCATG-CCCC-C-G-AAATCT----T-AG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-ATAGGC--TAGTTTTT------G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-cattctgt
gi|52617                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTT-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-T
gi|52618                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-AAATCT----A-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----tc
gi|52619                      : TTTATATG-CCCC-C-G-GAATCC----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CT-G-T--
gi|52620                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-AGATTG----A-AA-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--c
gi|52621                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAGTCT----T-GG-A-----T--T-AGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGcattctgt
gi|52622                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----A--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT-------T--T-TG-TCTG
gi|52623                      : TTTTTACG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCtttg
gi|52624                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-C-GGGG-C--G-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCG
gi|52625                      : TTTTTATGCCCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A--------T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52626                      : TTTTTATG-CCCC-G-T-GA--------T-CG-A-----AGAT-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTGTCCT-G-----T-CT----GT--CC-T-T--C-TG-Tcattctgt
gi|52627                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--CATGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52629                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAAACT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--TC-G-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52630                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52631                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----A-CG-A-----T--T-CAGGGG-G--A-T-A-------TA-TTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGc
gi|52632                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52633                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattatgt
gi|52634                      : TTTGTATA-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAATTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-CG-TTTGcaattctgt
gi|52635                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-CATA-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-A-T--G-TG-TCTGt
gi|52636                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----AT--CC-A-T--T-TG-TCCGtctgt
gi|52637                      : TTATTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-T--TCTt
gi|52638                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52639                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCA----A-AG-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TTG-GTTTA-----A-----T-TT----GT--CCTG-T--C-TG-TCcatt
gi|52640                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGattctgt
gi|52641                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-TGATCG----A-AG-A--------T-CGGGGG-T--A-T-AT------TGGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52643                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGAG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52644                      : TTTTTGTG-CCCC-C-G-GGATCT----T-CT-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTCG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGc
gi|52645                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-ACAATGTATAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT----------T-TG-TCt
gi|52646                      : TTTTTATG-CTCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-A-------TAG-TTTTG-----G-----C-CT----GT--CT-G-T--T-
gi|52647                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG------AG-A-----A--T-CGGGG--C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52648                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGA-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----A-TT----GT--CC-G-cattctgt
gi|52649                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A----------TTTTTA-----G-----T-CT----GT--TC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52650                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TAGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGtctgt
gi|52651                      : TTTTTTTG-CCTC-C-A-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGATGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----TCCT----GT--CT-G-T--C-TG-TCTG
gi|52652                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----A-CG-A-----T--T-CAGGGG-G--A-T-A-------TATATTTTG-----G-----T-CT----GT---C-A-T--T-TG-TCTGt
gi|52653                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--C---GGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G----T-TG-TCTGtttgt
gi|52654                      : TTTTTATG-TCCC-T-G-GAATTG----A-AG-A-----T--T-CAGGGG-T--A-C-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GA--TT-A-T--C-TG-TCTt
gi|52655                      : TTGTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GTGACC-A-T--T-TG-TCTGttc
gi|52656                      : TTTTTACG-CCCC-A-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGGTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-TTGT-TG-TCTG
gi|52657                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGAG-C--A-T-T-------TAGTTTTTG-----G-----T-CTGTCGGT--CC-G-T--T-TG-Tt
gi|52658                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-TGGGAG-C--A-T-A-------TAGTGTTTG-----G-----C-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCG
gi|52659                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----TAAG-A-----T--C-GGGGGG-C--A---A-------TTGTTTTTG-----T-----T-CT----GT-------T--T-TC-TCTG
gi|52660                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTGTTT-----G-----T-CT----Gtccttctgt
gi|52661                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--G-T-A--------AGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TTTG
gi|52662                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-TGATCA----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-TCA-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52663                      : TTGTTATG-TTCT-C-G-GAATCG----A-AG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGGTTTTG-----G-----T-CT----GT--CA-A-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52664                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-T--A-T-A-------TAGTTTTCG-----G-----T-CT----AC--CC-ATT--T-TG-TCTGtctgt
gi|52665                      : TTTTTATG-CCCC-C-GTGA--------T-CG-AAG---G--T-CGGGGC-C--A-T-A-------TTGTGTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52666                      : TTTTTATG-CCTC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGGG-C--A-T-A-------T-TTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52667                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTT-----------------T----GT--CC-T-T--TCTG-TCcattctgt
gi|52668                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GA-TCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTA-----G-----T-CT----CT---C-G-C--C-TG-TCattctgt
gi|52669                      : TTTTTATG-CCTC-T-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGTGTTTG-----G-----C-CT----GT--GT-G-T--C-TG-TTTG
gi|52670                      : TTTTTTTG-CCTC-CAG-GAATCA----A-AG-A-----T--T-CTGGGT-C--A-T-A-------TAGTTTTT------G-----C-CT----GT--CT-G-T--C-t
gi|52671                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTT-------G-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52672                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-C-GGGG-C--A-T-A-------TA--TTTTG-----GTCTGTT-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGcattctgt
gi|52674                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-GAATAA----T-TG-A-----T--T-CGGGGGTC--A-T-A-------TAGTTTATG-----G-----T-CT----AT--CT-A-T--C-TG-TCTGt
gi|52760                      :  TTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTT-----G-----T-CT----GT--CC-G----T-TG-TCt
gi|52761                      :  TTGTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TT-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CT-G-T--T-ctgt
gi|52762                      :  TTTTATG-CCCC-A-A-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TC-TCTGt
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gi|52764                      :  TTTTATG-CCCC---G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGAGG-C--A-T-A-------TAGTTTTT------T-----T-CT----GT--CC-G-T--t
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gi|52660                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTGTTT-----G-----T-CT----Gtccttctgt
gi|52661                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--G-T-A--------AGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TTTG
gi|52662                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-TGATCA----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-TCA-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52663                      : TTGTTATG-TTCT-C-G-GAATCG----A-AG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGGTTTTG-----G-----T-CT----GT--CA-A-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52664                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-T--A-T-A-------TAGTTTTCG-----G-----T-CT----AC--CC-ATT--T-TG-TCTGtctgt
gi|52665                      : TTTTTATG-CCCC-C-GTGA--------T-CG-AAG---G--T-CGGGGC-C--A-T-A-------TTGTGTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52666                      : TTTTTATG-CCTC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGGG-C--A-T-A-------T-TTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52667                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTT-----------------T----GT--CC-T-T--TCTG-TCcattctgt
gi|52668                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GA-TCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTA-----G-----T-CT----CT---C-G-C--C-TG-TCattctgt
gi|52669                      : TTTTTATG-CCTC-T-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGTGTTTG-----G-----C-CT----GT--GT-G-T--C-TG-TTTG
gi|52670                      : TTTTTTTG-CCTC-CAG-GAATCA----A-AG-A-----T--T-CTGGGT-C--A-T-A-------TAGTTTTT------G-----C-CT----GT--CT-G-T--C-t
gi|52671                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTT-------G-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52672                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-C-GGGG-C--A-T-A-------TA--TTTTG-----GTCTGTT-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGcattctgt
gi|52674                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-GAATAA----T-TG-A-----T--T-CGGGGGTC--A-T-A-------TAGTTTATG-----G-----T-CT----AT--CT-A-T--C-TG-TCTGt
gi|52760                      :  TTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTT-----G-----T-CT----GT--CC-G----T-TG-TCt
gi|52761                      :  TTGTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TT-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CT-G-T--T-ctgt
gi|52762                      :  TTTTATG-CCCC-A-A-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TC-TCTGt
gi|52763                      :  TTTTATA-CCCC-T-G-GAATC--------A-AAAGATT--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TGGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGt
gi|52764                      :  TTTTATG-CCCC---G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGAGG-C--A-T-A-------TAGTTTTT------T-----T-CT----GT--CC-G-T--t
gi|52766                      :  TTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AGGA-----T--A-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--c
gi|52767                      :  TTTTATG-TCCC-C-A-AAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-A-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52787                      :    TTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTGTCCTTG-----T-CT----GT--CA-T-T--C-TG-Tt
gi|52788                      :    TTATG-CCCC-T-G--AATCT----T-TA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----AT--CC-G-T--C-TT-TCCG
gi|52789                      :    TTATG-CCCC-C-A-TGATCG----A-AG-A-----T----CGGGGG-T--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--TCTG-TCTGt
gi|52790                      :    TCACG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGAG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52796                      :     TATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----C--T-CGGAGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-CG-TCTGcattctgt
gi|52797                      :     TATG-CCCC-C-G-TAATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGAC-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52798                      :      ATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGAGGT-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52800                      :        G-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTT------------T-TT----GT--CT-G-TCGT-TG-TCt


blockSeqs                     :                         AAATTC    AAGAT                    CAATGTA         TCCTT TCTGT                  TG C
blockSeqs                     :                         TAA       AG                       TAGGC           TCCT  .                      CG C
blockSeqs                     :                         TT        .                        T               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TG        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .  .
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TT        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         AA        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                      .   
blockSeqs                     :                         TC        .                        .               .     .                          
blockSeqs                     :                         A         .                        .               .     .                          
blockSeqs                     :                         .         .                        .               .                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
finalCons                     : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG





Alignments
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lowQualScore                  :         .    . . .      ....... . ..... .. .      . .. . . .......         ..... ..... .  ....  ..  . . .. .  .    
lowQualScore                  :         4    4 4 4      9999999 4 66666 66 4      4 66 4 4 7777777         99999 00000 4  9999  66  4 4 11 1  6    
consensus                     : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
Reference ( family-159 )      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52585                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTG
gi|52586                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCTGt
gi|52587                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-TG-Tt
gi|52589                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGtc
gi|52590                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCTAAATT-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCTG
gi|52591                      : TTTTTATG-CCCT-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGt
gi|52592                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTGt
gi|52593                      : TTTTTATG-CCCCTC-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----G----C-G-T--T-TGTTCTG
gi|52594                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----C-----T-CA----GT--CC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52595                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCt
gi|52596                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-AT----GT--CT-G-T--C-CG-TCTGggt
gi|52597                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTC-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCGt
gi|52598                      : TTTTTTTG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--C-TG-TCTGt
gi|52599                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TGGGGG-C--ATT-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-TG-TTTGt
gi|52600                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--G-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52601                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-C-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TA-TCTGcattctgt
gi|52602                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----C--T-CGGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-T--TCTGt
gi|52603                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----A--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52604                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAG-TTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52605                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CA----GT--CC-G-T--T-TA-TCTGt
gi|52607                      : TTTTTATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--C----T--T-TG-TCT
gi|52608                      : TTTTTATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-
gi|52609                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----A-----T-CT----GT--TT-G-T--T-
gi|52610                      : TTTTCATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TGTG
gi|52611                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52612                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52613                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----T-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52614                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-A-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52615                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52616                      : TTTTCATG-CCCC-C-G-AAATCT----T-AG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-ATAGGC--TAGTTTTT------G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-cattctgt
gi|52617                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTT-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-T
gi|52618                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-AAATCT----A-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----tc
gi|52619                      : TTTATATG-CCCC-C-G-GAATCC----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CT-G-T--
gi|52620                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-AGATTG----A-AA-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--c
gi|52621                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAGTCT----T-GG-A-----T--T-AGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGcattctgt
gi|52622                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----A--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT-------T--T-TG-TCTG
gi|52623                      : TTTTTACG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCtttg
gi|52624                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-C-GGGG-C--G-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCG
gi|52625                      : TTTTTATGCCCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A--------T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52626                      : TTTTTATG-CCCC-G-T-GA--------T-CG-A-----AGAT-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTGTCCT-G-----T-CT----GT--CC-T-T--C-TG-Tcattctgt
gi|52627                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--CATGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52629                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAAACT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--TC-G-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52630                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52631                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----A-CG-A-----T--T-CAGGGG-G--A-T-A-------TA-TTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGc
gi|52632                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52633                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattatgt
gi|52634                      : TTTGTATA-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAATTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-CG-TTTGcaattctgt
gi|52635                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-CATA-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-A-T--G-TG-TCTGt
gi|52636                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----AT--CC-A-T--T-TG-TCCGtctgt
gi|52637                      : TTATTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-T--TCTt
gi|52638                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52639                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCA----A-AG-A-----T--T-GGGGGG-C--A-T-A-------TTG-GTTTA-----A-----T-TT----GT--CCTG-T--C-TG-TCcatt
gi|52640                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGattctgt
gi|52641                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-TGATCG----A-AG-A--------T-CGGGGG-T--A-T-AT------TGGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52643                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGAG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52644                      : TTTTTGTG-CCCC-C-G-GGATCT----T-CT-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTCG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGc
gi|52645                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-ACAATGTATAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT----------T-TG-TCt
gi|52646                      : TTTTTATG-CTCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-TGGGGG-C--A-T-A-------TAG-TTTTG-----G-----C-CT----GT--CT-G-T--T-
gi|52647                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG------AG-A-----A--T-CGGGG--C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52648                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGA-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----A-TT----GT--CC-G-cattctgt
gi|52649                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A----------TTTTTA-----G-----T-CT----GT--TC-G-T--T-TG-TCTG
gi|52650                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-TAGGAG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGtctgt
gi|52651                      : TTTTTTTG-CCTC-C-A-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGATGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----TCCT----GT--CT-G-T--C-TG-TCTG
gi|52652                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----A-CG-A-----T--T-CAGGGG-G--A-T-A-------TATATTTTG-----G-----T-CT----GT---C-A-T--T-TG-TCTGt
gi|52653                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--C---GGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G----T-TG-TCTGtttgt
gi|52654                      : TTTTTATG-TCCC-T-G-GAATTG----A-AG-A-----T--T-CAGGGG-T--A-C-A-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GA--TT-A-T--C-TG-TCTt
gi|52655                      : TTGTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GTGACC-A-T--T-TG-TCTGttc
gi|52656                      : TTTTTACG-CCCC-A-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGGTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-TTGT-TG-TCTG
gi|52657                      : TTTTTATG-CCCC-A-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGAG-C--A-T-T-------TAGTTTTTG-----G-----T-CTGTCGGT--CC-G-T--T-TG-Tt
gi|52658                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-TGGGAG-C--A-T-A-------TAGTGTTTG-----G-----C-CT----GT--CT-G-T--T-TG-TCCG
gi|52659                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----TAAG-A-----T--C-GGGGGG-C--A---A-------TTGTTTTTG-----T-----T-CT----GT-------T--T-TC-TCTG
gi|52660                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTGTTT-----G-----T-CT----Gtccttctgt
gi|52661                      : TTTTTATG-CCCC-T-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--G-T-A--------AGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TTTG
gi|52662                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-TGATCA----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-TCA-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52663                      : TTGTTATG-TTCT-C-G-GAATCG----A-AG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGGTTTTG-----G-----T-CT----GT--CA-A-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52664                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CA-A-----T--T-CGGGGG-T--A-T-A-------TAGTTTTCG-----G-----T-CT----AC--CC-ATT--T-TG-TCTGtctgt
gi|52665                      : TTTTTATG-CCCC-C-GTGA--------T-CG-AAG---G--T-CGGGGC-C--A-T-A-------TTGTGTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52666                      : TTTTTATG-CCTC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGGG-C--A-T-A-------T-TTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--cattctgt
gi|52667                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTT-----------------T----GT--CC-T-T--TCTG-TCcattctgt
gi|52668                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GA-TCT----T-CG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTA-----G-----T-CT----CT---C-G-C--C-TG-TCattctgt
gi|52669                      : TTTTTATG-CCTC-T-G-GAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-C-A-------TAGTGTTTG-----G-----C-CT----GT--GT-G-T--C-TG-TTTG
gi|52670                      : TTTTTTTG-CCTC-CAG-GAATCA----A-AG-A-----T--T-CTGGGT-C--A-T-A-------TAGTTTTT------G-----C-CT----GT--CT-G-T--C-t
gi|52671                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTT-------G-----C-CT----GT--CT-G-T--
gi|52672                      : TTTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-C-GGGG-C--A-T-A-------TA--TTTTG-----GTCTGTT-CT----GT--CC-G-T--T-TG-TCCGcattctgt
gi|52674                      : TTTTTATG-CCAC-C-G-GAATAA----T-TG-A-----T--T-CGGGGGTC--A-T-A-------TAGTTTATG-----G-----T-CT----AT--CT-A-T--C-TG-TCTGt
gi|52760                      :  TTTTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTT-----G-----T-CT----GT--CC-G----T-TG-TCt
gi|52761                      :  TTGTATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-TT-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-TT----GT--CT-G-T--T-ctgt
gi|52762                      :  TTTTATG-CCCC-A-A-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGGG--C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-G-T--T-TC-TCTGt
gi|52763                      :  TTTTATA-CCCC-T-G-GAATC--------A-AAAGATT--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TGGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-G-T--C-TG-TCTGt
gi|52764                      :  TTTTATG-CCCC---G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGGAGG-C--A-T-A-------TAGTTTTT------T-----T-CT----GT--CC-G-T--t
gi|52766                      :  TTTTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AGGA-----T--A-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--c
gi|52767                      :  TTTTATG-TCCC-C-A-AAATCT----T-TG-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-G-------TAGTTTTTG-----G-----C-CT----GT--CC-A-T--C-TG-TCTGcattctgt
gi|52787                      :    TTATG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGGG-C--A-T-A-------TTGTTTTTGTCCTTG-----T-CT----GT--CA-T-T--C-TG-Tt
gi|52788                      :    TTATG-CCCC-T-G--AATCT----T-TA-A-----T--T-CGGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----AT--CC-G-T--C-TT-TCCG
gi|52789                      :    TTATG-CCCC-C-A-TGATCG----A-AG-A-----T----CGGGGG-T--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--TCTG-TCTGt
gi|52790                      :    TCACG-CCCC-C-G-TGATCG----A-AG-A-----T--C-GGGGAG-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52796                      :     TATG-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----C--T-CGGAGG-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CT-G-T--C-CG-TCTGcattctgt
gi|52797                      :     TATG-CCCC-C-G-TAATCG----A-AG-A-----T--C-AGGGAC-C--A-T-A-------TTGTTTTTG-----T-----C-CT----GT--CT-G-T--t
gi|52798                      :      ATG-CCCC-C-A-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CGAGGT-C--A-T-A-------TAGTTTTTG-----G-----T-CT----GT--CC-A-T--T-TG-TCTGcattctgt
gi|52800                      :        G-CCCC-C-G-GAATCT----T-CG-A-----T--T-CAGGGG-C--A-T-A-------TAGTTTTT------------T-TT----GT--CT-G-TCGT-TG-TCt