lowQualScore                  :                                                            111111111111111                                          1111111                        1111111     111111111111          22222222    1111111111111111                                        11                       
lowQualScore                  :           3    6 3       33     2   444         2 2    2   444444444444444    2 99999999 2    66666  66 2       33  4444444 2     44  222 2   666  5555555   2 111111111111   2 2 2  44444444    0000000000000000 2 3      2   444 55  5    2 2 2        00             99  1     
lowQualScore                  :           .    . .       ..     .   ...         . .    .   ...............    . ........ .    .....  .. .       ..  ....... .     ..  ... .   ...  .......   . ............   . . .  ........    ................ . .      .   ... ..  .    . . .        ..             ..  .     
lowQualScore                  :           1    0 1       44     4   111         2 2    2   666666666666666    4 66666666 5    22222  99 5       22  0000000 7     22  888 5   999  6666666   5 111111111111   5 5 5  66666666    7777777777777777 5 9      5   444 99  0    5 4 5        33             77  4     
consensus                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG-------ANCATTC-TTCA-A-------GG-GATG-----AA--T-AGCCGAGA-TC-------G-TATAG-CGA-C-A-GTC---CT----A--ATG-A--T---------GAG-T-C-CAA------NATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-ANT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTTT-TTCTTTTT
Reference ( gi|100467 )       : GAAAATTTCT-AAGTTC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG-------AGTATTT-TTCA-A-------AG-GATG-----AA--T-AGCCGAGA-TC-------G-TATAG-CGA-C-A-GTC---CT----A--ATG-A--T---------GAG-T-C-CAT------CATGT---------A------T-ATCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-AAT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTTC-TTCTCTTT
gi|100468                     : GGAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-GAAT-AAG-------ACTATGT-TCCA-A-------GA-GATA-----AA--T-AGCCGAGA-TC-------C-TATAG-CGA-C-A-GGC---CT----A--ATG-A--T---------GAG-T-C-CAA------TATGC---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-ACT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTT
gi|100469                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AA-T-TCG-------AATATTC-CTTA-A-------GG-TATGTCATCAA--T-AGCCGAGA-TC-------G-TATAG-CGA-C-A-ATC---CT----A--ATG-A--T---------GAT-T-C-CAA------GATGT---------A------T-ACCTGTAG-TTC---G--AA-TACC-ATA-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTTTATTTTTTTTaatattttttttt
gi|100471                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA-------AGCATTC-TTCA-A-------GA-GATT-----AAACC-AGCCGAGA-TCG------G-TATAG-GGA-T-A-GTC---CT----GTTATG-A--T---------GAG-T-C-AA-------CATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AAGTACC-AAT-TTTTCCTA--CGTATATTTTGTTT-T
gi|100470                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA-------AGCATTC-TTCA-A-------GA-GATT-----AAACC-AGCCGAGA-TCG------G-TATAG-GGA-T-A-GTC---CT----GTTATG-A--T---------GAG-T-C-AA-------CATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AAGTACC-AAT-TTTTCCTA--CGTATATTTTGTTT-Tgaattttatttt
gi|100473                     : GAAAATTT-T-AAGTCC-AAGCCAG--GTGACTTTT---AAATAGCTT-A-AAAT-TC--------CTTATCT-TGCA-A-------GA-GATG-----AA--T-AGCCGAGAGGC-------G-TATAG-CGA-C-A-GTCT--TT----A--TTG-AATC---------GAG-T-A-CAT------AATGT---------A------TAACCTGTGG-TTC---GT-AA-TACC--AT-TTTTCCTA--CGTGTTTTTTTTTC--TCTCTTTgaattttatttt
gi|100472                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-A-ACCTGTGGTGAC-TTTTTAAAATAGTTTTG-AAAT-TCG-------GAAATTC-TTCA-AGACGTGAAGAGAAG-----GA--T-AGCCGAAA-TC-------G-AATAG-CGA-C-A-GTC---CA----A--ATG-A--T---------GAG-T-C-CAA------TATGC---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-GCT-TTTTCCTA--CGTATTTTT--TTT-TCATCTTT
gi|100475                     : GAAAATTTTTTAAGTCC-ATGTC-G--GTAAC-TTT---ACATAGCT--A-AAATCTCG-------A-CATATATTCA-T-------AG-GATG-----AA--T-AGCCGAG--TA-------G-TGTAG-TGA---A-GTA---TT--------TG-G--A---------AAG-G-CACATACTATACATTT---------AT-----T-ATCGGTGG-TTC---A--TA-TACC-AGA-TTTTTCTGCCCATATTTTTTT
gi|100474                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAA
gi|100476                     : GAACATTTCT-ATGTCC-ACGTCGG--GTGAC-TTT---AGATAACTT-G-AGAT-TCA-------AAAAACC-TTCA-A-------
gi|100477                     :  AAAATTTCA-TTGTCC-ATGTCGG--TTGAC-TTT---AGATAGCTT-G-AAAT-GTGAAAAAAAAATA----TTCA-T-------GA-GATG-----GG--T-AGCTGAGG-TG-------G-TAAAG-TGA-C-A-GTC---TT----A--TTGAA--TTTTTGGACAGGG-T-C-CAA------ACTGT---------A------T-ATCGGTGG-TTC---G--A-------AGT-GTTTTCTACCCATATTTTTTTg
gi|100478                     :   AAATTTCT-ATGTCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG-------ACTATTC-TTCA-A-------GA-GATG-----AA--T-AGCCGAGA-TC-------G-AATAGCCGA-C-A-GTC---GT----T--ATG-A--T---------GAA-T-C-CAA------TAAGT---------ATACATGT-ACCTGTGGTTTC---G--AA-TACC-ACT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTTT-T
gi|100479                     :   AAATTCTT-AAGTCCGATGTTCG--GTGAC-TTT---AGATAGCTT-GAAAAT-TAG-------GAAACTA-TTCATG-------AG-GATG-----AA--T-AGCCGAGgttt
gi|100480                     :    AACTTTT---GCCC-ATACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG-------AGTGTTC-TTCA-A-------GG-GATG-----AA--T-AGCCGAAA-TC-------G-TATAG-CGA-C-A-CTC---CT----T--GGG-A--T---------GAG-T-C-CAA------CATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-AAT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTTCA-TTTTTTTT
gi|100481                     :                     ACCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TTG-------At
gi|100482                     :                      CCAG--GTGAC-TTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG-------ACTATGA-TCCA-A-------TA-GATG-----AA--T-AGCCGAGA-TC-------G-TATAG-AGA-T-A-GGC---TT----G--ATG-A--A---------GAG-T-C-CAA------TATGC---------A------T-ACCTGTAG-TTC---G--AC-TACC-ACT-TTTTCCTA--CGTATTTTTTTT
gi|100483                     :                         G--GTGAC-TT----AAATAGCTT-G-AAAT-TCA-------AGCATTC-TTC--A-------AG-AGTA-----AA--C-AGCCGAGA-TC-------GTTAT-G-CGA-T-A-GTC---TT----T--ATG-A--T---------GAGTT-C-TAC------AATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-AAT-TTTTCA-A--CGTATTTTTTTaaaaatattttttttct
gi|100486                     :                                 -TTT---AAATAGCTT-----------------------CT-GTTA-A-------GG-GGCG-----AA--TTAAACGAG--TC-------G-TAAAG-CGAACGA-GCCTAGCT----A--ATG-A--T---------GAT-T-C-CAA------CATGTTTTCTGTTTA------T-ACCTGTGG-TTTCTGGTTAT-TACCTAATCTTTTCCTA--CGTATTTTGTTTTT-TTaaattttattttct
gi|100484                     :                                   ttaacaAGTAGCTT-G-AAAT-TCG-------GACATTC-TTTA-A-------GG-AATG-----AA--T-AGCTGAGG-TCCCTTTCTT-TTTTG--GA-C-AGGTC---CG----A--AT----------------------------------TGC---------A------T-AACTGTGG-TTC---G--AA-CACC-AAA-TTGTCCTA--C---TTTTTattaaatttttt
gi|100485                     :                                          ATAGCTA-A-AAAT-TCG-------A-CATATATTCA-T-------AG-GATG-----AA--T-AGCCGAGG-TA-------G-TGTAG-TGA-C-A-GTA---TTTGGAA--AGG-G--C---------ACA-TAC-TAT------AAT-T---------A------T-ATCGGTGG-TTC---G--AA-TACC-AGA-TTTTTCTGCCCATATTTTTTT
gi|100487                     :                                                                                                                                         -A-GTC---CT----T--ATG-A--T---------GAG-T-C-CAG------CATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC-AGT-TTTTCCTA--CGTATTTTGTTTTT-TACTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                1111                       11111111                                     111                            111111                                                                              111111111111           
lowQualScore                  :           2      2       33        666         2 2    2    99  1111   2 2    2     55555  55555555 2        2  5  2    2   333    666  333  33 33 99999   55555   2 2 111111 1    9999999999999999 2        2   444 55  4    33 3         66           33 444444444444 3  55     
lowQualScore                  :           .      .       ..        ...         . .    .    ..  ....   . .    .     .....  ........ .        .  .  .    .   ...    ...  ...  .. .. .....   .....   . . ...... .    ................ .        .   ... ..  .    .. .         ..           .. ............ .  ..     
lowQualScore                  :           9      9       22        111         1 1    1    22  4444   2 2    2     99999  00000000 4        5  0  5    5   555    555  555  22 22 11111   99999   4 4 888888 0    5555555555555555 4        4   111 66  7    22 3         55           44 999999999999 1  44     
consensus                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGAGCAT----TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---CTN--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------ACATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
Reference ( family-819 )      : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGANCAT----TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---CTA--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------ANATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
gi|100467                     : GAAAATTTCT-AAGTTC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGAGTAT----TTT-T-CAAA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---CTA--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------TCATGT---------A------T-ATCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----C-TTC-TCTTT
gi|100468                     : GGAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-GAAT-AAGACTAT----GTT-C-CAAG-AGATA-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-CT-ATAG-CGA-C-AGGC---CTA--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------ATATGC---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------TAATAT-TTT-TTTTT
gi|100469                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AA-T-TCGAATAT----TCC-T-TAAG-GTATGTCATCAA--------T-AGCCGAGA-TC-GT-ATAG-CGA-C-AATC---CTA--AT--G--A-----TGA-----TTC-C-A------AGATGT---------A------T-ACCTGTAG-TTC---G--AA-TACC--ATATTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----TATTT-TTTTT
gi|100470                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCAAGCAT----TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGA-TCGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G--A-----TGA-----GT--C-A------ACATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-T
gi|100471                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCAAGCAT----TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGA-TCGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G--A-----TGA-----GT--C-A------ACATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-Tgaattttatttt
gi|100472                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-A-ACCTGTGGTGACTTTTTAAAATAGTTTTG-AAAT-TCGGAAAT----TCT-T-CAAG-ACGTG-----AAGAGAAGGAT-AGCCGAAA-TC-GA-ATAG-CGA-C-AGTC---CAA--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------ATATGC---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--GCTTTTTCCTA--CGTATTTTTT----------------T-TTCATCTTTgaattttatttt
gi|100473                     : GAAAATTT-T-AAGTCC-AAGCCAG--GTGACTTTT--AAATAGCTT-A-AAAT-TC---CTTA---TCT-TGCAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAGGC-GT-ATAG-CGA-C-AGTCT--TTA--TT--G--AAT---CGA-----GTA-C-A------TAATGT---------A------TAACCTGTGG-TTC---GT-AA-TACC--A-TTTTTCCTA--CGTGTTTTTTT--T-------TC---T-CTC-TTT
gi|100474                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAA
gi|100475                     : GAAAATTTTTTAAGTCC-ATGTC-G--GTAACTTT---ACATAGCT--A-AAATCTCGA-CATA---TAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAG--TA-GT-GTAG-TGA---AGTA---TT----T--G--G-----AAA-----GGCAC-ATACTATACATTT---------AT-----T-ATCGGTGG-TTC---A--TA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100476                     : GAACATTTCT-ATGTCC-ACGTCGG--GTGACTTT---AGATAACTT-G-AGAT-TCAAAAAA----CCT-T-CAAG-
gi|100477                     :  AAAATTTCA-TTGTCC-ATGTCGG--TTGACTTT---AGATAGCTT-G-AAAT-GTGAAAAAAAAATAT-T-CATG-AGATG-----GG--------T-AGCTGAGG-TG-GT-AAAG-TGA-C-AGTC---TTA--TT--G--AATTTTTGGACAGGGTC-C-A------AACTGT---------A------T-ATCGGTGG-TTC---G--AA--------GTGTTTTCTA--CCCATATTTTT--T-------T----
gi|100478                     :   AAATTTCT-ATGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGACTAT----TCT-T-CAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-GA-ATAGCCGA-C-AGTC---GTT--AT--G--A-----TGA-----ATC-C-A------ATAAGT---------ATACATGT-ACCTGTGGTTTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-T
gi|100479                     :   AAATTCTT-AAGTCCGATGTTCG--GTGACTTT---AGATAGCTT-GAAAAT-TAGGAAAC----TAT-T-CATGAGGATG-----AA--------T-AGCCGAGgttt
gi|100480                     :    AACTTTT---GCCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGAGTGT----TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAAA-TC-GT-ATAG-CGA-C-ACTC---CTT--GG--G--A-----TGA-----GTC-C-A------ACATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TCA-----T----T-TTT-TTTT
gi|100481                     :                     ACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TTGA
gi|100482                     :                      CCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCGACTAT----GAT-C-CAAT-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGA-TC-GT-ATAG-AGA-T-AGGC---TTG--AT--G--A-----AGA-----GTC-C-A------ATATGC---------A------T-ACCTGTAG-TTC---G--AC-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TAAAAATAT----T-TTT-TTTCT
gi|100483                     :                         G--GTGACTT----AAATAGCTT-G-AAAT-TCAAGCAT----TCT-T-CAAG-AG-TA-----AA--------C-AGCCGAGA-TC-GTTAT-G-CGA-T-AGTC---TTT--AT--G--A-----TGA-----GTT-CTA------CAATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCA-A--CGTATTTTTTTAAA-------T----T-TTA-TTTT
gi|100484                     :                                        AGTAGCTT-G-AAAT-TCGGACAT----TCT-T-TAAG-GAATG-----AA--------T-AGCTGAGG-TC-CC-TT-----------TC---TTT--TTTGG--A-----CAG-----GTC-C-G------AATTGC---------A------T-AACTGTGG-TTC---G--AA-CACC--AAATTGTCCTA--C---TTTTTct
gi|100485                     :                                         ATAGCTA-A-AAAT-TCGA-CATA---TAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGG-TA-GT-GTAG-TGA-C-AGTA---TT----T--GGAA-----AGG-----GCA-C-ATACT--ATAATT---------A------T-ATCGGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100486                     :                                 TTT---AAATAGCTT---------------------CTGT-TAAG-GGGCG-----AA--------TTAAACGAG--TC-GT-AAAG-CGAACGAGCCTAGCTA--AT--G--A-----TGA-----TTC-C-A------ACATGTTTTCTGTTTA------T-ACCTGTGG-TTTCTGGTTAT-TACCTAATCTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TTA-TT
gi|100487                     :                                                                                                                        ttaaca-AGTC---CTT--AT--G--A-----TGA-----GTC-C-A------GCATGT---------A------T-ACCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGTTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TAC-TTTaaatttttt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                            11111111                                               111111111111                                                                                                111111111111           
lowQualScore                  :           2      2       33        666         2 2    2   4444 77  6   2 2    2     55555  55555555 2         2 5  2    2   333    888888 3  55 2 000000000000     2  999999  2 2  33 9999999999999999  2       2   444 55  4    33 3         99           33 666666666666 3  55     
lowQualScore                  :           .      .       ..        ...         . .    .   .... ..  .   . .    .     .....  ........ .         . .  .    .   ...    ...... .  .. . ............     .  ......  . .  .. ................  .       .   ... ..  .    .. .         ..           .. ............ .  ..     
lowQualScore                  :           9      9       22        555         1 1    1   5555 33  7   2 2    2     99999  00000000 4         5 0  5    5   555    666666 3  66 4 000000000000     4  111111  4 4  22 5555555555555555  4       4   111 66  7    22 3         77           44 777777777777 1  44     
consensus                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
Reference ( family-819 )      : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
gi|100467                     : GAAAATTTCT-AAGTTC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTAT-TTT-T-CAAA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------TC-A-TG--T---------A------TA-TCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----C-TTC-TCTTT
gi|100468                     : GGAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-GAAT-AAG----ACTAT-GTT-C-CAAG-AGATA-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-CT-ATAG-CGA-C-AGGC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------TAATAT-TTT-TTTTT
gi|100469                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AA-T-TCG----AATAT-TCC-T-TAAG-GTATGTCATCAA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AATC---C--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AG-A-TG--T---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AA-TACC--ATATTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----TATTT-TTTTT
gi|100470                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-T
gi|100471                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-Tgaattttatttt
gi|100472                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-A-ACCTGTGGTGACTTTTTAAAATAGTTTTG-AAAT-TCG----GAAAT-TCT-T-CAAG-ACGTG-----AAGAGAAGGAT-AGCCGAAAT-C-GA-ATAG-CGA-C-AGTC---C--AAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--GCTTTTTCCTA--CGTATTTTTT----------------T-TTCATCTTTgaattttatttt
gi|100473                     : GAAAATTT-T-AAGTCC-AAGCCAG--GTGACTTTT--AAATAGCTT-A-AAAT-TC-------CTTATCT-TGCAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAGGC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---T--TTATT-G-AATC---------GAGTA-CA------TA-A-TG--T---------A------TAACCTGTGG-TTC---GT-AA-TACC--A-TTTTTCCTA--CGTGTTTTTTT--T-------TC---T-CTC-TTT
gi|100474                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAA
gi|100475                     : GAAAATTTTTTAAGTCC-ATGTC-G--GTAACTTT---ACATAGCT--A-AAATCTCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAG-T-A-GT-GTAG-TGA---AGTA---T--T--T--G-G--A---------AAGGCACATACTATAC-A-TT--T---------AT-----TA-TCGGTGG-TTC---A--TA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100476                     : GAACATTTCT-ATGTCC-ACGTCGG--GTGACTTT---AGATAACTT-G-AGAT-TCA----AAAAA-CCT-T-CAAG-
gi|100477                     :  AAAATTTCA-TTGTCC-ATGTCGG--TTGACTTT---AGATAGCTT-G-AAAT-GTGAAAAAAAAA-TAT-T-CATG-AGATG-----GG--------T-AGCTGAGGT-G-GT-AAAG-TGA-C-AGTC---T--TATT--GAA--TTTTTGGACAGGGTC-CA------AA-C-TG--T---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--A--------AGTGTTTTCTACCCATATTTTTTT--
gi|100478                     :   AAATTTCT-ATGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-TCT-T-CAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GA-ATAGCCGA-C-AGTC---G--TTAT--G-A--T---------GAATC-CA------AT-A-AG--T---------ATACATGTA-CCTGTGGTTTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-T
gi|100479                     :   AAATTCTT-AAGTCCGATGTTCG--GTGACTTT---AGATAGCTT-GAAAAT-TAG----GAAAC-TAT-T-CATGAGGATG-----AA--------T-AGCCGAGgttt
gi|100480                     :    AACTTTT---GCCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTGT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAAAT-C-GT-ATAG-CGA-C-ACTC---C--TTGG--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TCA-----T----T-TTT-TTTT
gi|100481                     :                     ACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TTG----A
gi|100482                     :                      CCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-GAT-C-CAAT-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-AGA-T-AGGC---T--TGAT--G-A--A---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AC-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TAAAAATAT----T-TTT-TTTCT
gi|100483                     :                         G--GTGACTT----AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AG-TA-----AA--------C-AGCCGAGAT-C-GTTAT-G-CGA-T-AGTC---T--TTAT--G-A--T---------GAGTT-CT------AC-AATG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCA-A--CGTATTTTTTTAAA-------T----T-TTA-TTTT
gi|100484                     :                                        AGTAGCTT-G-AAAT-TCG----GACAT-TCT-T-TAAG-GAATG-----AA--------T-AGCTGAGGT-C-CC-TT-----------TC---T--TTTTTGG-A--C---------AGGTC-CG------AA-T-TG--C---------A------TA-ACTGTGG-TTC---G--AA-CACC--AAATTGTCCTA--C---TTTTTct
gi|100485                     :                                         ATAGCTA-A-AAAT-TCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGGT-A-GT-GTAG-TGA-C-AGTA---T--TTGG--A-A--A---------GGGCA-CAT-----ACTA-TAATT---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100486                     :                                              TT-T-AAAT--------AGC-T-TCTGT-TAAG-GGGCG-----AA--------TTAAACGAG-T-C-GT-AAAG-CGAACGAGCCTAGC--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AC-A-TG--TTTTCTGTTTA------TA-CCTGTGG-TTTCTGGTTAT-TACCTAATCTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TTA-TT
gi|100487                     :                                                                                                                         ttaaca-AGTC---C--TTAT--G-A--T---------GAGTC-CA------GC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGTTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TAC-TTTaaatttttt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                            11111111                                               111111111111                                                                                                111111111111           
lowQualScore                  :           2      2       33        666         2 2    2   4444 77  6   2 2    2     55555  55555555 2         2 5  2    2   333    888888 3  55 2 000000000000     2  999999  2 2  33 9999999999999999  2       2   444 55  4    33 3         99           33 666666666666 3  55     
lowQualScore                  :           .      .       ..        ...         . .    .   .... ..  .   . .    .     .....  ........ .         . .  .    .   ...    ...... .  .. . ............     .  ......  . .  .. ................  .       .   ... ..  .    .. .         ..           .. ............ .  ..     
lowQualScore                  :           9      9       22        555         1 1    1   5555 33  7   2 2    2     99999  00000000 4         5 0  5    5   555    666666 3  66 4 000000000000     4  111111  4 4  22 5555555555555555  4       4   111 66  7    22 3         77           44 777777777777 1  44     
consensus                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
Reference ( family-819 )      : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
gi|100467                     : GAAAATTTCT-AAGTTC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTAT-TTT-T-CAAA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------TC-A-TG--T---------A------TA-TCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----C-TTC-TCTTT
gi|100468                     : GGAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-GAAT-AAG----ACTAT-GTT-C-CAAG-AGATA-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-CT-ATAG-CGA-C-AGGC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------TAATAT-TTT-TTTTT
gi|100469                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AA-T-TCG----AATAT-TCC-T-TAAG-GTATGTCATCAA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AATC---C--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AG-A-TG--T---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AA-TACC--ATATTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----TATTT-TTTTT
gi|100470                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-T
gi|100471                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-Tgaattttatttt
gi|100472                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-A-ACCTGTGGTGACTTTTTAAAATAGTTTTG-AAAT-TCG----GAAAT-TCT-T-CAAG-ACGTG-----AAGAGAAGGAT-AGCCGAAAT-C-GA-ATAG-CGA-C-AGTC---C--AAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--GCTTTTTCCTA--CGTATTTTTT----------------T-TTCATCTTTgaattttatttt
gi|100473                     : GAAAATTT-T-AAGTCC-AAGCCAG--GTGACTTTT--AAATAGCTT-A-AAAT-TC-------CTTATCT-TGCAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAGGC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---T--TTATT-G-AATC---------GAGTA-CA------TA-A-TG--T---------A------TAACCTGTGG-TTC---GT-AA-TACC--A-TTTTTCCTA--CGTGTTTTTTT--T-------TC---T-CTC-TTT
gi|100474                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAA
gi|100475                     : GAAAATTTTTTAAGTCC-ATGTC-G--GTAACTTT---ACATAGCT--A-AAATCTCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAG-T-A-GT-GTAG-TGA---AGTA---T--T--T--G-G--A---------AAGGCACATACTATAC-A-TT--T---------AT-----TA-TCGGTGG-TTC---A--TA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100476                     : GAACATTTCT-ATGTCC-ACGTCGG--GTGACTTT---AGATAACTT-G-AGAT-TCA----AAAAA-CCT-T-CAAG-
gi|100477                     :  AAAATTTCA-TTGTCC-ATGTCGG--TTGACTTT---AGATAGCTT-G-AAAT-GTGAAAAAAAAA-TAT-T-CATG-AGATG-----GG--------T-AGCTGAGGT-G-GT-AAAG-TGA-C-AGTC---T--TATT--GAA--TTTTTGGACAGGGTC-CA------AA-C-TG--T---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--A--------AGTGTTTTCTACCCATATTTTTTT--
gi|100478                     :   AAATTTCT-ATGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-TCT-T-CAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GA-ATAGCCGA-C-AGTC---G--TTAT--G-A--T---------GAATC-CA------AT-A-AG--T---------ATACATGTA-CCTGTGGTTTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-T
gi|100479                     :   AAATTCTT-AAGTCCGATGTTCG--GTGACTTT---AGATAGCTT-GAAAAT-TAG----GAAAC-TAT-T-CATGAGGATG-----AA--------T-AGCCGAGgttt
gi|100480                     :    AACTTTT---GCCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTGT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAAAT-C-GT-ATAG-CGA-C-ACTC---C--TTGG--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TCA-----T----T-TTT-TTTT
gi|100481                     :                     ACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TTG----A
gi|100482                     :                      CCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-GAT-C-CAAT-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-AGA-T-AGGC---T--TGAT--G-A--A---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AC-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TAAAAATAT----T-TTT-TTTCT
gi|100483                     :                         G--GTGACTT----AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AG-TA-----AA--------C-AGCCGAGAT-C-GTTAT-G-CGA-T-AGTC---T--TTAT--G-A--T---------GAGTT-CT------AC-AATG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCA-A--CGTATTTTTTTAAA-------T----T-TTA-TTTT
gi|100484                     :                                        AGTAGCTT-G-AAAT-TCG----GACAT-TCT-T-TAAG-GAATG-----AA--------T-AGCTGAGGT-C-CC-TT-----------TC---T--TTTTTGG-A--C---------AGGTC-CG------AA-T-TG--C---------A------TA-ACTGTGG-TTC---G--AA-CACC--AAATTGTCCTA--C---TTTTTct
gi|100485                     :                                         ATAGCTA-A-AAAT-TCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGGT-A-GT-GTAG-TGA-C-AGTA---T--TTGG--A-A--A---------GGGCA-CAT-----ACTA-TAATT---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100486                     :                                              TT-T-AAAT--------AGC-T-TCTGT-TAAG-GGGCG-----AA--------TTAAACGAG-T-C-GT-AAAG-CGAACGAGCCTAGC--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AC-A-TG--TTTTCTGTTTA------TA-CCTGTGG-TTTCTGGTTAT-TACCTAATCTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TTA-TT
gi|100487                     :                                                                                                                         ttaaca-AGTC---C--TTAT--G-A--T---------GAGTC-CA------GC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGTTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TAC-TTTaaatttttt


blockSeqs                     :           T      G       TG        TTA         T A    C   AAAA CT  A   G G    A     TCATC  GAGAAGGA T         G G  T    C   ACG    TAGC   A  TG A TTTTTGGACA       A  TACTAT  T A  AT TTTCTGTTTA        A       T   CTG TT  G    TA C         CC           AA AAAAATAT     A  CA
blockSeqs                     :           .      .       .         T           . .    .   .    AT  A   . .    .     .      AC       .         . G  .    .   C      CTG    A  T  . ATC              .  T       . .  .  ATACATG           .       .   .   T   G    .  T         CC           .  TAATA        .  T 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    GC  A   . .    .     .      AC       .         . .  .    .   C      CTG    T  .  . T                .  .       . .  .  AT                .       .   .   .   .    .  A         CC           .  CAT          .  T 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    GC  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   T      C      T  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  A         .            .  TC           .  C 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    AA  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   T      C      A  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  C         .            .  T            .  T 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    AA  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      C      T  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  G         .            .  T            .  T 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    AA  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      T      A  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  G         .            .  T            .  A 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    CT  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      T      T  .  . A                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  C         .            .  T            .  A 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    AA  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      T      T  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  A         .            .  T            .  C 
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    GT  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      G      G  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  C         .            .  T            .    
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    CT  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   T      C      T  .  . A                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  A         .            .  T            .    
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    GC  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   T      T      T  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  A         .            .  .            .    
blockSeqs                     :           .      .       .         .           . .    .   .    AC  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   C      T      T  .  . C                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  G         .            .                    
blockSeqs                     :                          .         .           . .    .   .    GC  .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   .      T      A  .  . A                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  T         .            .                    
blockSeqs                     :                          .         .           . .    .   .    C   .   . .    .     .      .        .         . .  .    .   .      T      T  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  G         .            .                    
blockSeqs                     :                          .         .           . .    .   .    C   .   . .    .     .      .        .                              C      .  .  . T                .  .       . .  .  A                 .       .   .   .   .    .  .         .                                 
blockSeqs                     :                                                . .    .   .    C   .   . .    .                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                . .    .   .                                                                                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
finalCons                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                            11111111                                               111111111111                                                                                                111111111111           
lowQualScore                  :           2      2       33        666         2 2    2   4444 77  6   2 2    2     55555  55555555 2         2 5  2    2   333    888888 3  55 2 000000000000     2  999999  2 2  33 9999999999999999  2       2   444 55  4    33 3         99           33 666666666666 3  55     
lowQualScore                  :           .      .       ..        ...         . .    .   .... ..  .   . .    .     .....  ........ .         . .  .    .   ...    ...... .  .. . ............     .  ......  . .  .. ................  .       .   ... ..  .    .. .         ..           .. ............ .  ..     
lowQualScore                  :           9      9       22        555         1 1    1   5555 33  7   2 2    2     99999  00000000 4         5 0  5    5   555    666666 3  66 4 000000000000     4  111111  4 4  22 5555555555555555  4       4   111 66  7    22 3         77           44 777777777777 1  44     
consensus                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
Reference ( family-819 )      : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGCAT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TNAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ANTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-TTC-TTTTT
gi|100467                     : GAAAATTTCT-AAGTTC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTAT-TTT-T-CAAA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------TC-A-TG--T---------A------TA-TCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----C-TTC-TCTTT
gi|100468                     : GGAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-GAAT-AAG----ACTAT-GTT-C-CAAG-AGATA-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-CT-ATAG-CGA-C-AGGC---C--TAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------TAATAT-TTT-TTTTT
gi|100469                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AA-T-TCG----AATAT-TCC-T-TAAG-GTATGTCATCAA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-CGA-C-AATC---C--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AG-A-TG--T---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AA-TACC--ATATTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----TATTT-TTTTT
gi|100470                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-T
gi|100471                     : GAAAATTTCT-AAGTCC-ATAC-AG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AGATT-----AAAC------C-AGCCGAGAT-CGGT-ATAG-GGA-T-AGTC---CTGTTAT--G-A--T---------GAGT--CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AAGTACC--AATTTTTCCTA--CGTATATTTTG--T-------T----T-Tgaattttatttt
gi|100472                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-A-ACCTGTGGTGACTTTTTAAAATAGTTTTG-AAAT-TCG----GAAAT-TCT-T-CAAG-ACGTG-----AAGAGAAGGAT-AGCCGAAAT-C-GA-ATAG-CGA-C-AGTC---C--AAAT--G-A--T---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--GCTTTTTCCTA--CGTATTTTTT----------------T-TTCATCTTTgaattttatttt
gi|100473                     : GAAAATTT-T-AAGTCC-AAGCCAG--GTGACTTTT--AAATAGCTT-A-AAAT-TC-------CTTATCT-TGCAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAGGC-GT-ATAG-CGA-C-AGTC---T--TTATT-G-AATC---------GAGTA-CA------TA-A-TG--T---------A------TAACCTGTGG-TTC---GT-AA-TACC--A-TTTTTCCTA--CGTGTTTTTTT--T-------TC---T-CTC-TTT
gi|100474                     : GAAAATTTCG-AAGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAA
gi|100475                     : GAAAATTTTTTAAGTCC-ATGTC-G--GTAACTTT---ACATAGCT--A-AAATCTCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAG-T-A-GT-GTAG-TGA---AGTA---T--T--T--G-G--A---------AAGGCACATACTATAC-A-TT--T---------AT-----TA-TCGGTGG-TTC---A--TA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100476                     : GAACATTTCT-ATGTCC-ACGTCGG--GTGACTTT---AGATAACTT-G-AGAT-TCA----AAAAA-CCT-T-CAAG-
gi|100477                     :  AAAATTTCA-TTGTCC-ATGTCGG--TTGACTTT---AGATAGCTT-G-AAAT-GTGAAAAAAAAA-TAT-T-CATG-AGATG-----GG--------T-AGCTGAGGT-G-GT-AAAG-TGA-C-AGTC---T--TATT--GAA--TTTTTGGACAGGGTC-CA------AA-C-TG--T---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--A--------AGTGTTTTCTACCCATATTTTTTT--
gi|100478                     :   AAATTTCT-ATGTCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-TCT-T-CAAG-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GA-ATAGCCGA-C-AGTC---G--TTAT--G-A--T---------GAATC-CA------AT-A-AG--T---------ATACATGTA-CCTGTGGTTTC---G--AA-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--T-------T----T-T
gi|100479                     :   AAATTCTT-AAGTCCGATGTTCG--GTGACTTT---AGATAGCTT-GAAAAT-TAG----GAAAC-TAT-T-CATGAGGATG-----AA--------T-AGCCGAGgttt
gi|100480                     :    AACTTTT---GCCC-ATACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----AGTGT-TCT-T-CAAG-GGATG-----AA--------T-AGCCGAAAT-C-GT-ATAG-CGA-C-ACTC---C--TTGG--G-A--T---------GAGTC-CA------AC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TCA-----T----T-TTT-TTTT
gi|100481                     :                     ACCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TTG----A
gi|100482                     :                      CCAG--GTGACTTT---AAATAGCTT-G-AAAT-TCG----ACTAT-GAT-C-CAAT-AGATG-----AA--------T-AGCCGAGAT-C-GT-ATAG-AGA-T-AGGC---T--TGAT--G-A--A---------GAGTC-CA------AT-A-TG--C---------A------TA-CCTGTAG-TTC---G--AC-TACC--ACTTTTTCCTA--CGTATTTTTTT--TAAAAATAT----T-TTT-TTTCT
gi|100483                     :                         G--GTGACTT----AAATAGCTT-G-AAAT-TCA----AGCAT-TCT-T-CAAG-AG-TA-----AA--------C-AGCCGAGAT-C-GTTAT-G-CGA-T-AGTC---T--TTAT--G-A--T---------GAGTT-CT------AC-AATG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AATTTTTCA-A--CGTATTTTTTTAAA-------T----T-TTA-TTTT
gi|100484                     :                                        AGTAGCTT-G-AAAT-TCG----GACAT-TCT-T-TAAG-GAATG-----AA--------T-AGCTGAGGT-C-CC-TT-----------TC---T--TTTTTGG-A--C---------AGGTC-CG------AA-T-TG--C---------A------TA-ACTGTGG-TTC---G--AA-CACC--AAATTGTCCTA--C---TTTTTct
gi|100485                     :                                         ATAGCTA-A-AAAT-TCG----A-CATATAT-T-CATA-GGATG-----AA--------T-AGCCGAGGT-A-GT-GTAG-TGA-C-AGTA---T--TTGG--A-A--A---------GGGCA-CAT-----ACTA-TAATT---------A------TA-TCGGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGATTTTTCTGCCCATATTTTTTT--
gi|100486                     :                                              TT-T-AAAT--------AGC-T-TCTGT-TAAG-GGGCG-----AA--------TTAAACGAG-T-C-GT-AAAG-CGAACGAGCCTAGC--TAAT--G-A--T---------GATTC-CA------AC-A-TG--TTTTCTGTTTA------TA-CCTGTGG-TTTCTGGTTAT-TACCTAATCTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TTA-TT
gi|100487                     :                                                                                                                         ttaaca-AGTC---C--TTAT--G-A--T---------GAGTC-CA------GC-A-TG--T---------A------TA-CCTGTGG-TTC---G--AA-TACC--AGTTTTTCCTA--CGTATTTTGTT--T-------T----T-TAC-TTTaaatttttt