lowQualScore : 1111 1111111111111111111 111111111111 1111111111111 111 111 222222222222222 1 1111 111111111 111
lowQualScore : 2 0 2 22 1 1 1 1 333 22 1 555 1 1111 22 222 777777 44 1 22 66666666 1 1 7777777777777777777 1 4 99999 1 1 777 666 1 1 3 222 1 1 1 333333 1 222 1 55 4444 3 77777777777 1 1 1 1 1 7777 3 22 3 3 33 3 1 444 0 1 222 1 1 22 22 4 111111111111 1 1 1 22 1 22 33333 1 1 1 1 4 1 1 22 222 4444 1 3 33 3 1 3333 1 1 22 22 22 0000000000000 1 222 1 1 22 22 44 88888 1 22 1 7777777 1 1 1 555555 1 1 66666 1 333 3 1 1 22 3333 555555555 555 888 666666666666666 1 5555 22 55 55555555 5 7777 1 1 22 66666 22 22 1 1 1 44 44444 8888 1 1 0 1 1 44 1 1 1 3333 44444 3 1 1 3333 555 22 3 7777 1 3333 000000000 44 1 1 1 555555 1 1 22 444 1 5 1 1 1 1 9 1 333 1 55 1 333 1 1 44 1 1 1 1 1 44 77 44 55555 22 0 222 222 0 2 5
lowQualScore : . . . .. . . . . ... .. . ... . .... .. ... ...... .. . .. ........ . . ................... . . ..... . . ... ... . . . ... . . . ...... . ... . .. .... . ........... . . . . . .... . .. . . .. . . ... . . ... . . .. .. . ............ . . . .. . .. ..... . . . . . . . .. ... .... . . .. . . .... . . .. .. .. ............. . ... . . .. .. .. ..... . .. . ....... . . . ...... . . ..... . ... . . . .. .... ......... ... ... ............... . .... .. .. ........ . .... . . .. ..... .. .. . . . .. ..... .... . . . . . .. . . . .... ..... . . . .... ... .. . .... . .... ......... .. . . . ...... . . .. ... . . . . . . . . ... . .. . ... . . .. . . . . . .. .. .. ..... .. . ... ... . . .
lowQualScore : 1 9 0 88 9 9 9 8 222 44 7 444 7 5555 33 999 555555 00 7 33 00000000 7 6 1111111111111111111 6 8 22222 6 6 666 999 6 6 2 888 6 6 6 222222 6 888 5 22 8888 1 00000000000 5 6 6 6 6 8888 1 11 1 1 77 1 5 222 6 5 777 5 5 11 11 4 777777777777 5 5 5 00 5 00 77777 5 5 4 4 4 5 5 00 666 6666 5 8 88 3 7 7777 7 7 55 55 55 0000000000000 8 111 8 8 55 44 11 33333 7 44 7 4444444 7 7 7 000000 7 7 11111 7 000 5 7 7 33 5555 777777777 888 666 666666666666666 7 0000 22 44 88888888 0 2222 7 7 44 11111 44 44 7 7 7 88 33333 2222 7 7 2 7 7 00 7 7 7 7777 66666 5 7 7 7777 444 44 5 2222 7 7777 444444444 11 7 7 7 000000 7 7 44 888 7 2 8 8 8 8 1 8 000 8 00 8 222 8 8 33 8 8 9 9 9 11 00 88 00000 88 2 444 777 9 5 0
consensus : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--T--AG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--AAAA--A---A-T---TTTC-CCAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-NTA--C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
Reference ( gi|50013 ) : AGGTCTC-AGA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTA--T--AG---AGA-A----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----GT-TT-TT---G--CT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ATGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GTC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-C-T-C-T--G--C--AG----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--CAAA--C---A-T---TTGC-CCAG----TA--TA--A--------TGCCA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CA---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-ATA--C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-G-AGC-TGT-CCCTC
gi|50014 : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--T--AG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-TT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-A--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AT-AT--G-----G-GT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACTT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A---AAA--T---A-T---GTTC-CCAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-A--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----AG---TT--C-C----T-TAAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTAA---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-C-AG-TG-AA-AATAGA-A-ATA--C-----CCG--CCGAA-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50015 : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CGG--T--AG---ATA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAA-CTC-C--CT----C----CAAAAAA---A--AAAA--A---A-T---TT-C-CCAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATGT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACG-TA--CC-G---T-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGTTGA-A-GTA--C-----ACG--GCGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50017 : AGGTCTC-AGA-T--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--C--AG---AAG-A----C--A-CA--T--------TT-T-T-----TTTT----------AATG-AT-CA----AT-TT-TTT--G--TA-ACCA-TGGCAAAC---C-AA-T-TT-CA---T--AG-A---TAA-T--GTC----TT-TAG-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TT-ATA-T---GTCC-AT----A--TCA-C------------ATGTGC-TG-CT--GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GTC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--CGAA--A---A-T---TT-C-CCAGT---TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-G-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCAAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T-----G-TCA-TAA----GG---TT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TATTT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-GT-TTCG---ACT-TA--CT-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-ATA--C-----CCA--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50016 : AGGTCTC-AAA-C--T-GGCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--T--AG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--TTC----TT-TAT-----------CT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-ACA--------------------------T---GTCC-AT-G--A--TCA-T------------ATGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-C-G-C--C---TG----AAGCACTT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--AT----G----A----AA---A--AAAAAAC---A-T---TTCC-CCAG----TA--AA--A--------TGACAGATGT-AT-ATC--AA-----A--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---T-CA-TCCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-TTA--C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50018 : AGGTCTC-AGA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--T--AG---ATA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----A-------------AATA-AT-CA----AT-TT-TTT--G--TT-ACCA-TGGCAA-T---C-GA-T-TTTCA---T--AA-A---TAG-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-CA-AT-AG----AC-GCA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---CTCC-AT-G--A--TCA-C------------ATGTGC-TT-CTT-GCCAGG--AA-AT--A-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---CG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--A-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GATCCC-CAT-TTC-A--CT----C----G----AA---A--GAAA--CAAAA-T---T--C-CCAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CT---TA-AC-TTTTCCAACGA-G-G--CCA-C-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---CA--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TC--TT---G-CA-TTCAATTT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-
gi|50019 : AGGTCTC-AGAAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAAATT-T---CA-CTG--T--AG---A-A-G----G--A-CAAAT--------TT-T-T-----T-------------AAAG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TTTACCAATGGCAA-C---CCAA-T-TTT-A---T--AA-A---TAAAT--GTC----TC-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----ACCACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTAT--T---GTCCCAT-G--A--TCAAC------------ATGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGAAG-AT-T-GGC--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-GGA--GA--GG--A-------------AATTT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-T-AA-A-A------TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CGC-A--TT----C----C----AAAAGA--AAAA--A---A-T---T--C-CCAG----TA--TA--A--------TG--A------AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC---A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTT-CAA-AA-G-G--CCA-A-A-T----T-----G-TCA-T-A-----G---TT--T-C----T-TGAT----TC---------TA--TCTT-C-AA------GA-TG-TT--TTG--G-CATTTTAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-CAATCC-G---T-T-TTAA-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-TTA--C-----CCG--CCAAG-A-AGTCAA-AGC-TGC-CCCTC
gi|50020 : AGGTCTC-AAA-C--TTACCA-GGAAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CGG--T--AG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----TT------------AATG-ATTCA----AT-TT-TTT--G--TT-ACCA-TGGCAA-C-----AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTA-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A---A--AA-GACA---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-CT-----------ACATGC-TG-CTCGGCCTGGAAAA-AT--G-----G-GTGCGA-G-AT-TGG-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--ACTC-C----TCG-A--GA--GG--A-------------AA-TT---T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A---------CT-ACC-AAT----TT-TT---GACCCC-CAT--TC-A--CC----C----A----AA---A--T-----------T---TTTC-CCAG----TA--TAG-A--------TGACA----T-AT-ATC--AT-----G--TTCCTTTGC-A-C-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GGGTTCT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-T--CT--TT---G-CAGTTCAA-GT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---TGT-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-AGATT--C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACCTTGT-CC
gi|50023 : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--TCT---CA-CGT--G--AG---AGA-G----G--ATCA--T--------TT-A-T-----T-------------AATG-ATCCA----ATGGT-TT---G--TT-ACCA-TGG-AA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-TAGGTC----TTATAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AAGCT-AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GT-C-AT-G--ATCTCA-C------------ACGTGCATG-CTT-GCTTGG--AA-AT--G-----GCGT-CGA-GAAT-T-G-C--CTTGTG----AAGCACCT-G-C--A-TCAC----T-G-A--GAAGGA--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-ATA------CCT-A-C-AA-----TT-TTTTGGACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--AAAA--A---A-T---TT-C-CCAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATT--CA-----GCTTTC--TTGCAA-A-A--AAT-----CATCCTA-AC-C-TTCCAACAAGG-G--CCA-A-ACT----T---GCG-TTATT-A----GG---TT--C-CT---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GATTA-TT--TT---G-CA-TTCCATAT-GAAA--A-T-GCTA--T-TTCG---ACT-TA--CC-GTTTT-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGTAGA-
gi|50021 : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-AGGA---TGAAAA--T-T---CAACGG--T--AG---AGGGA----G--G-AA--T--------TT-T-T-----TTAAAATGATTAATAACG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-AC-A-TGGCAAAC---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTCC---TT-TAT-----------TA-ATTA-A-AA-AT-AG----ACCACA--AGC-A--AAAGA-A---TTTA-A-TCTGGTCC-AT-G--A--TCAAC------------AC-TGC-TGGCTC-GCCTGG--AA--T--G-----G-TC-CGA-G-AT-T-G-C--T---------AAGCACCTTGCC--A-TC-C--------G--GA--GG--A-------------AA-TT-T-TTC-T--G--C--AA----A-AA--G-G---------TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TTGTT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--GAAA--A---T-T---TTTC-CCAG----TA--TAG-A--------TGACA----TGAT-A-C--AA--------TTC--TTGC-A-A-AACAAT-----C----TA-AC-CTTT-CAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--T-CA---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA-------A-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-G-AA-CA-TAGCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CCGG---T-T-TA-A-A-AG-TA-AA-AGTAAG-A-AGAT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50024 : AGGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-CTG--T--TG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GTC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-TTC-A--CT----C----C----AA---A--AAAA--A---A-T---TT-C-CCAG----TG--TA--A--------T
gi|50025 : AAGTCTC-AAA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-CTG--T--TG---AGA-G----G--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GTC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A--AAAA--A---A-T---TT-C-CCAG----TG--TA--A--------T
gi|50022 : AGGTCTC-AGA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TG-AAA--T-T---CT-CTG--T--AG---ATA-G----GTCA-CA--T--------
gi|50026 : GGTCTC-AAA-C--T-ACCT-G-AAAAATGGA---TGAAAA--T-TGC-CA-C-AGGT--AG---AGA-G----G--A-TA--T--------TT-TTT-----T-------------AATG-AT-CA----A--TT-TT---G--TT-ATCA-TGGCAA-C---C-AATT-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AAGAT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA--A-A---TTTATA-T---GTCC-ATGG--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-ATGGG-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-----AGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------AA-TT-T-T-CTT--G--C--AA----A-AA--G-A-------T-TGAA-A-A------CCTGACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----AA---A---AAA------A-T---TTTC-CTAG----TA--TATGA--------TGACAT---T-AT-ATC--AA-----G---TC--TTGC---A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CC--A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----TGTGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TT-AT--TT---G-CATTTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACT-TC--CC-G-----T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAG--A-ATA--C-----GC---CCGAG-AGATTC-A-ACC-TGT-CC
gi|50027 : GGTCTC-AAA-C--T-ACCC-C-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-CCC--C--GG---AGA-G----G--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CA----AA-TT-TT---G--TT-GCCA-TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---C--AA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-G--A--TAA-C------------ATCTGC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-GC-TGA-G-ATAC-A-C--C---C-----AAGCACCT-GTC--A-AC-C----T-G-A--G---GGTCA-------------AA-TT---T-C-A--A--C--GA----A-AA--C-G-------A-TGAA-A-A------ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TTGAAAT----A----AA---A--AAAA--A---A-T---T--C-ACAG----TA--TA--T--------TGACA----G-GT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--TAT-----TC---TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTGTTT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-ATT--C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50029 : GGTCTC-AAA-C--T-ACAA-G-GATA-TGGA---TGAAAA--T-T---TG-CTG--C--AG---TGA-G----A--T-CA--T--------CT-T-T-------------------AATG-AC-TA----GT-TT-CT---G--TT-GCTA-TGACAA-G---T-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--ATC----AA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----AC-ACA--A-T-ATGAATGA-C---TTCAAA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-CATG---------ATGTGC-TG-CTA-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGTCCCT-GCC--A-TT-T----T----------GG--G-------------AA-TT-T-T-T-T--G--C--TGTTGCA-AA--A-A-------A-TG--------------T-AAC--A-----TT-TT-----CCTCGCTT-GTG-A--TT----C----C----AATATA--TGAA--T---A-T---TTA---CAG----TA--TA--G--------TGACA----T-TT-TTC--AA-----G--TTC--TTCC-A-A-A--AAT-----CC---TA-A--CGTTCCAACAG-G-G--CCA-A-A-T----C---T-G-CAA-A-A----TG---TT--C-C----T-TGAT----TC----------A--TT-TGC-AA------AA-TA-TT--GA---G-CA-TC-----T-GCAG-CA---------T-TTCA---ATT-TT--TC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-CTG--T-----CTA--CCAAG-A-ATTC---ATC-TCC-CCCTC
gi|50028 : GGTCTC-AAA-C--T-ACCCCG-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-CCC--CCGAG---AGA-G----G--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CA----AA-TT-T----G--TT-GCCA-TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---GCAAA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-G--A--TAA-C------------ATCTGC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-G--CGA-G-ATAC-A-C--C---C-----AAGCACCT-GTC--A-AC-C----T-G-G--GG--TC--A-------------AA-TT---T-C-A--A--CG-AA----A-AA--C-G-------A-TGAA-A-A------ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TT----GATAAT----AA---A--AAAA--A---A-T---T--C-ACAG----TA--TA--T--------TGACA----G-GT-ATC--AAA----G--TTC--TTGC-A-A-A--TAT-----TC---TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTG-TT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-ATT--C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50030 : GATCTT-AGA-C--T-ACCA-A-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-CTG--T--AA---AGA-G----G--T-TA--T--------TC-A-T-------------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-TTCA-TGGCGA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---G
gi|50031 : GTCTCCAAA-CCTT-ACCA-----AA-TGG----TGAAA-----T---TA-CGG--T--AG---AGA-G----G--A-TA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CA----AT-TT-TT---G--TT-AT-A--GGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-AT-G-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T----TCC-AT-G--A--TCA-C------------ACGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA--T--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA--G---A-------------AA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------C-T-ACC-A-------T-TT---GACCCC---T-CTC-A--CT----C----C----AA---A---AAA------A-T---TTTC-CTAG----TA--TG--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TT---TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--T--T-C-AA------G---A-TT--TT---G-CA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAG--A-GTA--C-----GCG---CGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50032 : TC-AGA-C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TAAAAA--T-T---CA-CAG--T--AG---AGA-A----GG-A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-AA----AT-GT-TT---G--TT-ACAA-TGACAA-C---C-AA-T-TTTCA---A--AA-A---TAA-A--GTC----TT-TAT-----------TT-
gi|50033 : -C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-C---CA-CTG--T--AG---AGA-A----G--A-CA--T--------CT-T-T-----T-------------AATG-AT-TA----AT-TT-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCATTTT--AA-A----AA-T--GTC----TA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-A---CTTAAA-T---GCCC-AT-G--A--TCA-C------------GTGTGT-TG-CTT-GCCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-T-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-
gi|50035 : -ACCA---AAAA-TGGAGACTGAAAA--T-TTCTCA-CT---C--AGGTAAGA-G----G--A-CA--TGTGAGCATTTAT-T-----T-------------AATGTAT-TAAGATGT-TTCTT---A--CG-GTAA-TGGCA------C-AA-T-TTATA---A--AA-A---TAA-T---TG----TA-TAT-----------TA-ATTG-A-AA-AT-AGT---AC-ACA--A-C-AG-AA-GA-AGTATTTATAGT---GTCC-GT-TTTA--TAA-C------------GTA-GC-TG-CTA-GCT--G--AA-AT--G-----G-TC-TGA-G-AT-G-G-C--T---TGG---AAGCAT-T-GCC--A-TC-T----C-C-A--GA--GG--A-------------AA-TTAT-T-C-TGGG--C--AA----A-TA--G-G-------A-TTAA-A---------CT-TCC-AA-----TT-TG---TA---C-CAT-ACT-A--CT----C----C----AA---A---AAA--A---A-TAAATTTC-CTAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATCGGAA-----G--TTC--TGG------A--AAT-----CC---TA-AA-CTATCATACAC-GTG--CCA-A-A-T----T-----G-TTA-T-A----G-----T--CAC----T-T-AT----TCT--------TAGTTC-T-CGAA------GA-TA-TT--TTTTGG-CA-TTCAATATCGAAA-CA-T-GCTG-TT-TCGA---ATT-TA--CC-G---T-TGT--A-ATAGATG-AATAGTACAGG-GTA--C-----GCGCACCGAG-A-
gi|50036 : AAA-TTAA---TGAAAA--T-T---CA-CTT--C--TA---AGA-A---------CA--T--------TT-T-T-----T-----------------------------------------TT-ACCA-T--CAA-T---C-AA-T-TT-CA---A--AA-A---TAA-T---TC----TT--AT-----------TT--TT--A-AA-AT-AT----AC-ACA--A-C-A------------------------TC--------A--TCA-C------------ATTTTC-TT-CTT---CCGG--AA-AT--T-----A--T-CAA-T-AT-T-T-C--C---CA----AAGCACCT-TCC--A-TC-C----T-T-A--AA--A---A-------------AC-TT-C-T-T-G--G--CCAAA----A-AA--A-T-------A-TGTA-A-A------CCT-ACT-AA-----TT------GACCCCGCAT-CTC-A--CT----C----A----AA---G--AAAA--C-----T---TT-C-CCA-----TA--TA--A-----------CA----C-AA-ATC--AA-----G--TTC--TT-C-A-A-ACGAAT-----CC---TA-AC-CTTT-CAACTA-G-A--CC--A-A-T----T---G-G-----C-A----AG---T-----C----T-TTAT----TC---------TA--TC---C-AA-------A-TA-----TT---G-CA-TCCAAT----GAA-CA-T--CTA-TC-T------AC--TA--CC-------T-T--A-A-AC-TGTAA-AGTAG--A-ATAACC-----CCG--CCATA-A-TTTC-A-AGC-CTT-CCCTC
gi|50034 : AA--T-G---CA---A--C--AG---AGA-ACAAAA--A-CA--T--------TT-T-TCTCCTT-------------AATG-ATACA----GT-TT-TTTTTGTCCC-ACC--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---C--AA-AAGATAA-T--GTC----TT-TATATGTAAATATATT-AGCG-ATAA-AT-AGTACTAC-ATATCC-C-A--TA-GG-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TTA-CCATCTGTAATTTATG-GC-GG-CTT-GCCTGG--AA-AT--GAATTCG-GT-CAG-A-AT-A-G-C--A---TGATGAAATCAGCT-GCCCAA-TC-CCTCAC-G-ATCGA--GG--ACGACGGACCACCCAT-TT-C-T-C-T--G--C--AG----G-AAATG-GAGCTCATA-CGAACA-AATTGACCCT-GAC-AGCTATTTT-TT---GA-CTC-CAT-CTC-ACTCT----C----C----AA---A--CAAA--A---A-A---ATTA-TCAGTTATTA--CA--AGACTGAACTACTA----C-AT-CTC--AACTGAGG--CTT--TT-C-A-ATA--AATGATGCCA---TATAC-CTTTCCAACAA-G-AT-CTA-A-A-TCTCCT---G-GATC--T-ACTTTGG---TT--CACCGAAT-TGAT----TCAACAAATGATA--TT-C-T-AACAGAACGA-TA--T--TT---G-CA-TCCAATAT-GAAACCACT-GCTATTT-TTCG---A
gi|50037 : taccagaaagaaccccataggttgaaccagaaattaccTG--T--AG---AGA-G----G--G-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TT-CT---G--TT-ACCA-TGACAA-T---C-AA-T-TTTCA---T--TA-A---TAA-T--ATC----TC-TAT-----------TT-
gi|50038 : T-T-T-----T-------------AATG-AT-CA----AT-TC-TT---G--TT-ACCA-TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA------AA-A---TAA-T--AT-----TT-TAT-----------TTGATTG-A-AA-ATAAG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ATGTGC-TG-CTT-GCCT-----------------G-GT-CGG-G-AT-T-G-C--C---TG----AA-CAACT-GCC--A-TC-C----T-G-A--GA---G--A-------------AT-TT-CTT-C-T--G--C--AA----A-AA--G-G-------ATTGAA-A-A------TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----CA-------AAA--T---T-T---TTTC-CCAG----TA--TA--A--------AGACAT---T-AT-AGC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAATAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA---A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------T---TC-T-C-CA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TTATTTG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-TTA--------CCG--CCAAGAA-AGTC-A-AGA-TGT-CCCTC
gi|50039 : -T-----T-------------AACG-AT-CA-------TT-TT---G--TT-ACCG-GAGCAA-CTCGC-AG-TGTTTCA---T--AATA---T-------TC----TTGTTT-----------TT-AGTGTG-AA-AT-AG----AC-AAA--A-C-A--AA----A---TCTATA-T---GTCC-AT-G--A--TAATC------------ATGTGC-TG-CTT-G-CTGG--AAGAT--G-----G-GT-CGA-G-ATAT-G-CTTC---CG-----AGCACTT-CTC--AGTT-C----T-G-A-------G--G-------------AA-TT-T-T-C-T--GGTC--AA----ATAA--GAG-------A-TG-A-A-A------CCT-GCC-AT-----TT-TT---G-CCTC-CATACTC-A--CA----CT---C----AA---AGTGAAA--T---ATT---TTTT-CCAT----TATTTG--A--------TGACA----T-ATGATC--AA-----G--TTC--TTGT-GCG-A--AAT-----C----TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CCA-AGA-T----T-----G-TCA-T-A----GG---TTTCC-C----T-TAAT----TC---------TAG-TC-T-C-AA------GA-TA-TTTCTT---G-CA-TT-AATAT-GAAC-TA-T-GATATTT-TTCGACTACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-GGT-GC-A-ATA--C-----CCG--CCGAG---AGTC-ATAGC-TGTGCCCTC
gi|50040 : AA-T--GTCATACTG-TTT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AA-ACA--A-C-A--AC-GA-A---TTTGTA-T---GTCC-AT-G--A--TCA-C------------ATGTGT-TG-CTT-GCCTTG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----AAGCACCT-G
gi|50041 : T-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-AC--TTTA-A-T---TCCC-AT-G--A--TCA-C------------GTGTGC-TG-CTT-GTCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-A-AT-T-T-C--C---TG----AAGCACCT-GCC--A-TC-C----T-G-c
gi|50042 : C-ACA--GGC-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-G--A--TTA-C------------A--TGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--------G-GC-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG----ACGCACCT-GCC--
gi|50043 : TCC-AT-G--A--TGA-C------------ATGTGC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-
gi|50044 : A-C------------CTGTTC-TG-CTT-GCCTAG--AA-AT--G-----G-GT-TGA-A-AT-T-C-C--C---TG----AAGCA
gi|50045 : -G-AT-T-G-C--C---TG----AAA-ATCT-GCCA-A-TC-C----T-G-A--GA--GG--A-------------TA-TT-T-T-C-T--G--C--AA----A-AA--G-GA------A-TGAA-A-A------TCT-ACCAAA-----TT-TT---GA-CCC-CAT-CTCGG--CT----C----A----AA---A--AAAA--
gi|50046 : --C--AA----A-AA--G-G-------A-TGAA-A-A------CCT-ACC-AA-----TT-AT---GACCAC-CAT-CTC-A--CG----C----C----AA---A--GAAA--A---A-T---TTTC-TTAG----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTA--CTGC-A-A-A--ATT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACGA-G-G--CCA-aaaaaaaaaaaaataaataataaataaaataataaaatcccagtaatgacatatatcaattctttgtaaaaatcctaacgctttccaacaaggcaaattggtcatagattccttgcttcgtactcgggatattttggcatcaatatgaaacatgctatttttcgactgtaccgtttaagtgaaagaagaatttacccgagaagtcaagctatgtcctc
gi|50047 : T-CTC-A--CT----C----C----AA---A--GAAA--A---A-AA--TTGTTCCAT----TA--TA--A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AAT-----CC---TA-AC-CTTTCCAACGA-A-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-G-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAATAT-GAAA-TA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TC--CC-G---T-T-T--A-A-TG-TG-AA-AGTAG--A-GTA--C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-A
gi|50045 : C-CCAG----TA------A--------TGACA----T-AT-ATC--AA-----T--TCT--TTGT-A-A-A--AAT-----CC---TA-ACGCTTTCCAACAA-G-G--C-A-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GA---TT--C-C----T-TGCT----TCG--------TA---C-T-C-GG------GA-TA-TT--TT---GGCA-T-CAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACTGTA--CC-G---T-T-T----A-AG-TG-AA-AGAAGA-ATTTA--C-----CCG-----AG-A-AGTC-A-AGC-TATGTCCTC
gi|50048 : gattgcctgaaaatctgccaatcctgagaggatattttctgcaaaaaggaatgaaaatctaccaaattttgaccccatctcggctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaataataaataaaataataaaatG----TA--TA--A--------TGAAA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC-A-A-A--AGT-----TC---TA-AC-CTTTTGAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-CAA-T-G----GG---TT--C-T----A-TGAT----TC---------TC--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---G-CA-TTCAAT
gi|50049 : -CCTTCCAACAA-C-GAACCACG-A-T----TTTAG-ACTCG-T-A----GGAG-GT--C-C----T-TGATCCAGTC---------T---TC-T-C-AA------AA-GA-TT--TT---G-CA-TT-AATA------------------T-TTCA---ACT-TAAGTG-G---T-A-T--ATA-AG-TG-AA-AGTAGA-A-TTG--CAAAAACCA--C--AG-A-AGTC-A-ACC-TGA-CC
gi|50050 : CG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGTAGA-A-TTG--T-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGC-CCC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111 111111111111 111111111
lowQualScore : 2 2 22 1 1 1 1 333 22 1 555 1 77777 1 1 22 1 22 1 22 55555555 1 1 6666666666666666666 1 4 22 1 1 3 1 22 222 33 3 222 1 1 1 222222 1 222 1 55 4444 3 66666666666 1 1 1 1 1 7777 3 22 3 3 33 3 1 444 0 1 222 1 1 22 4 111111111111 22 1 1 1 1 22 1 22 33333 1 1 1 1 4 1 1 22 222 1 3333 1 33 3 1 5555 1 22 22 777777777 333 1 44 1 66666 1 66 1 22 1 1 3 7777777 22 1 44444 1 1 55555 1 222 3 1 1 22 3333 66666666 33 444 1 1 22 555 22 1 22 55 222 44444 6666 1 1 22 55555 22 22 1 1 44 3333 3333 1 1 1 1 1 33 1 1 1 3333 44444 3 1 1 3333 555 22 3 6666 1 3333 000000000 44 1 1 1 444444 1 1 22 666 5 1 1 1 1 8 1 222 1 44 1 333 1 1 44 1 1 1 1 1 1 1 66 1 44444 22 1 1 2 2 0 2 4
lowQualScore : . . .. . . . . ... .. . ... . ..... . . .. . .. . .. ........ . . ................... . . .. . . . . .. ... .. . ... . . . ...... . ... . .. .... . ........... . . . . . .... . .. . . .. . . ... . . ... . . .. . ............ .. . . . . .. . .. ..... . . . . . . . .. ... . .... . .. . . .... . .. .. ......... ... . .. . ..... . .. . .. . . . ....... .. . ..... . . ..... . ... . . . .. .... ........ .. ... . . .. ... .. . .. .. ... ..... .... . . .. ..... .. .. . . .. .... .... . . . . . .. . . . .... ..... . . . .... ... .. . .... . .... ......... .. . . . ...... . . .. ... . . . . . . . ... . .. . ... . . .. . . . . . . . .. . ..... .. . . . . . . .
lowQualScore : 0 0 66 8 8 8 7 000 44 7 444 7 99999 7 7 33 7 22 6 22 88888888 6 5 1111111111111111111 5 6 11 5 5 1 5 11 777 77 1 777 5 5 5 888888 5 777 5 00 6666 0 88888888888 4 5 5 5 5 5555 0 00 0 0 55 0 5 111 3 5 666 5 5 00 4 777777777777 88 4 4 4 4 00 4 00 66666 4 4 4 4 3 4 4 00 555 4 0000 5 77 2 6 2222 7 44 44 000000000 000 7 11 7 11111 7 99 7 33 7 7 3 1111111 33 7 22222 7 7 88888 7 999 3 6 6 22 4444 44444444 77 888 5 5 11 777 22 5 11 22 777 22222 9999 7 7 33 88888 33 33 7 7 66 5555 5555 7 7 6 6 6 88 6 7 7 5555 00000 3 7 7 5555 222 33 3 9999 7 5555 000000000 00 7 7 7 888888 7 7 33 222 0 7 7 7 7 7 7 999 7 88 7 000 7 7 11 7 7 8 8 8 8 8 77 9 88888 66 9 9 2 2 3 4 7
consensus : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
Reference ( family-454 ) : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50013 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---A-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAG--T-TTT-T-GCT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--C-T-----C-TG--C-A--GA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-AAA-C--A--TTTGC--CCAG-TA--TA--A---TGC-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CA-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-G-AGC-TGT-CCCTC
gi|50014 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-TT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-AA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AT-AT--G-----G-GT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----A--A---A-AAA-T--A--TGTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-A--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----AG---TT--C-C----T-TAAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTAA---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-C-AG-TG-AA-AAT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCGAA-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50015 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAA-CTC-C--CT----C----CAAAAA--A---A-AAA-A--A--ATTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATGT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACG-TA--CC-G---T-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-TGA-A-GTA-C-----ACG--GCGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50016 : AGGTCTC-A-AAC--T-GGCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--TTC----TT-TAT-----------CT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-ACA--------------------------T---GTCC-AT-GA--TCA-T------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-C-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--AT----G----A---AA--A---A-AAA-A--ACATTTCC--CCAG-TA--AA--A---TGA-----CAGATGT-AT-ATC--AA-----A--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---TCA-TCCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50017 : AGGTCTC-A-GAT--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-C-AGAA--G-AC--A-CA--T--------TT-T-T-----TTTT----------AATG-AT-CAA--T-TTT-TTGTA-A--CC---A--TGGCAAAC---C-AA-T-TT-CA---T--AG-A---TAA-T--GTC----TT-TAG-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TT-ATA-T---GTCC-AT--A--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CT--GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-GAA-A--A---TTTC--CCAGTTA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCG-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCAAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T-----G-TCA-TAA----GG---TT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TATTT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-GT-TTCG---ACT-TA--CT-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCA--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50018 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----A-------------AATA-AT-CAA--T-TTTTT-GTT-A--CC---A--TGGCAA-T---C-GA-T-TTTCA---T--AA-A---TAG-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-CA-AT-AG----AC-GCA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---CTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TT-CTT-GCCAGG--AA-AT--A-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---CG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAA-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GATCCC-CAT-TTC-A--CT----C----G---AA--A---G-AAACA--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CT-TA-AC-TTTTCCAACGA-G-G--CCA-C-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---CA--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TC--TT---GCA-TTCAATTT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-
gi|50019 : AGGTCTC-AGAAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAAATT-T---CA-C-T---G-T-AGA---A-GG--A-CAAAT--------TT-T-T-----T-------------AAAG-AT-CAA--T-TTT-T-GTTTA--CC---AA-TGGCAA-C---CCAA-T-TTT-A---T--AA-A---TAAAT--GTC----TC-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----ACCACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTAT--T---GTCCCAT-GA--TCAAC------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGAAG-AT-T-GGC--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----GGA--GA--GGA---------A---ATTT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------T-AA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CGC-A--TT----C----C---AA--A---AGAAA-A--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-------------AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAA-AA-G-G--CCA-A-A-T----T-----G-TCA-T-A-----G---TT--T-C----T-TGAT----TC---------TA--TCTT-C-AA------GA-TG-TT--TTG--GCATTTTAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-CAATCC-G---T-T-TTAA-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTCAA-AGC-TGC-CCCTC
gi|50020 : AGGTCTC-A-AAC--TTACCA-GGAAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----TT------------AATG-ATTCAA--T-TTT-TTGTT-A--CC---A--TGGCAA-C-----AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTA-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A---A--AA-GACA---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CT-----------A-CAT-GC-TG-CTCGGCCTGGAAAA-AT--G-----G-GTGCGA-G-AT-TGG-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--ACTC-CTC---G-A--GA--GGA---------A---A--T--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A--------CT-ACC-AAT----TT-TT---GACCCC-CAT--TC-A--CC----C------------------AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AT-----G--TTCCTTTGCA-C-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GGGTTCT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-T--CT--TT---GCAGTTCAA-GT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---TGT-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-AGATT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACCTTGT-CC
gi|50021 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-AGGA---TGAAAA--T-T---CAAC-G---G-T-AGAGGGA-GG--A--A--T--------TT-T-T-----TTAAAATGATTAATAACG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--C----A--TGGCAAAC---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTCC---TT-TAT-----------TA-ATTA-A-AA-AT-AG----ACCACA--AGC-A--AAAGA-A---TTTA-A-TCTGGTCC-AT-GA--TCAAC------------A-C-T-GC-TGGCTC-GCCTGG--AA--T--G-----G-TC-CGA-G-AT-T-G-C--T------A----AGCACCTTGCC--A-TC-C-------G--GA--GGA---------A---A-TT--T-TT----C-TG--C-A--AA-AAG-G---------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TTGTT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---G-AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----TGAT-A-C--AA--------TTC--TTGCA-A-AACA----AT-----C-TA-AC-CTTT-CAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--T-CA---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA-------A-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-G-AA-CA-TAGCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CCGG---T-T-TA-A-A-AG-TA-AA-AGTAAGA-A-GAT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50022 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TG-AAA--T-T---CT-C-T---G-T-AGAT--A-GGTCA-CA--T--------
gi|50023 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--TCT---CA-C-----G-TGAGAG--A-GG--ATCA--T--------TT-A-T-----T-------------AATG-ATCCAA--TGGTT-T-GTT-A--CC---A--TGG-AA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-TAGGTC----TTATAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AAGCT-AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GT-C-AT-GATCTCA-C------------A-CGT-GCATG-CTT-GCTTGG--AA-AT--G-----GCGT-CGA-GAAT-T-G-C--CTTGTG-A----AGCACCT-G-C--A-TCACT----G-A--GAAGGAA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--ATA-----CCT-A-C-AA-----TT-TTTTGGACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATT--CA-----GCTTTC--TTGCA-A-A--AAATCAT----CC-TA-AC-C-TTCCAACAAGG-G--CCA-A-ACT----T---GCG-TTATT-A----GG---TT--C-CT---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GATTA-TT--TT---GCA-TTCCATAT-GAAA--A-T-GCTA--T-TTCG---ACT-TA--CC-GTTTT-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-
gi|50024 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-TTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50025 : AAGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50026 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCT-G-AAAAATGGA---TGAAAA--T-TGC-CA-CAG---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-TTT-----T-------------AATG-AT-CAA----TTT-T-GTT-A--TC---A--TGGCAA-C---C-AATT-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AAGAT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA--A-A---TTTATA-T---GTCC-ATGGA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-ATGGG-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG------AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----CTTG--C-A--AA-AAG-A-T-------TGAA--A-A-----CCTGACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------A---A-AAA-A--A--TTTTC--CTAG-TA--TATGA---TGA-----CAT---T-AT-ATC--AA-----G---TC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CC--A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----TGTGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TT-AT--TT---GCATTTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACT-TC--CC-G-----T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A--TA-C-----GC---CCGAG-AGATTC-A-ACC-TGT-CC
gi|50027 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCC-C-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-C---C-C-GGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT-T-GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---C--AA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-GC-TGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-A--GG--GTC---------A---A-AT--T-T-----C-AA--C-G--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TTGAAAT----A---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTGTTT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50028 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCCCG-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-CCCCG---AGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT---GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---GCAAA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-G--CGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-G--GG--TCA---------A---A-TT--T-------C-AA--CGA--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TT----GATAAT---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AAA----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTG-TT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50029 : GGTCTC-A-AAC--T-ACAA-G-GATA-TGGA---TGAAAA--T-T---TG-C-T---G-C-AGTG--A-GA--T-CA--T--------CT-T-T-------------------AATG-AC-TAG--T-TTC-T-GTT-G--CT---A--TGACAA-G---T-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--ATC----AA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----AC-ACA--A-T-ATGAATGA-C---TTCAAA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CATG---------A-TGT-GC-TG-CTA-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGTCCCT-GCC--A-TT-TT----G--------GGA---------A---T-TT--T-TTGCTGT-TG--C-A--AA-AA----A-------TG--------------T-AAC--A-----TT-TT-----CCTCGCTT-GTG-A--TT----C----C---AAT-A---T-ATG-A--A--TATTT--ACAG-TA--TA--G---TGA-----CA----T-TT-TTC--AA-----G--TTC--TTCCA-A-A--A----AT----CC-TA-A--CGTTCCAACAG-G-G--CCA-A-A-T----C---T-G-CAA-A-A----TG---TT--C-C----T-TGAT----TC----------A--TT-TGC-AA------AA-TA-TT--GA---GCA-TC-----T-GCAG-CA---------T-TTCA---ATT-TT--TC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-CTG-T-----CTA--CCAAG-A-ATTC---ATC-TCC-CCCTC
gi|50030 : GATCTT-A-GAC--T-ACCA-A-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AAAG--A-GG--T-TA--T--------TC-A-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-T--TC---A--TGGCGA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---G
gi|50031 : GTCTCCA-AACCTT-ACCA-----AA-TGG----TGAAA-----T---TA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--T----A---GGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-AT-G-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T----TCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA--T--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-A---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----C-T-ACC-A-------T-TT---GACCCC---T-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-------TTTTC--CTAG-TA--TG--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TT---TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--T--T-C-AA------G---A-TT--TT---GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----GCG---CGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50032 : TC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TAAAAA--T-T---CA-C-A---G-T-AGAG--AAGG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-AAA--T-GTT-T-GTT-A--CA---A--TGACAA-C---C-AA-T-TTTCA---A--AA-A---TAA-A--GTC----TT-TAT-----------TT-
gi|50033 : C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-C---CA-C-T---G-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------CT-T-T-----T-------------AATG-AT-TAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCATTTT--AA-A----AA-T--GTC----TA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-A---CTTAAA-T---GCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GT-TG-CTT-GCCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-
gi|50034 : --A-CA--T--------TT-T-TCTCCTT-------------AATG-ATACAG--T-TTT-T-TTT-GTCCC---ACCTGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---C--AA-AAGATAA-T--GTC----TT-TATATGTAAATATATT-AGCG-ATAA-AT-AGTACTAC-ATATCC-C-A--TA-GG-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-CCATCTGTAATTTA-TG--GC-GG-CTT-GCCTGG--AA-AT--GAATTCG-GT-CAG-A-AT-A-G-C--A---TG-ATGAAATCAGCT-GCCCAA-TC-CCTCACG-ATCGA--GGACGACGGACCACCCA-TT--TCT-----C-TG--C-AGGAA-ATG-G-AGCTCATACGAACAA-ATTGACCCT-GAC-AGCTATTTT-TT---GACTCC--AT-CTC-ACTCT----C----C---AAACA---A-AAA-A--A--TTATCAGTTAT-TA--CA--AGACTGAACTACTA----C-AT-CTC--AACTGAGG--CTT--TT-CA-ATA--A----ATGATGCCATATAC-CTTTCCAACAA-G-AT-CTA-A-A-TCTCCT---G-GATC--T-ACTTTGG---TT--CACCGAAT-TGAT----TCAACAAATGATA--TT-C-T-AACAGAACGA-TA--T--TT---GCA-TCCAATAT-GAAACCACT-GCTATTT-TTCG---A
gi|50035 : taccagaaagaaccccataggttgaaccagaaattaccaatgcaacagagaacaaaa-ACCA---AAAA-TGGAGACTGAAAA--T-TTCTCA-C-TCAGG-T-A-AG--A-GG--A-CA--TGTGAGCATTTAT-T-----T-------------AATGTAT-TAAGAT-GTT-T-CTT-A--CGGTAA--TGGCA------C-AA-T-TTATA---A--AA-A---TAA-T---TG----TA-TAT-----------TA-ATTG-A-AA-AT-AGT---AC-ACA--A-C-AG-AA-GA-AGTATTTATAGT---GTCC-GT-T---TTA-T------------AACGTAGC-TG-CTA-GCT--G--AA-AT--G-----G-TC-TGA-G-AT-G-G-C--T---TGGA----AGCAT-T-GCC--A-TC-TC----C-A--GA--GGA---------A---A-TTA-T-T-----C-TGGGC-A--AA-TAG-G-A-------TTAA--A--------CT-TCC-AA-----TT-TG---TACC----AT-ACT-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-ATAA--ATTTC--CTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATCGGAA-----G--TTC--TGG-----A--A----AT----CC-TA-AA-CTATCATACAC-GTG--CCA-A-A-T----T-----G-TTA-T-A----G-----T--CAC----T-T-AT----TCT--------TAGTTC-T-CGAA------GA-TA-TT--TTTTGGCA-TTCAATATCGAAA-CA-T-GCTG-TT-TCGA---ATT-TA--CC-G---T-TGT--A-ATAGATG-AATAGT-ACAGG-GTA-C-----GCGCACCGAG-A-
gi|50036 : AAA-TTAA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---TCT-A-----A-GA--A-CA--T--------TT-T-T-----T-----------------------------------TT-A--CC---A--T--CAA-T---C-AA-T-TT-CA---A--AA-A---TAA-T---TC----TT--AT-----------TT--TT--A-AA-AT-AT----AC-ACA--A-C-A------------------------TC------A--TCA-C------------A-TTT-TC-TT-CTT---CCGG--AA-AT--T-----A--T-CAA-T-AT-T-T-C--C---CA-A----AGCACCT-TCC--A-TC-CT----T-A--AA----A---------A---A-CT--T-C-----T-TGGCC-A--AA-AAA-ATA-------TGTA--A-A-----CCT-ACT-AA-----TT------GACCCCGCAT-CTC-A--CT----C---------A--A---A-GAA-A--A--CTTTC--CCA--TA--TA--------A-----CA----C-AA-ATC--AA-----G--TTC--TT-CA-A-ACGA----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAACTA-G-A--CC--A-A-T----T---G-G-----C-A----AG---T-----C----T-TTAT----TC---------TA--TC---C-AA-------A-TA-----TT---GCA-TCCAAT----GAA-CA-T--CTA-TC-T------AC--TA--CC-------T-T--A-A-AC-TGTAA-AGT-AGA-A-TAACC-----CCG--CCATA-A-TTTC-A-AGC-CTT-CCCTC
gi|50037 : -T---G-T-AGAG--A-GG--G-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTC-T-GTT-A--CC---A--TGACAA-T---C-AA-T-TTTCA---T--TA-A---TAA-T--ATC----TC-TAT-----------TT-
gi|50038 : T-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TCT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA------AA-A---TAA-T--AT-----TT-TAT-----------TTGATTG-A-AA-ATAAG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCT-----------------G-GT-CGG-G-AT-T-G-C--C---TG-A----A-CAACT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-----------A---A-TTTCT-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-AT------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------C---A-AAA-T--T--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---AGA-----CAT---T-AT-AGC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAATAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA---A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------T---TC-T-C-CA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TTATTTG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-------CCG--CCAAGAA-AGTC-A-AGA-TGT-CCCTC
gi|50039 : -T-----T-------------AACG-AT-CA-----TTT-T-GTT-A--CC---G--GAGCAA-CTCGC-AG-TGTTTCA---T--AATA---T-------TC----TTGTTT-----------TT-AGTGTG-AA-AT-AG----AC-AAA--A-C-A--AA----A---TCTATA-T---GTCC-AT-GA--TAATC------------A-TGT-GC-TG-CTT-G-CTGG--AAGAT--G-----G-GT-CGA-G-ATAT-G-CTTC---CG------AGCACTT-CTC--AGTT-CT----G-A-------GG---------A---A-TT--T-T-----C-TGGTC-A--AATAAGAG-A-------TG-A--A-A-----CCT-GCC-AT-----TT-TT---G-CCTC-CATACTC-A--CA----CT---C---AA--AGTGA-AAT-A--T--TTTTT--CCAT-TATTTG--A---TGA-----CA----T-ATGATC--AA-----G--TTC--TTGTGCG-A--A----AT-----C-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CCA-AGA-T----T-----G-TCA-T-A----GG---TTTCC-C----T-TAAT----TC---------TAG-TC-T-C-AA------GA-TA-TTTCTT---GCA-TT-AATAT-GAAC-TA-T-GATATTT-TTCGACTACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-GGT--GC-A-ATA-C-----CCG--CCGAG---AGTC-ATAGC-TGTGCCCTC
gi|50040 : AA-T--GTCATACTG-TTT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AA-ACA--A-C-A--AC-GA-A---TTTGTA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GT-TG-CTT-GCCTTG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GC
gi|50041 : T-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-AC--TTTA-A-T---TCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GC-TG-CTT-GTCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-A-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-
gi|50042 : C-ACA--GGC-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-C------------A---T-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--------G-GC-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----CGCACCT-GCC--
gi|50043 : TCC-AT-GA--TGA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-
gi|50044 : GT-TC-TG-CTT-GCCTAG--AA-AT--G-----G-GT-TGA-A-AT-T-C-C--C---TG-A----AGCA
gi|50045 : acct-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AA-ATCT-GCCA-A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------T---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-GAA-------TGAA--A-A-----TCT-ACCAAA-----TT-TT---GA-CCC-CAT-CTCGG--CT----C----A---AA--A---A-AAA-A--A--
gi|50045 : --A---A-TAA-A--A--T---C--CCAG-TA------A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----T--TCT--TTGTA-A-A--A----AT----CC-TA-ACGCTTTCCAACAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GA---TT--C-C----T-TGCT----TCG--------TA---C-T-C-GG------GA-TA-TT--TTG--GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACTGTA--CC-G---T-T-T----A-AG-TG-AA-AGA-AGA-ATTTA-C----------CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TATGTCCTCaaaaaaaaaaataaataataaataaaataataaaatcccagtaatgacatatatcaattctttgtaaaaatcctaacgctttccaacaaggcaaattggtcatagattccttgcttcgtactcgggatattttggcatcaatatgaaacatgctatttttcgactgtaccgtttaagtgaaagaagaatttacccgagaagtcaagctatgtcctc
gi|50046 : gattgcctgaaaatctgccaatcctgagaggatattttctgcaaaaaggaatgaaaatctaccaaattttgaccccatctcggctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaataataaataaaat--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-AT---GACCAC-CAT-CTC-A--CG----C----C---AA--A---G-AAA-A--A--TTTTC--TTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTA--CTGCA-A-A--A----TT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-G-G--CCA-
gi|50047 : T-CTC-A--CT----C----C---AA--AGA-A-AAA-A--A--TTGTT--CCAT-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-A-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-G-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-TA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TC--CC-G---T-T-T--A-A-TG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-A
gi|50048 : G-TA--TA--A---TGA-----AA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----GT----TC-TA-AC-CTTTTGAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-CAA-T-G----GG---TT--C-T----A-TGAT----TC---------TC--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAAT
gi|50049 : -CCTTCCAACAA-C-GAACCACG-A-T----TTTAG-ACTCG-T-A----GGAG-GT--C-C----T-TGATCCAGTC---------T---TC-T-C-AA------AA-GA-TT--TT---GCA-TT-AATA------------------T-TTCA---ACT-TAAGTG-G---T-A-T--ATA-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-CAAAAACCA--C--AG-A-AGTC-A-ACC-TGA-CC
gi|50050 : CG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-T-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGC-CCC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111 111111111111 111111111
lowQualScore : 2 2 22 1 1 1 1 333 22 1 555 1 77777 1 1 22 1 22 1 22 55555555 1 1 6666666666666666666 1 4 22 1 1 3 1 22 222 33 3 222 1 1 1 222222 1 222 1 55 4444 3 66666666666 1 1 1 1 1 7777 3 22 3 3 33 3 1 444 0 1 222 1 1 22 4 111111111111 22 1 1 1 1 22 1 22 33333 1 1 1 1 4 1 1 22 222 1 3333 1 33 3 1 5555 1 22 22 777777777 333 1 44 1 66666 1 66 1 22 1 1 3 7777777 22 1 44444 1 1 55555 1 222 3 1 1 22 3333 66666666 33 444 1 1 22 555 22 1 22 55 222 44444 6666 1 1 22 55555 22 22 1 1 44 3333 3333 1 1 1 1 1 33 1 1 1 3333 44444 3 1 1 3333 555 22 3 6666 1 3333 000000000 44 1 1 1 444444 1 1 22 666 5 1 1 1 1 8 1 222 1 44 1 333 1 1 44 1 1 1 1 1 1 1 66 1 44444 22 1 1 2 2 0 2 4
lowQualScore : . . .. . . . . ... .. . ... . ..... . . .. . .. . .. ........ . . ................... . . .. . . . . .. ... .. . ... . . . ...... . ... . .. .... . ........... . . . . . .... . .. . . .. . . ... . . ... . . .. . ............ .. . . . . .. . .. ..... . . . . . . . .. ... . .... . .. . . .... . .. .. ......... ... . .. . ..... . .. . .. . . . ....... .. . ..... . . ..... . ... . . . .. .... ........ .. ... . . .. ... .. . .. .. ... ..... .... . . .. ..... .. .. . . .. .... .... . . . . . .. . . . .... ..... . . . .... ... .. . .... . .... ......... .. . . . ...... . . .. ... . . . . . . . ... . .. . ... . . .. . . . . . . . .. . ..... .. . . . . . . .
lowQualScore : 0 0 66 8 8 8 7 000 44 7 444 7 99999 7 7 33 7 22 6 22 88888888 6 5 1111111111111111111 5 6 11 5 5 1 5 11 777 77 1 777 5 5 5 888888 5 777 5 00 6666 0 88888888888 4 5 5 5 5 5555 0 00 0 0 55 0 5 111 3 5 666 5 5 00 4 777777777777 88 4 4 4 4 00 4 00 66666 4 4 4 4 3 4 4 00 555 4 0000 5 77 2 6 2222 7 44 44 000000000 000 7 11 7 11111 7 99 7 33 7 7 3 1111111 33 7 22222 7 7 88888 7 999 3 6 6 22 4444 44444444 77 888 5 5 11 777 22 5 11 22 777 22222 9999 7 7 33 88888 33 33 7 7 66 5555 5555 7 7 6 6 6 88 6 7 7 5555 00000 3 7 7 5555 222 33 3 9999 7 5555 000000000 00 7 7 7 888888 7 7 33 222 0 7 7 7 7 7 7 999 7 88 7 000 7 7 11 7 7 8 8 8 8 8 77 9 88888 66 9 9 2 2 3 4 7
consensus : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
Reference ( family-454 ) : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50013 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---A-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAG--T-TTT-T-GCT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--C-T-----C-TG--C-A--GA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-AAA-C--A--TTTGC--CCAG-TA--TA--A---TGC-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CA-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-G-AGC-TGT-CCCTC
gi|50014 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-TT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-AA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AT-AT--G-----G-GT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----A--A---A-AAA-T--A--TGTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-A--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----AG---TT--C-C----T-TAAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTAA---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-C-AG-TG-AA-AAT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCGAA-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50015 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAA-CTC-C--CT----C----CAAAAA--A---A-AAA-A--A--ATTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATGT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACG-TA--CC-G---T-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-TGA-A-GTA-C-----ACG--GCGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50016 : AGGTCTC-A-AAC--T-GGCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--TTC----TT-TAT-----------CT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-ACA--------------------------T---GTCC-AT-GA--TCA-T------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-C-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--AT----G----A---AA--A---A-AAA-A--ACATTTCC--CCAG-TA--AA--A---TGA-----CAGATGT-AT-ATC--AA-----A--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---TCA-TCCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50017 : AGGTCTC-A-GAT--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-C-AGAA--G-AC--A-CA--T--------TT-T-T-----TTTT----------AATG-AT-CAA--T-TTT-TTGTA-A--CC---A--TGGCAAAC---C-AA-T-TT-CA---T--AG-A---TAA-T--GTC----TT-TAG-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TT-ATA-T---GTCC-AT--A--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CT--GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-GAA-A--A---TTTC--CCAGTTA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCG-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCAAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T-----G-TCA-TAA----GG---TT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TATTT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-GT-TTCG---ACT-TA--CT-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCA--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50018 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----A-------------AATA-AT-CAA--T-TTTTT-GTT-A--CC---A--TGGCAA-T---C-GA-T-TTTCA---T--AA-A---TAG-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-CA-AT-AG----AC-GCA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---CTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TT-CTT-GCCAGG--AA-AT--A-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---CG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAA-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GATCCC-CAT-TTC-A--CT----C----G---AA--A---G-AAACA--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CT-TA-AC-TTTTCCAACGA-G-G--CCA-C-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---CA--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TC--TT---GCA-TTCAATTT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-
gi|50019 : AGGTCTC-AGAAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAAATT-T---CA-C-T---G-T-AGA---A-GG--A-CAAAT--------TT-T-T-----T-------------AAAG-AT-CAA--T-TTT-T-GTTTA--CC---AA-TGGCAA-C---CCAA-T-TTT-A---T--AA-A---TAAAT--GTC----TC-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----ACCACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTAT--T---GTCCCAT-GA--TCAAC------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGAAG-AT-T-GGC--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----GGA--GA--GGA---------A---ATTT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------T-AA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CGC-A--TT----C----C---AA--A---AGAAA-A--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-------------AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAA-AA-G-G--CCA-A-A-T----T-----G-TCA-T-A-----G---TT--T-C----T-TGAT----TC---------TA--TCTT-C-AA------GA-TG-TT--TTG--GCATTTTAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-CAATCC-G---T-T-TTAA-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTCAA-AGC-TGC-CCCTC
gi|50020 : AGGTCTC-A-AAC--TTACCA-GGAAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----TT------------AATG-ATTCAA--T-TTT-TTGTT-A--CC---A--TGGCAA-C-----AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTA-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A---A--AA-GACA---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CT-----------A-CAT-GC-TG-CTCGGCCTGGAAAA-AT--G-----G-GTGCGA-G-AT-TGG-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--ACTC-CTC---G-A--GA--GGA---------A---A--T--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A--------CT-ACC-AAT----TT-TT---GACCCC-CAT--TC-A--CC----C------------------AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AT-----G--TTCCTTTGCA-C-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GGGTTCT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-T--CT--TT---GCAGTTCAA-GT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---TGT-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-AGATT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACCTTGT-CC
gi|50021 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-AGGA---TGAAAA--T-T---CAAC-G---G-T-AGAGGGA-GG--A--A--T--------TT-T-T-----TTAAAATGATTAATAACG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--C----A--TGGCAAAC---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTCC---TT-TAT-----------TA-ATTA-A-AA-AT-AG----ACCACA--AGC-A--AAAGA-A---TTTA-A-TCTGGTCC-AT-GA--TCAAC------------A-C-T-GC-TGGCTC-GCCTGG--AA--T--G-----G-TC-CGA-G-AT-T-G-C--T------A----AGCACCTTGCC--A-TC-C-------G--GA--GGA---------A---A-TT--T-TT----C-TG--C-A--AA-AAG-G---------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TTGTT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---G-AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----TGAT-A-C--AA--------TTC--TTGCA-A-AACA----AT-----C-TA-AC-CTTT-CAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--T-CA---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA-------A-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-G-AA-CA-TAGCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CCGG---T-T-TA-A-A-AG-TA-AA-AGTAAGA-A-GAT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50022 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TG-AAA--T-T---CT-C-T---G-T-AGAT--A-GGTCA-CA--T--------
gi|50023 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--TCT---CA-C-----G-TGAGAG--A-GG--ATCA--T--------TT-A-T-----T-------------AATG-ATCCAA--TGGTT-T-GTT-A--CC---A--TGG-AA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-TAGGTC----TTATAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AAGCT-AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GT-C-AT-GATCTCA-C------------A-CGT-GCATG-CTT-GCTTGG--AA-AT--G-----GCGT-CGA-GAAT-T-G-C--CTTGTG-A----AGCACCT-G-C--A-TCACT----G-A--GAAGGAA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--ATA-----CCT-A-C-AA-----TT-TTTTGGACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATT--CA-----GCTTTC--TTGCA-A-A--AAATCAT----CC-TA-AC-C-TTCCAACAAGG-G--CCA-A-ACT----T---GCG-TTATT-A----GG---TT--C-CT---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GATTA-TT--TT---GCA-TTCCATAT-GAAA--A-T-GCTA--T-TTCG---ACT-TA--CC-GTTTT-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-
gi|50024 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-TTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50025 : AAGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50026 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCT-G-AAAAATGGA---TGAAAA--T-TGC-CA-CAG---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-TTT-----T-------------AATG-AT-CAA----TTT-T-GTT-A--TC---A--TGGCAA-C---C-AATT-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AAGAT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA--A-A---TTTATA-T---GTCC-ATGGA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-ATGGG-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG------AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----CTTG--C-A--AA-AAG-A-T-------TGAA--A-A-----CCTGACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------A---A-AAA-A--A--TTTTC--CTAG-TA--TATGA---TGA-----CAT---T-AT-ATC--AA-----G---TC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CC--A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----TGTGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TT-AT--TT---GCATTTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACT-TC--CC-G-----T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A--TA-C-----GC---CCGAG-AGATTC-A-ACC-TGT-CC
gi|50027 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCC-C-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-C---C-C-GGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT-T-GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---C--AA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-GC-TGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-A--GG--GTC---------A---A-AT--T-T-----C-AA--C-G--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TTGAAAT----A---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTGTTT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50028 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCCCG-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-CCCCG---AGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT---GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---GCAAA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-G--CGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-G--GG--TCA---------A---A-TT--T-------C-AA--CGA--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TT----GATAAT---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AAA----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTG-TT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50029 : GGTCTC-A-AAC--T-ACAA-G-GATA-TGGA---TGAAAA--T-T---TG-C-T---G-C-AGTG--A-GA--T-CA--T--------CT-T-T-------------------AATG-AC-TAG--T-TTC-T-GTT-G--CT---A--TGACAA-G---T-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--ATC----AA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----AC-ACA--A-T-ATGAATGA-C---TTCAAA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CATG---------A-TGT-GC-TG-CTA-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGTCCCT-GCC--A-TT-TT----G--------GGA---------A---T-TT--T-TTGCTGT-TG--C-A--AA-AA----A-------TG--------------T-AAC--A-----TT-TT-----CCTCGCTT-GTG-A--TT----C----C---AAT-A---T-ATG-A--A--TATTT--ACAG-TA--TA--G---TGA-----CA----T-TT-TTC--AA-----G--TTC--TTCCA-A-A--A----AT----CC-TA-A--CGTTCCAACAG-G-G--CCA-A-A-T----C---T-G-CAA-A-A----TG---TT--C-C----T-TGAT----TC----------A--TT-TGC-AA------AA-TA-TT--GA---GCA-TC-----T-GCAG-CA---------T-TTCA---ATT-TT--TC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-CTG-T-----CTA--CCAAG-A-ATTC---ATC-TCC-CCCTC
gi|50030 : GATCTT-A-GAC--T-ACCA-A-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AAAG--A-GG--T-TA--T--------TC-A-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-T--TC---A--TGGCGA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---G
gi|50031 : GTCTCCA-AACCTT-ACCA-----AA-TGG----TGAAA-----T---TA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--T----A---GGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-AT-G-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T----TCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA--T--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-A---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----C-T-ACC-A-------T-TT---GACCCC---T-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-------TTTTC--CTAG-TA--TG--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TT---TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--T--T-C-AA------G---A-TT--TT---GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----GCG---CGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50032 : TC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TAAAAA--T-T---CA-C-A---G-T-AGAG--AAGG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-AAA--T-GTT-T-GTT-A--CA---A--TGACAA-C---C-AA-T-TTTCA---A--AA-A---TAA-A--GTC----TT-TAT-----------TT-
gi|50033 : C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-C---CA-C-T---G-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------CT-T-T-----T-------------AATG-AT-TAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCATTTT--AA-A----AA-T--GTC----TA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-A---CTTAAA-T---GCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GT-TG-CTT-GCCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-
gi|50034 : --A-CA--T--------TT-T-TCTCCTT-------------AATG-ATACAG--T-TTT-T-TTT-GTCCC---ACCTGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---C--AA-AAGATAA-T--GTC----TT-TATATGTAAATATATT-AGCG-ATAA-AT-AGTACTAC-ATATCC-C-A--TA-GG-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-CCATCTGTAATTTA-TG--GC-GG-CTT-GCCTGG--AA-AT--GAATTCG-GT-CAG-A-AT-A-G-C--A---TG-ATGAAATCAGCT-GCCCAA-TC-CCTCACG-ATCGA--GGACGACGGACCACCCA-TT--TCT-----C-TG--C-AGGAA-ATG-G-AGCTCATACGAACAA-ATTGACCCT-GAC-AGCTATTTT-TT---GACTCC--AT-CTC-ACTCT----C----C---AAACA---A-AAA-A--A--TTATCAGTTAT-TA--CA--AGACTGAACTACTA----C-AT-CTC--AACTGAGG--CTT--TT-CA-ATA--A----ATGATGCCATATAC-CTTTCCAACAA-G-AT-CTA-A-A-TCTCCT---G-GATC--T-ACTTTGG---TT--CACCGAAT-TGAT----TCAACAAATGATA--TT-C-T-AACAGAACGA-TA--T--TT---GCA-TCCAATAT-GAAACCACT-GCTATTT-TTCG---A
gi|50035 : taccagaaagaaccccataggttgaaccagaaattaccaatgcaacagagaacaaaa-ACCA---AAAA-TGGAGACTGAAAA--T-TTCTCA-C-TCAGG-T-A-AG--A-GG--A-CA--TGTGAGCATTTAT-T-----T-------------AATGTAT-TAAGAT-GTT-T-CTT-A--CGGTAA--TGGCA------C-AA-T-TTATA---A--AA-A---TAA-T---TG----TA-TAT-----------TA-ATTG-A-AA-AT-AGT---AC-ACA--A-C-AG-AA-GA-AGTATTTATAGT---GTCC-GT-T---TTA-T------------AACGTAGC-TG-CTA-GCT--G--AA-AT--G-----G-TC-TGA-G-AT-G-G-C--T---TGGA----AGCAT-T-GCC--A-TC-TC----C-A--GA--GGA---------A---A-TTA-T-T-----C-TGGGC-A--AA-TAG-G-A-------TTAA--A--------CT-TCC-AA-----TT-TG---TACC----AT-ACT-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-ATAA--ATTTC--CTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATCGGAA-----G--TTC--TGG-----A--A----AT----CC-TA-AA-CTATCATACAC-GTG--CCA-A-A-T----T-----G-TTA-T-A----G-----T--CAC----T-T-AT----TCT--------TAGTTC-T-CGAA------GA-TA-TT--TTTTGGCA-TTCAATATCGAAA-CA-T-GCTG-TT-TCGA---ATT-TA--CC-G---T-TGT--A-ATAGATG-AATAGT-ACAGG-GTA-C-----GCGCACCGAG-A-
gi|50036 : AAA-TTAA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---TCT-A-----A-GA--A-CA--T--------TT-T-T-----T-----------------------------------TT-A--CC---A--T--CAA-T---C-AA-T-TT-CA---A--AA-A---TAA-T---TC----TT--AT-----------TT--TT--A-AA-AT-AT----AC-ACA--A-C-A------------------------TC------A--TCA-C------------A-TTT-TC-TT-CTT---CCGG--AA-AT--T-----A--T-CAA-T-AT-T-T-C--C---CA-A----AGCACCT-TCC--A-TC-CT----T-A--AA----A---------A---A-CT--T-C-----T-TGGCC-A--AA-AAA-ATA-------TGTA--A-A-----CCT-ACT-AA-----TT------GACCCCGCAT-CTC-A--CT----C---------A--A---A-GAA-A--A--CTTTC--CCA--TA--TA--------A-----CA----C-AA-ATC--AA-----G--TTC--TT-CA-A-ACGA----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAACTA-G-A--CC--A-A-T----T---G-G-----C-A----AG---T-----C----T-TTAT----TC---------TA--TC---C-AA-------A-TA-----TT---GCA-TCCAAT----GAA-CA-T--CTA-TC-T------AC--TA--CC-------T-T--A-A-AC-TGTAA-AGT-AGA-A-TAACC-----CCG--CCATA-A-TTTC-A-AGC-CTT-CCCTC
gi|50037 : -T---G-T-AGAG--A-GG--G-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTC-T-GTT-A--CC---A--TGACAA-T---C-AA-T-TTTCA---T--TA-A---TAA-T--ATC----TC-TAT-----------TT-
gi|50038 : T-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TCT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA------AA-A---TAA-T--AT-----TT-TAT-----------TTGATTG-A-AA-ATAAG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCT-----------------G-GT-CGG-G-AT-T-G-C--C---TG-A----A-CAACT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-----------A---A-TTTCT-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-AT------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------C---A-AAA-T--T--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---AGA-----CAT---T-AT-AGC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAATAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA---A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------T---TC-T-C-CA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TTATTTG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-------CCG--CCAAGAA-AGTC-A-AGA-TGT-CCCTC
gi|50039 : -T-----T-------------AACG-AT-CA-----TTT-T-GTT-A--CC---G--GAGCAA-CTCGC-AG-TGTTTCA---T--AATA---T-------TC----TTGTTT-----------TT-AGTGTG-AA-AT-AG----AC-AAA--A-C-A--AA----A---TCTATA-T---GTCC-AT-GA--TAATC------------A-TGT-GC-TG-CTT-G-CTGG--AAGAT--G-----G-GT-CGA-G-ATAT-G-CTTC---CG------AGCACTT-CTC--AGTT-CT----G-A-------GG---------A---A-TT--T-T-----C-TGGTC-A--AATAAGAG-A-------TG-A--A-A-----CCT-GCC-AT-----TT-TT---G-CCTC-CATACTC-A--CA----CT---C---AA--AGTGA-AAT-A--T--TTTTT--CCAT-TATTTG--A---TGA-----CA----T-ATGATC--AA-----G--TTC--TTGTGCG-A--A----AT-----C-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CCA-AGA-T----T-----G-TCA-T-A----GG---TTTCC-C----T-TAAT----TC---------TAG-TC-T-C-AA------GA-TA-TTTCTT---GCA-TT-AATAT-GAAC-TA-T-GATATTT-TTCGACTACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-GGT--GC-A-ATA-C-----CCG--CCGAG---AGTC-ATAGC-TGTGCCCTC
gi|50040 : AA-T--GTCATACTG-TTT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AA-ACA--A-C-A--AC-GA-A---TTTGTA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GT-TG-CTT-GCCTTG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GC
gi|50041 : T-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-AC--TTTA-A-T---TCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GC-TG-CTT-GTCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-A-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-
gi|50042 : C-ACA--GGC-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-C------------A---T-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--------G-GC-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----CGCACCT-GCC--
gi|50043 : TCC-AT-GA--TGA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-
gi|50044 : GT-TC-TG-CTT-GCCTAG--AA-AT--G-----G-GT-TGA-A-AT-T-C-C--C---TG-A----AGCA
gi|50045 : acct-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AA-ATCT-GCCA-A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------T---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-GAA-------TGAA--A-A-----TCT-ACCAAA-----TT-TT---GA-CCC-CAT-CTCGG--CT----C----A---AA--A---A-AAA-A--A--
gi|50045 : --A---A-TAA-A--A--T---C--CCAG-TA------A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----T--TCT--TTGTA-A-A--A----AT----CC-TA-ACGCTTTCCAACAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GA---TT--C-C----T-TGCT----TCG--------TA---C-T-C-GG------GA-TA-TT--TTG--GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACTGTA--CC-G---T-T-T----A-AG-TG-AA-AGA-AGA-ATTTA-C----------CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TATGTCCTCaaaaaaaaaaataaataataaataaaataataaaatcccagtaatgacatatatcaattctttgtaaaaatcctaacgctttccaacaaggcaaattggtcatagattccttgcttcgtactcgggatattttggcatcaatatgaaacatgctatttttcgactgtaccgtttaagtgaaagaagaatttacccgagaagtcaagctatgtcctc
gi|50046 : gattgcctgaaaatctgccaatcctgagaggatattttctgcaaaaaggaatgaaaatctaccaaattttgaccccatctcggctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaataataaataaaat--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-AT---GACCAC-CAT-CTC-A--CG----C----C---AA--A---G-AAA-A--A--TTTTC--TTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTA--CTGCA-A-A--A----TT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-G-G--CCA-
gi|50047 : T-CTC-A--CT----C----C---AA--AGA-A-AAA-A--A--TTGTT--CCAT-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-A-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-G-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-TA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TC--CC-G---T-T-T--A-A-TG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-A
gi|50048 : G-TA--TA--A---TGA-----AA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----GT----TC-TA-AC-CTTTTGAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-CAA-T-G----GG---TT--C-T----A-TGAT----TC---------TC--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAAT
gi|50049 : -CCTTCCAACAA-C-GAACCACG-A-T----TTTAG-ACTCG-T-A----GGAG-GT--C-C----T-TGATCCAGTC---------T---TC-T-C-AA------AA-GA-TT--TT---GCA-TT-AATA------------------T-TTCA---ACT-TAAGTG-G---T-A-T--ATA-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-CAAAAACCA--C--AG-A-AGTC-A-ACC-TGA-CC
gi|50050 : CG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-T-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGC-CCC
blockSeqs : C G CT T C G A GAC AT C TCT A CCCC C G GG A TC T AA GTGAGCAT A T TTAAAATGATTAAT T T GA G T T T TC GTA CC A TCG C T G TTTT T AGA A AG ATAC A ATGTAAATATA G T T G A TACT C TC G G TG A C GTA G CTG C G TC A CATCTGTAATTT AC A A G G AA G GG AATTC C G A A A G G TT TTG G TGAA T CA C A TCAC G TC AG CGACGGACC CCC T TC C TGCTG T GG G GG T A T GCTCATA CA T TTGAC G A CTATT G TTG G A G CT GAAA ATAAT AC GTG G C TA CAT AG T TT TG GAC ACTAC GATG G G GG CTGAG CT CT C T AC AATC GATG A T G G T AA C G C CTCC TTAG A T A CTTT GTT TC A CGAA G CCAG AACAAATGA GT T G G CAGAAC T T TC TTG T C C C A T A ACT G AT G TTT G G TA T T A T T A G GA C AAAAA CA A G A T T G
blockSeqs : . . . . . . . . . . GC . TCAG . . . . . . . . . . CTCCTT . C . . . T . . . A A . . . . GCA . . . T C G . . . . . . GCT C . G G G T . C . . . . . A ATG C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A G . C . . . . . . A . T . GC . . . . A T . . . . . T . . G . . . . CAAA T GA . . . T . . . G . . T . . . A . . . . CG . . . . . . . T . . . . GC C . . . AG . A A . . T G . . . . . . . G G . . . . T . . . AG . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . TTTT . A . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T T C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . A . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . G . . . . . . . . G T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
finalCons : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111 111111111111 111111111
lowQualScore : 2 2 22 1 1 1 1 333 22 1 555 1 77777 1 1 22 1 22 1 22 55555555 1 1 6666666666666666666 1 4 22 1 1 3 1 22 222 33 3 222 1 1 1 222222 1 222 1 55 4444 3 66666666666 1 1 1 1 1 7777 3 22 3 3 33 3 1 444 0 1 222 1 1 22 4 111111111111 22 1 1 1 1 22 1 22 33333 1 1 1 1 4 1 1 22 222 1 3333 1 33 3 1 5555 1 22 22 777777777 333 1 44 1 66666 1 66 1 22 1 1 3 7777777 22 1 44444 1 1 55555 1 222 3 1 1 22 3333 66666666 33 444 1 1 22 555 22 1 22 55 222 44444 6666 1 1 22 55555 22 22 1 1 44 3333 3333 1 1 1 1 1 33 1 1 1 3333 44444 3 1 1 3333 555 22 3 6666 1 3333 000000000 44 1 1 1 444444 1 1 22 666 5 1 1 1 1 8 1 222 1 44 1 333 1 1 44 1 1 1 1 1 1 1 66 1 44444 22 1 1 2 2 0 2 4
lowQualScore : . . .. . . . . ... .. . ... . ..... . . .. . .. . .. ........ . . ................... . . .. . . . . .. ... .. . ... . . . ...... . ... . .. .... . ........... . . . . . .... . .. . . .. . . ... . . ... . . .. . ............ .. . . . . .. . .. ..... . . . . . . . .. ... . .... . .. . . .... . .. .. ......... ... . .. . ..... . .. . .. . . . ....... .. . ..... . . ..... . ... . . . .. .... ........ .. ... . . .. ... .. . .. .. ... ..... .... . . .. ..... .. .. . . .. .... .... . . . . . .. . . . .... ..... . . . .... ... .. . .... . .... ......... .. . . . ...... . . .. ... . . . . . . . ... . .. . ... . . .. . . . . . . . .. . ..... .. . . . . . . .
lowQualScore : 0 0 66 8 8 8 7 000 44 7 444 7 99999 7 7 33 7 22 6 22 88888888 6 5 1111111111111111111 5 6 11 5 5 1 5 11 777 77 1 777 5 5 5 888888 5 777 5 00 6666 0 88888888888 4 5 5 5 5 5555 0 00 0 0 55 0 5 111 3 5 666 5 5 00 4 777777777777 88 4 4 4 4 00 4 00 66666 4 4 4 4 3 4 4 00 555 4 0000 5 77 2 6 2222 7 44 44 000000000 000 7 11 7 11111 7 99 7 33 7 7 3 1111111 33 7 22222 7 7 88888 7 999 3 6 6 22 4444 44444444 77 888 5 5 11 777 22 5 11 22 777 22222 9999 7 7 33 88888 33 33 7 7 66 5555 5555 7 7 6 6 6 88 6 7 7 5555 00000 3 7 7 5555 222 33 3 9999 7 5555 000000000 00 7 7 7 888888 7 7 33 222 0 7 7 7 7 7 7 999 7 88 7 000 7 7 11 7 7 8 8 8 8 8 77 9 88888 66 9 9 2 2 3 4 7
consensus : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
Reference ( family-454 ) : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-NTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50013 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---A-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAG--T-TTT-T-GCT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--C-T-----C-TG--C-A--GA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-AAA-C--A--TTTGC--CCAG-TA--TA--A---TGC-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CA-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-G-AGC-TGT-CCCTC
gi|50014 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-TT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-AA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AT-AT--G-----G-GT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C----A--A---A-AAA-T--A--TGTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-A--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----AG---TT--C-C----T-TAAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTAA---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-C-AG-TG-AA-AAT-AGA-A-ATA-C-----CCG--CCGAA-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50015 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAA-CTC-C--CT----C----CAAAAA--A---A-AAA-A--A--ATTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATGT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACG-TA--CC-G---T-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-TGA-A-GTA-C-----ACG--GCGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50016 : AGGTCTC-A-AAC--T-GGCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--TTC----TT-TAT-----------CT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-ACA--------------------------T---GTCC-AT-GA--TCA-T------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-C-G-C--C---TG-A----AGCACTT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--AT----G----A---AA--A---A-AAA-A--ACATTTCC--CCAG-TA--AA--A---TGA-----CAGATGT-AT-ATC--AA-----A--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---TCA-TCCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50017 : AGGTCTC-A-GAT--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-C-AGAA--G-AC--A-CA--T--------TT-T-T-----TTTT----------AATG-AT-CAA--T-TTT-TTGTA-A--CC---A--TGGCAAAC---C-AA-T-TT-CA---T--AG-A---TAA-T--GTC----TT-TAG-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TT-ATA-T---GTCC-AT--A--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CT--GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---C-GAA-A--A---TTTC--CCAGTTA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCG-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCAAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T-----G-TCA-TAA----GG---TT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TATTT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-GT-TTCG---ACT-TA--CT-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATA-C-----CCA--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGT-CCCTC
gi|50018 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AGAT--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----A-------------AATA-AT-CAA--T-TTTTT-GTT-A--CC---A--TGGCAA-T---C-GA-T-TTTCA---T--AA-A---TAG-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-CA-AT-AG----AC-GCA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---CTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TT-CTT-GCCAGG--AA-AT--A-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---CG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAA-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GATCCC-CAT-TTC-A--CT----C----G---AA--A---G-AAACA--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CT-TA-AC-TTTTCCAACGA-G-G--CCA-C-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GG---CA--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TC--TT---GCA-TTCAATTT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-
gi|50019 : AGGTCTC-AGAAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAAATT-T---CA-C-T---G-T-AGA---A-GG--A-CAAAT--------TT-T-T-----T-------------AAAG-AT-CAA--T-TTT-T-GTTTA--CC---AA-TGGCAA-C---CCAA-T-TTT-A---T--AA-A---TAAAT--GTC----TC-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----ACCACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTAT--T---GTCCCAT-GA--TCAAC------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-GT-CGAAG-AT-T-GGC--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----GGA--GA--GGA---------A---ATTT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------T-AA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CGC-A--TT----C----C---AA--A---AGAAA-A--A--AATTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-------------AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAA-AA-G-G--CCA-A-A-T----T-----G-TCA-T-A-----G---TT--T-C----T-TGAT----TC---------TA--TCTT-C-AA------GA-TG-TT--TTG--GCATTTTAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-CAATCC-G---T-T-TTAA-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-C-----CCG--CCAAG-A-AGTCAA-AGC-TGC-CCCTC
gi|50020 : AGGTCTC-A-AAC--TTACCA-GGAAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----TT------------AATG-ATTCAA--T-TTT-TTGTT-A--CC---A--TGGCAA-C-----AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTA-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A---A--AA-GACA---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CT-----------A-CAT-GC-TG-CTCGGCCTGGAAAA-AT--G-----G-GTGCGA-G-AT-TGG-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--ACTC-CTC---G-A--GA--GGA---------A---A--T--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A--------CT-ACC-AAT----TT-TT---GACCCC-CAT--TC-A--CC----C------------------AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AT-----G--TTCCTTTGCA-C-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GGGTTCT--C-T----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-T--CT--TT---GCAGTTCAA-GT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---TGT-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-AGATT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACCTTGT-CC
gi|50021 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-AGGA---TGAAAA--T-T---CAAC-G---G-T-AGAGGGA-GG--A--A--T--------TT-T-T-----TTAAAATGATTAATAACG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--C----A--TGGCAAAC---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTCC---TT-TAT-----------TA-ATTA-A-AA-AT-AG----ACCACA--AGC-A--AAAGA-A---TTTA-A-TCTGGTCC-AT-GA--TCAAC------------A-C-T-GC-TGGCTC-GCCTGG--AA--T--G-----G-TC-CGA-G-AT-T-G-C--T------A----AGCACCTTGCC--A-TC-C-------G--GA--GGA---------A---A-TT--T-TT----C-TG--C-A--AA-AAG-G---------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TTGTT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---G-AAA-A--T--TTTTC--CCAG-TA--TAG-A---TGA-----CA----TGAT-A-C--AA--------TTC--TTGCA-A-AACA----AT-----C-TA-AC-CTTT-CAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--T-CA---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA-------A-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-G-AA-CA-TAGCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CCGG---T-T-TA-A-A-AG-TA-AA-AGTAAGA-A-GAT-C-----CCG--CCGAG-T-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50022 : AGGTCTC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TG-AAA--T-T---CT-C-T---G-T-AGAT--A-GGTCA-CA--T--------
gi|50023 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--TCT---CA-C-----G-TGAGAG--A-GG--ATCA--T--------TT-A-T-----T-------------AATG-ATCCAA--TGGTT-T-GTT-A--CC---A--TGG-AA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-TAGGTC----TTATAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AAGCT-AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GT-C-AT-GATCTCA-C------------A-CGT-GCATG-CTT-GCTTGG--AA-AT--G-----GCGT-CGA-GAAT-T-G-C--CTTGTG-A----AGCACCT-G-C--A-TCACT----G-A--GAAGGAA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--ATA-----CCT-A-C-AA-----TT-TTTTGGACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATT--CA-----GCTTTC--TTGCA-A-A--AAATCAT----CC-TA-AC-C-TTCCAACAAGG-G--CCA-A-ACT----T---GCG-TTATT-A----GG---TT--C-CT---T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GATTA-TT--TT---GCA-TTCCATAT-GAAA--A-T-GCTA--T-TTCG---ACT-TA--CC-GTTTT-T-T--T-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-
gi|50024 : AGGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-TTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50025 : AAGTCTC-A-AAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGCAAA--T-T---CA-C-T---G-T-TGAG--A-GG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--A-----T-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GTC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-A--A---TTTC--CCAG-TG--TA--A---T
gi|50026 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCT-G-AAAAATGGA---TGAAAA--T-TGC-CA-CAG---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-TTT-----T-------------AATG-AT-CAA----TTT-T-GTT-A--TC---A--TGGCAA-C---C-AATT-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AAGAT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA--A-A---TTTATA-T---GTCC-ATGGA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-ATGGG-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG------AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------A---A-TT--T-T-----CTTG--C-A--AA-AAG-A-T-------TGAA--A-A-----CCTGACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------A---A-AAA-A--A--TTTTC--CTAG-TA--TATGA---TGA-----CAT---T-AT-ATC--AA-----G---TC--TTGC--A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CC--A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----TGTGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TT-AT--TT---GCATTTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACT-TC--CC-G-----T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A--TA-C-----GC---CCGAG-AGATTC-A-ACC-TGT-CC
gi|50027 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCC-C-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-C---C-C-GGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT-T-GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---C--AA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-GC-TGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-A--GG--GTC---------A---A-AT--T-T-----C-AA--C-G--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TTGAAAT----A---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTGTTT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50028 : GGTCTC-A-AAC--T-ACCCCG-GAAA-TGGG----GAAAA--T-T---CA-C-CCCCG---AGAG--A-GG--C-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATT-TT-CAA--A-TTT---GTT-G--CC---A--TGGCAA-C---G-AA-C-TTTCG---GCAAA-A---TAA-TT-GAC----AT--GC-----------TT-CTTA-A-AA-GT-AG----AC-ACA--T-G-G--AA-GA-T---TTTAAG-G---GTGC-AT-GA--TAA-C------------A-TCT-GC-TG-CTT-ACCTGA--AA-AA--G-----G-G--CGA-G-ATAC-A-C--C---C--A----AGCACCT-GTC--A-AC-CT----G-G--GG--TCA---------A---A-TT--T-------C-AA--CGA--AA-AAC-G-A-------TGAA--A-A-----ATG-ACC-CA-----TT-TT---TAACCA-CTC-CTG-A--TT----GATAAT---AA--A---A-AAA-A--A--TT--C--ACAG-TA--TA--T---TGA-----CA----G-GT-ATC--AAA----G--TTC--TTGCA-A-A--T----AT----TC-TA-AC-GTTTCC--CAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-ACA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-ACAAGTGT-GCAG-CA-T-GCTG-TT-TTCA---ACT-TA--CC-G---A-T-T--C-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-ATT-C-----TCG--CCACG-C-AGT
gi|50029 : GGTCTC-A-AAC--T-ACAA-G-GATA-TGGA---TGAAAA--T-T---TG-C-T---G-C-AGTG--A-GA--T-CA--T--------CT-T-T-------------------AATG-AC-TAG--T-TTC-T-GTT-G--CT---A--TGACAA-G---T-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--ATC----AA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-GT-AG----AC-ACA--A-T-ATGAATGA-C---TTCAAA-T---GTCC-AT-GA--TCA-CATG---------A-TGT-GC-TG-CTA-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-TGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGTCCCT-GCC--A-TT-TT----G--------GGA---------A---T-TT--T-TTGCTGT-TG--C-A--AA-AA----A-------TG--------------T-AAC--A-----TT-TT-----CCTCGCTT-GTG-A--TT----C----C---AAT-A---T-ATG-A--A--TATTT--ACAG-TA--TA--G---TGA-----CA----T-TT-TTC--AA-----G--TTC--TTCCA-A-A--A----AT----CC-TA-A--CGTTCCAACAG-G-G--CCA-A-A-T----C---T-G-CAA-A-A----TG---TT--C-C----T-TGAT----TC----------A--TT-TGC-AA------AA-TA-TT--GA---GCA-TC-----T-GCAG-CA---------T-TTCA---ATT-TT--TC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-CTG-T-----CTA--CCAAG-A-ATTC---ATC-TCC-CCCTC
gi|50030 : GATCTT-A-GAC--T-ACCA-A-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---G-T-AAAG--A-GG--T-TA--T--------TC-A-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-T--TC---A--TGGCGA-C---C-AA-T-TTTCA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---G
gi|50031 : GTCTCCA-AACCTT-ACCA-----AA-TGG----TGAAA-----T---TA-C-G---G-T-AGAG--A-GG--A-TA--T--------TT-T-T-------------------AATG-AT-CAA--T-TTT-T-GTT-A--T----A---GGCAA-C---C-AA-T-TT-CA---T--AA-A---TAA-T--GTC----TT-TAT-----------TT-AT-G-A-AA-AT-AG----AC-ACA--A-C-A--A--GA-A---TTTATA-T----TCC-AT-GA--TCA-C------------A-CGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA--T--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-A---------A---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----C-T-ACC-A-------T-TT---GACCCC---T-CTC-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-------TTTTC--CTAG-TA--TG--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TT---TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACAA-G-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TTA-T-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--T--T-C-AA------G---A-TT--TT---GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----GCG---CGAG-A-ATTC-A-ACC-TGT-CCATC
gi|50032 : TC-A-GAC--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TAAAAA--T-T---CA-C-A---G-T-AGAG--AAGG--A-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-AAA--T-GTT-T-GTT-A--CA---A--TGACAA-C---C-AA-T-TTTCA---A--AA-A---TAA-A--GTC----TT-TAT-----------TT-
gi|50033 : C--T-ACCA-G-AAAA-TGGA---TGAAAA--T-C---CA-C-T---G-T-AGAG--A-AG--A-CA--T--------CT-T-T-----T-------------AATG-AT-TAA--T-TTT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCATTTT--AA-A----AA-T--GTC----TA-TAT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-A---CTTAAA-T---GCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GT-TG-CTT-GCCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-G-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-
gi|50034 : --A-CA--T--------TT-T-TCTCCTT-------------AATG-ATACAG--T-TTT-T-TTT-GTCCC---ACCTGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA---C--AA-AAGATAA-T--GTC----TT-TATATGTAAATATATT-AGCG-ATAA-AT-AGTACTAC-ATATCC-C-A--TA-GG-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-CCATCTGTAATTTA-TG--GC-GG-CTT-GCCTGG--AA-AT--GAATTCG-GT-CAG-A-AT-A-G-C--A---TG-ATGAAATCAGCT-GCCCAA-TC-CCTCACG-ATCGA--GGACGACGGACCACCCA-TT--TCT-----C-TG--C-AGGAA-ATG-G-AGCTCATACGAACAA-ATTGACCCT-GAC-AGCTATTTT-TT---GACTCC--AT-CTC-ACTCT----C----C---AAACA---A-AAA-A--A--TTATCAGTTAT-TA--CA--AGACTGAACTACTA----C-AT-CTC--AACTGAGG--CTT--TT-CA-ATA--A----ATGATGCCATATAC-CTTTCCAACAA-G-AT-CTA-A-A-TCTCCT---G-GATC--T-ACTTTGG---TT--CACCGAAT-TGAT----TCAACAAATGATA--TT-C-T-AACAGAACGA-TA--T--TT---GCA-TCCAATAT-GAAACCACT-GCTATTT-TTCG---A
gi|50035 : taccagaaagaaccccataggttgaaccagaaattaccaatgcaacagagaacaaaa-ACCA---AAAA-TGGAGACTGAAAA--T-TTCTCA-C-TCAGG-T-A-AG--A-GG--A-CA--TGTGAGCATTTAT-T-----T-------------AATGTAT-TAAGAT-GTT-T-CTT-A--CGGTAA--TGGCA------C-AA-T-TTATA---A--AA-A---TAA-T---TG----TA-TAT-----------TA-ATTG-A-AA-AT-AGT---AC-ACA--A-C-AG-AA-GA-AGTATTTATAGT---GTCC-GT-T---TTA-T------------AACGTAGC-TG-CTA-GCT--G--AA-AT--G-----G-TC-TGA-G-AT-G-G-C--T---TGGA----AGCAT-T-GCC--A-TC-TC----C-A--GA--GGA---------A---A-TTA-T-T-----C-TGGGC-A--AA-TAG-G-A-------TTAA--A--------CT-TCC-AA-----TT-TG---TACC----AT-ACT-A--CT----C----C---AA--A---A-AAA-ATAA--ATTTC--CTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATCGGAA-----G--TTC--TGG-----A--A----AT----CC-TA-AA-CTATCATACAC-GTG--CCA-A-A-T----T-----G-TTA-T-A----G-----T--CAC----T-T-AT----TCT--------TAGTTC-T-CGAA------GA-TA-TT--TTTTGGCA-TTCAATATCGAAA-CA-T-GCTG-TT-TCGA---ATT-TA--CC-G---T-TGT--A-ATAGATG-AATAGT-ACAGG-GTA-C-----GCGCACCGAG-A-
gi|50036 : AAA-TTAA---TGAAAA--T-T---CA-C-T---TCT-A-----A-GA--A-CA--T--------TT-T-T-----T-----------------------------------TT-A--CC---A--T--CAA-T---C-AA-T-TT-CA---A--AA-A---TAA-T---TC----TT--AT-----------TT--TT--A-AA-AT-AT----AC-ACA--A-C-A------------------------TC------A--TCA-C------------A-TTT-TC-TT-CTT---CCGG--AA-AT--T-----A--T-CAA-T-AT-T-T-C--C---CA-A----AGCACCT-TCC--A-TC-CT----T-A--AA----A---------A---A-CT--T-C-----T-TGGCC-A--AA-AAA-ATA-------TGTA--A-A-----CCT-ACT-AA-----TT------GACCCCGCAT-CTC-A--CT----C---------A--A---A-GAA-A--A--CTTTC--CCA--TA--TA--------A-----CA----C-AA-ATC--AA-----G--TTC--TT-CA-A-ACGA----AT----CC-TA-AC-CTTT-CAACTA-G-A--CC--A-A-T----T---G-G-----C-A----AG---T-----C----T-TTAT----TC---------TA--TC---C-AA-------A-TA-----TT---GCA-TCCAAT----GAA-CA-T--CTA-TC-T------AC--TA--CC-------T-T--A-A-AC-TGTAA-AGT-AGA-A-TAACC-----CCG--CCATA-A-TTTC-A-AGC-CTT-CCCTC
gi|50037 : -T---G-T-AGAG--A-GG--G-CA--T--------TT-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TTC-T-GTT-A--CC---A--TGACAA-T---C-AA-T-TTTCA---T--TA-A---TAA-T--ATC----TC-TAT-----------TT-
gi|50038 : T-T-T-----T-------------AATG-AT-CAA--T-TCT-T-GTT-A--CC---A--TGGCAA-C---C-AA-T-TTTCA------AA-A---TAA-T--AT-----TT-TAT-----------TTGATTG-A-AA-ATAAG----AC-ACA--A-C-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCT-----------------G-GT-CGG-G-AT-T-G-C--C---TG-A----A-CAACT-GCC--A-TC-CT----G-A--GA--G-----------A---A-TTTCT-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-G-AT------TGAA--A-A-----TCT-ACC-AA-----TT-TT---GACCCC-CAT-CTC-A--CT----C----C-------C---A-AAA-T--T--TTTTC--CCAG-TA--TA--A---AGA-----CAT---T-AT-AGC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAATAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA---A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------T---TC-T-C-CA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-CA-T-GCTA-TTATTTG---ACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTA-------CCG--CCAAGAA-AGTC-A-AGA-TGT-CCCTC
gi|50039 : -T-----T-------------AACG-AT-CA-----TTT-T-GTT-A--CC---G--GAGCAA-CTCGC-AG-TGTTTCA---T--AATA---T-------TC----TTGTTT-----------TT-AGTGTG-AA-AT-AG----AC-AAA--A-C-A--AA----A---TCTATA-T---GTCC-AT-GA--TAATC------------A-TGT-GC-TG-CTT-G-CTGG--AAGAT--G-----G-GT-CGA-G-ATAT-G-CTTC---CG------AGCACTT-CTC--AGTT-CT----G-A-------GG---------A---A-TT--T-T-----C-TGGTC-A--AATAAGAG-A-------TG-A--A-A-----CCT-GCC-AT-----TT-TT---G-CCTC-CATACTC-A--CA----CT---C---AA--AGTGA-AAT-A--T--TTTTT--CCAT-TATTTG--A---TGA-----CA----T-ATGATC--AA-----G--TTC--TTGTGCG-A--A----AT-----C-TA-AC-CTTTCC-ACAA-G-G--CCA-AGA-T----T-----G-TCA-T-A----GG---TTTCC-C----T-TAAT----TC---------TAG-TC-T-C-AA------GA-TA-TTTCTT---GCA-TT-AATAT-GAAC-TA-T-GATATTT-TTCGACTACT-TA--CC-G---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-GGT--GC-A-ATA-C-----CCG--CCGAG---AGTC-ATAGC-TGTGCCCTC
gi|50040 : AA-T--GTCATACTG-TTT-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AG----AA-ACA--A-C-A--AC-GA-A---TTTGTA-T---GTCC-AT-GA--TCA-C------------A-TGT-GT-TG-CTT-GCCTTG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AGCACCT-GC
gi|50041 : T-----------TT-ATTG-A-AA-AT-AA----AC-AAA--A-TGA--AA-GA-AC--TTTA-A-T---TCCC-AT-GA--TCA-C------------G-TGT-GC-TG-CTT-GTCTGG--AA-GT--G-----G-GT-CGA-A-AT-T-T-C--C---TG-A----AGCACCT-GCC--A-TC-CT----G-
gi|50042 : C-ACA--GGC-A--AA-GA-A---TTTATA-T---GTCC-AT-GA--TTA-C------------A---T-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--------G-GC-CGA-G-AT-T-G-C--C---TG-A----CGCACCT-GCC--
gi|50043 : TCC-AT-GA--TGA-C------------A-TGT-GC-TG-CTT-GCCTGG--AA-AT--G-----G-AT-CGA-G-
gi|50044 : GT-TC-TG-CTT-GCCTAG--AA-AT--G-----G-GT-TGA-A-AT-T-C-C--C---TG-A----AGCA
gi|50045 : acct-G-AT-T-G-C--C---TG-A----AA-ATCT-GCCA-A-TC-CT----G-A--GA--GGA---------T---A-TT--T-T-----C-TG--C-A--AA-AAG-GAA-------TGAA--A-A-----TCT-ACCAAA-----TT-TT---GA-CCC-CAT-CTCGG--CT----C----A---AA--A---A-AAA-A--A--
gi|50045 : --A---A-TAA-A--A--T---C--CCAG-TA------A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----T--TCT--TTGTA-A-A--A----AT----CC-TA-ACGCTTTCCAACAA-G-G---CA-A-A-T----T---G-G-TCA-T-A----GA---TT--C-C----T-TGCT----TCG--------TA---C-T-C-GG------GA-TA-TT--TTG--GCA--TCAATAT-GAAA-CA-T-GCTATTT-TTCG---ACTGTA--CC-G---T-T-T----A-AG-TG-AA-AGA-AGA-ATTTA-C----------CCGAG-A-AGTC-A-AGC-TATGTCCTCaaaaaaaaaaataaataataaataaaataataaaatcccagtaatgacatatatcaattctttgtaaaaatcctaacgctttccaacaaggcaaattggtcatagattccttgcttcgtactcgggatattttggcatcaatatgaaacatgctatttttcgactgtaccgtttaagtgaaagaagaatttacccgagaagtcaagctatgtcctc
gi|50046 : gattgcctgaaaatctgccaatcctgagaggatattttctgcaaaaaggaatgaaaatctaccaaattttgaccccatctcggctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaataataaataaaat--C-A--AA-AAG-G-A-------TGAA--A-A-----CCT-ACC-AA-----TT-AT---GACCAC-CAT-CTC-A--CG----C----C---AA--A---G-AAA-A--A--TTTTC--TTAG-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTA--CTGCA-A-A--A----TT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-G-G--CCA-
gi|50047 : T-CTC-A--CT----C----C---AA--AGA-A-AAA-A--A--TTGTT--CCAT-TA--TA--A---TGA-----CA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----AT----CC-TA-AC-CTTTCCAACGA-A-G--CCA-A-A-T----T---G-G-TCA-G-A----GG---TT--C-C----T-TGAT----TC---------TA--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAATAT-GAAA-TA-T-GCTA-TT-TTCG---ACT-TC--CC-G---T-T-T--A-A-TG-TG-AA-AGT-AG--A-GTA-C-----CCG--CCGAG-A-AGTC-A-A
gi|50048 : G-TA--TA--A---TGA-----AA----T-AT-ATC--AA-----G--TTC--TTGCA-A-A--A----GT----TC-TA-AC-CTTTTGAACAA-G-G--CTA-A-A-T----T---G-G-CAA-T-G----GG---TT--C-T----A-TGAT----TC---------TC--TC-T-C-AA------GA-TA-TT--TT---GCA-TTCAAT
gi|50049 : -CCTTCCAACAA-C-GAACCACG-A-T----TTTAG-ACTCG-T-A----GGAG-GT--C-C----T-TGATCCAGTC---------T---TC-T-C-AA------AA-GA-TT--TT---GCA-TT-AATA------------------T-TTCA---ACT-TAAGTG-G---T-A-T--ATA-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-CAAAAACCA--C--AG-A-AGTC-A-ACC-TGA-CC
gi|50050 : CG---ACT-TA--CC-A---T-T-T--A-A-AG-TG-AA-AGT-AGA-A-TTG-T-----CCG--CCAAG-A-AGTC-A-AGC-TGC-CCC